一种小麦二位点表达的HMW-GS数目变异全套近等基因系的创制方法与流程

文档序号:15485138发布日期:2018-09-21 19:44阅读:140来源:国知局

本发明属于小麦育种技术领域,涉及一种小麦二位点表达的 HMW-GS数目变异全套近等基因系的创制方法。



背景技术:

小麦种子贮藏蛋白包括:高分子量谷蛋白(High molecular weight glutenin subunits,HMW-GS)、低分子量谷蛋白和醇溶蛋白三种。小麦HMW-GS仅占成熟种子蛋白的10%左右,在面粉加水形成面团的揉混过程中,其通过分子间或分子内二硫键结合形成谷蛋白聚合体,这种网络状的“骨架”结构在小麦面筋形成过程中具有重要作用 (Shewry and Halford 2002;Shewry et al.2003;Yang et al.2014;Wieser and Kieffer.2001)。因此,小麦HMW-GS的数量和质量是影响小麦加工品质的重要因素。

普通小麦的HMW-GS基因位于第1同源群染色体长臂上,编码这类蛋白的基因位点统称为Glu-1,其对应于A、B和D基因组的基因位点分别为Glu-A1、Glu-B1和Glu-D1,每1位点内有2个紧密连锁的基因,分别编码分子量较大的x和较小的y亚基且为共显性遗传 (Shewry et al.1992,2003;Rasheed et al.2014)。普通小麦的3个 HMW-GS基因位点在理论上可表达6个亚基,但因部分基因沉默而仅表达3-5个亚基(Shewry et al.1992,2003)。这3-5个亚基可由Glu-A1, Glu-B1和Glu-D1 3个位点上每个表达1-2个HMW-GS,也称3位点表达型;也可由其中2个位点表达(通常为Glu-B1和Glu-D1表达1-2 个,而Glu-A1表达0个),也称2位点表达型。

近等基因系(near-isogenic line,NIL)是指除目标性状基因不同,而其他遗传背景完全相同的一组遗传材料(品系),是研究单个基因(对) 遗传效应的理想研究材料。构建小麦近等基因系的方法主要有:多代回交转育法、基于目标性状位点杂合个体自交法(Tuinstra et al.1997) 以及从突变体中分离等(李希锋和董娜2012)。小麦加工品质受多个品质基因编码的多种蛋白共同影响,小麦HMW-GS近等基因系是研究HMW-GS组成和数目变化导致加工品质发生变异的理想研究材料。目前,绝大多数小麦HMW-GS近等基因系都是通过杂交并多代回交转育方式创制。如,采用这种方法分别构建了遗传背景Sicco的1Dx null,1Dy null和1By null(Rogers et al.1991)、龙辐麦19Glu-A1的1和 2*(刘伟等,2005)、龙辐麦3号Glu-A1的null和1、龙97-586Glu-B1的7 和7+8(张莉丽等,2007,2009)、龙麦20Glu-B1的7+8和7+8*分别与 17+18(高丹丹等.2008;张延滨等.2008)、小偃54Glu-B1的14+18和 14+15(庞斌双等,2007)以及HD2329为背景的涉及Glu-A1的1和null, Glu-B1的7+8,7+8*,17+18和20以及Glu-D1的5+10和2.2等(Goel et al. 2015,2017)以及西农1718背景的Ax1与null,西农2208背景的Dx2亚基缺失与不缺失(Gao et al.2018)等多个HMW-GS近等基因系。应用 HMW-GS全缺失突变体,利用回交并结合分子标记技术,构建了Glu-1 位点近等渗入系(张星星等,2016)。也有从突变体中选育小麦 HMW-GS近等基因系的报道。如,在小麦冀92-3235的无性系变异材料中发现了Glu-D1 2+12亚基缺失体,从而选育了Glu-D1 2+12和null 亚基的近等基因系(温之雨等,2003)。

综上所述,现有创制小麦HMW-GS近等基因系的方法主要采用杂交后并多次回交转育,其在创制HMW-GS组成不同,数目变化不大(一般为1个或1对亚基的差异)的4个以下近等基因系具有优势,但这种方法由于需要多代回交,也存在纯合稳定时间相对偏长,不能快速获得目标近等基因系。

为了快速获得HMW-GS组成有差异,同时数目上梯度变化(最多可在3个Glu-1位点的5或4个HMW-GS有差异,即0-4/5个变化) 的全套近等基因系(最少4个,可多达8个),本发明应用3个Glu-1 位点表达0个HMW-GS的普通小麦作母本,而在B和D 2个基因组的Glu-1位点上表达3-4个而在A基因组的Glu-1位点不表达 HMW-GS的普通小麦为父本,通过1次杂交,并在后代通过生化标记连续选择2位点HMW-GS基因杂合型单株连续多代自交和选择, 获得了在HMW-GS基因组成和表达数目上都有很大差异的全套(4 个)小麦HMW-GS近等基因系。



技术实现要素:

针对现有技术存在的缺陷,本发明提供一种小麦二位点表达的 HMW-GS数目变异全套近等基因系的创制方法,仅通过一次杂交,结合应用生化标记鉴定后代HMW-GS组成选择后代自交,鉴定获得一套表达不同数目(0-3/4)HMW-GS小麦近等基因系。

本发明是通过以下技术方案来实现:

一种小麦二位点表达的HMW-GS数目变异全套近等基因系的创制方法,包括以下操作:

1)以A、B和D 3个基因组Glu-1位点所有HMW-GS均不表达的小麦为母本,以B和D基因组两个Glu-1位点表达、表达3-4个而 A基因组Glu-1表达0个HMW-GS的小麦为父本,进行杂交,得到 F1种子;

2)将F1种子分单粒种植于大田,开花前套袋自交,然后分别收获单株F2种子,选取其中两株种子数100粒以上的F2种子用于 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成,在所选株的每个单株中选择 HMW-GS组成与原父本蛋白表现型相同的所有含胚大半粒种子继续种植,其余舍掉;

3)将选中的F2种子分单粒种植成F3株系,开花前套袋自交,单株收获F3种子;

4)每个F3单株中随机选取10粒种子,分单粒利用半粒法 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成;选择单株内B和D 2个基因组的 Glu-1位点HMW-GS都在分离的单株为目标单株,目标单株内所有种子分单粒鉴定HMW-GS组成,选择与原父本具有相同HMW-GS 蛋白组成的所有单粒种子继续种植;

5)重复步骤4)的自交步骤从F4到F5,从F5的目标单株中鉴定所有种子的组成,并按HMW-GS表现型进行归类种植,在F6代鉴定出HMW-GS基因型纯合稳定的全套近等基因系。

F3单株中的目标单株的选择及种植为:

每个F3单株中随机选取10粒种子,分单粒利用半粒法 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成;若F3单株在B和D两个基因组Glu-1 位点上均出现HMW-GS有、无分离则作为目标单株保留,直至任意鉴定到2个目标单株;若在B和D两个基因组任意1个Glu-1位点上HMW-GS组成在10粒种子间表现一致,为非目标单株将其淘汰;对于中选的目标单株,从中鉴定出与原父本HMW-GS蛋白表现型相同的全部种子,分单粒种植成F4株系,开花前套袋自交,分单株收获F4种子。

F4、F5单株中的目标单株的选择及种植为:

每个F4单株中随机选取10粒种子,分单粒利用半粒法 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成;若F4单株在B和D两个基因组Glu-1 位点上均出现有、无分离则作为目标单株保留,直至任意鉴定到2个目标单株;若在B和D两个基因组任意1个Glu-1位点上10粒种子 HMW-GS组成表现一致,为非目标单株将其淘汰;对于中选的目标单株,从中鉴定出与原父本HMW-GS相同的全部种子,分单粒种植成F5株系,开花前套袋自交,分单株收获F5种子;

每个F5单株中随机选取10粒种子,分单粒利用半粒法 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成;若F5单株在B和D两个基因组的 Glu-1位点上均出现有、无分离则为目标单株保留,直至任意鉴定到 2个目标单株;若在B和D两个基因组任意1个Glu-1位点上10粒种子HMW-GS组成表现一致,为非目标单株将其淘汰;对于中选的目标单株,鉴定所有种子的HMW-GS组成,根据HMW-GS组成进行归类;将具有相同HMW-GS组成的种子,分单粒种植成F6株系,开花前套袋自交,分单株收获F6种子。

F6单株中的近等基因系为:

F6单株中将每类HMW-GS组成单株均分单粒检测10粒,只有当单株内10粒种子HMW-GS组成相同时,则认为其在Glu-1位点基因组成已纯合并再检测20粒确认,直至从所有类型中均鉴定到目标单株,这些单株互相为HMW-GS组成不同的近等基因系。

与现有技术相比,本发明具有以下有益的技术效果:

本发明通过连续选择Glu-1的2位点杂合基因型的个体(通过下一代HMW-GS表型分离情况推断其上一代的基因型是否为2位点杂合)进行连续自交,从自交3代后代中选择HMW-GS组成稳定而不发生分离的全套近等基因系,避免了连续回交导致HMW-GS纯合稳定时间过长的问题;更为明显的是,通过该方法可以获得HMW-GS近等基因系数目从0-3/4个梯度变化的全套(4个)近等基因系,实现了 HMW-GS组成不同、数目梯度变异的全套近等基因系。

附图说明

图1为本发明的创制流程示意图;

图2是以G0为母本,2位点HMW-GS表达型小麦品种作父本杂交F2代(及后代全杂合基因型)的HMW-GS分离情况。其中,G0表示3个Glu-1位点(Glu-A1,Glu-B1和Glu-D1)的所有HMW-GS均不表达(0个)的普通小麦,基因型NN,NN,NN,蛋白表型N,N,N。父本:在B和D 2个基因组Glu-1均表达HMW-GS蛋白,而在A基因组 Glu-1不表达HMW-GS蛋白,基因型NN,BB,DD,蛋白表型N,B,D;基因B,D相对N均为显性,即基因型NN,BN,DN分别与NN,BB,DD 的蛋白表型一致,均为N,B和D。下划线示2位点杂合基因型,阴影示基因型组成为纯合的4种近等基因系类型。

图3是以2位点表达型小麦品种蜀麦126(N,7+9,2+12)为父本创制的表达0-4个HMW-GS的近等基因系的SDS-PAGE电泳图。母本 G0:表达0个HMW-GS(N,N,N);父本蜀麦126:表达4个HMW-GS (N,7+9,2+12);A-D:表达0-4个HMW-GS的4种近等基因系。其表达的HMW-GS,A:(N,N,N);B:(N,7+9,N);C(N,N,2+12);D:(N, 7+9,2+12)。

具体实施方式

为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合实施例,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。

在创制表达HMW-GS组成有差异,数目变化幅度大的一整套近等基因系过程中存在的问题和不足,本发明提供了一种仅通过一次杂交,结合应用生化标记鉴定后代HMW-GS组成,依据父本所具有的 HMW-GS由2个Glu-1位点编码的情况,在后代选择2个Glu-1位点均为杂合基因型的单株连续自交,在自交4代的基因型杂合目标单株中,鉴定获得一套表达不同数目(0-3/4)HMW-GS小麦近等基因系的方法。

以3个基因组Glu-1表达HMW-GS为0个的普通小麦为母本,表达4个(如,蜀麦126,其Glu-A1,Glu-B1和Glu-D1HMW-GS组成为Axnull,Bx7+By9,Dx2+Dy12,即N,7+9,2+12)的普通小麦为父本通过一次杂交,后代通过连续自交鉴定筛选,最终获得HMW-GS组成不同,数目梯度变化的一整套(4个)近等基因系。

首先,通过常规杂交产生F1种子。F1自交产生F2种子并利用半粒法SDS-PAGE分单粒鉴定HMW-GS组成,即1粒种子1分为2,仅含胚乳的小半粒种子用于鉴定HMW-GS组成,含胚的大半粒种子用于种植繁种。在F2选择HMW-GS组成与父本相同的单粒种子继续种植,自交产生F3种子。F3分单株收获后,每个单株分单粒鉴定10 粒种子的HMW-GS组成,选择单株内B和D 2个基因组的Glu-1位点HMW-GS都在分离(即上一代上述两个Glu-1位点都为杂合,这一代都出现有、无带的分离)的单株为目标单株,据此推测其上一代的 HMW-GS基因在B和D 2个基因组的Glu-1位点都为杂合基因型类型。目标单株内所有种子分单粒鉴定HMW-GS组成,选择与原父本具有相同HMW-GS组成的所有单粒种子继续种植。重复以上自交步骤到F5,从F5的目标单株中鉴定所有种子的组成,并按HMW-GS表现型(即HMW-GS类型,非基因型,一整套含有4种HMW-GS表现型)进行归类种植,在F6代鉴定出HMW-GS基因型纯合稳定的全套近等基因系。

进一步的,一种小麦二位点表达的HMW-GS数目变异全套近等基因系的创制方法,包括以下操作:

1)以A、B和D 3个基因组Glu-1位点所有HMW-GS均不表达的小麦为母本,以Glu-B1和Glu-D1两个Glu-1位点表达、表达3-4 个HMW-GS而Glu-A1不表达HMW-GS的小麦为父本,进行杂交,得到F1种子;

2)将F1种子分单粒种植于大田,开花前套袋自交,然后分别收获单株F2种子,选取其中两株种子数100粒以上的F2种子用于 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成,在所选株的每个单株中选择 HMW-GS组成与原父本HMW-GS蛋白表现型相同的的所有含胚大半粒种子继续种植,其余舍掉;

3)将选中的F2种子分单粒种植成F3株系,开花前套袋自交,单株收获F3种子;

4)每个F3单株中随机选取10粒种子,分单粒利用半粒法 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成;若F3单株在B和D两个基因组Glu-1 位点上均出现HMW-GS有、无分离则作为目标单株保留,直至任意鉴定到2个目标单株;若在B和D两个基因组任意1个Glu-1位点上HMW-GS组成在10粒种子间表现一致,为非目标单株将其淘汰;对于中选的目标单株,从中鉴定出与原父本HMW-GS蛋白表现型相同的全部种子,分单粒种植成F4株系,开花前套袋自交,分单株收获F4种子;

5)每个F4单株中随机选取10粒种子,分单粒利用半粒法 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成;若F4单株在B和D两个基因组Glu-1 位点上均出现有、无分离则作为目标单株保留,直至任意鉴定到2个目标单株;若在B和D两个基因组任意1个Glu-1位点上10粒种子 HMW-GS组成表现一致,为非目标单株将其淘汰;对于中选的目标单株,从中鉴定出与原父本HMW-GS相同的全部种子,分单粒种植成F5株系,开花前套袋自交,分单株收获F5种子;

6)每个F5单株中随机选取10粒种子,分单粒利用半粒法 SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成;若F5单株在B和D两个基因组的 Glu-1位点上均均出现有、无分离则为目标单株保留,直至任意鉴定到2个目标单株;若在B和D两个基因组任意1个Glu-1位点上10 粒种子HMW-GS组成表现一致,为非目标单株将其淘汰;对于中选的目标单株,鉴定所有种子的HMW-GS组成,根据HMW-GS组成进行归类;将具有相同HMW-GS组成的种子,分单粒种植成F6株系,开花前套袋自交,分单株收获F6种子;

7)F6单株中将每类HMW-GS组成单株均分单粒检测10粒,只有当单株内10粒种子HMW-GS组成相同时,则认为其在Glu-1位点基因组成已纯合并再检测20粒确认,直至从所有类型中均鉴定到目标单株,这些单株互相为HMW-GS组成不同的近等基因系。

所述半粒法鉴定HMW-GS组成采用SDS-PAGE电泳法,具体实施方案如下:

(1)用刀片在种子远离胚端刮少量胚乳并研磨成细粉,按照每4 mg样品加入100μl蛋白提取液的比例加入提取液[含62.5mM Tris-HCl(pH6.8),10%(v/v)甘油,2%(w/v)SDS,0.002%(w/v)溴酚蓝,3.0%(v/v)β-巯基乙醇],于室温下振荡1.5h,沸水中变性3-5min, 8000rpm 4℃离心5min。

分离胶缓冲液(1L):溶解151.2g Tris,10g SDS,38g硼酸,加水定容至1L,pH值为8.9。

浓缩胶缓冲液:1.0M Tris-HCl(pH 6.8),10%(W/V)SDS。

电泳缓冲液:将分离胶缓冲液稀释10倍

聚丙烯酰胺凝胶组成如下:

(2)取上清液2.5μL点样,恒流20mA电泳,待溴酚蓝走出分离胶 30min后,电泳结束,取下胶用染色液(500ml染色液组成:325ml蒸馏水、0.5g考马斯亮蓝R-250、125ml异丙醇、50ml冰醋酸)染色1-2 h,清水漂洗脱色至凝胶背景清晰后,照相保存结果,结果如图3所示。

下面结合图1-图3及具体实施例对本发明作进一步描述。

一种小麦二位点表达的HMW-GS数目变异全套近等基因系的创制方法,包括以下操作:

1)以3个Glu-1位点表达0个HMW-GS的普通小麦为母本,2 个Glu-1位点表达4个(如,蜀麦126,其Glu-A1,Glu-B1和Glu-D1 HMW-GS组成为Axnull,Bx7+By9,Dx2+Dy12,即N,7+9,2+12)的普通小麦为父本,常规杂交产生杂交F1种子。

2)种植杂交F1种子,开花前套袋自交,结实、收获F2种子。 F2种利用半粒法(不含胚的小半粒)分单粒鉴定HMW-GS组成,选择 HMW-GS组成与原父本蜀麦126一致的单粒种子种植(含胚的大半粒),开花前套袋自交,分单株收获F3种子。

3)每个单株选择10粒F3种子鉴定HMW-GS组成,如某1个单株内10粒种子在B和D 2个Glu-1位点的HMW-GS都出现有带和无带的分离,则推测其上一代(F2)HMW-GS的基因组成在2个位点都为杂合型,则为目标单株,(选择2位点杂合基因型有2个重要原因, 一是通过连续选择Glu-1位点杂合基因型从而使其在除Glu-1位点外的其它位点形成连续自交,二是保证在最后一步的近等基因系选择过程中能具有全部4种类型,否则类型将不完整。

目标单株内所有种子分单粒SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成,选择与原父本蜀麦126HMW-GS组成相同的所有种子,如蜀麦126的 HMW-GS组成为N,7+9,2+12,则选择HMW-GS蛋白表现型全部为 N,7+9,2+12的种子,表现型为其它类型的均不选(如图2所示),分单粒种植,开花前套袋自交,分单株收获F4种子。

4)每个单株选择10粒F4种子鉴定HMW-GS组成,如某1个单株内10粒种子在B和D 2个Glu-1位点的HMW-GS都出现有带和无带的分离,则推测其上一代(F3)HMW-GS的基因组成在2个位点都为杂合型,则为目标单株。

目标单株内所有种子分单粒SDS-PAGE鉴定HMW-GS组成,选择与原父本蜀麦126HMW-GS组成相同的所有种子分单粒种植,开花前套袋自交,分单株收获F5种子。

5)每个单株选择10粒F5种子鉴定HMW-GS组成,如某1个单株内10粒种子在B和D 2个Glu-1位点的HMW-GS都出现有和无的分离,则推测其上一代(F4)HMW-GS的基因组成在2个位点都为杂合基因型,则为目标单株。目标单株内所有种子分单粒SDS-PAGE 鉴定HMW-GS组成,以蜀麦126为父本的为例,分成4类,其蛋白表型分别为A(N,N,N)、B(N,7+9,N)、C(N,N,2+12)、D(N,7+9, 2+12)。

6)上述种子分类分单粒种植,开花前套袋自交,分单株收获F6种子。

7)每个单株选择10粒F6种子鉴定HMW-GS组成,如果10粒种子HMW-GS组成一致,则该单株可能为HMW-GS稳定的目标单株并再鉴定10粒进行确认,直至选择到4种HMW-GS表现纯合稳定(即在基因组成上表现纯合)的类型,由此构成了一套HMW-GS数目0-4个的近等基因系。

以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。

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