一种动物组织长片段dna的提取方法及试剂盒的制作方法_4

文档序号:8218531阅读:来源:国知局
B以上,能够很好地满足Irys系统或其他酶切图谱的要求。
[0084](4)本发明的动物组织长片段DNA的提取试剂盒,配方简单、使用方便,可实现动物组织长片段DNA的快速提取。
[0085]下面通过具体实施例方式结合附图对本发明作进一步详细说明。
[0086]实施例1
[0087]利用本发明的动物组织长片段DNA的提取方法从金龙鱼的脑组织提取DNA,具体步骤如下:
[0088](I)将Ig的脑组织在已消毒的培养皿中用剪刀充分剪碎,加入ImL的细胞培养液(90 % DMEM 培养 +10 % FBS),进一步剪碎;
[0089](2)将剪碎的组织转移到15mL的离心管中,再向培养皿中加入ImL的细胞培养液清洗剪刀及培养皿,并收入离心管中,用细胞培养液补充离心管内液体体积至原体积的5倍,上下颠倒混匀,制得组织匀浆;
[0090](3)向步骤⑵中得到的组织匀浆中加入160 μ L的浓度为50mg/mL胶原酶I至终浓度为lmg/mL及80 μ L的浓度为50mg/mL胶原酶IV至终浓度为0.5mg/mL,若组织是肝脏组织,则仅需要加入l_2mL的0.05%的胰酶,然后将加入酶的组织匀浆置于37°C水浴或培养箱中,水平放置2h,每隔15min混匀一次,直至组织块变为柔软的絮状;
[0091](4)取少量的组织消化液利用普通相差显微镜进行镜检,可以看到较多的分散细胞;
[0092](5)将消化好的组织匀浆液过70 μ m的过滤器(Filter, Falcon),同时用5mL注射器的活塞进行轻微的研磨,过滤至培养皿中;
[0093](6)将过滤液分装到2mL的离心管中,500g,离心5min,弃上清液;将沉淀用IxPBS悬浮,500g,离心5min ;再用IxPBS洗2次,加入适量的Ix PBS,制得细胞悬液(cellsuspens1n buffer)待包埋;
[0094](7)将凝固的低熔点琼脂糖放置70°C待熔化,将500 μ L质量百分比浓度为2%的低熔点琼脂糖置于70°C的水浴锅中1min直到琼脂糖完全融化,将溶解后的琼脂糖转移至43°C的水浴锅或恒温仪中至少lOmin,将细胞悬液放置于43°C的水浴锅或恒温仪中至多1min ;
[0095](8)将45 μ L的低熔点琼脂糖快速加入75 μ L的细胞悬浮液,用Ρ1000枪头快速吸取90%的体积进行上下吹打,避免气泡产生,用Ρ200的枪头吸取细胞与胶的混合物95 μ L,快速添满成胶模具(plug cast),确保细胞与胶在水浴锅或恒温仪中保持43°C ;
[0096](9)将成胶模具(plug cast)放置在冰上45min,或放在冰盒中放置4°C冰箱45min,要避免胶与碎冰的接触,制得胶块;
[0097](10)转移胶块(plugs)到含有2.6mL蛋白酶K消化液的离心管中,确保胶块(plugs)完全浸没,50°C水浴2h,每隔一段时间混匀一次,其中,蛋白酶K消化液由167yL的浓度为 20mg/mL 蛋白酶 K(Qiagen Proteinase K enzyme)与 2.5mL 裂解 buffer 混合而成;
[0098](11)弃掉蛋白酶K消化液,重复步骤(10);
[0099](12)弃掉蛋白酶K消化液,用I XWashing buffer冲洗3次;
[0100](13)用1mL的TE buffer快速冲洗胶块(plugs)两次,在室温用摇床180rpm摇晃浸入1mL的TE buffer中的胶块15min,重复三次;
[0101](14)弃掉步骤(13)中的TE Buffer将管塞上的胶块(plug)用下铲子移置离心管底部,每个离心管中加2.5mL的RNase酶消化液,在37°C水浴锅中消化lh,每隔一段时间混勾一次,其中,RNase 消化液由 50 μ L 的浓度为 10mg/mL 的 RNase 酶(Qiagen RNase enzyme)和2.5mL的TE buffer混合而成;
[0102](15)弃掉RNase酶消化液,用IXwashing buffer冲洗胶块三次,每次手动摇晃10s,然后加入1mL I Xwashing buffer慢洗四次,放在摇床上180rpm摇晃15min ;
[0103](16)弃掉I Xwashing buffer,改用1mL TE buffer慢洗五次,在摇床上于180rpm 下摇晃 15min,弃掉 TE buffer ;
[0104](17)用金属小I产子取一个胶块,在干净的吸水纸(Kimwipes)上通过触碰小I产子底部除去胶块多余的液体,不要让吸水纸碰触到胶面,轻轻接触胶块的边缘;将吸好的胶块放置在1.5mL离心管中;
[0105](18)将胶块用离心机5000rpm点甩ls,有利于更好的溶胶;
[0106](19)在70°C水浴锅溶胶2min,快速将离心管转移到43°C水浴锅中5min,加入2 μ L的浓度为0.2U/ μ L的琼脂糖酶(Epicentre),用移液器快速搅拌1s保证酶混匀于琼脂糖中,在43°C水浴锅中45min,保证温差小于3°C ;
[0107](20)将15mL TE Buffer加入到6cm的培养皿中,用镊子将0.1 μπι透析膜放置在TE Buffer表面,盖盖静止润湿lOmin,用宽口枪头混匀DNA,将DNA全部点在膜上,不要点在膜边缘,每张膜可点2?3个DNA,将培养皿盖上盖子,在室温静止2.5h ;
[0108](21)用宽口枪头转移DNA到1.5mL离心管中,用枪头(USAScientific,#1111-1810)轻轻的吹打最多9次至DNA混匀,4°C保存备用。
[0109]接着,利用提取的金龙鱼DNA进行脉冲场凝胶电泳试验,步骤如下:
[0110](I)用150mL 0.5XTBE缓冲液制备一个1%琼脂糖凝胶。
[0111](2)胶凝后,小心移去样品梳,将样品跟loading buffer混合,慢慢注入加样孔中。
[0112](3)把胶放入电泳槽中,加缓冲液,刚好覆盖胶的表面即可,缓冲液事先14°C冷却。
[0113](4)将电泳槽和一个连着稳压电源的程序性开关设备相连。打开电源,调节蠕动泵到适当流速(5?10mL/rain)或打开变速泵至70。
[0114](5)调整电泳参数。大于50kb限制性片段在35s Initial switch time和90sFinal switch time的电脉冲下得以分离,时间20h。
[0115](6)在0.5 μ g/mL的溴化乙锭中进行染色并拍照。
[0116]通过得到的脉冲场凝胶电泳图(如图1所示),上述步骤得到的DNA长度可达2MB,效果良好。
[0117]比较例I
[0118]利用研磨方法从金龙鱼的脑组织提取DNA,具体步骤如下:
[0119](I)称取40mg组织迅速转移到遇冷的研钵中。
[0120](2)快速加入遇冷的2mL MB buffer,研杵上下研20次,不能旋转,避免气泡产生。
[0121](3)冰浴5min,使未匀碎的组织下沉,将每500 μ L上清转移至1.5mL离心管中。
[0122](4)加入等体积无水乙醇,颠倒混匀5次,冰浴60min,中间摇匀一次。
[0123](5) 1500g,4°C离心 7min,弃上清。
[0124](6)加入ImL的MB buffer重悬细胞,1500g,4°C离心7min,弃上清。
[0125](7)重复(6) —次。
[0126](8)每 5mg 组织用 125 μ L MB buffer 重悬,室温放置 15min。
[0127](9)将凝固的低熔点琼脂糖放置70°C待熔化,将500 μ L 2%的低熔点琼脂糖置于70°C的水浴锅中1min直到琼脂糖完全融化,将溶解后的琼脂糖转移至43°C的水浴锅或恒温仪中至少lOmin,将细胞悬浮液放置43°C的水浴锅或恒温仪中至多lOmin。
[0128](10)将45 yL的2%琼脂糖快速加入75 μ L的细胞悬浮液,用P1000枪头快速吸取90%的体积进行上下吹打,避免气泡产生,用Ρ200的枪头吸取细胞与胶的混合物95 μ L,快速添满成胶模具(plug cast),确保细胞与胶在水浴锅或恒温仪中保持43°C。
[0129](11)将成胶模具(plug cast)放置在冰上45min,或放在冰盒中放置4°C冰箱45min,要避免胶与碎冰的接触,制得胶块。
[0130](12)转移胶块(plugs)到含有2.6mL蛋白酶K消化液的离心管中,确保胶块(plugs)完全浸没。50°C水浴
当前第4页1 2 3 4 5 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1