产pha细菌的制作方法
【专利摘要】本发明公开涉及了产聚羟基链烷酸(PHA)的分离细菌菌株，包含这种菌株的微生物聚生体，以及这种菌株和微生物聚生体的培养物。特别的，本发明公开涉及了包含这种菌株、微生物聚生体、和培养物的组合物，以及其使用方法。
【专利说明】产PHA细菌
[0001]相关申请的交叉引用 [0002]本申请要求美国临时申请号61/417，846 (其于2010年11月29日提交)的权益，其整体通过参考的方式并入本文。
[0003]在ASCII文本文件上提交的序列表
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【技术领域】
[0005]本发明公开涉及生产聚羟基链烧酸(Polyhydroxyalkanoate, PHA)的新型分离细菌菌株和包括这种菌株的微生物聚生体(microbial consortia)。特别是,本发明公开涉及包括这些菌株和微生物聚生体(microbial consortia)的组合物，以及它们的使用方法。
【背景技术】
[0006]每天都有成千上万吨石油为基础的塑料废物在环境中积累，导致日益增长的非生物降解的垃圾填埋场和逐步升高的废物处置费用。这个问题的解决方案是使用塑料的可生物降解替代品，这样的一个替代方案是聚羟基链烷酸(PHA)，一个高性能，高度市场化的可生物降解的聚合物家族，具有优异的物理性能，适用于广泛的工业应用。
[0007]PHA是由许多细菌产生的大分子。它是由是羟基脂肪酸单体亚单位组成的聚酯分子。它是UV-稳定的，耐极端温度下，和耐渗透水的。与石油基塑料降解需要数百年不同，当放置在降解环境中，如垃圾填埋场或堆肥厂，PHA基塑料能完全生物降解。此外，如果不慎放置在地球的海洋中，PHA基塑料迅速降解而对海洋生命无任何有害影响，或者在更大的海洋环境中没有化学残留物或其它污染物。除了这些属性，PHA还具有生物相容性，无害地逐步分解而不诱导在体内的炎症反应。
[0008]PHA的生产是基于可再生资源，而不是减少化石燃料库存。在细菌的发酵过程中可以商业化生产PHA，用底物驱动微生物的生长和PHA的合成。这些底物可以是农产品，例如，糖和脂肪酸。
[0009]PHA生产最常见的形式是聚羟基丁酸(PHB)和聚羟基戊酸(PHV)的混合，目前发现在许多容器、家居用品、和汽车零部件中其与聚丙烯具有非常相似的性质。由于其生物相容性，PHA基塑料也可用于在生物应用，如医用缝合材料、组织修复装置、或其他生物医学用途。
[0010]PHA良好的性能提供鼓励开发使用生物系统生产PHA的有效的方法。尽管使用PHA塑料有优点，但与价格低的石化塑料相比，PHA的价格高，大大限制了它其广泛使用。几个因素对PHA的经济生产是至关重要的:底物成本，发酵时间和下游加工的效率。目前生产的过程中，依赖于转基因生物(GMOs)，有许多限制，如要求严格的环境控制，无菌操作条件下，和相对昂贵的原料。[0011]因此，存在需要开发有成本效益的高效率生物系统来生产PHA，特别是能够从便宜、容易获得、和可再生的原料(如有机废水)中生产高产量PHA的微生物。
[0012]发明概述
[0013]提供了分离的菌株、微生物聚生体(microbial consortia)、组合物、和符合这种需要的方法。
[0014]本发明公开涉及具有生产生物产品(例如PHA)能力的分离的细菌菌株，以及保留这种能力的突变种和变种。本发明公开也提供含有这种分离菌株的微生物聚生体(microbial consortia),以及含有这种分离菌株或微生物聚生体(microbial consortia)的组合物和培养物。所述分离的菌株、微生物聚生体(microbial consortia)、培养物、和组合物可以用于生产生物产品，例如PHA。还发现它们用于:稳定或去稳定在微生物群落(microbial consortium)内的种群动态,减少微生物群落内的污染,促进生物反应器内细胞或生物产品的恢复，改变生物反应器内的微环境，促进PHA在微生物群落内的储存，整治(remediating)生物反应器内化学污染物的存在,促进生物反应器内细胞浓度的增加，抑制生物群落内PHA的降解，监测生物群落内的种群动态或者生物产品的生产，监测生物过程中的细胞浓度，以及选择性消耗微生物群落内的异质底物(heterogeneoussubstrate)。此外，本发明公开是基于，至少部分是基于该新发现:分离的细菌菌株(例如代尔夫特食酸菌(De I ft i a ac i dovorans) MMOI)能够利用来自生物废物进料流(例如来自废水的污物)的挥发性脂肪酸以产生PHA。有利的是，当在本文所公开的某些特定条件下(例如温度和pH值)生长时，所述分离的菌 株能够产生至少为30克的PHA (每100克干重)，比先前描述的产 PHA 细菌菌株 Cupriavidus necator H-16 和 Azohydromonas lata H-4 产更多的 PHA。
[0015]因此，本发明公开的一个方面提供一个或多个分离的产聚羟基链烷酸(PHA)细菌菌株的细菌细胞，其中当所述细胞生长在生物废物进料流中，以氧浓度在20°C约0.0038毫克每升生物废物进料流至在20°C约1.14毫克每升生物废物进料流，约15°C至约34°C的温度范围，和从约6.5至约11的pH值范围时，所述细胞产生每100克干重所述细胞至少10克的PHA ;其中所述生物废物进料流包括一种或多种有机酸。
[0016]在某些实施方案中，所述一个或多个分离的PHA生产细菌细胞表现以ATCC保藏号[0001]保藏的代尔夫特食酸菌(Delftia acidovorans)MMOI细菌菌株细胞的特征。在某些实施方案中，所述一个或多个分离的PHA生产细菌细胞表现以ATCC保藏号[0002]保藏的褐鞘假单胞菌(pseudomonas fuscovaginae) PSFU01细菌菌株细胞的特征。在某些实施方案中，所述一个或多个分离的PHA生产细菌细胞表现以ATCC保藏号[0003]保藏的类产碱假单胞菌(Pseudomonas pseudoalcaligenes) PSA01G细菌菌株细胞的特征。在某些实施方案中，所述一个或多个分离的PHA生产细菌细胞表现以ATCC保藏号[0004]保藏的Vistreoscilla stercoraria VIS01细菌菌株细胞的特征。在某些实施方案中，所述一个或多个分离的PHA生产细菌细胞表现以ATCC保藏号[0005]保藏的恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) PSP04细菌菌株细胞的特征。
[0017]本发明公开的另一方面提供一个或多个分离细菌菌株的细菌细胞，其为以下菌株的:具有以ATCC保藏号[0001]保藏的菌株的所有鉴别特征的细菌菌株；以ATCC保藏号
[0001]保藏的菌株变种，具有以ATCC号[0001]保藏菌株的所有鉴别特征；以及以ATCC号[0001]保藏菌株突变种，具有以ATCC号[0001]保藏菌株的所有鉴别特征。
[0018]本发明公开的另一方面提供了一个或多个分离细菌菌株的细菌细胞，其为以下菌株的:具有以ATCC保藏号[0002]保藏的菌株的所有鉴别特征的细菌菌株；以ATCC保藏号
[0002]保藏的菌株变种，具有以ATCC号[0002]保藏菌株的所有鉴别特征；以及以ATCC号
[0002]保藏菌株突变种，具有以ATCC号[0002]保藏菌株的所有鉴别特征。
[0019]本发明公开的另一方面提供一个或多个分离细菌菌株的细菌细胞，其为以下菌株的:具有以ATCC保藏号[0003]保藏的菌株的所有鉴别特征的细菌菌株；以ATCC保藏号
[0003]保藏的菌株变种，具有以ATCC号[0003]保藏菌株的所有鉴别特征；以及以ATCC号
[0003]保藏菌株突变种，具有以ATCC号[0003]保藏菌株的所有鉴别特征。
[0020]本发明公开的另一方面提供一个或多个分离细菌菌株的细菌细胞，其为以下菌株的:具有以ATCC保藏号[0004]保藏的菌株的所有鉴别特征的细菌菌株；以ATCC保藏号
[0004]保藏的菌株变种，具有以ATCC号[0004]保藏菌株的所有鉴别特征；以及以ATCC号
[0003]保藏菌株突变种，具有以ATCC号[0004]保藏菌株的所有鉴别特征。
[0021]本发明公开的另一方面提供一个或多个分离细菌菌株的细菌细胞，其为以下菌株的:具有以ATCC保藏号[0005]保藏的菌株的所有鉴别特征的细菌菌株；以ATCC保藏号
[0005]保藏的菌株变种，具有以ATCC号[0005]保藏菌株的所有鉴别特征；以及以ATCC号
[0005]保藏菌株突变种，具有以ATCC号[0005]保藏菌株的所有鉴别特征。
[0022]在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一种或多种有机酸位两种或更多种有机酸、三种或更多种有机酸、四种或更多种有机酸、五种或更多种有机酸、六种或更多种有机酸、或者七种或更多种有机酸。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一种或多种有机酸选自:乙酸、丙酸、2-甲基丙酸，2，2- 二甲基丙酸、丁酸、2_甲基丁酸、3-甲基丁酸、戍酸、己酸(hexanoic acid)、己酸(caproic acid)、辛酸、癸酸、月桂酸、以及其它更高碳链脂肪酸，例如，C13至C18碳链长度脂肪酸。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述氧浓度为瞬时氧浓度(transient氧浓度)or a稳态氧浓度(steady state氧浓度)。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述氧浓度为在20°C约0.0038毫克每升生物废物进料流至在20°C约0.76毫克每升生物废 物进料流。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述氧为在20°C约0.0038毫克每升生物废物进料流至在20°C约0.38毫克每升生物废物进料流。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述氧为在20°C约0.038毫克每升生物废物进料流至在20°C约1.14毫克每升生物废物进料流。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述氧为在20°C约0.076毫克每升生物废物进料流至在20°C约0.76毫克每升生物废物进料流。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述氧为在20°C约0.38毫克每升生物废物进料流至在20°C约0.76毫克每升生物废物进料流。
[0023]在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在约20° C至约34° C的温度下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在约25° C至约34° C的温度下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在从约6.5至约10.5的pH范围下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在从约6.5至约10的pH范围下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在从约6.5至约9.5的pH范围下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在从约7.0至约9.5的pH范围下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在从约7.5至约9.5的pH范围下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞在从约8.0至约9.5的pH范围下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述菌株在从约8.5至约9.5的pH范围下生长。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述一个或多个细菌细胞产生至少15克PHA每100克干重，至少20克PHA每100克干重，至少25克PHA每100克干重，至少30克PHA每100克干重，至少35克PHA每100克干重，或者至少40克PHA每100克干重。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为聚(3-羟基丁酸酯-co-3-羟基戊酸酯)(PHBV)，中长链PHA (mcl-PHA),短链(short-chain-length) PHA (scl-PHA)，或其组合。在某些优选的实施方案中，所述scl-PHA为聚羟基丁酸(PHB).在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为聚(3 —羟基丁酸酯一 co-3-羟基戊酸酯)(PHBV)。
[0024]在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述鉴别特征之一是产生生物产品的能力。在某些实施方案中，所述生物产品为聚羟基链烷酸(PHA)。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述鉴别特征之一为产生PHA的能力。在某些实施方案中，所述生物产品为聚羟基链烷酸(PHA)。在所述生物产品为PHA的实施方案中，所述PHA为聚(3-羟基丁酸酯-co-3-羟基戊酸酯)(PHBV)。在所述生物产品为PHA的其它实施方案中，所述PHA为中长链PHA (mcl-PHA)或者短链PHA (scl-PHA)。在所述PHA为scl-PHA的实施方案中，所述scl-PHA为聚羟基丁酸(PHB)。
[0025]本发明公开的另一方面提供组合物，其含有任意的先前实施方案的细菌菌株、变种、和突变种的所述一个或多个分离细菌细胞。在某些实施方案中，所述组合物进一步包含一种或多种菌株，其中所述一个或多个细胞促进所述一种或多种菌株生产PHA的能力。
[0026]本发明公开的另一方面提供微生物群落(microbial consortium),其含有任意的先前实施方案的细菌菌株、变种、和突变种的所述一个或多个分离细菌细胞。在某些实施方案中，所述微生物群落(microbial consortium)进一步包含一种或多种菌株,其中所述一个或多个细胞促进所述一种或多种菌株产生PHA的能力。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述微生物群落(microbial consortium)产生PHA的量比所述一个或多个细胞的纯培养物产生的PHA的量高从至少5%至至少15%。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述微生物群落(microbial consortium)产生PHA的量比所述一个或多个细胞的纯培养物产生的PHA的量高从至少10%至至少15%。
[0027]本发明公开的另一方面提供含有先前实施方案的任意微生物聚生体的组合物。在某些实施方案中，所述微生物群落(microbial consortium)进一步包含一种或多种菌株，其中所述一个或多个细胞促进所述 一种或多种菌株产生PHA的能力。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述微生物群落(microbial consortium)产生PHA的量比所述一个或多个细胞的纯培养物产生的PHA的量高从至少5%至至少15%。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述微生物群落(microbialconsortium)产生PHA的量比所述一个或多个细胞的纯培养物产生的PHA的量高从至少10%至至少15%。
[0028]本发明公开的另一方面提供含有先前实施方案任意微生物聚生体的培养物。本发明公开的另一方面提供含有先前实施方案的培养物的组合物。
[0029]本发明公开的另一方面提供一种培养物，其含有任意的先前实施方案的所述一个或多个分离的细胞、变种、和突变种。本发明公开的另一方面提供含有先前实施方案培养物的组合物。在某些实施方案中，所述组合物进一步包含一种或多种菌株，其中所述一个或多个细胞促进所述一种或多种菌株产生PHA的能力。
[0030]本发明公开的另一方面提供通过培养先前实施方案的任意组合物，来制备生物产品的方法。在某些实施方案中，所述组合物在生物废物进料流中培养。本发明公开的另一方面提供制备生物产品的方法，包括使生物废物进料流与先前实施方案的任意所述组合物接触。在某些实施方案中，所述接触在生物反应器内发生。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述生物废物进料流含有挥发性脂肪酸(VFA)，并且所述生物产品为PHA。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为PHBV、mcl-PHA、scl-PHA、PHB、或其组合。在所述生物产品为PHA的实施方案中，所述PHA为PHBV。在所述生物产品为PHA的其它实施方案中，所述PHA为mcl-PHA或scl-PHA。在所述PHA为scl-PHA的实施方案中，所述scl-PHA为聚羟基丁酸(PHB)。
[0031]本发明公开的另一方面提供通过培养先前实施方案的任意所述组合物，来制备PHA的方法。在某些实施方案中，所述组合物在生物废物进料流中培养。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述生物废物进料流含有挥发性脂肪酸(VFA)。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为PHBV、mcl-PHA、scl-PHA、PHB、或其组合。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为PHBV。在可能与任意的.先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为mcl-PHA或者scl-PHA。在某些实施方案中，所述scl-PHA为聚羟基丁酸(PHB)。
[0032]本发明公开的另一方面提供制备PHA的方法，包括使生物废物进料流发酵以产生挥发性脂肪酸(VFA);并且使所述VFA与所述先前实施方案的任意所述组合物接触。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为PHBV、mcl-PHA、scl-PHA、PHB、或其组合。在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为PHBV0在可能与任意的先前所述实施方案组合的某些实施方案中，所述PHA为mcl-PHA或scl-PHA。在某些实施方案中，所述scl-PHA为聚羟基丁酸(PHB)。
[0033]本发明公开的另一方面提供稳定或去稳定在微生物群落(microbialconsortium)内的种群动态的方法,包括使微生物群落与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，其中所述组合物使所述微生物群落内的种群动态稳定或者去稳定。
[0034]本发明公开的另一方面提供减少微生物群落内污染的方法，包括使微生物群落与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，其中所述组合物减少微生物群落内的污染。
[0035]本发明公开的另一方面提供促进生物反应器内细胞恢复的方法，包括使生物反应器内的细胞与先前所述实施方案的任意组合物接触，其中所述组合物促进所述生物反应器内的细胞恢复。
[0036]本发明公开的另一方面提供促进生物产品恢复的方法，包括使生物反应器内的细胞与先前所述实施方案的任意组合物接触，其中所述组合物促进所述生物反应器内的生物产品恢复。在某些实施方案中，所述生物产品为PHA。在所述生物产品为PHA的实施方案中，所述PHA为PHBV。在所述生物产品为PHA的其它实施方案中，所述PHA为mcl-PHA或者scl-PHA。在所述PHA为scl-PHA的实施方案中，所述scl-PHA为PHB。
[0037]本发明公开的另一方面提供改变生物反应器内的微环境的方法，包括使生物反应器内形成微环境的细胞与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，其中所述组合物改变所述生物反应器内的所述微环境。
[0038]本发明公开的另一方面提供促进PHA在微生物群落内的储存的方法，包括使微生物群落与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，其中所述组合物促进微生物群落内的PHA储存。
[0039]本发明公开的另一方面提供整治(remediating)生物反应器内化学污染物存在的方法，包括使生物反应器内的化学污染物与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，其中所述组合物整治remediating)生物反应器内化学污染物的存在。
[0040]本发明公开的另一方面提供促进生物反应器内细胞浓度增加的方法，包括使生物反应器内的细胞与先前所述实施方案的任意组合物接触，其中所述组合物促进生物反应器内细胞浓度增加。
[0041]本发明公开的另一方面提供抑制生物群落内PHA的降解的方法，包括使微生物群落与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，其中所述组合物已知微生物群落内PHA的降解。
[0042]本发明公开的另一方面提供监测生物群落内的种群动态的方法，包括使微生物群落与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，并且监测所述组合物的特征。
[0043]本发明公开的另一方面提供监测生物群落内的生物产品生产的方法，包括使微生物群落与所述先前所述 实施方案的任意所述组合物接触，并且监测所述组合物的特征。
[0044]本发明公开的另一方面提供检测生物过程中细胞浓度的方法，包括使生物过程内的细胞与所述先前实施方案的任意所述组合物接触，并且监测所述组合物的特征。
[0045]本发明公开的另一方面提供选择性消耗微生物群落内的异质底物(heterogeneous substrate)的方法，包括使微生物群落和异质底物与先前所述实施方南的任意所述组合物接触，其中所述组合物选择性消耗微生物群落内的异质底物的组分。
[0046]附图概述
[0047]图1示出了供料和好氧循环的示意性设备和控制原理图。在所述图中，TRl是循环控制继电器；TR2是营养过剩与饥饿控制继电器；TR3是好氧/好氧控制继电器；?婣是阀门。阀H1、H2、H3、H4和H5是关闭排水管道阀；阀H6、H7、H8和H9是开放排水管道阀。PSV是压力安全阀。
[0048]图2 显不了一个 PHB/PHV 标准品的质谱图(mass spectrograph)。
[0049]图3 显不了由 D.aci dovorans MMOl 产生的 PHA 的质谱图(mass spectrograph)。
[0050]图4显示了由恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) PSP04产生的PHA的质谱图(mass spectrograph)。
[0051]图5 显不了由类产喊假单胞菌(Pseudomonas pseudoalcaligenes) PSA01 产生的PHA 的质谱图(mass spectrograph)。[0052]图6显不了由褐鞘假单胞菌(pseudomonas fuscovaginae) PSFUOl产生的PHA的质谱图(mass spectrograph)ο
[0053]发明详述
[0054]本发明公开涉及细菌菌株、其突变种、和其变种的一个或多个分离的细菌细胞，其能产生生物产品，例如聚羟基链烷酸。本发明公开进一步提供含有这种一个或多个细胞、聚生体的微生物聚生体(microbial consortia)、培养物，以及含有这种一个或多个细胞、聚生体、和培养物的组合物。也提供了它们的使用方法，特别是在生产聚羟基链烷酸(PHA)方面的方法。
[0055]表1列出了本发明公开的分离的细菌菌株的实验室(“Lab”)菌株名称，本发明公开的分离的细菌菌株的保藏菌株名称，和对于每个菌株的ATCC保藏号。应该指出，在整个本发明公开中，使用在表1中列出的每个所述分离细菌菌株的保藏菌株名称。
[0056]表1
【权利要求】
1.一个或多个分离的产聚羟基链烷酸(PHA)细菌菌株的细菌细胞，其特征在于，其中当所述细胞生长在生物废物进料流中，以氧浓度在20°C约0.0038毫克每升生物废物进料流至在20°C约1.14毫克每升生物废物进料流，约15°C至约34°C的温度范围，和从约6.5至约11的PH值范围时，所述细胞产生每100克干重所述细胞至少10克的PHA;其中所述生物废物进料流包括一种或多种有机酸。
2.根据权利要求1所述的一个或多个细菌细胞，其中所述一个或多个细菌细胞表现以ATCC保藏号[0001]保藏的代尔夫特食酸菌(Delftia acidovorans)MM01细菌菌株细胞的特征。
3.根据权利要求2的权利要求1所述的一个或多个细菌细胞，其中所述一种或多种有机酸选自:乙酸、丙酸、2-甲基丙酸、2，2-二甲基丙酸、丁酸、2-甲基丁酸、3-甲基丁酸、戊酸、己酸(hexanoic acid)、己酸(caproic acid)、辛酸、癸酸、月桂酸。
4.根据权利要求1-3任意一项所述的一个或多个细菌细胞，其中所述一个或多个细菌细胞包含每100克干重的所述细胞至少20克的PHA。
5.一个或多个分离细菌菌株的细菌细胞，其为以下菌株的:具有以ATCC保藏号[0001]保藏的菌株的所有鉴别特征的细菌菌株；WATCC保藏号[0001]保藏的菌株变种，其中所述变种具有以ATCC号[0001]保藏菌株的所有鉴别特征；以及以ATCC号[0001]保藏菌株突变种，其中所述突变种具有以ATCC号[0001]保藏菌株的所有鉴别特征。
6.根据权利要求5所述的一个或多个细菌细胞，其中所述鉴别特征之一是产生PHA的能力。
7.根据权利要求1-4和6的任意一项所述的一个或多个细菌细胞，其中所述PHA为聚(3 —羟基丁酸酯一 co-3-羟基戊酸酯)(PHBV)，中长链 PHA(mcl-PHA)，短链 PHA (scl-PHA)，或其组合。
8.根据权利要求7所述的一个或多个细菌细胞，其中所述scl-PHA为聚羟基丁酸(PHB)。
9.根据权利要求1-4和6的任意一项所述的一个或多个细菌细胞，其中所述PHA为聚(3 一羟基丁酸酯一 co-3-羟基戊酸酯)(PHBV)。
10.一种组合物，包含权利要求1-9任意一项所述的一个或多个细菌细胞。
11.权利要求10所述的组合物，进一步包含一种或多种菌株，其中所述一个或多个细菌细胞促进所述一种或多种菌株产生PHA的能力。
12.—种分离的微生物群落，包含权利要求1-9任意一项所述的一个或多个细菌细胞。
13.权利要求12所述分离的微生物群落，进一步包含一种或多种菌株，其中所述一个或多个细菌细胞促进所述一种或多种菌株产生PHA的能力。
14.一种组合物，包含权利要求12或权利要求13所述的分离的微生物群落。
15.生产生物产品的方法，其包括培养如权利要求10、权利要求11或权利要求14所述的组合物。
16.根据权利要求15所述的方法，其中所述组合物在生物废料进料流中培养。
17.根据权利要求16所述的方法，其中所述生物废物进料流包含挥发性脂肪酸(VFA)和所述生物产品为PHA。
18.根据权利要求17所述的方法其中所述PHA为PHBV、me1-PHA, scl-PHA、PHB、或其组合。
19.一种生产PHA的方法，包括培养权利要求10、权利要求11或者权利要求14所述的组合物。
20.根据权利要求19所述的方法其中所述组合物在生物废料进料流中培养。
21.根据权利要求20 所述的方法，其中所述生物废物进料流包含挥发性脂肪酸(VFA)。
【文档编号】C12R1/01GK103476937SQ201180064722
【公开日】2013年12月25日 申请日期:2011年11月29日 优先权日:2010年11月29日
【发明者】R·L·史密斯, J·比塞尔, C·麦格拉思 申请人:迈克罗麦达斯有限公司