用于组装来自一个或多个生物体的染色体段的方法、设备和计算机程序与流程

文档序号:12167254阅读:来源:国知局
技术总结
本发明涉及从代表文库的DNA片段的一组原始子序列组装代表至少一条染色体段的序列,所述文库包括包含连续核苷酸的链的DNA片段并且包括包含连续核苷酸的至少两条链的组合的DNA片段。在获得代表DNA区域之间的接触频率的第一值之后,所述第一值与代表相应DNA区域之间的距离的第二值相关联,迭代地进行以下步骤:‑基于所述第一和第二值并基于将DNA区域之间的接触概率与相应DNA区域之间的距离相关联的理论模型更新基因组结构,更新的基因组结构代表染色体的真实基因组结构;和‑更新作为更新的基因组结构的函数的所述理论模型的参数。

技术研发人员:R·克祖尔;M·玛波缇;H·D·玛瑞-奈利;A·科纳克
受保护的技术使用者:巴斯德研究所
文档号码:201580034173
技术研发日:2015.06.24
技术公布日:2017.03.01

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