与水稻抗白叶枯病基因紧密连锁的分子标记OSblb-SV2的制作方法

文档序号:12743900阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种与水稻抗白叶枯病基因紧密连锁的分子标记,其特征在于:所述分子标记含有Seq ID No.1所示序列;优选的,所述分子标记为Seq ID No.1所示序列。

2.一种扩增与水稻抗白叶枯病基因紧密连锁的分子标记的引物对,其特征在于:扩增的目标序列含有Seq ID No.1,具体为所述引物对的引物1含有Seq ID No.2所示序列,引物2含有Seq ID No.3所示序列;更为具体的,引物1为Seq ID No.2所示序列,引物2为Seq ID No.3所示序列;

Seq ID No.2:5’-GCATCTGCTCCCGTTCATGTA-3’;

Seq ID No.3:5’-CGCATATGGATTGGCAATAAC-3’。

3.一种筛选权利要求1所述的分子标记的方法,其特征在于:1)获得纯合型父本、母本基因组;2)分别通过测序获得父本、母本基因组序列;3)比较父本、母本基因组序列,获得差异位点;4)构建遗传群体并收集表型数据;5)对群体中的个体进行基因型分析;6)结合基因型和表型数据,将抗白叶枯病基因定位在基因组上;7)在靠近目标基因的区段选择候选的分子标记。

4.权利要求3所述分子标记的筛选方法,其特征在于在候选的分子标记的上下游设计引物,进行PCR扩增;优选的,所述引物为权利要求2所述的引物对。

5.权利要求3所述分子标记的筛选方法,其特征在于遗传群体通过单粒传法得到重组自交系RIL株系,并利用权利要求2中的引物进行稳定性验证。

6.权利要求1所述的分子标记的检测方法,包括步骤:根据权利要求1的分子标记的核苷酸序列上下游设计引物,以被检测水稻基因组DNA为模板进行扩增,并判断扩增产物中是否存在该分子标记;优选的,所述引物为权利要求2所述的引物对。

7.一种载体,其特征在于:含有权利要求1所述的分子标记。

8.一种重组细胞,其特征在于:含有权利要求7所述的载体。

9.权利要求1所述的分子标记或权利要求2的分子标记引物对在水稻辅助育种或者水稻抗白叶枯病基因定位或检测中的用途。

10.一种水稻辅助育种方法,其特征在于:所述方法包括检测权利要求1所述的分子标记或用权利要求2的分子标记引物对进行检测的步骤。

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