用作诱发抗原特异性T细胞反应的免疫原性增强剂的融合蛋白的制作方法

本发明主要涉及融合蛋白，并且更具体地涉及增强t细胞介导的免疫反应的融合蛋白。

背景技术：

分子生物学已使亚单位疫苗的生产成为可能，其中，免疫原为母蛋白或母复合物的片段或亚单位。所需要的是可诱发t细胞致敏反应又能足够灵活的并入来自许多感染源的毒株的序列的稳定疫苗的开发。

技术实现要素：

一方面，本发明涉及一种融合蛋白，其包含：

(a)抗原呈递细胞(apc)结合域或cd91受体结合域，其位于所述融合蛋白的n端；

(b)蛋白转导域，其位于所述apc结合域或cd91受体结合域的c端，所述蛋白转导域选自：

(i)融合多肽，其包含t细胞致敏信号转导肽、连接子及转位肽，其中：

(1)所述t细胞致敏信号转导肽位于所述融合多肽的n端；

(2)所述连接子包含seqidno:15，其连接所述t细胞致敏信号转导胜肽与所述转位肽；且

(3)所述转位肽的长度为34-112个氨基酸残基，且包含与seqidno:3、seqidno:20或seqidno:4至少90％相同的氨基酸序列；

(ii)t细胞致敏信号转导肽；及

(iii)长度为34-112个氨基酸残基的转位肽，其包含与seqidno:3、seqidno:20或seqidno:4至少90％相同的氨基酸序列；及

(c)病原体的抗原，其位于所述蛋白转导域的c端；

其中：

所述t细胞致敏信号转导肽的长度为28-53个氨基酸残基，且包含与seqidno:31至少90％相同的氨基酸序列，其中xaa⁸为i或l；xaa¹⁰为v、f或a；xaa¹¹为m或l；xaa¹⁷为l或i；且

若所述蛋白转导域为所述转位肽(biii)，则所述apc结合域或cd91受体结合域无假单胞菌外毒素a(pe)结合域i的氨基酸序列。

在本发明的一个实施方式中，所述apc结合域或所述cd91受体结合域为包含与选自seqidno:5、seqidno:9、seqidno:6、seqidno:7及seqidno:8的序列至少90％相同的氨基酸序列的多肽。或者，所述apc结合域选自受体相关蛋白-1(rap1)区域iii、α-2-巨球蛋白受体相关蛋白(a2m)、hiv-tat、热休克蛋白(hsp)及假单胞菌外毒素a(pe)结合域i。

在本发明的另一个实施方式中，所述融合蛋白无假单胞菌外毒素a(pe)结合域i的氨基酸序列。

在本发明的另一个实施方式中，所述融合蛋白进一步包含位于所述融合蛋白c端的内质网(er)滞留序列。

在本发明的另一个实施方式中，所述内质网滞留序列包含氨基酸序列lys-asp-glu-leu(seqidno:14)。所述er滞留序列可包含选自seqidno:14、seqidno:16至seqidno:19的序列。或者，所述er滞留序列可由选自seqidno:16至seqidno:19的序列组成。

在本发明的另一个实施方式中，若所述抗原含有10个或更多抗原决定簇，则所述融合蛋白的c端无内质网滞留序列。

在本发明的另一个实施方式中，所述蛋白转导域为融合多肽(bi)。

在本发明的另一个实施方式中，所述蛋白转导域为t细胞致敏信号转导肽(bii)。

在本发明的另一个实施方式中，所述融合蛋白在所述蛋白转导域与所述抗原之间进一步包含另一连接子，所述另一连接子包含seqidno:15。

在本发明的另一个实施方式中，所述蛋白转导域为转位肽(biii)。

在本发明的另一个实施例方式中，所述融合蛋白在所述apc结合域或所述cd91受体结合域与所述转位肽之间进一步包含另一连接子，所述另一连接子包含seqidno:15。

在本发明的另一个实施方式中，所述蛋白转导域包含seqidno:30。

在本发明的另一个实施方式中，所述apc结合域包含与选自seqidno:5、seqidno:9、seqidno:6、seqidno:7及seqidno:8的序列至少95％相同的氨基酸序列。

在本发明的另一个实施方式中，所述apc结合域或所述cd91受体结合域为包含选自seqidno:5、seqidno:9、seqidno:6、seqidno:7及seqidno:8的氨基酸序列的多肽。

在本发明的另一个实施方式中，所述t细胞致敏信号转导肽包含与seqidno:1或seqidno:2至少90％相同的氨基酸序列。

在本发明的另一个实施方式中，所述t细胞致敏信号转导肽包含选自seqidno:1及seqidno:2的氨基酸序列。

在本发明的另一个实施方式中，所述转位肽包含选自seqidno:3、seqidno:20及seqidno:4的氨基酸序列。

在本发明的另一个实施方式中，所述转位肽的长度为34-61个氨基酸残基。

在本发明的另一个实施方式中，前述融合蛋白的蛋白转导域具有以下特征：(i)所述t细胞致敏信号转导肽包含seqidno:1或seqidno:2的氨基酸序列；且(ii)所述转位肽包含与seqidno:3至少95％相同的氨基酸序列。

所述t细胞致敏信号转导肽显示出诱发识别并结合于t细胞上cd28受体的k¹(x)²e³(x)⁴(x)⁵y⁶p⁷p⁸p⁹y¹⁰氨基酸序列(seqidno:32)的抗体的特征，其中，(x)²为i或l；(x)⁴为v、f或a；且(x)⁵为m或l。

另一方面，本发明涉及一种融合蛋白，其由下列各项所组成：

(a)抗原呈递细胞(apc)结合域或cd91受体结合域，其位于所述融合蛋白的n端；

(b)蛋白转导域，其位于所述apc结合域或cd91受体结合域的c端，所述蛋白转导域选自：

(i)融合多肽，其包含t细胞致敏信号转导肽、连接子及转位肽，其中：

(1)所述t细胞致敏信号转导肽位于所述融合多肽的n端；

(2)所述连接子包含seqidno:15，其连接所述t细胞致敏信号转导肽与所述转位肽；且

(3)所述转位肽的长度为34-112个氨基酸残基，其包含与seqidno:3、seqidno:20或seqidno:4至少90％相同的氨基酸序列；

(ii)t细胞致敏信号转导肽；及

(iii)34-112个氨基酸残基长度的转位肽，，其包含与seqidno:3、20或4号至少90％相同的氨基酸序列；及

(c)病原体的抗原，其位于所述蛋白转导域的c端；

其中：

所述t细胞致敏信号转导肽的长度为28-53个氨基酸残基，且包含与seqidno:31至少90％相同的氨基酸序列，其中，xaa⁸为i或l；xaa¹⁰为v、f或a；xaa¹¹为m或l；xaa¹⁷为l或i；且

若所述蛋白转导域为所述转位肽(biii)，则所述apc结合域或所述cd91受体结合域无假单胞菌外毒素a(pe)结合域i的氨基酸序列。

所述抗原呈递细胞(apc)可以选自树突细胞、巨噬细胞、b细胞及单核细胞。

在本发明的一个实施方式中，所述apc的细胞膜包含cd91受体。

另一方面，本发明涉及一种疫苗组合物，其包含：(a)治疗有效量的前述融合蛋白；及(b)佐剂。

所述佐剂为抗原传送剂或免疫增效剂。在本发明的一个实施方式中，所述疫苗组合物包含抗原传送剂而无免疫增效剂。

此外，在另一方面，本发明涉及一种诱导增强的病原体抗原特异性t细胞反应的方法，其包括：对有此需要的受试者施用包含治疗有效量的前述融合蛋白的疫苗组合物；以及由此诱导增强的病原体抗原特异性t细胞反应。

此外，在另一方面，本发明涉及一种杀死通过疾病细胞的细胞膜上的第i类主要组织相容性复合体(mhc)分子呈递抗原的疾病细胞的方法，其包括：对有此需要的受试者施用疫苗组合物，所述疫苗组合物包含治疗有效量的前述融合蛋白；以及由此杀死通过疾病细胞的细胞膜上的第i类mhc分子呈递抗原的疾病细胞。

在本发明的一个实施方式中，所述疾病细胞为癌细胞。

在又一个方面，本发明涉及一种预防、治疗由病原体所引起的感染和/或将由感染所引起的症状减至最少的方法，其包括：对有此需要的受试者施用疫苗组合物，所述疫苗组合物包含治疗有效量的本发明的融合蛋白；以及由此预防、治疗由病原体所引起的感染和/或将由感染所引起的症状减至最少。本发明还涉及前述融合蛋白或疫苗组合物，其用于诱导增强的病原体抗原特异性t细胞反应，或用于杀死通过疾病细胞的细胞膜上的第i类mhc分子呈递抗原的疾病细胞，或用于预防、治疗由病原体所引起的感染和/或将由感染所引起的症状减至最少。

所述病原体可以是选自人乳头瘤病毒(hpv)、猪繁殖与呼吸综合症病毒(prrsv)、人免疫缺陷病毒(hiv-1)、流感病毒、登革热病毒、丙型肝炎病毒(hcv)、乙型肝炎病毒(hbv)及猪环状病毒2(pcv2)中的至少一种。

在本发明的一个实施方式中，前述的融合蛋白为用于增强有此需要的受试者的抗原特异性细胞毒性t细胞反应。所述融合蛋白在有此需要的受试者体内，亦可用于增强抗原特异性cd4+t细胞反应，或用作诱导增强的抗原特异性抗体效价反应的免疫原性增效剂。

由下述结合以下附图的优选实施方式的描述将明显可见这些及其他方面，但是在不偏离本说明书的新概念的实质和范围的情况下可影响其中的变化和修改。

附图显示本发明的一种或多种实施方式，并与书面说明共同用于解释本发明的原理。在可能情况下，整个附图使用的附图标记指实施例的相同或相似要素。

附图说明

图1为载体图谱。

图2为显示融合蛋白的sds-page分析结果的照片。

图3为载体图谱。

图4为显示本发明的一个实施方式的示意图。

图5a显示免疫接种程序表。

图5b为显示融合蛋白的sds-page分析结果的照片。

图5c-d分别为显示接种不同融合蛋白或安慰剂的动物组的肿瘤大小曲线及无肿瘤小鼠的百分比。

图6为制备融合蛋白的流程图(左图)，以及显示融合蛋白的sds-page分析结果的照片(右图)。

图7为显示t细胞致敏融合蛋白作用机理的示意图。

图8显示不同物种的cd28的序列比对。

图9a显示免疫接种程序表。

图9b-c分别显示接种不同融合蛋白或安慰剂的动物组的肿瘤大小曲线及存活率。

图10为显示用于由病原体产生含有dna插入片段的质粒的含有rap1的载体的示意图。

图11为显示含有各种病原体的抗原的融合蛋白结构的示意图。

图12a-f为显示各种融合蛋白的sds-page分析结果的照片。

图13a-b显示动物组、用于免疫动物的疫苗与剂量，以及免疫接种程序表。

图14a-d为显示来自已接种安慰剂或含有e716、e718、hcv核心或hbx抗原的融合蛋白的图13a的动物组的cd3+/cd4+脾细胞及cd3+/cd8+脾细胞的体外(exvivo)抗原特异性免疫反应的分析结果的表格。

图15a-j显示来自已接种安慰剂或含有pcv2(图15a-b)或prrsv抗原(图15c-j)的融合蛋白的图13a的动物组的cd3+/cd8+脾细胞及cd3+/cd4+脾细胞的体外抗原特异性免疫反应分析的ifnγ+细胞计数。

具体实施方式

在以下仅意欲作为说明的实施例中更具体地描述本发明，因为对本领域的技术人员来说其中的修改和变化将明显可见。现在，详细描述本发明的各种实施方式。参考附图，整个图中相同标号表示相同部分。当在此用于说明书和接着的整个权利要求时，除非上下文另外载明，否则“一”、“一个”及“该”的意思包括多个引用项目。并且，当在此用于说明书和接着的整个权利要求时，除非上下文另外载明，否则“在…中”的意思包括“在…中”及“在…上”。此外，为读者的便利在说明书中可以使用标题及小标题，其不应当影响本发明的范围。因此，以下将更具体地定义用于本说明书的若干术语。

定义

用于本说明书的术语在本发明的上下文中及使用各术语的特定上下文中通常在本领域中具有它们的通常涵义。以下或在本说明书的其他地方将讨论用以描述本发明的某些术语以向从业者提供关于本发明的描述的额外指导。为便利，某些术语可能例如使用斜体和/或引号来突出显示。突出显示的使用不影响术语的范围与意义；在相同上下文中术语的范围与意义相同，无论是否突出显示。将意识到同一件事能够以不止一种方式表达。因此，可选择的语言和同义词可以用于在此讨论的任一一种或多种术语，并无任何特殊意义强加于是否在此详细说明或讨论术语。提供某些术语的同义词。一种或多种同义词的列举不排除其他同义词的使用。本说明书中任何地方的实施例的使用(包括在此所讨论的术语的实施例)仅供说明之用，而非用于限制本发明或任何示例性术语的范围与意义。同样地，本发明不局限于在本说明书中给出的各种实施方式。

除非另有定义，在此使用的所有技术与科学术语与本领域中关于本发明的普通技术人员中的一个通常所理解的具有相同含义。若有相互冲突之处，则以本说明书及其所提供的定义为解释依据。

如在此使用的，“左右”、“约”或“大约”通常指在给出的数值或范围的20％以内，优选在10％以内，并且更优选在5％以内。在此给出的数量是大约的，指如果没明确规定能够推测术语“左右”、“约”或“大约”。

术语“抗原呈递细胞(apc)或辅助细胞”指呈现与其表面上的主要组织相容性复合体(mhc)复合的外源抗原的细胞。t细胞可使用它们的t细胞受体(tcr)来识别这些复合体。这些细胞加工抗原并且向t细胞呈递它们。专业抗原呈递细胞主要类型：树突细胞(dc)、巨噬细胞、单核细胞及若干b细胞。

术语“抗原呈递细胞(apc)结合域”指能够结合抗原呈递细胞(apc)的区域。所述apc结合域可为多肽，其包含与选自seqidno:5、seqidno:6、seqidno:7、seqidno:8及seqidno:9的序列至少90％相同的氨基酸序列。apc结合域为识别并结合在apc上的受体的配体。

分化簇91(cd91)为在细胞膜中形成受体且参与受体介导的内吞作用的蛋白质。

术语“蛋白转导域”指具有致敏t细胞并且因此增强抗原特异性t细胞反应，和/或将抗原导向或指向(即，靶向)抗原呈递的第i类主要组织相容性复合体(mhc-i)通路(即，细胞毒性t细胞通路)的功能的多肽或融合多肽。

术语“致敏t细胞”通常指致敏cd8+及cd4+t细胞，并且因此增强cd8+(ctl)及cd4+t细胞对抗原激发的反应。抗原特异性细胞介导的免疫反应通过在对抗原的反应中定量抗原特异性诱导的γ-干扰素的产生来测量。例如，在无致敏信号(即，无蛋白转导域)的情况下，抗原仅能诱导微弱的细胞介导免疫反应，或根本无法诱导细胞介导的免疫反应，即，cd8+及cd4+t细胞仅制造出少量抗原特异性γ-干扰素，或未制造出抗原特异性γ-干扰素，但在致敏信号(蛋白转导域)存在的情况下，所述抗原可诱导增强的细胞介导的免疫反应。因此，致敏信号(蛋白转导域)的作用在于敏化宿主体内的cd4+及cd8+t细胞，以使得当宿主日后被抗原激发时，由于先前cd4+及cd8+t细胞致敏，所述抗原可可诱导增强的抗原特异性细胞介导的免疫反应。

蛋白转导域可为肽和/或多肽，其选自：

(i)融合多肽，其包含t细胞致敏信号转导肽、连接子及转位肽，其中：

(1)所述t细胞致敏信号转导肽位于所述融合多肽的n端；

(2)所述连接子包含seqidno:15，其连接所述t细胞致敏信号转导肽与所述转位肽；且

(3)所述转位肽的长度为34-112个氨基酸残基，且包含与seqidno:3、seqidno:20或seqidno:4至少90％相同的氨基酸序列；

(ii)t细胞致敏信号转导肽；及

(iii)长度为34-112个氨基酸残基的转位肽，其包含与seqidno:3、seqidno:20或seqidno:4至少90％相同的氨基酸序列。

蛋白转导域可为“融合多肽”，其中，所述融合多肽包含t细胞致敏信号转导肽、连接子及转位肽。例如，所述融合多肽可为多肽“cd28convpet”。

术语“cd28conv”指cd28保守区，其为“t细胞致敏信号转导肽”。其为诱发cd28激动剂抗体的抗原决定簇。

术语“pet”指长度为34-112个氨基酸残基的转位肽。

“cd28conv”与“pet”之间存在连接子。融合多肽“cd28convpet”的方向或排列方式至关重要，因为“cd28conv”(或t细胞致敏信号转导肽)必须位于pet(或转位肽)的上游，即，pet必须位于“cd28conv”的c端以获得增强的t细胞反应。“cd28convpet”与反向融合肽petcd28conv相比可很大程度上提高对cd28conv具有特异性的igg效价(称为cd28特异性激动剂抗体)。所述cd28特异性激动剂抗体可致敏cd4+及cd8+t细胞。方向正确的融合多肽cd28convpet在cd28conv与pet区域之间含有连接子(rxrxkr)。所述连接子含有抗原呈递细胞(apc)特异性蛋白酶(组织蛋白酶l)切割位点lys-arg(kr)。因此，所述融合蛋白rap1-cd28convpet-抗原-k3可经消化后将形成两个片段：rap1-cd28conv及pet-抗原-k3。rap1-cd28conv片段可在溶酶体中进一步被消化，然后通过mhcii通路向apc细胞表面呈递cd28conv的抗原决定簇，其又诱发产生cd28激动剂抗体的体液免疫反应。因此，cd28激动剂抗体由b细胞产生。所述cd28激动剂抗体可结合t细胞表面上的cd28，并预先活化t细胞(cd4+及cd8+t细胞)。

“t细胞致敏信号转导肽”的长度为28-53个氨基酸残基，且包含与seqidno:31至少90％相同的氨基酸序列，其中，xaa⁸为i或l；xaa¹⁰为v、f或a；xaa¹¹为m或l；xaa¹⁷为l或i。

所述t细胞致敏信号转导肽包含关键区k¹(i/l)²e³(v/f/a)⁴(m/l)⁵y⁶p⁷p⁸p⁹y¹⁰(seqidno:32)，其中，(x)²为i或l；(x)⁴为v、f或a；(x)⁵为m或l。

以下实施例使用对小鼠具有特异性的t细胞致敏信号转导肽(tdiyfckiefmypppyldneksngtiih，seqidno:31，其中，x⁸为i，x¹⁰为f，x¹¹为m)。

图7为以融合蛋白rap1-cd28convpet-e7-k3为例显示t细胞致敏融合蛋白的作用机理的示意图。rap1-cd28convpet-e7-k3自n端至c端依序包含：(1)位于n端的全长rap1的区域iii；(2)cd28conv；(3)连接子；(4)来自假单胞菌外毒素a的修饰的转位肽；(5)全长第16型hpve7蛋白；及(6)位于c端作为er滞留信号的三段kdel。hpv16e7蛋白被加工成用融合蛋白免疫的受试者细胞内的抗原决定簇。相较于仅含有抗原的传统疫苗，rap1-cd28convpet-e7-k3可诱发较佳的细胞毒性t细胞(ctl)反应。设计rap1-cd28convpet-e7-k3蛋白来改善apc(如树突细胞)的摄取率并且增强向蛋白酶体途径的hpv16e7抗原加工，然后通过mhci复合体呈递。由疫苗rap1-cd28convpet-e7-k3诱发的hpv16e7蛋白特异性ctl免疫反应的作用机理如图7所示：(a)疫苗结合apc(如树突细胞)表面受体(cd91)，并经由内吞作用而内在化；(b1)rap1-cd28convpet-e7-k3因组织蛋白酶l蛋白酶在转位肽pet前的位点进行消化而经过蛋白水解；(b2)或rap1-cd28convpet-e7-k3循环至e.r.，并且因弗林蛋白酶在转位肽pet前的位点而经过蛋白水解；(b3)与此同时，rap1-cd28conv由溶酶体蛋白酶消化，然后通过mhcii向细胞表面呈递cd28conv的抗原决定簇，并且诱发cd28激动剂抗体的产生，这能预先活化t细胞；(c)最重要的步骤是通过转位肽(pet)使pet-e7-k3从溶酶体跨膜转位进入细胞质区室；(d)pet-e7-k3经蛋白酶体途径进行消化，然后通过mhci复合体呈递e7的抗原决定蔟，并诱发对e7特异性细胞介导的免疫反应。

图8显示不同物种的cd28保守区序列比对及其共有序列。共有序列中画线的序列(kievmypppy；seqidno:32，其中，x²为i，x⁴为v，x⁵为m)为cd28激动剂抗体识别与结合的关键区。该关键区可以k¹(i/l)²e³(v/f/a)⁴(m/l)⁵y⁶p⁷p⁸p⁹y¹⁰表示，其中，仅在此的第四个氨基酸残基为物种特异性的：并且在人类、大鼠、猪、牛、绵羊、狗及马中应为v；在小鼠中应为f；在火鸡中应为v。所述关键区序列可用k¹(x)²e³(x)⁴(x)⁵y⁶p⁷p⁸p⁹y¹⁰(seqidno:32)表示，其中，(x)²为i或l；(x)⁴为v、f或a；(x)⁵为m或l。

pet可包含与seqidno:3或seqidno:20至少90％相同的氨基酸序列。例如，pet的氨基酸序列可为pe的a.a.280-a.a.313(seqidno:3)、a.a.268-a.a.313(seqidno:20)、a.a.253-a.a.313或a.a.253-a.a.364(seqidno:4)。换言之，pet的氨基酸序列可含有pe区域ii(a.a.253至a.a.364；seqidno:4)的任一区，只要其包含a.a.280-a.a.313(seqidno:3)必要的片段即可。

抗原可为病原体蛋白、多肽或肽，其可导致由病原体所引发的疾病的原因，或能够在病原体所感染的宿主体内诱发免疫反应；或为在肿瘤细胞内特异性表达的多肽的肿瘤相关抗原(taa)。所述抗原可选自病原体或癌症细胞，其包括但不局限于人乳头瘤病毒(hpv)、prrsv、hiv-1、流感病毒、登革热病毒、丙型肝炎病毒(hcv)、乙型肝炎病毒(hbv)、猪环状病毒2(pcv2)、非小细胞肺癌、乳癌、黑色素瘤、淋巴瘤、结肠癌、肝细胞癌，及它们的结合。例如，hpve7蛋白(e7)、hcv核心蛋白(hcv核心)、hbvx蛋白(hbx)选作开发疫苗的抗原。所述抗原可为两种以上的抗原(选自一或多种病原体蛋白)融合而成的融合抗原。例如，prrsvorf6与orf5的融合抗原，或prrsv与pcv2病原体的抗原蛋白的融合。

内质网滞留序列的作用在于协助从内吞区室至er的抗原转位，并将其留在内腔中。内质网滞留序列包含序列lysaspgluleu(kdel)或rdel。er序列可包含序列kkdlrdelkdel(seqidno:16)、kkdelrdelkdel(seqidno:17)，kkdelrvelkdel(seqidno:18)，或基本上上由序列kkdlrdelkdel(seqidno:16)、kkdelrdelkdel(seqidno:17)，kkdelrvelkdel(seqidno:18)组成，或由序列kkdlrdelkdel(seqidno:16)、kkdelrdelkdel(seqidno:17)，kkdelrvelkdel(seqidno:18)组成。

分子量为39kda(千道尔顿)的受体相关蛋白(rap1)为er驻留蛋白，且为低密度脂蛋白受体相关蛋白的分子伴侣(molecularchaperone)。rap1对cd91具有高结合亲和度(kd～3nm)，且由三个功能类似的区域构成。

本发明涉及通过根据本发明的融合蛋白的t细胞介导的免疫反应的诱导和增强的发现。以rap1-cd28convpet-e7-k3为例，rap1-cd28convpet-e7-k3疫苗的策略主要致力于刺激t细胞的产生与活化，其能识别的表达靶抗原e7的hpv16受感染细胞。通过传递抗原至树突细胞，能产生抗原特异性cd8+t细胞及cd4+t细胞。第1型辅助cd4+t细胞尤能有效刺激并增强细胞毒性cd8+t细胞的免疫反应。同时，适应性免疫系统的这两个部分具有于身体多个位点杀死hpv16受感染细胞或与hpv16相关的肿瘤细胞而不对正常组织造成显著损伤。

术语“受试者”指人类或非人类动物。

术语“治疗”指对已患有癌症或感染、或有该疾病症状或诱因的有此需要的受试者施用有效量的融合蛋白，藉以治愈，减轻，解除，改善，缓解或预防疾病、其症状或其诱因。基于任一适当诊断方法的结果能够由健康护理专业人士识别该受试者。

术语“有效量”指给予治疗的受试者治疗效果所需的活性化合物的量。如本领域的技术人员所公认的，有效剂量将根据施用的途径、赋形剂的使用以及与其他治疗手段共用的可能性而变化。

缩写：cd28，分化簇28。

实施例

以下给出根据本发明实施方式的例示性的仪器、设备、方法与它们相关的结果，而不意欲限制本发明的范围。请注意，为读者的便利，标题或子标题可以用于实施例，其不应限制本发明的范围。此外，在此提出或说明某些理论；但是，不论它们正确或错误，它们不应当限制本发明的范围，只要本发明为根据其本身实践，不管任一特定理论或实行方案。

实施例1

表达载体的构建

图1显示融合蛋白rap1-pe268-313-e7-k3的表达载体，其包含rap1区域3(seqidno:5)、转位最小基本肽(pe268-313；seqidno:20)、抗原e7及内质网滞留序列(k3，或kdel信号；seqidno:16、seqidno:17、seqidno:18或seqidno:19)。转位最小基本肽(pe268-313；seqidno:20)为从a.a.268至a.a.313的pe(seqidno:10号)多肽序列区获得的。

所述表达载体为利用图10所示的质粒rap1-k3构建。含有rap-1区域3与k3的融合基因的质粒rap1-k3(图10)如下产生：通过pcr法合成编码^ndeirap1-^(ecori,xhoi)-k3^xhoi的dna片段，然后利用卡那霉素抗药基因连接到质粒puc18骨架中获得质粒rap1-k3(图10)。为产生表达载体rap1-pe268-313-e7-k3(图1)，将编码pe268-313-e7的dna片段插入质粒rap1-k3中(图10)。运用类似方法，通过pcr产生编码各种融合肽的dna片段(图11)，并将其分别插入质粒rap1-k3(图10)中以产生各种融合蛋白的表达载体(图12a-f)。图3显示融合蛋白rap1-cd28convpet-e7-k3的表达载体(图3)。

cd28convpet片段含有组织蛋白酶l及弗林蛋白酶的切割位点。图4显示融合蛋白rap1-cd28convpet-e7-k3的氨基酸序列图谱来说明cd28convpet片段的重要性。两箭头分别指示组织蛋白酶l及弗林蛋白酶的切割位点。这两个切割位点不仅可用做连接cd28conv与pet-e7的连接子，还允许融合蛋白的切割，以便将pet-e7-k3片段从溶体释放至细胞质中。由各种病原体引起的任何其他目的抗原可取代e7来与cd28convpet融合，之后再将所述融合产物插入到图10的质粒中，以形成图11所示的各种融合蛋白的表达载体。

pe268-313的序列为：pletftrhrqprgweqleqcgypvqrlvalylaarlswnqvdqvir(seqidno:20)。cd28convpet的完整序列如下：tdiyfckiefmypppyldneksngtiihrarykrgweqleqcgypvqrlvalylaarlswnqvdqvirgs(seqidno:30)，画线的序列代表含有组织蛋白酶l与弗林蛋白酶切割位点的连接子序列。

实施例2

蛋白表达

带有蛋白表达载体的大肠杆菌(e.coli)bl21细胞在37℃下，在含有25μg/ml卡那霉素的luriabertani培养基中培养。当培养物到达早期对数生长期(a600＝0.1至0.4)时，加入异丙基-β-d-硫代半乳糖苷(iptg)，使其最终浓度为0.5至2mm以达诱导的目的。在iptg诱导4小时后，收集细胞并通过声波震荡来干扰。将含有过表达蛋白的包涵体分离出来，并在8m尿素/tn缓冲液(8m尿素、50mm(tris)、50mmnacl，ph8.0)中溶解。

融合蛋白rap1-pe268-313-e7-k3的再折叠在4℃下，通过50x体积的tnz缓冲液(50mmtris、50mmnacl及0.01mmzncl2，ph8.0)透析过夜来进行。再折叠的蛋白在还原(包含二硫苏糖醇；+dtt)及非还原(不含二硫苏糖醇；-dtt)条件下经过sds-page分析(图2)。分析结果显示，大部分再折叠的蛋白在非还原条件下为单体，显示所述rap1融合蛋白容易再折叠且未聚集(图2)。

图6a为显示表达融合蛋白rap1-cd28pet-e7-k3(其含有小鼠cd28conv或人类cd28conv)并从e.coli细胞的包涵体中萃取而出的流程图。sds-page分析显示，融合蛋白已充分再折叠(图6b)。

图11显示以如下描述的类似方法表达的融合蛋白的列表：(1)rap1-pe268-313-e7-k3；(2)rap1-cd28convpet-e7-k3；(3)rap1-cd28pet-e718-k3；(4)rap1-hcv核心-k3；(5)rap1-cd28conv-hcv核心-k3；(6)rap1-cd28convpet-hcv核心-k3；(7)rap1-hbx；(8)rap1-hbx-k3；(9)rap1-cd28conv-hbx；(10)rap1-cd28conv-hbx-k3；(11)rap1-cd28convpet-hbx；(12)rap1-cd28convpet-hbx-k3；(13)rap1-pcv2orf2-k3；(14)rap1-pe268-313-pcv2orf2-k3；(15)rap1-cd28convpet-pcv2orf2-k3；(16)rap1-pe268-313-dgd-k3；(17)rap1-pe268-313-m12-k3；(18)rap1-pe268-313-pqab-k3；(19)rap1-pe268-313-rsab-k3；(20)rap1-cd28convpet-dgd-k3；(21)rap1-cd28convpet-m12-k3；(22)rap1-cd28convpet-pqab-k3；(23)rap1-cd28convpet-rsab-k3。使用上述相同的方法再折叠融合蛋白。sds-page分析的结果显示，这些融合蛋白均已充分再折叠，并且因此用于制备疫苗(图12a-f)。

实施例3

rap1-pe268-313-e7-k3抑制第16型人乳头瘤病毒(hpv)e7蛋白所诱导的肿瘤生长

如上所述表达所述融合蛋白pe407-e7-k3及rap1-pe268-313-e7-k3，并通过sds-page检查蛋白再折叠(图5b)。小鼠通过皮下注射用2x10³个tc-01细胞(带有第16型hpve7基因的小鼠肺部上皮细胞系)激发，以诱导第16型hpv癌。所述tc-01细胞激发后十二天，小鼠每周一次连续3周经皮下注射接种安慰剂(磷酸盐缓冲溶液+磷酸铝)、pe407-e7-k3(200μg/剂)或rap1-pe268-313-e7-k3(200μg/剂)(均以as04c(glaxosmithkline)为佐剂)(图5a)。为细胞毒性t淋巴细胞增强佐剂的as04c包含mpl(单磷酯脂a，免疫增效剂)及磷酸铝(用于抗原传递的蛋白质吸收剂)。术语“k3”代表氨基酸序列kdelkdelkdel(seqidno:19)。各组的肿瘤大小及无肿瘤动物数均加以记录(图5c-d)。以as04c为佐剂的两种疫苗pe407-e7-k3及rap1-pe268-313-e7-k3显著抑制肿瘤生长。但是，接种rap1-pe268-313-e7-k3的小鼠组具有较高比例的无肿瘤小鼠。其显示疫苗rap1-pe268-313-e7-k3在抑制肿瘤生长方面与pe407-e7-k3一样有效，或更为有效，而在提高无肿瘤动物的比例方面更好。

实施例4

rap1-cd28convpet-e7-k3可抑制第16型人乳头瘤病毒(hpv)e7蛋白所诱导的肿瘤生长并提高存活率

检验有或没有免疫增效剂的融合蛋白pe407-e7-k3及rap1-cd28convpet-e7-k3对肿瘤大小及存活率的影响。小鼠经皮下注射以较高剂量(3x10⁴)的tc-01细胞激发。激发后七天，小鼠以每周一次连续3周经皮下注射接种有免疫增效剂gpi-0100或蛋白质吸收剂磷酸铝的安慰剂、pe407-e7-k3(100μg/剂)或rap1-cd28convpet-e7-k3(100μg/剂)(图9a)。gpi-0100为th1/ctl刺激佐剂(免疫增效剂)。各组的肿瘤大小及存活率均加以记录(图9b-c)。当与佐剂gpi-0100结合时，pe407-e7-k3及rap1-cd28convpet-e7-k3两者抑制肿瘤生长。意外地，发现rap1-cd28convpet-e7-k3抑制肿瘤生长的效果不取决于佐剂。当与所述蛋白质吸收剂磷酸铝结合而未与佐剂gpi-0100结合时，rap1-cd28convpet-e7-k3仍可以与免疫增效剂gpi-0100结合时的相同效力有效抑制肿瘤生长(图9b，空心三角形对实心反向三角形)。

相比之下，pe407-e7-k3抑制肿瘤生长的效力取决于佐剂。当与蛋白质吸收剂磷酸铝结合时，pe407-e7-k3的效力低于与所述免疫增效剂gpi-0100结合时的效力(图9b，实心正方形对空心圆形)。

另一方面，就存活率而言，施用与所述免疫增效剂gpi-0100或所述蛋白质吸收剂磷酸铝结合的rap1-cd28convpet-e7-k3的小鼠具有比接种与gpi-0100或磷酸铝结合的pe407-e7-k3更高的存活率(图9c)。其显示，rap1-cd28convpet-e7-k3即使无免疫增效剂gpi-0100，仍可诱发th1/ctl免疫反应。所述结果亦显示，作为用于提高动物存活率的疫苗，所述融合蛋白rap1-cd28convpet-e7-k3优于pe407-e7-k3。

实施例5

免疫原性分析

测试多种疫苗的免疫原性。小鼠分为下列各组：hpv16e7、hpv18e7、hcv核心、hbvhbx、pcv2orf2及prrsv(图13a)，各组再划分为数个亚组，各亚组依每周一次连续3周经皮下注射安慰剂或针对病原体的一种或多种抗原而设计的疫苗(图13b)。针对prrsv的疫苗除外，各个疫苗由单一融合蛋白及吸收剂磷酸铝组成，其中，所述单一融合蛋白含有病原体的至少一种抗原。所述抗原为病原体的全长蛋白，或为含有病原体的抗原的至少一种抗原决定簇的非全长蛋白，或为两种以上抗原的融合肽，其中，各抗原为选自病原体的不同蛋白。

免疫接种程序、疫苗及剂量在图13a-b中显示。简言之，小鼠每周一次连续3周接种图13a列出的疫苗。所有小鼠均在最后一次免疫7后天处死，并收集其脾脏。脾细胞经分离后，在有10μg/ml的各种病原体重组抗原的6孔培养板(2x10⁷个细胞/2ml/孔)中培养，以在37℃下在1μg/mlgolgiplug(bdpharmingen,sandiego,ca)存在下刺激脾细胞16小时。

刺激后的脾细胞以facscan缓冲液清洗，并且所述细胞表面标记cd8a、cd4及cd3则以藻红蛋白共轭的单克隆大鼠抗小鼠cd8a抗体、af700共轭的单克隆大鼠抗小鼠cd4抗体及af647共轭的单克隆大鼠抗小鼠cd3抗体染色。接着再以根据制造商的说明(bdpharmingen)的cytofix/cytoperm套组浸透并固定细胞。细胞内的ifn-γ为以af488共轭的单克隆大鼠抗小鼠ifn-γ染色，以便量测免疫反应及细胞因子水平。使用gallios流式细胞术及kaluza分析软件(beckmancoulter)进行流式细胞术分析。

测试下列prrsv疫苗的免疫原性：pe407-prrsv-k3、rap1-pe268-313-prrsv-k3或rap1-cd28convpet-prrsv-k3疫苗。各疫苗含有四种不同融合蛋白的混合物，且各融合蛋白含有选自dgd、m12、pqab及rsab的不同抗原(图13a)。小鼠的接种及脾细胞的刺激使用与上述类似的方式进行。简言之，所有小鼠在最后一次免疫后7天处死，并收集脾脏。分离脾细胞，并且分别在有10μg/ml的重组dgd、m12、pqab或rsab抗原的6孔培养板(2x10⁷个细胞/2ml/孔)中培养，以在37℃下及1μg/mlgolgiplug(bdpharmingen,sandiego,ca)存在下刺激脾细胞16小时。

“dgd”(seqidno:26)的氨基酸序列如下：rhhftpserqlclssiqtafnqgagtcilsdsgrisytvefslpthhtvrlirvtappsaldqvirnalaspgsggdlgeaireqpeqarlaltlaaaeserfvrqgtgndeagaanadvvsltcpvaagecagpadsgdallernyptgaeflgdggdvrhhftpserqlclssiqtafnqgagtcilsdsgrisytvefslpthhtvrlirvtappsa。dgd代表prrsvorf7a.a.64-a.a.123(粗体)、连接子(画线)及orf7a.a.64-a.a.123(粗体)的融合抗原。

术语“m12”代表prrsvorf1ba.a.1046-a.a.1210的抗原。其氨基酸序列(seqidno:27)如下：nnkectvaqalgngdkfratdkrvvdslraicadlegsssplpkvahnlgfyfspdltqfaklpielaphwpvvstqnnekwpdrlvaslrpldkysracigagymvgpsvflgtpgvvsyyltkfvkgeaqvlpetvfstgrievdcreylddrerevaaslph。

“pqab”(seqidno:28)的氨基酸序列如下：gsslddfcydstapqkvllafsityasndssshlqliynltlcelngtdwlankfdwa。pqab代表prrsv美洲株orf6a.a.2-a.a.26及orf5a.a.31-a.a.63(画线)的融合抗原。

rsab的氨基酸序列为mgslddfcndstaaqklvlafsitytpifvaggssstyqyiynlticelngtdwlsnhfdwa(seqidno:29)。术语“rsab”代表prrsv欧洲株orf6a.a.2-28及orf5a.a.31-64(画线)的融合抗原。

实施例6

融合蛋白rap1-cd28convpet-e7-k3的rap1区域3的片段分别由a2m最小(seqidno:6)、hiv-tat最小(seqidno:7)或hsps最小(seqidno:8)取代，以产生融合蛋白a2m-cd28convpet-e7-k3、tat-cd28convpet-e7-k3及hsp-cd28convpet-e7-k3疫苗。使用与上述类似的方法检测由这些疫苗增强的tc-1肿瘤抑制活性及细胞介导的免疫反应。表1显示各融合蛋白的组分的序列编号(seqidno)。表2显示测试融合蛋白对动物t细胞介导的免疫反应的影响的及其抗原序列。

表1

表2

在免疫原性测定中，通过测量脾细胞中cd3+/cd4+/ifnγ+及cd3+/cd8+/ifnγ+t细胞的数量来评估由各疫苗所诱导的抗原特异性细胞介导的免疫反应。结果显示，所述疫苗rap1-cd28convpet-抗原-k3可诱导强烈的t细胞反应。图14b显示，由cd28convpet-e718-k3所诱发的cd3+/cd4+/ifnγ+t细胞数为rap1-k3所诱发的细胞数的大约50倍，由cd28convpet-e718-k3所诱发的cd3+/cd8+/ifnγ+t细胞数则为rap1-k3所诱发的细胞数的9倍以上。

疫苗rap1-cd28convpet-抗原-k3在诱发t细胞介导的免疫原性方面优于pe407-抗原-k3。例如，图14a显示，由cd28convpet-e716-k3所诱发的cd3+/cd4+/ifnγ+t细胞数及cd3+/cd8+/ifnγ+t细胞数分别为pe407-e716-k3所诱发的t细胞数的大约5倍与7倍。其显示，所述疫苗rap1-cd28convpet-e7-k3具有比pe407-e7-k3更好的细胞介导的免疫原性。

当选用的抗原包含10个或多于10个抗原决定簇时，包含rap1区域iii、致敏信号cd28conv(但不含转位肽pet)、抗原及er滞留信号的融合蛋白便足以诱发强烈的抗原特异性t细胞介导的免疫反应。图14c显示疫苗rap1-cd28conv-hcv核心-k3诱发cd3+/cd4+/ifnγ+及cd3+/cd8+/ifnγ+t细胞的数量分别为安慰剂组的20倍及7.6倍的t细胞反应。抗原hcv核心含有11个众所周知的mhci抗原决定簇。

意外地，所述er滞留信号对于本发明的融合蛋白诱发强烈的细胞介导的免疫原性来说不是必要的。换言之，在er滞留序列不存在的情况下，本发明的融合蛋白仍可诱发强烈的t细胞反应。图14d显示，由rap1-cd28convpet-hbx(其不含er滞留信号k3)所诱发的cd3+/cd4+/ifnγ+及cd3+/cd8+/ifnγ+t细胞的数量为安慰剂组的7倍及74倍。

相较之下，美国专利第7378100b2号及第7335361号显示所述er滞留信号k3对pe相关的融合蛋白(pe407-抗原-k3)诱发t细胞反应来说是必须的。

还发现，包含rap1区域iii、转位肽pe218-313(但不含致敏信号cd28conv)、抗原及er滞留信号的融合蛋白优于不含rap1区域iii的pe相关的融合蛋白。图15c-j显示，所述疫苗rap1-pe268-313-prrsv-k3所诱发的cd3+/cd4+/ifnγ+及cd3+/cd8+/ifnγ+t细胞数大于所述疫苗pe407-prrsv-k3所诱发的t细胞数。

已介绍上述的本发明的示例性实施方式仅用于说明和描述的目的，并未意欲成为全面的，或意欲限制本发明至说明的精确形式。依据以上教示可实现本发明的多种修改及变化。选择并描述实施方式与实施例以便解释本发明的原理与它们的实际应用，为了使本领域的其他技术人员能够利用本发明及各种实施方式及适合预期的特定使用的各种修改。在不偏离本发明的实质和范围的情况下，本发明有关的选择性的实施方式将对本领域的这些技术人员明显可见。因此，本发明的范围由所附权利要求来界定，而非由以上说明和在此描述的示例性实施方式来界定。

序列表

<110>生控基因疫苗股份有限公司

<120>用作诱发抗原特异性t细胞反应的免疫原性增强剂的融合蛋白

<130>10021-00001

<150>us/61733879

<151>2012-12-05

<160>32

<170>patentinversion3.5

<210>1

<211>28

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>hcd28核心

<400>1

thraspiletyrphecyslysilegluvalmettyrproproprotyr

151015

leuaspasnglulysserasnglythrileilehis

2025

<210>2

<211>53

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>hcd28最大

<400>2

asncysaspglylysleuglyasngluservalthrphetyrleugln

151015

asnleutyrvalasnglnthraspiletyrphecyslysilegluval

202530

mettyrproproprotyrleuaspasnglulysserasnglythrile

354045

ilehisvallysgly

50

<210>3

<211>34

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>pet核心

<400>3

glytrpgluglnleugluglncysglytyrprovalglnargleuval

151015

alaleutyrleualaalaargleusertrpasnglnvalaspglnval

202530

ilearg

<210>4

<211>112

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>pet最大

<400>4

glyglyserleualaalaleuthralahisglnalacyshisleupro

151015

leugluthrphethrarghisargglnproargglytrpgluglnleu

202530

gluglncysglytyrprovalglnargleuvalalaleutyrleuala

354045

alaargleusertrpasnglnvalaspglnvalileargasnalaleu

505560

alaserproglyserglyglyaspleuglyglualaileargglugln

65707580

progluglnalaargleualaleuthrleualaalaalagluserglu

859095

argphevalargglnglythrglyasnaspglualaglyalaalaasn

100105110

<210>5

<211>104

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>rap1最小

<400>5

alaglupheglugluproargvalileaspleutrpaspleualagln

151015

seralaasnleuthrasplysgluleuglualapheargglugluleu

202530

lyshispheglualalysileglulyshisasnhistyrglnlysgln

354045

leugluilealahisglulysleuarghisalagluservalglyasp

505560

glygluargvalserargserargglulyshisalaleuleuglugly

65707580

argthrlysgluleuglytyrthrvallyslyshisleuglnaspleu

859095

serglyargileserargalaarg

100

<210>6

<211>153

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>a2m最小

<400>6

valtyrleuglnthrserleulystyrasnileleuproglulysglu

151015

glupheprophealaleuglyvalglnthrleuproglnthrcysasp

202530

gluprolysalahisthrserpheglnileserleuservalsertyr

354045

thrglyserargseralaserasnmetalailevalaspvallysmet

505560

valserglypheileproleulysprothrvallysmetleugluarg

65707580

serasnhisvalserargthrgluvalserserasnhisvalleuile

859095

tyrleuasplysvalserasnglnthrleuserleuphephethrval

100105110

leuglnaspvalprovalargaspleulysproalailevallysval

115120125

tyrasptyrtyrgluthraspgluphealailealaglutyrasnala

130135140

procysserlysaspleuglyasnala

145150

<210>7

<211>24

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>hiv-tat最小

<400>7

argglyaspprothrglyglnglugluserlysglulysvalglulys

151015

gluthrvalvalaspprovalthr

20

<210>8

<211>641

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>hsps最小

<400>8

metalalysalaalaalaileglyileaspleuglythrthrtyrser

151015

cysvalglyvalpheglnhisglylysvalgluileilealaasnasp

202530

glnglyasnargthrthrprosertyrvalalaphethraspthrglu

354045

argleuileglyaspalaalalysasnglnvalalaleuasnprogln

505560

asnthrvalpheaspalalysargleuileglyarglyspheglyasp

65707580

provalvalglnseraspmetlyshistrppropheglnvalileasn

859095

aspglyasplysprolysvalglnvalsertyrlysglygluthrlys

100105110

alaphetyrproglugluilesersermetvalleuthrlysmetlys

115120125

gluilealaglualatyrleuglytyrprovalthrasnalavalile

130135140

thrvalproalatyrpheasnaspserglnargglnalathrlysasp

145150155160

alaglyvalilealaglyleuasnvalleuargileileasnglupro

165170175

thralaalaalailealatyrglyleuaspargthrglylysglyglu

180185190

argasnvalleuilepheaspleuglyglyglythrpheaspvalser

195200205

ileleuthrileaspaspglyilephegluvallysalathralagly

210215220

aspthrhisleuglyglygluasppheaspasnargleuvalasnhis

225230235240

phevalglugluphelysarglyshislyslysaspileserglnasn

245250255

lysargalavalargargleuargthralacysgluargalalysarg

260265270

thrleuserserserthrglnalaserleugluileaspserleuphe

275280285

gluglyileaspphetyrthrserilethrargalaargphegluglu

290295300

leucysseraspleupheargserthrleugluprovalglulysala

305310315320

leuargaspalalysleuasplysalaglnilehisaspleuvalleu

325330335

valglyglyserthrargileprolysvalglnlysleuleuglnasp

340345350

phepheasnglyargaspleuasnlysserileasnproaspgluala

355360365

valalatyrglyalaalavalglnalaalaileleumetglyasplys

370375380

sergluasnvalglnaspleuleuleuleuaspvalalaproleuser

385390395400

leuglyleugluthralaglyglyvalmetthralaleuilelysarg

405410415

asnserthrileprothrlysglnthrglnilephethrthrtyrser

420425430

aspasnglnproglyvalleuileglnvaltyrgluglygluargala

435440445

metthrlysaspasnasnleuleuglyargphegluleuserglyile

450455460

proproalaproargglyvalproglnilegluvalthrpheaspile

465470475480

aspalaasnglyileleuasnvalthralathrasplysserthrgly

485490495

lysalaasnlysilethrilethrasnasplysglyargleuserlys

500505510

glugluilegluargmetvalglnglualaglulystyrlysalaglu

515520525

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530535540

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545550555560

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565570575

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580585590

gluhislysarglysgluleugluglnvalcysasnproileileser

595600605

glyleutyrglnglyalaglyglyproglyproglyglypheglyala

610615620

glnglyprolysglyglyserglyserglyprothrileglugluval

625630635640

asp

<210>9

<211>252

<212>prt

<213>假单胞菌

<400>9

alagluglualapheaspleutrpasnglucysalalysalacysval

151015

leuaspleulysaspglyvalargserserargmetservalasppro

202530

alailealaaspthrasnglyglnglyvalleuhistyrsermetval

354045

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505560

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65707580

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859095

trpserleuasntrpleuvalproileglyhisglulysproserasn

100105110

ilelysvalpheilehisgluleuasnalaglyasnglnleuserhis

115120125

metserproiletyrthrileglumetglyaspgluleuleualalys

130135140

leualaargaspalathrphephevalargalahisgluserasnglu

145150155160

metglnprothrleualaileserhisalaglyvalservalvalmet

165170175

alaglnthrglnproargargglulysargtrpserglutrpalaser

180185190

glylysvalleucysleuleuaspproleuaspglyvaltyrasntyr

195200205

leualaglnglnargcysasnleuaspaspthrtrpgluglylysile

210215220

tyrargvalleualaglyasnproalalyshisaspleuaspilelys

225230235240

prothrvalileserhisargleuhispheproglu

245250

<210>10

<211>613

<212>prt

<213>假单胞菌

<400>10

alagluglualapheaspleutrpasnglucysalalysalacysval

151015

leuaspleulysaspglyvalargserserargmetservalasppro

202530

alailealaaspthrasnglyglnglyvalleuhistyrsermetval

354045

leugluglyglyasnaspalaleulysleualaileaspasnalaleu

505560

serilethrseraspglyleuthrileargleugluglyglyvalglu

65707580

proasnlysprovalargtyrsertyrthrargglnalaargglyser

859095

trpserleuasntrpleuvalproileglyhisglulysproserasn

100105110

ilelysvalpheilehisgluleuasnalaglyasnglnleuserhis

115120125

metserproiletyrthrileglumetglyaspgluleuleualalys

130135140

leualaargaspalathrphephevalargalahisgluserasnglu

145150155160

metglnprothrleualaileserhisalaglyvalservalvalmet

165170175

alaglnthrglnproargargglulysargtrpserglutrpalaser

180185190

glylysvalleucysleuleuaspproleuaspglyvaltyrasntyr

195200205

leualaglnglnargcysasnleuaspaspthrtrpgluglylysile

210215220

tyrargvalleualaglyasnproalalyshisaspleuaspilelys

225230235240

prothrvalileserhisargleuhispheprogluglyglyserleu

245250255

alaalaleuthralahisglnalacyshisleuproleugluthrphe

260265270

thrarghisargglnproargglytrpgluglnleugluglncysgly

275280285

tyrprovalglnargleuvalalaleutyrleualaalaargleuser

290295300

trpasnglnvalaspglnvalileargasnalaleualaserprogly

305310315320

serglyglyaspleuglyglualailearggluglnprogluglnala

325330335

argleualaleuthrleualaalaalaglusergluargphevalarg

340345350

glnglythrglyasnaspglualaglyalaalaasnalaaspvalval

355360365

serleuthrcysprovalalaalaglyglucysalaglyproalaasp

370375380

serglyaspalaleuleugluargasntyrprothrglyalagluphe

385390395400

leuglyaspglyglyaspvalserpheserthrargglythrglnasn

405410415

trpthrvalgluargleuleuglnalahisargglnleuglugluarg

420425430

glytyrvalphevalglytyrhisglythrpheleuglualaalagln

435440445

serilevalpheglyglyvalargalaargserglnaspleuaspala

450455460

iletrpargglyphetyrilealaglyaspproalaleualatyrgly

465470475480

tyralaglnaspglngluproaspalaargglyargileargasngly

485490495

alaleuleuargvaltyrvalproargserserleuproglyphetyr

500505510

argthrserleuthrleualaalaproglualaalaglygluvalglu

515520525

argleuileglyhisproleuproleuargleuaspalailethrgly

530535540

progluglugluglyglyargleugluthrileleuglytrpproleu

545550555560

alagluargthrvalvalileproseralaileprothraspproarg

565570575

asnvalglyglyaspleuaspproserserileproasplysglugln

580585590

alaileseralaleuproasptyralaserglnproglylyspropro

595600605

arggluaspleulys

610

<210>11

<211>323

<212>prt

<213>人类

<400>11

tyrserargglulysasnglnprolysproserprolysarggluser

151015

glygluglupheargmetglulysleuasnglnleutrpglulysala

202530

glnargleuhisleuproprovalargleualagluleuhisalaasp

354045

leulysileglngluargaspgluleualatrplyslysleulysleu

505560

aspglyleuaspgluaspglyglulysglualaargleuileargasn

65707580

leuasnvalileleualalystyrglyleuaspglylyslysaspala

859095

argglnvalthrserasnserleuserglythrglngluaspglyleu

100105110

aspaspproargleuglulysleutrphislysalalysthrsergly

115120125

lyspheserglyglugluleuasplysleutrpargglupheleuhis

130135140

hislysglulysvalhisglutyrasnvalleuleugluthrleuser

145150155160

argthrglugluilehisgluasnvalileserproseraspleuser

165170175

aspilelysglyservalleuhisserarghisthrgluleulysglu

180185190

lysleuargserileasnglnglyleuaspargleuargargvalser

195200205

hisglnglytyrserthrglualaglupheglugluproargvalile

210215220

aspleutrpaspleualaglnseralaasnleuthrasplysgluleu

225230235240

glualapheargglugluleulyshispheglualalysileglulys

245250255

hisasnhistyrglnlysglnleugluilealahisglulysleuarg

260265270

hisalagluservalglyaspglygluargvalserargserargglu

275280285

lyshisalaleuleugluglyargthrlysgluleuglytyrthrval

290295300

lyslyshisleuglnaspleuserglyargileserargalaarghis

305310315320

asngluleu

<210>12

<211>357

<212>prt

<213>人类

<400>12

metalaproargargvalargserpheleuargglyleuproalaleu

151015

leuleuleuleuleupheleuglyprotrpproalaalaserhisgly

202530

glylystyrserargglulysasnglnprolysproserprolysarg

354045

gluserglygluglupheargmetglulysleuasnglnleutrpglu

505560

lysalaglnargleuhisleuproprovalargleualagluleuhis

65707580

alaaspleulysileglngluargaspgluleualatrplyslysleu

859095

lysleuaspglyleuaspgluaspglyglulysglualaargleuile

100105110

argasnleuasnvalileleualalystyrglyleuaspglylyslys

115120125

aspalaargglnvalthrserasnserleuserglythrglngluasp

130135140

glyleuaspaspproargleuglulysleutrphislysalalysthr

145150155160

serglylyspheserglyglugluleuasplysleutrparggluphe

165170175

leuhishislysglulysvalhisglutyrasnvalleuleugluthr

180185190

leuserargthrglugluilehisgluasnvalileserproserasp

195200205

leuseraspilelysglyservalleuhisserarghisthrgluleu

210215220

lysglulysleuargserileasnglnglyleuaspargleuargarg

225230235240

valserhisglnglytyrserthrglualaglupheglugluproarg

245250255

valileaspleutrpaspleualaglnseralaasnleuthrasplys

260265270

gluleuglualapheargglugluleulyshispheglualalysile

275280285

glulyshisasnhistyrglnlysglnleugluilealahisglulys

290295300

leuarghisalagluservalglyaspglygluargvalserargser

305310315320

argglulyshisalaleuleugluglyargthrlysgluleuglytyr

325330335

thrvallyslyshisleuglnaspleuserglyargileserargala

340345350

arghisasngluleu

355

<210>13

<211>101

<212>prt

<213>人免疫缺陷病毒

<400>13

metgluprovalaspproargleugluprotrplyshisproglyser

151015

glnprolysthrprocysthrlyscystyrcyslyslyscyscysleu

202530

hiscysglnvalcysphemetthrlysglyleuglyilesertyrgly

354045

arglyslysargargglnargargargalaproglnaspasnlysasn

505560

hisglnvalserleuserlysglnprothrserargalaargglyasp

65707580

prothrglyglnglugluserlysglulysvalglulysgluthrval

859095

valaspprovalthr

100

<210>14

<211>4

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>er滞留序列

<400>14

lysaspgluleu

1

<210>15

<211>6

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>cd28-pet的连接子

<220>

<221>misc_feature

<222>(2)..(2)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(4)..(4)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<400>15

argxaaargxaalysarg

15

<210>16

<211>12

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>er滞留序列

<400>16

lyslysaspleuargaspgluleulysaspgluleu

1510

<210>17

<211>13

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>er滞留序列

<400>17

lyslysaspgluleuargaspgluleulysaspgluleu

1510

<210>18

<211>13

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>er滞留序列

<400>18

lyslysaspgluleuargvalgluleulysaspgluleu

1510

<210>19

<211>12

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>er滞留序列

<400>19

lysaspgluleulysaspgluleulysaspgluleu

1510

<210>20

<211>46

<212>prt

<213>假单胞菌

<400>20

proleugluthrphethrarghisargglnproargglytrpglugln

151015

leugluglncysglytyrprovalglnargleuvalalaleutyrleu

202530

alaalaargleusertrpasnglnvalaspglnvalilearg

354045

<210>21

<211>98

<212>prt

<213>人乳头瘤病毒第16型

<400>21

methisglyaspthrprothrleuhisglutyrmetleuaspleugln

151015

progluthrthraspleutyrcystyrgluglnleuasnaspserser

202530

gluglugluaspgluileaspglyproalaglyglnalagluproasp

354045

argalahistyrasnilevalthrphecyscyslyscysaspserthr

505560

leuargleucysvalglnserthrhisvalaspileargthrleuglu

65707580

aspleuleumetglythrleuglyilevalcysproilecyssergln

859095

lyspro

<210>22

<211>105

<212>prt

<213>人乳头瘤病毒第18型

<400>22

methisglyprolysalathrleuglnaspilevalleuhisleuglu

151015

proglnasngluileprovalaspleuleucyshisgluglnleuser

202530

aspsergluglugluasnaspgluileaspglyvalasnhisglnhis

354045

leuproalaargargalagluproglnarghisthrmetleucysmet

505560

cyscyslyscysglualaargilelysleuvalvalgluserserala

65707580

aspaspleuargalapheglnglnleupheleuasnthrleuserphe

859095

valcysprotrpcysalaserglngln

100105

<210>23

<211>190

<212>prt

<213>丙型肝炎病毒

<400>23

metserthrasnprolysproglnarglysthrlysargasnthrasn

151015

argargproglnaspvallyspheproglyglyglyglnilevalgly

202530

glyvaltyrleuleuproargargglyproargleuglyvalargala

354045

thrarglysthrsergluargserglnproargglyargargglnpro

505560

ileprolysalaargargprogluglyargthrtrpalaglnprogly

65707580

tyrprotrpproleutyrglyasngluglymetglytrpalaglytrp

859095

leuleuserproargglyserargproasntrpglyprothrasppro

100105110

argargargserargasnleuglylysvalileaspthrleuthrcys

115120125

glyphealaaspleumetglytyrileproleuvalglyalaproleu

130135140

glyglyvalalaargalaleualahisglyvalargvalleugluasp

145150155160

glyvalasntyralathrglyasnleuproglycysserpheserile

165170175

pheleuleualaleuleusercysleuthrthrproalaser

180185190

<210>24

<211>154

<212>prt

<213>乙型肝炎病毒

<400>24

metalaalaargmetcyscysglnleuaspproalaargaspvalleu

151015

cysleuargprovalglyalagluserargglyargproleuprogly

202530

proleuglyalaleuproproserseralaseralavalproalaasp

354045

hisglyserhisleuserleuargglyleuprovalcysserpheser

505560

seralaglyprocysalaleuargphethrseralaargargmetglu

65707580

thrthrvalasnalaprotrpserleuprothrvalleuhislysarg

859095

thrileglyleuserglyargsermetthrtrpilegluglutyrile

100105110

lysaspcysvalphelysasptrpglugluleuglyglugluilearg

115120125

leulysvalphevalleuglyglycysarghislysleuvalcysser

130135140

proalaprocysasnphephethrserala

145150

<210>25

<211>192

<212>prt

<213>猪环状病毒

<400>25

asnglyilepheasnthrargleuserargthrpheglytyrthrile

151015

lysargthrthrvallysthrprosertrpalavalaspmetmetarg

202530

pheasnileasnasppheleuproproglyglyglyserasnproarg

354045

servalpropheglutyrtyrserileserlysvallysvalgluphe

505560

trpprocysserproilethrglnglyaspserglyvalglyserser

65707580

alavalileleuaspaspasnphevalthrlysalathralaleuthr

859095

tyraspprotyrvalasntyrserserarghisthrilethrglnpro

100105110

phesertyrhisserargtyrphethrprolysprovalleuaspser

115120125

thrileasptyrpheglnproasnasnlysargasnglnleutrpleu

130135140

argleuglnthralaglyasnvalasphisvalglyleuglythrala

145150155160

phegluasnseriletyraspglnglutyrasnileargvalthrmet

165170175

tyrvalglnpheargglupheasnleulysaspproproleuasnpro

180185190

<210>26

<211>220

<212>prt

<213>猪繁殖与呼吸综合症病毒

<400>26

arghishisphethrprosergluargglnleucysleuserserile

151015

glnthralapheasnglnglyalaglythrcysileleuseraspser

202530

glyargilesertyrthrvalglupheserleuprothrhishisthr

354045

valargleuileargvalthralaproproseralaleuaspglnval

505560

ileargasnalaleualaserproglyserglyglyaspleuglyglu

65707580

alailearggluglnprogluglnalaargleualaleuthrleuala

859095

alaalaglusergluargphevalargglnglythrglyasnaspglu

100105110

alaglyalaalaasnalaaspvalvalserleuthrcysprovalala

115120125

alaglyglucysalaglyproalaaspserglyaspalaleuleuglu

130135140

argasntyrprothrglyalaglupheleuglyaspglyglyaspval

145150155160

arghishisphethrprosergluargglnleucysleuserserile

165170175

glnthralapheasnglnglyalaglythrcysileleuseraspser

180185190

glyargilesertyrthrvalglupheserleuprothrhishisthr

195200205

valargleuileargvalthralaproproserala

210215220

<210>27

<211>165

<212>prt

<213>猪繁殖与呼吸综合症病毒

<400>27

asnasnlysglucysthrvalalaglnalaleuglyasnglyasplys

151015

pheargalathrasplysargvalvalaspserleuargalailecys

202530

alaaspleugluglyserserserproleuprolysvalalahisasn

354045

leuglyphetyrpheserproaspleuthrglnphealalysleupro

505560

ilegluleuaspprohistrpprovalvalserthrglnasnasnglu

65707580

lystrpproaspargleuvalalaserleuargproleuasplystyr

859095

serargalacysileglyalaglytyrmetvalglyproservalphe

100105110

leuglythrproglyvalvalsertyrtyrleuthrlysphevallys

115120125

glyglualaglnvalleuprogluthrvalpheserthrglyargile

130135140

gluvalaspcysargglutyrleuaspasparggluarggluvalala

145150155160

alaserleuprohis

165

<210>28

<211>58

<212>prt

<213>猪繁殖与呼吸综合症病毒

<400>28

glyserserleuaspaspphecystyraspserthralaproglnlys

151015

valleuleualapheserilethrtyralaserasnaspserserser

202530

hisleuglnleuiletyrasnleuthrleucysgluleuasnglythr

354045

asptrpleualaasnlyspheasptrpala

5055

<210>29

<211>62

<212>prt

<213>猪繁殖与呼吸综合症病毒

<400>29

metglyserleuaspaspphecysasnaspserthralaalaglnlys

151015

leuvalleualapheserilethrtyrthrproilephevalalagly

202530

glyserserserthrtyrglntyriletyrasnleuthrilecysglu

354045

leuasnglythrasptrpleuserasnhispheasptrpala

505560

<210>30

<211>68

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>cd28-pet

<220>

<221>misc_feature

<222>(8)..(8)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(10)..(11)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(17)..(17)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(30)..(30)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(32)..(32)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<400>30

thraspiletyrphecyslysxaagluxaaxaatyrproproprotyr

151015

xaaaspasnglulysserasnglythrileilehisargxaaargxaa

202530

lysargglytrpgluglnleugluglncysglytyrprovalglnarg

354045

leuvalalaleutyrleualaalaargleusertrpasnglnvalasp

505560

glnvalilearg

65

<210>31

<211>28

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>cd28共有序列

<220>

<221>misc_feature

<222>(8)..(8)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(10)..(11)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(17)..(17)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<400>31

thraspiletyrphecyslysxaagluxaaxaatyrproproprotyr

151015

xaaaspasnglulysserasnglythrileilehis

2025

<210>32

<211>10

<212>prt

<213>人工序列

<220>

<223>cd28关键区

<220>

<221>misc_feature

<222>(2)..(2)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<220>

<221>misc_feature

<222>(4)..(5)

<223>xaa可为任一种天然氨基酸

<400>32

lysxaagluxaaxaatyrproproprotyr

1510