一种大豆开花期的qtl作图区间及获得方法和应用的制作方法
【专利摘要】一种大豆开花期的QTL作图区间及获得方法和应用，它涉及一种QTL作图区间及获得方法和应用。所述的大豆开花期的QTL作图区间为Sat_128—Satt519—Sct_026，期货的方法为：一、将大豆品种TK780和H4杂交，对F1代获得的种子进行自交，获得重组自交系群体；二、确定遗传距离，绘制连锁群图谱；三、利用MapQTL5.0，以LOD≥2.5为标准，对大豆开花期进行遗传作图。其中，大豆开花期SSR标记Satt519作为选择大豆开花期的分子标记在大豆遗传育种中的应用。本发明的区间为进一步丰富大豆开花期调控网络提供了一种最经济有效的分子育种新途径。
【专利说明】-种大豆开花期的QTL作图区间及获得方法和应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于大豆分子育种领域，具体地涉及一种WL作图区间及获得方法和应 用。
【背景技术】
[0002] 大豆为人类提供重要的植物蛋白质和油份。在世界范围内，北至高缔度的北欧瑞 典和北美加拿大，南至己西及阿根廷等广泛区域内均有大豆栽培，但单个品种或种质资源 一般适宜种植的缔度跨度较小，该种区域适应性与大豆的生育期基因密切相关。迄今已发 现了 10个主要影响大豆开花期和成熟期（生育期）基因位点E1-E9和J。但大豆的开花期 是一个数量性状，受多个基因同时控制，发掘与大豆生育期有关的数量性状遗传位点，对于 进一步丰富大豆生育期调控网络的研究有重要意义。
【发明内容】
[0003] 本发明的目的在于提供一种大豆开花期的WL作图区间及获得方法和应用，所述 的作图区间为如表1所示的大豆开花期QTL的11号染色体作图区间Sat_128 - Satt519- Sct_026,该区间的Satt519可作为选择大豆开花期的分子标记。
[0004] 本发明的一种大豆开花期的WL区间的分子标记，所述的大豆开花期的WL作图 区间为 Sat_128 -Sat1:5l9-Sct_026。
[0005] 本发明的大豆开花期SSR标记Satt519作为选择大豆开花期的分子标记在大豆遗 传育种中的应用。
[0006] 本发明的一种大豆开花期的WL作图区间的获得方法，所述的大豆开花期的QTL 作图区间为Sat_128 - Satt519 - Sct_026,它是按照W下步骤进行的：
[0007] -、TK780和H4杂交，对Fi代获得的种子进行自交，获得重组自交系群体；
[0008] 二、根据MapManage;rp;rogramQT甜20确定遗传距离，用Mapchart2. 1绘制连锁群图 谱；
[0009] H、利用MapQ化5. 0, W LOD > 2. 5为标准，对大豆开花期进行遗传作图。
[0010] 本发明利用大豆品种TK780和H4杂交，产生的96个后代中选择种子继续种植，多 代自交得到一个由96个株系组成的重组自交系群体。并将此群体分成两个亚群体；El背 景下的60个个体的重组自交系群体A和eini背景下的36个个体的重组自交系群体B。利 用96个个体的群体构建了具有282个标记的遗传连锁图谱。并将第九代重组自交系群体 种植在H个试验点进行田间花期统计，即2004年在日本札幌，2005年在日本札幌，2010年 在中国哈尔滨，分别统计96个个体的花期。
[0011] 本发明利用MapManagerprogramQT甜20确定遗传距离后，用Mapchart2. 1绘制连 锁群图谱。利用MapQ化5.0, W LOD >2. 5为标准，对大豆开花期进行遗传作图。结果在用 El背景下的60个个体的A群体检测WL时，发现在第11号染色体有H个试验点重复出现 的QTL区间Sat_128-Satt519-Sct_026,如表1所示。其中Satt519为H个试验点共同 出现的标记，其贡献率大于24. 8%，最大可达40. 6%。与此标记紧密相连的QTL的加性效 应为负值，即H4为该WL的供体。因此，无论是从WL的定位，还是WL对表型的贡献率来 看，W Sat巧19居中的Sat_128 -Sat巧19一Sct_026的区间都是大豆开花期的理想标记区 间。
[0012] 本发明包含W下有益效果：
[0013] 本发明W Satt519居中的Sat_128-Satt519-Sct_026的区间都是大豆开花期 的理想标记区间（见表1所示），其中Satt519为H个试验点共同出现的标记，其贡献率大 于24. 8%，最大可达40. 6%。与此标记紧密相连的QTL的加性效应为负值，即H4为该QTL 的供体。因此，无论是从QTL的定位，还是Q化对表型的贡献率来看，W Satt519居中的 Sat_128一Sat巧19一Sct_026的区间都是大豆开花期的理想标记区间。
[0014] 利用本发明提供的如表1所示的大豆开花期染色体作图区间Sat_128-Sat巧19一Sct_026的重要意义在于，利用Sat巧19进行分子标记选择晚花性状时，就要选 择与H4具有相同标记的育种材料，该就为为培育晚花的大豆品种提供了一条有效的途径。 利用晚花的性状对于扩大大豆的种植范围具有重要意义。此外，此标记还可W进一步丰富 大豆开花期调控网络提供了一种最经济有效的分子育种新途径。
【专利附图】
【附图说明】
[0015] 图1给出本发明的大豆开花期的遗传作图。
【具体实施方式】
【具体实施方式】 [0016] 一；本实施方式的一种大豆开花期的WL作图区间，所述的大豆开 花期的9化作图区间为Sat_128-Satt519-Sct_026。
【具体实施方式】 [0017] 二；本实施方式与一不同的是；所述的Sat_128引物 序列为：
[0018] 上游引物；5, GGGGTTTTGTTAATCATTGTCCTTAGAT3'
[0019] 下游引物；5, GGGAGAAAATTTTTAATGCCAGTAGTTA3'。其它与【具体实施方式】一相同。
【具体实施方式】 [0020] 二；本实施方式与一不同的是；W Satt519作为分子 标记选择大豆开花期的Q化作图区间Sat_128 - Satt519 - Sct_026。其它与 一相同。
【具体实施方式】 [0021] H ;本实施方式与一或二不同的是：所述的分子标记 Satt519是W待鉴定材料的基因组DNA作为模板，W引物进行PCR扩增所得的片段；所述的 引物序列为：
[0022] 上游引物；5，GGATTTCAAAGAATGAACACAGA3，
[0023] 下游引物；5' CCGCAAGGTTACGAACTGCTCGAA3'。其它与【具体实施方式】一或二相同。
【具体实施方式】 [0024] 四；本实施方式与一至H之一不同的是；所述的PCR 反应条件如下：
[00 巧]
【权利要求】
1. 一种大豆开花期的QTL作图区间，其特征在于所述的大豆开花期的QTL作图区间为 Sat-128-Satt 519-Set-026。
2. 根据权利要求1所述的一种大豆开花期的QTL作图区间，其特征在于以Satt519作 为分子标记选择大豆开花期的QTL作图区间Sat_128 - Satt519 - Sct_026。
3. 根据权利要求2所述的一种大豆开花期的QTL作图区间，其特征在于所述的分子标 记Satt519是以待鉴定材料的基因组DNA作为模板，以引物进行PCR扩增所得的片段；所述 的引物序列为： 上游引物：5' GGATTTCAAAGAATGAACACAGA3' 下游引物：5' CCGCAAGGTTACGAACTGCTCGAA3'。
4. 根据权利要求3所述的一种大豆开花期的QTL作图区间，其特征在于： 所述的PCR反应条件如下：
PCR扩增条件为：94°C预变性5min，94°C变性30s，48°C退火30s，72°C延伸30s，共35个 循环，再72°C延伸10min，4°C保温。
5. 根据权利要求1所述的一种大豆开花期的QTL作图区间，其特征在于用于PCR扩增 Sat_128的引物为： 上游引物：5 ' GGGGITITGTTAATCAITGTCCTTAGAT3 ' 下游引物：5' GGGAGAAAATTTTTAATGCCAGTAGTTA3'。
6. 根据权利要求1所述的一种大豆开花期的QTL作图区间，其特征在于用于PCR扩增 Sct_026的引物为： 上游引物：5' CGAAACGCAAAATCTC3' 下游引物：5' AAAACGTATCTGAAGTAGTGG3'。
7. 大豆开花期SSR标记Satt519作为选择大豆开花期的分子标记在大豆遗传育种中的 应用。
8. 根据权利要求7的大豆开花期SSR标记Satt519的应用，其特征在于大豆开花期SSR 标记Satt519来源于大豆品种H4。
9. 一种大豆开花期的QTL作图区间的获得方法，其特征在于它是按照以下步骤进行 的： 一、将大豆品种TK780和H4杂交，对F1代获得的种子进行自交，获得重组自交系群体； 二、 利用MapManagerprogramQTXb20确定遗传距离，用Mapchart2. 1绘制连锁群图谱； 三、 利用MapQTL5. 0,以LOD彡2. 5为标准，对大豆开花期进行遗传作图。
【文档编号】C12N15/11GK104357442SQ201410578282
【公开日】2015年2月18日 申请日期:2014年10月25日 优先权日:2014年10月25日
【发明者】孔凡江, 刘宝辉, 芦思佳, 王家麟, 曹东, 袁晓辉 申请人:中国科学院东北地理与农业生态研究所