本申请要求于2015年12月18日提交的美国临时申请第62/269,805号和于2016年11月30日提交的美国临时申请第62/428,498号的优先权，两者均通过引用整体并入本文。
技术领域
本公开涉及治疗患者癌症的方法，其中已知患者具有ALK、ROS1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、TrkA、TrkB或TrkC或其组合中的至少一处分子改变，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是抑制剂或ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC或其组合，第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。
背景技术：
蛋白激酶(PK)的功能障碍是许多疾病的标志。大部分涉及人类癌症的癌基因和原癌基因编码PK。关于PK功能障碍或调控失常的一般参考，例如参见《化学生物学新见(Current Opinion in Chemical Biology)》1999，3:459-465，其通过引用整体并入本文。
间变性淋巴瘤激酶(ALK)是属于RTK的胰岛素受体亚家族的酪氨酸激酶受体：ALK基因位于染色体2上并主要在神经元细胞中表达，特别是在发育过程中。许多来自文献的数据已经证明ALK融合蛋白具有强致癌潜力。
ROS1属于胰岛素受体超家族。像其他酪氨酸激酶受体分子一样，它在将来自细胞外的环境的生长信号转移到细胞核中起作用。它是两种没有已知结合配体的孤儿受体酪氨酸激酶家族成员之一。ROS1的遗传变化，例如基因重排、突变或拷贝数增加，会产生癌基因，从而导致癌症。ROS1在NSCLC患者中以融合蛋白(ROS1的6种不同伴侣)的形式出现，并且可在约2％的NSCLC患者中找到ROS1。在多种其他癌症中，包括多形性胶质母细胞瘤、胆管癌、卵巢癌、胃腺癌、结肠直肠癌、炎症性肌纤维母细胞瘤、血管肉瘤和上皮样血管内皮瘤，已检测到另两种ROS1基因重排。
Trk是由一组称为神经营养因子(NT)的可溶性生长因子激活的高亲和力受体酪氨酸激酶。Trk受体家族有三个成员——TrkA、TrkB和TrkC。神经营养因子中有(i)激活TrkA的神经生长因子(NGF)，(ii)激活TrkB的脑源性神经营养因子(BDNF)和NT-4/5，和(iii)激活TrkC的NT3。Trk在神经元组织中广泛表达，并涉及神经元细胞的维持、信号传导和存活(Patapoutian等人，《神经生物学新见(Current Opinion in Neurobiology)》，2001，11，272-280，其通过引用整体并入本文)。NTRK1编码TrkA受体酪氨酸激酶。TrkA激活促进细胞生长和存活的PI3K/AKT、PKC和ERK1/2途径。
最近的文献已显示Trk的过表达、激活、扩增和/或突变与多种癌症相关联，包括包括神经母细胞瘤(Brodeur，G.M.，《自然癌症综述(Nat.Rev.Cancer)》2003，3，203-216，通过引用整体并入本文)，卵巢癌(Davidson.B.等人，《临床癌症研究(Clin.Cancer Res.)》2003，9，2248-2259，通过引用整体并入本文)，乳腺癌(Kruettgen等人，《脑病理学(Brain Pathology)》2006，16:304-310，通过引用整体并入本文)，前列腺癌(Dionne等人，《临床癌症研究(Clin.Cancer Res.)》1998，4(8):1887-1898，通过引用整体并入本文)，胰脏癌(Dang等人，《肠胃病与肝病学杂志(Journal of Gastroenterology and Hepatology)》2006，21(5):850-858，通过引用整体并入本文)，多发性骨髓瘤(Hu等人，《癌遗传学与细胞遗传学(Cancer Genetics and Cytogenetics)》2007，178:1-10，通过引用整体并入本文)，星形细胞瘤和髓母细胞瘤(Kruettgen等人，《脑病理学(Brain Pathology)》2006，16:304-310，通过引用整体并入本文)神经胶质瘤(Hansen等人，《神经化学杂质(Journal of Neurochemistry)》2007，103:259-275，通过引用整体并入本文)，黑素瘤(Truzzi等人，《皮肤病学研究杂志(Journal of Investigative Dermatology)》2008，128(8):2031-2040，通过引用整体并入本文)，甲状腺癌(Brzezianska等人，《神经内分泌学快报(Neuroendocrinology Letters)》2007，28(3)，221-229，通过引用整体并入本文)，肺腺癌(Perez-Pinera等人，《分子和细胞生物化学(Molecular and Cellular Biochemistry)》2007，295(1&2)，19-26，通过引用整体并入本文)，大细胞神经内分泌肿瘤(Marchetti等人，《人类突变(Human Mutation)》2008，29(5)，609-616，通过引用整体并入本文)和结肠直肠癌(Bardelli，A.，《科学(Science)》2003，300，949，通过引用整体并入本文)。在癌症的临床前模型中，Trk抑制剂在抑制肿瘤生长和阻止肿瘤转移方面都是有效的。特别是，TrkA、B和C以及Trk/Fc嵌合体的非选择性小分子抑制剂在抑制肿瘤生长和阻止肿瘤转移方面都是有效的(Nakagawara,A.《癌症快报(Cancer Letters)》2001，169:107-114；Meyer等人，《白血病(Leukemia)》2007，1-10；Pierottia和Greco，《癌症快报(Cancer Letters)》2006，232:90-98；Eric Adriaenssens等人，《癌症研究(Cancer Res)》2008，68:(2)346-351；Truzzi等人，《皮肤病学研究杂志(Journal of Investigative Dermatology)》2008，128(8):2031-2040，其各自通过引用整体并入本文)。因此，激酶的Trk家族的抑制剂预期可用于治疗癌症。
技术实现要素：
一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合；并且第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ALK中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。在一些实施例中，所述ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:4所示的ALK多肽的氨基酸残基G1202或G1269的位置。在一些实施例中，所述ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:4所示的ALK多肽的氨基酸残基G1202的位置。在一些实施例中，所述ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:4所示的ALK多肽的氨基酸残基G1269的位置。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ROS1抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ROS1中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ROS1抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。在一些实施例中，所述ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:5所示的ROS1多肽的氨基酸残基G2032或G2101的位置。在一些实施例中，所述ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:5所示的ROS1多肽的氨基酸残基G2032的位置。在一些实施例中，所述ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:5所示的ROS1多肽的氨基酸残基G2101的位置。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkA抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有NTRK1中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkA抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:1所示的TrkA多肽的氨基酸残基G595或G667的位置。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:1所示的TrkA多肽的氨基酸残基G595的位置。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Arg取代(G595R)。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:1所示的TrkA多肽的氨基酸残基G667的位置。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Cys取代(G667C)。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkB抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有NTRK2中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkB抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:2所示的TrkB多肽的氨基酸残基G639或G709的位置。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:2所示的TrkB多肽的氨基酸残基G639的位置。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Arg取代(G639R)。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:2所示的TrkB多肽的氨基酸残基G709的位置。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Cys取代(G709C)。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkC抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有NTRK3中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文公开了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkC抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:3所示的TrkC多肽的氨基酸残基G623或G696的位置。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:3所示的TrkC多肽的氨基酸残基G623的位置。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Arg取代(G623R)。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:3所示的TrkC多肽的氨基酸残基G696的位置。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Cys取代(G696C)。
在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，第二药剂是MEK抑制剂。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1、MEK2或其组合的抑制剂。在一些实施例中，所述MEK抑制剂选自由以下组成的群组：PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼(refametinib)、曲美替尼、匹马西布(pimasertib)、比尼替尼(binimetinib)、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，MEK抑制剂是PD0325901。在一些实施例中，MEK抑制剂是司美替尼。在一些实施例中，MEK抑制剂是考比替尼。在一些实施例中，MEK抑制剂是瑞美替尼。在一些实施例中，MEK抑制剂是曲美替尼。在一些实施例中，MEK抑制剂是匹马西布。在一些实施例中，MEK抑制剂是比尼替尼。在一些实施例中，MEK抑制剂是AZD8330。在一些实施例中，MEK抑制剂是RO4987655。在一些实施例中，MEK抑制剂是RO5126766。在一些实施例中，MEK抑制剂是WX-554。在一些实施例中，MEK抑制剂是E-6201。在一些实施例中，MEK抑制剂是GDC-0623。在一些实施例中，MEK抑制剂是TAK-733。在一些实施例中，MEK抑制剂是RG-7304。在一些实施例中，MEK抑制剂是CKBP-002。在一些实施例中，MEK抑制剂是RDEA-436。在一些实施例中，MEK抑制剂是索拉非尼。在一些实施例中，MEK抑制剂是PD-184352。在一些实施例中，MEK抑制剂是GSK-2091976A。在一些实施例中，MEK抑制剂是AS-703988。
在一些实施例中，第二药剂是ERK抑制剂。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1、ERK2或其组合的抑制剂。在一些实施例中，ERK抑制剂选自由以下组成的群组：TG-02、MK-8353、尤夏替尼(ulixertinib)、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。在一些实施例中，ERK抑制剂是TG-02。在一些实施例中，ERK抑制剂是MK-8353。在一些实施例中，ERK抑制剂是尤夏替尼。在一些实施例中，ERK抑制剂是HE-3235。在一些实施例中，ERK抑制剂是AEZS-134。在一些实施例中，ERK抑制剂是AEZS-136。在一些实施例中，ERK抑制剂是IDN-5491。
在一些实施例中，癌症选自非小细胞肺癌、甲状腺乳头状癌、神经母细胞瘤、胰脏癌、黑素瘤和结肠直肠癌。在一些实施例中，癌症是非小细胞肺癌。在一些实施例中，癌症是甲状腺乳头状癌。在一些实施例中，癌症是神经母细胞瘤。在一些实施例中，癌症是胰脏癌。在一些实施例中，癌症是黑素瘤。在一些实施例中，癌症是结肠直肠癌。
在一些实施例中，所述组合是药物组合物，其包含治疗有效量的第一药剂、治疗有效量的第二药剂和至少一种药学上可接受的载剂。
在一些实施例中，所述组合是同时给予包含治疗有效量的第一药剂的第一药物组合物和包含治疗有效量的第二药剂的第二药物组合物。
在一些实施例中，所述组合是依序给予包含治疗有效量的第一药剂的第一药物组合物和包含治疗有效量的第二药剂的第二药物组合物。
附图说明
图1是来自实例9的蛋白质印迹分析，证明在表达TPM3-TrkA-G595R的Ba/F3细胞与表达野生型TPM3-TrkA的Ba/F3细胞中，p-MEK1/2(Ser217/221)和总MEK1/2上调。
图2是来自实例10的活细胞生长的图，证明与未经处理的细胞(DMSO)、单用恩曲替尼(entrectinib)(300nM)处理的细胞以及单用曲美替尼(30nM)处理的细胞相比，用恩曲替尼(300nM)和曲美替尼(30nM)的组合处理的表达TPM3-TrkA-G595R的Ba/F3细胞显示出显著的生长抑制(多至40天)。
图3是来自实例11的结果的图，其证明与对照组(赋形剂)中的小鼠、单用恩曲替尼(60mg/kg)处理的小鼠以及单用曲美替尼(1mg/kg)处理的小鼠的肿瘤生长相比，在被给予恩曲替尼(RXDX-101)(60mg/kg)和曲美替尼(1mg/kg)的组合的小鼠中降低了植入表达TPM3-TrkA-G595R的细胞的小鼠中的肿瘤生长。
具体实施方式
如本文使用，术语“N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺”是指具有以下化学结构的化合物，
N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺可以按照美国专利第8,299,057号中所述制备，其公开内容通过引用整体并入本文。N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺与CAS登记号1108743-60-7相关联。N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺化合物也可以被描述为“恩曲替尼”和/或“RXDX-101”。
除非上下文另有明确规定，否则单数形式“一种(a/an)”和“所述(the)”包括复数指代。例如，术语“一种细胞”包括一种或多种细胞，包括其混合物。本文中使用“A和/或B”以包括所有以下替代表达方式：“A”、“B”、“A或B”和“A和B”。
如本文使用，术语“约”是指在包括提供的值的所有情况下，或者在提供的值的正负10％内，或者四舍五入到最接近的有效数字。在提供范围时，所述范围包含边界值。
如本文使用，术语“酸化剂”是指本质上呈酸性的化学化合物。如本文使用，术语“有机酸化剂”是指其化学组成包含碳的酸化剂。如本文使用，术语“无机酸化剂”是指其组成不含碳的酸化剂。
如本文使用，术语“给药(administration/administering)”是指通过给药途径递送生物活性组合物或制剂，所述给药途径包括但不限于静脉给药、动脉给药、肌肉给药、腹腔给药、皮下给药、局部肌肉给药或其组合。
如本文使用，术语“AUC”是指患者血浆中的化合物的浓度随时间变化的图的曲线下面积。
如本文使用，术语“间变性淋巴瘤激酶”和“ALK”是指ALK酪氨酸激酶受体或CD246(分化簇246)，其是在人体中由ALK基因编码并且还具有UniProt标识符ALK_HUMAN的酶。
如本文使用，术语“AZD8330”是指具有以下化学结构的化合物，
AZD8330的替代名称包括AZD-8330和2-(2-氟-4-碘苯基氨基)-N-(2-羟基乙氧基)-1,5-二甲基-6-氧代-1,6-二氢吡啶-3-甲酰胺。AZD8330与CAS登记号869357-68-6相关联。
如本文使用，术语“甜菜碱盐酸盐”是指具有CAS登记号590-46-5和通用名称1-羧基-N,N,N-三甲基甲基氯化铵和(羧甲基)三甲基铵盐酸盐的化合物。
如本文使用，术语“比尼替尼”是指具有以下化学结构的化合物，
比尼替尼的替代名称包括MEK162、ARRY-162、ARRY-438162和5-((4-溴-2-氟苯基)氨基)-4-氟-N-(2-羟基乙氧基)-1-甲基-1H-苯并[d]咪唑-6-甲酰胺。比尼替尼与CAS登记号606143-89-9相关联。
如本文使用，术语“生物样本”包括从生物体获得的各种样本类型，并且可用于诊断或监测测定。样本可以是健康组织、患病组织或疑似患病组织。样本可以是例如在手术过程中取得的活检。可以通过细针抽吸、刮擦或清洗腔体以收集细胞或其组织来收集样本。样本可以是肿瘤，例如实体肿瘤和造血系统肿瘤以及邻近的健康组织。样本可能是单个细胞或组织切片的涂片。所述术语包括生物来源的血液和其他液体样本，固体组织样本，如活检样本或组织培养物或由其衍生的细胞及其后代。所述术语包括在获得之后以任何方式操作的样本，例如通过用试剂处理、溶解或富集某些组分。所述术语包括临床样本，并且还包括细胞培养物、细胞上清液、细胞裂解物、细胞提取物、细胞匀浆、亚细胞组分(包括合成蛋白、血清、血浆、体液和其他生物流体)以及组织样本中的细胞。生物样本可以含有天然不与自然界中的细胞或组织混合的化合物，例如防腐剂、抗凝血剂、缓冲剂、固定剂、营养物、抗生素等。在一个实施例中，样本保存为冷冻样本或甲醛或多聚甲醛固定石蜡包埋(FFPE)组织制备物。例如，样本可以包埋于基质中，例如FFPE块或冷冻样本。
如本文使用，术语“生物标志物”是指其核酸或蛋白产物的水平相对于患者的生物学状态的方面具有定量差异浓度或水平的分子。“生物标志物”和“标志物”在本文中可互换使用。可以以核酸水平以及多肽水平测量生物标志物的水平。以核酸水平，可以测量核酸基因或从患者染色体和染色体外基因组的任何部分转录的转录物(包括例如线粒体基因组)。优选测量生物标志物的RNA转录物，更优选测量生物标志物的包括初级转录物、剪接转录物、可变剪接转录物或mRNA的RNA转录物。以多肽水平，可以测量生物标志物的前肽元、肽元，成熟肽或分泌肽。生物标志物可以单独使用或与一种或多种其他标识的生物标志物结合使用，以便允许与如本文所定义的感兴趣生物学状态相关。本公开涵盖的生物标志物的具体实例包括ALK、ROS1、TrkA、TrkB和TrkC。
如本文使用，“癌症”是指由异常细胞生长引起的任何恶性和/或侵袭性生长或肿瘤。如本文使用，“癌症”是指针对形成它们的细胞的类型命名的实体肿瘤，血癌、骨髓癌或淋巴系统癌。实体肿瘤的实例包括但不限于肉瘤和癌。血癌的实例包括但不限于白血病、淋巴瘤和骨髓瘤。术语“癌症”包括但不限于源于身体特定部位的原发性癌症，已经从其开始的部位扩散到身体其他部位的转移性癌症，原始原发性癌症在缓解之后的复发以及具有癌症病史的人的第二原发性癌症(第二原发性癌症是一种新的原发性癌症，之前所患癌症与之后所患癌症类型不同)。这些术语还意味着具有典型致癌细胞特征的细胞的存在，典型致癌细胞特征例如不受控制的增殖、永生化、转移潜能、快速生长和增殖速率以及某些特征性形态学特征。癌细胞通常呈肿瘤形式，但这些细胞可以单独存在于动物体内，或者可以是非致瘤性癌细胞，如白血病细胞。这些术语包括实体肿瘤、软组织肿瘤或转移性病灶。如本文使用，术语“癌症”包括恶变前癌症以及恶性癌症。在某些实施例中，癌症是实体肿瘤、软组织肿瘤或转移性病灶。
如本文使用，术语“化疗剂”是指用于治疗病症(特别是癌症)的化学物质，例如细胞毒性剂或细胞抑制剂。
如本文使用，术语“Cmax”是指在已将化合物或包含所述化合物的药物组合物给予患者之后，所述化合物在患者血浆中达到的峰浓度。在一些实施例中，将所述化合物或包含所述化合物的药物组合物经口服给予患者以达到特定的Cmax。
如本文使用，术语“考比替尼”是指具有以下化学结构的化合物，
考比替尼的替代名称包括GDC-0973、XL-518、RG7420、CotellicTM和(S)[3,4-二氟-2-(2-氟-4-碘苯基氨基)苯基]3-羟基-3-(哌啶-2-基]氮杂环丁-1-基)甲酮。考比替尼与CAS登记号934660-93-2相关联。
如本文使用，术语“组合”和“与…组合”是指将本文提供的化合物连同至少一种其他药物或药剂(例如，抗癌剂)依序或同时给予。其包括同时给药，或彼此相隔几分钟或几小时给药，或在同一天给药或隔天给药，或者每天、每周多天或每周给予本文提供的化合物，例如，在给予本文提供的化合物的同时或在其一部分时间期间，在同一天/周、隔天/周或周期性地给予其他化合物(例如，化疗剂)。例如，N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐可以每天或每周几天给药，而化疗剂隔天、隔周或以其他时间周期(例如，每1天、2天、3天、4天、5天、6天、7天、8天、9天、10天、11天、12天、13天、14天或更多天)给药。
如本文使用，术语“E6201”是指具有以下化学结构的化合物，
E6201的替代名称包括(3S,4R,5Z,8S,9S,11E)-14-(乙基氨基)-8,9,16-三羟基-3,4-二甲基-3,4,9,10-四氢-1H-2-苯并氧杂环四癸炔-1,7-(8H)-二酮。E6201与CAS登记号603987-35-5相关联。
如本文使用，术语“ERK”是指细胞外信号调节激酶(ERK)家族，并且是蛋白激酶细胞内信号传导分子。ERK包括但不限于ERK1和ERK2。如本文使用，术语“ERK1”是指具有UniProt标识符MK03_HUMAN并且由MAPK3基因编码的细胞外信号调节激酶1。如本文使用，术语“ERK2”是指具有UniProt标识符MK01_HUMAN并且由MAPK1基因编码的细胞外信号调节激酶2。ERK1和ERK2还分别被本领域普通技术人员称为MAPK3和MAPK1。对ERK1的引用是对MAPK3的引用。对ERK2的引用是对MAPK1的引用。除非另外指明，否则术语“ERK”的使用可以指ERK1、ERK2或其组合。
如本文使用，术语“食物影响”是指当将所述化合物在进餐后不久(即进食条件)给予患者时，化合物在患者中的吸收速率和/或程度相比于当化合物在禁食条件下给予患者时化合物的吸收速率和/或程度的改变。如本文使用，术语“无食物影响”是指当在进食条件下将化合物给予患者时，化合物在患者中的吸收速率和/或程度与禁食条件相比没有显著的差异。
如本文使用，术语“GDC-0623”是指具有以下化学结构的化合物，
GDC-0623的替代名称包括5-[(2-氟-4-碘苯基)氨基]-N-(2-羟基乙氧基)-咪唑并[1,5-a]吡啶-6-甲酰胺。GDC-0623与CAS登记号1168091-68-6相关联。
如本文使用，术语“HE-3235”是指具有以下化学结构的化合物，
HE-3235的替代名称包括HE3235、H E3235、和(3R,5S,8R,9S,10S,13S,14S,17R)-17-乙炔基-10,13-二甲基十六氢-1H-环戊[a]菲-3,17-二醇。HE-3235与CAS登记号183387-50-0相关联。
如本文使用，术语“IDN-5491”是指具有以下化学结构的化合物，
IDN-5491的替代名称包括贯叶金丝桃素三甲氧基苯甲酸酯和(1S,5R,7S,8R)-1-异丁酰基-8-甲基-3,5,7-三(3-甲基-2-丁烯-1-基)-8-(4-甲基-3-戊烯-1-基)-4,9-二氧代双环[3.3.1]壬-2-烯-2-基2,3,4-三甲氧基苯甲酸酯。
如本文使用，术语“MEK”是指有丝分裂原/细胞外信号调节激酶(MEK)家族，并且是磷酸化有丝分裂原活化蛋白激酶(MAPK)的激酶。MEK也被称为MAP2K和MAPKK。MEK的异构型包括但不限于MEK1和MEK2。如本文使用，术语“MEK1”是指具有UniProt标识符MP2K1_HUMAN并且由MAP2K1基因编码的有丝分裂原/胞外信号调节激酶-1。如本文使用，术语“MEK2”是指具有UniProt标识符MP2K2_HUMAN并且由MAP2K2基因编码的有丝分裂原/细胞外信号调节激酶-2。除非另外指明，否则术语“MEK”的使用可以指MEK1、MEK2或其组合。
如本文使用，术语“微阵列”是安装在能够结合其他分子种类或抗体的固体载体上的阵列元素(例如，来自患者的生物样本的小样本，例如组织样本)的有序排列。阵列元素被布置成使得优选存在至少一个或多个不同的阵列元素。
如本文使用，术语“分子改变”和“遗传改变”是指与相应的野生型基因或蛋白质相比，基因序列或蛋白质序列在患者的或多个细胞中的任何变化。一处或多处分子改变包括但不限于基因突变、基因扩增、剪接变体、缺失、基因重排、单核苷酸变异(SNV)、插入和异常RNA/蛋白表达。术语“分子改变”和“遗传改变”在本文中可互换使用。
如本文使用，术语“患者”是指哺乳动物，包括但不限于人类、狗或猫。在一些实施例中，患者是人类。在一些实施例中，患者是狗。在一些实施例中，患者是猫。
如本文使用，术语“PD0325901”是指具有以下化学结构的化合物，
PD0325901的替代名称包括PD 0325901、PD325901和N-[(2R)-2,3-二羟基丙氧基]-3,4-二氟-2-[(2-氟-4-碘苯基)氨基]苯甲酰胺。PD0325901与CAS登记号391210-10-9相关联。
如本文使用，术语“PD184352”是指具有以下化学结构的化合物，
PD184352的替代名称包括CI-1040和2-(2-氯-4-碘苯基氨基)-N-环丙基甲氧基-3,4-二氟苯甲酰胺。PD184352与CAS登记号212631-79-3相关联。
如本文使用，术语“匹马西布”是指具有以下化学结构的化合物，
匹马西布的替代名称包括AS-703026、AS 703026、AS703026、MSC1936369B、N-[(2S)-2,3-二羟基丙基]-3-(2-氟-4-碘苯胺基)吡啶-4-甲酰胺和N-(2,3-二羟基丙基)-1-((2-氟-4-碘苯基)氨基)异烟酰胺。匹马西布与CAS登记号1236699-92-5相关联。
如本文使用，术语“瑞美替尼”是指具有以下化学结构的化合物，
瑞美替尼的替代名称包括BAY-86-9766、RDEA119和N-[3,4-二氟-2-[(2-氟-4-碘苯基)氨基]-6-甲氧基苯基]-1-[(2S)-2,3-二羟基丙基]-环丙烷磺酰胺。瑞美替尼与CAS登记号923032-37-5相关联。
如本文使用，术语“RO4987655”是指具有以下化学结构的化合物，
RO4987655的替代名称包括RO 4987655、RO-4987655、RG 7167、CH-4987655、CH 4987655、CH4987655和3,4-二氟-2-(2-氟-4-碘苯胺基)-N-(2-羟基乙氧基)-5-[(3-氧代恶嗪烷-2-基)甲基]苯甲酰胺。RO4987655与CAS登记号874101-00-5相关联。
如本文使用，术语“RO5126766”是指具有以下化学结构的化合物，
RO5126766的替代名称包括RO-5126766和CH5126766。RO5126766与CAS登记号946128-88-7相关联。
如本文使用，术语“ROS1”是指具有UniProt名称ROS1_HUMAN并且由ROS1基因编码的ROS1受体酪氨酸-蛋白激酶。
如本文使用，术语“司美替尼”是指具有以下化学结构的化合物，
司美替尼的替代名称包括AZD6244、ARRY-142886和6-(4-溴-2-氯苯胺基)-7-氟-N-(2-羟基乙氧基)-3-甲基苯并咪唑-5-甲酰胺。司美替尼与CAS登记号606143-52-6相关联。
如本文使用，术语“固体载体”是指众所周知的固体材料，各种组分(例如，蛋白质和核酸)被物理连接到固体材料上，由此固定组分。如本文使用，术语“固体载体”是指非液体物质。固体载体可以是但不限于膜、片、凝胶、玻璃、塑料或金属。例如，固定的组分可以通过共价键和/或经由非共价吸引力(例如氢键相互作用、疏水吸引力和离子力)与固体载体结合。
如本文使用，术语“索拉非尼”是指具有以下化学结构的化合物，
索拉非尼的替代名称包括BAY 43-9006、和4-[4-[[4-氯-3-(三氟甲基)苯基]氨基甲酰基氨基]苯氧基]-N-甲基-吡啶-2-甲酰胺。索拉非尼与CAS登记号284461-73-0相关联。
如本文使用，术语“TAK-733”是指具有以下化学结构的化合物，
TAK-733的替代名称包括(R)-3-(2,3-二羟基丙基)-6-氟-5-(2-氟-4-碘苯基氨基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-4,7(3H,8H)-二酮。TAK-733与CAS登记号1035555-63-5相关联。
如本文使用，术语“治疗有效量”是指将在一定程度上缓解所治疗病症的一种或多种症状的所给予的化合物的量。关于癌症的治疗，治疗有效量是指具有以下效果的量：(1)减小癌症肿瘤的大小，(2)抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤转移，(3)在一定程度上抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤生长，和/或(4)在一定程度上减轻(或优选消除)与癌症相关的一种或多种症状。
如本文使用，术语“曲美替尼”是指具有以下化学结构的化合物，
曲美替尼的替代名称包括GSK1120212和曲美替尼与CAS登记号871700-17-3相关联。
如本文使用，术语“原肌球蛋白受体激酶”是指由神经营养因子家族的肽激素激活的原肌球蛋白受体激酶(Trk)家族，并且包括但不限于TrkA、TrkB和TrkC。如本文使用，术语“TrkA”是指具有UniProt标识符NTRK1_HUMAN并且由NTRK1基因编码的野生型原肌球蛋白受体激酶A。如本文使用，术语“TrkB”是指具有UniProt标识符NTRK2_HUMAN并且由NTRK2基因编码的野生型原肌球蛋白受体激酶B。如本文使用，术语“TrkC”是指具有UniProt标识符NTRK3_HUMAN并且由NTRK3基因编码的野生型原肌球蛋白受体激酶C。TrkA、TrkB和TrkC还分别被本领域普通技术人员称为Trk1、Trk2和Trk3。对TrkA的引用是对Trk1的引用。对TrkB的引用是对Trk2的引用。对TrkC的参考是对Trk3的参考。
如本文使用，术语“尤夏替尼”是指具有以下化学结构的化合物，
尤夏替尼的替代名称包括BVD-523、VRT752271和4-(5-氯-2-(异丙基氨基)吡啶-4-基)-N-((S)-1-(3-氯苯基)-2-羟基乙基)-1H-吡咯-2-甲酰胺。尤夏替尼与CAS登记号869886-67-9相关联。
一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合；并且第二药剂包含MEK抑制剂或ERK抑制剂。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合；并且第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ALK中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ROS1抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ROS1中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ROS1抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkA抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有NTRK1中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkA抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkB抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有NTRK2中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkB抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkC抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有NTRK3中的至少一处遗传改变。
另一方面，本文提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkC抑制剂；第二药剂是MEK抑制剂或ERK抑制剂；并且所述患者具有TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。
在一些实施例中，从基于抗体的测定获知至少一处遗传改变。基于抗体的测定通常可以是任何基于抗体的测定，并且可以是例如ELISA、免疫组织化学法、蛋白质印迹法、质谱法、流式细胞术、蛋白质微阵列、免疫荧光和多重检测测定。在一些实施例中，基于抗体的测定包括免疫组织化学分析。
在一些实施例中，标识ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC调节缺陷，诸如上调缺陷或下调缺陷，例如个体的癌症或癌前胰腺细胞中的诸如ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC缺失的无效突变或ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC嵌合基因座编码组成型活性ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC激酶，包括在来自胰脏癌或癌前细胞群的细胞提取物中测定ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性。在一些实施例中，标识ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC调节缺陷，诸如上调缺陷或下调缺陷，例如个体的癌症或癌前胰腺细胞中的诸如ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC缺失的无效突变或ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC嵌合基因座编码组成型活性ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC激酶，包括在来自胰脏癌或癌前细胞群的RNA群中测定ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC转录物累积。在一些实施例中，标识ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC调节缺陷，诸如上调缺陷或下调缺陷，例如个体的癌症或癌前胰腺细胞中的诸如ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC缺失的无效突变或ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC嵌合基因座编码组成型活性ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC激酶，包括在来自胰脏癌或癌前细胞群的细胞中或包含所述细胞的细胞群中确定核酸序列，例如基因组脱氧核糖核酸序列。
在一些实施例中，本公开的方法用于通过向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合治疗患者的病症，减少其症状，改善其症状，延缓其发作或以其他方式在药学上处治所述病症，所述病症选自非小细胞肺癌、甲状腺乳头状癌、神经母细胞瘤、胰脏癌和结肠直肠癌以及可能的其他适应症(其中，ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性或其组合的调节缺陷或其上调、调节不当或缺失可能起作用)，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，本公开的方法用于通过标识ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC下调缺陷(例如，患者的癌症或癌前细胞中的诸如ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC缺失的无效突变)并且向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合治疗患者的病症，减少其症状，改善其症状，延缓其发作或以其他方式在药学上处治所述病症，所述病症选自与ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC下调缺陷(例如，诸如ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC缺失的无效突变)相关联的非小细胞肺癌、甲状腺乳头状癌、神经母细胞瘤、胰脏癌和结肠直肠癌，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了用于治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(a)获知在来自患者的生物样本中存在至少一处遗传改变，其中所述至少一处遗传改变通过包含与ALK、ROS1、TrkA、TrkB和TrkC生物标志物中的一种或多种结合的一种或多种抗体的测定来检测；(b)并且向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了用于治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试来自患者的包含肿瘤的一种或多种细胞中ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC中的至少一种的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC中的至少一种测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了用于治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试来自患者的包含肿瘤组织的一种或多种细胞中ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC中的至少一种的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC中的至少一种测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了用于治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(a)获知癌症患者的至少一种靶基因中存在至少一处遗传改变，其中所述至少一种靶基因选自ALK1、BDNF、NGF、NGFR、NTF3、NTF4、ROS1、SORT1、NTRK1、NTRK2和NTRK3；并且(b)向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且基于所述组合可有效治疗具有所述至少一种靶基因中的所述至少一处遗传改变的癌症患者的认识，第二试剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了用于治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂，并且其中在给予所述组合之前，已知患者具有至少一种靶基因中的至少一处遗传改变，所述至少一种靶基因选自ALK1、BDNF、NGF、NGFR、NTF3、NTF4、ROS1、SORT1、NTRK1、NTRK2和NTRK3。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了用于治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的治疗有效量的组合，已知所述患者具有至少一种靶基因中的至少一处遗传改变，所述至少一种靶基因选自ALK1、BDNF、NGF、NGFR、NTF3、NTF4、ROS1、SORT1、NTRK1、NTRK2和NTRK3，其中第一药剂药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了治疗癌症患者的方法，所述方法包括向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的治疗有效量的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合；第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂；所述癌症患者具有至少一种靶基因中的至少一处遗传改变，所述靶基因选自ALK1、BDNF、NGF、NGFR、NTF3、NTF4、ROS1、SORT1、NTRK1、NTRK2和NTRK3。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了治疗癌症患者的方法，所述方法包括(a)获知患者的至少一种靶基因中存在至少一处遗传改变，其中所述至少一种靶基因选自ALK1、BDNF、NGF、NGFR、NTF3、NTF4、ROS1、SORT1、NTRK1、NTRK2和NTRK3；并且(b)向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的治疗有效量的组合，其中第一药剂是ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性的抑制剂或其组合，并且第二试剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，MEK抑制剂是MEK1抑制剂、MEK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，MEK抑制剂选自PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，ERK抑制剂是ERK1抑制剂、ERK2抑制剂或其组合。在一些实施例中，ERK抑制剂选自TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了方法，其中肿瘤是由患者中存在非小细胞肺癌、甲状腺乳头状癌、神经母细胞瘤、胰脏癌或结肠直肠癌引起的。在一些实施例中，提供了方法，其中患者中包含肿瘤的一种或多种细胞针对表达ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC激酶中的至少一种的基因的存在测试呈阳性，或患者中包含肿瘤的一种或多种细胞显示出ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC激酶活性中的至少一种。
在一些实施例中，提供了方法，其中患者中包含肿瘤的一种或多种细胞针对至少一种基因重排测试呈阳性，所述基因重排包含表达ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC中的至少一种的基因或其片段。在一些实施例中，提供了这样的方法，其中细胞针对ROS1、TrkA、TrkB或TrkC中的至少一种测试呈阳性。在一些实施例中，提供了方法，其中细胞针对ALK测试呈阳性。在一些实施例中，提供了方法，其中细胞针对ROS1测试呈阳性。在一些实施例中，提供了方法，其中细胞针对TrkA、TrkB和TrkC中的至少一种测试呈阳性。在一些实施例中，提供了方法，其中细胞针对TrkA测试呈阳性。在一些实施例中，提供了方法，其中细胞针对TrkB测试呈阳性。在一些实施例中，提供了这样的方法，其中细胞针对TrkC测试呈阳性。
在一些实施例中，提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试患者中包含肿瘤的一种或多种细胞中ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC中的至少一种的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对ALK、ROS1、TrkA、TrkB或TrkC活性中的至少一种测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK抑制剂、ROS1抑制剂、TrkA抑制剂、TrkB抑制剂或TrkC抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试患者中包含肿瘤的一种或多种细胞中ALK的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对ALK活性测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ALK抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试患者中包含肿瘤的一种或多种细胞中ROS1的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对ROS1活性测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是ROS1的抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试患者中包含肿瘤的一种或多种细胞中TrkA、TrkB或TrkC或其组合的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对TrkA、TrkB或TrkC活性或其组合测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkA、TrkB或TrkC的抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了治疗有需要的患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试患者中包含肿瘤的一种或多种细胞中TrkA的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对TrkA活性测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkA抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了治疗患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试患者中包含肿瘤的一种或多种细胞中TrkB的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对TrkB活性测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkB抑制剂，第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了治疗患者的癌症的方法，所述方法包括：(1)测试患者中包含肿瘤的一种或多种细胞中TrkC的存在；并且(2)如果所述一种或多种细胞针对TrkC活性测试呈阳性，则向患者给予包含治疗有效量的第一药剂和治疗有效量的第二药剂的组合，其中第一药剂是TrkC抑制剂，第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在本文提供的方法的一些实施例中，患者具有TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。例如，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变可以是SEQ ID NO:1的遗传改变。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:1所示的TrkA多肽的氨基酸残基G595或G667的位置。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:1所示的TrkA多肽的氨基酸残基G595的位置。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Arg取代(G595R)。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:1所示的TrkA多肽的氨基酸残基G667的位置。在一些实施例中，所述TrkA受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Cys取代(G667C)。
在本文提供的方法的一些实施例中，患者具有TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。例如，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变可以是SEQ ID NO:2的遗传改变。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:2所示的TrkB多肽的氨基酸残基G639或G709的位置。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:2所示的TrkB多肽的氨基酸残基G639的位置。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Arg取代(G639R)。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:2所示的TrkB多肽的氨基酸残基G709的位置。在一些实施例中，所述TrkB受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Cys取代(G709C)。
在本文提供的方法的一些实施例中，患者具有TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。例如，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变可以是SEQ ID NO:3的遗传改变。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:3所示的TrkC多肽的氨基酸残基G623或G696的位置。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:3所示的TrkC多肽的氨基酸残基G623的位置。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Arg取代(G623R)。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:3所示的TrkC多肽的氨基酸残基G696的位置。在一些实施例中，所述TrkC受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变是Glu至Cys取代(G696C)。
在本文提供的方法的一些实施例中，患者具有ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。例如，所述ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变可以是SEQ ID NO:4的遗传改变。在一些实施例中，所述ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:4所示的ALK多肽的氨基酸残基G1202或G1269的位置。在一些实施例中，所述ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:4所示的ALK多肽的氨基酸残基G1202的位置。在一些实施例中，所述ALK受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:4所示的ALK多肽的氨基酸残基G1269的位置。
在本文提供的方法的一些实施例中，患者具有ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变。例如，所述ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变可以是SEQ ID NO:5的遗传改变。在一些实施例中，所述ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:5所示的ROS1多肽的氨基酸残基G2032或G2101的位置。在一些实施例中，所述ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:5所示的ROS1多肽的氨基酸残基G2032的位置。在一些实施例中，所述ROS1受体酪氨酸激酶多肽中的至少一处突变位于对应于SEQ ID NO:5所示的ROS1多肽的氨基酸残基G2101的位置。
在一些实施例中，所述组合是药物组合物，其包含治疗有效量的第一药剂、治疗有效量的第二药剂和至少一种药学上可接受的载剂。
在一些实施例中，所述组合是同时给予包含治疗有效量的第一药剂的第一药物组合物和包含治疗有效量的第二药剂的第二药物组合物
在一些实施例中，所述组合是依序给予包含治疗有效量的第一药剂的第一药物组合物和包含治疗有效量的第二药剂的第二药物组合物。在一些实施例中，第一药物组合物在第二药物组合物之前给予。在一些实施例中，第一药物组合物在第二药物组合物之后给予。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有癌症，所述癌症选自非小细胞肺癌、甲状腺乳头状癌、神经母细胞瘤、黑素瘤，胰脏癌和结肠直肠癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有癌症，所述癌症选自非小细胞肺癌、神经母细胞瘤、黑素瘤、胰脏癌和结肠直肠癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有癌症，所述癌症选自非小细胞肺癌、神经母细胞瘤、黑素瘤和结肠直肠癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有癌症，所述癌症选自非小细胞肺癌、神经母细胞瘤和结肠直肠癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有非小细胞肺癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有甲状腺乳头状癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有神经母细胞瘤。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有黑素瘤。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有胰脏癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中患者患有结肠直肠癌。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中第二药剂包含一种或多种化疗剂或放射疗法，例如通常给予以治疗癌症、改善癌症症状、或预防癌症或延迟癌症发作的放射疗法。这样的药剂包括但不限于抗激素剂(例如抗雌激素、抗雄激素和芳香酶抑制剂)、拓扑异构酶I抑制剂、拓扑异构酶II抑制剂、靶向微管的药剂、铂基药剂、烷化剂、DNA损伤或嵌入剂、抗肿瘤抗代谢物剂、其他激酶抑制剂、其他抗血管生成剂、驱动蛋白抑制剂、治疗性单克隆抗体、mTOR抑制剂、组蛋白脱乙酰酶抑制剂、法尼基转移酶抑制剂和低氧反应抑制剂。
在一些实施例中，提供了一种包含第一药剂和第二药剂的组合的产品或试剂盒作为在抗癌疗法中同时、单独或依序使用的组合制剂。
在一些实施例中，提供了一种包含第一药剂和第二药剂的组合的产品或试剂盒作为在抗癌疗法中同时、单独或依序使用的组合制剂，其中第一药剂包含ALK抑制剂、ROS1抑制剂、TrkA抑制剂、TrkB抑制剂或TrkC抑制剂或其组合，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，提供了一种产品或试剂盒，其中第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了一种包含第一药剂和第二药剂的组合的产品或试剂盒作为在抗癌疗法中同时、单独或依序使用的组合制剂，其中第一药剂包含ALK抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，提供了一种产品或试剂盒，其中第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了一种包含第一药剂和第二药剂的组合的产品或试剂盒作为在抗癌疗法中同时、单独或依序使用的组合制剂，其中第一药剂包含ROS1抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，提供了一种产品或试剂盒，其中第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了一种包含第一药剂和第二药剂的组合的产品或试剂盒作为在抗癌疗法中同时、单独或依序使用的组合制剂，其中第一药剂包含TrkA抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，提供了一种产品或试剂盒，其中第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了一种包含第一药剂和第二药剂的组合的产品或试剂盒作为在抗癌疗法中同时、单独或依序使用的组合制剂，其中第一药剂包含TrkB抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，提供了一种产品或试剂盒，其中第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中，提供了一种包含第一药剂和第二药剂的组合的产品或试剂盒作为在抗癌疗法中同时、单独或依序使用的组合制剂，其中第一药剂包含TrkC抑制剂，并且第二药剂选自MEK抑制剂和ERK抑制剂。在一些实施例中，提供了一种产品或试剂盒，其中第一药剂是N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在本文提供的方法的一些实施例中，第一药剂包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐。
在本文提供的方法的一些实施例中，以约200mg/m2至约1600mg/m2，或约200mg/m2至约1200mg/m2，或约200mg/m2至约1000mg/m2，或约400mg/m2至约1200mg/m2，或约400mg/m2至约1000mg/m2，或约800mg/m2至约1000mg/m2，或约800mg/m2至约1200mg/m2，或约800mg/m2至约1200mg/m2，或约800mg/m2至约1600mg/m2的量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂。在一些实施例中，以约200mg/m2、约300mg/m2、约400mg/m2、约500mg/m2、约600mg/m2、约700mg/m2、约800mg/m2、约900mg/m2、约1000mg/m2、约1100mg/m2、约1200mg/m2、约1300mg/m2、约1400mg/m2、约1500mg/m2、约1600mg/m2、约1700mg/m2、约1800mg/m2、约1900mg/m2或约2000mg/m2的量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂。在一些实施例中，第一药剂的量和第二药剂的量在上面列出的相同范围内。在一些实施例中，第一药剂的量和第二药剂的量在上面列出的不同范围内。
在本文提供的方法的一些实施例中，第一药剂包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐，并以一定量将其给予具有或患有癌症的患者或个体，使得患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量范围为约200mg/m2至约1600mg/m2，或约200mg/m2至约1200mg/m2，或约200mg/m2至约1000mg/m2，或约400mg/m2至约1200mg/m2，或约400mg/m2至约1000mg/m2，或约800mg/m2至约1000mg/m2，或约800mg/m2至约1200mg/m2或来自约800mg/m2至约1200mg/m2，或约800mg/m2至约1600mg/m2。
在本文提供的方法的一些实施例中，第一药剂包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐，并以一定量将其给予具有或患有癌症的患者或个体，使得患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约200mg/m2、约300mg/m2、约400mg/m2、约500mg/m2、约600mg/m2、约700mg/m2、约800mg/m2、约900mg/m2、约1000mg/m2、约1100mg/m2、约1200mg/m2、约1300mg/m2、约1400mg/m2、约1500mg/m2、约1600mg/m2、约1700mg/m2、约1800mg/m2、约1900mg/m2或约2000mg/m2，包括其中的增量。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约200mg/m2、约300mg/m2、约400mg/m2、约500mg/m2或约600mg/m2。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约200mg/m2。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约300mg/m2。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约400mg/m2。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约500mg/m2。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约600mg/m2。
在本文提供的方法的一些实施例中，以一定量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂，使得患者所接收的量为约0.5mg、约1mg、约10mg、约50mg、约100mg、约200mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg、约700mg、约800mg、约900mg、约1000mg、约1100mg、约1200mg、约1300mg、约1400mg、约1500mg、约1600mg、约1700mg、约1800mg、约1900mg或约2000mg，包括其中的增量。
在一些实施例中，第一药剂包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐，并且患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约200mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg、约700mg、约800mg、约900mg或约1000mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约200mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约300mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约400mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约500mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约600mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约700mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约800mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约900mg。在一些实施例中，患者所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约1000mg。
在本文提供的方法的一些实施例中，以一定量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂，使得患者每天所接收的第一药剂和/或第二药剂的量为约0.5mg、约1mg、约10mg、约50mg、约100mg、约200mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg、约700mg、约800mg、约900mg、约1000mg、约1100mg、约1200mg、约1300mg、约1400mg、约1500mg、约1600mg、约1700mg、约1800mg、约1900mg或约2000mg，包括其中的增量。
在本文提供的方法的一些实施例中，第一药剂包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺或其药学上可接受的盐，并以一定量将其给予具有或患有癌症的患者或个体，使得患者每天所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约0.5mg、约1mg、约10mg、约50mg、约100mg、约200mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg、约700mg、约800mg、约900mg、约1000mg、约1100mg、约1200mg、约1300mg、约1400mg、约1500mg、约1600mg、约1700mg、约1800mg、约1900mg或约2000mg，包括其中的增量。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约200mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约300mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约400mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约500mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约600mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约700mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约800mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约900mg。在一些实施例中，患者每天一次所接收的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的量为约1000mg。
在一些实施例中，在2至50天的治疗期内以多剂量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂。在一些实施例中，在5至42天的治疗期内以每剂量约50至约200mg/kg的多剂量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂。在一些实施例中，以约60mg/kg的口服剂量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂，每天两次(BID)，每周七次。在一些实施例中，以约60mg/kg的口服剂量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂，每天两次(BID)，每周七次，持续六周，以隔周形式(即，一周给药，一周不给药)。
一些实施例包括本文所述的任何方法，其中以约0.01mg/kg至约100mg/kg，或约0.02mg/kg至约50mg/kg，或约0.05mg/kg至约25mg/kg，或约0.1mg/kg至约20mg/kg，或约0.2mg/kg至约10mg/kg，或约0.5mg/kg至约5mg/kg，或约1mg/kg至约2mg/kg的量向具有或患有癌症的患者或个体给予第一药剂和/或第二药剂。在一些实施例中，第一药剂的量和第二药剂的量在上面列出的相同范围内。在一些实施例中，第一药剂的量和第二药剂的量在上面列出的不同范围内。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物进一步包含弱碱性有机化合物和至少一种酸化剂。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是有机酸化剂。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂选自酒石酸、马来酸、富马酸、柠檬酸和甜菜碱盐酸盐。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是富马酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是酒石酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是马来酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是柠檬酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是甜菜碱盐酸盐。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物进一步包含至少一种酸化剂。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是有机酸化剂。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂选自酒石酸、马来酸、富马酸、柠檬酸和甜菜碱盐酸盐。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是富马酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是酒石酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是马来酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是柠檬酸。在一些实施例中，所述至少一种酸化剂是甜菜碱盐酸盐。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和至少一种酸化剂的药物组合物呈片剂或胶囊形式。在一些实施例中，提供了片剂形式的药物组合物。在一些实施例中，提供了胶囊形式的药物组合物。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和至少一种酸化剂的药物组合物包含约10mg至约1000mg的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和至少一种酸化剂。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物在被给予禁食状态的患者时提供了患者的药代动力学特征，其中在向患者给予药物组合物之后，N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺在患者血浆中的Tmax介于约2小时和6小时之间。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物在以约800mg N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的总剂量被给予禁食状态的患者时提供了患者的药代动力学特征，其中在向患者给予药物组合物之后，N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺在患者血浆中的Cmax介于约2080nM和约2110nM之间。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物在以约800mg N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的总剂量被给予进食状态的患者时提供了患者的药代动力学特征，其中在向患者给予药物组合物之后，基于90％置信区间，N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺在患者血浆中的Cmax介于2560nM的80％至125％之间。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物在以约800mg N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的总剂量被给予禁食状态的患者时提供了患者的药代动力学特征，其中在向患者给予药物组合物之后，N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺在患者血浆中的AUC(0至24)介于约28,900nM*hr和约30,800nM*hr之间。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物提供了在向禁食状态的患者给予药物组合物之后，N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺在患者血浆中的AUC(0至24)介于约28,900nM*hr和约30,800nM*hr之间，并且其中组合物包含约800mg N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的总剂量。
在一些实施例中，提供了本文所述的任何方法，其中包含N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物提供了在向禁食状态的患者给予药物组合物之后，N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺在患者血浆中的Tmax介于约2小时和约6小时之间。
该量取决于各种因素而变化，包括但不限于本文提供的生物活性组合物和制剂的特性(包括其活性、药代动力学、药效动力学和生物利用度)、所治疗的患者或细胞的生理状况(包括年龄、性别、疾病类型和阶段、一般身体状况、对给定剂量的响应性和药物类型)、制剂中的药学上可接受的载剂的性质以及给药途径。此外，有效量或治疗有效量可以取决于本文提供的一种或多种生物活性组合物和制剂是单独给予还是与其他药物、其他疗法或其他治疗方法或形式组合给予而变化。临床和药理学领域的技术人员将能够通过常规实验确定有效量或治疗有效量，即通过监测细胞或患者对给予本文提供的一种或多种生物活性组合物和制剂的反应并相应地调整剂量。取决于上述因素，典型剂量可以在约0.1mg/kg至约100mg/kg或更多的范围内。在其他替代方案中，剂量可以在约0.1mg/kg至约100mg/kg；或约1mg/kg至约100mg/kg；或约5mg/kg直至约100mg/kg的范围内。对于局部应用，例如各种毛发症状的治疗，根据本文提供的一些替代方案，合适的剂量可以在约1mg/kg至约10g/kg；或约10mg/kg至约1g/kg；或约50mg/kg直至约10g/kg的范围内。关于这方面的额外指导，可以在例如《雷明顿：药学技术与实践(Remington:The Science and Practice of Pharmacy)》，第21版，Univ.of Sciences in Philadelphia(USIP),Lippincott Williams&Wilkins,Philadelphia,PA,2005，其全部内容通过引用并入本文。
在一些实施例中，根据本公开的这个和其他方面的方法的实施方式进一步包括在给予步骤之前从第二分析测定获知患者癌症中的遗传改变。第二分析测定通常可以是本领域普通技术人员已知的任何分析测定，并且可以是例如基于抗体的测定、基于核苷酸的测定或酶活性测定。合适的第二分析测定的非限制性实例包括毛细管电泳、核酸测序、多肽测序、限制性消化、基于核酸扩增的测定、核酸杂交测定、比较基因组杂交、实时PCR、定量逆转录PCR(qRT-PCR)、PCR-RFLP测定、HPLC、质谱基因分型、荧光原位杂交(FISH)、下一代测序(NGS)和激酶活性测定。合适的第二分析测定的其他实例包括ELISA、免疫组织化学法、蛋白质印迹法、质谱法、流式细胞术、蛋白质-微阵列、免疫荧光和多重检测测定。
在一些实施例中，使用FISH分析来标识导致一处或多处分子改变的染色体重排，例如本文所述的融合基因或基因产物。例如，为了进行FISH，可以设计用第一可检测标记标记的至少第一探针以靶向融合基因的第一基因，例如在基因的一个或多个外显子中，并且可以设计用第二可检测标记标记的至少第二探针以靶向融合基因的第二基因，例如在基因的一个或多个外显子(例如，含有包含酪氨酸激酶结构域的蛋白质部分的外显子)中。与没有携带所述融合基因或基因产物的患者相比，携带融合的患者中的至少一个第一探针和至少一个第二探针将更靠近在一起。在一些实施例中，使用FISH测定的变体，例如“分裂FISH”，来评估通过本文提供的方法选择的患者。通过该方法，例如在基因的一个或多个外显子和/或内含子处，应用了靶向融合连接的至少一个探针和靶向融合的单个基因的至少一个探针。在正常细胞中，将观察到两种探针(或因为基因融合的两个基因的紧密接近，将观察到二次色)，并且当易位发生时将仅观察到单个基因探针，或者具有不同颜色的探针将分离，使得观察到探针的本领域普通技术人员可以确定在样本中存在相关的基因融合或缺失。一般来说，使用放置在载玻片上的福尔马林固定石蜡包埋组织切片进行FISH测定。将来自组织样本切片的DNA变性为单链形式，随后使其与可以使用本领域普通技术人员已知的方法和技术设计和制备的合适的DNA探针杂交。杂交后，可通过一系列洗涤除去任何未结合的探针，并用DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚)(一种荧光蓝色的DNA特异性染料)对细胞核进行反染色。使用配备有合适的激发和发射滤光片的荧光显微镜观察探针的杂交，从而使荧光信号可视化。
例如，可以使用分裂FISH测定来检测涉及ALK基因座的多种类型的重排。在所述方法中，来自一些具有非小细胞肺癌(NSCLC)的患者的肿瘤细胞显示出使用包含绿色(FITC)、红色(德克萨斯红)和蓝色(4',6-二脒基-2-苯基吲哚)的单一干涉滤光片组以及双(红色/绿色)和三(蓝色、红色、绿色)带通滤光片检测到的ALK阳性FISH图案。将ALK基因的融合可视化为分离橙色和绿色信号、单橙色信号或单橙色和单绿色信号。
可以使用与上述相同的方法检查和评估源自癌症患者的生物样本中关于ALK、ROS1、TrkA、TrkB和TrkC的相关分子改变，但需通过以适合于目标分子改变并且可以由本领域普通技术人员容易地确定的方式对测定中使用的试剂、探针和其他材料进行修饰。
本领域已知的FISH方法的其他变化适合于评估根据本文提供的方法选择的患者。
在本文提供的方法的一些实施例中，癌症选自由以下组成的群组：间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)、结肠直肠癌(CRC)、胆管癌、胃癌、胶质母细胞瘤(GBM)、平滑肌肉瘤、黑素瘤、非小细胞肺癌(NSCLC)、鳞状细胞肺癌、神经母细胞瘤(NB)、卵巢癌、胰脏癌、前列腺癌、甲状腺髓样癌、乳腺癌和甲状腺乳头状癌。
在一些实施例中，提供了这样的方法，从对多种生物样本同时进行的测定获知一处或多处分子改变的存在。在一些实施例中，可以在多测试平台中测定多个生物样本。
如本文使用，术语“多平台”旨在涵盖用于容纳一种或多种反应混合物、混悬液或检测反应产物的任何合适手段。因此，许多筛选事件的结果可以组合到一个表面上，从而产生具有多个元素或部分或由其组成的“多平台”，以同时进行多于一个实验。术语“多平台”旨在涵盖蛋白质芯片、微量滴定板、多孔板、微卡、试管、陪替氏平板、托盘、载玻片等。在一些实施例中，多路复用可以进一步包括在多个分开的生物样本中的每一个中同时进行多个筛选事件。例如，分析的生物样本的数量可以基于载玻片上的斑点数量和每个斑点进行的测试次数。在另一个实例中，分析的生物样本的数量可以基于多孔板中的孔的数量和每个孔中进行的测试次数。例如，在目前公开的方法中，可以使用6孔、12孔、24孔、48孔、96孔、384孔、1536孔或3456孔微量滴定板，尽管本领域技术人员可以理解，但不是每个微量滴定孔都需要包含单独的生物样本。根据微量滴定板的大小和每个孔中单独的生物样本的数量，可以同时进行非常多的测试。
在一些实施例中，提供了这样的方法，其中多个生物样本包括至少6个、12个、24个、48个、96个、200个、384个、400个、500个、1000个、1250个、1500个或3000个样本，包括其中的增量。
在一些实施例中，提供了这样的方法，其中所述一处或多处分子改变选自基因突变、基因扩增、基因重排、单核苷酸变异(SNV)、缺失、插入、InDel突变、一处或多处单核苷酸点突变(SNP)、表观遗传改变、剪接变体、RNA/蛋白质过表达和异常RNA/蛋白质表达。在一些实施例中，提供了这样的方法，其中遗传改变包括异源核酸序列插入在生物标志物基因的编码序列内。在一些实施例中，提供了这样的方法，其中所述插入形成了编码融合肽的嵌合核酸序列。
在一些实施例中，提供了这样的方法，其中获知获一处或多处分子改变进一步包括确定包含所述一处或多处分子改变的核酸序列和/或氨基酸序列。在一些实施例中，对包含来自选择的癌症患者肿瘤的一处或多处分子改变的核酸序列进行测序。在一些实施例中，通过下一代测序方法确定序列。
根据本公开的这个和其他方面的方法的实施方式可以包括一个或多个以下特征。在一些实施例中，所述测定包括一种或多种结合至ALK、ROS1、TrkA、TrkB和TrkC生物标志物中的至少两种、三种、四种或全部的抗体。在一些实施例中，生物样本中检测到的一处或多处分子改变涉及生物标志物中的至少两种、至少三种或至少四种。在一些实施例中，从测定获知生物样本中的一处或多处分子改变的存在，所述测定包括使生物样本与对生物标志物具有特异性的一种或多种抗体或其片段相接触。在一些实施例中，特异性抗体是单克隆抗体。在一些实施例中，特异性抗体包括及其组合中的至少一种。在一些实施例中，生物样本同时与特异性抗体中的一种或多种相接触。在一些实施例中，生物样本依次与特异性抗体相接触。在一些实施例中，所述一处或多处分子改变导致ALK、ROS1、TrkA、TrkB和TrkC生物标志物中的一种或多种的表达升高。在一些实施例中，从测定获知一处或多处分子改变，其中确定一种或多种生物标志物的表达是否升高包括：(a)确定生物样本中一种或多种生物标志物的表达水平；和(b)将确定的表达水平与参考表达水平进行比较。
在一些实施例中，药物组合物包含固体、液体或胶囊形式的各种成分的物理混合物。其他实施例包含至少两种单独剂量单位或剂型的分离成分，诸如例如两层或三层片剂，其中至少两种活性成分位于片剂的单独层或区域中，任选地用第三材料隔开，诸如例如糖层或其他惰性阻隔层，以防止前两种成分之间的接触。在其他实施例中，将两种或更多种活性成分分别配制成单独的剂量单位，然后将其包装在一起以便于给药。一个实施例包含含有多个单独剂量单位的包装。例如，该实施例可以包括泡罩包装。在泡罩包装的一个实施例中，多个泡罩包装剂量单位存在于单个片上，并且将要一起给予的那些单位包装在泡罩包装的相同或相邻泡罩中。或者，可以使用任何其他包装，其中两种活性成分被包装在一起用于同时或依序使用。
在一些实施例中，所述方法涉及本文所述的任何化合物或其药学上可接受的盐在制备用于治疗哺乳动物异常细胞生长的药物中的用途。本公开进一步涉及如本文所述的任何化合物或其药学上可接受的盐在制备用于治疗哺乳动物异常细胞生长的药物中的用途，其中所述异常细胞生长是癌性或非癌性的。在一些实施例中，异常细胞生长是癌性的。在另一个实施例中，异常细胞生长是非癌性的。
在一些实施例中，包含第一药剂和/或第二药剂的药物组合物进一步包含至少一种药学上可接受的载剂。药学上可接受的载剂可以包含常规的药物载剂或赋形剂。合适的药物载剂包括惰性稀释剂或填充剂、水和各种有机溶剂(如水合物和溶剂合物)。如果需要，药物组合物可以含有其他成分，如调味剂、粘合剂、赋形剂等。因此，对于口服给药，含有各种赋形剂(如柠檬酸)的片剂可与各种崩解剂(如淀粉、海藻酸和某些复合硅酸盐)以及与粘合剂(如蔗糖、明胶和阿拉伯胶)一起使用。此外，润滑剂，如硬脂酸镁、月桂基硫酸钠和滑石粉，常常用于制片目的。类似类型的固体组合物也可以用于软和硬填充明胶胶囊中。因此，材料的非限制性实例包括乳糖或奶糖和高分子量聚乙二醇。当需要水性混悬液或酏剂用于口服给药时，其中的活性化合物可以与各种甜味剂或调味剂、着色剂或染料以及乳化剂或混悬剂(如果需要)连同稀释剂(如水、乙醇、丙二醇、甘油或其组合)相组合。
例如，所述药物组合物可以为适合口服给药的形式，如片剂、胶囊、丸剂、粉剂、缓释制剂、溶液混悬液，适合肠胃外注射的形式，如无菌溶液、混悬液或乳液，适合局部给药的形式，如软膏或乳膏，或适合直肠给药的形式，如栓剂。
示例性肠胃外给药形式包括活性化合物在无菌水溶液中的溶液或混悬液，例如丙二醇水溶液或葡萄糖水溶液。如果需要，这种剂型可以适当缓冲。
药物组合物可以是适合精确剂量单次给药的单位剂型。
本公开的药剂可以如下所述以本领域技术人员认为合适的任何药物形式配制成药物组合物。本公开的药物组合物包含治疗有效量的至少一种本文提供的化合物和惰性的药学上可接受的载剂或稀释剂。
所使用的药物载剂可以是固体或液体。示例性固体载剂是乳糖、蔗糖、滑石粉、明胶、琼脂、果胶、阿拉伯胶、硬脂酸镁、硬脂酸等。示例性液体载剂是糖浆、花生油、橄榄油、水等。类似地，本发明组合物可以包括本领域已知的延时或定时释放材料，例如单独的甘油单硬脂酸酯或甘油二硬脂酸酯，或具有蜡、乙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、甲基丙烯酸甲酯等的甘油单硬脂酸酯或甘油二硬脂酸酯。可以加入其他添加剂或赋形剂以实现所需的制剂性质。例如，可以加入生物可用性增强剂，如Labrasol、Gelucire等，或配制剂，如CMC(羧甲基纤维素)、PG(丙二醇)或PEG(聚乙二醇)。例如当制备胶囊制剂时，可以加入一种保护活性成分免受光、潮湿和氧化的影响的半固体载剂。
如果使用固体载剂，则制剂可以制成片剂，以粉末或小丸形式置于硬明胶胶囊中，或者形成锭剂或含片剂。固体载剂的量可以变化，但通常为约25mg至约1g。如果使用液体载剂，制剂可以是糖浆、乳剂、软明胶胶囊、安瓿瓶或小玻璃瓶中的无菌注射溶液或混悬液或非水液体混悬液。如果使用半固体载剂，则制剂可以是硬和软明胶胶囊制剂的形式。本发明组合物以适合于给药方式(例如，肠胃外给药或口服给药)的单位剂量形式制备。
为了获得稳定的水溶性剂型，可以将本公开的化合物的盐溶解在有机或无机酸的水溶液中，例如0.3M的琥珀酸或柠檬酸溶液。如果不存在可溶性盐形式，则可将药剂溶解在合适的共溶剂或共溶剂的组合中。合适的共溶剂的实例包括浓度范围为总体积的0至60％的醇、丙二醇、聚乙二醇300、聚山梨醇酯80、甘油等。在一个示例性实施例中，将本公开的化合物溶于DMSO中并用水稀释。组合物也可以是活性成分的盐形式的溶液形式，其在合适的水性载剂(例如，水或等渗盐水或葡萄糖溶液)中。
合适的制剂取决于所选的给药途径。对于注射，可将本公开化合物的药剂配制成水溶液，优选在生理学相容的缓冲液(如Hanks液、林格氏液或生理盐水缓冲液)中。对于经粘膜给药，在制剂中使用适合渗透阻隔层的渗透剂。这种渗透剂在本领域中通常是已知的。
对于口服给药，可以通过将活性化合物与本领域已知的药学上可接受的载剂组合来配制化合物。这样的载剂能够将本公开的化合物配制成由待治疗患者口服摄入的片剂、丸剂、糖衣丸、胶囊、液体剂、凝胶、糖浆、浆剂，混悬液等。口服使用的药物制剂可以使用固体赋形剂与活性成分(药剂)混合，任选地研磨所得混合物，并且如果需要，在加入合适的助剂后加工颗粒混合物以获得片剂或糖衣丸芯来获得。合适的赋形剂包括：填充剂，如糖，包括乳糖、蔗糖、甘露糖醇或山梨糖醇；和纤维素制剂，例如玉米淀粉、小麦淀粉、大米淀粉、马铃薯淀粉、明胶、树胶、甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素、羧甲基纤维素钠或聚乙烯吡咯烷酮(PVP)等。如果需要，可以加入崩解剂，如交联聚乙烯吡咯烷酮、琼脂或海藻酸或其盐(如海藻酸钠)。
糖衣丸芯具有合适的包衣。为此目的，可以使用浓糖溶液，其可以任选地包含阿拉伯胶、聚乙烯吡咯烷酮、卡波普凝胶、聚乙二醇和/或二氧化钛、漆溶液以及合适的有机溶剂或溶剂混合物。可以将染料或颜料加入片剂或糖衣丸包衣中以用于标识或以表征活性剂的不同组合。
可以口服使用的药物制剂包括由明胶制成的推入配合胶囊，以及由明胶和增塑剂(如甘油或山梨糖醇)制成的软密封胶囊。推入配合胶囊可含有活性成分，其混合有填充剂(如乳糖)、粘合剂(如淀粉)和/或润滑剂(如滑石粉或硬脂酸镁)以及任选的稳定剂。在软胶囊中，可将活性剂溶解或混悬于合适的液体中，如脂肪油、液体石蜡或液体聚乙二醇。另外，可以加入稳定剂。所有用于口服给药的制剂应该是适合于这种给药的剂量。对于口腔给药，组合物可以采取以常规方式配制的片剂或含片剂的形式。
对于鼻内或通过吸入给药，根据本公开使用的化合物可以以来自加压包装或喷雾器的气溶胶喷雾呈现形式方便地递送，其中使用了合适的推进剂，例如二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷、二氯四氟乙烷、二氧化碳或其他合适的气体。在加压气雾剂的情况下，剂量单位可以通过提供阀来递送计量量而确定。用于吸入器或吹入器等的明胶胶囊和药筒可以配制成含有化合物和合适的粉末基质(如乳糖或淀粉)的粉末混合物。
可以将化合物配制成用于通过注射(例如，通过快速浓注或连续输注)进行肠胃外给药。用于注射的制剂可以以单位剂量形式呈现，例如在安瓿瓶中或在多剂量容器中，其中加入防腐剂。组合物可以采取在油性或水性载剂中的混悬液、溶液或乳液的形式，并且可以含有配制剂，如混悬剂、稳定剂和/或分散剂。
用于肠胃外给药的药物制剂包括水溶性形式的活性化合物的水溶液。此外，活性剂的混悬液可以制备成适当的油性注射混悬液。合适的亲脂性溶剂或载剂包括脂肪油，如芝麻油，或合成脂肪酸酯，如油酸乙酯或甘油三酯，或脂质体。含水注射混悬液可以含有增加混悬液粘度的物质，例如羧甲基纤维素钠、山梨糖醇或葡聚糖。任选地，混悬液还可以含有合适的稳定剂或增加化合物溶解度以允许制备高浓度溶液的试剂。
或者，活性成分可以是粉末形式，用于在使用前用合适的载剂(如无菌无热原水)配制。
除了上述制剂之外，本公开的化合物还可以配制成长效制剂。这种长效制剂可以通过植入(例如皮下或肌肉内)或通过肌肉注射给予。因此，例如，化合物可以用合适的聚合或疏水材料(例如，作为在可接受的油中的乳液)或离子交换树脂配制，或配制成微溶衍生物(例如，例如配制成微溶盐)。用于疏水化合物的药物载剂是包含苯甲醇、非极性表面活性剂、水混溶性有机聚合物和水相的共溶剂体系。共溶剂体系可以是VPD共溶剂体系。VPD是3％w/v苯甲醇、8％w/v非极性表面活性剂聚山梨醇酯80和65％w/v聚乙二醇300的溶液，用无水乙醇定容。VPD共溶剂体系(VPD:5W)含有用5％葡萄糖水溶液以1:1稀释的VPD。该共溶剂体系很好地溶解了疏水性化合物，并且其本身在全身给药时产生低毒性。共溶剂体系的比例可以适当改变而不破坏其溶解度和毒性特性。此外，共溶剂组分的同一性可以不同：例如，可以使用其他低毒性非极性表面活性剂代替聚山梨醇酯80；聚乙二醇的分数大小可以变化；其他生物相容性聚合物可以代替聚乙二醇，例如聚乙烯吡咯烷酮；并且可以用其他糖或多糖代替葡萄糖。
或者，可以使用疏水性药物化合物的其他递送系统。脂质体和乳剂是疏水性药物的递送载剂或载剂的已知实例。某些有机溶剂，如二甲基亚砜，也可以使用，但是由于DMSO的毒性，通常以更高的毒性为代价。另外，可以使用缓释体系递送化合物，例如含有治疗剂的固体疏水聚合物的半透性基质。各种缓释材料已经建立并且是本领域技术人员已知的。取决于它们的化学性质，缓释胶囊可以在几周直至超过100天内释放化合物。取决于治疗剂的化学性质和生物学稳定性，可以使用用于蛋白质稳定化的其他策略。
药物组合物还可以包含合适的固相或凝胶相载剂或赋形剂。这些载剂和赋形剂可以显著改善难溶药物的生物利用度。这种载剂或赋形剂的实例包括碳酸钙、磷酸钙、糖、淀粉、纤维素衍生物、明胶和聚合物(如聚乙二醇)。此外，可以使用添加剂或赋形剂，例如等。
此外，可将药物组合物掺入皮肤贴片中以将药物直接递送到皮肤上。
可以理解的是，本公开的药剂的实际剂量将根据所使用的特定药剂，所配制的特定组合物，给药方式以及所治疗的特定部位、宿主和疾病而变化。鉴于给定化合物的实验数据，使用常规剂量确定测试的本领域技术人员可确定给定条件组下的最佳剂量。对于口服给药，通常采用的示例性日剂量将为约0.001至约1000mg/kg体重，治疗过程任选地以适当间隔重复。
另外，本公开的药学上可接受的制剂可以含有约0.5w/w％至约95w/w％，或约1w/w％至约95w/w％，或约1w/w％至约75w/w％，或约5w/w％至约75w/w％，或约10w/w％至约75w/w％，或约10w/w％至约50w/w％的量的本公开的化合物或其盐或溶剂化物。
本文提供的化合物或其盐或溶剂化物可以单独或作为药学上可接受的制剂的一部分给予患有异常细胞生长的哺乳动物(诸如人)，每周一次，每天一次，一天两次，一天三次，或一天四次，甚至更频繁。
本领域普通技术人员将理解，对于本公开的化合物，每天给予需要这种治疗的哺乳动物的特定药物制剂、剂量和剂量数都是本领域普通技术人员的知识内的选择并且可以在没有过度实验的情况下确定。
本文提供的化合物的给予可以通过任何能够将化合物递送到作用部位的方法来实现。这些方法包括口服途径、十二指肠内途径、肠胃外注射(包括静脉内、皮下、肌肉内、血管内或输注)、局部给药和直肠给药。可以使用单次剂量，或者也可以使用1分钟、2分钟、3分钟、4分钟、5分钟、10分钟、15分钟、20分钟、30分钟、60分钟、90分钟、120分钟或更长时间周期或者任何中间时间周期内的输注，例如输注可持续3小时、4小时、5小时、6小时、7小时、8小时、9小时、10小时、12小时、14小时、16小时、20小时、24小时或更多小时或持续1-7天或更多天。输注可以通过滴注、连续输注、输液泵、计量泵、长效制剂或任何其他合适的手段给予。
可以调整剂量方案以提供最佳的期望响应。例如，可以给予单次剂量，可以随时间给予多个分次剂量，或者可以根据治疗情况的紧急程度指示按比例减少或增加剂量。特别有利的的是，以剂量单位形式配制肠胃外组合物以便于给药和剂量均匀性。如本文使用，剂量单位形式是指适合作为待治疗的哺乳动物患者的单位剂量的物理分离单位；每个单位含有经计算可产生所需治疗效果的预定量的活性化合物以及所需的药物载剂。本公开的剂量单位形式的规格取决于并且直接取决于(a)活性剂的独特特性和待实现的特定治疗或预防效果，以及(b)在配制此类用于治疗个体敏感性的活性化合物的领域内的固有限制。
因此，本领域技术人员将基于本文提供的公开内容意识到，剂量和给药方案根据治疗领域中公知的方法进行调整。也就是说，可以容易地建立最大可耐受剂量，并且还可以确定向患者提供可检测治疗益处的有效量，如给予每种药剂以向患者提供可检测治疗益处的时间要求。因此，尽管在本文中举例说明了某些剂量和给药方案，但这些实例决不限制在实施本公开时可提供给患者的剂量和给药方案。
要注意的是，剂量值可以随待缓解的病症的类型和严重程度而变化，并且可以包括单次或多次剂量。应当进一步理解，对于任何特定的患者，应根据个体需要和给予组合物或监督组合物给予的人员的专业判断随时间调整具体的剂量方案，并且本文所述的剂量范围仅仅是示例性的且并不旨在限制所要求保护的组合物的范围或实践。例如，可以基于药代动力学或药效动力学参数来调整剂量，其可以包括临床效果，如毒性效应和/或实验室值。因此，本公开涵盖由技术人员确定的患者内剂量递增。确定合适剂量和给予化学治疗剂的方案在相关领域中是公知的，并且一旦提供了本文提供的教导，其将被理解为可由本领域技术人员实现。
在一些实施例中，本文公开的方法可用于治疗癌症，所述癌症包括但不限于以下的癌症：循环系统，例如心脏(肉瘤【血管肉瘤、纤维肉瘤、横纹肌肉瘤、脂肪肉瘤】，粘液瘤、横纹肌瘤、纤维瘤、脂肪瘤和畸胎瘤)，纵隔和胸膜以及其他胸内器官，血管瘤和肿瘤相关血管组织；呼吸道，例如鼻腔和中耳，副鼻窦，喉，气管，支气管和肺(如小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞肺癌(NSCLC))，支气管癌(鳞状细胞、未分化小细胞、未分化的大细胞、腺癌)，肺泡(细支气管)癌，支气管腺瘤，肉瘤，淋巴瘤，软骨瘤性错构瘤，间皮瘤；肠胃系统，例如食道(鳞状细胞癌、腺癌、平滑肌肉瘤、淋巴瘤)，胃(癌、淋巴瘤、平滑肌肉瘤)，胃部，胰腺(导管腺癌、胰岛瘤、胰高血糖素瘤、胃泌素瘤、类癌瘤、舒血管肠肽瘤)，小肠(腺癌、淋巴瘤、类癌瘤、卡波西肉瘤、平滑肌瘤、血管瘤、脂肪瘤、神经纤维瘤、纤维瘤)，大肠(腺癌、管状腺瘤、绒毛状腺瘤、错构瘤、平滑肌瘤)。泌尿生殖道，例如肾(腺癌、肾胚胎瘤【肾母细胞瘤】、淋巴瘤、白血病)，膀胱和/或尿道(鳞状细胞癌、移行细胞癌、腺癌)，前列腺(腺癌、肉瘤)，睾丸(精原细胞瘤、畸胎瘤、胚胎癌、畸胎癌、绒毛膜癌、肉瘤、间质细胞癌、纤维瘤、纤维腺瘤、腺瘤样瘤、脂肪瘤)；肝，例如肝细胞瘤(肝细胞癌)，胆管癌，肝母细胞瘤，血管肉瘤，肝细胞腺瘤，血管瘤，胰腺内分泌肿瘤(如嗜铬细胞瘤、胰岛瘤、舒血管肠肽瘤、胰岛细胞瘤和胰高血糖素瘤)；骨，例如骨原性肉瘤(骨肉瘤)，纤维肉瘤，恶性纤维组织细胞瘤，软骨肉瘤，尤因氏肉瘤，恶性淋巴瘤(网状细胞肉瘤)，多发性骨髓瘤，恶性巨细胞瘤脊索瘤，骨软骨瘤(骨软骨性外生骨疣)，良性软骨瘤，软骨母细胞瘤，软骨黏液样纤维瘤，骨样骨瘤和巨细胞瘤；神经系统，例如中枢神经系统(CNS)肿瘤，原发性CNS淋巴瘤，颅骨癌(骨瘤、血管瘤、肉芽瘤、黄瘤、畸形性骨炎)，脑膜(脑膜瘤、脑膜肉瘤、脑胶质瘤)，脑癌(星形细胞瘤、髓母细胞瘤、神经胶质瘤、室管膜瘤、生殖细胞瘤【松果体瘤】、多形性胶质母细胞瘤、少突神经胶质瘤、神经鞘瘤、视网膜母细胞瘤、先天性肿瘤)，脊髓神经纤维瘤，脑膜瘤，神经胶质瘤，肉瘤)。生殖系统，例如妇科，子宫(子宫内膜癌)，宫颈(宫颈癌、宫颈癌前病变)，卵巢(卵巢癌【浆液性囊腺癌、粘液性囊腺癌、未分类癌】、粒层-卵泡膜细胞瘤、支持-间质细胞瘤、无性细胞瘤、恶性畸胎瘤)，外阴(鳞状细胞癌、上皮内癌、腺癌、纤维肉瘤、黑素瘤)，阴道(透明细胞癌、鳞状细胞癌、葡萄状肉瘤(胚胎性横纹肌肉瘤)，输卵管(癌)和与女性生殖器官有关的其他部位；胎盘，阴茎，前列腺，睾丸和与男性生殖器官有关的其他部位；血液系统，例如血液(骨髓性白血病【急性和慢性】、急性淋巴细胞白血病、慢性淋巴细胞性白血病、骨髓增殖性疾病、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征)，霍奇金病，非霍奇金淋巴瘤【恶性淋巴瘤】；口腔，例如嘴唇，舌头，牙龈，口底，上颚以及嘴部的其他部位，腮腺以及唾液腺的其他部位，扁桃体，口咽，鼻咽，梨状窦，咽喉以及嘴唇、口腔和咽部的其他部位；皮肤，例如恶性黑素瘤，皮肤黑素瘤，基底细胞癌，鳞状细胞癌，卡波西肉瘤，发育不良痣，脂肪瘤，血管瘤，皮肤纤维瘤和瘢痕瘤；肾上腺：神经母细胞瘤；和其他组织，包括结缔组织和软组织，腹膜后腔和腹膜，眼睛，眼内黑素瘤，和附件，乳房，头部或/和颈部，肛区，甲状腺，甲状旁腺，肾上腺以及其他内分泌腺及相关结构，淋巴结的继发性和未明示的恶性肿瘤，呼吸系统和消化系统的继发性恶性肿瘤以及其他部位的继发性恶性肿瘤。
在一些实施例中，提供了本文公开的方法，其中与本文所述的第一药剂组合使用的第二药剂包含MEK抑制剂或ERK抑制剂。在一些实施例中，第二药剂包含MEK抑制剂。说明性的MEK抑制剂包括但不限于PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。在一些实施例中，第二药剂包含ERK抑制剂。说明性的ERK抑制剂包括但不限于TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
在一些实施例中，提供了本文公开的方法，其中与本文所述的第一药剂组合使用的第二药剂是抗血管生成剂(例如，阻止肿瘤发育新血管的药剂)。抗血管生成剂的实例包括例如VEGF抑制剂、VEGFR抑制剂、TIE-2抑制剂、PDGFR抑制剂、血管生成素抑制剂、PKC-β抑制剂、COX-2(环氧合酶II)抑制剂、整联蛋白(α-v/β-3)、MMP-2(基质-金属蛋白酶2)抑制剂和MMP-9(基质-金属蛋白酶9)抑制剂。优选的抗血管生成剂包括舒尼替尼贝伐单抗阿西替尼(AG 13736)、SU 14813(Pfizer)和AG 13958(Pfizer)。
其他抗血管生成剂包括瓦他拉尼(CGP79787)、索拉非尼哌加他尼八钠凡德他尼PF-0337210(Pfizer)、SU 14843(Pfizer)、AZD 2171(AstraZeneca)、雷珠单抗(AE 941)、四硫钼酸盐(AMG 706(Amgen)、VEGF Trap(AVE 0005)、CEP 7055(Sanofi-Aventis)、XL 880(Exelixis)、替拉替尼(BAY 57-9352)和CP-868,596(辉瑞)。
其他抗血管生成剂包括恩沙托林(LY 317615)、米哚妥林(CGP 41251)、哌立福辛(KRX 0401)、替普瑞酮(Selbex)和UCN 01(Kyowa Hakko)。
可以与本文所述的一种或多种药物组合物一起使用的抗血管生成剂的其他实例包括塞来昔布帕瑞昔布德拉昔布(SC 59046)、罗美昔布伐地昔布罗非昔布艾拉莫德IP 751(Invedus)、SC-58125(Pharmacia)和依托昔布
其他抗血管生成剂包括依昔舒林双水杨酸酯二氟尼柳布洛芬酮洛芬萘丁美酮吡罗昔康萘普生双氯芬酸吲哚美辛舒林酸托美汀依托度酸酮咯酸和奥沙普秦
其他抗血管生成剂包括ABT 510(Abbott)、阿雷司他(TMI 005)、AZD 8955(AstraZeneca)、因塞林德(incyclinide)和PCK 3145(Procyon)。
其他抗血管生成剂包括阿维A普利提环肽(plitidepsin)茨冷泰德(cilengtide)(EMD 121974)、康普瑞汀A4(CA4P)、芬维A胺(4HPR)、卤夫酮(2-甲氧基雌二醇)、PF-03446962(Pfizer)、瑞马司他(rebimastat)(BMS275291)、卡妥索单抗来那度胺角鲨胺沙利度胺(NSC 631570)、(MEDI 522)和唑来膦酸
在一些实施例中，提供了本文公开的方法，其中与本文所述的第一药剂组合使用的第二药剂是所谓的信号转导抑制剂(例如，其抑制了调节分子(支配细胞生长、分化和生存的基本过程)在细胞内的通信手段)。信号转导抑制剂包括小分子、抗体和反义分子。信号转导抑制剂包括例如激酶抑制剂(例如，酪氨酸激酶抑制剂或丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂)和细胞周期抑制剂。更具体地，信号转导抑制剂包括例如ALK抑制剂、ROS1抑制剂、TrkA抑制剂、TrkB抑制剂、TrkC抑制剂、法尼基蛋白转移酶抑制剂、EGF抑制剂、ErbB-1(EGFR)抑制剂、ErbB-2抑制剂、pan erb抑制剂、IGF1R抑制剂、MEK抑制剂、c-Kit抑制剂、FLT-3抑制剂、K-Ras抑制剂、PI3激酶抑制剂、JAK抑制剂、STAT抑制剂、Raf激酶抑制剂、Akt抑制剂、mTOR抑制剂、P70S6激酶抑制剂、WNT通路抑制剂和所谓的多靶向激酶抑制剂。
可以使用的信号转导抑制剂包括吉非替尼西妥昔单抗埃罗替尼曲妥珠单抗舒尼替尼伊马替尼和PD325901(Pfizer)。
可以使用的信号转导抑制剂的其他实例包括BMS 214662(Bristol-Myers Squibb)、洛那法尼培利曲索(AG 2037)、马妥珠单抗(EMD 7200)、尼妥珠单抗(TheraCIM)、帕尼单抗凡德他尼帕唑帕尼(SB 786034)、ALT 110(Alteris Therapeutics)、BIBW 2992(Boehringer Ingelheim)和(TP38)。
可以使用的信号转导抑制剂的其他实例包括PF-2341066(Pfizer)、PF-299804(Pfizer)、卡奈替尼(CI 1033)、帕妥珠单抗拉帕替尼培利替尼(EKB 569)、米替福新BMS 599626(Bristol-Myers Squibb)、Lapuleucel-T(E75癌症疫苗)、(IDM 1)、木利替尼(TAK-165)、CP-724,714(Pfizer)、帕尼单抗拉帕替尼PF-299804(Pfizer)、培利替尼(EKB 569)和帕妥珠单抗
可以使用的信号转导抑制剂的其他实例包括ARRY 142886(Array Biopharm)、依维莫司佐他莫司替西罗莫司AP23573(ARIAD)和VX 680(Vertex)。
可以使用的其他信号转导抑制剂包括XL 647(Exelixis)、索拉非尼LE-AON(乔治敦大学)和GI-4000(GlobeImmune)。
可以使用的其他信号转导抑制剂包括ABT 751(Abbott)、艾弗地布(alvocidib)(夫拉平度)、BMS 387032(Bristol Myers)、EM 1421(Erimos)、因地丝兰(indisulam)(E 7070)、色昔莱布(seliciclib)(CYC 200)、BIO 112(One Bio)、BMS 387032(Bristol-Myers Squibb)、PD 0332991(Pfizer)、AG 024322(Pfizer)、LOXO-101(Loxo Oncology)、克唑替尼、色瑞替尼、曲美替尼、PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E6201、GDC-0623和TAK-733。
可以使用的其他信号转导抑制剂包括曲美替尼、PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E6201、GDC-0623和TAK-733。
可以使用的其他信号转导抑制剂包括曲美替尼、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、匹马西布和比尼替尼。可以使用的信号转导抑制剂包括曲美替尼。可以使用的信号转导抑制剂包括司美替尼。可以使用的信号转导抑制剂包括考比替尼。可以使用的信号转导抑制剂包括瑞美替尼。可以使用的信号转导抑制剂包括匹马西布。可以使用的信号转导抑制剂包括比尼替尼。
在一些实施例中，第二药剂选自经典抗肿瘤剂。经典抗肿瘤剂包括但不限于激素调节剂，如激素、抗激素、雄激素激动剂、雄激素拮抗剂和抗雌激素治疗剂、组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂、基因沉默剂或基因激活剂、核糖核酸酶、蛋白质组学、拓扑异构酶I抑制剂、喜树碱衍生物、拓扑异构酶II抑制剂、烷化剂、抗代谢物、聚(ADP-核糖)聚合酶-1(PARP-1)抑制剂、微管蛋白抑制剂、抗生素、植物源纺锤体抑制剂、铂配位化合物、基因治疗剂、反义寡核苷酸、血管靶向剂(VTA)和他汀类。
可以使用的经典抗肿瘤剂的实例包括但不限于糖皮质激素，例如地塞米松、泼尼松、泼尼松龙、甲基泼尼松龙、氢化可的松，以及孕激素，例如甲羟孕酮、醋酸甲地孕酮(Megace)、米非司酮(RU-486)、选择性雌激素受体调节剂(SERM；例如他莫昔芬、雷洛昔芬、拉索昔芬、阿非昔芬、阿佐昔芬、巴多昔芬、非培米芬、奥美昔芬、奥培米芬、替米利芬、托瑞米芬、曲洛司坦和CHF 4227(Cheisi))、选择性雌激素受体下调剂(SERD；例如氟维司群)、依西美坦(Aromasin)、阿那曲唑(Arimidex)、阿他美坦、法倔唑、来曲唑(Femara)、促性腺激素释放激素(GnRH；通常也称为黄体生成素释放激素【LHRH】)激动剂(如布舍瑞林(Suprefact)、戈舍瑞林(Zoladex)、亮丙瑞林(Lupron)和曲普瑞林(Trelstar))、阿巴瑞克(Plenaxis)、比卡鲁胺(Casodex)、环丙孕酮、氟他胺(Eulexin)、甲地孕酮、尼鲁米特(Nilandron)，以及奥沙特隆、度他雄胺、爱普列特、非那雄胺、锯叶棕、PHL 00801、阿巴瑞克、戈舍瑞林、亮丙瑞林、曲普瑞林、比卡鲁胺、他莫昔芬、依西美坦、阿那曲唑、法倔唑、福美斯坦、来曲唑及其组合。
可以使用的经典抗肿瘤剂的实例包括但不限于辛二酰苯胺异羟肟酸(SAHA，Merck Inc./Aton Pharmaceuticals)、缩酚酸肽(FR901228或FK228)、G2M-777、MS-275、丁酸新戊酰氧基甲酯和PXD-101；豹蛙酶(Onconase/ranpirnase)、PS-341(MLN-341)、万珂(硼替佐米)、9-氨基喜树碱、贝洛替康、BN-80915(Roche)、喜树碱、二氟替康、伊多卡林(edotecarin)、依喜替康(Daiichi)、吉马替康、10-羟基喜树碱、盐酸伊立替康(Camptosar)、鲁托替康、Orathecin(鲁比替康，Supergen)、SN-38、拓扑替康、喜树碱、10-羟基喜树碱、9-氨基喜树碱、伊立替康、SN-38、伊多卡林、拓扑替康、阿柔比星、紫杉醇、氨萘非特、氨柔比星、安那霉素(annamycin)、道诺霉素、多柔比星、依沙芦星、表柔比星、依托泊苷、伊达比星、加柔比星、羟基脲、奈莫柔比星、诺安托(米托蒽醌)、吡柔比星、匹杉琼、丙卡巴肼、蝴蝶霉素、索布佐生、塔菲泊苷(tafluposide)、戊柔比星、Zinecard(右雷佐生)、氮芥N-氧化物、环磷酰胺、AMD-473、六甲蜜胺、AP-5280、阿哌喹酮(apaziquone)、包他利星(brostallicin)、苯达莫司汀、白消安、卡波醌、卡莫司汀、苯丁酸氮芥、达卡巴嗪、雌莫司汀、福莫司汀、葡磷酰胺、异环磷酰胺、KW-2170、洛莫司汀、马磷酰胺、二氯甲基二乙胺、美法仑、二溴甘露醇、二溴卫矛醇、丝裂霉素C、米托蒽醌、尼莫司汀、雷莫司汀、替莫唑胺、噻替派和铂配位烷化化合物，如顺铂、伯尔定(卡铂)、依铂、洛铂、奈达铂、乐沙定(奥沙利铂，Sanofi)、链脲菌素、塞特铂(satrplatin)及其组合。
在一些实施例中，第二药剂选自二氢叶酸还原酶抑制剂。可以使用的二氢叶酸还原酶抑制剂的实例包括但不限于甲氨喋呤和NeuTrexin(三甲曲沙)，嘌呤拮抗剂(例如6-巯基嘌呤核苷、巯嘌呤、6-硫鸟嘌呤、克拉屈滨、氯法拉滨(Clolar)、氟达拉滨、奈拉滨和雷替曲塞)，嘧啶拮抗剂(如5-氟尿嘧啶(5-FU)、爱宁达(培美曲塞二钠，LY231514，MTA)、卡培他滨胞嘧啶阿拉伯糖苷、(吉西他滨，Eli Lilly)、替加氟(UFT Orzel或Uforal，并且包括替加氟、吉美司特和奥他司特的TS-1组合)、去氧氟尿苷、卡莫氟、阿糖孢苷(包括十八烷基磷酸盐、硬脂酸磷酸盐、缓释和脂质体形式)、依诺他滨、5-阿扎胞苷(Vidaza)、地西他滨和乙炔基胞苷)和其他抗代谢物，如依洛尼塞、羟基脲、亚叶酸、诺拉曲塞(Thymitaq)、三安品(triapine)、三甲曲沙、N-(5-[N-(3,4-二氢-2-甲基-4-氧代喹唑啉-6-基甲基)甲氨基]-2-噻吩甲酰)-L-谷氨酸、AG-014699(Pfizer Inc.)、ABT-472(Abbott Laboratories)、INO-1001(Inotek Pharmaceuticals)、KU-0687(KuDOS Pharmaceuticals)和GPI 18180(Guilford Pharm Inc)及其组合。
可以使用的经典抗肿瘤细胞毒性剂的其他实例包括但不限于白蛋白结合型紫杉醇(Abraxis BioScience,Inc.)、巴他布林(Amgen)、EPO 906(Novartis)、长春氟宁(Bristol-Myers Squibb Company)、放线菌素D、博来霉素、丝裂霉素C、新制癌菌素(Zinostatin)、长春碱、长春新碱、长春地辛、长春瑞滨(Navelbine)、多西他赛(Taxotere)、奥他赛(Ortataxel)、紫杉醇(包括他可雷新(Taxoprexin)DHA/紫杉醇偶联物)、顺铂、卡铂、奈达铂、奥沙利铂(Eloxatin)、塞特铂、Camptosar、卡培他滨(Xeloda)、奥沙利铂(Eloxatin)、泰索帝阿利维A酸、坎磷酰胺DMXAA(Antisoma)、伊班膦酸、L-天冬酰胺酶、培门冬酶乙丙昔罗(-放射疗法))、贝沙罗汀替米利芬(DPPE-增强细胞毒作用))、(Biomira)、维A酸替拉扎明莫特沙芬钆(mAb)和NBI-3001(Protox Therapeutics)、聚谷氨酸盐-紫杉醇及其组合。
可以使用的经典抗肿瘤剂的其他实例包括但不限于艾维新(Advexin)(ING 201)、TNFerade(GeneVec，一种或多种响应于放疗表达TNFα的化合物)、RB94(Baylor College of Medicine)、吉那森司(Genasense)(奥利默森，Genta)、康普瑞汀A4P(CA4P)、Oxi-4503、AVE-8062、ZD-6126、TZT-1027、阿伐他汀(Lipitor，Pfizer Inc.)、普伐他汀(Pravachol，Bristol-Myers Squibb)、洛伐他汀(Mevacor，Merck Inc.)、辛伐他汀(Zocor，Merck Inc.)、氟伐他汀(Lescol，Novartis)，西立伐他汀(Baycol，Bayer)、罗苏伐他汀(Crestor，AstraZeneca)、洛雾他汀(Lovostatin)、烟酸(Advicor，Kos Pharmaceuticals)、脂脉优、立普妥、托彻普及其组合。
在一些实施例中，本文公开的方法包括向患者给予进一步包含一种或多种其他药剂的组合。所述一种或多种其他药剂可独立地选自本文所述的抗血管生成剂、本文所述的所谓的信号转导抑制剂、本文所述的经典抗肿瘤剂和本文所述的二氢叶酸还原酶抑制剂。
如本领域技术人员将理解的，出于任何和所有目的，例如在提供书面描述方面，本文提供的所有范围还包括任何和所有可能的子范围以及其子范围的组合。任何列出的范围都可以容易地识别为充分描述并且使同一范围被分解成至少相等的两部分、三部分、四部分、五部分、十部分等。作为一个非限制性实例，本文讨论的每个范围可以容易地分解成后三分之一部分、中间三分之一部分和前三分之一部分等。如本领域技术人员还将理解的，诸如“至多”、“至少”、“大于”、“小于”等的所有语言包括所列举的数字，并且是指可以随后分解成如上所述的子范围的范围。最后，如本领域技术人员将理解的，范围包括每个单个成员。因此，例如，具有1-3种物品的群组是指具有1种、2种或3种物品的群组。类似地，具有1-5种物品的群组是指具有1种、2种、3种、4种或5种物品的群组等等。
本文说明性描述的实施例可适当地在缺少本文中未具体公开的任何元素或限制的情况下实施。因此，例如，术语“包括”、“包含”、“含有”等应当被广义地理解并且没有限制。另外，本文使用的术语和表达已经被用作描述性术语而不是限制性术语，并且不希望使用这种术语和表达来排除所示出和描述的特征或其部分的任何等同物，但是可认识到，在要求保护的技术的范围内可以进行各种修改。此外，短语“基本上由……组成”将被理解为包括那些具体列举的元素和那些不会实质上影响所要求保护的技术的基本和新颖特性的其他元素。短语“由……组成”排除任何未指定的元素。
另外，在根据马库什组描述本公开的特征或方面的情况下，本领域技术人员将认识到，本公开由此还根据马库什群组的任何单个成员或亚组成员进行描述。落入一般公开内容中的每个较窄类型和亚属群组也构成本发明的一部分。这包括本发明的一般性描述，其中附带条件或负面限制从该属中移除任何主题，而不管在本文中是否具体列举了所去除的材料。
提供标题，例如(a)、(b)、(i)等，仅仅是为了便于阅读说明书和权利要求书。说明书或权利要求书中标题的使用不要求以字母或数字顺序或其呈现顺序执行步骤或元素。
提供本文的实例以说明本技术的优点，并进一步帮助本领域普通技术人员使用本技术。还呈现了本文的实例以更充分地说明本技术的优选方面。所述实例决不应被解释为限制由所附权利要求限定的本技术的范围。所述实例可以包括或结合任何变型、方面或上述本技术的方面。所述变型、方面或上述方面还可以进一步包括或结合任何或所有其他变型、方面或本技术的方面的变型。
实例
在说明书中使用的表示成分的量、反应条件等的所有数字应被理解为在所有情况下都被术语“约”修饰。因此，除非相反地指出，否则本文所述的数值参数是近似值，其可以根据试图获得的期望性质而变化。至少，并且不试图将等同原则的应用限制于要求本申请的优先权的任何申请中的任何权利要求的范围，应该根据有效位数和普通的四舍五入法来解释每个数字参数。
实例1：含有N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺的药物组合物
按如下制备含有N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和甜菜碱盐酸盐的药物组合物。
将N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺过60目筛并转移到分批混合容器。将甜菜碱盐酸盐用研钵和研杵研磨，过60目筛，然后转移到分批混合容器。N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)-苯甲酰胺和甜菜碱盐酸盐手动混合约1分钟，然后将预糊化淀粉、胶态二氧化硅和所需异麦芽酮糖醇的一半量加入分批容器。手动混合所得混合物约1分钟。将硬脂酸镁和剩余的异麦芽酮糖醇通过40目筛预混合，然后与分批混合容器中的材料复合。最后的混合物手动混合约5分钟。
将所得混合物填充入不透明白色尺寸#00的明胶胶囊壳中。分离胶囊的主体和胶囊帽，将胶囊主体放入胶囊装置中，通过移动装置的垫片确保胶囊主体的顶部与充填装置的表面齐平。将粉末混合物倾倒在填充装置的表面上，容积填充胶囊的主体，并且均匀地刮除多余的粉末直到所有胶囊主体被填充。使用压粉器一次性将粉末牢牢压实到壳体中。加入其他粉末混合物以填充胶囊的其余部分，刮除任何多余的粉末。对每个胶囊重复压实、填充和刮除过程，直至达到所需的胶囊填充重量。将填充好的胶囊收集在10目筛中并轻轻搅动来除尘。
填充好的胶囊的重量范围接受限度被设定为93％至107％。空胶囊壳的平均重量为119.4mg。胶囊重量下限设定为(0.93×450mg)+119.4mg＝538mg。胶囊重量上限设定为(1.07×450mg)+119.4mg＝601mg。只有那些符合重量限制的胶囊才被用于后续研究。
这些胶囊用于与单个包含第二药剂的药物组合物同时或依序给予。第二药剂可以是MEK抑制剂或ERK抑制剂。
实例2.非小细胞肺癌患者的组合疗法
向人类患者给予一个或多个适当剂量的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和第二药剂以治疗非小细胞肺癌。用所述组合治疗的预期结果包括(1)减小癌症肿瘤的大小，(2)抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤转移，(3)在一定程度上抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤生长，和/或(4)在一定程度上减轻(或优选消除)与癌症相关的一种或多种症状。第二药剂可以是MEK抑制剂或ERK抑制剂。MEK抑制剂的实例包括但不限于PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。ERK抑制剂的实例包括但不限于TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
实例3.甲状腺乳头状癌患者的组合疗法
向人类患者给予一个或多个适当剂量的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和第二药剂以治疗甲状腺乳头状癌。用所述组合治疗的预期结果包括(1)减小癌症肿瘤的大小，(2)抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤转移，(3)在一定程度上抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤生长，和/或(4)在一定程度上减轻(或优选消除)与癌症相关的一种或多种症状。第二药剂可以是MEK抑制剂或ERK抑制剂。MEK抑制剂的实例包括但不限于PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。ERK抑制剂的实例包括但不限于TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
实例4.神经母细胞瘤患者的组合疗法
向人类患者给予一个或多个适当剂量的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和第二药剂以治疗神经母细胞瘤。用所述组合治疗的预期结果包括(1)减小癌症肿瘤的大小，(2)抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤转移，(3)在一定程度上抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤生长，和/或(4)在一定程度上减轻(或优选消除)与癌症相关的一种或多种症状。第二药剂可以是MEK抑制剂或ERK抑制剂。MEK抑制剂的实例包括但不限于PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。ERK抑制剂的实例包括但不限于TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
实例5.胰脏癌患者的组合疗法
向人类患者给予一个或多个适当剂量的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和第二药剂以治疗胰脏癌。用所述组合治疗的预期结果包括(1)减小癌症肿瘤的大小，(2)抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤转移，(3)在一定程度上抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤生长，和/或(4)在一定程度上减轻(或优选消除)与癌症相关的一种或多种症状。第二药剂可以是MEK抑制剂或ERK抑制剂。MEK抑制剂的实例包括但不限于PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。ERK抑制剂的实例包括但不限于TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
实例6.黑素瘤患者的组合疗法
向人类患者给予一个或多个适当剂量的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和第二药剂以治疗黑素瘤。用所述组合治疗的预期结果包括(1)减小癌症肿瘤的大小，(2)抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤转移，(3)在一定程度上抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤生长，和/或(4)在一定程度上减轻(或优选消除)与癌症相关的一种或多种症状。第二药剂可以是MEK抑制剂或ERK抑制剂。MEK抑制剂的实例包括但不限于PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。ERK抑制剂的实例包括但不限于TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
实例7.结肠直肠癌患者的组合疗法
向人类患者给予一个或多个适当剂量的N-[5-(3,5-二氟苄基)-1H-吲唑-3-基]-4-(4-甲基-哌嗪-1-基)-2-(四氢-2H-吡喃-4-基氨基)-苯甲酰胺和第二药剂以治疗结肠直肠癌。用所述组合治疗的预期结果包括(1)减小癌症肿瘤的大小，(2)抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤转移，(3)在一定程度上抑制(即，在一定程度上减缓，优选停止)癌症肿瘤生长，和/或(4)在一定程度上减轻(或优选消除)与癌症相关的一种或多种症状。第二药剂可以是MEK抑制剂或ERK抑制剂。MEK抑制剂的实例包括但不限于PD0325901、司美替尼、考比替尼、瑞美替尼、曲美替尼、匹马西布、比尼替尼、AZD8330、RO4987655、RO5126766、WX-554、E-6201、GDC-0623、TAK-733、RG-7304、CKBP-002、RDEA-436、索拉非尼、PD-184352、GSK-2091976A和AS-703988。ERK抑制剂的实例包括但不限于TG-02、MK-8353、尤夏替尼、HE-3235、AEZS-134、AEZS-136和IDN-5491。
实例8.Ba/F3-TPM3-TrkA-G959R细胞系的生成
本实例描述了为了生成表达TPM3-TrkA-G595R融合蛋白的转基因Ba/F3细胞而进行的研究。编码TPM3-TrkA-G595R融合的cDNA通过基于PCR的技术从恩曲替尼抗性细胞克隆，随后插入慢病毒载体pVL-EF1a-MCS-IRES-Puro(BioSettia，San Diego，CA)中。在通过直接测序确认cDNA插入片段后，将含有TPM3-TrkA-G595R cDNA的水泡性口炎病毒GP(VSVG)-假型慢病毒用8μg/mL聚凝胺(EMD Millipore)以不同的感染倍数转导入鼠IL-3依赖性原B细胞Ba/F3中。在补充有10％FBS和1μg/mL嘌呤霉素的含有鼠IL-3的RPMI培养基中选择转导的Ba/F3细胞，持续2周。在补充有10％FBS(胎牛血清)并且没有鼠IL-3的RPMI培养基中进一步选择稳定的细胞池库，持续4周。
实例9.用恩曲替尼(RXDX-101)治疗对表达TPM3-TrkA或TPM3-TrkA-G595R突变的Ba/F3细胞的影响
将表达TPM3-TrkA或TPM3-TrkA-G595R的500-1000万个Ba/F3细胞在5％CO2培养箱中用不同浓度的恩曲替尼(RXDX-101)培养2小时。用冷磷酸盐缓冲盐水(PBS)(1x)洗涤细胞两次，然后将其再混悬于含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物(EMDMillipore)的1xRIPA缓冲液中，并将所得混合物在4℃下摇动30分钟。通过在4℃下离心(10,000×g)10分钟使所得裂解物澄清。将所得上清液保存用于蛋白质印迹分析。通过SDS-PAGE电泳分离20-40μg所得蛋白质，并转移到聚偏二氟乙烯(PVDF)膜上。根据相应手册中描述的程序用下列抗体(从细胞信号传导获得，除非另有说明)对所得膜进行印迹：磷酸-TrkA-Y490、磷酸-TrkA-Y785、pan-Trk、PLCY1、磷酸-PEGY1-Y783、MEK1/2、磷酸-MEK1/2(S217/S221)、β-肌动蛋白。所得条带用ECL试剂(Amersham)显影，并使用ChemiDoc成像仪(Bio-Rad)捕获图像。蛋白质印迹分析的结果显示在图1中，并证明在表达TPM3-TrkA-G595R的Ba/F3细胞与表达野生型TPM3-TrkA的Ba/F3细胞中，p-MEK1/2(Ser217/221)和总MEK1/2上调。
实例10.恩曲替尼(RXDX-101)、曲美替尼以及恩曲替尼和曲美替尼的组合对表达TPM3-TrkA-G959R的Ba/F3细胞系的生长抑制的体外活性
测量了用恩曲替尼(RXDX-101)、曲美替尼以及恩曲替尼和曲美替尼的组合治疗对表达TPM3-TrkA-G959R的Ba/F3细胞系的生长的影响。每孔约100万个表达TPM3-TrkA-G959R的Ba/F3细胞接种于5mL培养基中的6孔板中。向孔中加入以下一种DMSO中的1000x原液：(a)不含抑制剂(单独使用二甲基亚砜(DMSO)作为对照)，(b)浓度为约300nM的恩曲替尼(RXDX-101)，(c)浓度为约30nM的曲美替尼，或(d)浓度为300nM的恩曲替尼(RXDX-101)和浓度为30nM的曲美替尼的组合。在台盼蓝(Invitrogen，Carlsbad，CA)存在下，使用CountessTM细胞计数器(Invitrogen，Carlsbad，CA)每3至4天对每个相应孔中的细胞进行计数。对于孔中细胞计数当天含有至少100万个活细胞的那些孔，将含有这些细胞的培养基以1:10稀释，其中新鲜生长培养基含有相同的相应浓度的恩曲替尼、曲美替尼或恩曲替尼和曲美替尼的组合。孔中细胞计数当天含有少于100万个活细胞的孔未改变。研究结果显示在图2中，其证明了与不含化合物(DMSO对照)的孔中的细胞以及仅含有恩曲替尼(300nM)和仅含有曲美替尼(30nM)的孔中的细胞相比，用恩曲替尼(300nM)和曲美替尼(30nM)的组合处理的细胞显示出显著的生长抑制(至多40天)。
实例11.在给予恩曲替尼(RXDX-101)、曲美替尼或恩曲替尼和曲美替尼的组合之后，植入表达TPM3-TrkA-G595R的细胞的小鼠的体内研究
将无胸腺nu/nu小鼠，6-7周龄雌性小鼠按200万个KM-12TPM3-NTRK1G595R细胞/小鼠在皮下(右胁腹)植入。一旦平均肿瘤体积达到约150mm3，将动物随机化。动物接受总共10个剂量的赋形剂、60mg/kg恩曲替尼、1mg/kg曲美替尼和恩曲替尼(60mg/kg)+曲美替尼(1mg/kg)，口服，一天一次。所有处理都是可以忍受的。结果显示在图3中，其证明了与对照组(赋形剂)中的那些小鼠、单用恩曲替尼(60mg/kg)处理的那些小鼠和单用曲美替尼(1mg/kg)处理的那些小鼠的肿瘤生长相比，在被给予恩曲替尼(RXDX-101)(60mg/kg)和曲美替尼(1mg/kg)的组合的那些小鼠中降低了植入表达TPM3-TrkA-G595R的细胞的小鼠中的肿瘤生长。
在Ignyta合成了良好生产工艺(GMP)-质量恩曲替尼(RXDX-101)(批号：CA15-919，填充日期12/13/15)。恩曲替尼体内口服给药溶液通过将恩曲替尼混悬于0.5％甲基纤维素(批号：147255，M352-500，Fisher)和1％吐温80(批号：MKB58228V，P4780-100ML，Sigma)的溶液(浓度为5mg/mL)。通过将曲美替尼溶解在DMSO(批号：SHBG1596V，D8418-100ML，Sigma)、PEG 400(批号：MKBX3961V，202398-500G，Sigma)、吐温80(批号：MKB58228V，P4780-100ML，Sigma)和水的溶液中来制备曲美替尼体内口服给药溶液。曲美替尼的最终浓度为0.1mg/mL，并且所得溶液中每种组分的量为3.3％DMSO，16.7％PEG 400，15％吐温80和65％水，并且水仅在给药之前加入。
随机化后，所有动物口服给药以下溶液，一天一次：(a)恩曲替尼赋形剂，(b)恩曲替尼(5mg/mL)，(c)曲美替尼(0.1mg/mL)，或(d)恩曲替尼(5mg/mL)和曲美替尼(0.1mg/mL)的组合，给药体积为约10mL/kg体重。
从Charles River订购6-7周龄之间的无胸腺nu/nu雌性小鼠。在研究开始前3天让动物适应环境(例如细胞植入)。在68-79°F和30-70％湿度的条件下，将动物以12小时光暗循环饲养在经过辐照的单独的HEPA通风笼(IVC，Innovive USA)中。根据在Explora Biolabs(Ignyta ACUP#EB15-050)建立的动物饲养和使用规程向动物随意提供辐照食物(Teklad 2920X)和酸化饮用水(Innovive)。动物由唯一编号耳标标识。
KM12细胞被培养，获取并混悬于浓度为1000万个细胞/mL的1:1无FBS培养基：基质胶中。在第0天将细胞植入每只小鼠右胁腹皮肤下。植入体积为200μL/小鼠。肿瘤生长至平均肿瘤体积达到约130mm3。在第8天，将小鼠随机分为6个治疗组(10只小鼠/组)，开始治疗。动物的治疗通过口服以下，一天一次：(a)赋形剂(0.5％甲基纤维素和1％吐温80)，(b)恩曲替尼(60mg/kg)，(c)1mg/kg曲美替尼，或(d)恩曲替尼(60mg/kg)和曲美替尼(1mg/kg)的组合。所有组的最终治疗在第17天给予，总共10次剂量。最终的肿瘤和体重测量是在给药的最后一天(第17天)进行的。
在整个研究期间内每周两次收集肿瘤测量值和体重。通过卡尺评估肿瘤生长，并使用等式(1)计算肿瘤体积。从研究中移除肿瘤体积>2,000mm3的动物。
体积(mm3)＝[长度(mm)x宽度(mm)x宽度(mm)]/2 (1)
使用实验室规模收集体重。根据体重减轻评估毒性。从研究中移除失去<15％的其体重的动物。
在每个肿瘤测量中，计算每个治疗组的肿瘤生长抑制百分比(％TGI)。使用下面的等式(2)计算％TGI值，其中TVvehicle是经赋形剂处理的动物在特定时间点的肿瘤体积，TVinitial是治疗开始时的初始肿瘤体积，TVtreatment是治疗组在特定终点时间的肿瘤体积。使用GraphPad Prism(版本6.07，GraphPad Software,Inc.)通过ANOVA评估肿瘤体积的差异。
％TGI＝[(TVvehicle-TVtreatment)/(TVvehicle-TVinitial)]x 100
每个测量日的每个组的平均肿瘤体积的汇总表显示在表1中。如上所述计算每一天的％TGI，并且这些数据总结在表2中。由于恩曲替尼+曲美替尼组中有一例死亡，因此通过双因素ANOVA(Prism)进行的重要性评价限制于第14天。本研究的体重数据显示，该死亡可能是由于曲美替尼诱导的毒性引起的。分析显示，到第14天，仅单用曲美替尼组与赋形剂显著不同(p<0.05，双因素ANOVA，Prism)。如果忽略恩曲替尼+曲美替尼组并且分析进行到第17天，则发现相同的情况。还通过单因素ANOVA评估每个治疗组与赋形剂在每个测量日(即，第11天、第14天和第17天)的统计学评价。在第14天和第17天，在赋形剂和单用曲美替尼之间以及赋形剂和恩曲替尼+曲美替尼之间发现差异。在第17天，发现所有组与赋形剂不同(p<0.05，单因素ANOVA，Prism)。整个研究过程中，赋形剂组和单用恩曲替尼组的体重保持稳定。任何接受曲美替尼的动物都观察到了毒性。在恩曲替尼+曲美替尼组中观察到一例死亡，并且该动物的体重数据显示死亡前体重下降。
表1.每个治疗组在每个测量日的平均肿瘤体积
表2.每个治疗组在每个测量日的肿瘤生长抑制百分数(％TGI)
序列表
人原肌球蛋白受体激酶A(TrkA)
人原肌球蛋白受体激酶B(TrkB)
人原肌球蛋白受体激酶C(TrkC)
人ALK酪氨酸激酶受体(ALK)
人原癌基因酪氨酸-蛋白激酶ROS，ROS1
在下面的权利要求书中阐述了其他实施例，以及这些权利要求的等同物的全部范围。