一种过表达猪共刺激受体4-1bb载体及其应用_2

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B同源重组进行基因功能研究及动物疾病模型建立奠定了基础。
【附图说明】
[0037] 图1为本发明实施例2中CRISPR/Cas9打靶载体构建过程。
[0038] 图2为本发明实施例3中4-1BB转基因猪胎儿成纤维细胞筛选。
[0039] 图3为本发明实施例3中阳性细胞单克隆PCR鉴定引物设计策略。
[0040] 图4为本发明实施例3中阳性细胞单克隆短臂PCR鉴定结果,图中M为DNA MARKER:D2000plusDNALadder,N为阴性对照,P为阳性细胞单克隆短臂PCR鉴定结果。
[0041] 图5为本发明实施例3中阳性细胞单克隆长臂PCR鉴定结果,图中M为DNA MARKER:D2000plusDNALadder,N为阴性对照,P为阳性细胞单克隆长臂PCR鉴定结果。
【具体实施方式】
[0042] 以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。在不背离本发明精神 和实质的情况下,对本发明方法、步骤或条件所作的修改或替换,均属于本发明的范围。
[0043] 若未特别指明,实施例中所用的化学试剂均为常规市售试剂,实施例中所用的技 术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。
[0044] 实施例I4-1BB同源重组载体的构建
[0045] 构建4-1BB同源重组载体的步骤,包括以目标生物基因组为模板,PCR扩增左右同 源臂,4-1BB调控序列,胚胎期特异性调控元件0CT4。将同源左臂、4-1BB表达框、含LoxP位 点的Cre、Neo表达框、同源右臂、负筛选DTA依次连接,形成4-1BB同源重组载体p4B0CNDR。 具体构建过程如下:
[0046] 取生产性能测定优良的约克夏猪耳组织,采用组织块接种法建立猪成纤维细胞 系,命名为YKXOOl,常规细胞传代以及冷冻保存。细胞培养、传代和冻存方法详见《精编细 胞生物学实验指南》(J.S.博尼费斯农等著,章静波等译,2007年,科学出版社)。
[0047]同源左臂(5'arm)扩增:利用已公布的猪基因组序列(GenBank:NW_003612282), 设计同源左臂扩增引物,5-F:5' -TATCATATGTCGTTTGTTACGCTGGAAGGGGAAG-3'(SEQID NO. 7),下划线部分为NdeI限制性内切酶;5-R:5'-TATTACGTACTACGATATCGCTTAGGTGTTGCCT GGACTCATTTCC-3'(SEQIDNO. 8),下划线部分依次为SnaBI和EcoRV限制性内切酶。提取 上述成纤维细胞系YKXOOl基因组DNA,以其为模板,扩增同源左臂。PCR产物为rosa26基 因内含子1中一段长度为1197bp的序列,作为同源左臂(具体序列见SEQIDNO. 1)。
[0048] 同源右臂(3'arm)扩增:按照上述方法设计引物,3-F:5'-TATGGCGCGCCACTGCGAT TGGACCTGAGG-3'(SEQIDNO. 9),下划线部分为AscI限制性内切酶;3-R:5'-TATGCGGCCGCA TGGTTAATTAAGGGACAGTACTGATAGTCAGCCTCTTGC-3'(SEQIDNO. 10),下划线部分依次为NotI 和PacI内切酶。PCR产物为rosa26基因内含子1中一段长度为6395bp的序列,作为同源 右臂(具体序列见SEQIDNO. 2)。
[0049] 4-1BB表汰框扩增:4-F:5' -TATGATATCCGGACGATCTGTCTACAACCCACAC-3'(SEQID NO. 11),下划线部分为EcoRV限制性内切酶;4-R:5'-TATGGCGCGCCAATTTAGGTACCGTTAGGTGC TCCACGAMAACTGC-3'(SEQIDNO. 12),下划线部分依次为AscI和KpnI限制性内切酶(4-1BB 表达框具体序列见SEQIDNO. 3)。
[0050] 0CT4启动子扩增:利用已公布的猪0CT4调控序列,设计引物并添加上LoxP序列, O-F:5 '-TATGGTACCGCGCATAACTTCGTATAATGTATGCTATACGAAGTTATGGTGGTTCAGCGGTAATGAACC-3'(SEQIDNO. 13),下划线部分为KpnI限制性内切酶,粗体部分为LoxP序列;O-R:5'-TAT GCGGCCGCAAATTTGGCGCGCCAAATTTCATATGAGAAGGCGAAGTCGGAAGCCAGGTG-3'(SEQIDNO. 14), 下划线部分依次为Notl,AscI和NdeI限制性内切酶。PCR产物为3475bp序列。
[0051] Cre扩增(含 3' 调控元件):C-F:5' -TATCATATGATGCCCAAGAAGAAGAGGAAGG-3'(S EQIDNO. 15),下划线部分为NdeI内切酶;C-R:5'-TATGGCGCGCCAATTGAATTCCTAATCGCCATC TTCCAGCAGGC-3'(SEQIDNO. 16),下划线部分为AscI和EcoRI内切酶。
[0052]Neo表达框扩增:N-F:5' -TATGAATTCGCGACTCTAGATCATAATCAGC-3'(SEQID NO. 17),下划线部分为EcoRI内切酶;N-R:5'-TATGGCGCGCCGATAACTTCGTATAGCATACATTATAC GAAGTTATCAACACCGTGCGITTTAITCTGTC-3'(SEQIDNO. 18),下划线部分为AscI内切酶,粗体 是LoxP位点。
[0053]DTA表达框扩增:D-F:5' -TGTTAATTAAAATTCTACCGGGTAGGGGAGGCGCTTTTC-3'(SEQ IDNO. 19),下划线部分是PacI内切酶;D-R:5'-TATGCGGCCGCGGTACCGCCTCAGAAGCCATAGAGC-3'(SEQIDNO. 20),下划线部分是NotI内切酶。
[0054] 以pd2EYFP-Nl为载体骨架,第一步利用NdeI和KpnI插入同源左臂5'arm,同时 引入EcoRv酶切位点;第二步利用EcoRV和KpnI插入4-1BB表达框;第三步先利用EcoRI 和NotI将Neo表达框与Cre基因连接起来,再利用NdeI和NotI将其连在0CT4启动子下 游,组成LoxP-〇CT4-Cre_3'utr-SV40_Ne〇-3'utr-LoxP,利用KpnI和NotI将上述双框连 到含4-1BB的骨架载体上,同时引入AscI酶切位点;第四步利用AscI和PacI插入同源右 臂3'arm;第五步利用PacI和NotI插入DTA表达框,构建成p4B0CNDR同源重组载体。测 序验证其正确后,扩大培养,去内毒素大提。
[0055] 实施例2 CRISPR/Cas9打靶载体的构建
[0056]根据CRISPR革巴序列设计网站(http://crispr.genome-engineering,org/)对猪 rosa26位点第一内含子的打革EU立点进行预测分析。从候选革G位点中选出一个评分最高的序 列,命名为targetl。其序列和反向互补序列分别是TCCAGTCCCAGACATAGCAT(SEQIDNO. 21) 和ATGCTATGTCTGGGACTGGA(SEQIDNO. 22),分别合成互补配对的寡居核苷酸。如表1所示, 其中下划线为酶切位点。
[0057] 表1寡聚核苷酸序列
[0058]
[0059] 将合成的一对寡聚核苷酸序列稀释至100yM,按10yL反应体系,分别取IyL,加 入IOXPCRbuffer,混匀,退火处理,94°C,5min;37°C,IOmin;4°C,5min。得到的退火产物 即可与BbsI酶切过的pX330骨架连接。常规转化方法参照《分子克隆实验指南》(J.萨姆 布鲁克著,黄培堂译,2002年,化学工业出版社)。
[0060] 表2退火反应体系
[0061]
[0062] 挑取单克隆,测序验证其正确后,扩大培养,去内毒素大提。CRISPR/Cas9打靶载体 构建过程如图1所示。
[0063] 实施例3 4-1BB转基因细胞系的制备与鉴定
[0064] 选用性别为公的50日胎龄的约克夏猪皮肤成纤维细胞系,细胞复苏、培养和传代 参照《精编细胞生物学实验指南》(J.S.博尼费斯农等著,章静波等译,2007年,科学出版 社)。待细胞生长汇合至80%左右,消化收集细胞(约IXIO6个),加入实施例1和2中构 建的载体各2yg和100yLNucleofector试剂混勾,加入电击杯中,用A-024程序进行电 击转染。然后按1:20接种至IOcm培养皿中,37. 5°(:,5%0)2培养箱中培养。24h后更换含 500yg/mLG418的完全培养基(10%FBS+DMEM),每3~4天换液一次,96h后G418浓度增 加到800iig/mL。培养至第8天可见克隆点形成。第10~11天镜下标记克隆点位置,用细 胞克隆环将其消化,接种到24孔板。待其汇合度达90 %,消化细胞,一部分留在原孔继续培 养用于鉴定其整合位点,另一部分接种到6孔板用于细胞冻存。筛选过程如图2所示。
[0065] 对所得到的40个细胞克隆进行鉴定:
[0066]PCR鉴定引物设计策略见图3。短臂引物SF:5'-CGCACCCTTACCTTGTCCCA-3',该引 物位于同源臂上游;短臂引物SR:5'-GAAGGTGGGATGGAGGGTGA-3',该引物位于4-1BB启动子 上,PCR产物大小为2500bp。长臂引物LF:5' -ACCGCTTCCTCGTGCTTTAC-3',该引物位于Neo 基因上;长臂引物LR:5' -AGCTGCCTC
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