专利名称：用于微生物强化采油的方法、菌株和组合物弓形杆菌分支1的制作方法
技术领域：
本公开涉及环境微生物和利用微生物改变原油井特性的领域。更具体地，提供了改善从地下油层中采油的方法并鉴定了可用于采油的新微生物。
背景技术：
在从油层中采油期间，通过仅利用油层中存在的自然力的主要采油方法通常仅采集了含油层中的一小部分原油。为了改善采油，已经使用了多种补充采油技术如注水法，该方法涉及通过井钻孔将水注入油层。当水从注入井流入油层并流过含油岩层时，它使该处的油流到一个或多个生产井处，在生产井处进行采油。注水操作常遇到的一个问题是低下的注水波及效率。当水从注入井流入生产井时，它优先从通道通过油层的高渗透区域，因此绕过低渗透含油层，导致波及效率低下。因此未采收到在低渗透区域的原油。低下的波及效率也可能由水与油的不同移动性引起。已经使用多种方法，利用微生物来强化从地层中采油，这些方法可改善波及效率和/或促进油释放。例如，可将活体微生物注入油层，在其中它们可生长并粘附到可渗透区域中岩层或砂层内的孔洞和通道表面上以减少水通道，并且因此使注入水定向流向低渗透含油层。通过注入营养液到地层中用于促进原有微生物生长的方法在”4，558，739和”5，083，611中公开。已经公开了将分离自采油位点的微生物与营养液一起注入地层的方法，所述微生物包括恶臭假单胞菌(Pseudomonasputida)和肺炎克雷伯氏菌(Klebsiellapneumoniae) (US4, 800，959)、分离自自来水的芽孢杆菌(Bacillus)菌株或假单胞菌(Pseudomonas)菌株 1-2 (ATCC30304) (US4, 558，739)、和恶臭假单胞菌(Pseudomonasputida)、绿胺杆菌(Pseudomonasaeruginosa)、野兔棒状杆菌(Corynebacteriumlepus)JiI 脂红分枝杆菌(Mycobacteriumrhodochrous )、和母牛分枝杆菌(Mycobacteriumvaccae) (US5, 163, 510)。在 US5, 174, 378 中公开了注入分离微生物和表面活性剂的方法。需要用于强化采油的附加的可用微生物菌株和方法以进一步改善从油层中采油。
发明内容
本发明涉及强化从油层中采油的方法，以及可用于强化采油的分离的微生物和组合物。因此，本发明提供了强化从油层中采油的方法，其包括:a)提供包含下列的组合物: i)至少一种属于弓形杆菌(Arcobacter)分支I的弓形杆菌菌株；和
ii)包含至少一种电子受体的基本生长培养基；b)提供油层；c)用(a)的组合物接种所述油层，使得所述组合物中包含的弓形杆菌移植到所述油层中并且在所述油层中生长；以及d)从所述油层中采油；其中所述弓形杆菌在所述油层中的生长强化采油。在一个实施例中，所述属于弓形杆菌分支I的弓形杆菌菌株包含16SrDNA简并共有序列 SEQIDN0:40。在另一个实施例中，所述属于弓形杆菌分支I的弓形杆菌菌株包含的16SrDNA序列与选自SEQIDN0:1、2、3、4、5、6、7、8和39的序列具有至少约97%的序列同一性。在另一个实施例中，本发明提供了分离的微生物，所述微生物的菌株选自97AE3-3(ATCCN0.PTA-11410)和 97AE3-12 (ATCCN0.PTA-11409) 在另一个实施例中，本发明提供了强化采油组合物，其包含:a)至少一种分离的弓形杆菌菌株，所述弓形杆菌菌株包含选自SEQIDN0:1、33、34、35、36、37 和 38 的部分 16SrDNA 序列；b) —种或多种电子受体；和
c)至少一种碳源。附图和序列简沭通过下面的具体实施方式
、附图和随附的序列描述可以更全面地理解本发明，这些详细描述、附图和序列描述形成本专利申请的一部分。
图1示出弓形杆菌菌种和相关细菌基于16SrRNA基因序列(rDNA)的分子系统发育树，其将所述弓形杆菌属(Arcobacterspp.)分成至少三个系统发育分支。图2示出新分离的弓形杆菌菌种和参照细菌基于16SrRNA基因序列(rDNA)的分子系统发育树。图3A-D示出弓形杆菌分支I优势共有、弓形杆菌分支I简并共有、菌株97AE3-12、弓形杆菌分支2简并共有、和弓形杆菌分支3简并共有的16SrDNA序列的比对结果。图4示出多个弓形杆菌属(Arcobactersp)菌株的Riboprinter 分析。图5示出希瓦氏菌(Shewanella)菌种在rDNA可变区2 (A)、5 (B)、和8 (C)的优势和简并标记序列。下划线标出了可变位点。图例中给出了每个可变位点的可选核苷酸。图6示出了建立用于测量可渗透填砂模型堵塞程度的细管实验的示意图。图7示出了通过未接种细管的压降图。图8示出了通过细管的压降图，所述细管用弓形杆菌属97AE3-12(ATCCN0:PTA-11409)接种并随后定期分批给料。图9示出了通过细管的压降图，所述细管用弓形杆菌属97AE3-12(ATCCNO: PTA-11409 )接种并随后连续给料。下列序列符合37C.F.R.§ § 1.821-1.825(“对含有核酸序列和/或氨基酸序列公开的专利申请的要求-序列规则”)并且符合世界知识产权组织(WIPO)标准ST.25 (2009)和EPO和PCT的序列表要求(规则5.2和49.5 (a-bis),以及行政性指示的208节和附录C。用于核苷酸和氨基酸序列数据的符号和格式遵循如37C.F.R.§ 1.822所示的规定。
表1:弓形杆菌菌株的16SrDNA序列，其包括在大肠杆菌(E.coli)16SrDNA序列中的核苷酸坐标8至1511。
权利要求
1.强化从油层中采油的方法，包括: a)提供包含下列的组合物: i)至少一种属于弓形杆菌(Arcobacter)分支I的弓形杆菌菌株； 和 )包含至少一种电子受体的基本生长培养基； b)提供油层； c)用(a)的组合物接种所述油层，使得所述组合物中包含的弓形杆菌移植到所述油层中并且在所述油层中生长；以及 d)从所述油层中采油； 其中所述弓形杆菌在所述油层 中的生长强化采油。
2.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一种属于弓形杆菌分支I的弓形杆菌菌株包含16SrDNA简并共有序列SEQIDN0:40。
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一种属于弓形杆菌分支I的弓形杆菌菌株包含的16SrDNA序列与选自SEQIDN0:1、2、3、4、5、6、7、8和39的序列具有至少约97%的序列同一性。
4.根据权利要求1所述的方法，其中所述电子受体为至少一种硝酸离子盐。
5.根据权利要求1所述的方法，其中所述电子受体为至少一种亚硝酸离子盐或至少一种亚硝酸盐和至少一种硝酸盐的组合。
6.根据权利要求1所述的方法，其中所述油层包含至少一种具有至少约30份每千份的盐浓度的流体。
7.根据权利要求1或5所述的方法，其中所述属于弓形杆菌分支I的弓形杆菌菌株包含选自 SEQIDN0:1、33、34、35、36、37 和 38 的部分 16SrDNA 序列。
8.根据权利要求7所述的方法，其中所述属于弓形杆菌分支I的弓形杆菌菌株选自97AE3-3 (ATCCN0.PTA-11410)和 97AE3-12 (ATCC N0.PTA-11409)
9.根据权利要求1所述的方法，其中(a)的组合物还包含一种或多种在油存在的情况下、在脱氮条件下生长的附加微生物。
10.根据权利要求9所述的方法，其中所述一种或多种附加微生物包括希瓦氏菌(Shewanella)菌种或索氏菌属(Thauerasp.) AL9:8 (ATCC N0.PTA-9497)。
11.根据权利要求10所述的方法，其中所述希瓦氏菌菌种包含的16SrDNA包含简并标记序歹丨J SEQIDN0:48、50 和 52。
12.分离的微生物，所述微生物的菌株选自97AE3-3(ATCCN0.PTA-11410)和97AE3-12(ATCCN0.PTA-11409)。
13.强化采油组合物，包含: a)至少一种分离的弓形杆菌菌株，所述弓形杆菌菌株包含选自SEQIDN0:1、33、34、35、36、37和38的部分16SrDNA序列； b)一种或多种电子受体；和 c)至少一种碳源。
14.根据权利要求13所述的组合物，其中所述弓形杆菌菌株选自97AE3-3(ATCCN0.PTA-11410)和 97AE3-12 (ATCCN0.PTA-11409)。
15.根据权利要求13所述的组合物，其中所述至少一种碳源选自乳酸盐、乙酸盐、甲酸盐和琥珀酸盐。
16.根据权利要求13所述的组合物，还包含一种或多种附加微生物。
17.根据权利要求16所述的组合物，其中所述一种或多种附加微生物在油存在的情况下、在脱氮条件下生长。
18.根据权利要求17所述的组合物，其中所述一种或多种附加微生物包括希瓦氏菌菌种或索氏菌属 AL9:8 (ATCCN0.PTA-949)。
19.根据权利要求18所述的组合物，其中所述希瓦氏菌菌种包含的16SrDNA包含简并标记序列 SEQIDN0:48、50 和 52。 ·
全文摘要
本发明提供了方法、微生物和组合物，其中用属于弓形杆菌(Arcobacter)分支1的微生物和包括电子受体的培养基接种油层。弓形杆菌菌株在油层中生长以形成堵塞生物膜，它降低地下构造区域中的渗透性，从而提高波及效率，并且因此强化采油。
文档编号C09K8/035GK103221507SQ201180051271
公开日2013年7月24日 申请日期2011年11月1日 优先权日2010年11月1日
发明者E.R.亨里克森, S.C.杰克森, A.K.莱克瑞恩 申请人:纳幕尔杜邦公司