专利名称：早老性痴呆的检测方法
技术领域：
本发明涉及诊断和预测早老性痴呆(AD)的方法。老年斑和亲刚果红型(congophilic)血管病是畸型细胞外结构，该结构被发现大量存在于患早老性痴呆病人的大脑中。对这些结构的生化组成已有广泛的研究，以更好地认识这种痴呆病发病和机理的可能规律。成熟的老年斑是一种混合结构，包括由淀粉样原纤维组成的中心核，它由营养不良的轴索、轴索末端和树突、小神经胶质的纤维性的星形细胞包围，见D.SelkoeNeuron6.487-498(1991)导致congophilic血管病的血管周围的老年斑的淀粉样蛋白核，是含39到43个氨基酸的肽，即所谓β-淀粉样蛋白(Aβ)肽，见G、GlennerandC.Wong，Biochem.Biophys.Res.Comm.120，885-890(1984)。Aβ肽在早老性痴呆、唐氏综合症、Dutch类遗传性大脑出血和老年大脑中被发现，见K.KosikScience256，780-783(1992).Aβ是由更大的蛋白，即淀粉样蛋白前体(APP)非正常蛋白分解产生的。见K，BeyreutherandC.Masters，BrainPath.1，241-251(1991)。
老年斑和congophilic血管病所含蛋白还包括βA肽。通过使用抗体对前体蛋白的氨基端和羧基端的识别进行组织化学研究已确认了老年斑中的APP本身。见F.Tagliavineetal.，Neurosci.Lett.128，117-120(1991);C.Joachimetal.，Amer.Jour.Path.138，373-384(1991);这些蛋白在细胞外空间聚积与老年斑和congophilic血管病相联系的机理还不清楚。
对早老性痴呆机理大量研究的同时，还需要继续寻找新途径研究和制止这种疾病。
本发明公开了诊断或预测早老性痴呆的方法，本发明的一个实施方案包括检测在实验对象中是否存在或将阿朴脂蛋白E4型(ApoE4)同型物(isoform)编码的DNA.另一个实施方案包括检测是否存在或缺少ApoE4isoform。存在ApoE4isoform或对ApoE4isoform编码的DNA表明实验对象患有早老性痴呆或处于发展为早老性痴呆的危险中。
本发明前述和其它目的以及本发明各方面情况由附图详细解释并在下面进行说明。
附图简要说明
图1顶端的一组调查对象，表示与固定βA肽和潜伏期后的控制肽(“偶氢肽”、或“E.H.”)结合的脑脊髓液中蛋白和;用磷酸盐缓冲的盐溶液洗脱，柱1;用5%十二烷基硫酸钠洗脱，柱2;用4摩尔浓度尿素洗脱，柱3;或用6摩尔浓度胍盐酸盐洗脱，柱4。用免疫组织化学染色对底部一组调查对象的着色表示结合的阿朴脂蛋白E。
图2.顶端的一组调查对象，表示脑脊髓液中蛋白与不同固定肽的结合。对阿朴脂蛋白E的结合。也通过免疫组织化学染色对底部一组调查对象的着色表示。
图3.表示从实验对象与ApoE4等位基因0、1和2开始反应开始的时间。每条曲线都被ApoE4等位基因号标记。“大”号表示在短时间间隔内的多次诊断。开始反应曲线通过Kaplan-Meier产物极限分布进行估算并可清楚地区分(Logrank卡方＝53.8，自由度2，P＜0.0001)。
如上所述，本发明提供一种对实验对象患早老性痴呆进行普查(例如，诊断或预测)的方法。该方法包括检测实验对象是否出现或缺少ApoE4isoform或对ApoE4编码的DNA。如出现这种isoform或DNA则表示实验对象患有早老性痴呆或有发展成早老性痴呆的危险。合适的实验对象包括早期没有被诊断为患早老性痴呆者，早期被确定有发展为早老性痴呆危险者，以及被诊断为患早老性痴呆而想要确诊者。例如，被诊断或确定患有痴呆的病人，特别是早期临床表现正常但确定为患有痴呆发展趋向的病人，都是合适的实验对象。因此，本发明可用于检测家族性早老痴呆(晚期发作和早期发作)以及偶发性早老性痴呆。
检测ApoE4或对ApoE4编码的DNA可通过任何合适的方法直接或间接地实现。各种技术是本领域技术人员公知的。一般都包括从实验对象收集含DNA或ApoE4的生物样品，然后从该样品检测实验对象是否存在ApoE4或存在对该isoform编码的DNA。例如，检测步骤可以通过从实验对象收集ApoE样品(例如，从脑背髓液或任何其它含ApoE的体液或组织)、然后确定在ApoE样品中是否存在或缺少ApoE4isoform(例如，用等电聚积或免疫测定方法)。另外，检测步骤可以通过从实验对象收集含DNA的生物样品、然后确定该生物样品中是否存在或缺少对ApoE4isoform编码的DNA来实现。该实验对象含DNA的任何生物样品都可使用，包括组织样品和血液样品，其中血细胞是十分方便的来源。要确定对ApoE4isoform编码的DNA是否存在，可通过由合适检测基因标记的寡核苷酸探针来进行，或通过如聚合酶链反应或连接酶链反应这样的放大作用来进行(放大作用的产物可以用标记过的寡核苷酸探针检测)。进一步来说，检测步骤可以包括检测实验对象对将ApoE4isoform编码的基因是杂合子的还是纯合子的。已知多种不同寡核苷酸探针检验可以实现本发明。见，例如，美国专利号4，302，204Wahl等;美国专利号4，358，535，Falkow等;美国专利号4，563，419，Ranki等;以及美国专利号4，994，373，Stavrianopoulos等。(申请人特别想把这里所列的所有已公开的美国专利作为参考资料)。
选择的核酸顺序或目标核酸顺序的放大可以通过任何合适的方法实现。见generallyD.Kwohand7.Kwoh，Am.Biotechnol.Lab.8，14-25(1990)。合适的放大技术的例子包括但不限于，聚合酶链反应，连接酶链反应，线置换放大(见generallyG.Walkeretal.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA89，392-396(1992);G.Walkeretal.NucleicAcidsRes.20，1691-1696(1992)，转录碱基放大(见D.Kwohetal.，ProcNatl.AcadSci.USA86，1173-1177(1989)，自持顺序复制(or“3SR”)(见J.Guatellietal.Proc.Natl.Acad.Sci.USA87，1874-1878(1990)，QB复制酶体系(见P.Lizardietal.，BioTechnology6，1197-1202(1988))，核酸序列一碱基放大(or“NASBA”)(见R.Lewis，GeneticEngineeringNews12(9)，1(1992))，修复链反应(or“RCR”)(见R.Lewis，Supra)，boomerangDNA放大(or“BDA”)(见R.Lewis，Supra).聚合酶链反应是当前的优选方法。
通常，如前文一样DNA放大技术包括使用一个探针、一对探针或两对探针，它们专门与对ApoE4编码的DNA相结合，但在相同杂化条件下不与将ApoE2或ApoE3编码的DNA结合，这些探针作为ApoE4DNA放大的一个或多个引物或作为放大作用的一部分(同样，也可以使用专门与对ApoE2编码的DNA结合的一个探针、一对探针或两对探针，但在同样杂化条件下该探针不与对ApoE3或ApoE4编码的DNA结合，这些探针作为放大ApoE2DNA的一个或多个引物或作为放大反应的一部分;也可以使用专门与对ApoE3编码的DNA结合的一个探针、一对探针或两对探针，但在相同杂化条件下不与对ApoE2或ApoE4编码的DNA结合，这些探针作为放大ApoE3DNA的一个或多个引物或作为放大反应的一部分)。
通常，用于检测对ApoE4编码的DNA之寡核苷酸探针是与一对ApoE4编码的DNA结合之寡核苷酸探针，但该探针在相同杂化条件下不与将ApoE2或ApoE3编码的DNA结合。寡核苷酸探针用一个合适的可检测基因标记，如下面给出的相关的抗体。同样，一个用于检测将ApoE2编码的DNA寡核苷酸探针是与对ApoE2编码的DNA结合之寡核苷酸探针，该探针在相同杂化条件下不与对ApoE3或ApoE4编码的DNA结合。而用于检测对ApoE3编码的DNA之寡核苷酸探针是与对ApoE3编码的DNA相结合之寡核苷酸探针，该探针在相同杂化条件下不与对ApoE2或ApoE4编码的DNA结合。
聚合酶链反应(PCR)可依照已知技术完成。见美国专利4，683，195;4，683，202;4，800，159;和4，965，188。通常，PCR包括，首先，对要检测的每个特定顺序链(strand)，在杂化条件下用寡核苷酸引物处理核酸样品(如在热稳定的DNA聚合酶存在下)，以便对每一核酸链互补的扩大产物与数种引物进行合成从而足以与要杂化的每一特定顺序链互补，故当至每一引物合成的扩大产物从其补体中分离后，可以作为合成其它引物扩大产物的样板，如果要检测的一种或数种顺序出现了，在变性条件下处理样品，将引物扩大产物从它们的样板中分离。循环重复这些步骤直到达到想要的放大程度。检测放大的顺序列可以通过向反应产物中加入能够杂合反应产物的寡核苷酸探针实现(例如，本发明的寡核苷酸探针)，该探针载有可检测的标记，然后用已知技术检测该标记。
连接酶链反应(LCR)也可以依照已知技术完成。见，例如，R.Weiss，Science254，1292(1991)。通常，该反应是用两对寡核苷酸探针实现的一对探针与被检测顺序的一个链相结合;另一对探针与被检测顺序的另一链相结合。每对都与它相对映的链完全重叠。该反应的实现，首先，将被检测的顺序链变性(例如，分离)，然后在热稳定连接酶存在下让该链与两对寡核苷酸探针反应，这样每对寡核苷酸探针被连接在一起，然后分离反应产物，并循环重复上述过程直到该顺序列放大到所需程度。按以上描述的关于PCR类似方法完成检测。
很容易理解这里描述的检测步骤可以直接或间接实现。因此，举个例子，如果实验对象的ApoE2或ApoE3也被检测，则可以确定实验对象对ApoE4不是纯合子的;如果实验对象ApoE2和ApoE3两者同时被检测，则可以确定实验对象既不是ApoE4纯合子也不是杂合子。
对于等电聚合和对偶基因检测技术两种中任何一种，确定样品中存在或缺少ApoE4isoform的步骤可以用选择性地与ApoE4结合的抗体经抗体检验完成(也就是，与ApoE4结合的抗体在相同结合条件下基本不与ApoE2或ApoE3结合)。如果想要确定病人精确的ApoE补体，并且要确定病人对ApoE4是纯合子的或杂合子的，则与ApoE2和ApoE3选择性结合的抗体也可以使用(也就是，与ApoE2结合但在相同结合条件下基本不与ApoE3或ApoE4结合的抗体;与ApoE3结合但在相同结合条件下基本不与ApoE2或ApoE4结合的抗体)。
用于选择性地与ApoE2、ApoE3和ApoE4结合的抗体可以用任何合适的技术培养。例如，单细胞系(monoclonal)抗体可以在杂种(hybridoma)细胞链依照Kohler和Milstein的技术培养，Nature265，495-97(1975)。ApoE2、ApoE3或ApoE4可以从被确定为纯合子的病人获得，然后用S.Rall等MethodsinEnzymol.128，273(1986)描述的技术进行纯化，并对单细胞系抗体或多细胞(Polyclonal)抗体培养用作免疫原(immunogen)。纯化的ApoEisoforms可以通过重组法得到以表示生物活性的isoform。甚至一个免疫原片段可以用作免疫原。单细胞系Fab片段可以用通过本领域技术人员熟知的重组技术在大肠杆菌中(EscherichiaColi)从已知顺序生产。见，例如，W.Huse，Science246，1275-81(1989)(recombinantFabtechiques);P.Wenhametal.，Lancet337，1158(1991)(ApoPCRPrimers).对ApoE亚定型编码的DNA可以通过引用一直接致突变而获得并转变成另外种。见，例如，7.KunKeletal.，MethodsinEnzymol.154，367-382(1987);7.KunKel，U.S.PatentNo.4，873，192。
这里所用术语“抗体”是指所有类型的免疫球蛋白，包括免疫球蛋白G(IgG)，免疫球蛋白M(IgM)，免疫球蛋白A(IgA)，免疫球蛋白D(IgD)和免疫球蛋白E(IgE)。抗体可以是单细胞系或多细胞系的，并且可以是任何原始种，包括(例如)小鼠、大鼠、兔、马或人，或可以是嵌合抗体，并包括抗体片段，例如Fab、F(ab′)2和Fv片段，以及IgG以外抗体得到的相应片段。
通常，抗体测定可以是均一测定试验或不均一测定，均一测定中，免疫反应通常包括特定抗体标记分析物(analyte)，以及感兴趣的样品。标记产生的信号直接或间接地由抗体标记分析物(analyte)的结合而改变。免疫反应和范围检测两者在均一溶液中实现。免疫化学标记包括使用自由基、放射性同位素、荧光染料、酶、噬菌体、辅酶等。
不均一测定中，反应物通常是样品，本发明的抗体和为了产生检测信号的方法。可以使用以上描述的类似样品。抗体通常被固定在载体上，如珠、平皿或载玻片，并与在液相含抗原悬浮样品接触。然后将载体和液相分开并用产生可检测信号的方法检查载体相或液相的这种信号。该信号与样品中的分析物的存在有关。产生可检测信号的方法包括使用放射性标记、荧光标记、酶标记、如此等等。例如，如果被检测抗原含第二个结合位置，结合到该位置上的抗体能形成一个可检测基团并在分离步骤前加到了液相反应溶液中。在固体载体上的可检测基团的存在表示试验样品中抗原的存在。合适的免疫测定法例子有放射免疫测定、免疫荧光法、酶一连接免疫测定，如此等等。
本领域技术人员将熟悉大量特定的免疫测定程序以及它们的变化，这对实现这里公开的方法很有用见generallyE.Maggio，Enzyme-Immunoassay，(1980)(CRCPress，Inc.，BocaRaton，FL);见alsoU.S.PatentNo.4，727，022toSkoldetal.titled“MethodsforModulatingLigand-ReceptorInteractionsandtheirApplication，”U.S.PatentNo.4，659，678toForrestetal.，U.S.PatentNo.4，376，110toDavidetal.，U.S.PatentNo.4，275，149toLitmanetal.，U.S.PatentNo.4，233，402toMaggioetal.，以及U.S.PatentNo.4，230，767toBoguslaskietal.
选择性地与ApoE isoform结合的抗体(也就是，在相同结合条件下，与ApoE2、ApoE3或ApoE4中一个结合的基本上不与其它的结合)依照已知的技术如沉淀法结合到适于诊断测定的固体载体上(例如，珠、平皿载玻片或由如胶乳或聚苯乙烯材料形成的凹孔)。与ApoE isoform结合的抗体同样用已知技术与能检测的基团结合，如放射标记(例如，35S，125I，131I)，酶标记(例如，辣根过氧化物酶，碱性磷酸酶)和荧光标记(例如，荧光素)。
实现抗体测定的诊断用具可以用几个途径制备。一种实施方案中，检定用具包括(a)与ApoE2、ApoE3或ApoE4结合的抗体结合到固体载体上，(b)与ApoE2、ApoE3或ApoE4结合的第二种抗体与能检测基团结合。试剂还包括辅助试剂，例如缓冲剂和蛋白质固定剂，例如多糖和类似物。如果需要，诊断用具进一步包括产生信号系统的其它组成要素，该系统中的能检测的基团是一个组成要素(例如酶基质);在试验中减少、背景干扰的试剂;控制剂;实施试验的设备，如些等等。第二种实施方案的试验用具包括(a)如上的抗体，(b)抗体与能检测基团结合的特定结合配偶体。同样还包括上述辅助试剂。试验用具可以以任何合适的方式包装，典型的是每种组成要素单独用容器分装，附一个完成试验的说明书。
本发明由以下非限制性实施例进一步详细说明。
实施例1脑脊髓阿朴脂蛋白E(ApolipoproteinE)与固定的β-淀粉状蛋白前体蛋白片断结合βA肽(Bachem)、其它肽或乙醇胺被用共价键固定到Immobilon Av亲合膜上(微孔)。这种膜是化学活性亲水微孔膜，它通过氨基和硫羟基共价固定肽和蛋白质。βA肽或控制肽以1mg肽/100μl的浓度溶入蒸馏水中。10毫升该溶液(含100毫克肽应用于13mm直径的Immobilon盘，并且在室温下过液培养至干。肽对于膜上的功能结合基团大大过量。通过在2.0摩尔浓度(M)乙醇胺、1.0M NaHCO3、PH9.5条件下培养该膜使Immobilon Av膜上的反应活性基团成块制备控制膜。这些膜保存在-20℃干燥器内。使用这些膜前用磷酸盐缓冲溶液洗涤。12-28水疗模拟肽和偶氢(even-hydr)。肽通过用应用生物科学(Applied Bio-Science)430A型肽合成仪经标准f-Mco合成法合成。氨基酸由阻断基团保护，并在手工卵裂前去掉保护并洗涤。肽的纯度用反相高效液相色谱检验。
CSF蛋白质与固定肽结合ImmobilonAV膜先与βA肽键合，与乙醇胺，或与水模拟(hydromimic)或肽偶氢(even-hydvo)肽结合后与100μl脑脊髓液(先以0.22μ过滤器过滤)、50μl磷酰盐缓冲的盐溶液、PH7.3，在室温培养30分钟。培养后，膜移入微孔过滤漏斗(Swinnex)并用3.0ml磷酸盐缓冲的盐溶水洗涤，然后用700μl5%十二烷基硫酸钠洗涤(SDS)。将膜从过滤漏斗中移出，切成两半并置入150μlLaemmli缓冲液中(2%十二烷基硫酸钠5%β-巯基乙醇，PH6.8)并沸腾5分钟以溶解剩余蛋白质。45μlLaemmli缓冲液和溶解了的蛋白装入Rio-RadMinigel仪的每个十孔道中，并装入含40%聚丙烯酰胺积层凝胶和含12%聚丙烯酰胺的分离凝胶以及2%SDS。
ApoE的免疫测定电泳移动的蛋白质用标准Western转移技术(transfertechniques)转移到ImmobilonP上。当膜转移在Blotto中(在三羟甲基氨基甲烷(Tris)缓冲的盐溶液中有5%干奶，PH7.6，以及0.5%特威恩-20(Pierce)(Tween-20)于室温培养1小时后，膜在兔一抗人体(rabbit-anti-human)阿朴脂蛋白E(apolipoproteinE)抗体与Blotto比为1∶1，000稀释液(由Dr.JoelMorrisett，Dept.ofMedicine，BaylorCollegeofMed.，Houston，Tx.提供)中于40℃过夜培养，然后在Blotto中洗涤五次。该膜于室温暴露于结合在马-萝卜过氧化酶的山羊-抗-兔(goat-anti-rabbit)次级抗体的1∶10，000稀释液1小时，然后在Blotto洗涤7次，然后马-萝卜过氧化酶用EnhancedChemiluminesceDetectionKit(Amersham)显影，并在HyperfilmEcl(Amersham)上感光。
脑脊髓液样品脑脊髓液是经同意对人实验对象临床诊断腰穿刺得到，并保存于-80℃。
结果脑脊髓液含多种蛋白质，经培养和用磷酸盐缓冲的盐溶液洗涤后，它们与固定的βA肽和控制肽结合，见图1、顶部、柱1。图1、底部、柱1表示在滞留蛋白中的是阿朴脂蛋白E。柱2从两种固定肽用5%十二烷基硫酸钠洗脱下来的多种蛋白质;柱3经4摩尔浓度尿素洗脱;柱4经6摩尔浓度胍盐酸盐洗脱。然后，胍盐酸盐不能从βA(1-28)肽上洗脱阿朴脂蛋白E，但能洗脱先与控制肽结合几乎所有阿朴脂蛋白E，如图1柱4底部所示。
图2给出阿朴脂蛋白E与各种固定肽的结合。脑脊髓液中的阿朴脂蛋白E以高亲和力与固定的βA(1-40)、βA(1-28)及βA(12-28)结合，接着培养并用PBS和5%十二烷基硫酸钠洗涤。“12-28偶氢(even-hyolro)肽”与βA(12-28)含同样的氨基酸，但含不同的水疗法外形(hydnopalhic profile)。阿朴脂蛋白E不与如图2底部所示的固定肽结合。与βA(12-28)相比含不同氨基酸的12-28水疗法模拟肽，具有与βA(12-28)非常相似的水疗外形，并也和阿朴脂蛋白E结合。
实施例2早老性痴呆和对照病人的CSF中ApoE免疫测定。
从早老性痴呆病人和对照病人得到的脑脊髓液，含有免疫反应活性的阿朴脂蛋白E。每个对照的CSF中阿朴脂蛋白E与固定的βA(1-28)结合。然而，早老性痴呆病人脑脊髓液样品中的阿朴脂蛋白E，被证明与βA肽结合明显的不同。
实施例3用等电聚积法鉴别在早老性痴呆CSF样中的ApoEIsoforms对上面提到的确定与βA肽结合是否不同可以通过阿朴脂蛋白E的不均匀性本身来解释，CSF蛋白通过等电聚积被分辨，免疫反应活性的阿朴脂蛋白E被目测识别，脑脊髓液(CSF)蛋白经30μlCSF与等体积的氯仿∶甲醇为2∶1(V/V)混合液搅拌进行去脂。然后将去脂CSF用标准技术在垂直板胶仪(BiaradMinigel)中的尿素、Polacrylamide胶与Biaracl两性电解质PH3-10上等电聚积。接下来进行电泳试验，蛋白质被用Western技术转移到Immob∶lonP上并用如上所述方法检测。多种阿朴脂蛋白Eisoforms用等电聚积法检测。
实施例4早老性痴呆病人血细胞中的对ApoE4型isofovm编码的DNA检测。
阿朴脂蛋白E的大众联合调查是由85个患家族早老性痴呆实验对象的血样完成的，其中早老性痴呆的诊断是经尸体解剖证实的。
血样中的基因组的DNA经标准技术萃取并用Techne HI-TEMP96凹板和P.Wenham et al.，Lamcet337，1158(1991)所述的前体在stratagene SCS-96或Techne MW-Z热循环器中通过聚合酶链反应放大。聚合酶链反应始末计录基本上如Wenham et al.supra，and J.Hixson and D.Vernier，J.Lipid Res.31，545(1990)中所述。每个放大反应包含20ng基因组的DNA，1.0微微mol/μl前体，10%二甲亚砜(sigma)、200μmd NTP(pharmacia)、2.0MC(α-32P)dCTP(800Ci/mol在10mM Tricine中，NEN Research Products)0.05单位/μl Taq DNA聚合酶和添加1X培养缓冲液(Boehringer Mannheim)到最终体积为15μl。在94℃5分钟开始变性后，接着在65℃进0.5分钟35循环退火，在70℃扩展1.5分钟，在94℃变性0.5分钟，最后在70℃扩展10分钟。放大后，5单位Hhal(Pharmacia)直接加到每个凹孔中，板在37℃至少培养3小时。每个反应液取3μl置于6%非变性胶(0.4mm厚×43cm长)并在恒定电流(45mA)下电泳1小时。电泳后，上述胶被转移到Whatman 3M色谱纸上，干燥并用Kodak XAR-5胶片放射自显影。
数据在下面表1给出。结果显示其它非普通4型isoform与正常人群相比与早老性痴呆高度相关。普通人群的阿朴脂蛋白E的4型isoform基因频率是16%，而早老性痴呆病人检出的基因频率是51%。
根据显示检测对阿朴脂蛋白E4型isoform编码的DNA有利于预测和诊断家族性早老性痴呆。
实施例5ApoE4迟发性家族早老性痴呆和散发性早老性痴呆的联系。
这些数据进一步涉及到ApoE4等位基因(ApoE-e4)在迟发性家族早老痴呆和散发性早老性痴呆的发病机理。
家族性基因组DNA研究的血样如前所述取至家族。(J.Murrelletal.，第17页9-14行)。所有被单独诊断为可能是早老性痴呆病人.(AP)的样品是由Duke大学Josepha和KathleenBryan早老性痴呆病研究中心(ADRC)记忆错乱诊所、Toronto大学神经变性中心、Masschusetts Geneval医院经神病部和Harvard医学院的经神学家和有关的诊断人员测试的。这些临床诊断是依据NINCDS-ADRDA标准进行的(C.Mckhann et al.，Neurology 34，393-944(1984)。这些Duke家谱主要是迟发性AD家族，35个家族的平均年龄为66.1±10.3。三个家族可以分类为早发性(M＜60年)AD家族。一种家族用App717 Valile突变分离(A.Goate et al.，Nature 349，704-706(1991))、第二种用App717Val-Phe突变分离(I.Murrell et al.，Science 254，97-99(1991)、其它的与染色体14标记连接的最大优势对数值为3.5(G.Schellenberg et al.，Science 258，668-671(1992)和P.St.George-Hyslop et al.，Nature Genet 2，330-334(1992)。Toronto家谱被主要分类为早发性家族(17个家族中的13个)。其中五个家族中每个家族与染色体14连接的优势对数值大于3.0(P.H.St.George-Hyslop et al.，Nature Genet 2，330-334(1992))同时第六家谱有App 17 Val-ile突变(H.Karlinsky et al.，Neurology 42，1445-1453(1992))。家族和基因型数据PEDIGENETM系统处理(C.Haynes et al.，Genet.Epidemiol.3，235-239(1986)).
在Duke.Toronto和Boston中被诊断为可能为AD散发性病例的基因组DNA在过去6年已被储存(banked).散发性AD病人被定义为没有已知家族AD或痴呆史.散发性的和可能性AD病人代表1992年11月所有的在Toronto和Duke贮藏所储存的DNAs，其中排除在BryanADRC记忆错乱诊所于1992年8月进行的预期系列。这些个体的DNA在任何感兴趣的ApoEisotyping已随机收集。不是所有的在这些诊所评价的散发性AD病人都被常规蓄存的。已注意到在很专业的AD诊所对这组诊断为可能性AD的准确度范围可期望在80-90%。脑DNA是从经尸体解剖进一步记实的高加索AD病例得到的，这些高加索病例储存在Duke的Kathleen Bryan脑贮藏所、Toronto大学和Harvard医学院贮藏所。6个黑人或美洲印地安人的尸体解剖被排除为散发性AD尸解系列，因为与对照组的相关分析很敏感。研究中用了两个对照组。第一组是来自Centre d1Etude dlu Polymorphisme Humain(CEPH)参考家族91个不相关祖辈(J.Dausett et al.，Genomics 6，575-577(1990))。这些家族被收集作人体基因绘图(mapping)其特征是具有能作DNA绘图(mapping)的祖辈、父辈、许多孙辈。祖辈代表欧洲和美洲背景的高加索老龄一对照组(aged-Controls)的随机组，类似于迟发性FAD家族和尸解验证的散发性AD人群。二十一对高加索病人配偶参与可能是AD病人前展分析，并且对照组也用配偶。
基因组DNA依照已知技术(M.Pericak-Vance et al.，Neurology 36，1418-1423(1986)and M.Pericak-Vance et al.，Exp Neurol 102，271-279(1988))或GENEPURE 341TM核酸萃取者提供的始末记录(Applied Biosystems)通过转型淋吧母细胞得到高分子量的DNA。由脑组织得到的基因组DNA的分离是通过在液氮中研碎约300mg冷冻的脑组织、加4ml溶胞作用缓冲液(Applied Biosystems)和1mg蛋白酶K(Applied Biosystems)，并且在用GENEPURE 341TM萃取前于37℃温和摇动过夜。
ApoE同型物的放大和限制基因组DNA在Techne MW-2热循环器中用HITEMP 96-凹板(Techne)和由P.Wenhan et al.，Lancet 337，1158-1159(1991)描述的前体经聚合酶链反应(PCR)放大。PCR始末记录是基于Wenham et al.，和J.Hixsonetal.，J.Lipid Res.31，545-548(1990)所描述的内容。每个放大反应包括20ng基因组DNA，1.0微微摩尔/μl前体，10%二甲亚砜(Sigma)，200μM dNTP(Pharmacia).1.0μci(α-32P)dCTP 800Ci/mol in 10mM Tricine，NEN Research Products)，0.05单位/μl Taq DNA聚合酶，并加1X缓冲液(Boehringer Mannheim)至最终体积15μl。最初在94℃变性5分钟，接着在65℃35循环退火0.5分钟，在70℃扩展1.5分钟，于94℃变性0.5分钟，最后在70℃扩展10分钟。放大后，在每凹孔中(Well)直接加入5单位HhaI(Gibco)，该板在37℃至少培养3小时。每个凹孔加入15μl2X型Ⅲ终止染料(J.Sambrook et al.，Cold Spring Harbor Laboratory Press B.24(1989))，每个反应取3μl置于6%非变性聚丙烯酰胺胶体上(0.4mm厚×43cm长)并在恒定电流(45mA)电泳1小时。电泳后，这些胶转移到Whatman 3M色谱纸上，干燥，用Kodak XAR-5胶片放射自显1小时。每个放射自显影由两个不同的观察者单独阅读。
统计分析对照组和AD组的等位基因(allele)频率是通过计算等位基因和计算样本比率评价的。对早发性和迟发性FAD家族的等位基因评价是用从每个家族随机选择一个患者来计算的。两个比率相比较的Z统计被算出(R.ElstonandW.Johnson，EssentialsofBiostastics，(1987)andG.Schellenbergetal.，J.Neurogenet.4，97-108(1987))。Z极值与标准正态分布或然率相比建议舍弃两组等位基因频率相等这样的无效假设。为了在不同人群进行ApoE等位基因频率比较，也就是，AD组相对对照组，以及对照组间比较，进行的比较如下1)CEPH对照组与配偶对照组比较;2)CEPH对照组与文献对照组比较;3)CEPH对照组和迟发性组比较;4)CEPH对照组与早发性组比较;5)CEPH对照组与临床散发性AD组比较;以及6)CEPH对照组与尸解确证散发性AD组比较。对ApoE患病-血缘-成员(APM)连锁分析是依照现有技术进行的(M.Pericak-Vance et al.，Am.J.Hum.Genet.48，1034-1050(1991)and D.Weeks et al.，Am.J.Hum.Genet.42，315-326(1988))。两点优势对数值是用LINKAGETMProgram Package(Version 5.0)(G.Lanthrop et al.，Am.J.Hum.Genet.36，460-465(1984)and G.Lanthrop et al.，Proc.Natl Acad.Sci VSA 81，3443-3446(1984)计算机程序计算的。发病年龄(age-of-onset)和用于计算优势对数值的疾病参数如从前描述的(M.Pericak-Vanceet al.，Supra)。
结果表2表示ApoEe4等位基因频率三个对照比率评价1)CEPH参照家族91个祖辈;2)21对配偶取自连续前展性研究确定的散发性，可能性AD病人;3)文献中类似人群代表性对照系列(G.Lanthropetal.，Proc.Natl.Acad.Sci.USA81，3443-3446(1984))。表2还给出的是ApoEe4等位基因频率对一些不同的早老性痴呆病人组评价1)在Duke和Toronto/Boston迟发性FAD系列中随机选择的一个患病个体;2)在Duke和Toronto/Boston早发性FAD系列中随机选择的一个患病个体;3)在Duke和Toronto/Boston诊所诊断为可能性AD的散发性病人的储存DNA样品;4)来自Duke和Toronto/Boston176个尸解确证散发性AD病人DNA。
与前面实施例1-4一致，在主要为迟发性FAD家族随机选择的病人的ApoEe4等位基因频率与CEPH对照组的频率有显著性差异;0.50±0.06与0.16±0.027比较(等位基因频率评价±标准误差，Z＝2.44，P＝0.014)。同样，这里出现的Duke和Toronto/Boston迟发性FAD系列与CEPH对照组有显著性差异(P＝0.000017)。Toronto/Boston和Duke的早发性FAD系列的ApoE-e4频率(0.19±0.069)与CEPH对照的频率没有显著差异(P＝0.069)。统计分析证明散发性(可能的)AD(P＝0.00031)和尸解确证散发性AD(P＜0.00001)的ApoE-e4等位基因频率与CEPH对照组相比有很高的显著性差异。
1.等位基因频率评价±标准误差;染色数目的计算在圆括号内。
2.Z值是相对CEPH对照组。
3.来自CentreD′EtudeduPolymorphismHumain(CEPH)91个不相关祖辈。
4.在BryanADRCMemoryDisordersClinic，Duke大学的配偶对照组。
5.在H.Menzeletal.，ApolipoproteinEPolymorphismandCoronaryArteryDisease，Arteriosclerosis3，310-315(1983)。
6.“LOAD”的意思是迟发性AD;从32个Duke和4个Toronto/Boston迟发性FAD家族随机选择的一个患者。
7.“EOAD”的意思是早发性AD;从13个Toronto/Boston和3个Duke早发性FAD家族随机选择的一个患者。
8.39个Duke和30个Toronto/Boston散发性(可能的)AD病人。
9.143个Duke和33个Toronto/Boston尸解确证散发性AD实验对象。
实施例6在死后组织中淀粉样蛋白β-肽沉积与阿朴脂蛋白E的联系。
在本实施例中，一系列从已知ApoE基因型患散发性迟发性AD病人的脑组织被测定，确定含ApoE-e4等位基因AD组织是否有淀粉样沉淀的明显图案。已发现病人脑组织对APOE-e4是纯合子的。与ApoEe3纯合子相比较出现血管淀粉样沉积增加和淀粉粉样蛋白数量和密度增加以及神经炎斑(neuritioplaque)增加。免疫细胞化学研究发现，在有一或二个ApoE-e4等位基因的病人中，β-肽显著增加。三个主要ApoE基因型研究(e3/3，e3/4，e4/4)表明在性别、发病年龄或病期方面没有出现统计学上显著性差异。和对ApoE-e3等位基因为纯合子的病例相比，与一或二个ApoE-e4等位基因相关的迟发性Ad病例有明显的神经病理学表型。
病例选择;143例患迟发性早老性痴呆(AD)的尸解确证病例，符合NIT和CERAD标准，(C.Mckhamet.，Neurology34，939-944(1984)和S.Mirraetal.，Neurology41，479-486(1991))和未患病家族成员或其它神经病例是通过Duke大学KathleenBrgan脑贮藏所得到并作ApoE基因型分析。这些病例是在1985到1992年之间储存的。这143病例的平均死亡年龄为77.2±8.9，平均患病年限为8.6±4.2年，并且63%病人是女性。
ApoE基因型通过从每个病例的约300mg冷冻脑组织分离获得基因组DNA。每个病人的ApoE基因型是通过以上所描述的，即与ApoE前体性生聚合酶链反应放大以及用放射自显影测定法的HhaI限制性同型物实现的。被证实的ApoE基因型;47例ApoEe3/3，64例ApoEe3/4，23例ApoEe4/4，3例ApoEe2/3和6例ApoEe2/4。
神经病理学分析;
死亡身龄、病期、性别、脑重量、在脑管血中淀粉样蛋白沉积形成(用刚果红染料)和对神经炎斑密度的描述、神经原纤维缠结(变性的King′s银白染色[B.Lloyd et al.，J.Histotech8，155-156(1985)])数量等信息来自原始神经病理学报告。给出了100个病例的神经炎斑(nauritic plaque)数量和95个病例的神经原纤维缠结数量。每个数量代表一个单独显微镜视野在该区域断面发现的最受影响面积。空斑(Plaque)用10倍目镜计数(视野2.92mm2)，缠结用20倍目镜(视野0.72mm2)计数。空斑计算在100个10倍视野截断面。在ApoE基因型分析前，所有这些数据在病人病历记录中记录1至5年。
对用刚果红染料染色的血管淀粉样蛋白物质的分析。
按年代选择53个病人，预先染过刚果红染料的载玻片将这些病例整理。当17个ApoE基因型e4/4病(总共23个病人)病人;20个ApoE基因型e3/3(总共49个病人)病人;16个ApoE基因型e3/4(总共65个病人)选出后停止选择。53个尸解报告中的40个特别提到血管淀粉样蛋白，在基因型之前完成的盲观察组成一组。出现血管淀粉样蛋白的按三个水平分级;没有明显淀粉样蛋白沉积出现(0级)，微量淀粉样蛋白沉积其中包括一个阳性管(1级)，容易识别的血管淀粉样蛋白(2级)。另外，从53个病例得到的经刚果红染色的前额皮层、在内鼻皮层海马趾玻片经三个观定者用同样的分级标准确定其血管淀粉样蛋白。观察结果独立分析，双盲技术为平均内级别协议(inter-ratenagrement)的8.5%。
免疫细胞化学法海马区石蜡块、前额脑叶和额骨脑叶(Lobe)当从7个ApoEe4/4病例、8个ApoEe3/3病例、和4个ApoEe3/4病例得到的。选择是在没有神经病理学报告知识情况下随机进行。切成6-8微米石蜡片并装在(mounted)作免疫细胞化学试验的载玻片上。切片被脱蜡、用90%甲酸处理3分钟、洗涤，然后用对淀粉蛋白β-肽免疫定位的单细胞系抗体培养(抗体在S.Ikedaetal.，Prog.Clin.Biol.Res.317，313-323(1989)描述，由Drs.GeorgeGlennerandDavidAllsop赠)。切片平行地与相同抗体稀释液反应、用ABC法进行酶检测步骤(Vectorstain，Burlingame，(A).脱水后用盖玻片覆盖Permount.使用半一邻接切片(Semi-adjacentSections)(没用甲酸处理)，用单细胞系抗体(1∶1000稀释)与164kd-神经丝蛋白(SMI-34，Sternberger-MeyerImmunocytoChemicals，Inc)结合确证神经炎斑，在Westernblots(由Dr.JoelMorrisett，BaylorCollcgeofMedicine赠)上用多细胞系抗体(1∶20000稀释液)与人类ApoE结合确认ApoE2.ApoE3和ApoE4isoforms。在这些实施方案中平行的对照组不染色。
对免疫细胞化学物质分析选出每个切片上空斑密度最大的区域，图示分析是通过用规定的0.25mm2正方形划分成160个相等格子的显画器(Camera Lucida)画出空斑外缘完成的。计算任何格子包含的所有或免疫反应活性空斑的任何部分，总体被划分成实际基因型。这些方法的内级别(inter-rate)可靠度是85%，在同一切片上分离的各区域方差为15%。有代表性的区域用Zeiss显微照相机摄相。
统计分析数据被输入Statgraphics软件包，用方差分析描述各变量间的联系。含143个病例的主集、含53个病例的子集或以上用刚果红优择的ApoEe3/3、e3/4、e4/4基因型较小子集或关于死亡年龄、性别比例或脑重量免疫细胞化学分析较小子集等各集合之间不存在显著性差异。为了比较空斑和神经原纤维缠结数目，使用了Kruskal-Wallis一步法(one-Way)分析，因为对于正态分布用观察法不合适。
对ApoEe3或e4是纯合子的散发性AD病人脑组织中β-肽淀粉样蛋白沉淀免疫定位。
散发性迟发AD病人脑组织的β-肽免疫细胞化学研究证明ApoEe3/3病例和ApoEe4/4病例的免疫染色的脑皮层切片始终不同(数据未给出)。ApoEe3/3病例切片的β-肽免疫反应性显现很小直至不存在血管染色和微弱免疫反应的空斑，而ApoEe4/4病例切片的脑表面上丰富的免疫反应血管和强的免疫反应的空斑以及实质细胞中的血管被染得很黑。差别明显到这样一个程度，β-肽免疫染色的ApoEe4/4脑组织切片能在没有显微镜的情况下与ApoEe3/3脑组织切片区分。
对ApoEe3或e4是纯合子的AD病人脑组织之ApoE免疫定位。
用已有报导(J.Diedrichetal.，J.Virol.65，4759-4768(1991);andY.Nambaetal.，BrainRes.541，163-166(1991)之描述观察脑血管神经细胞、神经胶质细胞、老年斑和神经原纤维(neurofibrillary)缠结的ApoE免疫反应性。类似于β-肽免疫反应性，ApoE免疫反应性在甲酸处理后增强。ApoEe3/3病例ApoE免疫反应性与ApoEe4/4相比在定位或强度方面没有大的区别(注意针对ApoE的多细胞系抗血清检测ApoE3和ApoE4两种isoformss)。特别地，ApoEe4/4病例和ApoEe3/3病例中的大多数较大脑血管是ApoE免疫反应活性的。
e3/3，e4/4和e3/4ApoE基因型血管淀粉样蛋白范围-尸解报告回顾性分析53个病例中的40个，在尸解报告中清楚注明了是否存在经刚果红染色的血管淀粉样蛋白。尸解报告中对血管淀粉样蛋白沉积量的回顾性分级，揭示出血管淀粉样蛋白与ApoEe4等位基因数量显著相关(P＜0.0001)。特别是，对于ApoEe3/3病例没有提到血管淀粉样蛋白对e3/4病例有微量血管淀粉样蛋白，对大多数e3/4病例观察到大量血管淀粉样蛋白(见下面表3.A.1)。
刚果红染色物质前瞻性分析前瞻性考察总共53个病例的血管淀粉样蛋白变性范围，进行刚果红染色的海马和前额皮层切片双盲(试验)回顾。该分析证实刚果红阳性的淀粉样蛋白血管病的出现和53个病例中ApoEe4等位基因的剂量有很显著性相关(表3.A.1)。这种淀粉样变性血管不必出现在给定ApoEe4/4纯合子外皮区所有各处，但经常在如海马裂纹这样的深沟处占有优势。
β-肽免疫反应活性的血管分析当来自53个病人这一系列的一个子集的切片被对β-肽具有免疫反应和类似地定出级别，血管淀粉样蛋白的数量和ApoEe4等位基因剂量是同样在统计学上显著相关(表3.C.1)。ApoEe4纯合子中淀粉样血管包括被斑点样聚积的淀粉样蛋白包围的皮层板中柔脑膜(leptomeningeal)血管和大小血管(Plaque-LikeangiopathyofScholze[W.Scholze，Z.GesamteNeurol.Psych.162，694-715(1938)])。
与ApoEe3纯合子相比ApoEe4纯合子的神经炎斑数增加在五个外皮层区的四个中，在银白染色的物质中神经炎斑平均数在ApoEe4纯合子中比在ApoEe3纯合子中大(表1.A.2)。Keuskal-Wallis一步法分析表明平均神经炎斑数在三个区域与ApoE-e4等位基剂量显著相关前额皮、上颊皮、顶骨皮，并且这种相关在海马的CAL子或边界显著。神经炎斑数与发病时间无关。
ApoEe4纯合子与ApoEe3纯合子相比其神经原纤维缠结数稍稍增加在以上出现的所有五个外皮层区中，ApoE-e4纯合子与ApoE-e3纯合子相比，其神经原纤维缠结平均数更大(表3.A.3)。ApoEe4/4病例与ApoEe3/3病例相比，所有五个区神经原纤维缠结平均数增加的或然率为3%(非参数成对样品试验)。每单位面积的平均数差异不显著，并且对于Kruskal-Wallis试验不显著。然而，对于病人所有集合和各ApoE基因型子集的发病时间，每个外皮层区的神经原纤维缠结平均数变化显著(P＜0.01)。考虑到与ApoE-e4相关的发病时间呈上升趋势，ApoE-e4纯合子中神经原纤维缠结平均数的增加是显然的。
散发性AD病例淀粉样蛋白沉淀的免疫细胞化学分析对于散发性AD的ApoE-e4纯合子所示的淀粉样蛋白沉淀比ApoE-e3纯合子的要大大增加，该增加包括血管淀粉蛋白沉淀和老年斑的沉积。为了对其差异定性和定量，一个对ApoE-e4是纯合子的7个病人的集合与一个对ApoE-e3是纯合子的8个病人的集合相比较。四个杂合子(ApoE-e3/4)也被考查，以确定可能的ApoE剂量的影响。脑皮层低倍观察显示，β-肽免疫反应性的ApoEe3纯合子外皮切片与e4纯合子的相比较，被观察的所有β-肽免疫反应性完全不同(数据未给出)。这种差异即使当从给定外皮区得到的β-肽免疫染色切片在显微镜视野搜索使用最大浓度免疫反应空斑时仍能发现。ApoEe4/4病例中的空斑比在ApoEe3/3病例观察到的更多，常在包括血管时更大而且更黑。
空斑的β-肽免疫反应性定量分析得自十五个散发性AD病例的前额皮层切片被进行免疫反应而对β-肽定位，并对每个病例在显微镜视野所包含β-肽免疫反应空斑的最大密度作定量分析(表3.B.2)。ApoEe4/4纯合子被强β-肽免疫反应斑覆盖的平均面积为ApoEe3/3纯合子的7倍，这是很显著的(P＜0.002)。ApoEe3/4病例居中。
几个ApoEe3/3病例中，也出现弱的免疫反应空斑，其数量比ApoEe4/4病例显著地高(P＝0.04)。虽然如此，但ApoEe4/4纯合子被所有β-肽免疫反应的空斑覆盖的平均总面积为ApoEe3/3纯合子型的两倍(表3.B.2)。
神经炎斑范围来自以上病例中的八个前额皮层半邻接(Semi-adjacent)切片被免疫染色，用神经丝蛋白抗体(SMI-34)试验ApoE-e3纯合子与ApoE-e4纯合子之间神经炎斑密度是否不同。SMI-34免疫反应显示出神经炎突和神经原纤维缠结轴索。神经炎斑可以被他们包括的神经炎突鉴定。
虽然被神经炎斑(被SMI-34免疫反应确定)覆盖的数目和总面积比淀粉样斑(被β-肽免疫反应确定)小(数据未给出)，对这八个病例斑检测的两种方法比较，半邻接切片斑面积测量显示出显著相关和线性相关(P＜0.006，r＝0.73)。在ApoE-e4纯合子中被神经炎斑覆盖的面积也明显比ApoE-e3纯合子中大(P＜.02)实施例7ApoE4基因剂量与早老性痴呆危险的关系本实施例确定AD危险增加量和通过参照迟发性AD家族中ApoE4等位基因确定发病早期年龄。危险从20%增加到90%，同时随着ApoE4等位基因数增加平均发病年龄从84岁减少到68岁。这些数据表明ApoE4基因量是迟发性AD的主要危险因素，年龄为80岁时ApoE4的纯合性实际上是引起AD的充分因素。
46个家族中的4个经测试为早发性家族;两个有染色体21APP突变，两个与染色体14连接。这些家族中ApoE4频率没有提高。42个迟发性家族的成员，有已知的ApoE基因型，他们被诊断患AD或在60岁后没有患AD，对该成员作了评价。在参加我们的研究前，得到了每个实验对象的同意，必要的时候也得到他们的法律监护人的同意。所有的研究始末记录得到DukeUniversityMedicalCenterInstitutionalReviemBoard认可。对于患或非患病实验对象的统计描述在表4给出。平均来说，不管患病(P＝0.02)或未患病(P＝0.13)，妇女寿命比男人长。
从表4看到，90%以上的临床诊断的病例被尸解证实。当家族成员经尸解确证诊断为AD，临床检测的预测值接近100%。4个诊断为AD的实验对象和30个在60岁前检测的实验对象被排除分析。迟发性家族不与染色体21或染色体14连接，与预先连接到早发性AD的区域有19%重合。对AD和ApoE估计的最大二点(two-Point)优势对数值在6%重合时为2.61。
ApoE4等位基因数增加的患病个体的比例，对于基因型为2/3或3/3的比例为20%，基因型为2/4或3/4的实验对象为47%，对于4/4基因型实验对象为91%(表5)。这种增加趋势十分显著(希(Chi)平方＝33.1，自由度为1，P＜0.00001)(G.Kochetal.，AnalysisofCategoricalData(lesPressesdeL′UniversitedeMontreal，Motreal，1985)andSASInstitute，Inc.，SAS/STAT用户指南(User′sGuide)，Release6.03Edition(SASInstitute，CaryNC，1988)。女人较男人患病者多(P＝0.04)。这说明女人患AD的危险更大。
如表6所示，对每种增加ApoE4等位基因，AD危险增加因为2.84(95%置信区间(CI)2.03至3.96)(D.R.Coxetal.，AnlysisofSurvivalData(ChapmanandHall，London，1984)andL.Weietal.，JASA84，1065(1989)。因此，4/4基因型实验对象患病可能性为2/3或3/3基团型实验对象患病可能性的8倍以上。如对0，1和2ApoE4等位基因实验对象分别估计时，一致的证据是(没有达到统计显著性)女人比男人处于更高危险中。对于0、1和2ApoE4基因量，女人超过男人危险性分别为1.33(95%CI0.42至4.26)、1.39(95%CI0.76至2.55)和1.30(95%CI0.50至3.38)。
表6中危险评价是通过对从允许男人和女人危险不同的Cox成比例危险模型获得的评价参数取幂得到(SASInstituteInc.，AnalysisofSurvivalData(ChapmanandHall，London，1984)，和SASInstituteInc.，SAS技术报告(TechnicalReport)P-217，SAS/STAT软件(Softwaro)ThePHREGProcedure，Version6(SASInstituteInc.， CaryNC，1991))。‘+’号表示危险与参照值1相比有显著差异。年龄在60到75之间每个实验对象的情况被假定为成比例危险，对于年龄75的几乎所有2ApoE-e4等位基因型人诊断后情况没有给出。对成比例危险模型甚至对相关个体相关危险结果评价，如果不是全有效，也是统计学上一致的。(L.Weietal.，JASA84，1065(1989))。因此，危险评价是大约评价，这将由从一个家族的很大集合只抽取一个而得出该结论。
Mantel-Haenszel相关性统计(SASInstitnte，Inc.，SAS/STATUser′sGuide，Release6.03Edition(SASInstitute，CaryNC，1988)，andD.R.Coxetal.AnalysisofSurvialData(ChapmanandHall，London，1984))，以家族分层，用来评价ApoE4基因增加使危险增加趋势。患病实验对象比例明显随ApoE4基因量而增加(希平方＝33.4，自由度为1，P＜0.00001)。
下面判断发病年龄是否与ApoE4基因量相关。发病分布是由患病实验对象的发病年龄和最后检测未发病的实验对象年龄构成，发病分布对每个基因量是明显的(希平方＝53.84，自由度为2，P＜0.00001)(R.G.MillerJr.，SurvivalAnalysis)(Whiley，NewYork，1981)，和SASInstituteInc.，SASUser′sGuideStatistics，Version5Edition(SASInstitute，CaryNC，1985))(图3)。每个增加的ApoE4等位基因转向更年轻的发病年龄;对于1ApoE4等位基因的实验对象平均的发病年龄为84.3(SE1.3)岁，对于2ApoE4等位基因的实验对象为68.4(1.2)岁。女性的发病年龄要比男性早(P＝0.04)。
同样，存活分布是由已知实验对象死亡的死亡年龄和其它实验对象最后检测时年龄构成，不考虑发病情况。ApoE4基因量与存活相关(P＝0.004);对于0ApoE4等位基因实验对象生存年龄为84.9(SE＝1.3)岁;对于1ApoE4等位基因实验对象生存年龄为78.8(SE0.8)岁、对于2ApoE4等位基因实验对象生存年龄为78.1(SE1.4)岁。1或2ApoE4等位基因的早死亡主要是由于这些实验对象的高频率和AD病早发性造成(P＝0.001)。
不考虑1或2ApoE4等位基因实验对象生存期短这一点，比较各种ApoE4等位基因致使早发病情况，使我们怀疑大多数诊断AD和大多数流行病例是与1或2ApoE4等位基因实验对象相关的。对于2ApoE4等位基因实验对象平均发病年龄和平均存活年龄的差异是9.7年，对于1ApoE4等位基因实验对象为3.1年，对于0ApoE4等位基因实验对象为0.6年。
以前报导中关于AD连锁遗传靠近ApoE部位的标记可能是由于AD和ApoE4等位联系造成的。虽然这些标记没有出现ApoE失去平衡，他们的隔离可以仿效家族中连锁遗传至少隔离一个ApoE4等位基因(D.A.Greenberg，Am.J.Hum.Genet52，135-143(1993))。关于ApoE部位的AD连锁遗传的有力但不明确的数据(2＝2.61，0＝0.06)也支持这种解释。
认识到在我们的血统股的95个患病对象的19和Saunders等所描述的176个尸解确证的散发性AD病例中的64个不含有ApoE4等位基因，这一点是重要的(R.G.MillerJr.，SurvivalAnalysis(Wiley，NewYork，1981))。42个迟发性家族中的12个含有0ApoE4等位基因的患病者。潜在的可以提供资料的大量连锁遗传家族中，这种趋向是最大的并以模拟研究为基础，这一事实强烈地说明关于危险存在的其它基因源。一但ApoE4等位基因的影响包括在频率分析中，其它的基因就会被鉴定。
以上实施例是对本发明的说明，不是对本发明的限制。本发明通过以下权利要求限定，权利要求的等同物也包括其中。
权利要求
1.一种诊断和预测实验对象患早老性痴呆的方法，其中出现阿朴脂蛋白E4型同型物(ApoE4)说明该实验对象患早老性痴呆或和处于发展成早老性痴呆的危险中，所说的方法包括测定所说的实验对象是否存在ApoE4。
2.如权利要求1所述的方法，其中所述的检测定步骤是通过从所述实验对象收集含DNA的生物样品，然后测定在所述的生物样品中是否存在对ApoE4编码的DNA而实现的。
3.如权利要求2所述的方法，其中所述的测定步骤是通过放大对ApoE4编码的DNA来实现的。
4.如权利要求3所述的方法，其中所述的放大步骤是通过聚合酶链反应实现的。
5.如权利要求3所述的方法，其中所述的放大步骤是通过连接酶链的反应实现的。
6.如权利要求1所述的方法，其中所述的测定步骤是通过从所述实验对象收集ApoE样品，然后测定在所述ApoE样品中是否存在ApoE4同型物来实现。
7.如权利要求6所述的方法，其中所述的测定步骤是通过等电聚积实现的。
8.如权利要求6所述的方法，其中所述的测定步骤是通过免疫测定实现的。
9.如权利要求6所述的方法，其中所述的测定步骤是通过用选择性地与ApoE4同型物结合的抗体进行免疫测定实现的。
10.如权利要求1所述的方法，其中所述的实验对象已在先被确定有发展为早老性痴呆的危险。
11.如权利要求1所述的方法，其中所述的测定步骤包括测定所述实验对象是否为对ApoE4编码的基因之纯合子。
12.一种预测实验对象患早老性痴呆的方法，其实验对象在先没有被诊断为患早老性痴呆，其中阿朴脂蛋白E4型(ApoE4)的存在表明所述的实验对象处于发展为早老性痴呆危险中，所述的方法包括测定所述的实验对象是否存在ApoE4。
13.如权利要求12所述的方法，其中所述的测定步骤通过从所述实验对象收集含DNA生物样品，然后确定在所述的生物样品中是否存在对ApoE4编码的DNA来实现。
14.如权利要求13所述的方法，其中所述测定步骤通过放大对ApoE4编码的DNA来实现。
15.如权利要求14所述的方法，其中所述的放大步骤通过聚合酶链反应实现。
16.如权利要求14所述的方法，其中所述的放大步骤通过连结酶链反应实现。
17.如权利要求13所述的方法，其中的生物样品包括血样。
18.如权利要求12所述的方法，其中所述的测定步骤通过从所述实验对象收集ApoE样品，然后测定所述的ApoE样品中是否存在ApoE4同型物。
19.如权利要求18所述的方法，其中所述测定步骤通过等电聚积实现。
20.如权利要求18所述的方法，其中所述测定步骤经免疫测定实现。
21.如权利要求18的方法，其中所述测定步骤通过用选择性地与ApoE4同型物结合的抗体进行免疫测定来实现。
22.如权利要求18所述的方法，其中所述ApoE样品包括血样。
23.如权利要求12所述的方法，其中所述实验对象已在先被确定有发展为早老性痴呆的危险。
24.如权利要求12所述的方法，其中所述的测定步骤包括测定所述实验对象是否对ApoE4型编码的基因之纯合子。
25.一种检查患痴呆的实验对象是患早老性痴呆的方法，其中存在阿朴脂蛋白E4型(ApoE4)同型物表明所述的实验对象患有早老性痴呆，所述方法包括测定所述实验对象的ApoE4存在。
26.如权利要求25所述的方法，其中所述测定步骤是通过从所述对象收集含DNA生物样品，然后测定在所述生物样品中是否存在对ApoE4编码的DNA。
27.如权利要求26所述的方法，其中所述测定步骤通过放大对ApoE4编码的DNA来实现。
28.如权利要求26所述的方法，其中所述放大步骤是通过聚合酶链反应实现。
29.如权利要求26所述的方法，其中所述放大步骤是通过连结酶链反应实现。
30.如权利要求25所述的方法，其中所述的测定步骤是通过从所述实验通过收集ApoE样品，然后测定在所述ApoE样品中是否存在ApoE同型物。
31.如权利要求30所述的方法，其中所述的测定步骤通过等电聚积实现。
32.如权利要求30所述的方法，其中所述的测定步骤通过免疫测定实现。
33.如权利要求30所述的方法，其中所述的测定步骤通过选择性地与ApoE4同型物结合的抗体的免疫测定来实现。
34.如权利要求25所述的方法，其中所述的实验对象是没有预先诊断为患早老性痴呆者。
35.如权利要求25所述的方法，其中所述测定步骤包括测定是否所述实验对象为对ApoE4型同型物编码的基因之纯合子。
36.一种阿朴脂蛋白E同型物专一抗体，该抗体选自如下一组中(ⅰ)选择性地与阿朴脂蛋白E2型(ApoE2)同型物结合的抗体;(ⅱ)选择性地与阿朴脂蛋白3型(ApoE3)同型物结合的抗体;(ⅲ)选择性地与阿朴脂蛋白4型(ApoE4)同型物结合的抗体。
37.如权利要求36所述的抗体，其中所述抗体是单细胞系抗体。
38.如权利要求36所述的抗体，其中所述抗体选择性地与ApoE4同型物结合。
39.如权利要求36所述的抗体，与固体载体结合。
40.如权利要求36所述的抗体与可检测基团结合。
全文摘要
本发明公开了对早老性痴呆实验对象的诊断和预测方法。该方法包括测定实验对象是否存在阿朴脂蛋白E4型(APOE4)同型物或对APOE4编码的DNA。APOE4的存在表明实验对象患有早老性痴呆或处于发展为早老性痴呆的危险中。
文档编号C07K16/00GK1092525SQ9311484
公开日1994年9月21日 申请日期1993年10月13日 优先权日1992年10月13日
发明者A·D·罗斯, W·J·斯特里特马特, G·S·塞尔温森, J·恩格黑尔德, D·E·施梅凯尔 申请人:杜克大学