超稳定免疫球蛋白可变结构域的筛选和改造方法及其应用_4

文档序号:8448761阅读:来源:国知局
白是TEM-I β -内酰胺酶,并 且所述Tat信号序列是TorA。
8. -种载体,包含权利要求1至7中任一项的基因构建体。
9. 根据权利要求8的载体,其中所述载体是选自pET22b、pAE34、pET9a和ΛρΜΚ的组 中的任一种载体,并且所述基因构建体被插入到所选定的载体中。
10. 根据权利要求8的载体,其中所述载体是ρΕΤ-ΤΑΡΕ。
11. 一种转化有权利要求8的载体的宿主细胞。
12. 根据权利要求11的载体,其中所述宿主细胞是大肠杆菌。
13. -种宿主细胞群,包含一种或多种转化有权利要求1至7中任一项的基因构建体的 宿主细胞。
14. 根据权利要求13的宿主细胞群,其中在宿主细胞群中包括的宿主细胞转化有分别 编码各包括不同的靶蛋白的融合蛋白的基因构建体。
15. 根据权利要求13的宿主细胞群,其中所述宿主细胞是革兰氏阴性细菌菌株。
16. -种筛选可溶性靶蛋白的方法,该方法包括: (1) 在含有抗生素的液体培养基中培养权利要求13的宿主细胞群; (2) 收集存活的宿主细胞以收集质粒DNA ; (3) 从收集的质粒DNA中收集编码靶蛋白的核酸序列;和 (4) 从收集的核酸序列中确认并筛选靶蛋白的序列。
17. 根据权利要求16的方法,还包括,在步骤⑶后,选自下组的一个阶段: (3')制备基因构建体,其中所收集的核酸序列被再次功能性地连接到编码Tat-信号 序列的基因和抗生素抗性基因,然后再用制备的基因构建体转化该宿主细胞群, 和, (3")直接用含有所收集的核酸序列的质粒转化宿主细胞群,而不制备单独的基因构建 体, 其中,阶段(1)至(3')或阶段(1)至(3")被重复两轮或更多轮。
18. 根据权利要求16或17的方法,其中所述抗生素是氨苄青霉素或羧苄青霉素。
19. 根据权利要求17的方法,其中所述抗生素是在重复所述轮时以逐渐增加的浓度加 入。
20. 根据权利要求16所述的方法,其中所述抗生素在初始轮时具有0. 05至0. 2 μ g/ml 的浓度。
21. -种可溶性VH结构域抗体支架,具有下面的FRl至FR4的氨基酸序列: (1) FRl =X0VqlxiX2X3GX4X 5X6X7X8PGX9SX 10X11X12X13CX14X 15X16GX17X18X19 在FRl的氨基酸序列中, X。 是E或Q, X2是E,或Q, 父3是S,或A, 父4是6,或A, 父5是6,厘,1 V,或E, V,或 W, 父7是¥,K,A,或I, 父8是0, K,或H, 父9是6,1',六,1?4,5,或1', XI。 是 L,V,R,或 M, X1^R,或 K, 父12是1,I,或V, 父13是S,A,或T, 父14是六4,¥,1?,I,K,T,或 S, 父15是六,6,卩,V,或Τ, 父16是34,或¥, 父17是?,丫,1?,6,或1^ X1;^T,A,S,N,T,P,Ι,Ν,Η,或 Α, 父19是?,1^,¥,或(:; (2) FR2 =WX20RX21X22PGX23GX 24X25X26X27X28 在FR2的氨基酸序列中, 父2(1是V,Α,或L, 父21是 Q,N,R,I,Κ,Υ,V,M,S,Q,W,F,L,V,或 C, 父22是六,6,1(,S,V,M,或 Τ, 父23是1(,〇4,1?,或1', &4是 L,N,I,P,Y,T,V,W,A,R,M,或 S, X2^V,或 E, 父26是1,I,V,P,F,H,M,Y,L,C,或 R, 父27是 V,M,I,或 L, 父28是3^,或6; (3) FR3 :X29X3〇X3iX32X33X34X35X36X37X38X3A〇X4lX42X43X4A5X46X47X48X49X5〇X5lDX52X53X54YX55CX56X57 在FR3的氨基酸序列中, 父29是1?,11,〇,或1', X3。是 F,V,L,或 I, X3#T,S,或 I, 父32是 I,L,V,M,或 R, 父33是S,T,或D, 父34是1?4,¥,1或1, 父35是〇,1或八, X3f^N,T,D,I,R,K,Y,或 E, 父37是六,S,V,或T, X39是 ^!',!(。^,或乂, 父41是1,V,A,或 Μ, X42是F,Y,N,D,H,或S, 父43是L,或M, 父44是93,札或1 父45是11^,¥,I,或 W, X46是 N,T,K,D,Y,I,或 S, 父47是S或N, 父48是L或V, X4i^R,K,或 T, 父5。是0,六,5,?,1',¥,1,或5, X51是E,A,D,或S, ^是!^,或S, 父53是S,A,或G, 父54是 V,I,L,或 M, 父55是Y或F, X5f^A,G,V,或 S, 父57是1?,3,1(,1',1^,1 或 F;和 (4)FR4 :X58GX59GX60X61VTVSS 在FR4的氨基酸序列中, 父58是1(:,¥,6,5,或八, 父59是0,1?,或L, X6tl是 A,T,I,或 V, 父61是1^,1^,V,或 T。
22.根据权利要求21的VH结构域抗体支架,其中所述FRl至FR4具有下面的氨基酸序 列: (I) FRl AciVqlxiX2Sggx5X6X 7X8Pgx9SXiciRX12SCX 14X15SGX17X18X19 在FRl的氨基酸序列中, X。是E或Q, 父2是E或Q, X5是G,N,V,或E, 父6是L或V, 心是V或K, 父8是Q,K或H, 父9是6,1',六,1?4,或1', 父1(1是L或V, 父12是L或V, 父14是六4, V,I,K,或S, 父15是六,6,或V, 父17是?,丫,1?,6,或1^ X1;^T,A,S,N,T,P,Ι,Ν,Η,或 Α,和 父19是?,1^,¥,或(:; (2) FR2 :ffVRX21X22PGX23GX24X 25X26X27X28 在FR2的氨基酸序列中, 父21是 Q,N,R,I,Κ,Υ,V,M,S,Q,W,F,L,V,或 C, \2是六,6,1(,S,或 Μ, 父23是1(,〇4,1?,或1', &4是 L,Ν,I,Ρ,Υ,Τ,V,W,A,R,Μ,或 S, 乂25是V或Ε, 父26是1,I,V,P,F,H,M,Y,L,C,或 R, 父27是V,M,I,或L,和 父28是3^,或6; ⑶ FR3 :rx30tx32sx34dx36x37x 38x39x40x41x42x 43x44x45x46x47x 48x49x50x51dtax54yx 55cx56x57 在FR3的氨基酸序列中, X3。是 F,V,L,或 I, 父32是 I,L,V,或 M, 父34是1?4, V,或 I, X3f^N,T,D,I,R,K,Y,或 E, 父37是六,S,V,或T, X39是 ^!',!(。^,或乂, 父41是1,V,A,或 M, X42是F,Y,N,D,H,或S, 父43是L或M, 父44是93,札或1 父45是11^,¥,I,或 W, X46是 N,T,K,D,Y,I,或 S, 父47是S或N, 父48是L或V, X4i^R,K,或 T, 父5。是0,六,5,?,1',¥,1,或5, X51是E,A,D,或S, 父54是 V,I,L,或 M, 父55是Y或F, X5f^A,G,V,或 S,和 父57是1?,3,1(,1',1^,1或 F 和 (4) FR4 :X58GQGX60X61VTVSS 在FR4的氨基酸序列中, 父58是1(:,¥,6,5,或八, X6tl是 A,T,I,或 V,和 父61是1^^,V,或 T。
23.根据权利要求21的VH结构域抗体支架,其中所述VH结构域抗体支架是选自具有 下面的FRl至FR4的氨基酸序列的支架。



24.根据权利要求21的VH结构域抗体支架,其中所述VH结构域抗体支架是选自具有 下面的FRl至FR4的氨基酸序列的支架。


选自CDRHl的位置30和31,CDRH2的位置53和CDRH3的位置97、99、100和IOOa中的一个 或多个位置诱导的。
33. 根据权利要求28的VH结构域抗体文库,其中所述文库是天然的、合成的或免疫文
34. -种使用根据权利要求28的文库,筛选对所需抗原具有结合能力的VH结构域抗体 的方法。
35. 根据权利要求33的方法,其中所述筛选VH结构域抗体是通过除了被结合到其上的 VH结构域以外,洗脱未结合到固定的所需抗原的VH结构域抗体来执行的。
36. 根据权利要求34的方法,其中所述洗脱未结合到固定的所需抗原的VH结构域抗体 被重复两次或更多次。
【专利摘要】本发明涉及被称作Tat相关蛋白质改造工程(TAPE)的方法,通过将靶蛋白和抗生素抗性蛋白连接到Tat信号序列并在大肠杆菌内表达它,筛选具有更高的溶解性和优异的热稳定性的靶蛋白,特别是源自人生殖细胞的免疫球蛋白可变结构域(VH或VL),以及由TAPE法筛选的、具有溶解性和优异的热稳定性的、人或改造的VH和VL结构域抗体和人或改造的VH和VL结构域抗体支架。还提供了在由TAPE法筛选的人或改造的VH或VL结构域抗体支架中包括随机CDR序列的文库,以及其制备方法。海通了使用该文库筛选的具有靶蛋白质结合能力的VH或VL结构域抗体,包括该结构域抗体的药物组合物。
【IPC分类】C07K16-28, C07K19-00, C12N15-63, C12N15-62, C12N15-13, G01N33-53
【公开号】CN104769113
【申请号】CN201280076586
【发明人】李滢权, 金圣根, 朴荣燮, 南效廷, 金董植, 朴在燦, 尹桦
【申请人】财团法人牧岩生命工学研究所
【公开日】2015年7月8日
【申请日】2012年8月22日
【公告号】EP2888367A1, WO2014030780A1
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