用于利用羧胺三唑乳清酸盐治疗对先前化学治疗药物和靶向药物具有获得性耐药性的癌 ...的制作方法
【专利说明】用于利用羧胺三唑乳清酸盐治疗对先前化学治疗药物和靶 向药物具有获得性耐药性的癌症的方法和组合物
[0001] 其他申请的夺叉引用
[0002] 本申请是2012年2月21日提交的第13/385, 449号美国专利申请的部分继续申 请，而该申请又为2010年9月3日提交的第12/807, 415号美国专利申请的部分继续申请， 该申请于2013年2月19日作为第8, 377,973号美国专利公开，它们的全部内容通过引用 合并入本文。 发明领域
[0003] 本发明涉及用于患复发性或难治性恶性癌症的曾接受先前治疗的患者的癌症治 疗的新颖方法。更具体地，本发明旨在通过使用羧胺三唑乳清酸盐（CT0)进行治疗来克服 由恶性癌症中致癌基因中的新突变所引起的对传统化学治疗药物和靶向药物的获得性耐 药性。本发明是基于在自愿参与用以研究CT0安全性的I期临床研究的患有晚期或转移性 实体恶性癌症的癌症患者中观测的出乎意料的和非常重要的CT0临床效果。更具体地，本 发明涉及CT0的方法和组合物，以提高无进展生存期和总生存期以及诱导对先前治疗呈难 治疗性的一些恶性癌症中的应答，因此，在这之前，克服与新的突变致癌基因有关的耐药性 被认为是无法医治的。本发明旨在克服可能由基因和致癌基因的突变和扩增所引起的对使 用传统化学治疗药物和靶向药物的先前治疗的获得性耐药性以及提供在癌症治疗晚期的 稀有（rare)治疗。此外，本发明旨在预防可能是由癌症治疗晚期中的基因和致癌基因的突 变和扩增所引起的对使用传统化学治疗药物和靶向药物的先前治疗的获得性耐药性的发 病。目前，在获得性耐药性的状态下对于难治性癌症的治疗没有可选择的余地。
[0004] 发明背景
[0005] 用于治疗不同类型的实体癌症和一些白血病的更有效方案的进展已经取得了相 当大的进步，所述实体癌症例如乳腺癌、结肠癌、头颈癌、恶性神经胶质瘤以及恶性胶质瘤、 肺癌、非小细胞肺癌（NSCLC)、黑色素瘤、乳腺癌、睾丸癌、癌、肉瘤、淋巴瘤、胰腺癌、胃肠道 间质瘤、肾癌、卵巢癌、前列腺癌及其他，所述一些白血病例如慢性粒细胞性白血病（CL)。
[0006] 不幸的是，由于应答速度的持续时间是短暂的，提高对当前化学治疗和靶向治疗 方案的应答速度并没有转化为生存期的显著改善，并且所述疾病的自然史最终保持不变。 考虑到通过多靶向激酶抑制剂的使用在治疗不同癌症中的重要的当前进展，通过编码蛋白 激酶的新基因的扩增和发展的耐药性的发展对于成功的癌症治疗是主要的障碍。大量的努 力已集中于成为有前途的靶向治疗的潜在机制，所述靶向治疗在几个月之后使得初始肿瘤 收缩无效，这样会导致难治性或无法医治的癌症。当前，在大多数癌症患者的治疗过程期间 有时会使用细胞毒性药物。细胞毒性药物可以治疗一些原发癌和转移癌症，并在许多类型 的癌症中有效降低肿瘤体积、治疗症状以及甚至延长寿命。然而，因为这些方案是非选择性 的并且与系统毒性相关，因此生存率没有提尚。
[0007] 由于发现在大多数的癌症如乳腺癌、结肠癌、头颈癌、恶性神经胶质瘤以及恶性胶 质瘤、肺癌、非小细胞肺癌（NSCLC)、黑色素瘤、乳腺癌、睾丸癌、癌、肉瘤、淋巴瘤、胰腺癌、 胃肠道间质瘤、肾癌、卵巢癌、前列腺癌及其他、以及一些如慢性粒细胞性白血病（CML)的 白血病中多分子信号通路是失调的，因此分子靶向治疗表现出作为供替代的治疗策略的前 途。
[0008] 靶向治疗集中于特定于不同癌症的致癌信号通路，例如表皮生长因子受体 (EGFR)、人类表皮生长因子受体2(HER-2)、血管内皮生长因子受体（VEGFR)、胰岛素生长因 子-1-受体（IGF-1R)、MET受体、转录因子核因子kappaP (NF-kP )、KRAS、BRAF或磷脂酰 肌醇-3-激酶（PI3K)/AKT/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mTOR)通路。
[0009] 靶向治疗集中于患癌症的其肿瘤含有特定突变的患者的致癌信号通路中的任一 个，并且包括使用涉及所述突变的表达的酪氨酸激酶的抑制剂进行治疗。因为获得了在其 它致癌基因中获得突变所使用的对特定的或多靶向的酪氨酸激酶抑制剂（TKI)的抗性，所 以通常可以观测到原始肿瘤缩小而不是癌症恶化。因为特定的或多靶向的酪氨酸激酶抑制 剂相对于新发展的突变是无效的，所以这样的基因扩增代表了治疗失败的主要原因。此外， 目前在用和可用的一些TKI可能不能成功抑制发现于癌症中的特定突变，以及因此该突变 不仅将保持未治疗，并且TKI还可能诱导新突变的扩增。
[0010] 由于一种药剂可以抑制多种激酶，所以用于癌症治疗的多靶向激酶抑制剂的利 用是具有吸引力的。多靶向激酶抑制剂的实例包括舒尼替尼（VEGF，血小板源性生长因 子-PDGF)、索拉非尼、达沙替尼、拉帕提尼，等等。然而，当基因扩增和新突变诱导对这些化 合物的获得性耐药性时，这些化合物在若干治疗周期后无效。
[0011] 此外，本发明提供了调节由诱导新的致癌基因和基因扩增的化学治疗药物和靶向 药物所诱导的早期和后期变化的方法，以避免TKI或化学治疗以及因此预防对抗癌活性的 耐药性，从而实现治疗成功。更具体地，由于CT0已经在多数类型的靶标中证明有抑制多 TKI 通路的能力，因而选择 CTO。Bauer 等，2000 ;Alessandro 等，2008 ;Corrado 等，2012。
[0012] 即使当单独给予晚期癌症患者CT0时，重要地并且出乎意料地发现CT0抑制了由 各种先前治疗（包括目前在用的多靶向激酶抑制剂）所诱导的基因的扩增并修复在难治性 癌症中的应答。因此，通过证明CT0在威胁生命的难治性癌症中在稳定与或诱导应答的方 面对于现有治疗有实质性的改善，从而CT0具有治疗严重的恶性癌症的潜力。
[0013] 本发明提供了这样的方法，其用于i)评价在化学治疗药物和/或靶向药物中加入 CT0对特定肿瘤类型的应答能力的效应；ii)鉴别任何新的基因突变和/或诱导对先前有 效治疗药物的耐药性的机制；iii) CT0的给药以治疗难治性癌症，选择对CT0应答的癌症并 且设计CT0加化学治疗药物和/或靶向药物的方案以预防抑制和恢复应答能力；以及iv) 确定在先前细胞毒性药物和/或靶向药物与CTO之间的药效相互作用以达到最大限度的功 效、最小的耐药性以及成功治疗。
[0014] 换言之，正如在CT0的临床研究中在患有不同类型的具有广谱的在各自肿瘤组织 中的基因组突变并且已经得到先前化学治疗和多靶向药物的难治性恶性癌症的患者中出 乎意料所发现的，本发明提供了在多种肿瘤靶标中使用CT0预防或治疗新的致癌基因突变 和已知的可命中目标的致癌基因以抑制多数酪氨酸激酶（TKI)信号通路以及未知的TKI的 方法。由于CT0抑制了当前用现有的多靶标TKI以及其它当使用当前TKI时由于突变或基 因扩增而可能导致的TKI靶向的多TKI通路，CT0的效果是不同于目前在用的多靶标激酶 抑制剂的效果。在通过新的突变和基因扩增对药物具有获得性耐药性的难治性癌症中发现 了 CTO的这种新颖的用途。
[0015] CT0是羧胺三唑（CAI)的乳清酸盐。CAI是受体操纵钙离子通道介导钙内流的抑制 剂，并在包括人成胶质瘤细胞的一些人类癌细胞系中显示出具有抗增殖和抗入侵作用（Ge 等，2000)。通过中断作为第二信使的代谢作用，CAI可以抑制钙-敏感性信号转导通路，包 括花生四烯酸及其代谢产物的释放、一氧化氮的释放、肌醇磷酸盐的产生以及酪氨酸磷酸 化（Ge 等，2000 ;Kohn 等，1992)。CAI 抑制 VEGF 表达和分泌（Bauer 等，2000)。CAI 抑制细 胞蛋白STATS和CrkL的磷酸化，并通过下调bcr-abl诱导耐甲磺酸伊马替尼的慢性骨髓性 白血病细胞的凋亡（Alessandro等，2008)。CT0抑制在外来体激化HUVEC细胞中的Akt和 Erkl/2的磷酸化（Corrado等，2012)，以可以诱导耐药性或干扰抗肿瘤活性的肿瘤和机制 为革巴向。
[0016] 基于对新突变的致癌基因的过度表达和扩增或发展的化学治疗和/或靶向药物 的效应的动力学和范围的理解，CT0治疗的时机和持续时间可以确定为化学治疗和/或靶 向治疗的开始或治疗方案期间的各个阶段。目前指导化学治疗和/或靶向药物的选择的原 则不会考虑它们对于在几个成功的初始有效方