专利名称：一类半菁类染料化合物、其制备方法及应用的制作方法
技术领域：
本发明涉及精细化工领域中一类新的化合物，特别是涉及一类含有两个相似吸电子基的半菁染料类化合物、其制备方法以及作为荧光染料的应用。
背景技术：
荧光染料作为功能性色素在科学技术的各个领域得到广泛应用，尤其作为分子探针在生命科学、临床医疗诊断、免疫分析检测等方面的研究在全世界备受瞩目。随着基因密码的确立，RNA被认为是一个重要的生物分子，与细胞内一些重要过程紧密相连。因此，获得RNA合成，转运及处理过程中的时间-空间形态对我们理解细胞在疾病，健康及外部刺激下的功能及行为至关重要。而对RNA的活细胞成像能提供基因表达完整的时间-空间形态并解释其在细胞过程中所起的作用。目前，市面上可见的RNA成像的商品化染料仅有一种:Invitrogen公司设计的SYTO RNA-Select，其结构未被公开。SYTO RNA-Select是一类绿色染料，发射波长在510nm左右，设计合成一类新的长波长的RNA染料用于染色研究是十分有意义的。化学工作者们在设计合成新的RNA染料这一方面也仅见如下的五例报道:苯乙烯类染料(Q.Li, Y.Kim, J.Namm, A.Kulkarni, G.R.Rosania, Y.-H.Ahn and Y.-T.Chang, Chem.Biol.，2006，13，615-623 ；X.Liu, Y.Sun, Y.Zhang, F.Miao, G.Wang, H.Zhao, X.Yu, H.Liu and ff.-Y.Wong, Org.Biomol.Chem.，2011，9，3615-3618)、菲啶-荧光团共轭化合物(N.Stevens, N.0’ Connor, H.Vishwasrao, D.Samaroo, E.R.Kandel, D.L.Akins, C.M.Drainand N.J.Turro, J.Am.Chem.Soc., 2008, 130, 7182-7183.N.A.0 1 Connor, N.Stevens, D.Samaroo, M.R.Solomon, A.A.Marti, J.Dyer, H.Vishwasrao, D.L.Akins, E.R.Kandel andN.J.Turro, Chem.Commun., 2009, 2640-2642.)以及 David Parker 等报道的铕配合物可用于细胞核仁染色(J.Yu, D.Parker, R.Pal, R.A.Poole and M.J.Cann, J.Am.Chem.Soc.，2006, 128，2294-2299.)。因为 RNA磷酸骨架上的负电荷，大多数已经报道的RNA探针都拥有一个或更多的正电荷，这导致染料很难进入细胞(如需要24小时的孵育)或者根本不能进入细胞核。因此，合成一类新的具有细胞渗透性的RNA染料或染料组合物是十分必要的。
发明内容
本发明的目的是针对现有技术的不足，提供一类合成简单、具备大斯托克斯位移、近红外的新的化合物。本发明所述的半菁类染料化合物，具有如下结构通式1:
权利要求
1.一类半菁类染料化合物，具有如下结构通式1:
2.权利要求1所述的半菁类染料化合物，其特征在于所述的X为O或S。
3.权利要求1所述的半菁类染料化合物，其特征在于所述的R1、R2、R3和R4各自独立地选自Cp6烷基。
4.权利要求3所述的半菁类染料化合物，其特征在于所述的R1、R2、R3和R4各自独立地选自Cp3烷基。
5.权利要求4所述的半菁类染料化合物，其特征在于所述的RpR2、R3和R4为甲基。
6.权利要求1所述的半菁类染料化合物，其特征在于所述的R5和R6各自独立地选自H,C1^18烷基和卤素。
7.权利要求5或6所述的半菁类染料化合物，其特征在于所述的R5和R6是H。
8.权利要求1所述的半菁类染料化合物的制备方法，包括如下步骤: ①POCl3与DMF按摩尔比1:2-4在O 10°C反应l_4h后，加入式III的化合物，于50-100°C下反应8-24h制备式II的化合物，所述式III的化合物与POCl3摩尔比为1:2-5 ;
9.一种活细胞染色剂组合物，包括权利要求1所述的半菁类染料化合物。
10.权利要求9所述 的活细胞染色剂组合物，其特征在于还包括七元瓜环。
全文摘要
本发明公开一类半菁类染料化合物、其制备方法及应用，所述化合物具有如下结构通式I。该化合物具有近红外发射，Stokes位移大，结构简单，易于制备，毒性小，可以用作荧光染料。该化合物还对核酸有响应，而且是一类RNA选择性的荧光探针，可用于细胞中RNA染色。
文档编号C07D277/64GK103113284SQ20131001923
公开日2013年5月22日 申请日期2013年1月18日 优先权日2013年1月18日
发明者彭孝军, 孙世国, 李志勇, 张思 申请人:大连理工大学