具有核苷类似物的寡核苷酸的制作方法

文档序号:32101149发布日期:2022-11-09 02:52阅读:来源:国知局

技术特征:
1.一种寡核苷酸,其包含核苷酸和一个或多个抗癌核苷类似物。2.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中所述核苷酸包含脱氧核糖核苷酸。3.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中所述核苷酸包含核糖核苷酸。4.根据权利要求1所述的寡核苷酸,其中所述核苷酸包含脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸。5.根据权利要求1至4中任一项所述的寡核苷酸,其中所述一个或多个抗癌核苷类似物连接至分子的末端。6.根据权利要求1至4中任一项所述的寡核苷酸,其中所述一个或多个抗癌核苷类似物位于分子内。7.根据权利要求1至4中任一项所述的寡核苷酸,其中所述一个或多个抗癌核苷类似物作为环连接或位于分子的2条链之间的环内。8.根据权利要求1至7中任一项所述的寡核苷酸,其中所述一个或多个抗癌核苷类似物取代了一个或多个与它或与它们为类似物的核苷酸。9.根据权利要求1至8中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸具有1至10个抗癌核苷类似物。10.根据权利要求1至9中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含sirna。11.根据权利要求1至9中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含mirna。12.根据权利要求1至9中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含反义寡核苷酸(aso)。13.根据权利要求1至9中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含dna适体或rna适体。14.根据权利要求10至12中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸靶向并沉默或降低癌细胞内特定基因的表达。15.根据权利要求10所述的寡核苷酸,其中所述sirna沉默靶标或沉默基因,所述靶标在被沉默时增强所述抗癌核苷在癌细胞内的作用,所述基因在被沉默时增强所述抗癌核苷在杀伤细胞中的作用。16.根据权利要求1至15中任一项所述的寡核苷酸,其中寡核苷酸链包含化学修饰的核苷酸以提高针对核酸酶的稳定性。17.根据权利要求16所述的寡核苷酸,其中对所述寡核苷酸的修饰是2'-0-甲基或2'-氟代或硫代磷酸酯类似物。18.根据权利要求1至17中任一项所述的寡核苷酸,其中所述抗癌核苷类似物选自吉西他滨、阿糖胞苷、5-fu、5-脱氧-5-氟尿苷、氟达拉滨、卡培他滨、克拉屈滨、曲沙他滨或氯法拉滨、氮杂胞苷和5-脱氧氮杂胞苷。19.根据权利要求1至17中任一项所述的寡核苷酸,其中所述抗癌核苷类似物包含吉西他滨。20.根据权利要求19所述的寡核苷酸,其中所述核苷酸包含含有连续多个吉西他滨核苷的polygem序列。21.根据权利要求1至20中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸靶向并沉默或降低癌细胞内特定基因的表达。
22.根据权利要求21所述的寡核苷酸,其中所述基因选自atr、atm、wee1、chk1、chk1a、chk1b、chk2、rad17、bcl2、胞苷脱氨酶和bclxl。23.根据权利要求21所述的寡核苷酸,其中所述基因是chk1或chk2。24.根据权利要求21所述的寡核苷酸,其中所述基因是chk1或rad17。25.根据权利要求1至24中任一项所述的寡核苷酸,其还包含靶向配体。26.根据权利要求25所述的寡核苷酸,其中所述配体特异于癌细胞上的受体或蛋白并且其中所述配体结合至所述细胞。27.根据权利要求26所述的寡核苷酸,其中所述受体在癌细胞上的表达水平高于在非癌细胞上。28.根据权利要求24至27中任一项所述的寡核苷酸,其中所述靶向配体选自肽、小分子、蛋白、适体、抗体、纳米抗体、scfv片段和碳水化合物部分。29.根据权利要求28所述的寡核苷酸,其中所述碳水化合物部分包含galnac。30.根据权利要求24至27中任一项所述的寡核苷酸,其中所述靶向配体包含靶向在肿瘤细胞上上调的特定受体的肽。31.根据权利要求30所述的寡核苷酸,其中所述受体包含整合蛋白受体。32.根据权利要求31所述的寡核苷酸,其中所述整合蛋白受体包含α5β3或α5β6,并且所述配体在这两种受体之间表现出不同的亲和力。33.根据权利要求32所述的寡核苷酸,其中所述靶向配体来源于口蹄疫病毒(fmv)结合肽。34.根据权利要求33所述的寡核苷酸,其中所述靶向配体包含fmdv20肽序列(navpnlrgdlqvlaqkvart)的10至20个氨基酸。35.根据权利要求34所述的寡核苷酸,其中所述肽在第一个和最后一个位置被修饰以包含d-氨基酸而不是标准的l-氨基酸({d-asn}avpnlrgdlqvlaqkvar{d-thr})。36.根据权利要求35所述的寡核苷酸,其中所述肽在分子上的某点被聚乙二醇化以提高溶解度和/或pk性质(例如peg-{d-asn}avpnlrgdlqvlaqkvar{d-thr})。37.根据权利要求36所述的寡核苷酸,其中所述肽序列共价连接至寡核苷酸-polygem分子。38.根据权利要求37所述的寡核苷酸,其中所述肽将所述寡核苷酸-polygem分子递送至过表达相关受体的哺乳动物组织或器官中的癌细胞。39.根据权利要求38所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸-polygem分子通过胞吞作用被摄入到所述癌细胞中。40.根据权利要求39所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸杀伤所述癌细胞。41.一种包含核苷酸和一个或多个抗癌核苷类似物的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含sirna、mirna、aso、dna适体或rna适体,并且所述一个或多个抗癌核苷类似物包含吉西他滨。42.根据权利要求41所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸包含sirna或mirna,并且所述一个或多个抗癌核苷类似物包含吉西他滨。43.根据权利要求41或权利要求42所述的寡核苷酸,其中一个或多个吉西他滨核苷取代所述sirna分子或所述mirna分子的序列内的胞嘧啶分子。
44.根据权利要求43所述的寡核苷酸,其中一个或多个吉西他滨核苷被掺入到所述sirna的有义链或反义链中。45.根据权利要求41或权利要求42所述的寡核苷酸,其中一个或多个吉西他滨或一个或多个其他抗癌核苷类似物在所述寡核苷酸在所述癌细胞的细胞质内降解时释放。46.根据权利要求41至45中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸是sirna并且所述吉西他滨在所述sirna的有义链上,所述有义链在所述癌细胞内的risc复合物摄取反义链时被释放到细胞质中。47.根据权利要求46所述的寡核苷酸,其中所述反义sirna链沉默目的基因。48.根据权利要求41至47中任一项所述的寡核苷酸,其中所述寡核苷酸是sirna或mirna,并且释放到细胞质中的吉西他滨增强所述sirna或mirna的沉默效应的活性,从而在所述癌细胞内产生治疗效果,例如,阻止复制或生长或积极杀伤癌细胞。49.根据权利要求41至47中任一项所述的寡核苷酸,其中所述sirna或mirna使靶标基因沉默,所述靶标基因在被沉默时增强所述吉西他滨在杀伤所述癌细胞中的作用。50.根据权利要求49所述的寡核苷酸,其中所述靶标基因选自atr、atm、wee1、chk1、chk1a、chk1b、chk2、rad17、bcl2、胞苷脱氨酶和bclxl。51.根据权利要求49所述的寡核苷酸,其中所述靶标基因是chk1或rad17。52.根据权利要求49所述的寡核苷酸,其包含使在小鼠和人细胞中具有序列同一性的chk1沉默的sirna序列,并且相较于存在于针对chk1的chk_az sirna序列上的2个胞嘧啶,所述sirna序列具有更多数量的可以被gem取代的胞嘧啶部分(序列:ss:5
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aagaaagagau[gem]uguau[gem]aau-dtdt-3':不包含gem的as链5
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auugauacagaucucuuucuu-dtdt-3’)。53.根据权利要求41至52中任一项所述的寡核苷酸,其中所述sirna分子包含以下序列:ss=5
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ccu gug gaa uag uac uua cug caa u-3’chk1 sirna有义链as=5
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a uug cag uaa gua cua uuc cac agg-3’chk1 sirna反义链。54.根据权利要求53所述的寡核苷酸,其中吉西他滨取代有义链内的选定胞嘧啶部分:ss=5
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ccu gug gaa uag ua[gem]uua[gem]ug[gem]aa u-3’([gem]取代“c”)as=5
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a uug cag uaa gua cua uuc cac agg-3’(as链上没有gem)。55.根据权利要求41至52中任一项所述的寡核苷酸,其包含针对小鼠和人的rad17基因的sirna序列,其中有义链(ss)是rad17_7(6):ss-5’ccaacaauuaugaugaaauuucuua-3’。56.根据权利要求55所述的寡核苷酸,其中所述sirna的ss上的选定

c’基团被gem部分取代,如下所示:ss-5’ccaa[gem]aauuaugaugaaauuu[gem]uua-3’。57.根据权利要求41至56中任一项所述的寡核苷酸,其中所述sirna或mirna经化学修饰并直接连接到配体上,所述配体将所述寡核苷酸靶向并递送至特定受体,然后被摄入到细胞中。58.根据权利要求57所述的寡核苷酸,其中所述靶向配体包含galnac,并且所述受体包含肝脏中肝细胞上的asgpr受体。59.根据权利要求57所述的寡核苷酸,其中所述靶向配体特异于响应治疗的肿瘤细胞,例如,胰腺癌细胞响应chk1沉默,并且其生长受到抑制;将gem添加到靶向chk1的sirna中可
以进一步增强对胰腺和其他肿瘤细胞的作用。60.一种组合物,其包含根据权利要求1至59中任一项所述的寡核苷酸和药学上可接受的载体。61.根据权利要求60所述的组合物,其中所述药学上可接受的载体包含水和一种或多种以下的盐或缓冲剂:无水磷酸二氢钾nf、氯化钠usp、七水磷酸氢二钠usp和磷酸盐缓冲盐水(pbs)。62.根据权利要求60所述的组合物,其中所述药学上可接受的载体包含一种或多种组分,其选自可生物降解的组氨酸-赖氨酸聚合物,可生物降解的聚酯,例如,聚(乳酸)(pla)、聚(乙醇酸)(pga)和聚(乳酸-共-乙醇酸)(plga),聚酰胺胺(pamam)树枝状聚合物,阳离子脂质,例如,dotap、dope、dc-chol/dope、dotma和dotma/dope,聚乙二醇化的pei和脂质,例如,lipofectamine。63.根据权利要求60所述的组合物,其中所述药学上可接受的载体包含组氨酸-赖氨酸共聚物(hkp)。64.根据权利要求63所述的组合物,其中所述hkp包含结构(r)k(r)-k(r)-(r)k(x),其中r=khhhkhhhkhhhkhhhk、k=赖氨酸和h=组氨酸。65.根据权利要求60所述的组合物,其中所述药学上可接受的载体包含支化的组氨酸-赖氨酸共聚物。66.根据权利要求65所述的组合物,其中所述支化的组氨酸-赖氨酸聚合物具有式(r)k(r)-k(r)-(r)k(x),其中r=khhhkhhhkhhhkhhhk,或r=khhhkhhhnhhhnhhhn,x=c(o)nh2,k=赖氨酸,h=组氨酸,n=天冬酰胺。67.根据权利要求60所述的组合物,其中所述药学上可接受的载体包含含有精胺-脂质偶联物(slic)和胆固醇的脂质体。68.根据权利要求60所述的组合物,其中所述药学上可接受的载体包含具有以下式的肽:式kp{[(h)n(k)m]}y或kp{[(h)n(k)m]}y-c-x-z或式kp{[(h)a(k)m(h)b(k)m(h)c(k)m(h)d(k)m]}y或kp{[(h)a(k)m(h)b(k)m(h)c(k)m(h)d(k)m]}y-c-x-z,其中k是赖氨酸,h是组氨酸,c是半胱氨酸,x是接头,z是靶向哺乳动物细胞的配体,p是0或1,n是1至5的整数、m是0至3的整数,a、b、c和d是3或4以及y是3至10的整数。69.根据权利要求68所述的组合物,其中所述药学上可接受的载体包含多肽,其含有通过可切割键交联的权利要求68所述的肽中的至少2个。70.根据权利要求60至69中任一项所述的组合物,其中所述组合物包含纳米颗粒。71.一种包含第一寡核苷酸和第二寡核苷酸的组合物,其中所述第一寡核苷酸或所述第二寡核苷酸或两种寡核苷酸包含一个或多个抗癌核苷类似物。72.根据权利要求71所述的组合物,其中所述寡核苷酸选自sirna、mirna、aso、dna适体和rna适体。73.根据权利要求71或权利要求72所述的组合物,其中所述第一寡核苷酸包含第一sirna以及所述第二寡核苷酸包含不同于所述第一sirna的第二sirna。74.根据权利要求71至73中任一项所述的组合物,其中所述sirna靶向选自atr、atm、wee1、chk1、chk1a、chk1b、chk2、rad17、bcl2、胞苷脱氨酶和bclxl的基因。75.根据权利要求74所述的组合物,其中所述第一sirna靶向chk1,所述第二sirna靶向
rad17。76.一种包含根据权利要求71至75中任一项所述的组合物的组合物,其中所述一个或多个抗癌核苷类似物如本文所述。77.根据权利要求71至76中任一项所述的组合物,其中所述一个或多个抗癌核苷类似物包含吉西他滨。78.根据权利要求71至77中任一项所述的组合物,其还包含如本文所述的靶向配体。79.根据权利要求71至78中任一项所述的组合物,其还包含如本文所述的药学上可接受的载体。80.一种杀伤哺乳动物中癌细胞的方法,所述方法包括向所述哺乳动物施用治疗有效量的根据权利要求1至59中任一项所述的寡核苷酸或根据权利要求60至79中任一项所述的组合物。81.根据权利要求80所述的方法,其中所述癌包括胰腺癌、肝癌、结肠癌、膀胱癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、卵巢癌或头颈癌。82.根据权利要求81所述的方法,其中所述肝癌包括转移性胰腺癌、肝细胞癌或转移性结肠癌。83.根据权利要求80至82中任一项所述的方法,其中所述哺乳动物是实验动物。84.根据权利要求80至82中任一项所述的方法,其中所述哺乳动物是人。85.根据权利要求80至84中任一项所述的方法,其中将所述组合物直接注射到包含所述癌细胞的肿瘤中。86.根据权利要求41至52中任一项所述的寡核苷酸,其中所述sirna分子包含序列:chk1_az ss(gem在内)5'-aagaaagagau[gem]uguau[gem]aau-dtdt-3';as链:chk1_az as(无gem)5
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auugauacagaucucuuucuu-dtdt-3’。87.根据权利要求41至52中任一项所述的寡核苷酸,其中所述sirna分子包含以下序列对之一:(a)chk1_az ss(末端gem):5'-aagaaagagaucuguaucaau[gem][gem]-dtdt-3'chk1_az as(无gem)5
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auugauacagaucucuuucuu-dtdt-3’;(b).chk1_az ss(无gem):5'-aagaaagagaucuguaucaau-dtdt-3'chk1_az as(末端gem)5
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auugauacagaucucuuuc-uu[gem][gem]dtdt-3’或(c)chk1_az ss(末端gem):5'-aagaaagagaucuguaucaau[gem] [gem]-dtdt-3'chk1_az as(末端gem)5
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auugauacagaucucuuuc-uu[gem][gem]dtdt-3’。

技术总结
提供siRNA组合物,其包含取代siRNA中胞嘧啶部分的吉西他滨(GEM)。提供含有这些siRNA分子的药物组合物,以及使用这些组合物治疗疾病(如癌症)的方法。(如癌症)的方法。


技术研发人员:D
受保护的技术使用者:圣诺制药公司
技术研发日:2020.10.02
技术公布日:2022/11/8
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