一种枯草芽孢杆菌β-甘露聚糖酶的耐酸性改造的制作方法

文档序号:413608阅读:363来源:国知局
专利名称:一种枯草芽孢杆菌β-甘露聚糖酶的耐酸性改造的制作方法
技术领域
发明涉及ー种β -甘露聚糖酶耐酸性定点改造的方法,属于分子生物学和基因エ程领域。
背景技术
β -甘露聚糖酶(β -mannanase EC 3. 2. 1. 78)是一种半纤维素水解酶,以内切方式降解β_1,4糖苷键,降解产物的非还原末端为甘露糖,其作用底物包括葡萄甘露聚糖,半乳甘露聚糖及β_甘露聚糖等,β_甘露聚糖酶的来源非常广泛,包括植物、细菌、真菌、放线菌甚至软体动物。 β -甘露聚糖酶可消除食料中甘露聚糖的抗营养作用,改善饲料的营养价值,以及配合其他的酶(木聚糖酶、蛋白酶)进ー步提高家畜的生产性能;作为ー种典型的饲料用酶,其需要满足饲料生产以及动物消化系统对酶的性质的特殊要求,但由于动物肠道对pH的要求在PH2. 0左右,而本项目前期对纯化到的β -甘露聚糖酶酶学性质分析表明,其最适pH为pH6. 5,在pH4. 0以下迅速失活,故为了使其pH特性适合饲料用酶对pH的特殊要求,在理性分析其三维结构的的基础上,对β_甘露聚糖酶进行耐酸性的定点改造,以图得到符合エ业化需要的产β_甘露聚糖酶重组菌株。

发明内容
本发明主要研究内容针对来源于枯草芽孢杆菌B. subtilis 6-7(已保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CTCCM 2009200)的β -甘露聚糖酶进行理性分析,通过重叠PCR技术进行定点突变,经定点改造后的β -甘露聚糖酶基因Mlu I、BamH I双酶切与经同样酶切的表达载体PMA5在T4连接酶的作用下16°C过夜连接,将连接后的重组质粒转化枯草芽孢杆菌168菌株,成功得到一株重组菌株pMA5_gmuGb54/Bacillus subtilis168,经发酵纯化后对重组蛋白进行酶学性质分析,其pH由pH6. 5下降到pH5. 5,酶活力也相应的提高6.2%。本发明的技术方案以重组质粒pMA5_manA作为模板,根据设计好的引物及提前设计好的重叠PCR扩增条件和扩增体系进行定点突变,利用凝胶回收试剂盒对PCR产物进行纯化和回收。用PCR回收产物和质粒pMA5进行双酶切,利用凝胶回收试剂盒回收双酶切产物,利用T4DNA 连接酶 16 °C 过夜连接重组质粒 PMA5-gmuGal76、PMA5_gmuGb54、PMA5_gmuGcl98、PMA5-gmuGdlOU PMA5_gmuGel26,用连接产物转化感受态枯草芽孢杆菌168,挑取阳性转化子到10ml液体LB培养基中,37 °C摇床培养过夜,提取质粒,酶切验证正确后加入甘油,-20°C保藏备用,S卩成功构建了基因工程菌PMA5-gmuGal76/Bacillus subtilis168、 PMA5-gmuGb54/Baci1lus subtilis 168、 PMA5-gmuGc198/Bacillus subtilis 168、PMA5-gmuGdlO 1/Baci 1 lus subtilis 168、PMA5-gmuGe 126/Bacillus subtilis 168。将冻管保藏的基因工程菌分别按1%的接种量转接到10ml液体LB培养基中,37°C摇床培养过夜。次日按2%的接种量转接至50ml液体LB培养基中37°C摇床培养。发酵完成后,将发酵液4°C 8000r/min离心5min后弃上沉淀,将上清通过亲和层析得到纯酶液;分别对纯酶液进行酶学性质的分析,结果表明来自重组菌株PMA5_gmuGb54/Bacillus subtilis 168的β-甘露聚糖酶其最适pH值有ρΗ6. 5下降到ρΗ5. 5,酶活力升高6.2%。说明对β-甘露聚糖酶耐酸性定点改造成功。本发明的有益效果作为ー种典型的饲料用酶,其需要满足饲料生产以及动物消化系统对酶的性质的特殊要求,但由于动物肠道对pH的要求,为了使甘露聚糖酶更加适合エ业化生产的需要,本发明在理性分析其三维结构的的基础上,对β_甘露聚糖酶进行耐酸性的定点改造,成功构建了ー株产甘露聚糖酶基因工程菌PMA5-gmuGb54/Bacillus subtilisl68,其最适pH值有ρΗ6· 5下降到ρΗ5· 5,酶活力升高6· 2%,并研究了相应的酶学性质的变化,以便为酶的应用提供实验数据。


图1 重叠 PCR 核酸电泳图 M DL 2000marker 叫、a2, t^、b2, c2, c^、d2, e2 为
重叠PCR产物。图2亲和层析Ni-NTA柱纯化得到纯酶SDS-PAGE电泳图。M Protein Marker ;1 gmuGal7 ;2 gmuGb54 ;3 gmuGcl98 ;4 gmuGdl01 ;5 gmuGel26 ;6 :突变前 β-甘露聚糖酶MANA2a图3突变前后β -甘露聚糖酶最适pH值比较。
图4重组菌株发酵产β_甘露聚糖酶的生长曲线及酶活曲线。
具体实施例方式实施例1 : β -甘露聚糖酶基因的定点突变(1)引物的设计,针对甘露聚糖酶MANA2a在理性分析的基础上,通过重叠PCR技术进行定点突变,利用DNAMAN软件设计引物如下。P1 :5’ -GACGGATCCATGTTTAAGAAACATACGAT-3> (BamH I)P2 :5’ -GGCACGCGTTCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGCTCAACGATTGGCGTTA-3’ (Mlu I)MnF3 :5’ -ATGCCATGCTCAGCGAAATTGC-3’MnR4 :5’ ~CAATTTCGCTGAGCATGG~3,MnF5 5,~ACTGGCTTGCGGACCTGCCGAAC~3’MnR6 :5’ ~TTCGGCAGGTCCGCAAGCCAG~3,MnF7 :5’ ~CTGCATGACATGAACGGCGAATG~3,MnR8 :5’ ~CCATTCGCCGTTCATGTCATGC~3,MnF9 :5’ ~CGATTATGCCGCGGGATGG~3,MnRlO :5’ ~CAAGCCATCCCGCGGCATAATCGC~3,MnFll :5’ ~GATCAGTATAAGCAAATACTAG~3,MnR12 :5’ ~GTATTTGCTTATACTGATC~3,(2)以pMA5_manA2a为模板,利用实施例1提供的引物做PCR扩增,扩增条件为94°C,2min,1 个循环;94 °C,30s,56 °C,40s,72 °C,lmin 30s, 25 个循环;72°C,lOmin,1 个循环;15°C,10min,l个循环。扩增体系ddH20 17 μ 1,模板2 μ 1、相应的引物各0. 5 μ 1,dNTP Mix 2 μ 1, extaq-buffer 2. 5 μ 1,ex-Taq 酶 0. 5 μ 1,扩增出含相应的突变位点的PCR 产物 gmuGal76(AAA — GAA) ;2 gmuGb54(CAC — GAC) ;3 gmuGcl98 (GAA — GAC) ;4 gmuGdlOl (AGA — GCG) ;5 gmuGel26 (AAA — GCA);。利用琼脂糖凝胶回收盒对目的基因进行回收,第一次重叠PCR琼脂糖凝胶电泳如图1所示。实施例2 :重组质粒的构建及转化Bacillus subtilis 168构建重组载体PMA5-gmuGal76、PMA5_gmuGb54、PMA5_gmuGcl98、PMA5_gmuGdl01、PMA5-gmuGel26,将上述实施例⑵中得到的β _甘露聚糖酶基因PCR产物分别与质粒pMA5同时用BamH I和Mlu I双酶切,利用凝胶回收盒回收后进行连接,连接体系目的基因酶切产物7. 5 μ 1,。嫩5酶切产物0.5“ 1,T4DNA连接酶buffer 1 μ 1, T4DNA连接酶1μ 1,16 °C 过夜连接。将连接好的重组质粒 PMA5-gmuGal76、PMA5_gmuGb54、PMA5_gmuGcl98、PMA5_gmuGdl01、PMA5-gmuGel26 转化到感受态 Bacillus subtilis 168,转化方法挑取Bacillus subtilis 168接种于5ml LB培养,37°C摇床培养过夜;取lOOul过夜培养 的菌液,接种于用50ml离心管配好的5ml SPI培养基中,37°C摇床培养,当菌株生长到对数末期时,快速取200μ 1接种到2ml SPII培养基中,37 °C 100r/min摇床培养1. 5h加20ull00xEGTA溶液,于37°C 100r/min摇床培养lOmin,用1. 5ml离心管分装成500ul每管,分别向管中加入质粒,轻轻摇匀于37°C 100r/min摇床培养30min,将离心管转移到250r/min摇床培养1. 5h,以4000r/min离心收集菌体,弃部分上清,留100 μ 1重悬菌体,涂布于相应的抗性平板,37°C培养过夜,挑取阳性菌落经验证后获得因工程菌株PMA5-gmuGal76/Bacillus subtilis 168、PMA5-gmuGb54/Baci1lus subtilis 168、PMA5_gmuGcl98/Bacillus subtilis 168、 PMA5-gmuGdlO1/Bacillus subtilis 168、 PMA5_gmuGel26/Bacillus subtilis 168。实施例3 :重组菌株β -甘露聚糖酶的纯化及耐酸性分析将得到的产β -甘露聚糖酶重组菌株PMA5_gmuGal76/Bacillus subtilis168、 PMA5-gmuGb54/Bacillus subtilis 168、 PMA5-gmuGc198/Bacillus subtilis 168、PMA5-gmuGdlO1/Baci1lus subtilis 168> PMA5-gmuGe126/Bacillus subtilis 168 按 2%的接种量分别接到新的50ml LB液体培养基中,取发酵液,4°C 8000r/min离心5min后弃上沉淀,将上清通过Ni-NTA柱得到纯酶液,取得到的纯酶液10ul加相应的上样Marker作为样品进行SDS-PAGE检测,其中SDS-PAGE使用5%的分离胶和15%的浓缩胶,采用不连续垂直电泳,用考马斯亮蓝R250染色(如图2)。并对纯化到的β -甘露聚糖酶进行耐酸性分析,结果基因工程菌PMA5-gmuGb54/Bacillus subtilis 168产β -甘露聚糖酶,其酶活力为226. 23U/mL,相对定点突变前酶活力提高了 6. 2%,且其最适pH由6. 5下降到5. 5 (如图3所示)。实施例4 :重组菌株发酵产β -甘露聚糖酶摇瓶水平上对重组菌株pMA5-gmuGb54/B. subtilis 168产β -甘露聚糖酶的发酵条件进行优化,优化后该菌株的酶活力最高达到1501U/mL,是优化前的6倍以上。在此基础上,进行了 5L发酵罐放大实验的研究,在转速为500r/min,溶氧为lvvm条件下,通过两阶段控温发酵,酶活力最高达到3207. 82U/mL。(如图4所示)
权利要求
1.一种β-甘露聚糖酶耐酸性定点改造,其特征是根据β-甘露聚糖酶三级结构分析,通过重叠PCR技术进行定点突变,经过定点改造将第54位的组氨酸突变为天冬氨酸后的β -甘露聚糖酶基因连接至表达载体ΡΜΑ5上,将连接后的重组质粒转化枯草芽孢杆菌168菌株,成功得到一株重组菌株 pMA5_gmuGb54/Bacillus subtilis 168。
2.对权利要求I中所获得的重组菌种进行发酵,将发酵液离心后上清直接通过Ni-NTA柱纯化,成功的得到了纯的突变型β-甘露聚糖酶,其特征在于对纯化的β-甘露聚糖酶进行了酶学性质的分析,β -甘露聚糖酶最适pH由pH6. 5变为pH5. 5,此酶更适用于在饲料中应用。
3.对上述权利要求I中所述的重组菌株进行β_甘露聚糖酶活力测定,将上述获得的重组菌发酵液离心后,取上清测定β -甘露聚糖酶酶活力,与原始菌株进行比较,其特征是重组菌株PMA5-gmuGb54/Bacillus subtilis 168 β -甘露聚糖酶酶活力提高6. 2%,经5L发酵罐发酵,通过两阶段控温发酵,酶活力最高达到3207. 82U/mL。
全文摘要
本发明公开了一种β-甘露聚糖酶耐酸性定点改造的方法,其特征是针对一种来源于枯草芽孢杆菌B.subtilis 6-7(CTCCM 2009200)的β-甘露聚糖酶在理性设计的基础上,通过重叠PCR技术进行定点突变,经定点改造后的β-甘露聚糖酶基因与表达载体pMA5连接,转化枯草芽孢杆菌168菌株,成功获得一株β-甘露聚糖酶耐酸性得到显著提高的重组菌株pMA5-gmuGb54/B.subtilis 168,其相对酶活力提高了6.2%,摇瓶水平酶活为3226.23U/mL,最适pH由6.5下降到5.5,此突变酶更利用应用在饲料工业中。
文档编号C12N15/75GK102952789SQ20121036055
公开日2013年3月6日 申请日期2012年9月20日 优先权日2012年9月20日
发明者饶志明, 徐美娟, 张显, 刘项羽 申请人:江南大学
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