Myo18a基因在制备先天性小眼球诊断制品中的应用的制作方法
【专利摘要】本发明的目的是提供一种MYO18A基因在制备检测先天性小眼球(CMIC)诊断制品中的应用，本发明提供了MYO18A基因的新的用途，从而提供了一种有效的进行CMIC疾病基因诊断、产前基因筛查及遗传咨询的途径，应用效果表明本发明所提供的基因的SNP位点及检测引物可以有效的用于临床患者及胎儿绒毛或羊水进行MYO18A基因突变位点的快速检测。
【专利说明】MY018A基因在制备先天性小眼球诊断制品中的应用
【技术领域】
[0001]本发明属于基因诊断制品【技术领域】，具体涉及一种肌球蛋白XVIIIA (MY018A)在制备检测先天性小眼球基因诊断制品中的应用。
[0002]发明背景
[0003]先天性小眼球(congenital microphthalmia, CMIC)是一种先天发育异常性眼病，常累及双眼，眼球体积小及伴随的多发畸形常使大多数患者丧失视力，是先天性、遗传性致盲的重要原因之一。据国际出生缺陷中心统计，新生儿的患病率约为14/100000，占到盲童中的3.2%-11.2% ;中国新生儿的患病率约为11.8/100000，与国外相近，该病发病与种族、性别无关。目前尚无有效的治疗措施，手术预后差。
[0004]CMIC的临床特点为:生理性眼轴缩短(常<20mm);患者视力通常较差，伴有高度远视(+7.00-+13.00D);在儿童时期往往会产生弱视，中年后常并发闭角型青光眼，脉络膜渗漏等并发症，预后差。在临床上本病常被分为以下几种类型:(I)单纯性小眼球:仅表现为眼球体积小，不伴有其它畸形者，本型约占该病患者的20% ； (2)并发性或缺损性小眼球:伴有眼部其他畸形如前节发育不全、先天性白内障、脉络膜视网膜缺损、视网膜发育不良、视神经缺损及全身多发畸形等。此类表型复杂，约占到80%; (3)最严重的类型是先天性无眼球，此型极为罕见。
[0005]先天性小眼球的病因病理尚不清楚，目前世界上研究较少。国内外的遗传学研究结果表明该病的发生与染色体，单基因和环境的异常有关。由于在已克隆基因及散发患者中发现存在大量基因突变，由此判断CMIC在很大程度上是由于遗传因素导致的。临床观察发现不足1/4的CMIC具有家`族性，根据其遗传规律可被分为常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X-连锁遗传等类型。迄今为止，科学家们已经定位了 12个单纯性CMIC疾病基因的位点，并克隆出了 9个致病基因(详见表1)。
[0006]表1单纯性小眼球致病基因定位及克隆情况
[0007]
先天性小眼球I染色体定位蛋白产物
~_Y染色体性别决定(SRY)
SOX2 3q26.3-q27^ ^ _
常染色体___2转录因子
显性遗传 PAX6 11p13__成对蛋白盒转录因子
OTX2 14q22orthodenticle
[0008]
【权利要求】
1.一种MY018A基因的应用，其特征在于，所述的应用是MY018A基因在制备用于检测CMIC诊断制品中的应用。
2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述的诊断制品为PCR检测引物。
3.一种用于检测CMIC的引物对，所述的引物对的信息如下:
MYOI8A-1L:ATAAAAGGGTCGGTAGAGGT SEQ ID NO:1
MYOI8A-1R:TCTCTCAGACACAGCGAGAG SEQ ID NO:2
MY018A-2.1L:CCAAACTGCTCAGAATTCTACT SEQ ID NO:3
MY018A-2.1R:CCCTGAGCTAGTGACTAAAAAG SEQ ID NO:4
MY018A-2.2L:TGGGAACTTTTTAGTCACTAGC SEQ ID NO:5
MY018A-2.2R:GGAGTAGCTGTATCATTTGGTT SEQ ID NO:6
MY018A-2.3L:ACAATCATCTGTGAGTTCTGCT SEQ ID NO:7
MY018A-2.3R:AGTGGAGACAATATTGGGTAAG SEQ ID NO:8
MY018A-3L:CTCCTCAGATTTGAGTTGACTG SEQ ID NO:9
MY018A-3R:TAGTAGCTGTGGCTAGGGTCTA SEQ ID NO:10
MYOI8A-4L:CTCCTCAGATTTGAGTTGACTG SEQ ID NO:11
MYOI8A-4R:TAGTAGCTGTGGCTAGGGTCTA SEQ ID NO:12
MY018A-5L:TGGAAATGAAGACACTAAGTCC SEQ ID NO:13
MY018A-5R:AGAAGTTCCCAAGTGGAGTAG SEQ ID NO:14
MY018A-6L:TCTAGGTCATGAAATCATGTGG SEQ ID NO:15
MY018A-6R:TCTTAATGGGATCAGCTAAGAG SEQ ID NO:16
MY018A-7L:CAGCAGTAGAGTTAGGACAACC SEQ ID NO:17
MY018A-7R:GACAAGGGAGAAAACTGAAAGT SEQ ID NO:18
MY018A-8L:GAGTTCAGAGAACCCTTGTGTA SEQ ID NO:19
MY018A-8R:GATCTGGTATC·TGATTGAGCAC SEQ ID NO:20
MY018A-9L:CTGTGGAGATAGATGACCTCAA SEQ ID NO:21
MY018A-9R:GAACTGGTATTTGAATCCACAC SEQ ID NO:22
MYOI8A-1OL:AGGGAACAAGAAGGAGAGTTAT SEQ ID NO:23
MYOI8A-1OR:TATTTGTACCCCTAGGACAGAG SEQ ID NO:24
MY018A-1IL:GATGACTATGCATCTTCTGGAG SEQ ID NO:25
MYOI8A-1IR:AGTCTGACTGTGGTTGTGTTTT SEQ ID NO:26
MY018A-12L:GACAGAGCATCTGTTCACTCC SEQ ID NO:27
MYOI8A-12R:CTAATGTACTCAGGGAATGTGG SEQ ID NO:28
MYOI8A-13L:TACCTCCTTGTATCTTTCCAAC SEQ ID NO:29
MYOI8A-13R:GCTGGTAGTTGTGAGTGTGAG SEQ ID NO:30
MY018A-14L:CAGCTAAAATTCTCAGAACCTC SEQ ID NO:31
MYOI8A-14R:ACTCTGCTCCATGATGATTGT SEQ ID NO:32
MYOI8A-15L:GTCTGACAGCTTAGCACTGTTT SEQ ID NO:33
MYOI8A-15R:GAGGTTCTGAGAATTTTAGCTG SEQ ID NO:34
MYOI8A-16L:ACCTACAGAGAAGGAAGGAAAT SEQ ID NO:35MYOI8A-16R:TACCTTCTCTTGAAGAACCAGA SEQ ID NO:36MYO18A-17L:TCTGAAGAGTAGAACGGATGAC SEQ ID NO:37MYOI8A-17R:ATTTCCTTCCTTCTCTGTAGGT SEQ ID NO:38MY018A-18L:ATGCTAAACCTGGACAACTCT SEQ ID NO:39MYOI8A-18R:TAGAAGATGTTGAACCCTAACC SEQ ID NO:40MYOI8A-19L:GAGAGATGAGGAGAGACCAGAG SEQ ID NO:41MY018A-19R:GCTGTCAAAAAGAAGTCACTGT SEQ ID NO:42MY018A-20L:ACCATATCCACCTTCCTTCTA SEQ ID NO:43MYOI8A-20R:CCTCACTGACTACTAGGAGCTT SEQ ID NO:44MYO18A-21L:ACCATGTCCTACTTGCTCTCT SEQ ID NO:45MYOI8A-2IR:TAGTCATCTCTATGTCCCCAGA SEQ ID NO:46MY018A-22L:CTGACACAGCTCCTTAATCTTC SEQ ID NO:47MYO18A-22R:CTCTCCTTTCATCTCTCTTTGA SEQ ID NO:48MY018A-23L:GATGACAGCTCTCTGGACTAAA SEQ ID NO:49MYO18A-23R:TGTGTCAGTGACTCCTTTTCTT SEQ ID NO:50MY018A-24L:AGTTCCTTCATCTCCTTCTCAG SEQ ID NO:51MYOI8A-24R:TTTAGTCCAGAGAGCTGTCATC SEQ ID NO:52MY018A-25L:CAGACCATGATCACATGCTTAC SEQ ID NO:53MY018A-25R:GCTCATCAAATAGAAGATGTCC SEQ ID NO:54MY018A-26L:ATCATGGTTGTTTCAGCTCTAC SEQ ID NO:55MY018A-26R:TGACAGATGAGCGTAACACAG SEQ ID NO:56MY018A-27L:GGAACTGAAGAAGCTCTAATGA SEQ ID NO:57MY018A-27R:CTGAAAGAAACAGATGAGAAGG SEQ ID NO:58MY018A-28L:AACGACATTAGTCAGGAGAGTG SEQ ID NO:59MY018A-28R:TCATTAGAGCTTCTTCAGTTCC SEQ ID NO:60MY018A-29L:CTCTAGAGACACAACCTTCTGG SEQ ID NO:61MY018A-29R:ACTGTGGAAAGTGAGTTAGTGG SEQ ID NO:62MY018A-30L:GTAGGTGAGTGAGTGAATACGC SEQ ID NO:63MYOI8A-30R:CTAAATGTCACCGCTA`CCTTAC SEQ ID NO:64MYOI8A-3IL:ACAGACTCTGAGCCAATACATC SEQ ID NO:65MYO18A-31R:GCGTATTCACTCACTCACCTAC SEQ ID NO:66MY018A-32L:TCATTATCAGTGTCCCCATAAG SEQ ID NO:67MY018A-32R:TGGCTCAGAGTCTGTAGAGAAG SEQ ID NO:68MY018A-33L:GAGAGAAAGAGAATGGAAAGGT SEQ ID NO:69MY018A-33R:GAAGAGTATGAGGACAAGCAGA SEQ ID NO:70MY018A-34L:TCTCTAGGCACCTGTTTACATC SEQ ID NO:71MYOI8A-34R:ACCTTTCCATTCTCTTTCTCTC SEQ ID NO:72MY018A-35L:CAGAGAGAAAGGAGAAAGCTAA SEQ ID NO:73MYO18A-35R:GCCCATTATCATCTTCTCTACA SEQ ID NO:74
4.一种用于检测CMIC的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒包含有权利要求3所述的引物对中的任一种或几种。
5.一种与CMIC疾病相关的SNP位点，所述的SNP位点为MY018A基因编码区域由起始密码子起第5188位上游第3位，其碱基为C或A。
6.一种与CMIC疾病相关的SNP位点，为MY018A基因编码区域由起始密码子起第5333位，其碱基为A或G。
7.一种与CMIC疾病相关的SNP位点，为MY018A基因编码区域由起始密码子起第4985位，其碱基为A或T。
8.一种与CMIC疾病相关的SNP位点，为MY018A基因编码区域由起始密码子起第2078位，其碱基为A或T。
9.一种与CMIC疾病相关的SNP位点，为MY018A基因编码区域由起始密码子起第2387位，其碱基为C或T。
10.一种检测权利要求5-9任一项所述的SNP位点的方法，其特征在于，是用权利要求3所述的引物对中的对应引物来检测的。
【文档编号】C12Q1/68GK103820548SQ201410062258
【公开日】2014年5月28日 申请日期:2014年2月23日 优先权日:2014年2月23日
【发明者】谢立信, 于常红, 陈鹏, 吴晓明, 肖晶晶, 张清岩, 蒋慧, 王俊 申请人:山东省眼科研究所, 深圳华大基因科技有限公司