葡聚糖酶，编码它们的核酸以及制备和使用它们的方法
【专利摘要】本发明涉及具有葡聚糖酶，例如内切葡聚糖酶、甘露聚糖酶、木聚糖酶活性或这些活性的组合的多肽，和编码它们的多核苷酸。在一个方面，葡聚糖酶活性是内切葡聚糖酶活性(例如内-1,4-β-D-葡聚糖4-葡聚糖水解酶活性)，和包括水解纤维素、纤维素衍生物(例如羧甲基纤维素和羟乙基纤维素)、地衣多糖中的1,4-β-D-糖苷键，以及水解混合的β-1,3-葡聚糖，诸如谷物β-D-葡聚糖或木葡聚糖和含有纤维素部分的其他植物中的β-1,4键。此外，本发明也提供了设计新酶的方法，和使用它们的方法。在可选择的方面，新型葡聚糖酶，例如内切葡聚糖酶、甘露聚糖酶或木聚糖酶在增高的pH和温度中具有增加的活性和稳定性。
【专利说明】葡聚糖酶，编码它们的核酸以及制备和使用它们的方法
[0001]本申请是分案申请，原申请的申请日为2004年07月02日、申请号为200480025009.2 (PCT/US2004/021492)、发明名称为“葡聚糖酶，编码它们的核酸以及制备和使用它们的方法”。
[0002]查阅提交在光盘上的序列表
[0003]本申请包括光盘(一式四份提交)，该光盘中含有序列表。序列表的全部内容通过参考并入本文。序列表在光盘上标识如下:
【权利要求】
1.分离或重组的核酸，所述核酸包括与SEQID NO: 175具有至少50%的序列同一性的核酸序列，所述序列同一性在至少约20、30、40、50、60、75或100个残基的区域内，其中所述核酸编码至少一种具有葡聚糖酶活性的多肽，所述序列同一性通过采用序列比对算法的分析或通过目视检查法来测定。
2.如权利要求1所述的分离或重组的核酸,其中所述序列同一性至少约51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63% 或 64%。
3.如权利要求2所述的分离或重组的核酸，其中所述序列同一性至少约65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99% 或更大的序列同一性。
4.如权利要求1所述的分离或重组的核酸，其中所述的序列同一性是在至少大约50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050、1100、1150或更多个残基，或者基因或转录物的全长区域上。
5.如权利要求3所述的分离或重组的核酸，其中所述核酸序列包括SEQID NO: 175中示出的序列。
6.如权利要求1所述的分离或重组的核酸，其中所述核酸序列编码具有SEQIDNO: 176中示出的序列的多肽。
7.分离或重组的核酸，其中所述核酸包括序列，所述序列在严紧性条件下杂交到包括SEQ ID NO: 175的核酸，其 中所述核酸编码具有葡聚糖酶活性的多肽。
8.如权利要求7所述的分离或重组的核酸，其中所述核酸长度为至少约20、30、40、50、60、75、100、150、200、300、400、500、600、700、800、900、1000 个或更多残基，或基因或转录物的全长。
9.如权利要求7所述的分离或重组的核酸，其中所述严紧性条件包括洗涤步骤，所述洗涤步骤包括在0.2XSSC中，在约65°C的温度洗涤约15分钟。
10.核酸探针，用于鉴定编码具有葡聚糖酶活性的多肽的核酸，其中所述探针包括序列的至少10个连续的碱基，所述序列包括SEQ ID NO: 175，其中所述探针通过结合或杂交鉴定核酸。
11.如权利要求10所述的核酸探针、其中所述探针包括寡核苷酸，所述寡核苷酸包括至少约10至50、约20至60、约30至70、约40至80、或约60至100或约50至150个连续喊基。
12.核酸探针，用于鉴定编码具有葡聚糖酶活性的多肽的核酸，其中所述探针包括核酸，所述核酸包括与SEQ ID NO: 175具有至少50%序列同一性的核酸序列的至少约10个连续残基。所述序列同一性通过用序列比对算法分析或通过目视检查法来测定。
13.如权利要求12所述的核酸探针，其中所述探针包括寡核苷酸，所述寡核苷酸包括至少约10至50、约20至60、约30至70、约40至80、约60至100或约50至150个连续碱基。
【文档编号】C12NGK103484485SQ201310370270
【公开日】2014年1月1日 申请日期:2004年7月2日 优先权日:2003年7月2日
【发明者】B·斯蒂尔, W·卡伦, S·希利, D·普利安 申请人:维莱尼姆公司