技术总结
本发明涉及CRISPR-Cas9系统sgRNA作用靶点的筛选方法，包括：(1)利用已公布物种的全基因组序列及基因注释信息，获取基因组中具有5’-Nx-NGG-3’序列的区段(x为19～22之间的整数，N代表A/T/C/G)，作为CRISPR-Cas9系统sgRNA的候选靶点；(2)将基因组打断成22～25bp的片段并筛选以NGG结尾的，且在基因组上无重复的序列；(3)将步骤(1)的候选靶点序列与步骤(2)中筛到的序列进行比对，根据错配信息及评选公式对相应的优选序列进行筛选及排序，获取最优的全基因组sgRNA作用靶点集合。本发明还提供用于实现上述筛选方法的装置。本方法适用于所有已知基因组及其基因注释信息的物种，快速高效获得其全基因组水平的sgRNA序列全集来构建基因敲除突变体文库或基因敲除动物模型。
技术研发人员：赵毅强;高菲;王宇哲;许文杰;胥春龙;吴森;胡晓湘
受保护的技术使用者：中国农业大学
文档号码：201510888755
技术研发日：2015.12.07
技术公布日：2017.06.13