专利名称：在三维生物反应器中生产来自体内的功能性白血病细胞的制作方法
技术领域：
本发明涉及细胞培养领域，而且尤其是有关培养白血病细胞的方法和组合物。
背景技术：
白血病是起始于骨髓—柔软的骨骼中心部分中造血细胞的一种癌症形式。白血病—按照字面是希腊语的“白色血液”的意思—当血液中有过量的异常白细胞时发生。在一些个体中这些被称作白细胞的细胞十分丰富，以至于血液的确有发白的色调。
在通常情况下，骨髓中的造血细胞制造白细胞以保护身体使其抵抗象病毒和细菌一类的生物体的感染。但是如果一些白细胞被破坏并且仍然是未成熟的形式，这些白细胞抗感染能力会下降，它们过量繁殖并且不像它们本应当的那样死亡。白血病细胞积聚并且使携氧的红细胞(红血球)，凝血细胞(血小板)，以及正常的白细胞减少。如果不予以治疗，过剩的白血病细胞将充满骨髓，进入血流中，并最终入侵身体的其它部分，例如淋巴结，脾脏，肝脏，和中枢神经系统(即大脑，脊髓)。因此，白血病同通常起始于实体器官并可能扩散到骨髓的其它的癌症的情况不同。
有超过12种类型的白血病，但是下面的四种类型是最常见的急性淋巴细胞性白血病(ALL)；急性髓细胞性白血病(AML)；慢性淋巴细胞性白血病(CLL)，以及慢性髓细胞性白血病(CML)。
急性白血病通常发病突然，而有一些慢性类型可能在被诊断前存在了多年。
通常白血病被认为是一种儿童期疾病。事实上，成年人的白血病患者是儿童的十倍。美国癌症学会预测1999年在美国会诊断出有大约30,200个新的白血病病例-27,900个成人和2,300个儿童。报道的成人急性白血病中最多报道的类型是急性髓细胞性白血病(AML)，并且预测在1999年有大约10,100个新病例。
30,200个最新的病例中大约有41％是慢性白血病—估计有7,800个慢性淋巴细胞性白血病(CLL)病例以及4,500个慢性髓细胞性白血病(CML)病例。另外，毛细胞性白血病(HCL)，一种缓慢发展的淋巴细胞癌，大约占到604个病例(所有白血病的2％)。悲观的估计，在1999年大约有22,100个美国成人和儿童会死于白血病。
急性髓细胞性白血病(AML)是最常见的成人白血病，每年每100,000人中有近5人感染。
慢性白血病，象许多其它癌症一样，是一种“老年疾病”。慢性淋巴细胞性白血病(CLL)患者的平均年龄约70岁，而慢性髓细胞性白血病(CML)患者的平均年龄为40到50岁。与之相反，急性淋巴细胞性白血病(ALL)绝大多数是儿童疾病，通常出现在10岁以下的儿童中。
总之，在全世界男性中白血病患者比女性患者多，尽管西方国家CLL患者的男∶女比例是最高的。
由于白血病是一种多发疾病，仍然需要新的治疗白血病的方法。因此，开发一种最接近于体内环境的体外白血病细胞培养系统变得很重要。白血病细胞在白血病患者体内比正常造血细胞具有选择性生长优势，但是体外的情况正好相反。
鼠模型被用于研究白血病以及不同的治疗方法对疾病的效果。但是，鼠和人生理学上的不同反映出鼠模型是不够的。
白血病细胞非常难于生长和维持以至于不能在体外形成集落，这一特点被用于一些髓细胞性白血病的分类；正常的细胞在体外有选择性生长优势。这种优势通过无法建立患有费城(Ph1)染色体阳性慢性髓细胞性白血病患者细胞的长期德克斯特型悬浮培养物所证明。经过几个周或几个月，具有Ph1核型的细胞数量减少直到无法测出，并且正常有丝分裂的数量增长到100％。现在利用这些情况下在体外相对没有存活能力的特点来清除人骨髓中的残留白血病细胞，从而在几天后以没有白血病细胞的自体骨髓移植形式回输到患者体内。被移植的细胞在源自骨髓环境的条件下培养，因为德克斯特培养仅仅在二维条件下支持细胞生长。
虽然倾向于在体外使正常细胞比白血病细胞生长得快或者使白血病细胞死亡，但是已经开发了一些在短期培养物中生长白血病细胞的方法。最常用的方法包括在软琼脂或甲基纤维素中形成白血病细胞集落。生长白血病细胞集落的技术首先采取在半固体培养基中培养正常造血集落形成先祖细胞的系统，然后针对白血病细胞的特殊需要进行了改进。大多数白血病集落形成的研究是有关急性非成淋巴细胞性白血病(ANLL)细胞以及原型白血病集落的测定。白血病细胞可以从外周血液，骨髓抽取物或者活组织检查中获得或者罕见地由绿色肉瘤或脾脏中获得。制备用于培养的白血病细胞的步骤必需去除可能对细胞有害的酸性肝素，去除可能抑制细胞生长的患者的血清，去除使得白血病细胞不容易看清的红细胞，以及去除可能抑制白血病细胞生长的细胞例如粒细胞。有时候，也去除掉那些可能刺激生长的细胞(例如T—淋巴细胞和单核细胞)或者可能自身形成集落从而使其与白血病集落不容易区分的细胞。
第二种方法是在悬浮培养物中培养白血病细胞。大多数白血病细胞在含胎牛血清的培养基中只能够存活几天。
最后，第三种支持白血病细胞生长的方法是将人细胞异种移植到象裸鼠眼前房一类的位置中。
现在很清楚造血细胞和白血病细胞在体内和体外的生长是集落刺激因子，生长因子，以及生长因子受体之间复杂的相互作用的结果。这些因子可以是体内血浆中存在的体液因子；它们可以是由白血病细胞自己生成的自分泌因子，也可以是依赖于造血微环境中细胞与细胞间相互作用的旁分泌因子。
已经尝试用预先建立的基质细胞支持基质来建立长期骨髓细胞培养物，其中培养物中的基质提供维持细胞长期活性增殖所必需的支持，生长因子，以及调节因子。(Naughton)等，“在悬浮尼龙滤网—基质细胞微环境中血细胞的生成”英国生物化学杂志113171-177(1991))。它部分是基于以下发现，即基质细胞在尼龙滤网模板上生长时细胞活性增殖时间比在单层系统中保持得更长。该滤网模板是平面的，基本由具有最小深度的二维基质组成，深度取决于尼龙网眼线的厚度。
一直缺少一种培养白血病细胞的一致的细胞培养系统。需要一种长期白血病细胞培养系统以鉴定白血病先祖细胞，确定调节白血病细胞增殖和分化的分子，并筛选潜在的化学治疗制剂。
本发明的目的是克服现有技术的缺陷。
发明概述本发明提供一种培养白血病细胞的方法。
本方法包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞，并在具有覆盖或包围了培养基的支架的室中培养细胞。该支架使得细胞能够在三维方向上互相接触。非强制性地，可以用白血病细胞向培养基中再接种。这一步骤也可用于产生白血病细胞。
本发明也提供了一种筛选在个体基础上筛选药物治疗白血病的效力的方法。该方法包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞，在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养细胞，其中支架使得细胞在三维方向上能够互相接触，向容器中加入检测化合物，并鉴定这种检测化合物是否抑制白血病细胞的生长。该检测化合物可以是单一的化合物，一系列化合物或化合物的组合，具有不同的检测用量和/或持续时间。本发明也包括用在测定中已经确定能够抑制白血病细胞的化合物来治疗白血病患者。
本发明进一步涉及一种鉴定与白血病细胞形成或功能相关的基因的方法。该方法包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞，在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养细胞，其中所述的支架使细胞能够在三维方向上互相接触，在检测培养物中改变一个或多个培养条件，在检测样品中鉴定白血病细胞的数量和功能，并筛选出同检测样品中白血病细胞数量或功能的变化相关的一个或多个基因。可以用许多不同的已知方法来筛选基因，例如差别基因显示，RNA任意引物(RAP)-PCR，或者基因微阵列分析。也可以通过比较支持三维细胞生长的本发明培养方法和不支持白血病细胞的传统二维德克斯特培养法之间的基因表达进行基因筛选。
本发明还提供了一种用于筛选影响白血病细胞形成的化合物的方法。该方法包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞，在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养细胞，其中支架使白血病细胞与细胞之间在三维方向上能够互相接触，向容器中加入检测化合物，取出培养的细胞，并鉴定化合物对白血病细胞的形成的影响能力。
本发明还提供了一种白血病的诊断或预后方法。该方法包括分离可能包括白血病细胞在内的单核细胞，在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养该细胞，该支架使得细胞与细胞之间在三维方向上能够互相接触以及白血病细胞能够形成，并鉴定白血病的类型和阶段。
本发明的细胞培养技术能够培养人白血病细胞。这在现有技术系统中一直是不可能的。因此，本发明的细胞培养系统在了解疾病过程，筛选潜在的治疗方法，以及阐明白血病的起因上都有作用。所以，本发明构成了现有技术中的主要进展。
附图的简要描述
图1A是一个生物反应器的可能构造的简图。在这里所绘的构造中，多孔或纤维状的支架位于培养室内。
图1B是生物反应器中用作人工支架的大孔纤维素微球体的扫描电镜照片。
图2表示慢性淋巴细胞性白血病(＂CLL＂)的生长动力学，以每一培养物(100微升/孔)的细胞产量对时间(周)的图形的形式显示。
图3是以CLL的生存力百分比对时间(周)的图形形式显示的CLL生存力。
图4是以细胞百分比对时间(周)的图形形式显示的CLL的示差分析。
图5是以AML的生存力百分比对时间(周)的形式显示的急性髓细胞性白血病(“AML”)的生存力。
图6是以每一培养物(100微升/孔)的细胞产量对时间(周)的形式显示的AML生长动力学图形。
图7是以细胞百分比对时间(周)的图形形式显示的AML的示差分析。
图8是以未成熟细胞百分比对时间(周)的条形图的形式显示的AML未成熟细胞动力学。
图9A-E显示的是第0周的的AML(即在本发明生物反应器中培养之前)。
图10A-D显示在本发明的生物反应器中培养1周后(即第一周)的AML。
图11A-D显示的是在本发明的生物反应器中培养2.3个周后(即第2.3周)的AML。
图12A-D显示的是在本发明的生物反应器中培养3.5个周后(即第3.5周)的AML。
图13A-E显示的是在本发明的生物反应器中培养4.3个周后(即第4.3周)的AML。
发明详述本发明是有关培养白血病细胞的方法。该方法包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞并在具有覆盖或包围了培养基的支架的室中培养这些细胞，支架使得白血病细胞之间能够在三维方向相互接触。
本发明也提供一种筛选影响白血病细胞形成的化合物的方法。该方法包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞，在覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养细胞，其中支架使得白血病细胞之间能够在三维分向上互相接触，向容器中加入待测化合物，取出培养的细胞，并测定待测化合物对白血病细胞形成的影响能力。
本发明还提供一种白血病的诊断或预后方法。该方法包括分离可能包括白血病细胞在内的单核细胞，在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养细胞，其中支架使得白血病细胞之间能够在三维方向上互相接触以及白血病细胞的形成，以及鉴定白血病的类型和阶段。
在这里所用的术语“白血病细胞”指的是骨髓和淋巴组织中的非正常细胞，包括例如急性髓细胞性白血病细胞，慢性淋巴细胞性白血病细胞。急性髓细胞性白血病细胞是在成熟早期阶段停止的骨髓系的异常细胞。慢性淋巴细胞性白血病细胞是在发育的成熟阶段停止的淋巴细胞系的骨髓和淋巴组织的异常细胞。这种单核细胞可以从许多不同的来源中分离，例如骨髓吸出物或者活检物，绿色肉瘤，或脾脏，外周血液，浸润的器官，组织，以及体液，脐带血，胎儿的肝脏，以及细胞系。白血病细胞优选的是哺乳动物白血病细胞。在一个更优选的实施方案中，哺乳动物白血病细胞是人白血病细胞。
根据本发明，提供了一种产生功能性白血病细胞的生物反应器系统和方法。这里所用的“功能性白血病细胞”指的是能够持续白血病状态的白血病细胞(即它们在培养中不成熟化而是保持活性功能并且其行为同在人体中一样)。本发明的生物反应器提供了一种模拟天然细胞外基质和白血病细胞的充足表面积，并且能够在类组织细胞密度下使得细胞与细胞间相互作用的三维结构。可以理解，只要提供一种三维结构，本发明的生物反应器应当有很多不同的构造。关于生物反应器，术语“三维结构”可以同术语“支架”交替使用。
用于产生功能性白血病细胞的生物反应器包括一个容器或管，它们具有至少一个放置支架的室或区域。室或容器中所用的支架可以由缠结的纤维，多孔颗粒，或海绵状的材料组成。该支架应当由选自合成聚合物，天然物质，以及半合成材料的材料所构成，该支架为可降解或不可降解。培养基放置在多孔或纤维基质上面或周围。
图1A描述了用于产生功能性白血病细胞的生物反应器可能的一种构造。在图1中，多孔或纤维支架位于较下面的培养室中。可以理解，只要提供一种三维结构(支架)，本发明的生物反应器可以有任意构型。
容器或管壁可以包括任何材料，例如玻璃，陶瓷，塑料，聚碳酸酯，乙烯基，聚乙烯基(PVC)，金属，等等。支持造血和/或佐细胞生长并分化为功能性白血病细胞的培养基被放置在多孔和/或纤维材料之上或周围。
许多不同的多孔或纤维材料可以被用作生物反应器中的支架，例如象缠结的纤维，多孔颗粒，海绵，或海绵状的材料。如果需要，多孔或纤维支架可使白血病细胞能够固定，增殖，分化。仅仅是为了举例而不是限制，很多材料都可以用于制备支架的基质，包括天然聚合物象多糖和纤维蛋白，合成聚合物象聚酰胺(尼龙)，聚酯，聚氨酯和矿物质包括陶瓷和金属，珊瑚，明胶，聚丙烯酰胺，棉花，玻璃纤维，corrageenans，以及葡聚糖。缠结纤维的例子包括玻璃棉，钢棉，以及金属丝或纤维网。
多孔颗粒的例子包括例如珠子(玻璃，塑料，或诸如此类)纤维素，琼脂，羟基磷灰石，处理过或没有处理过的骨，胶原，Sephacryl，Sephadex，Sepharose等凝胶，琼脂糖或聚丙烯酰胺。“处理过的”骨可以是经受了酸或碱溶液等不同的化学制剂的处理。这样的处理改变了骨的孔隙度。如果需要，可以在基质上覆盖细胞外基质，例如，胶原，基质胶(matrigel)，纤连蛋白，硫酸肝素，hyalumonic和硫酸软骨素，层粘连蛋白，hemonectin，或者蛋白多糖。
在生物反应器中用作支架的纤维或多孔材料形成了白血病细胞进入的开口或孔。细胞一旦进入就开始陷入或附着到纤维或多孔材料上并且形成集落和/或聚集在其上。仅仅通过将细胞接种到加有和/或包围了多孔或纤维基质的培养基中，细胞的附着或集落形成就会发生。也可以通过直接将细胞接种到多孔或纤维基质中而使细胞的附着和集落形成发生。
根据本发明，白血病细胞必须能够进入纤维或多孔材料的开口(孔)中。本领域技术人员能够知晓白血病细胞的不同大小从而使孔的大小根据这样的细胞的需要予以调整。一般来说，可用孔的范围在大约15微米到1000微米。优选地，所用孔的大小范围是约100微米到300微米。
在一个优选的实施方案中，在生物反应器中放置一个薄膜以利于气体交换。该薄膜是可透气的并且其厚度范围大约从10微米到50微米。在另一个更优选的实施方案中，膜的厚度约50微米。该薄膜放置在室或容器的底部或侧面开口上。为了防止培养基和细胞从生物反应器中过多泄漏，应当在开口处周围加上密封衬垫和/或沿着开口处或在开口处的下面放置固体平板并装配固定。
用于生物反应器中的细胞培养基可以是任何公知的用于支持骨髓细胞生长和分化并且尤其是用于造血细胞和/或佐细胞生长和分化为功能性白血病细胞的培养基。例如，可以使用下面的传统培养基并且在需要的时候添加，维生素和氨基酸溶液，血清，和/或抗生素Fisher＇s培养基(Gibco)，Eagle基本培养基(BME)，Dulbecco改进的Eagle培养基(D-MEM)，Iscoves改进的Dulbecco培养基，极限必需培养基(MEM)，McCoy′s5A培养基，以及RPM培养基。
也可以使用专用的培养基，例如MyeloCultTM(Stem Cell Technologies)和Opti-CellTM(ICN Biomedicals)。如果需要，可以用StemSpan SFEMTM(StemCellTechnologies)，StemPro 34 SFM(Life Technologies)，和Marrow-Gro(QualityBiological Inc.)一类的无血清培养基。
在一个优选的实施方案中，用添加了维生素和氨基酸溶液的大约70％ v/v的McCoy＇s 5A培养基(Gibco)。在一个更优选的实施方案中，培养基含有大约70％(v/v)的McCoy’s 5A培养基(Gibco)，大约1×10-6M的氢化可的松，大约50μg/ml的青霉素，大约50mg/ml的链霉素，大约0.2mM的L-谷氨酰胺，大约0.45％的碳酸氢钠，大约1x的MEM丙酮酸钠，大约1的MEM维生素溶液，大约0.4x的MEM氨基酸溶液，大约12.5％(v/v)的热灭活马血清和大约12.5％的热灭活的FBS，或者自体血清。如果需要可以对培养基室持续注入。
例如用移液管向生物反应器的三维支架部分缓缓加入白血病细胞进行接种。另一种方法，可以将白血病细胞加入到覆盖和域包围了培养基的三维支架中。细胞会定居或迁移到组成支架的多孔或纤维材料中。加入到生物反应器中的细胞数量取决于三维支架的总面积和培养基的体积。优选地，白血病细胞可以从这里广泛讨论过的任何来源中获得，并用象Ficol/Plaque一类的梯度离心以去除成熟的红细胞，回收单核细胞。
因为生物反应器有一个大约3/16＂高5/16＂宽5/16＂长并装有一个大约0.01g的多孔或纤维基质的培养室，加入到生物反应器中的单核细胞的数量范围可以是大约104到109个之间的任何数目。优选地，可以用4-6×106个细胞接种到生物反应器中。根据这些准则，本领域技术人员能够根据三维支架的总面积，培养基的体积，三维支架的类型，以及白血病细胞的来源来调整细胞数量以用于接种到生物反应器中。
优选地，每两天向培养物中提供含有或不含有外源生长因子的培养基。为了进一步刺激白血病细胞的生长和分化，可以向培养基中添加其它不同的成分。因此，可以向培养基中加入例如象细胞因子，粒细胞集落刺激因子，粒细胞单核细胞集落刺激因子，IL3或者IL2一类的因子。
细胞培养物能够在任何地方生长大约几天到几周。优选地，大约三周后回收培养物。
可以用许多任何已知的方法回收细胞。可以用任何合适的象胶原酶一类的试剂处理培养室，以释放附着的细胞。非附着细胞可以在其释放到培养基中时候收集起来。也可以用象振荡，搅拌等一类的物理方法从基质上去除细胞。然后，用本技术领域中任何公知的方法，例如抽吸或离心收集细胞。优选地，可以通过轻轻搅拌并混合多孔或纤维材料层以释放非附着细胞然后通过离心或沉淀来收集细胞。
如果需要，可以用公知的阳性选择方法进一步富集从生物反应器中收集的样品。因此，例如，可以将具有同白血病细胞结合的抗体的固体支持物(例如珠子)同细胞样品混合，然后，在用磁珠的情况下，利用重力或其它方法，例如磁力，收集带有结合上白血病细胞的抗体结合珠子。
在阳性或阴性选择法中，可以根据大小来过滤以进一步分离白血病细胞。但是根据本发明，从生物反应器中移去的细胞样品含有可以用于许多不同诊断和药物筛选环境并且没有进一步富集的功能性白血病细胞。
可以用任何公知的指标例如对每种白血病类型都是唯一的互不相容的表面标记染色以鉴定白血病细胞。
本发明培养的白血病细胞在治疗和制药工业中有许多用途。例如，可以用受试者白血病细胞筛选抑制或刺激白血病细胞的形成或功能的药物和治疗方法(包括免疫疗法)。
现在知道白血病是同白血病细胞过度增殖相关的。例如，白血病细胞的形成是骨髓或淋巴组织中以前正常的细胞的DNA失调的状态，这使得细胞更倾向于增殖。因此，通过本发明的分析所鉴定的白血病细胞抑制剂可以用于治疗白血病。
因此按照本发明，提供了筛选对白血病细胞形成有影响的药物的方法。这里所用的“药物”或“待测化合物”包括任何能够抑制或刺激白血病细胞的形成和功能的成分，分子，化合物，激素，生长因子，核苷酸序列(包括寡核苷酸)，蛋白质(包括多肽)，细胞，辐射以及试剂。
在一个典型的筛选影响白血病细胞产生的药物的分析中，从生物反应器中取出培养的白血病细胞并放置于带有能够维持白血病细胞生存的足够培养基或缓冲液的培养皿，烧瓶，显微镜玻片，微滴皿等等。液体培养基应当优选模拟人体的血液环境，因为这是最终药物的抑制功能起作用的地方。优选地，pH值大约为7.2，并且温度大约保持在37℃。在筛选分析中所用白血病细胞的数量取决于经验。典型地，可以用总共含有1×106个细胞的样品，这取决于细胞样品中白血病细胞的数量。
细胞样品中白血病细胞相对于其它细胞的数量应当通过用显微镜对白血病细胞或未成熟细胞的形态计数来确定。免疫组织化学染色，流式血细胞计数或其组合也可以使用。对细胞的计数方法在本技术领域是公知的。待测化合物—即要筛选作为潜在白血病细胞活性抑制剂的药物的浓度取决于经验。在筛选分析中为了确定组合物的最佳效果而调整各组合物浓度的方法对于本领域技术人员是熟知的。一般地，在进一步的研究中利用一定范围内的浓度并将去除那些对白血病细胞存活显示出严重有害影响的浓度范围部分。鉴定出对白血病细胞存活影响较小的浓度范围部分用于进一步研究对白血病形成，白血病细胞活性，或白血病细胞功能的抑制或刺激作用。
在足够抑制或刺激白血病细胞活性的条件下，将白血病细胞和待测化合物混合并温育一段时间。正如这里所定义的，足够的时间可以是从大约5分钟到几个小时或更长的任何时间。当在培养皿，烧瓶，显微镜玻片，微滴皿或类似等等中检测白血病细胞时，足够的时间可以是几分钟到几个小时。当然，如果需要，可以延长检测时间以观察对细胞的影响。本领域技术人员能够通过收集样品并用显微镜检测细胞的活性以确定进行筛选分析的最佳时间。
在反应中优选使用的缓冲液是添加有1x非必需氨基酸，1xL-谷氨酰胺，10％FBS，50 U/ml的青霉素，以及50μg/ml链霉素的无酚红MEM。在一个优选的实施方案中，检测反应体积在大约0.5和大约2ml之间。在一个更优选的实施方案中，反应体积大约为1ml。在一个优选的实施方案中，培养温度大约为37℃。
在一个供选择的实施方案中，提供了一种筛选抑制或刺激白血病细胞形成的药物的方法。在这一实施方案中，待测化合物可以直接加入到生物反应器中。该待测化合物可以加入到培养基或三维支架中。可根据经验确定加入待测化合物的时间但是相对较早。一般，对照在以没有加入待测化合物的生物反应器中进行。
待测化合物抑制白血病细胞形成的能力可以是由白血病细胞的计数，免疫组织化学染色，流式细胞仪或其组合所确定的。细胞的计数方法是本领域公知的。比较测试和对照分析的细胞计数。同对照相比较，白血病细胞数目的增加同白血病细胞形成的刺激物的鉴定相关。同对照相比较，白血病细胞数量的减少同白血病细胞形成的抑制物的鉴定相关。
然而如上所述，任何可提供的待测化合物可以用于筛选对白血病细胞的形成，活性，或功能有效的抑制剂。
在本发明的一个方面，白血病细胞分离自白血病患者，然后用本发明的方法培养这些细胞。然后用待测化合物处理这些培养细胞以鉴定出哪种化合物在治疗白血病中特别有效。以这些测试步骤为基础，给患者服用最为有效的待测化合物以抑制白血病患者的白血病细胞生长。
本发明提供了一种支持患者白血病细胞在培养物中生长的方法，从而为免疫治疗目的提供白血病抗原。这些例子包括供体淋巴细胞注入和树突细胞治疗。
本发明还提供了一种鉴定同白血病细胞的形成或功能相关的基因的方法。在本发明的这一方面，可以改变不同的培养条件参数(例如，营养成分(包括白血病细胞制剂，温度，氧气浓度，CO2浓度，以及营养组分)，细胞因子环境，细胞内容物，以及受体的抑制，信号传递或附着分子。改变一个或更多参数后，白血病细胞数目和功能可以被确定。可以通过形态学，免疫组织化学，或流式细胞仪确定白血病细胞数目。如果当与对照相比的时候，待测样品的白血病细胞数目和功能发生了变化，那么这一系统可以用于进一步筛选引起改变的一个或多个基因。可以用差别基因显示的改进方法，例如RNA任意引物(RAP)-PCR技术或微基因阵列分析进一步识别并鉴定相关基因。这些方法是本领域公知的。另外，同不能支持白血病细胞的二维德克斯特培养法相比较，它可以用于筛选基因。另外，可以通过克隆由纯化的或富集的受试者白血病细胞表达的基因来鉴定同待测样品的白血病细胞相关的基因。
下面的具体的实施例是对本发明进一步说明而不是以任何方式限制本发明的范围。
实施例实施例1-生物反应器的制备生物反应器是用聚碳酸酯板制备的(图1A)。培养室(3/16＂高x 5/16＂宽x5/16＂长)装有0.01g的多孔微载体。微载体填充层覆盖有培养基。培养基室(1/2＂高x5/16＂宽x12/16＂长)含有0.6ml的培养基。用TeflonTM膜(50μm厚)促进气体交换。
在整个试验过程中用CellsnowTM-EX，L型(低离子电)大孔纤维素微载体(Kirin，日本；直径1-2mm；100-200μm孔径；95％气孔率)作为人骨髓细胞人工支架。(图1B)实施例2-人骨髓制备根据Rochester大学研究项目评论委员会的说明，从志愿者的髂嵴中抽取骨髓，用McCoy＇s 5A培养基(Gibco，Grand Island，纽约)以1∶1的比例稀释，涂布到Ficol/Paque上(Pharmacia，Piscataway，纽约，密度1.027g/ml)，并在200g下离心30分钟。收集单核细胞层，洗涤三次，并用于接种到生物反应器中。根据需要留出一部分细胞用于各种分析。
实施例3-三维长期人骨髓培养物通过移液管将适量(每个培养室4-6×106个细胞)的单核细胞移到生物反应器的多孔微载体部分以接种培养物。培养物在潮湿的CO2温育箱中(含有5％的CO2)于37℃下培养。LTBMC培养基(每日更换)是由70％(v/v)McCoy＇s5A培养基(Gibco)，1×10-6M的氢化可的松(Sigma，St.Louis，MO)，50μ/ml青霉素(Sigma)，50mg/ml链霉素(Sigma)，0.2mM的L-谷氨酰胺(Gibco)，0.045％的碳酸氢钠(Sigma)，1xMEM丙酮酸钠(Gibco)，1xMEM维生素溶液(Gibco)，0.4xMEM氨基酸溶液(Gibco)，12.5％(v/v)热灭活马血清(Gibco)，以及12.5％热灭活的FBS(Gibco)组成。前两周，每隔两天用完全培养基培养该培养物。第二周后，通过轻轻搅拌并混合多孔微球体层以释放未附着的细胞而使培养物细胞减少(50微升/孔)。用锥虫蓝染料(Sigma)排斥法和血细胞计数器来确定未附着细胞中的活细胞数。每周通过缓慢移液收集培养物并在第四周和第五周之间杀死培养物以进行各种分析。
实施例4-差别细胞分析从人骨髓细胞中获得的未附着细胞的细胞旋转(cytospin)玻片是用细胞旋转离心机(Shandon，Sewickly，PA)在500rpm下对20,000个细胞/玻片的细胞旋转(cytospin)漏斗离心5分钟而制备的。在用瑞特染液(Geometric Data，Wayne，PA)染色前15分钟将细胞风干，接着用蒸馏水洗涤1分钟。通过计数每个样品的超过100个细胞进行差别细胞计数。对于每种培养条件，建立了六到九种完全相同的培养物。Lefkovits，I.ed.免疫学方法年报综合技术参考资料，学院出版社，圣地亚哥(1997)，在此引入作为参考。
实施例5-细胞形态学鉴定从生物反应器中去除支架和其中的细胞并包埋于2％的Bacto琼脂中(Gibco)。然后在10％的中性福尔马林缓冲液中(Fisher，Pittsburgh，PA)固定至少一小时。然后用石蜡浸润支架和细胞。Humason，G.L.，动物组织技术W.H.Freeman公司，旧金山(1967)，在此引入作为参考。三维骨髓细胞石蜡薄切片被连续切割成4-5μm厚的切片并封固在化学包被的玻片上。用二甲苯，100％的乙醇，95％的乙醇，以及70％的乙醇去除石蜡薄切片的石蜡，接着用自来水清洗。然后用Mayers苏木精—曙红对薄切片染色并用显微镜检测以鉴定细胞形态。
实施例6-慢性淋巴细胞性白血病细胞根据实施例1-3分离来自慢性淋巴细胞白血病个体的单核细胞并放置于生物反应器中。在没有外源生长因子的情况下这些细胞保持细胞产量，图2说明了观察到的细胞产量(每周和累积)。在整个培养过程中，产出细胞的存活力保持在75％以上，如图3所示。差别细胞分析表明，在最初的第一周下降后，淋巴细胞总数保持恒定(图4)。另外，在第4.5周杀死的生物反应器培养物中的石蜡薄切片中观察到了恶性淋巴样组分，这同在患者骨髓活检物中观察到的情况类似。在培养物中的石蜡薄切片中观察到了大量的基质细胞发育。
实施例7-急性髓细胞性白血病细胞根据实施例1-3从急性髓细胞性白血病患者中分离单核细胞并放置于生物反应器中。在没有外源生长因子的情况下，如图6所示的生物反应器细胞产量动力学说明这些细胞在三维生物反应器中保持活性。如图5所示在整个培养过程中，产出细胞的存活力保持在80-85％以上。差别细胞动力学分析表明粒细胞总数在整个培养过程中的保持(图7)。如图8所示，在整个培养过程期间，经过第一周期最初的下降后，骨髓型白血病未成熟细胞开始出现。在整个培养阶段出现的有丝分裂的未成熟细胞，说明急性髓细胞性白血病细胞培养物增殖活跃。图9显示了在培养物接种之前第0周的细胞旋转制品。根据较高的细胞核对细胞质的比例以及核仁的出现可以鉴定出白血病未成熟细胞。图10和11分别显示了在培养一周和两周后的细胞旋转制品。白血病未成熟细胞显著持久生存。图12和13显示了培养3.5和4.3周后的旋转细胞制品。根据有丝分裂图说明在生物反应器培养物中存在分裂活跃的细胞。而且白血病未成熟细胞显著持久生存。
虽然为了说明的目的，已经对本发明做出了详细的描述，可以理解这种详述仅仅是为了这一目的，本领域技术人员可以在不背离本发明宗旨并且不脱离下面权利要求所规定的范围内在其中做出各种改变。
权利要求
1.一种培养白血病细胞的方法，包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞并在具有被培养基覆盖或包围的支架的室中培养，其中所述的支架使得白血病细胞之间能够在三维方向上相互接触。
2.根据权利要求1的方法，其中的白血病细胞是哺乳动物白血病细胞。
3.根据权利要求1的方法，其中的哺乳动物白血病细胞是人白血病细胞。
4.根据权利要求1的方法，其中的白血病细胞是急性骨髓性细胞。
5.根据权利要求1的方法，其中的白血病细胞是慢性淋巴细胞性白血病细胞。
6.根据权利要求1的方法，其中的支架选自缠结纤维，多孔颗粒，海绵，海绵样材料及其组合。
7.根据权利要求1的方法，其中的支架由选自金属，玻璃，陶瓷，塑料，羟基磷灰石，处理过的或未处理过的骨，合成的聚合物，天然物质，半合成材料及其组合的材料形成。
8.根据权利要求7的方法，其中的材料是可降解的。
9.根据权利要求7的方法，其中的材料是不可降解的。
10.根据权利要求1的方法，其中的培养基含有外源生长因子。
11.根据权利要求1的方法，其中的培养基包含粒细胞集落刺激因子，粒细胞单核细胞集落刺激因子，IL3或IL2。
12.根据权利要求1的方法，进一步包括用单核细胞再次接种室。
13.根据权利要求1的方法，其中的单核细胞是从白血病患者分离的并且所述的方法进一步包括从培养基中去除白血病细胞并将培养基中剩余的细胞移植给患者。
14.根据权利要求1的方法，其中的单核细胞来自外周血液，骨髓抽出物或活检物，绿色肉瘤，或脾脏。
15.根据权利要求1的方法培养的白血病细胞。
16.一种筛选药物治疗白血病的效力的方法，包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞；在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养这些细胞，其中所述的支架能够使细胞和细胞在三维方向上相互接触；将待测化合物加入到容器中；以及确定该待测化合物能否抑制白血病细胞的生长。
17.根据权利要求16的方法，其中的白血病细胞是哺乳动物白血病细胞。
18.根据权利要求17的方法，其中的哺乳动物白血病细胞是人细胞。
19.根据权利要求16的方法，其中的白血病细胞是慢性淋巴细胞性白血病细胞。
20.根据权利要求16的方法，其中的白血病细胞是急性髓细胞性白血病细胞。
21.根据权利要求16的方法，其中的待测化合物杀死白血病细胞。
22.根据权利要求16的方法，其中的支架选自缠结纤维，多孔颗粒，海绵，海绵状材料及其组合。
23.根据权利要求16的方法，其中的支架由选自金属，玻璃，陶瓷，塑料，羟磷灰石，处理过的或未处理过的骨，合成的聚合物，天然物质，半合成材料或其组合的材料形成。
24.根据权利要求23的方法，其中的材料是可降解的。
25.根据权利要求23的方法，其中的材料是不可降解的。
26.根据权利要求16的方法，其中的培养基含有外源生长因子。
27.根据权利要求16的方法，其中的白血病细胞分离自白血病患者并且所述方法进一步包括给白血病患者服用鉴定出的抑制白血病细胞生长的待测化合物。
28.根据权利要求16的方法，其中的单核细胞来自外周血液，骨髓抽出物或活检物，绿色肉瘤，或脾脏。
29.一种鉴定与白血病细胞的形成或功能相关的基因的方法，包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞；在具有覆盖或包围了培养基的支架的室中培养这些细胞，其中所述的支架使细胞和细胞之间能够在三维方向上相互接触；在测试培养物中改变一种或多种培养条件；测定测试样品中白血病细胞的数目和功能；以及筛选测试样品中与白血病细胞数目或功能的改变相关的一个或多个基因。
30.根据权利要求29的方法，其中白血病细胞数目是用免疫组织化学，细胞形态学，以及流式细胞仪所测定。
31.根据权利要求29的方法，其中筛选同白血病细胞数目或功能的改变相关的一个或多个基因的方法至少是差别基因显示，RNA任意引物(RAP)-PCR，基因微阵列分析，或者同不能支持白血病细胞的二维德克斯特培养法相比较的方法之一。
32.一种筛选影响白血病细胞形成的化合物的方法，包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞；在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养这些细胞，其中所述的支架使细胞和细胞之间能够在三维方向上相互接触；将待测化合物加入到容器中；取出培养的细胞；并测定待测化合物影响白血病细胞形成的能力。
33.权利要求32的方法，其中的待测化合物影响白血病细胞形成的能力是通过白血病细胞计数，免疫组织化学，流式细胞仪，或其组合测定的。
34.权利要求33的方法，其中的待测化合物刺激白血病细胞形成。
35.权利要求32的方法，其中的待测化合物抑制白血病细胞形成。
36.根据权利要求32的方法，其中的白血病细胞是哺乳动物白血病细胞。
37.根据权利要求36的方法，其中的哺乳动物白血病细胞是人白血病细胞。
38.根据权利要求32的方法，其中的支架是选自由缠结纤维，多孔颗粒，海绵，海绵状材料，及其组合。
39.根据权利要求32的方法，其中的支架由选自金属，玻璃，陶瓷，塑料，羟基磷灰石，处理过的或未处理过的骨，合成的聚合物，天然物质，半合成材料及其组合的材料形成。
40.根据权利要求39的方法，其中的材料是可降解的。
41.根据权利要求39的方法，其中的材料是不可降解的。
42.根据权利要求32的方法，其中的培养基包含粒细胞集落刺激因子，粒细胞单核细胞集落刺激因子，IL3，或IL2。
43.根据权利要求32的方法，进一步包括在容器中再次接种白血病细胞。
44.一种诊断或预防白血病的方法，包括分离可能包括白血病细胞在内的单核细胞；在具有覆盖或包围了培养基的支架的容器中培养这些细胞，其中的支架使得细胞和细胞之间能够在三维方向上相互接触以及白血病细胞能够形成；以及鉴定白血病的类型和阶段。
45.根据权利要求44的方法，其中的白血病细胞是哺乳动物白血病细胞。
46.根据权利要求45的方法，其中哺乳动物白血病细胞是人白血病细胞。
47.根据权利要求44的方法，其中的白血病细胞是急性骨髓细胞。
48.根据权利要求44的方法，其中的白血病细胞是慢性淋巴细胞性白血病细胞。
49.根据权利要求44的方法，其中的支架选自缠结纤维，多孔颗粒，海绵，海绵状材料，及其组合。
50.根据权利要求44的方法，其中的支架由选自金属，玻璃，陶瓷，塑料，羟基磷灰石，处理过的或未处理过的骨，合成的聚合物，天然物质，半合成材料及其组合的材料形成。
51.根据权利要求44的方法，其中的材料是可降解的。
52.根据权利要求44的方法，其中的材料是不可降解的。
53.根据权利要求44的方法，其中的培养基包含外源生长因子。
54.根据权利要求44的方法，其中的培养基包含粒细胞集落刺激因子，粒细胞单核细胞集落刺激因子，IL3，或IL2。
55.根据权利要求44的方法，其中的单核细胞来自外周血液，骨髓抽出物或活检物，绿色肉瘤，或者脾脏。
全文摘要
本发明提供了培养的白血病细胞。该方法包括分离包括白血病细胞在内的单核细胞在具有覆盖或包围了培养基的支架的室中培养这些白血病细胞，其中的支架使白血病细胞之间能够在三维方向上互相接触。受试者的白血病细胞可用于筛选抑制或刺激白血病细胞的功能或形成的化合物。
文档编号G01N33/50GK1471586SQ01805928
公开日2004年1月28日 申请日期2001年3月1日 优先权日2000年3月2日
发明者J·H·D·吴, A·曼塔拉里斯, N·帕诺斯卡尔蒂斯, J H D 吴, 邓箍ǘ 偎, 锼 申请人:罗切斯特大学