用于检测前列腺基底细胞的方法_2

文档序号:8547946阅读:来源:国知局
[0化日]根据本发明,编码可分析的人TRIM29蛋白(在下文中也称为人TRIM29基因)的 核酸的碱基序列被示于SEQIDNO;l,且人TRIM29蛋白的氨基酸序列被示于SEQIDNO;2。 然而,要分析的基因不限于具有SEQIDNO;l中所示碱基序列的TRIM29基因,只要其在前 列腺基底细胞中表达并能够与W下探针或引物杂交,其中该探针或引物能够与具有SEQID NO;1的碱基序列的TRIM29基因结合。要分析的蛋白也不限于具有SEQIDNO;2中所示氨 基酸序列的TRIM29蛋白,只要其在前列腺基底细胞中表达且能够与W下抗体结合,其中该 抗体能够与具有SEQIDNO;2的氨基酸序列的蛋白结合。换言之,根据本发明,要分析的 TRIM29可W是具有一个或多个突变的TRIM29,只要其在前列腺基底细胞中表达。其也不限 于人TRIM29,且可W是哺乳动物TRIM29,包括例如,人、猴、狗、猫、雪貂、牛、马、山羊、绵羊、 豚鼠、仓鼠、沙鼠、小鼠或大鼠的TRIM29。具有一个或多个突变的TRIM29蛋白的实例包括, 当W人TRIM29作为例子时,由在SEQIDN0;2的氨基酸序列中替换、缺失、插入或增补1到 多个例如1、2、3、4、5、6、7、8或9个氨基酸的氨基酸序列构成的蛋白,^及由与569 10^; 2的氨基酸序列具有80%或更高的序列同一性例如80%或更高、85%或更高、90%或更高、 95%或更高、或者98%或更高序列同一性的氨基酸序列构成的蛋白。
[0化^ <TRIM29蛋白的表达分析〉
[0化2] 根据本发明的检测方法通过免疫组化染色的TRIM29表达分析设及,但不限于, 使TRIM29蛋白的表达可视化。通过TRIM29蛋白表达的可视化,可W在形态学上在相同的 基底细胞中识别出前列腺基底细胞,且前列腺基底细胞和前列腺腺组织结构的形态能够在 TRIM29蛋白表达的基础上被识别。换言之,本发明的检测方法优选地包括在构成部分腺组 织结构的基底细胞中,分析在前列腺的腺组织结构的形态和TRIM29蛋白的可视化表达。 [0化3]如本文所用,"可视化"不仅是指通过光学显微镜或巧光显微镜来总体地识别由免 疫组化染色引起的着色或巧光,而且包括对例如着色、巧光、冷光或放射(即,信号)的机械 检测,并接着识别通过使信号成像得到的图片等。
[0化4]如本文所用,"分析前列腺的腺组织结构的形态W及S重基序蛋白29(TRIM29)蛋 白的可视化表达"不仅包括同时观察前列腺腺组织结构的形态和TRIM29蛋白的表达,而且 还包括,例如,与通过将信号成像得到的图片等相比较地观察前列腺腺组织结构的形态。 [0化5]在前列腺基底细胞中的TRIM29蛋白的分析通过免疫组化染色进行。该是因为基 底细胞在前列腺组织中的位置W及基底细胞的形态能够通过免疫组化染色进行识别。
[0056](免疫组化染色)
[0化7]免疫组化染色是已确立的技术,除使用对TRIM29特异的抗体外,能够基于已知方 法进行。换言之,免疫组化染色是包括通过采用特异性识别抗原的抗体来检测在组织切片 细胞中表达的特异性抗原的方法。
[0化引具体而言,免疫组化染色能够例如如下进行。将前列腺组织冰冻并切片,或将固定 的、石蜡包埋的组织块切片W制备组织切片。识别TRIM29的抗体与组织切片的表面进行反 应。TRIM29抗体能够用发出信号的物质做标记W检测在各个组织切片上的TRIM29蛋白。 或者,TRIM29抗体的二抗可W用发出信号的物质做标记,而不标记TRIM29抗体。此外,生 物素可W与TRIM29抗体或二抗结合,接下来使用发出信号的物质标记与生物素特异结合 的抗生物素蛋白。
[0059]可W用于标记抗体的物质包括,但不限于,巧光染料(例如,若丹明、异硫氯酸巧 光素(FITC)或稀±金属塞合物)、放射性物质(例如,3h、i4C或1251)、或酶(例如,过氧化物 酶、碱性磯酸酶或0-D-半乳糖巧酶)。信号的检测能够采用,但不限于,巧光、放射(放射 自显影)、发冷光W及着色进行。例如,当采用若丹明或FITC作为巧光染料时,信号能够用 巧光显微镜检测。例如当采用碱性磯酸酶并用NBT/BCIP实施着色时,信号能够在光学显微 镜下检测且能同时观察细胞形态。
[0060] 具体地,常用方法包括过过氧化物酶-抗过氧化物酶法(PAP法)、抗生蛋白链菌 素-生物素复合物法(sABC法)、二抗和标记酶被结合到高分子的高分子试剂法、W及采用FITC标记的一抗或采用HRP标记的FITC抗体作为二抗的方法。
[006U(TRIM29 抗体)
[0062] 除采用TRIM29蛋白或其部分多肤作为免疫原之外,根据本发明的用于免疫组化 染色的TRIM29抗体能够通过已知方法进行制备。TRIM29抗体可W是多克隆抗体或单克隆 抗体;并且优选单克隆抗体。该是因为单克隆抗体通常与其他蛋白产生较少的交叉反应。 还可W采用已知的或商业可得的抗体。
[006引 例如,单克隆抗体能够根据Koehler和Milstein(化Uire256 ;495-497,1975)的 方法进行制备。对于多克隆抗体,例如,单独的NKG2D配体或与BSA或KLH结合的抗原可W与佐剂例如弗氏完全佐剂混合,并定期地皮下免疫接种至兔子,之后一旦血液中的抗体效 价升高即采集血液,并且所采集的血液能够被用作抗血清,或者抗体可W在使用前通过已 知方法进行纯化。
[0064] 用于免疫分析法中的抗体还可W是包含针对TRIM29蛋白的抗原结合位点的抗体 片段(抗原结合片段)。该抗体片段的实例包括F(油')2、F油'、F油和Fv。该些抗体片段 能够各自通过,例如,用蛋白酶(例如,胃蛋白酶或木瓜蛋白酶)通过常规方法消化抗体并 随后通过用于分离和纯化蛋白的常规方法来纯化所得物而获得。
[00化]在根据本发明的用于检测前列腺基底细胞的方法中,除TRIM29蛋白的表达分析 夕F,还优选实施细胞角蛋白和/或P63蛋白的表达分析。换言之,TRIM29蛋白和细胞角蛋 白可W被分析;TRIM29蛋白和p63蛋白可W被分析;或者S种蛋白可W被分析。
[0066] 根据本实施方式,2种或更多种蛋白可W在来自同一受试者(患者)的同一组织切 片上分析。此外,2种或更多种蛋白可W在来自同一受试者(患者)的各个不同组织切片上 分别分析。
[0067] <细胞角蛋白的表达分析〉
[0068] 在本发明检测方法中通过免疫组化染色进行的细胞角蛋白表达分析设及,但不限 于,使细胞角蛋白的表达可视化。通过细胞角蛋白表达的可视化,可W在形态学上在相同的 基底细胞中识别出前列腺基底细胞,且前列腺基底细胞和前列腺腺组织结构的形态能够在 细胞角蛋白表达的基础上被识别。换言之,本发明的检测方法优选地设及,分析前列腺腺组 织结构的形态,W及细胞角蛋白在形成部分腺组织结构的基底细胞中的可视化表达。
[0069] 除采用对细胞角蛋白特异的抗体外,细胞角蛋白的表达分析可W基于已知方法来 进行。具体地,除采用对细胞角蛋白特异的抗体外,分析可W根据"TR1M29蛋白的表达分析" 中记载的方法进行。细胞角蛋白5的氨基酸序列在SEQIDNO;4中示出,且细胞角蛋白14 的氨基酸序列在SEQIDNO;6中示出。编码细胞角蛋白5的碱基序列在SEQIDNO;3中示 出,且编码细胞角蛋白14的碱基序列在SEQIDNO;5中示出。
[0070] 对细胞角蛋白特异的抗体可W是多克隆抗体或单克隆抗体;并且优选单克隆抗 体。该是因为单克隆抗体通常与其他蛋白产生较少的交叉反应。还可W采用已知或商业可 得的抗体。例如,可W采用340E12单克隆抗体,其是商业可得的细胞角蛋白单克隆抗体; 该抗体识别细胞角蛋白1、5、10和14。
[0071] <p63蛋白的表达分析〉
[0072]在本发明的检测方法中的p63表达分析设及,但不限于,使p63蛋白的表达可视 化。通过p63蛋白表达的可视化,可W在形态学上在相同的基底细胞中识别出前列腺基 底细胞,且前列腺基底细胞和前列腺腺组织结构的形态可W在P63蛋白表达的基础上被识 另IJ。换言之,本发明的检测方法优选地设及,分析前列腺腺组织结构的形态,W及P63蛋白 在构成部分腺组织结构的基底细胞中的可视化表达。
[0073]除采用对p63特异的抗体之外,p63蛋白的表达分析可W基于已知方法进行。具体 而言,除采用对p63特异的抗体外,分析可W根据"TRIM29蛋白的表达分析"记载的方法进 行。p63的氨基酸序列在SEQIDNO;8中示出,且编码p63的碱基
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