一种香菇香九菌种的ssr标记指纹图谱与应用的制作方法

文档序号:534177阅读:396来源:国知局
专利名称:一种香菇香九菌种的ssr标记指纹图谱与应用的制作方法
技术领域
本发明属于香菇菌种的检测领域,特别涉及一种香菇香九菌种的SSR标记指纹图谱与应用。
背景技术
我国香菇产量已从1983年的I. 95万吨迅速发展到2005年的242万吨,占全球香菇总产量的70%以上,改写了世界食用菌产量的排行榜,并不断缩小与排行第一的双孢蘑菇产量差距,有专家预测,由于中国香菇产业的迅猛发展,在近10年内其将成为世界产量 最高的食用菌。中国香菇以其惊人的发展速度,优质的品质及低廉的成本为世界菇业人士瞩目,中国香菇已风靡世界。优质菌种在香菇单产和质量中的贡献率举足轻重,这决定了香菇菌种在香菇产业中的重要地位。1999年我国签署了《国际植物新品种保护法》,这不仅要求我们尊重其它国家的品种知识产权,同时也要加强保护我们国家自己的品种知识产权,为了建立食用菌新品种登记制度来真正保护我国的品种产权,必须首先建立成熟的品种鉴定技术,为新品种登记奠定基础。尤其日本2004年4月I日开始实行《种苗法修正案》,对我国食用菌尤其是香菇的出口构成了极大的威胁。就国内而言,香菇栽培菌种“同种异名,异种同名”的现象,不仅给菇农带来了极大的损失,影响了他们的栽培积极性,也极大地影响了中国香菇的快速发展;而且,随着大规模的工厂化栽培方式的出现,对香菇栽培菌株质量的要求越来越高,需要发展更为简便、快速、准确的菌株鉴定技术,以保证每批次的用种都准确无误。面对这种局势,就需要我们进一步加快菌种鉴定技术的研究,在香菇的研究中引进更为有效的菌种鉴定体系。

发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种香菇香九菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用,该指纹图谱与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比,具有检测时间短,准确性高,重复性好的优点。本发明的一种香菇香九菌种的SSR标记指纹图谱,该指纹图谱由7对SSR标记组成,是基于香菇基因组简单重复序列片段开发SSR引物,扩增带型好,重复性高的SSR引物,标记详细信息如表I。表I SSR标记详细信息列表
权利要求
1.一种香菇香九菌种的SSR标记指纹图谱,其特征在于该指纹图谱由7对基于香菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成,7对SSR标记在香菇香九菌种上扩增的等位片段信息具体为 Le_fp0001的等位片段的数量为1,等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为600bp ; Le_fp0002的等位片段的数量为1,等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为270bp ; Le_fp0003的等位片段的数量为1,等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为900bp Le_fp0004的等位片段的数量为O ; Le_fp0005的等位片段的数量为1,等位片段6相对于50bp DNA ladder的分子量为530bp ; Le_fp0006的等位片段的数量为1,等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为780bp ; Le_fp0007的等位片段的数量为1,等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为700bp。
2.根据权利要求I所述的一种香菇香九菌种的SSR标记指纹图谱,其特征在于所述7对SSR标记等位片段的特异编号组合为1310621。
3.—种如权利要求I所述的香菇香九菌种的SSR标记指纹图谱的应用,其特征在于应用于鉴定香菇香九菌种的特异等位变异组合以及鉴定香菇香九菌种相对于其他国审香菇品种的特异性。
全文摘要
本发明涉及一种香菇香九菌种的SSR标记指纹图谱与应用,该指纹图谱由7对基于香菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成。应用包括对香菇菌种进行SSR标记扩增,将得到的带型与指纹图谱对照,与该指纹图谱一致即为香菇香九菌种。本发明与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比,具有检测时间短、准确性高、可重复性好的优点,在收集的我国25个国审的香菇主栽菌种中具有香菇香九菌种的专一性。
文档编号C12Q1/68GK102936627SQ201210465639
公开日2013年2月20日 申请日期2012年11月16日 优先权日2012年11月16日
发明者张丹, 巫萍, 谭琦, 尚晓冬, 宋春艳, 章炉军, 鲍大鹏, 杨慧 申请人:上海市农业科学院
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