1.检测马铃薯X病毒的成套试剂,由引物对X1和探针PVX-p组成;所述引物对X1由引物PVX-f和引物PVX-r组成;所述引物对X1的靶序列含有特异DNA片段;所述特异DNA片段为如下y1)或y2):
y1)序列表的序列4所示的单链DNA分子;
y2)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子;
所述探针PVX-p为20-30个核苷酸组成的单链DNA分子,与所述特异DNA片段中的部分区段相同。
2.如权利要求1所述成套试剂,其特征在于:
所述引物PVX-f为如下a1)或a2):
a1)序列表中序列1所示的单链DNA分子;
a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的单链DNA分子;
所述引物PVX-r为如下b1)或b2):
b1)序列表中序列2所示的单链DNA分子;
b2)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的单链DNA分子;
所述探针PVX-p为如下c1)或c2):
c1)序列表中序列3所示的单链DNA分子;
c2)将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列3具有相同功能的单链DNA分子。
3.如权利要求1或2所述成套试剂,其特征在于:所述探针PVX-p的末端具有荧光标记。
4.权利要求1或2所述成套试剂中的所述引物对X1。
5.c1)或c2):
c1)权利要求1至3任一所述成套试剂的制备方法,为将权利要求1至3任一所述成套试剂中的所述引物PVX-f、所述引物PVX-r和所述探针PVX-p分别单独包装;
c2)权利要求4所述引物对X1的制备方法,为将权利要求4所述引物对X1中各引物分别单独包装。
6.权利要求1至3任一所述成套试剂或权利要求4所述引物对X1的应用,为如下d1)或d2)或d3)或d4):
d1)制备用于检测或辅助检测马铃薯X病毒的试剂盒;
d2)检测或辅助检测待测样品中是否含有或疑似含有马铃薯X病毒;
d3)制备用于鉴定或辅助鉴定马铃薯X病毒的试剂盒;
d4)鉴定或辅助鉴定待测病毒是否为候选的马铃薯X病毒。
7.含有权利要求1至3任一所述成套试剂或权利要求4所述引物对X1的试剂盒。
8.权利要求7所述试剂盒的应用,为如下d2)或d4):
d2)检测或辅助检测待测样品中是否含有或疑似含有马铃薯X病毒;
d4)鉴定或辅助鉴定待测病毒是否为候选的马铃薯X病毒。
9.一种检测待测样品是否含有马铃薯X病毒的方法,为A1)或A2)或A3):
A1)以待测样品的cDNA为模板,以权利要求1至3任一所述成套试剂进行数字PCR,然后进行如下评判:如果所述成套试剂可以实现对所述cDNA的数字PCR,则待测样品中含有或疑似含有马铃薯X病毒;如果所述成套试剂不能实现对所述cDNA的数字PCR,则待测样品不含有或疑似不含有马铃薯X病毒;
A2)以待测样品的cDNA为模板,以权利要求4所述引物对X1进行PCR扩增,然后进行如下评判:如果所述引物对X1可以实现对所述cDNA的PCR扩增,则待测样品中含有或疑似含有马铃薯X病毒;如果所述引物对X1不能实现对所述cDNA的PCR扩增,则待测样品不含有或疑似不含有马铃薯X病毒;
A3)检测待测样品的cDNA中是否含有特异DNA片段,然后进行如下评判:如果待测样品的cDNA中含有特异DNA片段,则待测样品中含有或疑似含有马铃薯X病毒;如果待测样品的cDNA中不含有特异DNA片段,则待测样品不含有或疑似不含有马铃薯X病毒;
所述特异DNA片段为如下y1)或y2):
y1)序列表的序列4所示的单链DNA分子;
y2)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子。
10.一种鉴定待测病毒是否为候选的马铃薯X病毒的方法,为B1)或B2)或B3):
B1)以待测病毒的cDNA为模板,以权利要求1至3任一所述成套试剂进行数字PCR,然后进行如下评判:如果所述成套试剂可以实现对所述cDNA的数字PCR,则待测病毒为候选的马铃薯X病毒;如果所述成套试剂不能实现对所述cDNA的数字PCR,则待测病毒为候选的非马铃薯X病毒;
B2)以待测病毒的cDNA为模板,以权利要求4所述引物对X1进行PCR扩增,然后进行如下评判:如果所述引物对X1可以实现对所述cDNA的PCR扩增,则待测病毒为候选的马铃薯X病毒;如果所述引物对X1不能实现对所述cDNA的PCR扩增,则待测病毒为候选的非马铃薯X病毒;
B3)检测待测病毒的cDNA中是否含有特异DNA片段,然后进行如下评判:如果待测病毒的cDNA中含有特异DNA片段,则待测病毒为候选的马铃薯X病毒;如果待测病毒的cDNA中不含有特异DNA片段,则待测病毒为候选的非马铃薯X病毒;
所述特异DNA片段为如下y1)或y2):
y1)序列表的序列4所示的单链DNA分子;
y2)将序列4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列4具有相同功能的DNA分子。