一种用于次生代谢物含量高的植物组织的dna提取方法_2

文档序号:9300514阅读:来源:国知局
μ L上清液至新的2. OmL无菌离心管,加入等体积氯仿-异戊醇 (24:1),上下颠倒100次,12000rpm室温离心20min ;
[0051] 6.吸取400 μ L上清液至新的I. 5mL无菌离心管中,加入0. 35倍体积无水乙醇,迅 速混勾,4°C放置过夜,12000rpm室温离心10min,弃上清,瞬时离心,弃上清;
[0052] 7. ImL 70%乙醇清洗沉淀两次,7500rpm离心5min,弃上清;瞬时离心,吸弃残留 液体,37°C干燥5min (或室温干燥),至DNA沉淀呈半透明状;
[0053] 8.根据DNA沉淀量加入适量含20 μ g/L RNase A的超纯水溶解DNA沉淀,37 °C消 化 30min。
[0054] 9. Nanodrop 2000 (Thermo)检测浓度,并取500ng进行琼脂糖凝胶电泳。NaNodrop 2000检测结果见表1,琼脂糖凝胶电泳见图1。
[0055] 表1检测结果
[0058] 实施例3猕猴桃叶片基因组DNA提取(多糖含量高样品)
[0059] 提取步骤与实施例2相同,NaNodrop 2000检测结果见表2,琼脂糖凝胶电泳见图 2〇
[0060] 表2检测结果
[0062] 对比例1
[0063] 本对比例与实施例2的区别在于:未经干扰物清除液处理进行DNA提取,用1/10 体积3M乙酸钠和2/3体积异丙醇进行沉淀。
[0064] NaNodrop 2000检测结果见表3,琼脂糖凝胶电泳见图3。
[0065] 表3检测结果
[0067] 从电泳图可以看出,实施例2用干扰物清除液清洗结合0. 35倍无水乙醇4°C沉淀 的方法所提取的基因组DNA条带整齐,而本对比例中相同样品由于杂质的干扰基因组DNA 在琼脂糖凝胶电泳时不能正常迀移,从而出现条带变形拖溢现象。可见,本发明提供的方法 对于杂质的去除效果非常有效。
[0068] 对比例2
[0069] 本对比例与实施例3的区别在于:利用干扰物清除液清洗三次,但用1/5体积乙酸 铵、等体积异丙醇进行沉淀。
[0070] NaNodrop 2000检测结果见表4,琼脂糖凝胶电泳见图4。
[0071] 表4检测结果
[0073] 从电泳图可以看出,实施例3用干扰物清除液清洗结合0. 35倍无水乙醇4°C沉淀 的方法所提取的基因组DNA条带整齐,而本对比例中相同样品由于多糖类杂质去除效果不 佳,导致所提DNA溶液呈现出明显粘稠状态,同时琼脂糖凝胶电泳迀移异常。可见,本发明 利用干扰物清除液结合〇. 35倍无水乙醇4°C沉淀的方法对于多糖类杂质的去除效果非常 明显。
[0074] 虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述,但在 本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因 此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
【主权项】
1. 一种用于次生代谢物含量高的植物组织的DNA提取方法,其特征在于,所述方法在 进行细胞裂解前,利用干扰物清除液对植物组织进行处理;所述干扰物清除液的组分为: IOOmM Tris-HCl(pH8.0),5mM EDTA,5%甘油,10%PEG8000,1% (6-巯基乙醇。2. 根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤: (一) 将样品在预冷的研钵中充分研磨成粉末状; (二) 加入干扰物清除液清洗,振荡离心弃上清液; (三) 加入预热的CTAB裂解液中混匀,使样品悬浮,温浴30~60min ;取出冷却至室 温,离心取上清; (四) 经氯仿-异戊醇抽提离心取上清; (五) 加入无水乙醇进行DNA沉淀; (六) 经乙醇清洗后离心得到DNA沉淀,干燥后加入含Rnase A的超纯水溶解DNA沉 淀,消化RNA。3. 根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(三)加入65°C预热的CTAB裂 解液中混匀,使样品悬浮,65°C温浴30~60min ;取出冷却至室温,离心取上清。4. 根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(二)加入干扰物清除液,振荡 离心弃上清液,重复清洗至上清液不粘稠。5. 根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(四)中氯仿与异戊醇的体积比 为 24:1。6. 根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤(五)加入相对于上清液0. 35 倍体积的无水乙醇进行DNA沉淀。7. 根据权利要求4-6任一项所述的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤: 1) 将组织样品移至预冷的研钵中,用预冷的研杵将组织充分研磨成粉末状;然后用液 氮预冷的小勺将样品粉末转移至无菌离心管中; 2) 立即加入干扰物清除液,振荡离心弃上清液,重复清洗至上清液基本不粘稠; 3) 加入65°C预热的CTAB裂解液,剧烈震动混勾,使样品完全悬浮,65°C温浴30min至 60min ;取出后,冷却至室温,室温离心取上清液至新无菌离心管中; 4) 加入氯仿-异戊醇,缓慢上下颠倒多次,室温离心; 5) 吸取上清液至新无菌离心管,加入等体积氯仿-异戊醇,上下颠倒多次,室温离心; 6) 吸取上清液至新无菌离心管中,加入无水乙醇,迅速混匀,4°C放置过夜,室温离心, 弃上清,瞬时离心,弃上清; 7) 加入70 %乙醇清洗沉淀两次,离心弃上清;瞬时离心,吸弃残留液体,干燥至DNA沉 淀呈半透明状; 8) 根据DNA沉淀量加入含20 y g/L Rnase A的超纯水溶解DNA沉淀,消化RNA。8. 根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤: 1) 将IOOmg植物组织材料移至预冷的研钵中,用预冷的研杵将组织充分研磨成粉末 状;而后用液氮预冷的小勺将样品粉末转移至2. OmL无菌离心管中; 2) 立即加入ImL干扰物清除液,振荡lmin,12000g离心10min,弃上清液,重复清洗至 上清液基本不粘桐; 3) 加入ImL 65°C预热的CTAB裂解液,剧烈震动混匀,使样品完全悬浮,65°C温浴30min 至60min ;取出后,冷却至室温,8000rpm室温离心5min,取800 Ii L上清液至新的2. OmL无 菌离心管中; 4)加入800 y L氯仿-异戊醇,缓慢上下颠倒100次,上下为1次,12000rpm室温离心 20min ; 5) 吸取600 y L上清液至新的2. OmL无菌离心管,加入等体积氯仿-异戊醇,上下颠倒 100 次,12000rpm 室温离心 20min ; 6) 吸取400 y L上清液至新的I. 5mL无菌离心管中,加入0. 35倍体积无水乙醇,迅速混 勾,4°C放置过夜,12000rpm室温离心10min,弃上清,瞬时离心,弃上清; 7. ImL 70%乙醇清洗沉淀两次,7500rpm离心5min,弃上清;瞬时离心,吸弃残留液体, 37°C或室温干燥5min,至DNA沉淀呈半透明状; 8) 根据DNA沉淀量加入适量含20 y g/L Rnase A的超纯水溶解DNA沉淀,37°C消化 30min〇9. 一种用于次生代谢物含量高的植物组织DNA提取的干扰物清除液,其特征在于,所 述干扰物清除液的组分为=IOOmM Tris-HCl,5mM EDTA,5%甘油,10% PEG8000,1 % P -巯 基乙醇。
【专利摘要】本发明涉及生物技术领域,具体提供了一种用于次生代谢物含量高的植物组织的DNA提取方法,所述方法在进行细胞裂解前,利用干扰物清除液对植物组织进行处理,并用0.35倍无水乙醇对抽提上清液进行4℃沉淀;所述干扰物清除液的组分为:100mM?Tris-HCl(pH8.0),5mM?EDTA,5%甘油,10%PEG8000,1%β-巯基乙醇。
【IPC分类】C12N15/10
【公开号】CN105018463
【申请号】CN201510303273
【发明人】郑洪坤, 刘慧 , 张蕾
【申请人】北京百迈客生物科技有限公司
【公开日】2015年11月4日
【申请日】2015年6月5日
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