一种鲤疱疹病毒ii型实时荧光pcr检测方法_2

文档序号:9519408阅读:来源:国知局
实施例2 : 本实施例在实施例1的基础上,进一步提出了用磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取 病毒样品中CyHV-2病毒的DNA,并置于-80°C的温度下保存备用。
[0029] 实施例3: 本实施例在实施例2的基础上,进一步提出了在实时荧光PCR扩增检测中,扩增片段 为83bp,扩增体系为20μL。
[0030] 实施例4: 本实施例在实施例3的基础上,进一步提出了实时荧光PCR的扩增反应条件包括:94°C1min; 95°C5s、56°C30s、72°C20s,循环35次;检测设立阳性对照和阴性对照,所 述阳性对照为阳性质粒标准品。
[0031] 实施例5: 本实施例涉及的鲤疱疹病毒II型实时荧光PCR检测方法包括以下步骤: 1)根据CyHV-2 0RF6 基因序列(登录号:JQ815364.1)用软件(PrimerExpress3.0) 设计并合成基因特异性引物及Taqman探针,如下所示: 上游引物F :5 z - CTGGGTACTGTCTGTCCATGTTG -3 z ; 下游引物R:5z-CAAAACGGGCTGGCAGTCT-3 '; 探针P :5 z FAM- TTG TAC CAG CAC TCG CCA ATG AGC A -BHQ 3 z。
[0032] 2)用磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取病毒样品中CyHV-2病毒的DNA,并置 于-20°C的温度下保存备用。
[0033] 3)进行实时荧光PCR扩增检测,扩增片段为83bp,扩增体系为50μL,扩增反应条 件包括:95°C3min;95°C15s、56°C40s、72°C30s,循环45次;检测设立阳性对照和 阴性对照,阳性对照为阳性质粒标准品,阴性对照为ddH20。
[0034] 实施例6 : 本实施例涉及的鲤疱疹病毒II型实时荧光PCR检测方法包括以下步骤: 1)根据CyHV-2 0RF6 和 0RF24基因序列(登录号:JQ815364. 1)用软件(PrimerExpress3. 0)设计并合成基因特异性引物及Taqman探针,如下所示: 上游引物F :5 z - CTGGGTACTGTCTGTCCATGTTG -3 z ; 下游引物R:5z-CAAAACGGGCTGGCAGTCT-3 '; 探针P :5 z FAM- TTG TAC CAG CAC TCG CCA ATG AGC A -BHQ 3 z。
[0035] 2)用磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取病毒样品中CyHV-2病毒的DNA,并置 于-30°C的温度下保存备用。
[0036] 3)进行实时荧光PCR扩增检测,扩增片段为83bp,扩增体系为25μL,扩增反应条 件包括:95°C3min;95°C10s、56°C40s、72°C30s,循环40次;检测设立阳性对照和 阴性对照,阳性对照为阳性质粒标准品,阴性对照为ddH20。
[0037] 实施例7 : 本实施例涉及的鲤疱疹病毒II型实时荧光PCR检测方法包括以下步骤: 1)根据CyHV-2 0RF6 和 0RF24基因序列(登录号:JQ815364. 1)用软件(PrimerExpress3. 0)设计并合成基因特异性引物及Taqman探针,如下所示: 上游引物F :5 z - CTGGGTACTGTCTGTCCATGTTG -3 z ; 下游引物R:5z-CAAAACGGGCTGGCAGTCT-3 '; 探针P :5 z FAM- TTG TAC CAG CAC TCG CCA ATG AGC A -BHQ 3 z。
[0038] 2)用磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取病毒样品中CyHV-2病毒的DNA,并置 于-20°C的温度下保存备用。
[0039] 3)进行实时荧光PCR扩增检测,扩增片段为83bp,扩增体系为20μL,扩增反应条 件包括:95°Clmin;95°C5s、58°C30s、72°C25s,循环45次;检测设立阳性对照和阴性对 照,阳性对照为阳性质粒标准品,阴性对照为ddH20。
[0040] 实施例8 : 本实施例涉及的鲤疱疹病毒II型实时荧光PCR检测方法包括以下步骤: 1)根据CyHV-2 0RF6 和 0RF24基因序列(登录号:JQ815364. 1)用软件(PrimerExpress3. 0)设计并合成基因特异性引物及Taqman探针,如下所示: 上游引物F :5 z - CTGGGTACTGTCTGTCCATGTTG -3 z ; 下游引物R:5z-CAAAACGGGCTGGCAGTCT-3 '; 探针P :5 z FAM- TTG TAC CAG CAC TCG CCA ATG AGC A -BHQ 3 z。
[0041] 2)用磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取病毒样品中CyHV-2病毒的DNA,并置 于-50°C的温度下保存备用。
[0042] 3)进行实时荧光PCR扩增检测,扩增片段为83bp,扩增体系为25μL,扩增反应条 件包括:95°C2min;95°C8s、56°C35s、72°C25s,循环42次;检测设立阳性对照和阴性 对照,阳性对照为阳性质粒标准品,阴性对照为ddH20。
[0043] 实施例9 : 本实施例涉及的鲤疱疹病毒II型实时荧光PCR检测方法包括以下步骤: 1)根据CyHV-2 0RF6 和 0RF24基因序列(登录号:JQ815364. 1)用软件(PrimerExpress3. 0)设计并合成基因特异性引物及Taqman探针,如下所示: 上游引物F :5 z - CTGGGTACTGTCTGTCCATGTTG -3 z ; 下游引物R:5z-CAAAACGGGCTGGCAGTCT-3 '; 探针P :5 z FAM- TTG TAC CAG CAC TCG CCA ATG AGC A -BHQ 3 z。
[0044] 2)用磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取病毒样品中CyHV-2病毒的DNA,并置 于-60°C的温度下保存备用。
[0045] 3)进行实时荧光PCR扩增检测,扩增片段为83bp,扩增体系为22μL,扩增反应条 件包括:95°C3min;95°C10s、56°C40s、72°C30s,循环40次;检测设立阳性对照和 阴性对照,阳性对照为阳性质粒标准品,阴性对照为ddH20。
[0046] 实施例10 : 本实施例涉及的鲤疱疹病毒II型实时荧光PCR检测方法包括以下步骤: 1)根据CyHV-2 0RF6 和 0RF24基因序列(登录号:JQ815364. 1)用软件(PrimerExpress3. 0)设计并合成基因特异性引物及Taqman探针,如下所示: 上游引物F :5 z - CTGGGTACTGTCTGTCCATGTTG -3 z ; 下游引物R:5z-CAAAACGGGCTGGCAGTCT-3 '; 探针P :5 z FAM- TTG TAC CAG CAC TCG CCA ATG AGC A -BHQ 3 z。
[0047] 2)用磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取病毒样品中CyHV-2病毒的DNA,并置 于-20°C的温度下保存备用。
[0048] 3)进行实时荧光PCR扩增检测,扩增片段为83bp,扩增体系为25μL,扩增反应条 件包括:95°C3min;95°C15s、56°C35s、72°C30s,循环35次;检测设立阳性对照和阴 性对照,阳性对照为阳性质粒标准品,阴性对照为ddH20。
[0049] 在上述实施例5~10中,待实时荧光PCR扩增反应结束后,利用荧光PCR仪器的 分析软件,依据Ct值和扩增动力学曲线进行分析测定: (I)TaqMan荧光定量PCR的反应条件,采用2XPremixExTaq(ProbeqPCR)试剂推 荐的25yL体系,以相同浓度的阳性质粒为模板,选用不同浓度的引物和探针,通过矩阵法 对引物和探针的最佳浓度进行优化,同时优化最佳退火温度,获得反应的最低Ct值和最高 荧光强度增加值(ΛRn),为提高反应扩增效率与敏感度,增设NTC(空白)对照。
[0050] (II)TaqMan荧光PCR的标准曲线,以10倍连续梯度稀释(10 3~10 9)的阳性标准 品为模板,以(1)中的反应条件进行TaqMan荧光定量PCR,以模板浓度(拷贝数/μL)为横 坐标,以Ct值为纵坐标绘制标准曲线。
[0051] (III)TaqMan荧光定量PCR检测方法的评价: 敏感性试验:将常规PCR与10倍连续梯度稀释好的阳性标准品分别进行TaqMan荧光 定量PCR,方法参照(I),比较两种检测方法的敏感性。
[0052] 特异性试验:用(I )中建立的TaqMan荧光定量PCR方法分别检测CyHV-2、ISAV、 IHNV、KHV和SVCV,评价建立的TaqMan荧光定量PCR的特异性,。
[0053] 重复性试验:批间重复性试
当前第2页1 2 3 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1