1.水稻种子快速萌发QTL qGS11的分子标记，其特征在于所述的分子标记选自YB20、YB21、RM26614中的任意一种；所述的分子标记YB20的上游引物为RMYB20L：SEQ ID NO.1，下游引物为RMTB20R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为133bp；所述的分子标记YB21的上游引物为YB21L：SEQ ID NO.3，下游引物为YB21R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为194bp；所述的分子标记RM26614的上游引物为RM26614L：SEQ ID NO.5，下游引物为RM26614R：SEQ ID NO.6，扩增产物大小为183bp。
2.权利要求1所述的水稻种子快速萌发QTL qGS11的分子标记引物，其特征在于所述的分子标记YB20的上游引物为RMYB20L：SEQ ID NO.1，下游引物为RMTB20R：SEQ ID NO.2，扩增产物大小为133bp；所述的分子标记YB21的上游引物为YB21L：SEQ ID NO.3，下游引物为YB21R：SEQ ID NO.4，扩增产物大小为194bp；所述的分子标记RM26614的上游引物为RM26614L：SEQ ID NO.5，下游引物为RM26614R：SEQ ID NO.6，扩增产物大小为183bp。
3.权利要求1所述的分子标记在筛选快速萌发的水稻品种中的应用。
4.权利要求2所述的分子标记引物在筛选快速萌发的水稻品种中的应用。
5.一种快速鉴别qGS11增效等位基因存在与否的方法，其特征在于包含如下步骤：
(1)取水稻叶片，提取基因组DNA；
(2)利用权利要求2所述的分子标记引物中的任意一对、两对或三对对所述的基因组DNA进行PCR扩增，PCR扩增产物在8％非变性聚丙烯酰胺胶上进行电泳检测，如果扩增出对应大小的DNA片段，标志着种子快速萌发QTL qGS11增效等位基因的存在。
6.根据权利要求5所述的水稻种子快速萌发分子筛选方法，其特征在于所述的PCR反应：体积为25微升，其中10×buffer 2.5微升，25mM MgCl2 1.5微升，4pmol/微升引物对2.5微升，2.5mM dNTPs 2微升，5单位/微升Taq酶0.2微升，模板DNA 20纳克，加水至25微升。反应程序为DNA 95℃预变性5min；95℃预变性30s，50℃退火30s，72℃延伸展30s，循环35次；最后72℃延伸10min。
7.根据权利要求5所述的水稻种子快速萌发分子筛选方法，其特征在于SSR分子标记YB20的上下游引物扩增籼稻品种IR28或者IR28与粳稻杂交后代的基因组DNA，如果能够扩增出133bp的扩增片段，则标志着qGS11的籼稻IR28增效等位基因存在，否则扩增出128bp，则表明增效等位基因没有导入。
8.根据权利要求5所述的水稻种子快速萌发分子筛选方法，其特征在于用SSR分子标记YB21的上下游引物扩增籼稻品种IR28或者IR28与粳稻杂交后代的基因组DNA，如果能够扩增出194bp的扩增片段，则标志着qGS11的籼稻IR28增效等位基因存在，否则扩增出178bp，则表明增效等位基因没有导入。
9.根据权利要求5所述的水稻种子快速萌发分子筛选方法，其特征在于用SSR分子标记RM26614的上下游引物扩增籼稻品种IR28或者IR28与粳稻杂交后代的基因组DNA，如果能够扩增出183bp的扩增片段，则标志着qGS11的籼稻IR28增效等位基因存在，否则扩增出200bp，则表明增效等位基因没有导入。