人类基因突变的HGVS名称生成及分析系统的实现方法与流程

文档序号:11407893阅读:来源:国知局

技术特征:

技术总结
本发明公开了一种基因突变的HGVS名称自动生成模块的算法。其要素有三,一是先以“gene(R/M)S z/c”格式描述变异位点,其含义为:基因名称,(变异位点参考序列/变异位点突变序列)变异位点之后一段序列,变异位点是纯合型还是杂合型,三部分以空格隔离,以此描述测序所发现的变异;二是将该格式输入突变分析系统,通过HGVS计算程序调用基因信息数据库、基因遗传方式数据库、HGMD数据库等进行计算;三是获得基因变异的HGVS名称和基于HGVS名称的相关信息。经测试,基于本算法的人类基因突变分析系统可对6000多个人类基因的突变进行分析,满足一般的遗传病、癌症等的基因突变分析的需要。

技术研发人员:杨永臣
受保护的技术使用者:杨永臣
技术研发日:2017.05.01
技术公布日:2017.09.01
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