生物发光提高的发光蛋白质的制作方法

文档序号:3553848阅读:433来源:国知局

专利名称::生物发光提高的发光蛋白质的制作方法
技术领域
:本发明提供了发光活性提高的嵌合发光蛋白质,提供了其在报告基因系统中作为钙指示物的用途以及在用于检测和测定胞内钙的基于细胞的测定法中作为钙指示物的用途。
背景技术
:生物发光是活的生物体通过多种化学发光发应系统发射可见光的能力。生物发光反应需要三种主要的成分萤光素、萤光素酶和分子氧。然而在一些反应中也需要包括阳离子(Ca++和Mg++)和辅因子(ATP、NAD(P)H)的其他成分。萤光素酶为催化底物萤光素氧化并产生不稳定中间体的酶。光在不稳定中间体衰变成基态产生氧化萤光素时发射。虽然存在多种不同的无关萤光素类型,但是来自至少七个门的许多物种使用相同的萤光素,即已知的腔肠素(coelenterazine),其含有由三个氨基酸(2个酪氨酸和1个苯丙氨酸)形成的环。萤光素/萤光素酶系统可在一些动物(如水母)中以稳定的“发光蛋白质”形式提取,其在结合钙时能发光。发光蛋白质与萤光素酶不同,因为前者为萤光素酶和萤光素的稳定氧化中间复合体。发光蛋白质在许多海洋腔肠动物中存在并允许这些生物为包括繁殖、摄食和防御在内的多种目的发光(1)。虽然细菌能连续发光,但发光在许多其他生物中以闪光的形式出现,一般地持续时间为0.1-1秒。这需要酶促反应的迅速开/关且存在适当螯合并易于快速动员的反应物。在腔肠动物中闪光由钙的进入引起。发光蛋白质的钙结合位点与钙调素同源。发光蛋白质在钙存在的条件下通过分子内反应发出可见光。虽然有许多发光生物,但目前只有七种发光蛋白质得到分离,即Thalassicolin(2,3)、水母发光蛋白(4-6)、Mitrocromin(与Halistaurin为同物异名词)(7,8)、Clytin(与Phialidin为同物异名词)(8,9)、奥贝林(Obelin)(2,6,10,11)、Mnemiopsin(12,13)和Berovin(12,13)。这些蛋白全部为脱辅基蛋白质、咪唑吡嗪发色团(腔肠素)和氧的复合体。其结构高度保守,尤其在包含三个钙结合位点(EF手型结构)的区域。这些EF手型结构为钙结合蛋白家族的特点。发光蛋白质一旦和与EF手型袋紧密结合的钙反应就会发光。反应为单次周转事件并造成CO2的释放和在蓝光区域发光(λmax=470nm)。术语“发光蛋白质”等同于与萤光素结合的多肽,其能发光,而“脱辅基发光蛋白质”用于表示不具萤光素的蛋白质。研究最多的发光蛋白质为从维多利亚多管水母(Aequoreavicoria)分离的水母发光蛋白(14)和从双叉薮枝螅(Obelialongissima)分离的奥贝林(15)。当与Ca++结合时,水母发光蛋白经历将其转换成加氧酶(萤光素酶)的构象变化,然后通过结合的分子氧催化腔肠素的氧化。蓝色荧光蛋白由不与脱辅基发光蛋白质共价连接的coelenteramide组成,其为腔肠素的氧化产物。发光蛋白质可通过将脱辅基发光蛋白质与腔肠素、分子氧、EDTA和2-巯基乙醇或二硫苏糖醇孵育而重新产生。既然腔肠素为发光蛋白质水母发光蛋白、Mitrocomin、Clytin和奥贝林使用的共同发光底物,那么这四种发光蛋白质中的发光反应可能是相同的(16)。最近获得的水母发光蛋白和奥贝林的一级结构和晶体学数据带来了有关其功能的其他信息。来源于螅体双叉薮枝螅的天然奥贝林为含有非共价连接的发色团腔肠素的、具有分子量约为20kDa的由195个氨基酸残基(aa)组成的单链蛋白质。对Clytin一级结构的分析表明其含有189个氨基酸残基并属于发光蛋白质家族。然而水螅Ca++结合发光蛋白质与其他的Ca++结合蛋白质如钙调素和肌钙蛋白C不同,前者具有相对高含量的半胱氨酸、组氨酸、色氨酸、脯氨酸和酪氨酸残基。对奥贝林结构和功能的研究在BondarVS等,Biochemistry(2001),66(9)1014-8,VysotskiES等,(2003),42(20)6013-24和DengL.等,FEBSLett.(2001),506(3)281-5中报道。后两者尤其描述了W92F奥贝林突变体的生物发光和发射性质。发光蛋白质广泛用于报告基因技术中来监测与信号转导和基因表达相关的细胞事件。对细胞事件和其调节的研究需要灵敏的、非侵害性的分析方法。发光蛋白质和通常的生物发光为极好的报告系统,因为其与荧光系统相比实质上不具有背景。已经在哺乳动物细胞中表达了发光蛋白质以监测对不同刺激反应的钙变化。胞内钙浓度可通过向表达发光蛋白质的哺乳动物细胞中加入腔肠素辅因子并探测光子发射来测定,其中所述光子发射为胞内钙浓度的指示物。发明详述现在发现将奥贝林蛋白质(脱辅基奥贝林)所包含的、位于前两个钙结合位点之间的区域用选自C1ytin、水母发光蛋白、Thalassicolin、Mitocromin、Mnemiopsoin和Berovin的发光蛋白质中的相应区域进行替代的嵌合,可获得生物发光提高的新发光蛋白质。如在此使用的,奥贝林可指从包括双叉薮枝螅水母和曲膝薮枝螅(Obeliageniculata)在内的不同种类薮枝螅中分离的任一发光蛋白质(17)。奥贝林核苷酸和氨基酸序列参考分别列于SEQIDNO.1和2中。Clytin、Mitocromin和水母发光蛋白的氨基酸序列和核苷酸序列参考存于GenBank登录号Q08121、P39047、AAA27720和分别地L13247、L31623、L29571,而Thalassicolin、Mnemiopsis和Berovin的序列在参考文献2、3、12和13中描述。正如在此使用的,“相应的区域或片段”是指在所选择发光蛋白质中的任一这样的氨基酸序列,其在分别的序列比对中除了至少1个、优选地除了至少5个、更优选地除了至少10个氨基酸残基外与奥贝林序列匹配,并在相关蛋白质(奥贝林和所选发光蛋白质)中不保守,在涉及奥贝林序列时,所述的区域或片段优选地跨越42-112位残基,更优选地跨越50-95位残基。根据本发明优选的实施方案,嵌合蛋白质可通过用Clytin序列从53到97位残基的片段替代奥贝林氨基酸序列的50到94位残基来获得。这样获得的命名为“Photin”的发光蛋白质具有SEQIDNO.3的氨基酸序列。本发明的嵌合蛋白质可进一步通过一个或多个氨基酸残基的删除、添加或替代来修饰,条件是使发光蛋白质涉及发光和钙反应性的活性特征得以维持或提高。在涉及奥贝林序列时,尤其优选的为在55、66、67、73、74、75、78、83、84、87、89和94位替代。体外研究表明,Photin产生对钙刺激产生强烈的生物发光,一般其高于在天然发光蛋白质中观察到的生物发光。为制备嵌合发光蛋白质,可使用常规的基因工程制备具有奥贝林和所选的非奥贝林发光蛋白质的部分编码序列的重组DNA构建体,将得到的嵌合产物插入载体,在适当的宿主中表达,然后分离和纯化。例如编码奥贝林和不同发光蛋白质的cDNA可通过PCR扩增或用合成寡核苷酸在体外构建,产物可利用适当的限制酶切位点重组,其中所述酶切位点为天然存在或人工引入寡核苷酸中用于PCR或体外构建。除了重组构建体之外,表达载体还可含有启动子、核糖体结合位点、起始密码子、终止密码子或转录增强子的共有位点。载体还可包含用于分离含有DNA构建体的宿主细胞的选择标记。适当的载体为例如酵母或细菌质粒、噬菌体、病毒、逆转录病毒或DNA。携带重组构建体的载体可通过常规技术导入宿主。宿主细胞可为原核的或真核的,如细菌、酵母或哺乳动物细胞。用于发光蛋白质表达/生产的优选宿主为哺乳动物细胞,包括上皮或淋巴母细胞来源的细胞,如Hek-293、CHO-K1、HepG2和HL-60。这些细胞可在细胞质中(18)、通过向发光蛋白质添加线粒体靶向序列而在线粒体中、或者在任何其他细胞器中(19-21)表达脱辅基发光蛋白质。作为选择,也可使用非哺乳动物细胞例如细菌或真菌。一旦选择了宿主细胞类型,基因构建体可通过磷酸钙沉淀、电穿孔或其他常规技术引入。转染之后在适当的培养基中培养细胞并筛选合适的活性。本发明的发光蛋白质可用常规的方法分离和纯化,例如提取、沉淀、层析、亲和层析、电泳。可通过重叠延伸PCR在嵌合产物中引入点突变。为产生Photin,奥贝林基因的NdeI/MunI片段用对应于Clytin编码序列156到291位核苷酸的135个核苷酸片段替换。另一方面,本发明涉及编码在此公布的嵌合蛋白质的核酸分子。DNA编码序列可利用遗传密码的简并性修饰,例如改变密码子选择以提高在异源系统中的表达。在本发明优选的实施方案中,编码蛋白质Photin的DNA序列选自SEQIDNO.4和5。在存在腔肠素的无细胞麦胚翻译系统中进行体外转录和翻译实验以检验嵌合产物是否具有功能。在这些实验中,活性发光蛋白质的形成通过检测翻译混合物中加入钙离子之后的发光来记录。在存在35S-甲硫氨酸的情况下进行翻译反应,以使测量的发光与产生的蛋白质数量相关。通过测量掺入三氯乙酸不溶级分的35S-甲硫氨酸确定新合成多肽的数量。这些实验结果证明Photin在对钙离子刺激反应产生生物发光的灵敏性和效力。本发明的另一个实施方案中,在此提供的嵌合蛋白质可作为钙指示物使用,尤其是用于测量胞内钙浓度。在典型的分析中,向表达发光蛋白质的哺乳动物细胞中加入辅因子例如腔肠素并用本领域已知的方法记录光的发射,例如使用商业购买的发光计。可使用同时表达发光蛋白质和参与胞内钙动员的受体的细胞检测候选分子在受体调节方面的影响。本发明的嵌合发光蛋白质可用于多种基于细胞的功能鉴定法中,其利用测量胞内钙评估蛋白质活性,所述蛋白质尤其是G-蛋白偶联受体(GPCRs)和质膜例子通道。虽然GPCRs和离子通道刺激之后大量且迅速地胞内钙浓度的增加可通过多种报告分子如钙敏感性荧光染料检测,但优选使用生物发光的发光蛋白质(22)是因为其与荧光染料相比实质上不具有背景;此外,用发光蛋白质测量钙除了产生迅速的信号外还产生具有广泛检测敏感性范围的高信噪比(22,23)。基于细胞的功能鉴定法一般包括在同时表达GPCRs或离子通道和发光蛋白质的细胞培养物中加入适当的激动剂,然后通过测量发光蛋白质活性确定任何钙浓度的改变,例如由从胞外位点迅速流入或从胞内库中释放引起的钙增加(18)。使用同时表达Photin和参与胞内钙浓度调节的受体的细胞提供了筛选对胞内钙释放有影响的化合物的有效系统。使用根据本发明的发光蛋白质也可设计高通量筛选鉴定法作为报告系统。系统的敏感性和其高信噪比允许使用小的鉴定体积。在另一个实施方案中,根据本发明的发光蛋白质与分析、诊断或治疗目的分子连接,并将连接产物用于竞争性固相免疫测定以确定生物样品中的分子数量。例如,发光蛋白质可与激素蛋白质化学连接并用于使用激素特异性抗体确定激素唾液水平(24)的固相免疫测定中。还在另一实施方案中,根据本发明的发光蛋白质和不同的(多)肽的融合产物用如在US6087476中(其在此引用作为参考)公布的已知基因工程技术产生并用于免疫诊断或图象加工,其中所述不同的(多)肽为例如激素、抗原性肽、轻链或重链免疫球蛋白、亲和素、链亲和素或蛋白A。下列实施例详细描述了本发明。附图简述图1.新合成的发光蛋白质的钙诱导生物发光。发光蛋白质在存在腔肠素的麦胚无细胞体系中翻译。所有翻译混合物等分试样于30℃黑暗条件下孵育2小时。反应中加入50mMCaCl2并记录发光10秒。图2.存在腔肠素条件下的发光蛋白质DNA翻译,通过稀释反应混合物测量发光。AQ水母发光蛋白,PHPhotin,OB奥贝林。图3.(A)PhotinDNA转染的CHO-K1细胞表达的内源ATP受体刺激下ATP剂量依赖性发光。细胞转染、收获和Photin表达如实施例1所述进行。细胞用两个不同浓度的ATP处理。(B)使用奥贝林DNA转染的CHO-K1细胞作为阳性对照。发光以RLU(相对光度单位)形式表达。图4.用内皮素A受体和Photin两者转染的CHO-K1细胞中Photin活性的剂量依赖性曲线。受体通过注射浓度为100和500nM的内皮素活化。图5.由表达发光蛋白质Photin和大鼠辣椒素受体1(vanilloidreceptor1(VR1))的细胞获得的剂量依赖性曲线。特异的激动剂辣椒素以10和50μM的浓度使用。实施例1.发光蛋白质DNA的体外转录/翻译发光蛋白质的翻译根据提供商的通用说明在麦胚无细胞体系(TNT试剂盒,Promega)中进行。每一个体外转录/翻译反应混合物中使用约2μgDNA。翻译体积(50μl)包括25μl麦胚提取物、2μl反应缓冲液、不含甲硫氨酸的氨基酸混合物、RNA酶抑制剂和腔肠素(40μM)、T7聚合酶。混合物还含有35S-甲硫氨酸(比活性1000Ci/mmol)。35S-甲硫氨酸用于确定体外合成的发光蛋白质的数量。为此,每个翻译混合物样品中的5μl在冰上用TCA沉淀30分钟,过滤,用冷的5%TCA、甲醇洗,干燥并置于计数管中。表1显示了无细胞体系中产生的Photin和奥贝林数量。表I进入发光蛋白质翻译产物中的放射性标记2.发光蛋白质分析取5和10μl翻译混合物直接与固定于发光计(Berthold)的96孔板中的95-90μlPBS溶液混合。在孔中注入50μl溶液(50mMCaCl2)以引发发光蛋白质发光并记录发光10秒钟。图1显示了Photin、奥贝林和水母发光蛋白DNA体外翻译的结果。图2显示了通过稀释体外翻译反应中的发光蛋白质获得的发光测量结果。表II显示了不同数量Photin和奥贝林DNA在翻译过程中获得的发光数据与TCA计数的比较(测量的发光与新合成的发光蛋白质数量成比例)。表II放射性标记的发光蛋白质含量及其在翻译混合物中的发光3.基于细胞的功能鉴定法的实施例3.1通过转染CHO-K1细胞获得Photin表达克隆(材料和方法)。转染后两天细胞用胰酶消化并稀释10或100倍。一旦细胞生长为充分分开的集落,将集落转移到新板上并在其对不同浓度ATP功能性反应(发光信号)的基础上选择,已知ATP能刺激CHO内源受体并使胞质Ca++浓度升高。每一个实验的最后,细胞通过灌流含有TritonX-100和CaCl2的溶液裂解。活性的发光蛋白质通过将细胞与稀释于含2mM钙的PBS中的10μM腔肠素在5%CO2气体中37℃黑暗条件下孵育3小时再生。为测量发光,细胞在钙存在条件下裂解并记录发出的光。发光计整合前10秒发出的光子数量并在屏幕上显示。空质粒转染的细胞或未转染的细胞(数据未显示)不能增加光子发射。注入10、50、100μMATP以检测钙浓度的变化并确定钙反应动力学。图3(A)显示了获得的曲线。使用表达发光蛋白质奥贝林的细胞系作为阳性对照,见图3(B)。3.2建立表达内皮素A受体和Photin的CHO细胞系。在激动剂的刺激下,此受体诱导胞内钙浓度的增加,其通过Photin发光测量。细胞在96孔板中于含10%胎牛血清(FBS)的DMEM/F12培养基中培养成单层。实验当天去除培养基,细胞在含10μM腔肠素的PBS中孵育至少3小时。内皮素肽在PBS中稀释成100和500nM浓度。每孔中加入约50μl内皮素并测量反应。立即记录发射的光30秒。图4报告了对内皮素的剂量依赖性反应。3.3表达脱辅基Photin和大鼠VR1辣椒素受体-钙可透性离子通道-的CHO细胞在组织培养瓶中生长到80-95%汇合并通过胰酶消化收获。用生长培养基将细胞悬浮成在96孔板中的10,000个细胞/孔并于5%CO2湿润培养箱中37℃孵育过夜。为进行发光实验,细胞中加入10μM腔肠素在37℃5%CO2条件下3小时。通过在每孔中加入10和50μM辣椒素刺激钙反应。使用LabsystemLuminoskanAscent追踪闪光动力学,其在每一单孔中注入反应物并记录光的发射。辣椒素的加入在30秒内引起迅速且短暂的发光信号,在约10秒内出现峰水平(图5)。材料和方法试剂限制性内切酶购于NewEnglandBiolabs并根据提供商的说明书使用。RNA酶抑制剂和用于体外转录和翻译的TNT试剂盒来自Promega(Madison,WI)。PfuTurbo聚合酶、PCR试剂和大肠杆菌(E.coli)XL-lBlue和BL21菌株感受态细胞为Stratagene(LaJolla,CA)生产。寡核苷酸购于Primm(Milan)。腔肠素为ProlumeLtd.(Pittsburg,PA)生产。所有其他化学品为合格来源并为试剂级别或更高级别。用于奥贝林DNA序列一步合成的装配PCRPCR装配需要4个步骤寡聚物合成、基因装配、基因扩增和克隆。我们合成了长度为40nt的30个寡聚物,其合起来编码奥贝林基因序列的两条链。互补寡聚物重叠20nt。在20μlGeneampXLPCR混合液(PerkinElmer)中稀释250倍之前,从30个寡聚物溶液中的每一个取出的等体积混合成终浓度约为250μM的混合寡聚物。扩增过程通过三个阶段进行。第一步用混合的寡聚物如下进行40℃2分钟,然后加入聚合酶,72℃10秒,然后40个循环(94℃15秒,40℃30秒和72℃10秒)。反应混合物用新制PCR和聚合酶混合液稀释3倍。第二阶段为25个循环(94℃15秒,40℃30秒,72℃45秒)。反应再次用完全PCR混合液稀释3倍。第三阶段的条件为20个循环(94℃15秒,40℃30秒,72℃70秒)。反应产物通过1%琼脂糖凝胶电泳分析,特异片段克隆到pcrBlunt载体中用于进一步的克隆步骤。此质粒称为pcr-OB。PCR反应的保真性通过双脱氧测序确认。嵌合蛋白质的构建根据Clytin基因序列设计4对寡聚物。选择EF-手型结构I和EF-手型结构II之间的区域进行基因嵌合。以下为寡核苷酸引物Clyt-45′-AATTCTTTCCATCCATCAACAAAAGCTGGGAATTCGACTTCTTTACCATAATCCATACCAATC-3′Clyt-35′-AAAGATTGGTATGGATTATGGTAAAGAAGTCGAATTCCCAGCTTTTGTTGATGGATGGAAAG-3′Clyt-25′-TTTTTGAAGAAAGCTTCGACAGCATCCTGGTGACGTTTGGTCTGTTCTGGTGTTGCTCCAAGTTTGGCGCA-3′Clyt-15′-TATGCGCCAAACTTGGAGCAACACCAGAACAGACCAAACGTCACCAGGATGCTGTCGAAGCTTTCTTCAA-3′退火寡聚物克隆到pcr-OB载体上的NdeI/MunI单一位点中。含有嵌合基因产物的质粒称为pcr-Photin。PhotinDNA进一步亚克隆到含有T7启动子的pcDNA3载体中。基于PCR的密码子选择的改变使用重叠延伸PCR技术产生奥贝林突变体。设计6对引物,其带有10个不同点突变,能产生10个不同的密码子选择改变。PCR反应如下进行,以扩增用于重叠延伸的DNA片段pfu聚合酶2.5单位、DNA模板50ng、每一种dNTP250μM、每一种引物50pmol,总体积100μl。使用的循环参数为前10个循环94℃1分钟、45℃1分钟、72℃1分钟30秒,然后退火温度为50℃进行20个循环。位点特异的突变通过Primm(Milan)进行的DNA测序确认。所有的分子方法使用标准方案进行。CHO细胞培养所有细胞在标准湿润条件37℃和5%CO2下培养。CHO细胞保持在DMEM/F12+FBS10%+Pen/Strep+G4180.5mg/ml+丙酮酸1.6mM+NaHCO30.2%中,所有试剂为LifeTechnologies生产。这些细胞在板上生长到70%-80%汇合时进行DNA转染。参考文献1.Kendall,J.M.和Badminton,M.N.(1998).维多利亚多管水母生物发光进入激动人心的新时代,TrendsBiotechnology.16(5)216-24.2.Campbell,A.K.,Hallet,R.A.,Daw,M.E.,Ryall,R.C.,Hart和HerringP.J.(1981).发光蛋白质奥贝林在测量细胞中游离Ca++的应用,在BioluminescenceandChemiluminescence,basicChemistryandAnalyticalapplications(M.A.deLuca和W.D.McElroy编辑)一书中的601-607页.AcademyPress,NewYork.3.Herring,P.J.(1979)放射虫Thalassicolasp.生物发光的某些特征,Mar.Biol.53,213-216.4.Shimomura,O.,JohnsonF.H.和Saiga,Y(1962)发光水螅水母多管水母属的发光蛋白质即水母发光蛋白的提取、纯化和性质,J.Cell.Comp.Physiol.59,223-239.5.Shimomura,O.,JohnsonF.H.和Saiga,Y(1963)生物发光蛋白质水母发光蛋白的其他数据,J.Cell.Comp.Physiol.62,1-8.6.Morin,J.G.和HastingsJ.W.(1971)群体螅体和其他腔肠动物生物发光的生物化学,J.Cell.Physiol.77,305-311.7.Shimomura,O.,Johnson,F.H.和Saiga,Y.(1963)水螅水母Halistaura的生物发光蛋白质halistaurin的提取和性质,J.Cell.Physiol.62,9-15.8.Shimomura,O.,和Shimomura,A.(1985)Halistaurin、phialidin和修饰形式的水母发光蛋白在生物系统中作为Ca++指示物,Biochem.J.228,745-749.9.Levine,L.D.,和Ward,W.W.(1982)生物发光水母Phialidiumgregarium中的发光蛋白质“phialidin”和光谱单一绿色荧光蛋白的分离和性质研究,Comp.Biochem.Physiol.72B,77-85.10.Morin,J.G.和Hastings(1971)生物发光系统中的能量转移,J.Cell.Physiol.77,313-318.11.Campbell,A.K.(1974)水螅体曲膝薮枝螅的钙激活蛋白质奥贝林的提取、部分纯化和性质,Biochem.J.143,411-418.12.Ward,W.W.和Selinger(1974)栉水母动物Mnemiopsissp.和Bernovata的钙激活发光蛋白质的提取和纯化,Biochemistry13,1491-1499.13.Ward,W.W.和SeligerH.H.(1974)栉水母动物Mnemiopsissp.和Bernovata的钙激活发光蛋白质mnemiopsin和berovin的性质,Biochemistry13,1500-1510.14.Johnson,F.H.和Shimomura,O.(1978)水母生物发光简介,尤其涉及到发光蛋白质水母发光蛋白,MethodsEnzymol.57,271-291.15.IllarionovBA,BondarVS,IllarionovaVA,VysotskiES.编码双叉薮枝螅水母钙激活发光蛋白质奥贝林的cDNA序列,Gene.199514;153(2)273-4.16.Blinks,J.R.,Weir,W.G.,Hess,P.和Prendergast,F.G.(1982).活细胞中Ca++浓度的测量,Prog.Biophys.Mol.Biol.40,1-114.17.MarkovaSV,VysotskiES,BlinksJR,BurakovaLP,WangBC,LeeJ.,(2002)生物发光海洋螅体曲膝薮枝螅的奥贝林克隆、表达及与其他Ca2+调节发光蛋白质一些性质的比较,Biochemistry.2002Feb19;41(7)2227-36.18.ButtonD,BrownsteinM.(1993)表达水母发光蛋白的哺乳动物细胞系用于报告Ca++的动员,CellCalcium.Oct;14(9)663-71.19.Mattheakis,L.和Ohler,L.D.(2002)展望细胞中的钙成像用于药物发现,DrugDiscoveryTodayS,15-19.20.StablesJ,GreenA,MarshallF,FraserN,KnightE,SautelM,MilliganG,LeeM.,ReesS.(1997).潜在的任何G蛋白偶联受体激动剂活性的生物发光分析,(1997)AnalBiochem1;252(1)115-26.21.BriniM.,PintonP.,PozzanT.,RizzutoR.(1999).关注重组水母发光蛋白监测活细胞多种细胞器中Ca++的工具,Microsc.Res.Tech.46,380-389.22.CretonR.,KreilingJ.A.,JaffeLF.(1999)带有化学发光的钙成像,Microsc.Res.Tech.46,390-397.23.Shimomura,O.等(1993)重组半合成水母发光蛋白和重组连接荧光素的水母发光蛋白的发光性质用于测量细胞钙,CellCalcium14,373-378.24.Mirasoli,M.等(2002)使用重组水母发光蛋白作为标记物进行皮质醇的生物发光免疫测定,AnalyticalBiochemistry306,204-211.序列表<110>阿克萨姆有限公司<120>生物发光提高的发光蛋白质<130>1191EUR<160>9<170>PatentIn版本3.1<210>1<211>662<212>DNA<213>双叉薮枝螅(Obelialongissima)<400>1acgatcgaaccaaacaactcagctcacagctactgaacaactcttgttgtgtacaatcaa60aatgtcttcaaaatacgcagttaaactcaagactgactttgataatccacgatggatcaa120aagacacaagcacatgtttgatttcctcgacatcaatggaaatggaaaaatcaccctcga180tgaaattgtgtccaaggcatctgatgacatatgtgccaagctcgaagccacaccagaaca240aacaaaacgccatcaagtttgtgttgaagctttctttagaggatgtggaatggaatatgg300taaagaaattgccttcccacaattcctcgatggatggaaacaattggcgacttcagaact360caagaaatgggcaagaaacgaacctactctcattcgtgaatggggagatgctgtctttga420tattttcgacaaagatggaagtggtacaatcactttggacgaatggaaagcttatggaaa480aatctctggtatctctccatcacaagaagattgtgaagcgacatttcgacattgcgattt540ggacaacagtggtgaccttgatgttgacgagatgacaagacaacatcttggattctggta600cactttggacccagaagctgatggtctctatggcaacggagttccctaagctttttttcg660aa662<210>2<211>195<212>PRT<213>双叉薮枝螅<400>2MetSerSerLysTyrAlaValLysLeuLysThrAspPheAspAsnPro151015ArgTrpIleLysArgHisLysHisMetPheAspPheLeuAspIleAsh202530GlyAsnGlyLysIleThrLeuAspGluIleValSerLysAlaSerAsp354045AspIleCysAlaLysLeuGluAlaThrProGluGlnThrLysArgHis505560GlnValCysValGluAlaPhePheArgGlyCysGlyMetGluTyrGly65707580LysGluIleAlaPheProGlnPheLeuAspGlyTrpLysGlnLeuAla859095ThrSerGluLeuLysLysTrpAlaArgAsnGluProThrLeuIleArg100105110GluTrpGlyAspAlaValPheAspIlePheAspLysAspGlySerGly115120125ThrIleThrLeuAspGluTrpLysAlaTyrGlyLysIleSerGlyIle130135140SerProSerGlnGluAspCysGluAlaThrPheArgHisCysAspLeu145150155160AspAshSerGlyAspLeuAspValAspGluMetThrArgGlnHisLeu165170175GlyPheTrpTyrThrLeuAspProGluAlaAspGlyLeuTyrGlyAsn180185190GlyValPro195<210>3<211>195<212>PRT<213>嵌合蛋白<400>3MetSerSerLysTyrAlaValLysLeuLysThrAspPheAspAsnPro151015ArgTrpIleLysArgHisLysHisMetPheAspPheLeuAspIleAsn202530GlyAsnGlyLysIleThrLeuAspGluIleValSerLysAlaSerAsp354045AspIleCysAlaLysLeuGlyAlaThrProGluGlnThrLysArgHis505560GlnAspAlaValGluAlaPhePheLysLysIleGlyMetAspTyrGly65707580LysGluValGluPheProAlaPheValAspGlyTrpLysGluLeuAla859095ThrSerGluLeuLysLysTrpAlaArgAsnGluProThrLeuIleArg100105110GluTrpGlyAspAlaValPheAspIlePheAspLysAspGlySerGly115120125ThrIleThrLeuAspGluTrpLysAlaTyrGlyLysIleSerGlyIle130135140SerProSerGlnGluAspCysGluAlaThrPheArgHisCysAspLeu145150155160AspAsnSerGlyAspLeuAspValAspGluMetThrArgGlnHisLeu165170175GlyPheTrpTyrThrLeuAspProGluAlaAspGlyLeuTyrGlyAsn180185190GlyValPro195<210>4<211>600<212>DNA<213>嵌合基因<400>4ggatccgccgccatgtcttcaaaatacgcagttaaactcaagactgactttgataatcca60cgatggatcaaaagacacaagcacatgtttgatttcctcgacatcaatggaaatggaaaa120atcaccctcgatgaaattgtgtccaaggcatctgatgacatatgcgccaaacttggagca180acaccagaacagaccaaacgtcaccaggatgctgtcgaagctttcttcaaaaagattggt240atggattatggtaaagaagtcgaattcccagcttttgttgatggatggaaagaattggcg300acttcagaactcaagaaatgggcaagaaacgaacctactctcattcgtgaatggggagat360gctgtctttgatattttcgacaaagatggaagtggtacaatcactttggacgaatggaaa420gcttatggaaaaatctctggtatctctccatcacaagaagattgtgaagcgacatttcga480cattgcgatttggacaacagtggtgaccttgatgttgacgagatgacaagacaacatctt540ggattctggtacactttggacccagaagctgatggtctctatggcaacggagttccctaa600<210>5<211>607<212>DNA<213>嵌合基因<400>5ggatccgccgccatgtcttcaaaatacgcagttaaactcaagactgactttgataatcca60cgatggatcaaaagacacaagcacatgtttgatttcctcgacatcaatggaaatggaaaa120atcaccctcgatgaaattgtgtccaaggcatctgatgacatctgcgccaaactgggagca180acaccagaacagaccaaacggcaccaggatgctgtcgaagctttcttcaaaaagattggt240atggattatggtaaagaagtcgaattcccagcttttgttgatggatggaaagaattggcg300acttcagaactcaagaaatgggcaagaaacgaacctactctcattcgtgaatggggagat360gctgtctttgatattttcgacaaagatggaagtggtacaatcactttggacgaatggaaa420gcttatggaaaaatctctggtatctctccatcacaagaagattgtgaagcgacatttcga480cattgcgatctggacaacagtggcgacctggatgttgacgagatgacaagacaacatctt540ggattctggtacactttggacccagaagctgatggcctctatggcaacggagttccctaa600gaattcc607<210>6<211>70<212>DNA<213>寡核苷酸引物<400>6tatgcgccaaacttggagcaacaccagaacagaccaaacgtcaccaggatgctgtcgaag60ctttcttcaa70<210>7<211>71<212>DNA<213>寡核苷酸引物<400>7tttttgaagaaagcttcgacagcatcctggtgacgtttggtctgttctggtgttgctcca60agtttggcgca71<210>8<211>62<212>DNA<213>寡核苷酸引物<400>8aaagattggtatggattatggtaaagaagtcgaattcccagcttttgttgatggatggaa60ag62<210>9<211>63<212>DNA<213>寡核苷酸引物<400>9aattctttccatccatcaacaaaagctgggaattcgacttctttaccataatccatacca60atc6权利要求1.嵌合发光蛋白质,其通过将奥贝林蛋白质所包含的位于第一个和第二个钙结合位点之间的区域用选自Clytin、水母发光蛋白、Thalassicolin、Mitocromin、Mnemiopsin和Berovin的发光蛋白质中的相应区域进行替代而获得。2.根据权利要求1的嵌合发光蛋白质,其中所选发光蛋白质中的所述相应区域在分别的序列比对中除了至少1个氨基酸残基外与奥贝林序列匹配。3.根据权利要求2的嵌合发光蛋白质,其中所选发光蛋白质中的所述相应区域在分别的序列比对中除了至少5个氨基酸残基外与奥贝林序列匹配。4.根据权利要求3的嵌合发光蛋白质,其中所选发光蛋白质中的所述相应区域在分别的序列比对中除了至少10个氨基酸残基外与奥贝林序列匹配。5.根据权利要求1的嵌合发光蛋白质,其中所述的区域为奥贝林蛋白质序列的42到122位残基。6.根据权利要求5的嵌合发光蛋白质,其中所述的区域为从奥贝林蛋白质序列的50位残基延伸至94位残基。7.根据权利要求6的嵌合发光蛋白质,其中奥贝林蛋白质的50到94位残基用Clytin序列从53位残基延伸到97位残基的片段替代。8.根据权利要求7的嵌合发光蛋白质,其具有SEQIDNO.3的氨基酸序列。9.根据权利要求1的嵌合发光蛋白质,其还包含在奥贝林序列55、66、67、73、74、75、78、83、84、87、89和94位进行一个或多个氨基酸替代。10.融合蛋白质,其含有权利要求1-9的发光蛋白质。11.连接产物,其由根据权利要求1-6的发光蛋白质和用于分析、诊断或治疗用途的分子之间连接形成。12.经分离核酸分子,其编码根据权利要求1-9的嵌合发光蛋白质。13.根据权利要求12的编码权利要求8所述蛋白质的经分离核酸分子,其具有选自SEQIDNO.4和SEQIDNO.5的序列。14.根据权利要求1-9的嵌合发光蛋白质的用途,其与萤光素底物组合用于检测钙离子。15.根据权利要求14的用途,其中所述的萤光素底物为腔肠素。16.根据权利要求14-15的用途,用于定量测定钙离子。17.根据权利要求14-15的用途,用于测定胞内钙浓度。18.宿主细胞,其具有根据权利要求12-13的核酸分子。19.权利要求18的细胞宿主,其选自细菌、酵母、真菌、植物、昆虫和动物细胞。20.产生发光蛋白质的方法,其包括在适于发光蛋白质表达的条件下培养权利要求18-19的宿主细胞和收获表达的蛋白质。21.筛选生物活性分子的方法,其包括将根据权利要求18-19的细胞宿主暴露于一定量的所述分子并检测胞内钙浓度的任何变化。22.根据权利要求21的方法,其中宿主细胞用异源G蛋白偶联受体或离子通道转染。23.根据权利要求11的连接产物在竞争性固相免疫测定法中的用途,用于测定生物样品中所述分子的量。24.生物发光共振能量转移(BRET)系统,其包含荧光蛋白和权利要求8的发光蛋白质。全文摘要所公开的为发光活性提高的发光蛋白质,其在用于检测和测量胞内钙的基于细胞的分析法中作为钙指示物的用途。文档编号C07K14/435GK1705680SQ200380101748公开日2005年12月7日申请日期2003年10月21日优先权日2002年10月21日发明者M·福蒂,S·洛默尔申请人:阿克萨姆有限公司
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