与阻塞性睡眠呼吸暂停相关的组合物和方法_6

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《导睡眠巧录。所有参与的儿童会经历使用现有技术方法 (Montgom&ry-Downs,2006)的整夜多导睡眠记录(PSG)。会用阻塞性呼吸暂停-低通气指 数(AHI)来定量OSA的严重度,AHI被定义为总睡眠时间中每小时阻塞性呼吸暂停和低通 气的次数(Grigg-Damberger等人,2007;Redline等人,2007)。
[0192] 巧忆回忆测试。为了评估巧忆回忆,不知情的研究者会实施常规方法 烟leirandish-Gozal等人,2010)来评价患OSA的儿童(图9)。会给儿童示出一系列26幅 有色的动物图片,运些图片都是儿童熟悉的(例如狗、猫、鸡、狮子、大象、长颈鹿、马、牛、骆 驼、鱼、蝴蝶等)。会允许对象看每个动物图片10秒。儿童最初会识别动物,然后研究者也 会说出每个动物(同时指出它们)作为对每个图片中动物的充分认知的进一步确认。在示 出所有图片后,会合上书,给对象2分钟来自由回忆他们在不看图片的情况下可W记得的 任何动物。每个正确的答案会得一分,错误的答案不会被扣分,对象会被告知允许他们重复 动物的名字如果他们希望运样做。在初次试验后,会允许对象再看一次图片并复习动物名 字。该过程会在晚上重复总计四次(获取阶段),然后在四次试验完成后10分钟进行第一 次回忆测试。在该10分钟间隔期间,会允许儿童看电视。在睡眠研究后的上午,在醒来的 10至15分钟内,会要求对象回忆他们在之前的夜间试验中记住的图片,并计算晨间分数。
[0193] 尿收集和处理。在上午醒来后或在晚上收集中段尿样本作为首次排尿。为了使蛋 白质降解最小化,会将样品(20mL)立即转移到含有丝氨酸蛋白酶抑制剂PMSF(最终浓度 2mM)的管中,并在-80°C储存直至分析(Gozal等人,2009)。
[0194] 开发《巧量分类器。值用按顺序并入经验证的軍白质W评价它们对分类器性能的 互补贡献的化ISA测量来建立不同的多变量分类器(候选生物标志物的组)。使用线性判 别分析(McLachlan,2004)来构建运些多变量分类器,线性判别分析对每个生物标志物分 配反应其贡献的数值权重(在合计的分类器分数中)W共同地将OSA-I与OSA-N对象区分 开。
[0195] 评价候洗牛物梳虎物巧分类器忡能。会基于将巿确巧不巿确分类的样品(即 OSA-I相对于0SA-N)的数量制表来计算每种单独的候选生物标志物或每个多变量的分类 器(生物标志物的组)的灵敏度和特异性。通过将所有可获得的阔值的所有灵敏度值绘制 在y轴而将其当量(1-特异性)值绘制在X轴上来获得受试者工作特征(ROC)图。通过曲线 下面积来评价每个测试的整体准确度,因为其提供不依赖于特定阔值的单个测量(Fawcett 等人,2006)。会基于自然对数转换后的强度和近似t分布的高斯分布来计算上调的P值。 通过Reiner及其同事描述的方法(Reiner等人,2003)来进行多个检验的统计调整。
[0196] 本本本本本本本本本本本本本本
[0197] 本文中所公开和要求保护的所有组合物和/或方法可W根据本公开制成和实现 而不需要不合适的实验。尽管本发明的组合物和方法已经按照一些实施方案进行了描述, 但是对于本领域技术人员明显的是,在不脱离本发明的概念、精神和范围的情况下可W对 所述组合物和方法W及在本文所描述方法的步骤或步骤的顺序中实施变化。更具体地,明 显地,化学和生理两方面都相关的特定试剂可W替代本文所描述的试剂,同时会实现相同 或相似的结果。所有对本领域技术人员明显的运类相似的替代和改变都被视为在如由所附 权利要求限定的本发明的精神、范围和概念内。 阳19引 参考义献
[0199]W下参考文献和本文所列出的任何其他文献在一定程度上提供示例性程序或对 本文所陈述细节补充的其他细节,它们通过引用完整地明确地并入本文。
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【主权项】
1. 一种用于识别患有阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)的对象的方法,其包括 a) 测量来自对象的生物样品的表1中所列出一种或更多种基因的一种或更多种产物 的表达水平;和 b) 基于所述一种或更多种产物的表达水平识别患有OSA的对象。2. 根据权利要求1所述的方法,其包括将一种或更多种产物的表达水平与对照或参考 水平进行比较。3. 根据权利要求1或2所述的方法,其中与对照或参考水平相比一种或更多种产物的 升高的表达水平表明对象可能患有0SA。4. 根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中与对照或参考水平相比一种或更多 种产物的较低的表达水平表明对象可能患有0SA。5. 根据权利要求2至4中任一项所述的方法,其中对照是来自已知未患有OSA的对象 的对照样品中的一种或更多种产物的表达水平。6. 根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中相对于样品中相应标准产物的表达 水平对所述一种或更多种产物的表达水平进行标准化。7. 根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述一种或更多种产物是由选自 CD14、CTSB、HPX、DPP4、TTR、DEFBlIHBD1、FABP3、CP和AZGPl的基因编码的一种或更多种蛋 白质。8. 根据权利要求7所述的方法,其中所述一种或更多种产物是由选自HPX、DPP4、CP和 AZGPl的一种或更多种基因编码的一种或更多种蛋白质。9. 根据权利要求1至8中任一项所述的方法,其中测量至少2、3、4、5、6、7、8、9或10种 产物的表达水平。10. 根据权利要求1至9中任一项所述的方法,其还包括从所述对象获得生物样品。11. 根据权利要求1至10中任一项所述的方法,其中样品为尿样品。12. 根据权利要求11所述的方法,其中相应标准蛋白质是尿肌酸。13. 根据权利要求1至12中任一项所述的方法,其中在晨间收集所述样品。14. 根据权利要求1至12中任一项所述的方法,其中在晚上收集所述样品。15. 根据权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述对象疑似患有0SA。16. 根据权利要求1至14中任一项所述的方法,其还包括使用计算机算法来评价所测 量的选自表1的一种或更多种基因的表达水平。17. 根据权利要求16所述的方法,其还包括确定对象患有OSA的风险评分。18. 根据权利要求1至16中任一项所述的方法,其中测量RNA转录物的表达水平。19. 根据权利要求18所述的方法,其中使用与所述RNA转录物互补的DNA来测量RNA 转录物的表达水平。20. 根据权利要求18或19所述的方法,其中使用扩增或杂交分析来测量RNA转录物的 表达水平。21. 根据权利要求1至16中任一项所述的方法,其中测量蛋白质的表达水平。22. 根据权利要求21所述的方法,其中使用一种或更多种结合多肽来测量蛋白质的表 达水平。23. 根据权利要求22所述的方法,其中所述一种或更多种结合多肽是抗体。24. 根据权利要求1至23中任一项所述的方法,其还包括对所述对象进行睡眠研究。25. 根据权利要求24所述的方法,其中所述睡眠研究包括以下的一种或更多种:使用 多导睡眠图(PSG),进行多次睡眠潜伏期试验(MSLT),或进行清醒度维持测试(MffT)。26. 根据权利要求24或25所述的方法,其中所述睡眠研究包括测量对象睡眠时的一种 或更多种生理特征。27. 根据权利要求26所述的方法,其中所述生理特征包括以下的一种或更多种:脑活 动、心率、心律、血压、呼气中呼出的二氧化碳、和血含氧量。28. 根据权利要求24所述的方法,其中所述睡眠研究包括使用活动记录器。29. 根据权利要求24至28中任一项所述的方法,其中在测量对象中的表达水平之后进 行所述睡眠研究。30. -种用于确定对象是否患有阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)的方法,其包括: a) 分析来自对象的生物样品的由表1中所列出基因编码的一种或更多种蛋白质的表 达水平;和 b) 计算生物样品的风险评分,所述风险评分指示对象患有OSA的可能性。31. 根据权利要求30所述的方法,其中计算风险评分包括使用计算机和算法。32. 根据权利要求30所述的方法,其中计算风险评分包括对表达水平中的每一个应用 模型系数。33. 根据权利要求30所述的方法,其还包括识别具有指示50%可能性或更大可能性患 有OSA的风险评分的患者。34. -种用于评估对象的阻塞性睡眠呼吸暂停的方法,其包括在基于测量从对象获得 的尿样品中的表1所列出一种或更多种基因的表达水平确定对象患有睡眠呼吸暂停后对 对象进行睡眠研究。35. 根据权利要求34所述的方法,其中所述睡眠研究包括以下的一种或更多种:使用 多导睡眠图(PSG),进行多次睡眠潜伏期试验(MSLT),或进行清醒度维持测试(MffT)。36. 根据权利要求34或35所述的方法,其中所述睡眠研究包括测量对象睡眠时的一种 或更多种生理特征。37. 根据权利要求35所述的方法,其中所述生理特征包括以下的一种或更多种:脑活 动、心率、心律、血压和血含氧量。38. 根据权利要求34所述的方法,其中所述睡眠研究包括使用活动记录器。39. 根据权利要求1至38中任一项所述的方法,其中所述对象是儿童。
【专利摘要】本发明的技术涉及用于诊断一种在儿童中观察到的常见病即阻塞性睡眠呼吸暂停的方法和组合物。在一些实施方案中,提供涉及使用新的生物标志物来诊断阻塞性睡眠呼吸暂停的方法和组合物。
【IPC分类】G01N33/573, G01N33/68, H01J49/26, C12Q1/37
【公开号】CN105229165
【申请号】CN201480026312
【发明人】大卫·戈扎尔, 莱芙·贝克尔
【申请人】芝加哥大学
【公开日】2016年1月6日
【申请日】2014年3月7日
【公告号】US20160042121, WO2014138583A1
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