预测抗tnf响应性或无响应性的生物标志物的制作方法

预测抗tnf响应性或无响应性的生物标志物的制作方法
【专利摘要】本发明涉及预测抗TNF响应性或无响应性的生物标志物。本发明提供预测受治疗者对抗TNF治疗的响应性或无响应性的生物标志物。本发明描述的生物标志物、组合物和方法用于为患有诸如免疫病症的疾病的受治疗者选择适合的治疗模式(例如抗TNF治疗或非抗TNF治疗)。
【专利说明】预测抗TNF响应性或无响应性的生物标志物
[0001]本申请是申请日为2008年06月06日、中国申请号为200880102360.5、发明名称为“预测抗TNF响应性或无响应性的生物标志物”的发明申请的分案申请。
[0002]相关申请的交叉引用
[0003]本申请要求2007年6月8日提交的美国临时申请第60/942，937号的优先权，其内容通过引用其整体在此并入。
[0004]关于联邦赞助研究或开发的声明
[0005]本申请描述的研究由来自美国国家卫生研究院的关节炎与肌骨和皮肤疾病国家研究院的第1-AR-1-2256号基金支持。政府可具有本发明的某些权利。
[0006]背景
[0007]肿瘤坏死因子-a (TNF)是在炎性疾病(诸如类风湿性关节炎)的发病机制中起关键作用的细胞因子。通过使用抗TNF单克隆抗体(例如阿达木单抗(adalimumab)或英夫利昔单抗(infliximab))或TNF受体融合蛋白(例如依那西普(etaneracept))阻断TNF信号传导可用于改善某些炎性疾病的症状。尽管抗TNF治疗已经非常成功，但它们不会在所有接受它们的患者中产生明显的临床响应。
[0008]鉴定患者为可能或不太可能响应抗TNF治疗是最优患者管理的关键。显示出患者不太可能响应抗TNF治疗的生物标志物的患者可立即(即不施用抗TNF治疗)或在第一抗TNF治疗失败后转向其他治疗。
[0009]概述`
[0010]本发明至少部分基于预测受治疗者对抗TNF治疗的响应性或无响应性的生物标志物的发现。例如，表1中描述的基因的一种或多种的表达水平或表2-4或13中描述的单核苷酸多态性的一种或多种的存在可预测给定受治疗者将会或将不会响应抗TNF治疗的可能性。因此，本文描述的生物标志物、组合物和方法用于为患有诸如免疫或炎性病症(例如类风湿性关节炎或Crohn病)的疾病的受治疗者选择适合的治疗模式(例如抗TNF治疗或非抗TNF治疗)。
[0011]一方面，本公开提供治疗免疫病症的方法，所述方法包括向需要其的受治疗者施用有效量的包括抗TNF剂的治疗的步骤，其中所述受治疗者已被鉴定为具有下述的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种或至少24种):(i)与健康个体相比，ANKIBl、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或ZFP36L1中的一种或多种的升高的表达水平；或(ii)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2 中的一种或多种的降低的表达水平。
[0012]另一方面，本公开提供治疗免疫病症的方法，所述方法包括向需要其的受治疗者施用有效量的包括非抗TNF剂的治疗的步骤，其中所述受治疗者已被鉴定为具有下述的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少I种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种或至少24种):(i)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCH1、SEL1L或SFRS2中的一种或多种的升高的表达水平；或(ii)与健康个体相比，ANKIBl、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或ZFP36L1中的一种或多种的降低的表达水平。
[0013]在以上方法中的任意一个的一些实施方案中，受治疗者已被鉴定为与健康个体相比，具有选自由以下组成的组的至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种、至少23种或至少24种或更多)基因的升高或降低的表达水平:ANKIB1、ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 和 SFRS2。所述至少5 个基因可包括例如 ANKIB1、ARF1、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、DNAH UEEAU EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGK1、RBBP4、RER1、SELIL、SERF2、SFRS2 和 YIPF6。所述至少 5 个基因可包括例如 CLTB、C0L4A3BP、CXorf 52, FAM44A、MXRA7、PGKUSFRS2 或 HPF6。所述至少 8 个基因可包括例如 ANKIBl、ARFl、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、DNAHl、EEA1、EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGKl、RBBP4、RERl、SEL1L、SERF2、SFRS2和/或HPF6。所述至少8个基因可由以下组成或包括以下:例如 CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、FAM44A、MXRA7、PGKl、SFRS2 和 / 或 HPF6。所述至少24个基因可由以下组成或包括以下:例如ANKIBl、ARF1、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52,DNAHl、EEAl、EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGKl、RBBP4、RER1、SEL1L、SERF2、SFRS2 和 YIPF6。
[0014]另一方面，本公开描述预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法。该方法包括以下步骤:提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并测量该生物样本中一种或多种基因的表达水平，其中所述一种或多种基因包括选自由以下组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22或至少24个)基因:ANKIB1、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL和SFRS2，其中下述至少一个预示该受治疗者将会响应包括抗TNF剂的治疗:(i)与健康个体相比，ANKIBl、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或ZFP36L1中的一种或多种的升高的表达水平；或(ii)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2中的一种或多种的降低的表达水平；而其中下述至少一个预示该受治疗者将不会响应包括抗 TNF 剂的治疗:(i)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHU EEAUFAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCH1、SELlL 或 SFRS2 中的一种或多种的升高的表达水平；或 Qi)与健康个体相比，ANKIBl、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGUYIPF6.ZNF294或ZFP36L1中的一种或多种的降低的表达水平。可测量一种或多种基因的RNA或蛋白质表达。可使用例如微阵列分析和/或定量聚合酶链式反应测量一种或多种基因的RNA表达水平。
[0015]在一些实施方案中，该方法包括确定(i)与健康个体相比，ANKIBU ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或 ZFP36L1 中的一种或多种的表达水平升高；或 Qi)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCH1、SEL1L 或 SFRS2 中的一种或多种的表达水平降低；并为受治疗者选择包括抗TNF剂的治疗。该方法可还包括向受治疗者施用所述包括抗TNF剂的治疗。
[0016]在一些实施方案中，该方法还可包括产生指示受治疗者可能响应包括抗TNF剂的治疗的记录，条件是⑴与健康个体相比，ANKIBU ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB,C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGU YIPF6, ZNF294或ZFP36L1中的一种或多种的表达水平升高；或(ii)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHU EEAU FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCH1、SEL1L或SFRS2中的一种或多种的表达水平降低。可在例如计算机可读介质上产生该记录。
[0017]在一些实施方案中，该方法可包括确定(i)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2 中的一种或多种的表达水平升高；或Qi)`与健康个体相比，ANKIB1、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGKl、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGl、YIPF6, ZNF294 或 ZFP36L1 中的一种或多种的表达水平降低；并为受治疗者选择包括非抗TNF剂的治疗。该方法可还包括向受治疗者施用所述包括非抗TNF剂的治疗。
[0018]在一些实施方案中，该方法还可包括产生指示受治疗者不太可能响应包括抗TNF剂的治疗的记录，条件是Q)与健康个体相比，ANKRDl2, CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHUEEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2 中的一种或多种的表达水平升高；或 Qi)与健康个体相比，ANKIBU ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGU YIPF6, ZNF294或ZFP36L1中的一种或多种的表达水平降低。可在例如计算机可读介质上产生该记录。
[0019]在本文描述的方法中的任何一个的一些实施方案中，与健康个体相比，选自由以下组成的组的至少一种基因的表达水平升高或降低了至少约1.5倍(例如至少约2倍、至少约2.5倍、至少约3.0倍、至少约3.5倍、至少约4.0倍或至少约5倍或更多)=ANKIBl、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL和SFRS2。本文描述的方法可包括测量选自由以下组成的组的至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种或至少24种)基因的表达水平=ANKIBU ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 和 SFRS2。所述至少5 种基因可包括例如 ANKIBl、ARFl、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、DNAH UEEAU EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGK1、RBBP4、RER1、SELIL、SERF2、SFRS2 和 YIPF6。所述至少 5 种基因可包括例如 CLTB、C0L4A3BP、CXorf52, FAM44A、MXRA7、PGKUSFRS2 或 HPF6。所述至少 8 种基因可包括例如 ANKIBl、ARFl、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXor f 52、DNAH UEEAU EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGKl、RBBP4、RERl、SEL1L、SERF2、SFRS2和/或HPF6。所述至少8种基因可由以下组成或包括以下；例如 CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、FAM44A、MXRA7、PGKl、SFRS2 和 / 或 HPF6。所述至少24种基因可由以下组成或包括以下:例如ANKIBl、ARF1、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52,DNAHl、EEAl、EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGKl、RBBP4、RER1、SEL1L、SERF2、SFRS2 和 YIPF6。
[0020]另一方面，本公开提供预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法，所述方法包括评价来自受治疗者的生物样本中的一种或多种基因的表达水平(例如RNA或蛋白质表达水平)的步骤，其中所述一种或多种基因包括选自由以下组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、 至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种、至少20种、至少21种、至少22种或至少24种)基因=ANKIBU ARFUARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RERU RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGU YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52,DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 和SFRS2，其中 ANKIBl、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGKl、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGl、YIPF6、ZNF294 或 ZFP36L1 的升高的表达水平或 ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHU SELlL 或 SFRS2 的降低的表达水平预示受治疗者将会响应抗 TNF 治疗，而其中 ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCH1、SEL1L 或 SFRS2 的升高的表达水平或 ANKIBl、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGU YIPF6, ZNF294 或 ZFP36L1 的降低的表达水平预示受治疗者将不会响应抗TNF治疗。[0021]在一些实施方案中，该方法可包括确定ANKIB1、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB,C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGUYIPF6, ZNF294 或 ZFP36L1 中的 I 种或多种(例如 2 种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种、21种或多种或22种或更多种)的表达水平被升高；或ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAH1、EEA1、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCH1、SEL1L 或 SFRS2 中的 I 种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种、21种或多种或22种或更多种)的表达水平被降低；并预测受治疗者将会响应抗TNF治疗。在一些实施方案中，该方法包括预测受治疗者将会响应抗TNF治疗后，向该受治疗者施用抗TNF治疗。
[0022]在一些实施方案中，该方法可包括确定ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf 52,DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2 中的 I 种或多种(例如 2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种、21种或多种或22种或更多种)的表达水平被升高；或ANKIBl、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或 ZFP36L1 中的 I 种或多种(例如、2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种、21种或`多种或22种或更多种)的表达水平被降低；并预测受治疗者将不会响应抗TNF治疗。在一些实施方案中，该方法包括预测受治疗者将不会响应抗TNF治疗后，向该受治疗者施用非抗TNF治疗。
[0023]又一方面，本公开描述治疗免疫病症的方法。该方法包括向需要其的受治疗者施用有效量的包括抗TNF剂的治疗的步骤，其中所述受治疗者已被鉴定为具有选自由以下组成的组的I种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)单核苷酸多态性(SNP)基因型:rsl 1778767 (A/A), rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615(C/C)、rs3849942(A/G)、rs3849942(G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653(G/G)、rs774359(A/A)、rs868856 (A/G)和 rs868856(G/G)。
[0024]另一方面，本公开描述治疗免疫病症的方法，该方法包括向需要其的受治疗者施用有效量的包括非抗TNF剂的治疗的步骤，其中所述受治疗者已被鉴定为具有选自由以下组成的组的I种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型:rsl 1778767 (A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209(A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表13中描述的任何SNP基因型。
[0025]在一些实施方案中，受治疗者已被鉴定为具有选自由以下组成的组的I种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种`、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型:rsll778767 (A/G)、rsll778767 (G/G)、rsll780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209(G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942(A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286(G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653(A/A)、rs774359(A/G)、rs774359(G/G)和 rs868856(A/A)。
[0026]在一些实施方案中，受治疗者已被鉴定为具有选自由以下中的任何组成的组的I种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型:rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547(A/G)、rs7046653(A/G)、rs868856(C/T)、rs774359(C/T)、rs2814707(A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942(A/A)、rs6028945(T/T)、rs6138150 (T/T)和 rs6071980(C/C)。
[0027]在一些实施方案中，受治疗者已被鉴定为具有选自由以下组成的组的I种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型:rs 1800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs 1800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895(A/A)、rs7026551 (C/C)和 rs4803455(C/C)。
[0028]在一些实施方案中，受治疗者已被鉴定为具有选自由表13中描述的任何SNP基因型组成的组的I种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型。
[0029]另一方面，本公开`描述治疗免疫病症的方法，该方法包括向需要其的受治疗者施用有效量的包括非抗TNF剂的治疗的步骤，其中所述受治疗者已被鉴定为具有选自由以下组成的组的I种或多种(例如2种或更多种、3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型:rsl 1778767 (A/G)、rsll778767(G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293(G/G)、rs3849942(A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006(G/G)、rs7046653(A/A)、rs774359(A/G)、rs774359(G/G)或 rs868856(A/A)。
[0030]另一方面，本公开提供预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法。该方法包括以下步骤:提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并检测该生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种或至少20种)SNP基因型:rsll778767 (A/A)、rsll780500(A/A)、rsl1780500(G/G)、rsl422422(A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201(A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359(A/A)、rs868856 (A/G)、rs868856 (G/G)、rs 11778767 (A/G)、rs 11778767 (G/G)、rsl1780500(A/G)、rsl422422(A/G)、rsl422422(G/G)、rsl441209(A/G)、rsl441209(G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表 13 中描述的任何 SNP 基因型，其中 rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs217 0331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943(A/A)、rs4562286(A/A)、rs4976592(A/A)、rs6531358(A/A)、rs6665006(A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)或rs868856 (G/G)中的I种或多种的存在预示受治疗者将会响应包括抗TNF剂的治疗，且其中 rsl1778767 (A/G)、rsl1778767 (G/G)、rsl1780500(A/G)、rsl422422(A/G)、rsl422422(G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856(T/T)、rs774359(C/C)、rs2814707(A/A)、rs3849942(A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)或描述于表13的任何SNP基因型中的一种或多种的存在预示受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗。
[0031] 另一方面，本公开提供预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法。该方法包括以下步骤:提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并检测该生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种或至少20种)SNP基因型:rs983332(A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A`/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表 13 中描述的任何 SNP 基因型，其中 rs983332(A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)或表 13 中描述的任何 SNP 基因型中的任何SNP基因型中一种或多种的存在预示受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗。
[0032]另一方面，本公开提供预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法。该方法包括以下步骤:提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并检测该生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下的任何基因型组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种或至少20种)SNP基因型:rs983332(A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707(A/A)、rs3849942(A/A)、rs6028945(T/T)、rs6138150(T/T)和 rs6071980(C/C)，其中 rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)或rs6071980(C/C)中的任何SNP基因型中的一种或多种的存在预示受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗。
[0033]另一方面，本公开`提供预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法。该方法包括以下步骤:提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并检测该生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种或至少20种)SNP基因型:rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)和 rs4803455 (C/C)，其中 rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490(A/A)、rs231726(A/A)、rs3096851(C/C)、rs6708660(A/A)、rs2523619(G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)或 rs4803455 (C/C)中的任何 SNP 基因型中的一种或多种的存在预示受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗。
[0034]另一方面，本公开提供预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法。该方法包括以下步骤:提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并检测该生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由表13中描述的任何SNP基因型组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种或至少20种)SNP基因型，其中表13中描述的任何SNP基因型中的一种或多种的存在预示受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗。
[0035]另一方面，本公开提供预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法。该方法包括以下步骤:提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并检测该生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少I种(例如至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少16种、至少17种、至少18种、至少19种或至少20种)SNP基因型:rsll778767 (A/A)、rsll780500(A/A)、rsl1780500(G/G)、rsl422422(A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201(A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、 rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359(A/A)、rs868856 (A/G)、rs868856 (G/G)、rs 11778767 (A/G)、rs 11778767 (G/G)、rsl1780500(A/G)、rsl422422(A/G)、rsl422422(G/G)、rsl441209(A/G)、rsl441209(G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942(A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286(G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)和 rs868856 (A/A)，其中 rsl 1778767 (A/A)、rsll780500(A/A)、rsl1780500(G/G)、rsl422422(A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201(A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942(A/G)、rs3849942(G/G)、rs437943(A/A)、rs4562286(A/A)、rs4976592(A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)或rs868856 (G/G)中的一种或多种的存在预示受治疗者将会响应包括抗 TNF 剂的治疗，且其中 rsll778767 (A/G)、rsll778767 (G/G)、rsll780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286(G/G)、rs4976592(A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)或rs868856 (A/A)中的一种或多种的存在预示受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗。
[0036]在一些实施方案中，该方法包括检测rsll778767(A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl1780500(G/G)、rsl422422(A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201(A/A)、rs2028446(A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)或rs868856 (G/G)中的一种或多种的存在；并为受治疗者选择包括抗TNF剂的治疗。该方法还可包括向受治疗者施用所述包括抗TNF剂的治疗。
[0037]在一些实施方案中，该方法可包括产生指示受治疗者可能响应包括抗TNF剂的治疗的记录，条件是存在 rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)或rs868856 (G/G)中的一种或多种。可在计算机可读介质上产生该记录。
[0038]在一些实施方案中，该方法可包括检测rsll778767(A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsll780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209(G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942(A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286(G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)或 rs868856 (A/A)中的一种或多种的存在；并为受治疗者选择包括非抗TNF`剂的治疗。该方法还可包括向受治疗者施用包括非抗TNF剂的治疗。
[0039]在一些实施方案中，该方法可包括检测rsll778767(A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsll780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209(G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619(G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)或表13中描述的任何SNP基因型中的一种或多种的存在；并为受治疗者选择包括非抗TNF剂的治疗。该方法还可包括向受治疗者施用所述包括非抗TNF剂的治疗。[0040] 在一些实施方案中，该方法可包括检测rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)或表 13 中描述的任何SNP基因型中的任何SNP基因型中的一种或多种的存在；并为受治疗者选择包括非抗TNF剂的治疗。该方法还可包括向受治疗者施用所述包括非抗TNF剂的治疗。
[0041 ] 在一些实施方案中，该方法可包括检测rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)或 rs6071980 (C/C)中的任何 SNP 基因型中的一种或多种的存在；并为受治疗者选择包括非抗TNF剂的治疗。在一些实施方案中，该方法可包括检测 rsl800896(A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851(A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455(A/C)、rsl800896(A/A)、rs3024490(A/A)、rs231726(A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)或rs4803455(C/C)中的一种或多种的存在；并为受治疗者选择包括非抗TNF剂的治疗。在一些实施方案中，该方法可包括检测表13中描述的任何SNP基因型中的一种或多种的存在；并为受治疗者选择包括非抗TNF剂的治疗。该方法可还包括向受治疗者施用所述包括非抗TNF剂的治疗。
[0042]在一些实施方案中，该方法可包括产生指示受治疗者不太可能响应包括抗TNF剂的治疗的记录，条件是存在 rsl 1778767 (A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)或表 13 中描述的任何SNP基因型中的一种或多种。可在计算机可读介质上产生该记录。
[0043]在一些实施方案中，该方法可包括产生指示受治疗者不太可能响应包括抗TNF 剂的治疗的记录，条件是存在 rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rs 13393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl094`5919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)或表 13 中描述的任何 SNP 基因型中的任何SNP基因型中的一种或多种。可在计算机可读介质上产生该记录。
[0044]在一些实施方案中，该方法可包括产生指示受治疗者不太可能响应包括抗TNF 剂的治疗的记录，条件是存在 rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rs 13393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945(T/T)、rs6138150 (T/T)或 rs6071980 (C/C)中的任何 SNP 基因型中的一种或多种。在一些实施方案中，该方法可包括产生指示受治疗者不太可能响应包括抗TNF剂的治疗的记录，条件是存在 rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455(A/C)、rs1800896(A/A)、rs3024490(A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)或rs4803455 (C/C)中的一种或多种。在一些实施方案中，该方法可包括产生指示受治疗者不太可能响应包括抗TNF剂的治疗的记录，条件是存在表13中描述的任何SNP基因型中的一种或多种。可在计算机可读介质上产生该记录。
[0045]在一些实施方案中，该方法可包括产生指示受治疗者不太可能响应包括抗TNF剂的治疗的记录，条件是存在 rsl 1778767 (A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359(A/G)、rs774359(G/G)或rs868856 (A/A)中的一种或多种。可在计算机可读介质上产生该记录。
[0046]在一些实施方案中，受治疗者可以是被鉴定为具有选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型的受治疗者:rsll778767(A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl1780500(G/G)、rsl422422(A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201(A/A)、rs2028446(A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006(A/A)、rs6665006(A/G)、rs7046653(A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)和 rs868856(G/G)。
[0047]在一些实施方案中，受治疗者可以是被鉴定为具有选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型的受治疗者:rsll778767(A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl1780500(A/G)、rsl422422(A/G)、rsl422422(G/G)、rsl441209(A/G)、rsl441209(G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rs 13393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rs 10945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175(A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619(G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表13中描述的任何SNP基因型。
[0048]在一些实施方案中，受治疗者可以是被鉴定为具有选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型的受治疗者:rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表 13 中描述的任何SNP基因型。
[0049]在一些实施方案中 ，受治疗者可以是被鉴定为具有选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型的受治疗者:rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547(A/G)、rs7046653(A/G)、rs868856(C/T)、rs774359(C/T)、rs2814707(A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942(A/A)、rs6028945(T/T)、rs6138150 (T/T)和 rs6071980(C/C)。
[0050]在一些实施方案中，受治疗者可以是被鉴定为具有选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型的受治疗者:rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895(A/A)、rs7026551 (C/C)和 rs4803455(C/C)。
[0051]在一些实施方案中，受治疗者可以是被鉴定为具有选自表13的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型的受治疗者。
[0052]在一些实施方案中，受治疗者可以是被鉴定为具有选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP基因型的受治疗者:rsll778767(A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl1780500(A/G)、rsl422422(A/G)、rsl422422(G/G)、rsl441209(A/G)、rsl441209(G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942(A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286(G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653(A/A)、rs774359(A/G)、rs774359 (G/G)和 rs868856 (A/A)。
[0053]在一些实施方案中，该方法可包括检测选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP 基因型的存在或缺乏:rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A),rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943(A/A)、rs4562286(A/A)、rs4976592(A/A)、rs6531358(A/A)、rs6665006(A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)和rs868856 (G/G)。[0054]在一些实施方案中，该方法可包括检测选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP 基因型的存在或缺乏:rsl 1778767 (A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表 13 中描述的任何SNP基因型。
[0055]在一些实施方案中，该方法可包括检测选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP 基因型的存在或缺乏:rsl 1778767 (A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286(G/G)、rs4976592(A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359(A/G)、rs774359 (G/G)和 rs868856 (A/A)。
[0056]在一些实施方案中，该方法可包括检测选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP 基因型的存在或缺乏:rs983332(A/C)、rs928655(A/G)、rsl3393173(A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、r s7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表 13 中描述的任何 SNP 基因型。
[0057]在一些实施方案中，该方法可包括检测选自由以下组成的组的2种或更多种(例如3种或更多种、4种或更多种、5种或更多种、6种或更多种、7种或更多种、8种或更多种、9种或更多种、10种或更多种、11种或多种、12种或更多种、13种或更多种、14种或更多种、15种或更多种、16种或更多种、17种或更多种、18种或更多种、19种或更多种、20种或更多种或所有)SNP 基因型的存在或缺乏:rsl 1778767 (A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286(G/G)、rs4976592(A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359(A/G)、rs774359 (G/G)和 rs868856 (A/A)。
[0058]本文描述的方法中的任何一个还可包括为受治疗者指定包括抗TNF剂或非抗TNF剂的治疗(其选择依据本文描述的预测方法的结果)。
[0059]本文描述的方法中的任何一个中的生物样本可由例如血液组成，或包括例如血液。
[0060]在本文描述的方法中的任何一个的一些实施方案中，受治疗者可患有诸如免疫(例如炎性)病症、感染或由本文描述的包括抗TNF剂的治疗可治疗的任何疾病的疾病。例如，受治疗者可患有类风湿性关节炎或Crohn病。受治疗者可以是人。
[0061]在本文描述的方法中的任何一个的一些实施方案中，抗TNF剂可由抗TNF抗体或可溶TNF受体组成,或包括抗TNF抗体或可溶性TNF受体。抗TNF抗体可以是例如，阿达木单抗或英夫利昔单抗。可溶性TNF受体可以是例如，依那西普。
[0062]在一些实施方案中，非抗TNF剂可由以下组成或包括:非甾体抗炎药(NSAID)、皮质甾类、缓解疾病的抗风湿药(DMARD)、抗CD20抗体、TWEAK抑制剂、IL-6抑制剂、IL-6受体抑制剂、可溶性淋巴毒素β受体或可溶性BAFF拮抗剂。NSAID可以是C0X-2抑制剂。DMARD
可以是甲氨蝶呤、金、青霉胺或羟氯喹。
[0063]另一方面，本公开提供包含至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种、至少20种、至少22种或至少24种或更多种)多核苷酸的组合物，所述多核苷酸选择性地杂交于选自由以下组成的组的至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种、至少20种、至少22种或至少24种或更多种)基因中的每一种的全部或一部分:ANKIB1、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2。所述至少5 种基因可包括例如 ANKIBl、ARFl、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、DNAH UEEAU EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGK1、RBBP4、RER1、SELIL、SERF2、SFRS2 和 YIPF6。所述至少 5 种基因可包括例如 CLTB、C0L4A3BP、CXorf 52, FAM44A、MXRA7、PGKUSFRS2 或 HPF6。所述至少 8 种基因可包括例如 ANKIBl、ARFl、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、DNAHl、EEA1、EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGKl、RBBP4、RERl、SEL1L、SERF2、SFRS2和/或HPF6。所述至少8种基因可由以下组成或包括以下:例如 CLTB、C0L4A3BP、CXorf52、FAM44A、MXRA7、PGKl、SFRS2 和 / 或 HPF6。所述至少24种基因可由以下组成或包括以下:例如ANKIBl、ARF1、ARF5、C9orf80、CALM2、CASP5、CLTB、C0L4A3BP、CXorf52,DNAHl、EEAl、EGLN2、FAM44A、HDAC4、HDAC5、LGALS9、MXRA7、PGKl、RBBP4、RER1、SEL1L、SERF2、SFRS2 和 YIPF6。
[0064]又一个方面，本公开提供包含至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种或至少20种或更多种)多核苷酸的组合物，所述多核苷酸选择性地杂交于选自由以下组成的组的至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种或至少20种或更多种)SNP基因型中的每一种:rsl 1778767 (A/A), rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653(G/G)、rs774359(A/A)、rs868856(A/G)、rs868856(G/G)、rsl1778767(A/G)、rsll778767(G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表13中描述的任何SNP基因型。
[0065]又一个方面，本公开提供包含至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种或至少20种或更多种)多核苷酸的组合物，所述多核苷酸选择性地杂交于选自由以下的任何基因型组成的组的至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种、至少20种或更多种)SNP 基因型中的每一种:rs983332(A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、 rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856(T/T)、rs774359(C/C)、rs2814707(A/A)、rs3849942(A/A)、rs6028945(T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表 13 中描述的任何 SNP 基因型。
[0066]另一方面，本公开提供包含至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种或至少20种或更多种)多核苷酸的组合物，所述多核苷酸选择性地杂交于选自由以下组成的组的至少2种(例如至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少11种、至少12种、至少15种、至少20种或更多种)SNP基因型中的每一种:rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653(G/G)、rs774359(A/A)、rs868856(A/G)、rs868856(G/G)、rsl1778767(A/G)、rsll778767(G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293(G/G)、rs3849942(A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286(A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006(G/G)、rs7046653(A/A)、rs774359(A/G)、rs774359(G/G)和 rs868856(A/A)。
[0067]在本文描述的组合物中的任何一个的一些实施方案中，至少两个多核苷酸可结合于固相支持体。所述固相支持体可以是微阵列芯片、颗粒(例如编码颗粒、磁性颗粒或磁性并编码的颗粒)或本文描述的任何其他固相支持体。
[0068]上述组合物中的任何一个可包含小于100，000种(例如小于90,000种；小于80，000种；小于70，000种；小于60，000种；小于50，000种；小于40，000种；小于30，000种；小于20，000种；小于15，000种；小于10，000种；小于5，000种；小于4，000种；小于3，000种；小于2，000种；小于1，500种；小于1，000种；小于750种；小于500种；小于200
种；小于100种或小于50种)不同的多核苷酸。
[0069]又一方面，本公开提供了确定表达水平或检测一种或多种SNP基因型的存在或缺乏的试剂盒。该试剂盒可包括:以上描述的组合物中的任何一个和，任选地，确定表达水平(例如RNA和/或蛋白质表达水平 )的说明书或检测一种或多种SNP基因型的说明书。试剂盒还可包括例如，用于确定表达水平或检测一种或多种SNP基因型的存在或缺乏的一种或多种其他试剂。例如，该试剂盒可包括下述的一种或多种:由关注的基因编码的蛋白质的特异性抗体、引物(例如随机六聚物或寡(dT)引物)、逆转录酶、DNA聚合酶(例如Taq聚合酶)、T4核苷酸激酶、一种或多种可检测的标记(诸如本文描述的任何一个)或本文描述的任何其他试剂。
[0070]在一些实施方案中，该试剂盒包括施用包括抗TNF剂的治疗的说明书，施用的条件是确定 ANKIBl、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGKl、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGl、YIPF6、ZNF294或ZFP36L1中的一种或多种的表达水平被升高，或确定ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2 中的一种或多种的表达水平被降低。
[0071 ] 在一些实施方案中，该试剂盒包括施用包括抗TNF剂的治疗的说明书，施用的条件是检测到 rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359(A/A)、rs868856(A/G)或 rs868856 (G/G)中的一个或更多个。
[0072] 另一方面，本公开提供通过包括以下步骤的方法获得的受治疗者的抗TNF治疗响应概况:提供来自受治疗者的生物样本；测量该生物样本中的一种或多种基因的表达水平，其中所述一种或多种基因包括选自由以下组成的组的至少一种基因:ANKIB1、ARFUARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGKURBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGl、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRDl2,CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 和SFRS2 ;和评价该生物样本中的一种或多种基因中的至少两种的表达水平，以获得受治疗者的抗TNF响应概况。[0073]又一方面，本公开描述通过包括以下步骤的方法获得的受治疗者的抗TNF治疗响应概况:提供来自受治疗者的生物样本；并检测来自受治疗者的生物样本中两种或更多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少一种 SNP 基因型:rsl 1778767 (A/A)、rsll780500 (A/A)、rsll780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)、rs868856 (G/G)、rsl 1778767 (A/G), rsl 1778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422(G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293(A/G)、rs3019293(G/G)、rs3849942(A/A)、rs437943(A/G)、rs437943(G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)和rs868856 (A/A)，以获得受治疗者的抗TNF响应概况。
[0074]又一方面，本公开描述通过包括以下步骤的方法获得的受治疗者的抗TNF治疗响应概况:提供来自受治疗者的生物样本；并检测来自受治疗者的生物样本中两种或更多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少一种 SNP 基因型:rsl 1778767 (A/A)、rsll780500 (A/A)、rsll780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)、rs868856 (G/G)、rsl 1778767(A/G), rsl1778767(G/G)、rsl1780500(A/G)、rsl422422(A/G)、rsl422422(G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856(T/T)、rs774359(C/C)、rs2814707(A/A)、rs3849942(A/A)、rs6028945(T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表13中描述的任何SNP基因型，以获得受治疗者的抗TNF响应概况。
[0075]又一方面，本公开描述通过包括以下的方法方法获得的受治疗者的抗TNF治疗响应概况:提供来自受治疗者的生物样本；并检测来自受治疗者的生物样本中两种或更多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少一种 SNP 基因型:rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856(T/T)、rs774359(C/C)、rs2814707(A/A)、rs3849942(A/A)、rs6028945(T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2`395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表13中描述的任何SNP基因型，以获得受治疗者的抗TNF响应概况。
[0076]以上描述的响应概况中的任何一个可用于预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应。
[0077]如本文所用，抗TNF剂是抑制TNF活性的剂。TNF活性的抑制包括，例如TNF表达(mRNA或蛋白质表达)的抑制、其中产生TNF的细胞的TNF释放的抑制或TNF结合和/或活化其同源受体的能力的抑制。抑制TNF活性的剂包括但不限于小分子、小干扰RNA(SiRNA)、反义RNA、特异性结合TNF的抗体、可溶性TNF受体或显性阴性TNF分子(诸如显性阴性TNF蛋白质或编码显性阴性TNF蛋白质的核酸)。应理解，抑制TNF的剂可以是抑制TNF活化受体的能力但不抑制TNF结合受体的剂。抗TNF抗体包括例如，英夫利昔单抗(Remicade?)、D2E7(阿达木单抗；Humira?)、赛妥珠单抗(CDP-870)和CDP-571 (参见例如Sandborn等人(2004)Gut53(10):1485-1493 ；Choy 等人(2002) Rheumatology41 (10):1133-1137 ;和Kaushik 等人(2005) Expert Opinion on BiologicalTherapy5 (4): 601-606 (6))。可溶性TNF受体包括例如依那西普(sTNF-Rll:Fc ； Enbrel? )。示例性抗TNF治疗描述于例如美国专利第6，270, 766号。
[0078]非抗TNF剂可以是例如非甾体抗炎药(NSAID)、皮质甾类(例如糖皮质激素或盐皮质激素)或缓解疾病的抗风湿药(DMARD)。NSAID包括例如C0X-2抑制剂(例如塞来考昔、艾托考昔或罗美昔布)、水杨酸类(例如、阿司匹林、amoxiprin、贝诺酯、胆碱水杨酸镁、二氟尼柳、faislamine、水杨酸甲酯、水杨酸镁或水杨酸水杨酸酯(双水杨酸))、芳基烧酸(例如、双氯芬酸、醋氯芬酸、阿西美辛、溴芬酸、依托度酸、吲哚美辛、酮咯酸、萘丁美酮、舒林酸或托美汀)或吡唑烷衍生物(诸如苯乙丁氮酮、阿扎丙宗、安乃近、羟基保泰松或磺吡酮(sulfinprazone))。DMARD包括但不限于阿达木单抗、硫唑嘌呤、抗痕疾药(例如氯喹或羟氯喹)、环孢霉素A、D-青霉胺、金盐(例如、金硫丁二钠或金诺芬)、来氟米特、甲氨蝶呤(MTX)、米诺环素或柳氮磺吡啶(SSZ)。非抗TNF治疗还包括抗CD20抗体(例如利妥昔单抗(Rituxan? ))、TWEAK抑制剂(例如抗TWEAK抗体，参见例如W006/122187，其公开内容通过引用其整体在此并入)、可溶性淋巴毒素β受体(例如LTBR-Fc)、BAFF拮抗剂，诸如BR3-Fc ;和IL-6抑制剂(例如IL-6拮抗剂抗体、可溶性IL-6受体)和IL-6受体抑制剂(例如IL-6受体拮抗剂抗体诸如托珠单抗或atlizumab (Actemra?),参见例如W0/2004/096273 ;EP1536012、W0/2006/119115、美国专利第 5，559，012 和 5，888，510 号；和美国公布第20010001663号，其各自公开内容通过引用其整体在此并入)。在一些实施方案中，非抗TNF剂可以是不包括抗TNF剂的抗炎剂。
[0079]由包括抗TNF剂的治疗可治疗的疾病包括，例如免疫(例如炎性)病症、感染、神经变性疾病、包括分泌TNF的肿瘤或涉及TNF的其他恶性肿瘤的恶性疾病，和酒精性肝炎。
[0080]免疫或炎性病症包括但不限于变应性支气管肺曲菌病；变应性鼻炎；自身免疫性溶血性贫血；黑棘皮病；变应性接触性皮炎；Addison病；特应性皮炎；斑秃；普秃；淀粉样变性；类过敏性紫癜；类过敏性反应；再生障碍性贫血；遗传性血管性水肿；特发性血管性水肿；强直性脊柱炎；颅动脉炎；巨细胞动脉炎；高安氏动脉炎；颞动脉炎；哮喘；共济失调毛细血管扩张；自身免疫性卵巢炎；自身免疫性睾丸炎；自身免疫性多内分泌衰竭；Behcet病；Berger病；Bu`erger病；支气管炎；大疱性天疱疮；慢性皮肤粘膜念珠菌病；Caplan综合征；心肌梗塞后综合征；心包切开术后综合征；心脏炎；乳糜泻；Chagas病；Chediak-Higashi综合征；Churg_Strauss病；Cogan综合征；冷凝集素病；CREST综合征；Crohn病；冷球蛋白血症；隐原性纤维化肺泡炎；疱疫样皮炎(dermatitis herpetifomis)；皮肌炎；糖尿病；Diamond-Blackfan综合征；DiGeorge综合征；盘状红斑狼疮；嗜酸细胞性筋膜炎；巩膜外层炎；持久性隆起性红斑；风湿性边缘性红斑；多形性红斑；结节性红斑；家族性地中海热；Felty综合征；肺纤维化；类过敏性肾小球肾炎；自身免疫性肾小球肾炎；链球菌感染后肾小球肾炎；移植后肾小球肾炎；膜性肾病变Goodpasture综合征；免疫介导型粒细胞减少；环状肉芽肿；变应性肉芽肿病；肉芽肿性肌炎；Grave病；桥本甲状腺炎；新生儿溶血病；特发性色素沉着病；Henoch-Schoenlein紫癜；慢性活动性和慢性进展性肝炎；组织细胞增多病X ;嗜酸细胞过多综合征；特发性血小板减少性紫癜Job综合征；青少年型皮肌炎；青少年型类风湿性关节炎(青少年慢性关节炎)；Kawasaki病；角膜炎；干性角膜结膜炎；Landry_GuiIIain-Barre-Strohl综合征；瘤型麻风；Loeffler综合征；狼疮；Lyell综合征；Lyme病；淋巴瘤样肉芽肿；全身性肥大细胞过多症；混合性结缔组织病；多数性单神经炎；MUCkle-WellS综合征；皮肤粘膜淋巴结综合征；皮肤粘膜淋巴结综合征；多中心网状组织细胞增多症；多发性硬化；重症肌无力；蕈样肉芽肿；全身性坏死性脉管炎；肾病综合征；重叠综合征；脂膜炎；阵发性冷性血红蛋白尿症；阵发性睡眠性血红蛋白尿症；类天疱疮；天疱疮；红斑型天疱疮；落叶型天疱疮；寻常型天疱疮；饲鸽者病；过敏性肺炎；结节性多动脉炎；风湿性多肌痛；多肌炎；特发性多神经炎；葡萄牙家族性多发性神经疾病(Portuguese familial polyneuropathies);子痫前期/子痫；原发性胆汁性肝硬化；进行性全身性硬化(硬皮病)；银屑病；银屑病关节炎；肺泡蛋白沉积症；肺纤维化；Raynaud现象/综合征；Reidel甲状腺炎；Reiter综合征，复发性多发软骨炎；风湿热；类风湿性关节炎；肉样瘤病；巩膜炎；硬化性胆管炎；血清病；Sezary综合征；Sjogren综合征；Stevens-Johnson综合征；Still病；亚急性硬化性全脑炎；交感性眼炎；全身性红斑狼疮；移植排斥；溃疡性结肠炎；未分化结缔组织病；慢性荨麻疹；寒冷性荨麻疹；葡萄膜炎；白斑；Weber_Christian 病；Wegener 肉芽肿或 Wiskott-Aldrich 综合征。
[0081]感染可包括例如，由急性或慢性细菌感染引起的脓毒病综合征、恶病质、循环衰竭和休克、急性和慢性寄生虫病和/或传染病、细菌感染、病毒感染或真菌感染。
[0082]神经变性疾病包括例如脱髓鞘性病(诸如多发性硬化和急性横贯性脊髓炎)；锥体束外和小脑病症，诸如皮质脊髓束的损伤；基底神经节病症或小脑病症；运动机能亢进性病症，诸如亨丁顿氏舞蹈病和老年性舞蹈症；药物诱导的运动病症，诸如由阻断CNS多巴胺受体的药物诱导的病症；运动不足病症(hypokinetic movement disorders),诸如帕金森病；进行性核上性麻痹(progressive supranucleo palsy);小脑和脊髓小脑病症,诸如小脑的非结构性损伤；脊髓小脑变性(脊髓性共济失调、Friedreich共济失调、小脑皮质变性、多系统变性(Mencel、Dejerine-Thomas、Shi_Drager 和 Machado-Joseph));和全身性病症(Refsum病、无β脂蛋白血症、共济失调微血管扩张症和线粒体多系统病症)；脱髓鞘核病症(demyelinating core disorders),诸如多发性硬化、急性横贯性脊髓炎；运动单位的病症，诸如神经原性肌萎缩(前角细胞变性，诸如肌萎缩性侧索硬化、婴儿型脊髓性肌萎缩和青少年脊髓性肌萎缩)；阿尔茨海默病；中年人中的Down综合征；弥漫性Lewy体疾病；Lewy体型老年痴呆；Wernicke_Korsakoff综合征；慢性醇中毒；Creutzfeldt_Jakob病；亚急性硬化全脑炎；HalIerrord`en-Spatz病；和拳击员痴呆。
[0083]包括分泌TNF的肿瘤或涉及TNF的其他恶性肿瘤的恶性疾病包括但不限于白血病(急性、慢性粒细胞性、慢性淋巴细胞性和/或骨髓增生异常综合征)；或淋巴瘤(霍奇金和非霍奇金淋巴瘤，诸如恶性淋巴瘤(Burkitt淋巴瘤或蕈样肉芽肿))。
[0084]可根据本文描述的方法治疗的其他病症描述于例如W006/74399、W006/122187或美国专利第5，656，272和5，919，452号，其各自公开内容通过引用其整体在此并入。
[0085]如本文所用，序列“互补性”指特定含氮碱基之间由于它们的氢键结合性质而产生的化学亲和力(即具有碱基的两条核酸链可以形成反向平行双链体的性质，其中腺嘌呤和尿嘧啶(或胸腺嘧啶，在DNA或修饰的RNA的情况中)彼此相对，且鸟嘌呤和胞嘧啶彼此相对)。因此，完全互补序列将是具有碱基序列完全一一对应(即腺嘌呤与尿嘧啶，以及鸟嘌呤与胞嘧啶)的两条序列，此时核苷酸序列形成反向平行双链体。
[0086]除非另外定义，本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解相同的含义。尽管与本文描述的方法和材料相似或等同的方法和材料能用于本发明的实践或检测，但下文描述了示例性的方法和材料。本文提及的所有的出版物、专利申请、专利和其他参考文献通过引用其整体并入。在冲突的情况下，将以本申请(包括定义)为准。材料、方法和实施例仅为示例，且无意限制。
[0087]根据以下的详细描述和权利要求，本发明的其他特征和优势将变得明显。
[0088]详细描述
[0089]本文提供预测受治疗者(诸如人类患者)对抗TNF治疗的响应的方法和组合物(例如核酸阵列和试剂盒)。此外，本公开提供了鉴定施用抗TNF治疗可能是有效或无效的那些受治疗者的预测性生物标志物(例如基因表达水平或SNP基因型)。这种生物标志物、组合物和方法用于为患有诸如类风湿性关节炎、Crohn病、银屑病关节炎、Behget病、强直
性脊柱炎和其他免疫病症的疾病的受治疗者选择适合的治疗模式(例如抗TNF治疗或非抗TNF治疗)。
[0090]某闵表汰和对杭TNF治疗的响应件
[0091]已鉴定一系列基因，它们的表达水平(例如mRNA或蛋白质表达水平)预示受治疗者对抗TNF治疗的响应性或无响应性。表1描述了基因(和它们对应的Entrez基因ID号)ο
[0092]表1.[0093]
【权利要求】
1.一种预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法,所述方法包括: 提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并 测量所述生物样本中一种或多种基因的表达水平，其中所述一种或多种基因包括选自由以下组成的组的至少一种基因:ANKIB1、ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGl、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT, MXRA7、PTCHl、SELlL 和 SFRS2， 其中下述的至少一个预示所述受治疗者将会响应包括抗TNF剂的治疗:(i)与健康个体相比，ANKIB1、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9or f 80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP, PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或ZFP36L1中的一种或多种的升高的表达水平；或(ii)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2 中的一种或多种的降低的表达水平。
2.—种预测受治疗者对包括抗TNF剂的治疗的响应的方法,所述方法包括: 提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并 测量所述生物样本中一种或多种基因的表达水平，其中所述一种或多种基因包括选自由以下组成的组的至少一种基因:ANKIB1、ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 和 SFRS2， 其中下述的 至少一个预示所述受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗:(i)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52, DNAHU EEAU FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHU SELlL或SFRS2中的一种或多种的升高的表达水平；或(ii)与健康个体相t匕，ANKIBU ARFU ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP, PCBP2、PGK1、RBBP4、RER1、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或ZFP36L1中的一种或多种的降低的表达水平。
3.一种治疗免疫病症的方法，所述方法包括向需要其的受治疗者施用有效量的包括抗TNF剂的治疗，其中所述受治疗者已被鉴定为具有下述的至少一个:(i)与健康个体相比，ANKIB1、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGKl、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUG1、YIPF6、ZNF294 或 ZFP36L1中的一种或多种的升高的表达水平；或(ii)与健康个体相比，ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf52、DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL 或 SFRS2 中的一种或多种的降低的表达水平。
4.一种预测受治疗者响应包括抗TNF剂的治疗的方法,所述方法包括: 提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并 检测所述生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少一种SNP基因型:rsl 1778767 (A/A)、rsll780500(A/A)、rsll780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942(A/G)、rs3849942(G/G)、rs437943(A/A)、rs4562286(A/A)、rs4976592(A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359(A/A)、rs868856 (A/G)和 rs868856(G/G)，
其中 rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsll780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)或 rs868856 (G/G)中的一种或多种的存在预示所述受治疗者将会响应包括抗TNF剂的治疗。
5.一种提供预测受治疗者响应包括抗TNF剂的治疗的方法,所述方法包括: 提供获自患有免疫病症的受治疗者的生物样本；并 检测所述生物样本中一种或多种SNP基因型的存在或缺乏，其中所述一种或多种SNP基因型包括选自由以下组成的组的至少一种SNP基因型:rsl 1778767 (A/G)、rsll778767(G/G)、rsll780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A /C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455(C/C)和表13中描述的任何SNP基因型，
其中 rsl 1778767 (A/G)、rsll778767 (G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs223 9804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)或表 13 中描述的任何 SNP 基因型中一种或多种的存在预示所述受治疗者将不会响应包括抗TNF剂的治疗。
6.一种治疗免疫病症的方法，所述方法包括向需要其的受治疗者施用有效量的包括抗TNF剂的治疗，其中所述受治疗者已被鉴定为具有选自由以下组成的组的一种或多种单核苷酸多态性(SNP)基因型:rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)和rs868856 (G/G)。
7.一种组合物，其包括选择性杂交于选自由以下组成的组的至少5种基因中的每一种的至少 5 种多核苷酸:ANKIBl、ARFl、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB、C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP, PCBP2、PGKl、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGl、YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRD12、CAMK2G-、CASP5、CXorf 52, DNAHl、EEAl、FAM44A、F0XJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHU SELlL 和 SFRS2。
8.一种组合物，其包括选择性杂交于选自由以下组成的组的至少5种SNP基因型中的每一种的至少 5 种多核苷酸:rsl 1778767 (A/A)、rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209 (A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653 (G/G)、rs774359 (A/A)、rs868856 (A/G)、rs868856 (G/G)、rsl 1778767 (A/G)、rsl 1778767 (G/G)、rsll780500 (A/G)、rsl422422(A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl800896 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表 13 中描述的任何 SNP 基因型。
9.一种试剂盒，其包括: 包括结合于固相支持体的多个多核苷酸的阵列，其中所述多个多核苷酸包括选择性杂交于选自由以下组成的组的至少5种基因中的每一种的至少5种多核苷酸:ANKIB1、ARF1、ARF5、BRWD2、CALM2、CLTB, C0L4A3BP、C9orf80、EGLN2、HDAC5、LGALS9、MYLIP、PCBP2、PGKl、RBBP4、RERl、RPA3、SERF2、SLC25A39、SRGAP2、TUGU YIPF6、ZNF294、ZFP36L1、ANKRDl2,CAMK2G-、CASP5、CXorf52,DNAHl、EEAl、FAM44A、FOXJ3、HDAC4、MNT、MXRA7、PTCHl、SELlL和SFRS2 ;和 用于检测样本中所述多核苷酸的一种或多种的存在或量的说明书。
10.一种试剂盒，其包括: 包括结合于固相支持体的多个多核苷酸的阵列，其中所述多个多核苷酸包括选择性杂交于选自由以下组成的组的至少5种SNP基因型中的每一种的至少5种多核苷酸:rsl 1778767 (A/A), rsl 1780500 (A/A)、rsl 1780500 (G/G)、rsl422422 (A/A)、rsl441209(A/A)、rsl968201 (A/A)、rs2028446 (A/A)、rs2028446 (A/G)、rs2028446 (G/G)、rs2170331 (A/G)、rs2170331 (G/G)、rs2814707 (A/G)、rs2814707 (G/G)、rs3019293 (A/A)、rs3087615 (A/C)、rs3087615 (C/C)、rs3849942 (A/G)、rs3849942 (G/G)、rs437943 (A/A)、rs4562286 (A/A)、rs4976592 (A/A)、rs6531358 (A/A)、rs6665006 (A/A)、rs6665006 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs7046653(G/G)、rs774359(A/A)、rs868856(A/G)、rs868856(G/G)、rsl1778767(A/G)、rsll778767(G/G)、rsl 1780500 (A/G)、rsl422422 (A/G)、rsl422422 (G/G)、rsl441209 (A/G)、rsl441209 (G/G)、rsl968201 (A/G)、rs2170331 (A/A)、rs2814707 (A/A)、rs3019293 (A/G)、rs3019293 (G/G)、rs3849942 (A/A)、rs437943 (A/G)、rs437943 (G/G)、rs4562286 (A/G)、rs4562286 (G/G)、rs4976592 (A/G)、rs4976592 (G/G)、rs6531358 (A/G)、rs6531358 (G/G)、rs6665006 (G/G)、rs7046653 (A/A)、rs774359 (A/G)、rs774359 (G/G)、rs868856 (A/A)、rs983332 (A/C)、rs928655 (A/G)、rsl3393173 (A/G)、rs437943 (A/G)、rsl0945919 (A/G)、rs854555 (A/C)、rs854548 (A/G)、rs854547 (A/G)、rs7046653 (A/G)、rs868856 (C/T)、rs774359 (C/T)、rs2814707 (A/G)、rs3849942 (A/G)、rs6028945 (G/T)、rs6138150 (C/T)、rs6071980 (C/T)、rsl80089 6 (A/G)、rs3024490 (A/C)、rs231726 (A/G)、rs3096851 (A/C)、rs6708660 (A/G)、rs2523619 (A/G)、rs3915971 (A/G)、rs9264869 (A/G)、rs2239804 (A/G)、rs2395175 (A/G)、rs2395185 (A/C)、rs2516049 (A/G)、rs660895 (A/G)、rs7026551 (A/C)、rs4803455 (A/C)、rs983332 (A/A)、rs928655 (A/A)、rsl3393173 (A/A)、rs437943 (G/G)、rsl0945919 (G/G)、rs854555 (A/A)、rs854548 (A/A)、rs7046653 (A/A)、rs868856 (T/T)、rs774359 (C/C)、rs2814707 (A/A)、rs3849942 (A/A)、rs6028945 (T/T)、rs6138150 (T/T)、rs6071980 (C/C)、rsl800896 (A/A)、rs3024490 (A/A)、rs231726 (A/A)、rs3096851 (C/C)、rs6708660 (A/A)、rs2523619 (G/G)、rs3915971 (A/A)、rs9264869 (A/A)、rs2239804 (A/A)、rs2395175 (G/G)、rs2395185 (C/C)、rs2516049 (A/A)、rs660895 (A/A)、rs7026551 (C/C)、rs4803455 (C/C)和表13中描述的任何SNP基因型；和 用于检测样本 中所述SNP基因型的一种或多种的存在或量的说明书。
【文档编号】C12Q1/68GK103710458SQ201410012312
【公开日】2014年4月9日 申请日期:2008年6月6日 优先权日:2007年6月8日
【发明者】约翰.P.卡鲁利, 彼得.K.格雷格森, 弗拉纳克.巴特利瓦拉, 杰德维加.比恩科夫斯卡, 刘春宇 申请人:比奥根艾迪克Ma公司, 范斯坦医药研究院