载体设计方法及载体设计装置的制造方法_2

文档序号:9810890阅读:来源:国知局
载体骨架信息进行显示。
[0052]此外,在一个具体示例中,上述元件还可以包括个性化元件,S卩,与上述载体骨架类型标识对应的各元件除了包含必须具备的基础元件之外,还可以包含自定义元件,该自定义元件可以由用户基于实际需要灵活确定。其中,在初始获得与上述载体骨架类型标识对应的各元件时,相应的个性化元件可以以个性化元件类别标识来标识,对应的元件属性为虚拟属性。同一类别的个性化元件的虚拟属性可以相同。
[0053]据此,在上述步骤S304、步骤S305中得到初始的拼接后载体后,可以基于实际需要来对拼接后载体进行调整,因此,在另一实施例中,如图5所示,在上述步骤S305之后,还可以包括步骤:
[0054]步骤S306:调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。
[0055]其中,具体的对拼接后载体的调整方式,可以是添加不同的个性化元件,或者是对个性化元件的元件属性进行调整。以添加个性化元件为例:
[0056]在其中一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:基于个性化元件推荐列表,接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
[0057]在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:基于个性化元件历史记录收藏夹,接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
[0058]在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,并根据该个性化元件的元件属性将该个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
[0059]在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:接收查询指令,所述查询指令中包括关键字,根据所述查询指令查询与所述关键字匹配的个性化元件,并将查询结果进行显示,基于查询结果接收个性化元件选择指令,所述个性化元件选择指令包括个性化元件标识,获取与所述个性化元件标识对应的个性化元件及个性化元件的元件属性,接收个性化元件编辑指令,根据该编辑指令对获取得到的个性化元件和/或该个性化元件的元件属性进行编辑后,根据编辑后的个性化元件的元件属性将该编辑后的个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据编辑后的个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示;
[0060]在另一种方式中,对拼接后载体调整的方式可以是:接收自定义指令,根据该自定义指令调用载体编辑工具,并将通过载体编辑工具得到的自定义个性化元件添加到所述拼接后载体中,根据自定义个性化元件的元件属性调整所述拼接后载体,并将调整后的拼接后载体进行可视化显示。
[0061]其中,在上述对拼接后载体的调整过程中,调整次数可以有多次,以选用、添加或者删减不同的个性化元件,或者是对个性化元件的元件属性进行调整,每次调整后,都可以将调整后的拼接后载体进行可视化显示,以供用户观看拼接后载体。
[0062]在上述步骤S305或者步骤S306确定的拼接后载体进行可视化显示的过程中,还可以供用户查看相关元件的元件属性,具体的方式可以是:
[0063]基于可视化显示的拼接后载体接收属性查看指令,所述属性查看指令包括元件标识;获取与所述元件标识对应的元件的元件属性;将获得的与所述元件标识对应的元件的元件属性进行显示。其中,这里的元件标识可以是基础元件的元件标识,也可以是个性化元件的元件标识。
[0064]在基于可视化显示的拼接后载体确定初步符合要求时,可进一步进行酶切分析,确定拼接后载体是否满足预期结果。因此,如图5所示,本发明实施例的载体设计方法还可以包括步骤:
[0065]步骤S307:接收酶切分析指令,根据该酶切分析指令对拼接后载体进行酶切分析,得到酶切分析结果,并将酶切分析结果进行显示。
[0066]终端用户可以基于显示的酶切分析结果决定是否需要修改个性化元件。在需要修改的情况下,可返回上述步骤S306,进一步对拼接后载体进行调整。在不需要修改的情况下,则载体设计完成。上述拼接后载体即为设计的载体。
[0067]此时,如图5所示,本实施例中的方法还可以包括步骤:
[0068]步骤S307:接收载体构建指令,根据该载体构建指令将所述拼接后载体作为构建的载体进行存储或者添加到载体设计记录中。
[0069]从而构建好的载体可以存储起来,也可以是添加到载体设计记录中便于后续查看,其中,这里的载体设计记录可以是购物篮、购物记录、收藏夹等各种表现形式。
[0070]另一方面,如图5所示,本实施例中的方法还可以包括:
[0071]步骤S308:接收订单生成指令;根据该订单生成指令向服务器发送订单生成请求,该订单生成请求包括所述拼接后载体;接收服务器根据所述订单生成请求返回的订单生成结果。
[0072]从而基于设计好的载体,进一步生成订单,以获得与该设计好的拼接后载体对应的实物载体。
[0073]以下结合一个具体示例对本发明实施例的方案进行进一步的详细说明。图6中示出了一个具体示例中的载体设计方法的流程示意图,在该具体示例中是结合用户终端与服务器的交互过程为例进行说明。
[0074]首先,对本发明实施例方案中的载体骨架体系、载体骨架类型等做一个简要说明。在本发明实施例的方案中,将大部分的真核表达载体骨架归纳为几个体系,在本实施例中为7个体系,称之为载体骨架体系,每个体系根据需要再细分为多个小类别,本发明实施例中称之为载体骨架类型,以便于在设计载体的过程中逐步缩小范围,快速确定载体骨架。
[0075]在确定载体骨架类型后,即可按归类后的载体骨架类型,收集每一类载体骨架类型的组成元件以及元件的元件属性。在本发明实施例中,将组成元件从总体上分为两类:基础元件和个性化元件。其中,基础元件为同一个载体骨架类型的载体骨架均具有的永恒不变的元件;个性化元件指同一个载体骨架类型的载体骨架均具有,但是根据用户需求不同而改变的元件。个性化元件依据相似度的不同,可以分为多个小类,以便于在确定个性化元件时,可以有目的地选择或自定义个性化元件,而不是大海捞针式的选择。
[0076]随后,建立每一个载体骨架类型及其基础元件和个性化元件类别之间的关联。从而可以便于在设计载体的过程中,在选择了载体骨架类型之后,基于这种关联关系自动获得和添加关联的基础元件,并可以通过个性化元件类别来对选择或定义个性化元件进行指引。
[0077]在载体骨架体系的归纳分类、以及各载体骨架体系下的载体骨架类型的细分,基于载体骨架的真核表达方式可以有不同的方式。在本实施例中,以归类为7个载体骨架体系为例,这7个体系可以分别命名为Mammalian Gene Express1n Vectors ,Mammalian shRNAKnockdown Vectors,CRISPR Vectors,TALEN Vectors,Mammalian Promoter/EnhancerTesting Vectors,Bacterial Protein Express1n Vectors和Mammalian HomologousRecombinat1n Donor Vector。
[0078]其中,各个载体骨架体系下包含的各载体骨架类型的细分方式,可以是如下所述:
[0079]Mammalian Gene Express1n Vectors载体骨架体系下包含6个载体骨架类型,分另1J 记为:Lentivirus ,MMLV retrovirus ,Adenovirus,Adeno-associated virus (AAV),Regular plasmid,PiggyBac;
[0080]Mammalian shRNA Knockdown Vectors载体骨架体系下包含2个载体骨架类型,分另1J记为:Lentivirus ,PiggyBac ;
[0081 ] CRISPR Vectors载体骨架体系下包含I个载体骨架类型,记为:Regular plasmid(single gRNA);
[0082]TALEN Vectors载体骨架体系下包含2个载体骨架类型,记为:Regular plasmid;
[0083]Mammalian Promoter/Enhancer Testing Vectors载体骨架体系下包含I个载体骨架类型,记为:1n vivo enhancer testing;
[0084]Bacterial Protein Express1n Vectors载体骨架体系下包含2个载体骨架类型,分别记为:pET,pBAD;
[0085]Mammalian Homologous Recombinat1n Donor Vector载体骨架体系下包含I个载体骨架类型,记为:pDonor。
[0086]本领域技术人员可以理解的是,这里提及的载体骨架体系的个数、名称,以及各体系下的载体骨架类型的个数、划分和名称等等,仅仅是一种示例性的说明,便于技术人员理解以及后文的举例应用,并不用于对载体骨架体系以及载体骨架类型的划分方式做具体限定。
[0087]通过上述方式得到的载体骨架体系、各
当前第2页1 2 3 4 5 6 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1