一种5-羟甲基糠醛氧化酶的高通量活性筛选方法与流程

文档序号:14890808发布日期:2018-07-07 17:47阅读:382来源:国知局

本发明属于生物技术领域,具体涉及一种5-羟甲基糠醛氧化酶的高通量活性筛选方法。



背景技术:

呋喃-2,5-二羧酸(fdca)是一种可代替传统材料用于合成高分子多聚物的新型小分子化合物。呋喃-2,5-二羧酸可由生物来源的5-羟甲基糠醛(hmf)经过3步连续的氧化反应生成。目前研究报道了一种来自甲基菌属methylovorussp.strainmp688的5-羟甲基糠醛氧化酶(hmfo),研究人员以大肠杆菌中重组表达的hmfo为催化剂,成功的将hmf转化成了fdca,但催化效率较低。由于该酶催化的反应具有重大的应用价值,因此对酶进行改造以提高其催化效率显得尤为重要。定向进化是改进生物酶的常用有效手段,但需要从大量的突变体中筛选出极少数性质提高的突变体,因此要求对突变库进行快速高效的筛选,而常规的hplc等筛选方法不仅需要昂贵的检测仪器,而且操作步骤多、费时,无法满足对活性酶进行快速定向进化的要求。另外,如若要从自然界中大批量筛选产hmfo野生菌株,常规的筛选方法也不适合。因此,建立一种快速、准确、低成本和易操作的5-羟甲基糠醛氧化酶的高通量筛选方法是很有必要的。



技术实现要素:

本发明意在提供一种5-羟甲基糠醛氧化酶的高通量活性筛选方法,以解决使用现有技术不能对活性酶进行快速筛选的问题。

为了解决上述技术问题,本发明提供如下技术方案:一种5-羟甲基糠醛氧化酶的高通量活性筛选方法,包括以下步骤:

步骤一、过夜培养:在96孔培养板的孔中均放入100~120μllb培养基,挑取含5-羟甲基糠醛氧化酶基因的菌株单克隆依次放入孔中,再将96孔培养板放入摇床,在37~40℃的温度下以250~300rmp的转速培养16~20h;

步骤二、诱导培养:向96孔培养板的孔中均加入100~120μl且浓度为0.1~0.5mmiptg的诱导剂,在16~18℃培养20~24h;

步骤三、离心收集:在5000~6000rmp的转速下离心5~10min,然后收集细胞菌体,去除培养基和诱导剂,加入150~200μl的细胞裂解液,并在20~25℃的温度下以5000~6000rmp的转速震荡1h;

步骤四、二次离心:在5000~6000rmp的转速下离心15~20min;

步骤五、提取上清液与显色反应液:从96孔培养板的每个孔中取20~50μl含5-羟甲基糠醛氧化酶蛋白的上清液置于96孔酶标板中,然后在96孔酶标板中加入含有90~100mm磷酸缓冲液、1~20mm底物和10~20μm10-acetyl-3,7-dihydroxyphenoxazine与6~10u/ml辣根过氧化物酶的显色反应液;

步骤六、检测:将96孔酶标板放入酶标仪中,在560~580nm波长下测定不同时间的光吸收值。

优选的,步骤一中,所述lb培养基的成分为:蛋白胨10g/l、酵母膏5g/l和nacl5g/l。

优选的,步骤三中,所述细胞裂解液的成分为:100mm磷酸缓冲液(ph=6.0~8.0)、1mg/l溶菌酶、10mm氯化镁,1u/mldna酶i。

本发明的工作原理及其有益效果为:相比于常规的应用hplc检测等方法检测5-羟甲基糠醛氧化酶活性,本发明建立高通量活性筛选方法具有快速、准确、低成本、易操作和高通量等优点。

附图说明

图1为5-羟甲基糠醛氧化酶的高通量活性筛选方法原理;

图2为ptrchisb-hmfo表达载体示意图;

图3为5-羟甲基糠醛氧化酶在96孔培养板中对底物hmf的活性展示;

图4为5-羟甲基糠醛氧化酶在96孔培养板中对底物ffca的活性展示。

具体实施方式

下面通过具体实施方式进一步详细的说明:(以下所述,仅是本发明的较佳实施例而已,并非对本发明作任何形式上的限制,任何未脱离本发明技术方案内容,依据本发明的技术实质对以上实施例所作的任何简单修改、等同变化与修饰,均仍属于本发明技术方案的范围内)。

实施例1:

根据已报到的hmfo蛋白序列(序列号:wp_013440946)在ncbi中比对获得相应的基因核酸序列,人工合成hmfo基因全长,并在其两端导入bamhi和sali酶切位点。用bamhi和sali进行双酶切后,与同样经过bamhi和sali双酶切的质粒ptrchis-b进行连接。用t4dna连接酶,16℃连接4h后,连接产物转化大肠杆菌dh5α。通过图1所示的5-羟甲基糠醛氧化酶的高通量活性筛选方法原理,过夜培养后,挑取长出的单克隆菌落摇菌并提取质粒,获得重组质粒ptrchis-hmfo,其示意图参见图2。最后将质粒ptrchis-hmfo转化到大肠杆菌bl21(de3)中,甘油(终浓度为20%)保存于-80℃冰箱。

实施例2:

将保存于甘油中含ptrchis-hmfo质粒的基因工程菌bl21(de3)划平板活化后,从平板上挑取46个单克隆至96孔培养板的各个孔中(含100μllb培养基),挑取2个ptrchis-b空质粒的bl21(de3)菌作为对照。将平板放入摇床,在37℃下以250rpm的转速培养过夜(约16h)后,向96孔培养板孔中加入100μl含0.2mm浓度诱导剂(诱导剂终浓度为0.1mm),转至16℃,250rpm的转速培养24h,诱导5-羟甲基糠醛氧化酶蛋白表达。然后置于5000rpm的转速下离心5min收集菌体细胞,在去除培养基后加入200μl细胞裂解液,常温下充分震荡1h。最后置于5000rpm的转速下离心15min,从每个孔中取50μl含5-羟甲基糠醛氧化酶蛋白的上清液于96孔酶标板中。向酶标板中加入含有10mmhmf底物的150μl反应液,置于酶标仪中,利用kinetic模式测定每个孔在560nm波长下的光吸收增加值,比较每个孔中酶的活性(图3)。结果表明,在每一个含有ptrchis-b质粒的孔中均检测到了明显的活性,表明本方法能成功检测5-羟甲基糠醛氧化酶对底物hmf的活性。更重要的是,每个孔中的酶活性值基本一致,不同孔间的标准误差仅为5%,表明本方法带来的实验误差非常小,可用于高通量的活性筛选。

实施例3:

参照实施例2的方法和步骤获得含5-羟甲基糠醛氧化酶蛋白的粗酶液,取50μl粗酶液于96孔酶标板中。向96孔酶标板中加入含有10mmffca底物的150μl反应液,半小时后置于酶标仪中,利用endpoint模式测定每个孔在560nm波长下的光吸收值,比较每个孔中酶的活性(图4)。结果表明,在每一个含有ptrchis-b质粒的孔中均检测到了明显的活性,表明本方法能成功检测5-羟甲基糠醛氧化酶对底物ffca的活性。同样,每个孔中的酶活性值基本一致,不同孔间的标准误差仅为8%,表明本方法带来的实验误差非常小,可用于高通量的活性筛选。

实施例4:

使用引物f:5’-gggaattccatatgactgatacgatttttgac-3’和r:5’-cgcggatccttaagcctgggtcagaatc-3’,以ptrchis-hmfo质粒dna为模板,利用易错pcr,构建hmfo随机突变体库。pcr反应体系如下:10×taqbuffer5μl,mgcl21.5mm,dntp0.4mm,dna模板10ng,dmso3%,上下游引物各0.5μl、mncl20.01mm,ddh2o补至50μl。将pcr片段导入表达载体ptrchis-b后转化大肠杆菌dh5α,过夜培养后收集平板上的菌株单克隆,再次提取质粒并导入大肠杆菌bl21(de3),获得突变体库。过夜培养后挑取单克隆至96孔平板,按照实施例2中的方法培养获得hmfo酶蛋白。接着按照实施例2中检测方法,筛选突变体对hmf的活性。结果表明,利用此高通量筛选方法,成功筛选到了一些活性提高2-10倍的酶蛋白突变体,说明本发明的方法可以成功应用于5-羟甲基糠醛氧化酶突变体的筛选。

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