一种基于scar标记鉴定坛紫菜品系的方法
【专利摘要】本发明的目的在于提供一种基于SCAR标记鉴定坛紫菜品系的方法，即用SCAR标记鉴定坛紫菜“浙东1号”品系，其中SCAR标记的核苷酸序列为SEQ ID NO:1；从SCAR标记上设计的引物的序列为SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3，PCR扩增片段大小为220bp。本发明采用分子标记技术鉴定坛紫菜“浙东1号”，结果不受环境因素影响，准确可靠；本发明提供的SCAR标记具有操作快速简单、检测结果稳定及成本低廉等优点；本发明提供的SCAR标记法也可应用于坛紫菜其它品系的特异性标记筛查。
【专利说明】-种基于SCAR标记鉴定坛紫菜品系的方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于分子生物学DNA标记检测【技术领域】，涉及一种基于SCAR标记鉴定坛紫 菜品系的方法，即用SCAR标记鉴定坛紫菜"浙东1号"品系的方法。
【背景技术】
[0002] 坛紫菜是我国特有的具有重要经济价值的暖温带大型海洋藻类，主要栽培于浙 江、福建、广东三省，产量约占全国紫菜产量的80%。早些年因使用未进行人工选育的野 生种质而发生紫菜烂苗、抗逆性低、产量下降等现象，造成巨大的经济损失，因此，坛紫菜良 种选育的工作迫在眉睫。特别是浙江海域和福建北部海域，海水浑浊，含有大量的砂质颗 粒，在潮流、风浪作用下，对海区栽培的紫菜造成机械损伤，藻体较薄的紫菜损伤的程度更 大。而藻体厚的紫菜具有一定是抵御泥沙的冲击能力，能够减轻藻体的损伤程度。坛紫菜 多是潮间带插杆的方式栽培，栽培的位置往往在沿海的内湾，海水的透明度差，一般仅仅在 15?50cm。如果藻体过于细长，不易及时漂浮，光合效率下降，造成减产。而经过长期选育 出的"浙东1号"坛紫菜品系的藻体长/宽比值小、叶片厚、皱褶多、基部发达、色素含量高， 生长快，可以适应浙闽海域混水区大规模栽培生产，而且能够提高产量，满足加工要求，提 高经济效益。
[0003] 但不同的坛紫菜品系，尽管在藻体的色泽、形态等方面存有差异，但这些差异易受 海区栽培环境的影响，以往依靠形态学特征的分类法很难准确区分不同品系。导致养殖过 程中品系之间发生混淆。因此，应积极开展种质鉴定来保证坛紫菜栽培的良种化，从而提高 紫菜采收的经济效益。
【发明内容】
[0004] 本发明的目的在于提供一种基于SCAR标记鉴定坛紫菜品系的方法，即用SCAR标 记鉴定坛紫菜"浙东1号"品系，从而弥补现有技术的不足。
[0005] 本发明首先提供一种SCAR标记，其核苷酸序列为SEQIDNO: 1 ;
[0006]上述的SCAR标记用于制备检测坛紫菜品系的分子标记；
[0007]所述的分子标记为探针或引物；
[0008]作为实施例的一种优选，所述的引物的信息如下：
[0009]正向引物
【权利要求】
1. 一种SCAR标记，其特征在于，所述的标记的核苷酸序列为SEQ ID NO: 1。
2. 权利要求1所述的标记在制备检测坛紫菜品系的分子标记中的应用。
3. 如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述的分子标记为探针或引物。
4. 一种引物，其特征在于，所述的引物是从权利要求1所述的SCAR标记上设计的，用于 检测坛紫菜品系。
5. 如权利要求4所述的引物，其正向引物和反向引物的序列分别为SEQ ID NO: 2和SEQ ID N0:3。
6. -种鉴定坛紫菜"浙东1号"品系的方法，其特征在于，所述的方法步骤如下： 1) 总DNA的提取：收集待鉴定坛紫菜叶状体，液氮研磨，使用植物基因组DNA提取试剂 盒提取总DNA ; 2) 使用权利要求5所述的引物对上述获得的总DNA进行PCR扩增； 3) 步骤2)的？〇?反应体系为：25111反应体系中，1^12.5111，(1(111208.5 111，正反向 引物各1 iil，模板DNA2 yl ;PCR扩增条件为：94°C预变性5min，接着设置40个循环：94°C 变性458,6〇1：退火3〇8,721：延伸3〇8，循环结束后721：延伸71^11; 4) 将3)所得PCR产物进行电泳检测，若PCR扩增产物中出现长度220bp的特异性片 段，则所鉴定的坛紫菜为"浙东1号";若未出现220bp的特异性片段，则所鉴定的坛紫菜不 是"浙东1号"。
【文档编号】C12N15/11GK104328115SQ201410623378
【公开日】2015年2月4日 申请日期:2014年11月6日 优先权日:2014年11月6日
【发明者】骆其君, 徐佳丽, 杨锐, 陈海敏, 王亚军, 严小军 申请人:宁波大学