一种定量RNaseH活性测定方法

文档序号:488696阅读:2591来源:国知局
一种定量RNaseH活性测定方法
【专利摘要】本发明公开了一种定量RNaseH活性测定方法,所述方法包括如下步骤:以一段RNA模板为底物,在DNA引物存在下,利用逆转录酶合成cDNA,形成DNA-RNA杂合链;以该DNA-RNA杂合链为底物,加入RNaseH酶,进行降解反应;降解反应后测定DNA单链或DNA-RNA杂合链的相对量,由该测定结果推导出RNaseH酶的活性程度。该方法与现有技术方法相比,无放射性污染,操作简单便利,逆转录方法得到的DNA-RNA杂合链可直接用于RNaseH的测活,不需要再经过酚氯仿抽题、乙醇沉淀等步骤,并且可以RNaseH活性进行定量的检测分析。
【专利说明】一种定量RNaseH活性测定方法

【技术领域】
[0001] 本发明属于生化【技术领域】,具体来说涉及一种定量RNaseH活性测定方法。

【背景技术】
[0002] RNaseH,即核糖核酸酶H,是一种核糖核酸内切酶,可以特异性地水解DNA-RNA杂 合链中的RNA。RNase H是基因工程技术中一种重要的工具酶,其应用包括cDNA第二条链 合成前去除mRNA ;通过互补的DNA序列实现对RNA的定点剪切;除去杂交到poly (dT)上的 mRNA中的poly(A);体外多腺苷酸化反应(polyadenylation reaction)产物研究。此外, RNaseH在逆转录病毒中起着非常重要的作用,并且也是目前非转录病毒的重要药物靶标。 因此,精确、快速、简便测定RNase H活性,可以保证RNase H作为工具酶的质量稳定性,且 有助于促进抗病毒药物的开发,具有极大的理论和现实意义。
[0003] 标准的RNaseH测活方法采用放射性同位素法。将RNaseH进行2倍连续梯度稀释, 加入到含%1〇17〇^)、?〇17((11')0嫩和1\1?1^6!1缓冲液的5(^1^反应体系中,371:条 件下孵育,产物用TCA沉淀并加在Whatman滤纸上,就可以实现掺入产物和标记物的分离。 再经过洗涤、干燥、洗脱,最后测定酸可溶性物质中放射性同位素的量,就可以计算出RNase H的活性。这种方法存在易产生放射性污染、步骤多、周期长的缺陷,难以实现高通量、自动 化。


【发明内容】

[0004] 本发明的目的在于建立一种简便、快速、非放射性且定量的RNaseH测活方法,其 原理如图1所示。
[0005] 具体来说,本发明采用了如下技术方案: 一种定量RNaseH活性测定方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:以一段RNA模板 为底物,在DNA引物存在下,利用逆转录酶合成cDNA,形成DNA-RNA杂合链;以该DNA-RNA杂 合链为底物,加入RNaseH酶,进行降解反应;降解反应后测定DNA单链或DNA-RNA杂合链的 相对量,由该测定结果推导出RNaseH酶的活性程度。
[0006] 优选地,DNA单链或DNA-RNA杂合链的相对量是利用荧光染料,通过荧光法测得 的,并且该相对量是以荧光强度表示的。更优选,所用的荧光染料是双链特异性荧光染料。 在一个实施方案中,所用的双链特异性突光染料是商购的picogreen染料。
[0007] RNA模板可以采用任何适合长度的RNA单链,只要能方便地测定RNaseH酶活即可。 在一个实施方案中,所用RNA模板为一段polyA RNA单链,所用的DNA引物为Oligo dT。
[0008] 本发明的优点: 1. 无放射性污染; 2. 操作步骤简单,重复性好,稳定性强,反应迅速; 3. 逆转录方法得到的DNA-RNA杂合链可直接用于RNaseH的测活,不需要再经过酚氯 仿抽题、乙醇沉淀等步骤; 4.可以对RNaseH活性进行定量的检测分析,便于操作。

【专利附图】

【附图说明】
[0009] 图1为本发明测定方法的原理图。
[0010] 图2为通过本发明方法测得的RNaseH活性-荧光强度曲线图。
[0011] 图3为不同来源RNaseH的酶活-荧光强度曲线图。

【具体实施方式】
[0012] 本发明建立了一种简便、快速、非放射性且定量的RNaseH测活方法,其原理如图1 所示。
[0013] 如图1所示,本发明选择PolyA作为RNA单链,以Oligo dT为引物,先用逆转录酶 进行相匹配的cDNA链的合成,生成的DNA-RNA杂合链作为本测活方法中的底物。若加入 RNaseH,则该酶会降解DNA-RNA杂合链中的RNA链,产生一条DNA单链,该单链不能被双链 特异性的Picogreen染料结合,不产生荧光;若不加入RNaseH,体系中仍是DNA-RNA杂合链 的结构,贝 1J可以被双链特异性的picogreen染料结合,发出突光。
[0014] 由此可见,RNaseH的活性在一定范围内同DNA-RNA杂合链的量成反比,而DNA-RNA 杂合链的量在一定情况下,同荧光强度成正比。因此,RNaseH的活性就可以用picogreen荧 光强度来进行测定。
[0015] 本发明人进一步证明了上述假设,从而建立了非放射性、简便、快速且可以定量的 RNaseH测活方法。
[0016] 下面将结合具体实施例来进一步说明本发明。
[0017] 实施例1.荧光法测定RNaseH活性方法的建立 1. 构建DNA+RNA杂合链体系: 逆转录酶为PrimeScript逆转录酶(TaKaRa 2680A)

【权利要求】
1. 一种定量RNaseH活性测定方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:以一段 RNA模板为底物,在DNA引物存在下,利用逆转录酶合成cDNA,形成DNA-RNA杂合链;以 该DNA-RNA杂合链为底物,加入RNaseH酶,进行降解反应;降解反应后测定DNA单链或 DNA-RNA杂合链的相对量,由该测定结果推导出RNaseH酶的活性程度。
2. 如权利要求1所述的定量RNaseH活性测定方法,其特征在于,DNA单链或DNA-RNA 杂合链的相对量是利用荧光染料,通过荧光法测得的,并且该相对量是以荧光强度表示的。
3. 如权利要求2所述的定量RNaseH活性测定方法,其特征在于,所用的荧光染料是双 链特异性荧光染料。
4. 如权利要求3所述的定量RNaseH活性测定方法,其特征在于,所用的双链特异性荧 光染料是picogreen染料。
5. 如权利要求1所述的定量RNaseH活性测定方法,其特征在于,所用RNA模板为一段 polyA RNA单链,所用的DNA引物为Oligo dT。
【文档编号】C12Q1/68GK104293931SQ201410502173
【公开日】2015年1月21日 申请日期:2014年9月28日 优先权日:2014年9月28日
【发明者】徐晓昱, 王静 申请人:南京诺唯赞生物科技有限公司
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1