使核酸分子同步化的方法与流程

文档序号:12249634阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种使一个或多个非同步化测序产物同步化的方法,所述方法包括:

(a)对多个测序产物执行一个或多个同步化步骤,所述多个测序产物包括所述一个或多个非同步化测序产物,其中所述一个或多个同步化步骤中的每个包括:

(i)将所述多个测序产物与第一组多达三种不同的核苷酸接触,所述多达三种不同的核苷酸选自由dATP、dTTP、dCTP、dGTP和dUTP组成的组;

(ii)用DNA聚合酶延伸所述多个测序产物;以及

(iii)任选地,除去所述组的未标记的核苷酸,

由此使所述一个或多个非同步化测序产物同步化。

2.如权利要求1所述的方法,其中所述一个或多个同步化步骤的每个相继的同步化步骤包括:将所述多个测序产物与第二组多达三种不同的核苷酸接触,所述多达三种不同的核苷酸选自由dATP、dTTP、dCTP、dGTP和dUTP组成的组,其中所述第二组核苷酸与所述第一组核苷酸不同。

3.如权利要求1所述的方法,所述方法还包括在执行所述一个或多个同步化步骤之前:

(b)将多个测序引物与多个靶核酸杂交;以及

(c)执行一个或多个相继的测序轮次,所述一个或多个相继的测序轮次的每个轮次包括:(i)在一个或多个标记的核苷酸存在下延伸所述多个测序引物,以产生所述多个测序产物;以及(ii)测定所述多个测序产物的核酸序列。

4.如权利要求3所述的方法,其中所述执行一个或多个相继的测序轮次包括执行100至200个相继的测序轮次。

5.如权利要求3所述的方法,所述方法还包括在执行所述一个或多个同步化步骤之后,一次或多次重复所述一个或多个相继的测序轮次,接着是所述一个或多个同步化步骤。

6.如权利要求1所述的方法,其中所述组的多达三种不同核苷酸还包括可逆终止子核苷酸。

7.如权利要求6所述的方法,其中所述一个或多个同步化步骤的每个同步化步骤之后,所述可逆终止子核苷酸被去封闭,并且所述多个测序产物准备作进一步延伸。

8.如权利要求6所述的方法,其中所述可逆终止子核苷酸与每个所述组中所述多达三种不同的核苷酸相比,具有不同的碱基。

9.如权利要求1所述的方法,其中所述使一个或多个非同步化测序产物同步化的方法包括执行至少四个同步化步骤。

10.如权利要求1所述的方法,其中所述使一个或多个非同步化测序产物同步化的方法包括执行至少八个同步化步骤。

11.如权利要求1所述的方法,其中在执行所述一个或多个同步化步骤之后,至少95%的所述测序产物被同步化。

12.如权利要求1所述的方法,其中在执行所述一个或多个同步化步骤之后,所述测序产物具有至少0.85的纯洁度得分。

13.如权利要求3所述的方法,其中所述多个靶核酸经由捕获探针附接至固体支撑物。

14.如权利要求1所述的方法,所述方法还包括在每个同步化步骤之后,(i)通过洗涤或(ii)通过使用核苷酸降解酶来除去所述组的多达三种不同的核苷酸。

15.如权利要求1所述的方法,其中所述组的多达三种不同核苷酸还包括天然核苷酸。

16.如权利要求3所述的方法,其中所述一个或多个标记的核苷酸包括一个或多个荧光标记的核苷酸。

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