一种低温尿嘧啶DNA糖苷酶的制备方法与流程

文档序号:14468056阅读:647来源:国知局

本发明涉及一种低温尿嘧啶dna糖苷酶的制备方法。



背景技术:

目前pcr交叉污染防治中添加的尿嘧啶dna糖苷酶来源于常温微生物,其在低温下的失活效果不明显,只能在高温加热才能失活,导致pcr过程中目的基因扩增产量低,使得基于pcr的核酸检测灵敏度降低。

目前pcr中添加的尿嘧啶dna糖苷酶来源于常温微生物,其只能在30-40度具有最高活性,同时只有在70度以上才失活。



技术实现要素:

本发明针对现有pcr检测中添加的尿嘧啶dna糖苷酶的缺陷,开发了一种低温尿嘧啶dna糖苷酶的制备方法,该方法制备出了在低温发挥活性的尿嘧啶dna糖苷酶,该尿嘧啶dna糖苷酶来自于嗜冷微生物colwelliapsychrerythraea,并经过基因改造,使得其在20-25度的温度范围内,能够有效发挥最高活性,而在高温迅速丧失活性。

为了实现上述目的,本发明的技术方案是设计一种低温尿嘧啶dna糖苷酶的制备方法,包括以下步骤:

步骤一、设计合成嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶基因,并插入pet28表达载体,构建dna连接酶的重组表达质粒;重组嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶n端带有来源于pet28载体的6个连续组氨酸亲和纯化标签,用于固定化镍离子亲和层析纯化;

步骤二,重组表达嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶;将嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶重组表达质粒转化大肠杆菌表达宿主bl21(de3),得到嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶重组表达菌株;将表达菌株培养至od600=0.6,加入0.5mm诱导剂iptg,在20℃温度下培养12小时,诱导嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶表达;

嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶重组蛋白的氨基酸序列(氮端→碳端)如seqidno:1所示。

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第三步,嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶亲和纯化;将步骤二诱导后的大肠杆菌离心收集后,菌体重新悬浮于蛋白裂解液(20mmtris-hcl,ph8.0,300mmnacl,0.5mmdtt,10vol%甘油);超声波破碎菌体,离心收集含有嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶的菌体裂解上清液;利用固定化镍离子亲和纯化树脂纯化嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶;

第四步,检测嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶活性温度依赖性;利用含du的单链dna作为底物,加入嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶,测定酶活性与温度依赖性。具体酶活性温度依赖性结果见图1。结果表明嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶在20-25内具有最高酶活性。

本发明的优点和有益效果在于:本发明为一种来自于嗜冷微生物colwelliapsychrerythraea的低温型尿嘧啶dna糖苷酶。由于该尿嘧啶dna糖苷酶来源于低温微生物,在20-25度表现最高的酶活性,而在50度加热5分钟即完全失活。显著改善了pcr的交叉污染防治效果。

附图说明

图1为基于开发的低温型尿嘧啶dna糖苷酶水解du的最优曲线。

具体实施方式

下面结合附图和实施例,对本发明的具体实施方式作进一步描述。以下实施例仅用于更加清楚地说明本发明的技术方案,而不能以此来限制本发明的保护范围。

实施例:

一种低温尿嘧啶dna糖苷酶的制备方法,包括以下步骤:

步骤一、设计合成嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶基因,并插入pet28表达载体,构建dna连接酶的重组表达质粒;重组嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶n端带有来源于pet28载体的6个连续组氨酸亲和纯化标签,用于固定化镍离子亲和层析纯化;

步骤二,重组表达嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶;将嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶重组表达质粒转化大肠杆菌表达宿主bl21(de3),得到嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶重组表达菌株;将表达菌株培养至od600=0.6,加入0.5mm诱导剂iptg,在20℃温度下培养12小时,诱导嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶表达;

嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶重组蛋白的氨基酸序列(氮端→碳端)如seqidno:1所示。

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第三步,嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶亲和纯化;将步骤二诱导后的大肠杆菌离心收集后,菌体重新悬浮于蛋白裂解液(20mmtris-hcl,ph8.0,300mmnacl,0.5mmdtt,10vol%甘油);超声波破碎菌体,离心收集含有嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶的菌体裂解上清液;利用固定化镍离子亲和纯化树脂纯化嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶;

第四步,检测嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶活性温度依赖性;利用含du的单链dna作为底物,加入嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶,测定酶活性与温度依赖性。具体酶活性温度依赖性结果见图1。结果表明嗜冷细菌colwelliapsychrerythraea尿嘧啶dna糖苷酶在20-25内具有最高酶活性。

以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明技术原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。

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