在癌症免疫疗法中有用的生物标记的制作方法_4

文档序号:9773749阅读:来源:国知局
受GemCap与GV1001治疗10周的患者血清样本中的IL-17、IL-4、IL-5、IL-7、PDGF、 RANTES及VEGF含量明显升高。然而,接着进行邦佛朗尼-霍母校正(Bonferroni-Holm correction)后,仅有TOGF仍保有显著意义。第1图中示出第2组及第3组在基期及治疗后的 IL-4、IL-5、IL7、IL-17、PDGF 和 VEGF细胞因子的比较图。
[0119]针对以下项目进行成对分析:
[0120] ?处于基期及经GemCap治疗7周的第2组患者。
[0121] ?处于基期及经GemCap与GVlOOl治疗10周的第3组患者。
[0122] 表3中示出此等检定的总体p值结果。
[0123] 第2组患者与第3组患者的p值有着明显差异。成对魏克逊分析结果显示,第2组患 者在基期与经GemCap治疗7周后,两者之间有19种细胞因子含量呈现明显差异,且在进行邦 佛朗尼-霍母校正后,此19种有明显差异的细胞因子减少为10种。然而,在第3组中,患者在 基期与经6¥1001/66!1^ &?治疗10周后,两者之间仅61-03?达到具有显著性化=0.052),并且 在进行邦佛朗尼-霍母校正后,GM-CSF也不再具有显著性。
[0124] 第2图中示出针对第2组及第3组两组患者进行成对分析以用于挑选细胞因子的数 据图。该图亦包含从基期到治疗后的患者样本中可见的正变化与负变化的数目。在大多数 的第2组患者中,从基期到第7周(即,在GemCap治疗期间)所分析的细胞因子逐渐下降。此结 果与第3组的结果形成对比,在第3组中,正变化与负变化的数目的分布相对均匀。
[0125] C-反应蛋白的结果:
[0126] 分析血清中的CRP含量。第3图示出第2组及第3组患者在基期时与经治疗后血清中 的CRP含量。该数据显示基期时的CRP含量没有显著差异,然而,治疗后的分析结果则显示出 显著差异,接受GVIOOl/GemCap治疗的患者的CRP含量明显低于仅接受GemCap治疗的患者的 CRP含量。表4示出CRP数据依照组别及基期与治疗后进行汇整的统计资料。
[0127] 如同该细胞因子数据一般进行成对分析,且分析结果示于第4图中。从基期到治疗 后,在第2组及第3组中皆无显著差异。
[0128] 血浆分析
[0129] 细胞因子的结果:
[0130] 表4中示出第1组第14周(GemCap)与第3组第14周(GemCap及GV1001)的血浆样本的 比较情形,两者间无显著差异。表5中不出第1组第26周(GemCap)与第3组第26周(GemCap及 GV1001)的血浆样本的比较情形,两者间无显著差异。如同该血清分析一般,使用成对魏克 逊检定法对血浆进行分析,以用于进行以下表6中的p值比较:
[0131] ?处于基期且随后施以GemCap治疗14周的第1组患者。
[0132] ?处于基期且随后施以GemCap与GV1001治疗14周的第3组患者。
[0133] ?处于基期且随后施以GemCap治疗26周的第1组患者。
[0134] ?处于基期且随后施以GemCap与GV1001治疗26周的第3组患者。
[0135]注意到,在接受GemCap治疗后的血清中所见到的细胞因子下降情形,在血浆中不 复见。在第3组第14周的患者中仅在RANTES上看到显著差异,在经过GemCap与GV1001治疗之 后RANTES的含量下降,然而,此下降情形在经过邦佛朗尼-霍母校正之后不再具有显著意 义。
[0136] 存活期分析
[0137] 血清细胞因子:
[0138] 针对基期及治疗后的细胞因子含量及细胞因子含量的绝对变化值进行初期存活 期分析,以显示IL_8(第5图)、嗜酸粒细胞趋化蛋白(第6图)、ΜΙΡ1α(第7图)、ΜΙΡ1β(第8图) 及VEGF(第9图)对于接受单种治疗组或接受双种治疗组的存活期的影响。
[0139] CRP:
[0140] 尽管初期存活期分析指出基期CRP对存活期有影响,但此影响未能达到统计上的 显著意义。然而,第3组在治疗后的CRP含量确实呈现出与存活期差异之间有着明显相关性 (高CRP的中位存活期为222天,低CRP的中位存活期为486天,ρ = 0.002,见第11图),在第2组 中未能见到此情形(第10图)。
[0154] 进一步分析结果
[0155] 第13图图示第2组的基期血清细胞因子数据及治疗后血清细胞因子数据的对数 (log)平均数的测线图。
[0156] 第14图图示第3组的基期血清细胞因子数据及治疗后血清细胞因子数据的对数平 均数。
[0157] 第15图图示各组血清中的细胞因子平均差(治疗后-基期)的测线图。
[0158] 值得注意的是,该等分析结果显示在第2组的血清中有19种细胞因子在基期与治 疗后的数值之间表现出具有统计意义的下降情形(该19种细胞因子为PDGF、ILli3、IL-lra、 IL-2、IL-4、IL-5、IL-7、IL-10、IL-12、IL-13、IL-17、G-CSF、IFNy、嗜酸粒细胞趋化蛋白、 FGFb、MIP1 β、RANTE S、TNFa、VEGF;而非 CRP、IL-6、IL-8、IL-9、IL-15、GM-CSF、IP10、MCP1、 MIPla),然而在第3组中没有一个细胞因子表现出具有统计意义的下降情形。由第16图可看 出此结果,第16图提供针对各组的各种细胞因子使用魏克逊符号排序检定法所获得的p值, 该方法是用以检定由基期至治疗后的数值升高/下降情形。如图中所见,有显著差异者以灰 色粗体字型表示。第2组中的细胞因子的降幅大于第3组,并指出在第2组中有19种细胞因子 明显降低,但第3组中则无。
[0159] 第17图是针对该项研究中各组及各种细胞因子,示出治疗后血清中的细胞因子含 量减去基期血清中的细胞因子含量所得的差值中位数。含量下降者以浅灰色表示,且含量 升高/不变者则以深灰色表示。
[0160] 第18图图示针对该项研究中各组的血清中的每种细胞因子基期数据所建立的考 氏比例风险模型。该表提供该基期数据的单变量分析结果并示出具有95%信赖区间的风险 比率及P值。就第2组而言,〇^、11^-1瓜、几-2、11^-10、嗜酸粒细胞趋化蛋白及正1^具有显著 意义(p〈0.1 ),就第3组而言则是CRP、IL-Ira及嗜酸粒细胞趋化蛋白具有显著意义。
[0161] 第19a图及第19b图示出第2组及第3组处于基期时的血清CRP含量。就第2组而言, 低CRP含量可得到337天的中位存活期,及对于第3组而言,低CRP含量可得到373天的中位存 活期。基期CRP含量预测出第3组中的中位(95%CI)总体存活期(高CRP = 250[132~451]天; 低0^ = 372.5[229~517]天$ = 0.0500),但未能预测第2组的中位总体存活期(高0^ = 195[140~262]天;低〇^ = 337[167~366]天卬=0.2534)。
[0162] 第20a图及第20b图示第2组及第3组处于基期时的嗜酸粒细胞趋化蛋白含量。就第 2组而言,高的血清嗜酸粒细胞趋化蛋白含量得到300天的中位存活期,及对于第3组而言, 高的血清嗜酸粒细胞趋化蛋白含量得到451天的中位存活期。基期嗜酸粒细胞趋化蛋白含 量预测出第3组中的中位(95%CI)总体存活期(高嗜酸粒细胞趋化蛋白=451 [308~623] 天;低嗜酸粒细胞趋化蛋白=238.5[178~344]天;p = 0.0135),但未能预测第2组的中位总 体存活期(高嗜酸粒细胞趋化蛋白=299.5 [167~358]天;低嗜酸粒细胞趋化蛋白= 188 [102 ~320]天;ρ = 0·1138)。
[0163] 第21a图及第21b图示针对血清CRP合并血清嗜酸粒细胞趋化蛋白的基期数据使用 二元变量进行比例风险模型分析。当合并基期的变量时,利用低血清CRP含量加上高血清嗜 酸粒细胞趋化蛋白含量的组合预测出第2组中的最长总体存活期(中位存活期= 337天),并 同样预测出第3组中的最长总体存活期(中位存活期= 450天)。
[0164] 第22a图及第22b图示第2组及第3组在治疗后的血清CRP含量。对于第2组,低血清 CRP含量得到337天的中位存活期,及对于第3组,低血清CRP含量得到450天的中位存活期。
[0165] 第23a图及第23b图示第2组及第3组在治疗后的血清嗜酸粒细胞趋化蛋白含量。对 于第2组,高血清嗜酸粒细胞趋化蛋白含量得到251天的中位存活期,及对于第3组,高血清 嗜酸粒细胞趋化蛋白含量得到364天的中位存活期。
[0166] 第24a图及第24b图示针对血清CRP合并血清嗜酸粒细胞趋化蛋白的治疗后数据使 用二元变量进行比例风险模型分析。当合并变量时,利用低CRP含量加上高嗜酸粒细胞趋化 蛋白含量的组合预测出第2组中的最长存活期(中位存活期= 355天),并同样地预测出第3 组中的最长存活期(中位存活期= 535天)。当合并治疗后的变量时,利用低CRP含量加上高 嗜酸粒细胞趋化蛋白含量的组合预测出第2组中的最长存活期(中位存活期= 355天),并同 样地预测出第3组中的最长存活期(中位存活期= 5
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