用于靶向c-rel的方法和组合物的制作方法

文档序号:438576阅读:10889来源:国知局

专利名称::用于靶向c-rel的方法和组合物的制作方法
技术领域
:本发明涉及用于靶向c-Rel的组合物和方法。特别地,本发明提供了通过抑制c-Rel活性,引起免疫耐受用于治疗癌症、自身免疫病、过敏症、炎性疾病、移植排斥和骨丟失,以及用于调节c-Rel用于研究和药物筛选应用的组合物和方法。本发明还涉及如通过测定c-Rel介导的生物活性确定的筛选c-Re1活性抑制剂的方法。
背景技术
:许多人疾病包括炎症、自身免疫病和癌症归于转录因子的异常激活,这导致失调的靶基因表达和新生物活性的证据以及存活或增殖优势。在转录因子领域,NF-kb作为涉及众多生物学功能和病理学状况的转录因子已吸引了重要注意,所述生物学功能和病理学状况包括针对感染、炎症、细胞存活和肿瘤发生的固有性和适应性免疫应答的调节。NF-kB涉及最初在1990's早期由Dr.DavidBaltimore的团体在MIT的WhiteheadInstitute分离的p50(NF-kBl)和p65(RelA)亚单位。发现3种其他蛋白质——c-Rel、RelB和p52(NF-kB2)共享在Rel同源结构域(RHD)上的序列同源性。因此,这5种蛋白质分类为Rel转录因子家族。尽管存在相似性,但每个Rel成员就組织表达模式、对受体信号的应答和靶基因特异性而言是不同的。这些差异根据由单个Rel敲除小鼠显示的非冗余表型是显而易见的。因此,靶向不同Rel成员的疗法具有不同的生物效应和安全/毒性概况。c-Rel不同于NF-kB(p50,p65)。c-Rel是由禽类REV-T逆转录病毒编码的v-Rel癌基因的细胞同系物。与在机体的所有细胞中遍在表达的NF-kBp50和p65不同,c-Rel专有地表达于造血起源的细胞中,包括T细胞、B细胞、巨噬细胞和树突状细胞。此外,c-Rel和NF-kb调节不同细胞中的不同把基因组。因此,它们具有不同的生物学功能。c-Rel是许多炎症和自身免疫病中的关键肇事者(culprit)。用于炎症、自身免疫病、移植的抗炎症和免疫抑制疗法在过去数十年中已经历革命性发展。用于治疗自身免疫/炎性病症的症状的早期疗法依赖糖皮质激素或皮质类固醇一一在195(Ks发现的来自肾上腺髓质的激素。糖皮质激素在消除几乎所有炎性病症中的炎症体征和症状以及所产生的免疫病理学中特别有效,所述炎性病症包括类风湿性关节炎、津喘、特应性皮炎、炎性肠病、多发性硬化症、移植排斥、移植物抗宿主(GvH)病、和器官特异性自身免疫病例如甲状腺炎和糖尿病。不幸的是,皮质类固醇引起影响几乎所有器官系统的严重的全身性副作用,并且这妨碍其长期施用。因此,皮质类固醇可能"治愈"慢性自身免疫和炎性疾病的愉悦甚至在1960s前就快速消散了。慢性炎性病症例如类风湿性关节炎的症状的减轻是分类为非甾体类抗炎药(NSAIDs)的药物。然而,这些试剂中的许多的长期使用可以引起胃肠(GI)出血。在1990s开发了被称为Cox2(Vioxx、Celebrex、Bextra)的选择性抑制剂的新类药物,以治疗疼痛和炎症但避免NSAID对GI道的副作用。NSAID和Cox2抑制剂对于自身免疫病患者仅治疗症状和緩解疼痛。然而,这些药物不能制止疾病过程的进展。在2004年,由于增加的心脏病发作发病率,Vioxx被逐出市场。黑盒标记也置于Bextra上。随后,随着心血管危险在这类药物中变得常见,所有Cox2抑制剂药物的销售显著下降。在1990年开发了阻断肺瘤坏死因子(TNF)——炎症细胞因子的新类生物学。这个类另'J中的3种药物--Enbrel、Remicade和Humira16在减慢由类风湿性关节炎引起的关节损伤中已具有主要影响,并且药物之一也被批准用于治疗银屑病、克罗恩氏病和强直性脊柱炎。尽管这些新生物学药物具有比类固醇少的副作用,但它们非常昂贵且与感染和某些癌症的危险相关。此外,由于中和抗体的产生,30-35%患者随着时间过去变得抗拒抗TNF疗法。这些事实使得对于备选的安全和有效疗法的需要变得显而易见,所述疗法还可提供用于治疗炎症和自身免疫病。如由TNF阻断类药物的成功暗示的,靶向涉及自身免疫的核心疾病机制的特异性细胞蛋白质的疗法是最希望的,因为此类疗法将减慢疾病进展。基于c-Rel在免疫细胞中的基本功能,c-Rel阻断进一步在其他病理学状况的治疗中找到用途,包括炎症、自身免疫病、骨丢失、移植排斥、淋巴瘤和实体瘤。癌症仍是不治之症。大多数目前的癌症疗法例如化学疗法具有广泛的细胞靶且对患者显示不能忍受的副作用。格列卫在CML及其他相关癌症中的成功已证明下述原则只要鉴定了致癌靶,就可以达到靶向疗法。c-Rel首先在儿童中表征为原癌基因。随后,c-Rel基因扩增或组成性激活已在许多人B细胞白血病、淋巴瘤、以及衍生自实体组织的肿瘤中得到证明。因此,c-Rel是关于具有过度反应的c-Rel或NF-kB活性的人癌症的新治疗靶。发明概述本发明涉及用于靶向c-Rel的组合物和方法。特别地,本发明提供了通过抑制c-Rel活性,引起免疫耐受和用于调节c-Rel用于治疗癌症、自身免疫病、过敏症、炎性疾病、移植排斥和骨丢失的组合物和方法用于研究和药物筛选应用。本发明还涉及如通过测定c-Rel介导的生物活性确定的筛选c-Re1活性抑制剂的方法。因此,本发明提供了用于靶向c-Rel作为用于炎性病症和肿瘤的治疗靶,以及用于诱导免疫耐受用于治疗自身免疫病和移植排斥的方法和組合物。例如,在某些实施方案中,本发明提供了用于在抑制c-Rel或c-Re1信号配偶体活性中使用的c-Re1活性抑制剂(例如,反义、siRNA、适体、抗体、肽、拟肽、小分子和天然化合物)。此类抑制剂在癌症、自身免疫、移植排斥和炎性疾病的治疗中以及研究和药物筛选应用中找到用途。例如,在某些实施方案中,本发明提供了减少c-Rel活性的方法,其包括使表达c-Rel基因的细胞与c-Rel活性抑制剂接触。在某些实施方案中,c-Rel活性抑制剂是反义寡核苷酸、siRNA(例如SEQIDN0s:6、10、13、16或17-26)、适体、肽、拟肽或抗体。在其他实施方案中,c-Rel活性抑制剂是天然化合物或小分子。在某些实施方案中,小分子具有式l或式2的结构其中Ri、R2、Rs和R6独立地选自氢,芳基,取代芳基,烷基,取代烷基,烯基,取代烯基,炔基,取代炔基,g代烷基,卣代烯基,面代炔基,芳基烷基,芳基烯基,芳基炔基,杂环芳香族或非芳香族,取代杂环芳香族或非芳香族,环烷基,取代环烷基;R3选自氢,芳基,取代芳基,烷基,取代烷基,烯基,取代烯基,炔基,取代炔基,卤代烷基,卣代烯基,g代炔基,芳基烷基,芳基烯基,芳基炔基,杂环芳香族或非芳香族,取代杂环芳香族或非芳香族,环烷基,取代环烷基,卣素,CN,N0"S。2Ru,NRUR!2,NR12(CO)OR",NH(CO)NRUR12,NR12(CO)R,0(CO)Ru,0(CO)0RU,0(CS)Ru,NR12(CS)R,NH(CS)NRR12,NR12(CS)ORn;其中Ru和Ru独立地选自氢,芳基,芳烷基,取代芳烷基,烷基,取代烷基,烯基,取代烯基,炔基,取代炔基,卣代烷基,卣代烯基,卣代炔基,芳基烷基,芳基烯基,芳基炔基,杂环芳香族或非芳香族,取代杂环芳香族或非芳香族,环烷基,取代环烷基。优选的R3基团选自芳基、取代芳基、杂环芳香族或非芳香族、取18代杂环芳香族或非芳香族。例如,其中X选自0、S、NH、冊7。114独立地选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卤代烯基、卣代烯基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基、卤素、CN、N02、S02Ru、NRnR12、NR12(CO)0Ru、NH(CO)NRUR12、NR12(CO)Ru、0(CO)Rn、0(CO)0RU、0(CS)Ru、NR12(CS)Rn、NH(CS)NRR12、NR12(CS)OR!!,并且其中R7、R和R12独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、囟代烯基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环芳基、取代环烷基。在某些实施方案中,小分子具有下述结构其中Ri和R2独立地选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、闺代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基、卣素、0H、0RU、SH、SRU、N02、CN、S02Ru、NRUR12、NR12(CO)0RU、NH(CO)NRR12、NR12(CO)R、0(CO)R、0(CO)0R、0(CS)Ru、NR12(CS)Ru、NH(CS)NRUR12、NR12(CS)0Ru。Ru和Ru独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卤代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。Ru和Ru可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族、环芳基、取代环烷基。R3和R,独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、囟代烷基、卣代烯基、囟代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。113和R4可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族、环芳基、取代环烷基。在某些实施方案中,小分子包含下式其中X和Y独立地选自NH、NR4、0和S。R!、112和114独立地选自氢、芳基、烷基、取代烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基彿基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。^和R2可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环、取代杂环、环芳基、取代环烷基。Rs选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、离代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基、卣素、C0Ru、0H、0R、SH、SRU、N02、CN、S02Ru、NRUR12、NR12(CO)0Rn、NH(CO)NRUR12、NR12(CO)Ru、0(CO)R"、0(CO)0R、0(CS)Ru、NR12(CS)Ru、NH(CS)NRR12、NR12(CS)0R。Ru和Ru独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、面代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。Ru和Ru可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族、环芳基、取代环烷基。示例性化合物包括但不限于1,3-二甲基-5-{3-[2-(4-硝基苯氧基)乙氧基]苯亚甲基}-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,1,3-二甲基一5-[3-(2-苯氧基乙氧基)苯亚甲基]-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,[3-[(四氢-l-甲基-2,4,6-三氧代-5(2H)-嘧啶基亚基)甲基]苯氧基]-乙酸,4-[(四氢-1-甲基-2,4,6-三氧代-5(2H)-嘧啶基亚基)曱基]-苯曱酸,5-[3-溴-4"(二甲基氨基)苯亚甲基]-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,5-[[4-(二甲基氨基)-3-硝基苯基]亚甲基]-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,5-[(5-氯-2-甲氧基苯基)亚甲基]-l,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,5-[[2-[(2-氯苯基)甲氧基]苯基]亚甲基]-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,5-[[3-[(2-氯苯基)甲氧基]苯基]亚甲基]-1,3-二曱基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,5-[[2-[(4-氯苯基)曱氧基]苯基]亚甲基]-1,3-二甲基-2,4,6(1H,3H,5H)-嘧咬三酮,2,4,6(1H,3H,5H)-嘧咬三酮,5,-(1,4-亚苯基二次甲基)双-(9CI)或巴比妥酸,5,5'-(p-亚苯基二次曱基)二-(8CI);5,5'-对二甲苯二亚基双(巴比妥酸)苄腈,2-[2-甲氧基-4-[(四氢-1,3-二甲基-2,4,6-三氧代-5(2H)-嘧啶基亚基)甲基]苯氧基]-5-硝基-(9CI)2,4,6(1H,3H,5H)-嘧啶三酮,或5-[[3-氯-5-甲氧基-4-[2-(4-甲基苯氧基)乙氧基]苯基]亚甲基]-(9CI)。在其他实施方案中,小分子是lH-吡唑-l-丁酸,3-(4-溴苯基)-5-(1,2-二氢-7-甲基-2-氧代-3-喹啉基)-4,5-二氢-g-氧代-(9CI)1,5-萘二磺酸,3-(4,5-二氢-3-甲基-5-氧代-lH-吡唑-l-基)-1,3-萘二磺酸,7-(3-甲基-5-氧代-2-吡咯啉-l-基)-(8CI)丁二酸,或[5-[(4-羟基-3-甲氧基苯基)亚甲基]-4-氧代-2-硫代-3-噻唑烷基]。在再进一步的实施方案中,小分子是4-羟基-2-氧代-l,2-二氢喹啉-3-羧酸N-(4-羟基苯基)酰胺或7-(二乙氨基)-3-[5-(2,5-二甲氧基苯胺基)-1,3,4-漆二唑-2-基]-2H-氧萘-2-酮。在某些实施方案中,细胞是人细胞、癌细胞、B淋巴细胞、T淋巴细胞、抗原呈递细胞或炎症细胞。在某些实施方案中,细胞是生物(例如,人或非人哺乳动物)。在某些实施方案中,人显示出癌症(例如,表l中描述的那些)的症状。在其他实施方案中,人显示过敏症、炎症或自身免疫病(例如,表l中描述的那些)的症状。在再进一步的实施方案中,人已经历器官移植(例如,表l中描述的那些)。21在某些实施方案中,c-Rel的抑制导致选自细胞生长停止、凋亡、免疫抑制和免疫耐受诱导的表型。在某些实施方案中,抑制c-Rel活性包含减少c-Rel与c-Rel靶基因上的c-Rel识别位点的结合。在其他实施方案中,抑制c-Rel活性包含阻断c-Rel与选自c-Rel转录辅激活物、转录介质或其他转录因子的试剂的相互作用。在另外其他的实施方案中,抑制c-Rel活性包含阻止经由选自上游信号分子、辅因子或酶的试剂的c-Rel修饰。在再进一步的实施方案中,抑制c-Rel活性包含使c-Rel结构构象改变成灭活状态。本发明进一步包含抑制c-Rel靶基因(例如,可溶因子、细胞因子、细胞周期调节剂和细胞存活蛋白质)表达的方法,其包括使表达c-Rel基因的真核细胞与c-Rel活性抑制剂接触。本发明另外提供了方法,其包括使显示异常信号效应的真核细胞与c-Rel活性抑制剂在这样的条件下接触,使得异常信号效应减少,其中所述异常信号效应导致改变的c-Rel活性(例如,增加的活性或减少的活性)。本发明还提供了用于修饰细胞外信号对真核细胞的影响的方法,其中所述细胞外信号诱导c-Rel介导的生物活性,所述方法包括使细胞与c-Rel活性抑制剂在这样的条件下接触,使得异常信号效应减少。在某些实施方案中,本发明提供了治疗由过量c-Rel活性引起的疾病的方法,其包括给显示疾病症状的受试者施用c-Rel活性抑制剂。在某些实施方案中,疾病是炎性疾病(例如,急性呼吸窘迫、脓毒症、肝炎、结肠炎、炎性肠病、缺血-再灌注损伤或动脉粥样硬化),自身免疫病(淋巴组织增生病、全身性红斑狼疮、类风湿性关节炎、多发性硬化症或强直性脊柱炎),骨丟失(例如,衍生自关节炎的骨丢失、衍生自炎症的骨丢失、或衍生自自身免疫病的骨丢失),器官移植排斥(移植物抗宿主病或骨髓移植排斥),免疫疗法(例如,免疫耐受的诱导),和癌症(例如,B细胞淋巴瘤、伯基特氏淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病、多发性骨髓瘤、具有Pten突变的淋巴瘤、具有Pten突变的白血病、考登氏综合征、具有Pten突变的肿瘤、前列腺癌、乳腺癌、转移性肿瘤肝细胞癌、结肠癌或胃肠癌)。本发明另外提供了治疗由c-Rel靶基因的异常表达引起的疾病的方法,其包括给显示疾病(例如,本文公开的那些疾病)症状的受试者施用c-Rel活性抑制剂。本发明进一步提供了包含在药学上可接受的载体中的c-Rel活性抑制剂的试剂盒。在某些实施方案中,c-Rel活性抑制剂是反义寡核苷酸、siRNA(例如,SEQIDN0:6、10、13、16或17-26)、适体、肽、拟肽或抗体。在其他实施方案中,c-Rel活性抑制剂是天然化合物或小分子。在某些实施方案中,小分子具有如上所述的结构。本发明还提供了包含小分子的组合物,其中小分子具有如上所述的结构。本发明还提供了包含用于调节c-Rel活性的siRM的组合物。在某些实施方案中,siRNA具有SEQIDN0s:6、10、13、16或17-26的核酸序列或其功能等价物。在再进一步的实施方案中,本发明提供了篩选化合物的方法,其包括使人c-Rel同二聚体与结合配偶体(例如,在IL-2基因的启动子区中的CD28反应元件(CD28RE))接触;且测量相对于在不存在测试化合物的情况下的水平,在测试化合物的存在下的荧光偏振的水平。在某些实施方案中,测定法是高流通量测定法。在某些实施方案中,测试化合物使用电泳迁移位移测定法进行进一步筛选。在另外的实施方案中,本发明提供了减少c-Rel活性的方法,其包括提供c-Rel信号途径組分和下游靶基因的抑制剂。在某些实施方案中,信号途径组分是由其同源配体触发的c-Rel激活的上游报道分子(例如,TCR、BCR、CD40、TNF受体家族、N0D1、N0D2和Toll样受体)。在其他实施方案中,信号途径组分是c-Rel激活的上游信号分子(例如,Lyn、Fyn、Lck、PI3-激酶、Pten、Akt、Vav、BSAP、SLP-76、LAT、Itk、Btk、ZAP-70、PKC-P、PKC-6、PKC-"Bc卜lO、MALT1、CARMA1、IKKa、IKK0、IKKy、NIK、TRAFs、TAK1、TBK1、RIP、My亂TIRAP、TRAM和TRIF)。在其他实施方案中,c-Rel下游靶基因包括2、IL-3、GM-CSF、IFN-y、IFN-oc、TNF、IL-6、IL-8、IL-IO、IL-13、IL-15、IL-12、IL-23、IL-17、IL-27、EBI3、MIPla、Rantes、VEGF),细胞因子受体(例如IL-2Rot、IFN-oc受体、0CILRP1、NKRPlf、双调蛋白、血管生成素样、N-EGF2、FGF1、Bmp-l),共刺激分子(例如CD80、CD86、C幽、CD44、CCR7、CXCR4、ICAM-1、VCAM-1、MMP-9),细胞周期蛋白质(例如细胞周期蛋白Dl、细胞周期蛋白D2、细胞周期蛋白D3、细胞周期蛋白E、E2Fs、ifi202),细胞存活蛋白质(例如Bcl-X、Bf卜l、Mcl-l、c-IAPs、c-FLIP、A20),信号分子(例如IKK-I、MKK1、GBP-1、Piml、Rapl、R-Rad、Mapl3K、PLA-y),和转录因子(例如c-myc、JunB、IRF1、IRF4、Stat5a、B-Atf、Tbx-2、Cited2、Pvitl、Cril、Siah2、Hox-8)。在某些实施方案中,靶向2种或更多途径组分。本发明的其他实施方案在下文说明书和实施例中描述。附图简述图1显示在本发明的某些实施方案中使用的荧光偏振筛选测定法的概述。图2显示纯化的人c-Rel蛋白质和识别的kB位点CD28RE之间的特异性剂量依赖性相互作用的表征。左图,c-Rel同二聚体的样品电泳迁移位移测定法。右图,来自EMSA与c-Rel同二聚体的DNA结合数据的对数图。图3显示鉴定转录因子c-Rel的小分子抑制剂的测定法的开发和验证。3a,将各种浓度的c-Rel加入10nMFITC标记的CD28RE探针中,并且测量荧光偏振。3b,不同浓度的未标记的CD28RE探针和对照寡核苷酸Octl的荧光偏振。3c,将200nMc-Rel的内源性抑制剂IkBa加入包含lOnM探针、100nMc-Rel和与3b相同的其他组分的反应内。3d,来自示例384孔平板的FP数据的扩散分布。图4显示经由EMSA进一步鉴定c-Rel的小分子抑制剂。图5显示衍生自Pten突变型小鼠的淋巴瘤细胞具有对BCR信号的24高增殖应答。(A)Pten(+Z-)淋巴结衍生淋巴瘤的组织学。(B)Pten(+/-)淋巴瘤细胞在抗IgM的存在或不存在下在培养基中培养高达72小时。细胞周期和凋亡通过碘化丙啶(PI)染色随后为流式细胞术进行分析。图6显示Pten突变型脾细胞和B细胞显示响应BCR和CD40信号的自发增殖和加速的细胞周期进展。从?〖611+/-和野生型小鼠中分离的(A)脾细胞或(B)B细胞用单独的培养基(上图)或抗IgM(下图)进行培养。(C)刺激72小时后经过每个周期的B细胞百分比显示于每个直方图内,从左往右,0、第1个、第2个、第3个、第4+5个周期。图7显示Pten突变型B细胞显示持续的NF-kB激活动力学且表达高水平的c-Rel靶基因EBI3。(A)衍生自Pten突变型和对照B细胞的核提取物的EMSA用抗IgM刺激高达6小时。(B)衍生自Pten(低等位基因)B细胞的核提取物的EMSA。(C)EBI3在Pten突变型B细胞中组成性上调。图8显示药理学NF-kB抑制剂有效阻断细胞周期进展且诱导Pten突变型B细胞的线粒体凋亡进展。CFSE测定法(A)或碘化丙啶染色(B)用于评估细胞分裂。(C)Bay11和万珂处理导致Pten突变型和对照B细胞的线粒体去极化。图9显示c-Rel缺失导致Pten突变型B细胞的凋亡和细胞周期停止。衍生自具有c-Rel或Pten缺失或两者的小鼠的B细胞通过使用PI染色(A)或3U-胸苷掺入测定法就凋亡和细胞周期进展进行分析(B)。图10显示c-Rel的体外沉默。(a)用100pic-RelsiRNA表达逆转录病毒或对照病毒(病毒滴度5x106/ml)处理的NIH3T3细胞中的GFP水平。(b)用c-Rel特异性多克隆抗体的蛋白质印迹。图11显示沉默c-Rel导致B细胞淋巴瘤Wehi-231细胞中减少的细胞存活和细胞周期进展。(a)GFP+细胞的百分比,(b)通过PI染色分析的细胞存活和细胞周期进展,(c)(b)中的数据概括为线图。图12显示c-Rel的体外沉默导致受损的原代B细胞响应抗原和促有丝分裂信号的细胞存活和细胞周期进展。(a)显示感染效率的流式细胞术,(b)细胞存活和细胞周期进展通过PI染色进行分析,(c)从(a)中的相同培养物收获的细胞使用细胞内染色法用抗Ki-67进行染色,并且通过流式细胞术进行分析。图13显示c-Rel的体内沉默导致受损的原代B细胞响应抗原和促有丝分裂信号的细胞存活和细胞周期进展。(a)从嵌合小鼠脾中分离且分别用抗IgM(10.0jag/ml)、抗CD40(10.0pg/ml)和LPS(10.0pg/ml)刺激48小时的原代B细胞的3H胸苷掺入。(b)在(a)中用抗CD40刺激的B细胞分别通过PI染色就细胞存活和细胞周期进展和通过Ki-67染色就细胞增殖进行进一步分析。图14显示c-Rel的体内沉默导致受损的针对抗原特异性信号的T细胞介导的免疫应答。图15显示本发明的示例性小分子。图16显示本发明的示例性I、II和III类化合物。(a)II类化合物抑制c-Rel。(b)与c-Rel结合的DNA探针的I类化合物抑制随着I类混合物浓度增加。图17显示本发明的示例性化合物的合成。图18显示本发明的示例性化合物的合成。图19显示本发明的示例性化合物的衍生物的合成。图20显示将放射化学试剂或稳定同位素标记掺入本发明的化合物内的示意图。图21显示本发明的II类化合物的羧化物部分中的修饰。图22显示本发明的化合物的中性砜或磺胺基团修饰。图23证实c-Rel抑制剂化合物对T细胞中的IL-2表达的细胞效力。(a)在用抗CD3和抗CD28刺激的T细胞上的细胞内IL-2染色。数据显示C04——I类化合物减少T细胞中的IL-2表达。(b,c)在本发明的某些化合物的存在下经由T细胞的IL4生产的剂量依赖性抑制。(d,e)各种剂量的C04和C01用于测量c-Rel抑制剂化合物在抑制经由CD4+或CD8+T细胞的IL-2生产中的IC50。图24是举例说明Rel/NF-icB的激活是免疫原应答所需的模型。这个模型还提出致耐受性细胞中的c-Rel/NF-kb活性的过度激活可以导致免疫耐受破坏和自身免疫病的发作。图25显示经历免疫耐受或缺失的未成熟的B细胞具有c-Rel和NF-kB激活的特弄性抑制。图26显示在经历免疫耐受和缺失的未成熟的B细胞中的PI3K信号途径的特异性受损的激活。图27显示Pten突变(或缺失)可以恢复存活和对致耐受性淋巴细胞的增殖应答,从而构成关于免疫耐受破坏和自身免疫的基础。图28显示Akt——PI3K/Pten途径的下游效应物可以保护致耐受性淋巴细胞不受凋亡或缺失。图29列出了使用DNA微阵列技术通过比较用BCR(B细胞抗原受体)刺激的c-Rel野生型和c-Rel敲除淋巴细胞鉴定的所选择的c-Rel靶基因。图30列出了使用DNA微阵列技术通过比较用CD40刺激的c-Rel野生型和c-Rel敲除淋巴细胞鉴定的所选择的c-Rel靶基因。定义为了促进本发明的理解,在下文定义了许多术语和短语如本文所使用的,术语"c-Rel活性"指c-Rel的任何生物化学和生物活性,包括但不限于表达,与结合配偶体(例如其他NF-kB成员,包括但不限于p50、p52、p65和RelB)结合,与具有特异性Rel应答序列的DNA结合,磷酸化、乙酰化和其他翻译后修饰,核转位,转录活性,靼基因转录和表达的调节,与核中的辅激活物、辅阻遏物或介质的相互作用,与RNA聚合酶II的相互作用,与c-Rel靶基因上的相同启动子上的其他转录因子(例如,STATs、IRFs、c-jun、c-fos、Foxp3和NF-ATs)的相互作用,和信号活性。c-Rel活性包括通过与其他蛋白质或核酸相互作用介导或响应上游受体信号途径的活性。例如,在某些实施方案中,c-Rel生物活性指通过同源配体与其相应受体(例如,TCR、BCR、CD40、TNF受体家族、N0D1、N0D2和Toll样受体)结合发出的信号途径的c-Rel激活。在其他实施方案中,c-Rel生物活性由c-Rel的信号组分(例如,Lyn、Fyn、Lck、PI3-激酶、Pten、Akt、Vav、BSAP、SLP-76、LAT、Itk、Btk、ZAP-70、PKC-P、PKC-6、PKC-^、Bc卜lO、MALT1、CARMA1、IKKa、IKKP、IKKy、NIK、TRAFs、TAK1、TBK1、RIP、MyD88、TIRAP、TRAM和TRIF)调节。在另一个实施方案中,c-Rel活性指c-Rel下游靶基因的调节,所述靶基因包括但不限于细胞因子(例如IL-2、IL-3、GM-CSF、IFN-y、IFN-a、TNF、IL-6、IL-8、IL-IO、IL-13、IL-15、IL-12、IL-23、IL-27、EBI3、MIPla、Rantes、VEGF),细胞因子受体(例如IL-2Rcc、IFN-ct受体、0CILRP1、NKRPlf、双调蛋白、血管生成素样、N-EGF2、FGF1、Bmp-l),共刺激分子(例如CD80、CD86、CD40、CD44、CCR7、CXCR4、ICAM-1、VCAM-1、MMP-9),细胞周期蛋白质(例如细胞周期蛋白D1、细胞周期蛋白D2、细胞周期蛋白D3、细胞周期蛋白E、E2Fs、ifi202),细胞存活蛋白质(例如Bcl-X、Bfl-l、Mcl-l、c-IAPs、c-FLIP、A20),信号分子(例如IKK-I、MKK1、GBP-1、Piml、Rapl、R-Rad、Mapl3K、PLA-y),和转录因子(例如c-myc、JunB、IRF1、IRF4、Stat5a、B-Atf、Tbx-2、Cited2、Pvitl、Cril、Siah2、Hox-8)。如本文所使用的,术语"c-Rel活性抑制剂"指经由直接接触c-Rel蛋白质、接触c-RelmRNA、引起c-Rel的构象变化、减少c-Rel蛋白质水平、或千扰c-Rel与信号配偶体(例如,本文描述的那些)的相互作用、和影响c-Rel靶基因(例如,本文描述的那些)表达来减少c-Rel的任何活性(例如,包括但不限于,本文描述的活性)的任何分子(例如,siRNA、反义核酸、适体、抗体、肽、拟肽、天然化合物或小分子)。抑制剂还包括通过截断上游信号分子(例如,PI3K、Pten、IKKs)间接调节c-Rel生物活性的分子。如本文所使用的,术语"异常信号"指导致异常细胞应答(例如,在生长、存活、凋亡、分化、代谢、效应子功能、或基因表达模型中)的信号途径或信号途径组分中的改变。在某些实施方案中,异常信号导致改变的c-Rel活性。在某些实施方案中,异常信号是c-Rel靶基因或c-Rel上游信号分子(例如,本文描述的那些)改变的活性的结果。如本文所使用的,术语"细胞外信号影响"指细胞外信号分子(例如,药学试剂、针对受体的配体、细胞因子、趋化因子、可溶因子、粘附分子、或其他信号分子)对细胞(例如,真核细胞)具有的影响。在某些实施方案中,细胞外信号诱导c-Rel活性,改变c-Rel激活动力学,或改变c-Rel靶基因表达模式。如本文所使用的,术语"取代脂肪族"指具有小于10个碳的烷烃,其中脂肪族氢原子中的至少一个已由卤素、氨基、羟基、硝基、硫基、酮、醛、酯、酰胺、低级脂肪族、取代低级脂肪族、或环(芳基、取代芳基、脂环族、或取代脂环族等)替代。此类的例子包括但不限于l-氯乙基等。如本文所使用的,术语"烷基"指优选具有约1-约8个碳的分支或未分支烃链,例如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基、2-曱基戊基、戊基、己基、异己基、庚基、4,4-二甲基戊基、辛基、2,2,4-三甲基戊基等。如本文所使用的,术语"取代烷基"包括任选由通常与此类链附着的一个或多个官能团取代的烷基,所述官能团例如羟基、溴、氟、氯、碘、巯基或硫基、氰基、烷硫基、杂环基、芳基、杂芳基、羧基、烷氧羰基、烷基、烯基、硝基、氨基、烷氧基、酰氨基等,以形成烷基例如三氟甲基、3-羟己基、2-羧丙基、2-氟乙基、羧甲基、氰丁基等。如本文所使用的,术语"环烷基"在本文中单独或作为另一个基团的部分使用时,包括包含1-3个环的饱和或部分未饱和的(包含1个或多个双键)环烃基团,包括单环烷基、二环烷基和三环烷基,包含形成环的总共3-20个碳,优选形成环的3-10碳,并且当对于芳基描述时其可以与1或2个芳环融合,其包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、环辛基、环癸基和环十二烷基、环己烯基。如本文所使用的,术语"取代环烷基"包括任选由l个或多个取代基取代的环烷基,所述取代基例如卣素、烷基、烷氧基、羟基、芳基、芳氧基、芳基烷基、环烷基、烷基酰胺、烷酰基氨基、氧代、酰基、芳基羰基氨基、氨基、硝基、氰基、硫醇和/或烷硫基和/或"取代烷基"定义中包括的任何取代基。如本文所使用的,术语"烯基"其自身或作为另一个基团的部分指在正链中2-20个碳、优选2-12个碳、和更优选2-8个碳的直链或支链基团,其包括正链中的一个或多个双键,例如乙烯基、2-丙烯基、3-丁烯基、2-丁烯基、4-戊烯基、3-戊烯基、2-己烯基、3-己烯基、2-庚烯基、3-庚烯基、4-庚烯基、3-辛烯基、3-壬烯基、4-癸烯基、3-十一碳烯基、4-十二碳烯基、4,8,12-十四碳三烯等。"取代烯基"包括任选由一个或多个取代基取代的烯基,所述取代基例如上文在"取代烷基"和"取代环烷基"的定义中包括的取代基。如本文所使用的,术语"炔基"其自身或作为另一个基团的部分指在正链中2-20个碳、优选2-12个碳、和更优选2-8个碳的直链或支链基团,其包括正链中的一个或多个叁键,例如2-丙炔基、3-丁炔基、2-丁炔基、4-戊炔基、3-戊炔基、2-己炔基、3-己炔基、2-庚炔基、3-庚炔基、4-庚炔基、3-辛炔基、3-壬炔基、4-癸炔基、3-十一碳炔基、4-十二碳炔基等。"取代炔基"包括任选由一个或多个取代基取代的炔基,所述取代基例如上文在"取代烷基"和"取代环烷基"的定义中包括的取代基。如本文所使用的,术语"芳基烷基"、"芳基烯基"和"芳基炔基,,单独或作为另一个基团的部分使用时,指如上文描述的具有芳基取代基的烷基、烯基和炔基。芳基烷基的代表性例子包括但不限于,苯甲基、2-苯乙基、3-苯丙基、苯乙基、二苯曱基和萘甲基等。"取代芳基烷基"包括其中芳基部分任选由一个或多个取代基取代的芳基烷基,所述取代基例如上文在"取代烷基"和"取代环烷基"的定义中包括的取代基。如本文所使用的,术语"囟素"或"卣族,,单独或作为另一个基团的部分使用时,指氯、溴、氟和碘。如本文所使用的,术语"卣代烷基"、"卣代烯基"和"炔基"单独或作为另一个基团的部分时指由选自氟、氯、溴、氟和碘的一个或多个原子取代的"烷基"、"烯基"和"炔基"。如本文所使用的,术语"芳基"或"Ar"单独或作为另一个基团的部分时指在环部分(例如苯基或萘基包括1-萘基和2-萘基)中包含6-10个碳的单环和多环芳香族基团,并且可以任选包括与碳环或杂环(例如芳基、环烷基、杂芳基或环杂烷基环)融合的l-3个另外的环。如本文所使用的,术语"取代芳基"包括任选由一个或多个官能团取代的芳基,所述官能团例如卣素、g烷基、烷基、卣烷基、烷氧基、卣烷氧基、烯基、三氟甲基、三氟甲氧基、炔基、环烷基-烷基、环杂烷基、环杂烷基烷基、芳基、杂芳基、芳基烷基、芳氧基、芳氧基烷基、芳基烷氧基、烷氧基羰基、芳基羰基、芳基烯基、氨基羰基芳基、芳硫基、芳基亚磺酰基、芳基偶氮、杂芳基烷基、杂芳基烯基、杂芳基杂芳基、杂芳氧基、羟基、硝基、氰基、氨基、其中氨基包括1或2个取代基(其为烷基、芳基、或定义中提及的任何其他芳基化合物)的取代氨基、硫醇、烷硫基、芳硫基、杂芳基硫基、芳硫基烷基、烷氧基芳硫基、烷基羰基、芳基羰基、烷基氨基羰基、芳基氨基羰基、烷氧基羰基、氨基羰基、烷基羰酰氧基、芳基羰酰氧基、烷基羰基氨基、芳基羰基氨基、芳基亚磺酰基、芳基亚磺酰基烷基、芳基如本文所使用的,术语"杂环"表示未取代或取代的稳定的5-10个成员的单环环系统,其可以是饱和或未饱和的,且由碳原子和选自N、0或S的1-4个杂原子组成,并且其中氮和硫杂原子可以任选是氧化的,和氮杂原子可以任选是季胺化的。杂环环可以附着在任何杂原子或碳原子上,这导致稳定结构的产生。此类杂环基团的例子包括但不限于哌啶基、哌溱基、氧代哌嗪基、氧代哌啶基、氧代吡咯烷基、氧代氮卓(oxoazepinyl)、氮卓(azepinyl)、p比咯基、他咯烷基、呋喃基、噻吩基、吡唑基、吡唑啶基、咪唑基、咪唑啉基、咪唑烷基、吡啶基、吡嗪基、嘧啶基、哒嗪基、噁唑基、噁唑烷基、异噁唑基、异噁唑啉基、吗啉基、噻唑基、噻唑烷基、异噻唑基、噻二唑基、四氢p比喃基、塞吗啉基(thiamorpholinyl)、噻吗啉基亚砜、噢吗啉基亚砜和噁二唑基。如本文所使用的,术语"杂环芳香族"单独或作为另一个基团的部分指5或7个成员的芳环,其包括l、2、3或4个杂原子,例如氮、氧或硫,以及与芳基、环烷基、杂芳基或杂环烷基环(例如,苯并苯硫基、吲味基)融合的此类环,且包括可能的N氧化物。如本文所使用的,术语"取代杂芳基"包括任选由1-4个取代基取代的杂芳基,所述取代基例如上文在"取代烷基"和"取代环烷基"的定义中包括的取代基。如本文所使用的,术语"脂环族"指具有小于8个碳或由不超过3个稠脂环族环組成的稠环系统的环烷烃。此类的例子包括但不限于萘烃等。如本文所使用的,术语"取代脂环族"指具有小于IO个碳或由不超过3个稠环组成的稠环系统的环烷烂,并且其中脂肪族氢原子中的至少一个已由卣素、硝基、硫基、氨基、羟基、酮、醛、酯、酰胺、低级脂肪族、取代低级脂肪族、或环(芳基、取代芳基、脂环族、或取代脂环族等)替代。此类的例子包括但不限于l-氯十烷基、双环-庚烷、辛烷和壬烷(例如,nonrbornyl)等。如本文所使用的,术语"取代杂环,,指具有小于8个碳的或由不超过3个稠环组成的稠环系统的环烷烃和/或芳环系统,其中环碳原子中的至少一个由氧、氮或硫替代,和其中脂肪族氢原子中的至少一个已由卣素、羟基、硫基、硝基、氨基、酮、醛、酯、酰胺、低级脂肪族、取代低级脂肪族、或环(芳基、取代芳基、脂环族、或取代脂环族等)替代。此类的例子包括但不限于2-氯吡喃基。如本文所使用的,术语"接头"指包含连接2个不同结构部分的高达且包括8个邻接原子的链,其中此类原子是例如碳、氮、氧或硫。乙二醇是一个非限制性例子。如本文所使用的,术语"低级烷基-取代-卣素"指包含高达且包括8个碳原子的任何烷基链,其中脂肪族氢原子之一由卣素替代。此类的例子包括但不限于氯乙烷等。如本文所使用的,术语"乙酰氨基"应意指乙酰化的任何伯或仲氨基。此类的例子包括但不限于乙酰胺等。如本文所使用的,术语化合物的"衍生物"指化学修饰的化合物,其中化学修饰在化合物的官能团上或芳环上发生。如本文所使用的,术语"药物组合物"指活性剂与惰性或活性栽体的组合,使得组合物特别适合于体内、体内或离体诊断或治疗用途。如本文所使用的,术语"药学上可接受的载体"指任何标准药学载体,例如磷酸盐緩冲盐水溶液、水、乳状液(例如,油/水或水/油乳状液)、和各种类型的湿润剂。组合物还可以包括稳定剂和防腐剂。关于载体、稳、定剂和佐剂的例子。(参见例如,Martin,Remington'sPharmaceuticalSciences,第15版,MackPubl.Co.,Easton,PA[1975])。如本文所使用的,术语"药学上可接受的盐"指本发明的化合物的任何药学上可接受的盐(例如,酸或碱),其在给受试者施用后能够提供本发明的化合物或其活性代谢物或残基。如本领域技术人员已知的,本发明的化合物的"盐"可以衍生自无机或有机酸和碱。酸的例子包括但不限于,盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、高氯酸、延胡索酸、马来酸、磷酸、乙醇酸、乳酸、水杨酸、琥珀酸、对甲苯磺酸、酒石酸、乙酸、柠檬酸、甲磺酸、乙磺酸、甲酸、苯甲酸、丙二酸、萘-2-磺酸、苯磺酸等。其他酸例如草酸,尽管其自身不是药学上可接受的,仍可以用于制备作为获得本发明的化合物及其药学上可接受的酸加成盐中的中间产物有用的盐。碱的例子包括但不限于碱金属(例如钠)氢氧化物、碱土金属(例如,镁)氢氧化物、铵和式冊/的化合物,其中W是d-4烷基等。盐的例子包括但不限于乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、硫酸氢盐、丁酸盐、柠檬酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、环戊丙酸盐、二葡萄糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙磺酸盐、延胡索酸盐、氟庚酸盐、甘油磷酸盐、半疏酸盐、庚酸盐、己酸盐、盐酸化物、氢溴化物、氢碘化物、2-羟基乙磺酸盐、乳酸盐、马来酸盐、甲磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、戊酸盐(pectinate)、过硫酸盐、苯丙酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、琥珀酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、曱苯磺酸盐、十一酸盐等。盐的其他例子包括与合适的阳离子例如Na+、NH/和NW4+(其中W是d-4烷基)等化合的本发明化合物的阴离子。如本文所使用的,术语"免疫球蛋白"或"抗体"指结合特异性抗原的蛋白质。免疫球蛋白包括但不限于多克隆、单克隆、嵌合和人源化抗体、Fab片段、F(ab')2片段,并且包括下述类别的免疫球蛋白IgG、IgA、IgM、IgD、IgE和分泌型免疫球蛋白(slg)。免疫球蛋白一般包含2条相同的重链和2条轻链。然而,术语"抗体"和"免疫球蛋白"还包含单链抗体和双链抗体。如本文所使用的,术语"抗原结合蛋白质"指与特异性抗原结合的蛋白质。"抗原结合蛋白质,,包括但不限于肽或免疫球蛋白,包括多克隆,单克隆,嵌合和人源化抗体;Fab片段,F(ab')2片段和Fab表达文库;和单链抗体。如本文所使用的,术语"表位"指与特定免疫球蛋白接触的抗原部分。当蛋白质或蛋白质的片段用于免疫宿主动物时,蛋白质的众多区域可以诱导与蛋白质上的给定区域或三维结构特异性结合的抗体的产生;这些区域或结构被称为"抗原决定簇"。抗原决定簇可以与完整抗原(即,用于引起免疫应答的"免疫原")竟争与抗体的结合。术语"特异性结合"当就抗体和蛋白质或肽的相互作用而言使用时,意指相互作用依赖蛋白质上特定结构(即,抗原决定簇或表位)的存在;换言之抗体识别且与特定蛋白质结构结合而不是与一般而言的蛋白质结合。例如,如果抗体对于表位"A"特异,那么在包含标记34的"A"和抗体的反应中包含表位A(或游离的,未标记的A)的蛋白质的存在将减少与抗体结合的标记的A的量。如本文所使用的,术语"非特异性结合"和"本底结合"当就抗体和蛋白质或肽的相互作用而言使用时,意指相互作用不依赖特定蛋白质结构的存在(即,抗体与一般而言的蛋白质而不是特定结构例如表位结合)。如本文所使用的,术语"受试者"指将是特定治疗的受体的任何动物(例如,哺乳动物),包括但不限于,人、非人灵长类动物、啮齿类动物等。一般地,术语"受试者,,和"患者,,在本文中就人受试者而言时可互换使用。如本文所使用的,"诊断具有癌症的受试者"指其已测定且发现具有癌细胞的受试者。癌症可以使用任何合适的方法进行诊断,所述方法包括但不限于活组织检查、x射线、验血和本发明的诊断方法。如本文所使用的,术语"缺乏功能性c-Rel基因的非人转基因动物"指其内源性c-Rel基因已被灭活(例如,由于"c-Rel敲除"或"c-Rel敲入")的非人动物(优选哺乳动物,更优选小鼠)。如本文所使用的,术语"c-Rel敲除"指缺乏功能性c-Rel基因的动物(例如,小鼠)。在某些实施方案中,整个c-Rel基因被删除。在其他实施方案中,基因经由其他方式(例如,基本部分的删除或者某些或全部c-Rel基因的倒转)进行灭活。在其他实施方案中,c-Rel基因使用反义抑制进行灭活。c-Rel敲除包括条件性敲除(例如,基因活性的选择性抑制)。c-Rel敲除小鼠可以使用任何合适的方法进行制备,所述方法包括但不限于本文描述的那些。c-Rel基因还可以经由"c-Rel敲入,,的构建进行灭活,其中基因通过将外源DNA插入功能所需的基因区域内进行灭活。如本文所使用的,术语"c-Rel模拟"指模拟c-Rel与配体的结合的小分子化合物。如本文所使用的,术语"非人动物"指所有非人动物,包括但不限于,脊推动物例如啮齿类动物、非人灵长类动物、绵羊科动物、牛科动物、反刍动物、兔类动物、猪科动物、羊科动物、马科动物、犬科动物、猫科动物、鸟类等。如本文所使用的,术语"基因转移系统"指将包含核酸序列的组合物递送给细胞或组织的任何方式。例如,基因转移系统包括但不限于,载体(例如,逆转录病毒、腺病毒、腺伴随病毒、和其他基于核酸的递送系统),棵露核酸的显微注射,基于聚合物的递送系统(例如,基于脂质体和基于金属颗粒的系统),生物弹道注射等。如本文所使用的,术语"病毒基因转移系统"指包含病毒元件(例如,完整病毒、经修饰的病毒和病毒组分例如核酸或蛋白质)的基因转移系统,以促进样品对所需细胞或组织的递送。如本文所使用的,术语"腺病毒基因转移系统"指包含属于腺病毒科的完整或改变病毒的基因转移系统。如本文所使用的,术语"位点特异性重组靶序列"指提供关于重组因子的识别序列和其中重组方式的位置的核酸序列。如本文所使用的,术语"核酸分子"指包含任何核酸的分子,包括但不限于DNA或RNA。该术语包含包括DNA和RNA的任何已知碱基类似物的序列,所述类似物包括但不限于4-乙酰胞嗜啶、8-羟基-N6-甲基腺苷、吖丙啶基胞嘧啶、假异胞嘧啶、5-(羧基羟基甲基)尿嘧啶、5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-羧甲基氨基甲基-2-硫脲嘧啶、5-羧甲基氨基甲基尿嘧啶、二氢尿嘧啶、肌苷、N6-异戊烯腺嘌呤、1-甲基腺嘌呤、1-甲基假尿嘧啶、1-甲基鸟嘌呤、l-甲基肌苷、2,2-二甲基鸟嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、3-甲基胞嘧咬、5-甲基胞嘧啶、N6-甲基腺嘌呤、7-曱基鸟嘌呤、5-曱基氨基甲基尿嘧啶、5-甲氧基氨基曱基-2-硫脲嘧咬、p-D-甘露同氨^(mannosylqueosine)、5'-曱氧基羰基曱基尿嘧啶、5-甲氧基尿嗜啶、2-甲基硫-N6-异戊烯腺噪呤、尿嘧啶-5-羟乙酸甲酯、尿嘧啶-5-羟乙酸、丁氧基氯喹(oxybutoxosine)、假尿嘧咬、羟基氯会(queosine)、2-硫胞嘧咬、5-甲基-2-硫脲嘧啶、2-硫脲嘧啶、4-硫脲嘧啶、5-甲基尿嘧啶、N-尿嘧啶-5-羟乙酸曱酯、尿嘧啶-5-羟乙酸、假尿嘧啶、羟氯喹36(q翻sine)、2-硫胞嘧咬和2,6-二氨基噪呤。术语"基因"指包含用于生产多肽、前体或RNA(例如,mRNA、rRNA、tRNA)所需的编码序列的核酸(例如,DNA)序列。多肽可以由全长编码序列或编码序列的任何部分编码,只要全长或片段的所需活性或功能性质(例如,酶促活性、配体结合、信号转导、免疫原性等)被保留。该术语还包含结构基因的编码区以及在5'和3'末端上位于编码区邻近的序列,距离在任一末端上约1kb或更多,从而使得基因对应全长mRNA的长度。位于编码区5'且存在于mRNA上的序列称为5'非翻译序列。位于编码区3'或下游且存在于mRM上的序列称为3'非翻译序列。术语"基因"包含cDNA和基因组形式的基因。基因的基因组形式或克隆包含由称为"内含子"或"间插区"或"间插序列"的非编码序列间断的编码区。内含子是转录成核RNA(hnRNA)的基因区段;内含子可以包含调节元件例如增强子。内含子从核或原始转录物中去除或"剪接掉";内含子因此在信使RNA(mRNA)转录物中不存在。mRNA在翻译期间起作用以指定新生多肽中的氨基酸序列或顺序。如本文所使用的,术语"异源基因"指在其天然环境中不存在的基因。例如,异源基因包括从一个物种引入另一个物种内的基因。异源基因还包括已以某些方式(例如,突变、添加多个拷贝、与非天然调节序列连接等)进行改变对于生物天然的基因。异源基因与内源基因的不同之处在于异源基因序列一般与这样的DNA序列连接,所述DM序列在染色体中未发现与基因序列天然结合,或与在自然界中未发现的染色体部分(例如,在其中基因通常不表达的基因座中表达的基因)结合。如本文所使用的,术语"转基因,,指整合到生物(例如,非人动物)基因组内且在有性生殖期间传递给生物后代的异源基因。如本文所使用的,术语"转基因生物"指具有整合到其基因组内(例如,非人动物)。如本文所使用的,术语"基因表达"指通过基因的"转录"(即经由RNA聚合酶的酶促作用)将基因中编码的遗传信息转变成RNA(例如,mRNA、rRNA、tRNA或snRNA)的过程,和对于蛋白质编码基因,通过mRNA的"翻译,,转变成蛋白质的过程。基因表达可以在过程中的许多阶段上进行调节。"上调,,或"激活"指增加基因表达产物(即,RNA或蛋白质)的生产的调节,而"下调"或"阻遏"指减少生产的调节。涉及上调或下调的分子(例如转录因子)通常分别称为"激活物"和"阻遏物"。除了包含内含子,基因的基因组形式还可以包括存在于RNA转录物上位于序列的5'和3'末端上的序列。这些序列称为"侧翼"序列或区域(这些侧翼序列位于mRNA转录物上存在的非翻译序列的5'或3')。5'侧翼区可以包含控制或影响基因转录的调节序列例如启动子和增强子。3'侧翼区可以包含指导转录终止、转录后切割和多腺苷酸化的序列。术语"野生型,,指从天然存在的来源中分离的基因或基因产物。野生型基因是在群体中最常观察到且因此任意命名为基因的"正常"或"野生型"形式的基因。相比之下,术语"经修饰的"或"突变体"指当与野生型基因或基因产物比较时,显示序列和或功能性质(即,改变的特征)中的^务饰的基因或基因产物。应当指出可以分离天然存在的突变体;这些通过下述事实进行鉴定当与野生型基因或基因产物比较时,它们具有改变的特征(包括改变的核酸序列)。如本文所使用的,术语"编码……核酸分子"、"编码……DNA序列"、或"编码……DNA,,指脱氧核糖核苷酸沿着脱氧核糖核酸链的顺序或序列。这些脱氧核糖核苷酸的顺序决定氨基酸沿着多肽(蛋白质)链的顺序。DNA序列因此编码氨基酸序列。如本文所使用的,术语"具有编码基因的核苷酸序列的寡核苷酸"和"具有编码基因的核苷酸序列的多核苷酸",意指包含基因的编码区的核酸序列,或换言之编码基因产物的核酸序列。编码区可以以cDNA、基因组DNA或RNA形式存在。当以DNA形式存在时,寡核苷酸或多核苷酸可以是单链(即有义链)或双链的。必要时,合适的控制38元件例如增强子/启动子、剪接点、多腺苷酸化信号等可以置于与基因的编码区紧密接近,以允许转录的适当起始和/或原始RNA转录物的正确加工。备选地,在本发明的表达载体中使用的编码区可以包含内源增强子/启动子、剪接点、间插序列、多腺苷酸化信号等,或内源性和外源性控制元件的组合。如本文所使用的,术语"寡核苷酸"指单链多核苷酸链的短长度。寡核苷酸一般长度小于200个残基(例如,15-100个),然而,如本文所使用的,该术语还意欲包含更长的多核苷酸链。寡核苷酸通常由其长度提及。例如24残基寡核苷酸称为"24聚体"。寡核苷酸可以通过自身杂交或与其他多核苷酸杂交形成二级和三级结构。此类结构可以包括但不限于,双链体、发夹、十字形、弯曲和三链体。如本文所使用的,术语"互补"或"互补性"就由碱基配对法则涉及的多核普酸(即,核苷酸的序列)而言使用。例如,对于序列"5'-A-G-T-3",与序列"3'-T-C-A-5",互补。互补性可以是"部分的",其中根据碱基配对法则只有少数核酸碱基匹配。或者,在核酸之间可以存在"完全"或"全部"互补性。核酸链之间的互补性程度对于核酸链之间的杂交的效率和强度具有显著影响。这在扩增反应以及依赖核酸之间的结合的检测方法中具有特别的重要性。术语"同源性,,指互补性程度。可以存在部分同源性或完全同源性(即,同一性)。部分互补序列是至少部分抑制完全互补的核酸分子与"基本上同源的"靶核酸杂交的核酸分子。完全互补序列与靶序列的杂交的抑制可以使用杂交测定法(DNA或RNA印迹、溶液杂交等)在低严格性条件下进行检查。基本上同源的序列或探针在低严格性的条件下将与完全同源的核酸分子竟争且抑制与靶的结合(即,杂交)。这不是说低严格性条件是这样的,使得允许非特异性结合;低严格性条件要求2个序列与彼此的结合是特异性(即,选择性)相互作用。非特异性结合的不存在可以通过使用基本上非互补的(例如,小于约30%同一性)第二种耙进行测试;在不存在非特异性结合的情况下,探针将不与第二种非互补的靶杂交。当就双链核酸序列例如cDM或基因組克隆使用时,术语"基本上同源的"指如上所述在低严格性条件下将与双链核酸序列的任一或两条链杂交的任何探针。基因可以产生通过原始RNA转录物的差别剪接产生的多个RNA种类。其为相同基因的剪接变体的cDNAs将包含序列同一性或完全同源的区域(表示2个cDNAs上的相同外显子或相同外显子部分的存在)和完全非同一性的区域(例如,表示cDNAl上的外显子"A"的存在,而其中cDNA2包含外显子"B")。因为2个cDNAs包含序列同一性的区域,所以它们将与衍生自完整基因或包含在2个cDNAs上发现的序列的基因部分的探针杂交;2个剪接变体因此与此类探针和彼此基本上同源。当就单链核酸序列而言使用时,术语"基本上同源的"指如上所述在低严格性条件下可以与单链核酸序列杂交(即,它是互补物)的任何探针。如本文所使用的,术语"杂交"就互补核酸的配对而言使用。杂交和杂交的强度(即,核酸之间的结合强度)受诸如核酸之间的互补性程度、涉及的条件的严格性、所形成的杂交物的L、和核酸内的G:C比的因素影响。包含在其结构内的互补核酸配对的单个分子被说成是"自身杂交的,,。如本文所使用的,术语"Tm"就"解链温度"而言使用。解链温度是在其下双链核酸分子的群体变得一半解离成单链的温度。用于计算核酸的L的等式是本领域众所周知的。如由标准参考文献指出的,L值的简单估计可以通过下式进行计算Ta=81.5+0.41(%G+C),其中核酸在水溶液中,在lMNaCl下(参见例如,Anderson和Young,QuantitativeFilterHybridization,inNucleicAcidHybridization[1985])。其他参考文献包括对于Tn的计算考虑结构以及序列特征的更复杂的计算。如本文所使用的,术语"严格性"就在其下进行核酸杂交的温度、离子强度和其他化合物例如有机溶剂的存在的条件而言使用。在"低40严格性条件"下,目的核酸序列将与其确切互补物、具有单碱基错配的序列、紧密相关的序列(例如,具有90%或更大同源性的序列)、和仅具有部分同源性的序列(例如,具有50-90%同源性的序列)杂交。在"中等严格性条件"下,目的核酸序列将仅与其确切互补物、具有单碱基错配的序列、和紧密相关的序列(例如,具有90%或更大同源性的序列)杂交。在"高严格性条件"下,目的核酸序列将仅与其确切互补物、和具有单碱基错配的序列(依赖条件例如温度)杂交。换言之,在高严格性条件下,可以升高温度,以便排除与具有单碱基错配的序列的杂交。"高严格性条件"当就核酸杂交而言使用时,包含等价于下述的条件在42r下在由5XSSPE(43.8g/1NaCl、6.9g/1NaH2P04.H20和1.85g/1EDTA,pH用NaOH调整至7.4)、0.5%SDS、5XDenhardt氏试剂和100ng/ml变性鲑精DNA组成的溶液中结合或杂交,随后在包含O.1XSSPE、1.0%SDS的溶液中于42'C洗涤,当使用长度约500个核普酸的探针时。"中等严格性条件"当就核酸杂交而言使用时,包含等价于下述的条件在42。C下在由5XSSPE(43.8g/1NaCl、6.9g/1NaH2P04H20和1.85g/1EDTA,pH用NaOH调整至7.4)、0.5%SDS、5XDenhardt氏试剂和100jag/ml变性鲑精DNA組成的溶液中结合或杂交,随后在包含l.OXSSPE、1,0%SDS的溶液中于421C洗涂,当使用长度约500个核苷酸的探针时。"低严格性条件,,包含等价于下述的条件在42C下在由5XSSPE(43.8g/1NaCl、6.9g/1NaH2P04H20和1.85g/1EDTA,pH用NaOH调整至7.4)、0.1%SDS、5XDenhardt's试剂[50XDenhardt's每500ml包含5gFicoll(Type400,Pharamcia)、5gBSA(FractionV;Sigma)]和IOOg/ml变性鲑精DNA组成的溶液中结合或杂交,随后在包含5XSSPE、0.1%SDS的溶液中于42n洗涤,当使用长度约500个核苷酸的探针时。本领域众所周知的是可以使用众多等价条件以包含低严格性条件;考虑因子例如探针的长度和性质(DNA、RNA、碱基组成)以及靶的性质(DNA、RNA、碱基组成、存在于溶液中或固定的等)以及盐和其他组分(例如,甲酰胺、硫酸葡聚糖、聚乙二醇的存在或不存在)的浓度,并且杂交溶液可以改变以产生不同于但等价于上文列出的条件的低严格性杂交。此外,本领域已知促进在高严格性条件下的杂交的条件(例如,增加杂交和/或洗涤步骤的温度,在杂交溶液中使用甲酰胺等)(参见上文关于"严格性"的定义)。如本文所使用的,术语"以可操作的组合"、"以可操作的顺序"、和"可操作地连接"指核酸序列的连接以这样的方式,使得产生能够指导给定基因的转录和/或所需蛋白质分子的合成的核酸分子。该术语还指氨基酸序列以这样的方式连接,使得产生功能蛋白质。术语"分离的"当就核酸而言使用时,如在"分离的寡核苷酸"或"分离的多核苷酸"中,指被鉴定且与它在其天然来源中与之通常结合的至少一种组分或污染物分开的核酸序列。分离的核酸以与其在自然界中发现的那种不同的形式或设置存在。相比之下,非分离的核酸如核酸,例如DNA和RNA以其在自然界中存在的状态发现。例如,给定DNA序列(例如,基因)在与邻近基因接近的宿主细胞染色体中发现;RNA序列,例如编码特定蛋白质的特定mRNA序列,作为与编码许多蛋白质的众多其他mRNAs的混合物在细胞中发现。然而,编码给定蛋白质的分离的核酸包括,例如,在通常表达给定蛋白质的细胞中的此类核酸,其中核酸在与天然细胞的那种不同的染色体位置中,或否则由与自然界中发现的那种不同的核酸序列侧接。分离的核酸、寡核苷酸或多核苷酸可以以单链或双链形式存在。当分离的核酸、寡核苷酸或多核苷酸待用于表达蛋白质时,寡核苷酸或多核苷酸将最低限度包含有义或编码链(即,寡核苷酸或多核苷酸可以是单链的),但可以包含有义和反义链(即,寡核苷酸或多核苷酸可以是双链的)。如本文所使用的,术语"纯化的"或"纯化"指从样品中去除组分(例如,污染物)。例如,抗体通过去除污染性非免疫球蛋白蛋白质进行纯化,它们还通过去除不与靼分子结合的免疫球蛋白进行纯化。非免疫球蛋白蛋白质的去除和/或不与靶分子结合的免疫球蛋白的去除导致样品中靶反应性免疫球蛋白百分比中的增加。在另一个例子中,重组多肽在细菌宿主细胞中进行表达,并且多肽通过去除宿主细胞蛋白质进行纯化;重组多肽的百分比由此在样品中得到增加。"氨基酸序列,,和术语例如"多肽"或"蛋白质"不意欲使氨基酸序列限制于与所述蛋白质分子结合的完全的、天然氨基酸序列。如本文所使用的,术语"天然蛋白质"意指蛋白质不包含由载体序列编码的氨基酸残基;即,天然蛋白质仅包含当它在自然界中存在时在蛋白质中发现的那些氨基酸。天然蛋白质可以通过重組方式产生或可以从天然存在的来源中分离。如本文所使用的,术语"部分"就蛋白质而言使用时(如在"给定蛋白质的部分"中)指那种蛋白质的片段。片段大小可以为4个氨基酸残基至整个氨基酸序列减1个氨基酸。如本文所使用的,术语"载体"用于指将DNA区段从一种细胞转移至另一种的核酸分子。术语"媒介物"有时可与"栽体,,互换使用。载体通常衍生自质粒、噬菌体、或植物或动物病毒。如本文所使用的,术语"表达载体"指包含所需编码序列和合适的核酸序列的重组DNA分子,所述核酸序列对于在特定宿主生物中表达可操作地连接的编码序列是必需的。对于在原核生物中表达所需的核酸序列通常包括启动子、操纵子(任选的)和核糖体结合位点、通常连同其他序列。真核细胞已知利用启动子、增强子以及终止和多腺苷酸化信号。术语"过表达"就mRNA水平而言用于指比在对照或非转基因动物中的给定组织中观察到的那种高约3倍(或更大的)表达水平。mRNA水平使用本领域技术人员已知的许多技术中的任何一种进行测量,包括但不限于RNA印迹分析。合适的对照包括在RNA印迹上,以控制关于由分析的每种组织装载的RNA量中的差异(例如,在每种样品中存在的28SrRNA的量可以用作正常化或标准化在RNA印迹上观察到的mRNA特异性信号的方式,所述28SrRNA是在所有组织中以基本上相43同的量存在的丰富RM转录物)。大小对应正确剪接的转基因RNA的条带中存在的mRNA量进行定量;与转基因探针杂交的其他微小种类的RNA在转基因mRNA表达的定量中不予以考虑。如本文所使用的,术语"转染"指将外源DNA引入真核细胞内。转染可以通过本领域已知的各种方法来完成,所述方法包括磷酸钓-DNA共沉淀、DEAE-葡聚糖介导的转染、聚凝胺介导的转染、电穿孔、显微注射、脂质体融合、脂转染、原生质体融合、逆转录病毒感染和biolistics。术语"稳定转染"或"稳定转染的"指外源DNA引入且整合到转染细胞的基因组内。术语"稳定转染子"指已将外源DNA稳定整合到基因组DNA内的细胞。术语"瞬时转染"或"瞬时转染的,,指外源DNA引入细胞内,其中外源DNA无法整合到转染细胞的基因组内。外源DNA在转染细胞的核中持续数天。在这个时间过程中,对外源DNA实施调节控制,这控制内源基因在染色体中的表达。术语"瞬时转染子"指已吸收外源DNA但无法整合这种DNA的细胞。如本文所使用的,术语"细胞培养"指任何体外细胞培养。这个定义内包括的是连续细胞系(例如,具有永生表型)、原代细胞培养、转化细胞系、有限细胞系(例如,非转化细胞)、和在体外维持的任何其他细胞群体。如使用的,术语"真核生物"指可与"原核生物"区分的生物。希望该术语包含具有显示真核生物的通常特征的细胞的所有生物,所述特征例如由核膜束缚的真核的存在,在其内存在染色体,膜结合细胞器的存在、和通常在真核生物中观察到的其他特征。因此,该术语包括但不限于此类生物如真菌、原生动物和动物(例如,人)。如本文所使用的,术语"体外"指人为环境和在人为环境内发生的过程或反应。体外环境可以由试管和细胞培养组成,但不限于试管和细胞培养。术语"体内"指天然环境(例如,动物或细胞)和在天然环境内发生的过程或反应。术语"测试化合物"和"候选化合物"指任何化学实体、药剂、药物等,其是用于治疗或预防机体功能的疾病、病、病患或病症(例如,癌症或炎性疾病)的候选物。测试化合物包含已知和潜在的治疗化合物。测试化合物可以通过使用本发明的筛选方法篩选确定为治疗性的。如本文所使用的,术语"样品"以其最广泛的含义使用。在一种含义中,它意欲包括得自任何来源的样本或培养物,以及生物和环境样品。生物样品可以得自动物(包括人)并且包含流体、固体、组织和气体。生物样品包括血液制品例如血浆、血清等。环境样品包括环境材料例如表面物质、土壤、水和工业样品。然而,此类例子不应被解释为限制可应用于本发明的样品类型。如本文所使用的,术语"siRNAs"指小干扰RNAs。在某些实施方案中,siRNAs包含长约18-25个核香酸的双链体、或双链区域;通常siRNAs包含在每条链的3'末端上的约2-4个未配对的核苷酸。siRNA的双链体或双链区域的至少一条链与靶RNA分子基本上同源,或基本上互补。与乾RNA分子互补的链是"反义链";与靶RNA分子同源的链是"有义链",并且还与siRNA反义链互补。siRNAs还可以包含另外的序列;此类序列的非限制性例子包括连接序列、或环、以及茎和其他折叠结构。siRNAs看起来在无脊推动物和脊推动物中触发RNA干扰中,以及在植物中转录后基因沉默期间触发序列特异性RNA降解中充当关键中间产物。术语"RNA干扰,,或"RNAi"指通过siRNAs沉默或减少基因表达。这是在动物和植物中由siRNA起始的序列特异性、转录后基因沉默的过程,所述siRNA在其双链体区域中与沉默基因的序列同源。基因对于生物可以是内源或外源的,整合到染色体内存在或存在于未整合到基因组内的转染载体中。基因的表达被完全或部分抑制。RNAi还可以视为抑制靶RNA的功能;靶RNA的功能可以是完全或部分的。如本文所使用的,术语"抗癌剂"、"常规抗癌剂"、或"癌症治疗药物,,指在癌症治疗中(例如在哺乳动物中)使用的任何治疗剂(例如,化学治疗化合物和/或分子治疗化合物)、放射疗法或手术干预。如本文所使用的,术语"药物"和"化学治疗剂"指用于诊断、治疗或预防生理学系统(例如,受试者,或体内、体外或离体细胞、组织和器官)中的疾病或病理学状况的药理学活性分子。药物通过改变药物已施用于其的活生物、组织、细胞或体外系统的生理学来发挥作用。希望术语"药物"和"化学治疗剂"包含抗过增生、抗肿瘤、抗炎、免疫抑制和免疫调节化合物以及其他生物学治疗化合物。发明详述本发明涉及用于靶向c-Rel的组合物和方法。特别地,本发明提供了通过抑制c-Rel活性,引起免疫耐受和用于调节c-Rel用于治疗癌症、自身免疫病、过敏症、炎性疾病、移植排斥和骨丢失的组合物和方法用于研究和药物筛选应用。本发明还涉及如通过测定c-Rel介导的生物活性确定的筛选c-Re1活性抑制剂的方法。免疫系统的主要功能是保护宿主不受经由外源主体的感染或侵入,所述外源主体包括细菌、病毒、寄生虫、变应原和同种异体组织(alio-tissue)。遭遇外源抗原或被病原体感染后,宿主能够设定炎性免疫应答以破坏且抑制外源因子。涉及炎症应答的免疫细胞包括固有的免疫细胞例如巨噬细胞、树突状细胞、嗜中性粒细胞和粒细胞,以及适应的免疫细胞例如T淋巴细胞和B淋巴细胞。免疫细胞中的合子和介质的产生,导致受感染细胞的破坏和外源因子的限制。器官移植排斥在本质上是针对外来组织的免疫应答。尽管炎症是自我防御机制,但不受控制的炎症应答可以导致急性痛苦的综合征或症状的慢性恶化。在那些发病率中,通常施用抗炎或免疫抑制药物以控制未减弱的免疫应答。尽管免疫系统能够识别广泛多样的外源因子,但它还进化了"耐受"自身组织或自身抗原的机制;称为"免疫耐受"的机制。因为自得"无应答或无反应性的,,,所以达到对自身抗原的免疫耐受。近来,T调节细胞(T-reg)也已暗示促成自身反应性淋巴细胞的抑制。当宿主免疫耐受机制被破坏和自身反应性淋巴细胞被激活时,自身免疫病跟着发生,因此攻击自身组织。在1960年,发现类固醇的免疫抑制效应的机制在于其阻断激活的淋巴细胞增殖的能力。同样,在60年代,除了其抗炎/免疫抑制效应外,还发现类固醇是有效的抗癌剂,特别是对于淋巴瘤和白血病。然而,尽管其抑制炎症和杀死恶性淋巴细胞的能力令人印象深刻,但负责抑制效应的分子机制直到1980年才被识别,当Dr.KendallA.Smith及其团队证实类固醇阻断经由T淋巴细胞(T细胞)的白介素2(IL2)的生产时。因为IL2是负责在免疫应答期间的T细胞增殖和存活的T细胞生长因子,所以这个发现很大程度上解释了类固醇是如此有效的免疫抑制剂的原因。随后,证实环孢菌素A和他克莫司(FK506)一一发现在阻断器官移植排斥中非常有效的新免疫抑制药物,也通过阻断IL2生产以及其他炎性细胞因子的生产来发挥作用。在1990年,类固醇由此能够产生此类广泛的免疫抑制效应的机制最终上溯至称为核因子kb(NF-kB)的分子家族的抑制,所述NF-kB调节许多基因的转录激活,包括编码IL2以及许多其他类似细胞因子分子例如介导炎症应答的肿瘤坏死因子(TNF)的基因。由于NF-kB与v-Rel和c-Rel的同源性,这个转录因子家族现在命名为Rel家族。存在Rel家族的5个分子成员,其中NF-kB(p50,p65)复合物分布在才几体的所有细胞中,而c-Rel主要表达于免疫细胞中。NF-kB涉及在1990's早期由Dr.DavidBaltimore的团体在MIT的WhiteheadInstitute分离的p50(NF-kB1)和p65(RelA)亚单位。发现3种其他蛋白质——c-Rel、RelB和p52(NF-kB2)共享在Rel同源结构域(RHD)上的序列同源性。因此,这5种蛋白质分类为Rel转录因子家族。尽管存在相似性,但每个Rel成员就组织表达模式、对受体信号的应答和靶基因特异性而言是不同的。这些差异根据由单个Rel敲除小鼠显示的非冗余表型是显而易见的。因此,靶向不同Rel成员的疗法可能具有不同的生物效应和安全/毒性概况。C-Rel不同于NF-kB(p50,p65)。NF-kB例如在美国专利号6,410,516中得到描述,所述专利通过引用合并入本文。首先,c-Rel作为由禽类REV-T逆转录病毒编码的v-Rel癌基因的细胞同系物分离。C-Rel因此在1990年NF-KB发现前6年识别为原癌基因。其次,与在机体的所有细胞中遍在表达的NF-KBp50和p65不同,c-Rel专有地表达于造血起源的细胞中,包括T细胞、B细胞、巨噬细胞和树突状细胞。第三,c-Rel和NF-KB调节不同细胞中的不同靶基因组。因此,它们具有不同的生物学功能。第四,最初归于NF-KB的许多炎症应答事实上在很大程度上归于c-Rel(因为与NF-KB比较,c-Rel是免疫细胞中的主要复合物)。这得到c-Rel敲除小鼠中的研究的支持。在1990's中期,独立地产生2个c-Rel敲除小鼠品系。C-Rel敲除小鼠正常发育但其免疫功能是缺陷的,例如产生IL2和其他细胞因子的能力,与其仅在激活的免疫细胞中的作用一致。阻断小鼠中的c-Rel改善动物模型中的哮喘、实验性自身免疫、糖尿病和移植排斥。动物模型中的c-Rel阻断还阻止了胶原诱发性关节炎的发作。这些研究证实c-Rel是炎症和自身免疫病过程中的关键参与者,由于其在免疫细胞(例如,淋巴细胞、树突状细胞、巨噬细胞)中的主要作用,和NF-KB在免疫细胞中的存在无法补偿c-Rel功能的丧失。C-Rel对于淋巴样和髓样细胞功能都是重要的。C-Rel是针对抗原和共刺激信号(例如BCR、TCR、CD28、CD40、CD30、Blys、TNF受体)的淋巴细胞应答所需的,这是适应性免疫的核心。具体地,c-Rel调节免疫细胞增殖和存活以及细胞因子生产。C-Rel调节细胞周期蛋白质(例如,细胞周期蛋白E)和细胞存活蛋白质(例如,Bcl-X、Bfl-l、Mcl-l)的表达。C-Rel是经由调节共刺激分子和细胞因子的抗原呈递细胞(例如,树突状细胞)成熟和共刺激功能所需的。c-Rel是控制T细胞细胞因子(IL-2、IFN-Y、TNF、IL-17),B细胞细胞因子(IL-6、IL-IO、IL-15),和树突状细胞细胞因子(IL-12、IL-23、IL-27)表达的通用细胞因子调节剂。c-Rel在免疫细胞功能的许多方面中的前述作用指出c-Rel是许多炎症和自身免疫病中的关键肇事者,并且阻断c-Rel保护或预防那些疾病的发作。事实上,c-Rel阻断已显示在预防动物中的几种疾病模型发作(例如,哮喘、实验性自身免疫性脑脊髓炎、胶原诱发性关节炎、糖尿病、胰岛移植和心脏移植)中是有利的。基于c-Rel在免疫细胞中的功能作用,预期c-Rel阻断对于治疗下述病理学状况(参见表l)也是有利的,其中某些在本发明中例示。A.急性和慢性炎症由变应原或病毒和细菌感染诱导的肺和呼吸系统中的炎症由免疫细胞对肺的浸润引起,所述免疫细胞产生炎症细胞因子或变应性介质(例如IgE)。在由病毒(例如流感病毒、禽流感病毒H5N1、SARS病毒)和细菌感染引起的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)可以是致死的情况下,如由浸润免疫细胞产生的"细胞因子风暴"可以导致肺水肿且损害肺的气体交换。脓毒症是由炎症细胞因子和介质的全身性释放表现的另外一种急性应答,由于进入血流内的严重细胞侵染。目前,不存在用于ARDS和脓毒症的有效疗法。肝炎、结肠炎、炎性肠病和动脉粥样硬化是特定组织中未解决的慢性炎症的其他例子。在这些病例的每一个中,NF-kB已显示起病理作用,并且在治疗这些病症中有效的治疗剂(商业或实验)已显示阻断NF-kB激活。许多研究已显示Rel家族成员激活在缺血期间激活,和Rel家族激活负责多个器官包括脑、心脏和肾的缺血再灌注损伤。大多数研究仅集中于NF-kB(p50,p65)在前述病理学状况中的作用,未致力于c-Rel的作用。本发明提供了c-Rel作为用于这些器官特异性炎性疾病以及再灌注组织损害的重要炎症介质。总之,本发明提供了用于抑制c-Rel的方法和组合物作为用于ARDS、呼吸炎症病症、脓毒症、器官特异性炎症和缺血损害的疗法。B.自身免疫病自身免疫病起于宿主免疫系统攻击其自身组织。存在累及各种组织例如关节(类风湿性关节炎)、中枢神经系统(多发性硬化症)、肠(克罗恩氏病)和皮肤(银屑病)的至少80种自身免疫病。估计自身免疫病影响5-8%的美国人群,或高达23.5百万人。关于c-Rel敲除小鼠的先前研究已证实阻断c-Rel活性使动物免于发展自身免疫性脑脊髓炎、I型糖尿病和胶原诱发性关节炎。本发明提供了在下述自身免疫病的治疗中用于阻断c-Rel的方法和组合物。抗TNF疗法在治疗具有类风湿性关节炎和强直性脊柱炎的患者中的近期成功暗示炎症细胞因子在这些疾病中起重要的病理作用。因为c-Rel涉及许多炎症细胞因子包括TNF和IL-6的表达,所以本发明提供了用于阻断c-Rel的方法和组合物作为在这些疾病中的治疗。自身免疫病起于针对自身组织或自身抗原的免疫耐受的破坏。如果抗原是广泛表达的(例如,核DNA),那么疾病是全身性的。相比之下,如果自身抗原仅表达于特定组织中(例如,胰岛素),那么疾病是组织特异性的(例如,在糖尿病的情况下的胰腺组织)。免疫学中的近期进展已许多基因。这i基因;的大多数在;节抗原受体(TCR/BCR)激活阈值中具有作用,其中c-Rel是抗原-受体信号途径的关键效应物。因此,本发明提供了用于特异性抑制自身反应性免疫细胞中的c-Rel活性的方法和组合物作为用于组织特异性和全身性自身免疫病的治疗,包括但不限于,类风湿性关节炎、多发性硬化症、糖尿病、克罗恩氏病、格雷夫斯氏病、桥本氏甲状腺炎、重症肌无力、银屑病、系统性红斑狼疮(SLE)、淋巴细胞增生病(ALPS)和干燥综合征。C.器官移植已充分证明宿主T细胞主要负责由HLA错配供体提供的同种异体移植的排斥。宿主T细胞的此类激活经由与移植物上的同种异体-MHC分子的TCR相互作用介导。因为c-Rel负责TCR介导的T细胞增殖和效应子功能,所以本发明提供了用于阻断宿主免疫细胞中的c-Rel的方法和组合物作为免疫抑制剂以及同种异体移植排斥的治疗和预防。c-Rel抑制剂作为免疫抑制剂在许多组织的移植中找到用途,所述组织包括但不限于骨髓、主要器官(心脏、肺、肾、肝)以及软组织(皮肤、软骨、骨)。在其他实施方案中,c-Rel抑制用于预防移植物抗宿主病。D.免疫耐受诱导目前的免疫抑制疗法例如环孢菌素、FK506和50糖皮质激素可以引起不良反应,这对具有慢性疾病的患者造成严重问题。此外,一般的免疫抑制还使得宿主更易受自发感染的影响。因此,免疫学领域中的目前趋势是开发免疫治疗策略,目的是诱导组织或抗原特异性免疫耐受用于治疗自身免疫病以及用于预防同种异体移植排斥。针对特异性抗原(或组织)的免疫耐受可以通过3种主要机制来达到删除、无反应性和T调节细胞。在本发明的开发过程中进行的实验证实c-Rel抑制与这3种免疫耐受机制相关。首先已显示对TCR/BCR刺激无应答的无反应性T细胞和无反应性B细胞,在c-Rel和NF-kB途径中具有特弄性阻断。其次,关于经历删除的未成熟的B细胞的研究在其c-Rel/NF-kB和PI3K激活途径中具有特异性阻断。相反,耐受细胞中的PI3K-Rel/NF-KB途径的激活可以导致免疫耐受破坏和自身免疫病的发作(实施例8)。第三,近期研究已显示NF-kB/Rel和NFAT经由FoxP3的抑制涉及效应T细胞功能T调节细胞的抑制。最后,存在支持阻断树突状细胞中的NF-kb/Rel活性可以阻止树突状细胞的成熟和此类未成熟的树突状细胞诱导T细胞耐受或T调节细胞分化的大量证据。因此,预期c-Rel/PI3K途径是用于决定免疫耐受对自身免疫的信号整合点。更具体而言,预期这个途径的持续激活导致自身免疫病,而这个途径的抑制诱导免疫耐受。E.骨丟失C-Rel和NF-kB已显示涉及骨丢失和骨质疏松症过程。几项研究已显示IKK-p导致破骨细胞中的c-Rel、RelB和RelA(p65)激活,这导致破骨细胞存活和炎症诱导的骨丟失。事实上,敲除NF-kB成员的p50/p52导致骨硬化症,并且抑制IKK活性阻断破骨发生且预防关节炎骨破坏。因此,在某些实施方案中,本发明提供了用于抑制常规NF-kB或c-Rel用于预防关节炎或炎症介导的骨破坏的方法和组合物。总之,c-Rel是关于自身免疫病、炎症、器官移植和骨丢失的治疗靶。因此,在某些实施方案中,本发明提供了c-Rel抑制剂,其减少淋巴细胞中多种炎症细胞因子的生产、共刺激分子的表达、以及细胞存活和细胞周期调节剂的表达。因此,c-Rel抑制剂抑制在免疫病理学状况核心处的主要类型的免疫细胞的激活T淋巴细胞、B淋巴细胞、树突状细胞和巨噬细胞。本发明提供了c-Rel抑制剂作为辅助试剂用于诱导免疫耐受或发展T调节作为用于自身免疫病和移植排斥的新疗法。与药物安全/毒性概况相关的另一个重要特征是c-Rel敲除小鼠中c-Rel活性的缺乏对系统发育、代谢或繁殖没有严重影响,它也不引起如Cox2敲除小鼠中可见的心纤维化。这种独特的安全性质是希望的,因为它暗示与Cox2抑制剂相反,c-Rel抑制剂将不引起不利效应。此外,靶向c-Rel避免了皮质类固醇和环孢菌素/FK506的全身毒性,以及Cox2抑制剂的心脏毒性。c-Rel最初鉴定为原癌基因。它的病毒配对物v-Rel癌基因最初转化且使来自脾脏和骨髓的未成熟和成熟的T和B淋巴样、髓样和树突状细胞永生化,并且在受感染的幼鸟中诱导侵袭性致死淋巴瘤。v-Rel的致癌潜能通过实验得到进一步证实,所述实验证实表达在T细胞向性启动子控制下的v-Rel的转基因小鼠发展在小鼠中的侵袭性T细胞白血病/、淋巴瘤。由于其阻止凋亡(通过诱导抗凋亡蛋白质)和诱导增殖(经由诱导细胞周期调节剂)的能力,c-Rel还与人中的许多癌症相关。c-Rel主要表达于造血细胞中的事实使得它成为许多B细胞白血病和淋巴瘤(表l)中最普遍的癌蛋白质之一。例如,人c-Rel基因座在显著比例的弥漫性大细胞淋巴瘤(23%)、原发性纵隔B细胞淋巴瘤、滤泡性B细胞淋巴瘤、和何杰金氏淋巴瘤中扩增。C-Rel基因重排或过表达也在弥漫性大细胞淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、和非小细胞性肺癌中检测到。此外,组成性或超激活NF-KB/Rel已在人B细胞肿瘤包括慢性淋巴细胞白血病(CLL)中检测到。新鲜分离的未刺激的CLLB细胞包含由c-Rel、p50和p65组成的高水平的核NF-kb/Rel活性。NF-kB/Rel可以由CD40进一步诱导,所述CD40与CLL细胞在体外延长的存活相关。显示异常c-Rel激活的B细胞肿瘤的其他例子包括多发性骨髓瘤、伯基特氏淋巴瘤、和外套细胞淋巴瘤。在某些实施方案中,本发明提供了阻断c-Rel减少B细胞淋巴瘤和具有Pten缺失的肿瘤细胞的增殖和存活的证据(实施例3,实施例4)。本发明不限于具体机制。事实上,机制的理解对于实践本发明不是必需的。然而,预期基于肺瘤B细胞已获得体内生存优势的观察,预期组成性c-Rel和/或NF-kB活性促成肿瘤细胞存活。NF-kB/Rel转录因子已知调节多种抗凋亡分子包括Bcl-x、Bel-2、Mcl-2、IAP和FLIPs。这些观察使得NF-KB/Rel家族成为用于治疗B细胞肿瘤、T细胞白血病、以及何杰金和非何杰金氏病的有吸引力的治疗靶。除了淋巴样肿瘤外,异常的组成性Rel/NF-kB活性已在许多非造血肿瘤和实体癌中发现,包括乳腺癌、前列腺癌、黑素瘤、结肠癌、卵巢癌、和非小细胞性肺癌。例如,具有在小鼠乳房肿瘤病毒(MMTV)长末端重复序列启动子控制下的人c-Rel基因的转基因小鼠发展乳房肿瘤,其平均潜伏期为19.9个月。高百分比的人乳腺肿瘤和肿瘤衍生细胞系具有由c-Rel、p50、Rel-B和Bc1-3组成的增加水平的組成性核NF-kB活性,且抑制NF-kB活性导致乳腺肿瘤细胞系的细胞毒性。在某些情况下,Rel/NF-kB活性的激活与成为转移或对化学疗法抗性的恶性进展。此类进展可以归于Rel/NF-KB在诱导涉及存活、增殖、迁移和血管发生的基因中的作用。在本发明的开发过程中进行的实验证实c-Rel活性的抑制减少起因于Pten基因中的突变的过度增生和淋巴瘤(实施例3)。Pten基因是在各种实体瘤中频繁突变的肿瘤抑制基因,所述实体瘤包括转移性前列腺癌、子宫内膜癌、转移性黑素瘤、和成胶质细胞瘤。Pten基因的突变已在超过80%具有考登氏病(CD)的个体中得到证明。Pten突变也在各种B细胞淋巴瘤中发现。特别地,鉴定了B细胞和淋巴瘤细胞的过增生性质之间的关联,所述细胞衍生自Pten突变型小鼠且持续激活和表达NF-KB/Rel及其下游靶基因。此外,通过药理学抑制剂或c-Rel敲除小鼠阻断NF-kB活性导致增殖的有效抑制和Pten突变型细胞的凋亡诱导。流行病学调查已显示由于癌症的~15%人死亡与慢性病毒或细菌感染相关,暗示感染、炎症和癌症之间的关联。例如,HCV感染是关于肝细胞癌(HCC)的重要危险因素。细菌幽门螺杆菌(Helicobactorpylori)是关于全世界第二种最常见的癌症胃癌的主要促进剂之一。已假设Re1/NF-kB经由经典IKK依赖途径的激活是炎症诱导的胂瘤生长和进展的关键介质。事实上,该假设已得到2种动物模型的支持炎症相关肝癌(关于肝瘤的模型)和炎症相关结肠癌(关于结肠炎相关癌症的模型)。这些模型暗示Rel/NF-KB可以通过诱导基因表达来促进肺瘤进展,所述基因编码分泌的细胞因子、生长因子、存活蛋白质、蛋白酶,以及关于趋化现象、迁移和血管发生的因子。因此,在某些实施方案中,本发明提供了用于靶向炎症相关癌症中的c-Rel的方法和组合物。在某些实施方案中,本发明提供了用于治疗感染或化学制品诱导的恶性的c-Rel活性抑制剂,所述恶性包括但不限于HCC、结肠癌、胃肠癌、肺癌、胰腺癌、膀胱癌和食道癌。尽管已存在关于开发抑制NF-kB和IKK信号途径的药物或化合物的几篇报道,但大多数这些研究集中于NF-kBP50/p65組分。W02005/046619(通过引用整体合并入本文)描述了用于调节c-Rel依赖性细胞因子生产的组合物和方法。在本发明的开发过程中进行的实验鉴定了c-Re1编码mRNA序列中可以特异性沉默c-Rel蛋白质表达的序列。c-Rel的沉默导致B细胞'淋巴瘤细胞系Wehi-231的凋亡和细胞周期进展的抑制(实施例4,5)。沉默原代B细胞中的c-Rel使得细胞更易受凋亡诱导的影响且减少对CD40信号的增殖应答。c-Rel的体内沉默导致针对抗原刺激的T细胞介导的免疫应答的显著损害。在本发明的开发过程中进行的进一步实验鉴定了抑制c-Rel活性的一系列小分子(参见例如,下文的实施例1和实施例6)。因此,在某些实施方案中,本发明提供了通过抑制c-Rel信号治疗癌症、炎症、自身免疫病、移植排斥和骨丟失的方法。例如,在某些实施方案中,本发明提供了抑制c-Rel活性的方法,以抑制抗原介导的免疫应答,引起抗原介导的免疫耐受(例如,自身抗原、自身组54织、变应原、同种异体抗原、同种异体组织、病原菌或病毒表位),且抑制慢性或急性炎症(例如,ARDS、脓毒症、哞喘、结肠炎,参见表l)。在其他实施方案中,c-Rel活性的抑制用于抑制自身反应性反应过度的淋巴细胞功能(例如,自身免疫病例如狼疮、类风湿性关节炎等,参见表l)。在另外其他的实施方案中,c-Rel活性的抑制用作用于移植的免疫抑制疗法。在再进一步的实施方案中,c-Rel活性的抑制用于诱导生长停止,且诱导具有组成性c-Rel活性或PI3K/Pten异常的肿瘤(例如,B细胞淋巴瘤、CLL、多发性骨髄瘤、非何杰金、前列腺癌、考登病和乳腺癌,参见表l)凋亡。抑制c-Rel信号途径及其下游靶基因的示例性方法在下文更详细地讨论,并且包括但不限于,调节影响c-Rel和靶基因表达的PI3K/Pten途径,包括免疫细胞受体(例如,关键BCR/TCR、TNF受体家族、N0D1、N0D2和Toll样受体)和已知调节c-Rel的信号组分(例如,Lyn、Fyn、Lck、PI3-激酶、Pten、Akt、Vav、BSAP、SLP-76、LAT、Itk、Btk、ZAP-70、PKC-P、PKC-6、PKC-C、Bcl-lO、MALT1、CARMA1、IKKoc、IKKP、IKKy、NIK、TRAFs、TAK1、TBK1、RIP、MyD88、TIRAP、TRAM和TRIF等),抑制c-Rel及其下游靶基因,包括但不限于,细胞因子(例如IL-2、IL-3、GM-CSF、IFN-y、IFN-ot、TNF、IL-6、IL-8、IL-IO、IL-13、IL-15、IL-12、IL-17、IL-23、IL-27、EBI3、MIP1ct、Rantes、VEGF),细胞因子受体(例如IL-2Roc、IFN-ct受体、0CILRP1、NKRPlf、双调蛋白、血管生成素样、N-EGF2、FGF1、Bmp-l),共刺激分子(例如CD80、CD86、CD40、CD44、CCR7、CXCR4、ICAM-1、VCAM-1、MMP-9),细胞周期蛋白质(例如细胞周期蛋白Dl、细胞周期蛋白D2、细胞周期蛋白D3、细胞周期蛋白E、E2Fs、ifi202),细胞存活蛋白质(例如Bcl-X、Bfl-l、Mcl-l、c-IAPs、c-FLIP、A20),信号分子(例如IKK-1、MKK1、GBP-1、Piml、Rapl、R-Rad、Mapl3K、PLA-y),和转录因子(例如c-myc、JunB、IRF1、IRF4、Stat5a、B-Atf、Tbx-2、Cited2、Pvitl、Cril、Siah2、Hox-8)。抑制c-Rel活性的示例性方法包括使用反义、siRNA、适体、抗体、肽、拟肽、小分子和天然化合物。I.疾病治疗和分析在某些实施方案中,本发明提供了用于治疗和/或分析癌症、炎症、器官移植排斥和自身免疫病的疗法。在某些实施方案中,方法抑制c-Rel活性或生物学功能(例如,通过抑制c-Rel与结合配偶体的相互作用)。在其他实施方案中,方法通过调节c-Rel上游信号调节剂、c-Rel转录活性或c-Rel靶基因表达来抑制功能。本发明进一步提供了药物筛选和研究用途(例如,鉴定c-Rel活性抑制剂)。在某些实施方案中,c-Rel活性的另外抑制剂使用本文公开的药物筛选应用进行鉴定。本发明不限于特定病状或疾病的治疗。特定癌症、炎症以及自身免疫病和病状的非限制性列表在表l中提供。显示可以应用的c-Rel特异性治疗的疾病由c-Rel抑制获益的特定疾病适应症炎性疾病(急性和慢性)哮喘和过敏症炎性肺综合征急性呼吸窘迫综合征(ARDS)新生儿慢性肺病慢性阻塞性肺疾病(COPD)革兰氏阳性脓毒症革兰氏阴性脓毒症培养物阴性脓毒症真菌脓毒症全身性炎症反应综合征肝炎结肠炎炎性肠病(IBD)缺血再灌注损伤动脉粥样硬化肾小球肾炎寻常天疱疮特发性血小板减少性紫癜口疮性溃疡虹膜炎结膜炎角膜结膜炎皮肤红斑狼疮阴道炎56<table>tableseeoriginaldocumentpage57</column></row><table>克罗恩氏病(炎性肠病)格雷夫斯氏病桥本氏曱状腺炎重症肌无力银屑病系统性红斑狼疮(SLE)淋巴组织增生病(ALPS)干燥综合征自身免疫性神经病格-巴二氏综合征自身免疫性葡萄膜炎自身免疫性溶血性贫血恶性贫血再生障碍性贫血单纯红细胞性贫血自身免疫性血小板减少症颞动脉炎抗磷脂综合征血管炎病韦格纳氏肉芽肿病白赛氏病疱渗一羊皮炎寻常天疱疮白癜风原发性胆汁性肝硬变自身免疫性肝炎自身免疫性卵巢炎和睾丸炎肾上腺的自身免疫病》更皮病多肌炎皮肌炎自身免疫性脑膜炎(meningitis)自身免疫性皮炎斑秃自身免疫性葡萄膜炎变应性脑脊髄炎间质肺纤维化血清阴性关节病结节病睾丸炎/输精管复通操作雷诺氏病B型胰岛素抵抗性糖尿病抗体介导的细胞毒性III型超敏反应58POEMS综合征多神经病器官巨大症内分泌病单克隆丙种球蛋白病皮肤改变综合征天疱疳混合性结締组织病特发性阿狄森氏病MI心切开术后综合征威尔逊氏病血色素沉着ot-1-抗胰蛋白酶缺乏骨质疏松症下丘脑-垂体-肾上腺轴评估家族性噬血性淋巴组织增生病子痫前症0kt3疗法抗-cd3疗法细胞因子疗法化学疗法放射疗法经由自身抗原或自身组织的共施用的免疫耐受疗法移植排斥移植物抗宿主病器官移植肾心肝胰腺岛细胞肺唇絲,輒皮肤同种异体移植软骨骨移植小肠胎儿胸腺植入甲状旁腺异种移植排斥同种异体移植排斥经由同种异体抗原或同种异体组织的共施用的免疫耐受疗法59癌症弥漫性大细胞淋巴瘤滤泡性B细胞淋巴瘤慢性淋巴细胞白血病多发性骨髄瘤伯基特氏淋巴瘤原发性纵隔B细胞淋巴瘤何杰金氏淋巴瘤非何杰金氏淋巴瘤外套细胞淋巴瘤粘膜相关淋巴样组织(MALT)淋巴瘤儿童急性成淋巴细胞白血病成人T细胞白血病急性成淋巴细胞性白血病慢性髄性白血病成免疫细胞性淋巴瘤卡波济氏肉瘤考登氏综合征(肠息肉病、曱状腺癌、乳腺癌)乳腺癌乳腺癌瘤结肠癌前列腺癌卵巢癌子宫内膜癌非小细胞性肺癌转移性前列腺癌转移性黑素瘤胰腺癌甲状腺癌膀胱癌肾细胞癌鳞状细胞癌鼻咽癌成胶质细胞瘤肝细胞癌(HCC)结肠癌胃肠癌肺癌胰腺癌膀脱癌食道癌A.反义和RNAi治疗60在某些实施方案中,本发明靶向c-Rel或信号配偶体的表达。例如,在某些实施方案中,本发明使用包含寡聚反义化合物特别是寡核苷酸的组合物,用于调节编码c-Rel或其信号配偶体的核酸分子的功能,最终调节c-Rel表达的量且影响c-Rel下游粑基因的表达。这通过提供与编码c-Rel或其信号配偶体的一种或多种核酸特异性杂交的反义化合物(例如,反义寡核苷酸、siRNA等)来完成。寡聚化合物与其靶核酸的特异性杂交干扰核酸的正常功能。i.RM干扰(RNAi)在某些实施方案中,RNAi用于抑制c-Rel功能。RNAi包括但不限于小干扰RNA(siRNA)、小发夹RM(shRNA)、和孩t小RNA(miRNA)。RNAi表示用于控制外源基因在大多数真核生物包括人中的表达的进化上保守的细胞防御。RMi—般由双链RM(dsRM)触发,且响应dsRNA引起与靶序列同源的单链靶RNAs的序列特异性mRNA降解。mRNA降解的介质是小干扰RNA双链体(siRNAs),这通常在细胞中通过酶促切割由长dsRNA产生。siRNAs长度一般为约21个核苷酸(例如,长度21-23个核苷酸),且具有特征在于2核苷酸3'-突出端的碱基配对结构。将小RNA或RNAi引入细胞内,认为序列递送给称为RISC的酶复合物(RNA诱导沉默复合物)。RISC识别靶且用核酸内切酶切割其。应当指出如果较大的RNA序列递送给细胞,那么RM酶III酶(Dicer)将较长的dsRNA转变成21-23nt双链siRNA片段。化学合成的siRNAs已成为用于培养的体细胞中的哺乳动物基因功能的全基因组分析的有效试剂。除了其用于验证基因功能的价值夕卜,siRNAs还具有作为基因特异性治疗剂的极大潜能(Tuschl和Borkhardt,MolecularIntervent.2002;2(3):158-67,通过引用合并入本文)。siRNAs转染到动物细胞内导致特异性基因的有效的、长效的转录后沉默(Caplen等人,ProcNat1AcadSciU.S.A.2001;98:9742-7;Elbashir等人,Nature.2001;411:494-8;Elbashir等人,GenesDev.2001;15:188-200;和Elbashir等人,EMBOJ.2001;20:6877-88,所有这些通过引用合并入本文)。用于用siRNAs执行RNAi的方法和组合物例如在美国专利6,506,559中得到描迷,所述专利通过引用合并入本文。siRNAs在减少耙RNA的量方面异常有效,并且通过延长蛋白质,通常至无法检测的水平。沉默效应可以持续数月,并且是异常特异性的,因为耙RNA和siRM的中心区域之间的1个核苷酸错配通常足以阻止沉默(Br画elkamp等人,Science2002;296:550-3;和Holen等人,NucleicAcidsRes.2002;30:1757-66,所述两者通过引用合并入本文)。siRNAs设计中的重要因子是用于siRNA结合的可接近位点的存在。Bahoia等人,(J.Biol.Chem.,2003;278:15991-15997;通过引用合并入本文)描迷了称为扫描阵列的DNA阵列类型的用途,以找到mRNAs中的可接近位点用于设计有效的siRNAs。这些阵列包含通过在序列中逐步添加每个碱基使用物理屏障(掩模)合成的,大小从单体到某一最大值通常为Comers的寡核苷酸。因此阵列表示靶基因区域的全长寡核苷酸互补物。靶mRNA与这些阵列的杂交提供了靶mRNA的这个区域详尽的可接近性概况。此类数据在反义寡核苷酸(7聚体-25聚体)设计中有用,其中重要的是达到寡核苷酸长度和结合亲和力之间的妥协,以保留效率和靶特异性(Sohail等人,NucleicAcidsRes.,2001;29(10):2041-2045)。用于选择siRNAs的另外方法和考虑在例如WO05054270、WO05038054Al、W003070966A2、JMolBiol.2005May13;348(4):883-93、JMolBiol.2005May13;348(4):871-81、和NucleicAcidsRes.2003Aug1;31(15):4417-24中得到描述,所述参考文献中的每一个通过引用整体合并入本文。此外,软件(例如,MWG在线siMAXsiRNA设计工具)是可商购或公开获得用于在siRNAs选择中使用。用于在调节c-Rel表达中使用的示例性siRNA序列在下文实施例4和5中描述。本发明不限于所述序列。可以设计且测试另外序列(例如使用本文描述的方法)。62ii.反义在其他实施方案中,本发明使用包含寡聚反义化合物特别是寡核苷酸(例如在下文描述的药物筛选方法中鉴定的那些)的组合物,用于调节编码c-Rel或其信号配偶体的核酸分子的功能,最终调节表达的c-Rel或信号配偶体的量。这通过提供与编码c-Rel或其信号配偶体的一种或多种核酸特异性杂交的反义化合物来完成。寡聚化合物与其靶核酸的特异性杂交干扰核酸的正常功能。靶核酸通过与其特异性杂交的化合物的这种功能调节一般称为"反义"。待干扰的DNA功能包括复制和转录。待干扰的RNA功能包括所有重要功能,例如RNA移位至蛋白质翻译位点、来自RNA的蛋白质翻译、RNA的剪接以产生一个或多个mRNA种类、以及可以由RNA参与或促进的催化活性。与靶核酸功能的此类干扰的总体效应是c-Rel表达的调节。在本发明的背景中,"调节"意指在基因表达中的增加(刺激)或减少(抑制)。例如,可以抑制表达以潜在治疗癌症或炎性疾病。优选靶向特定核酸用于反义。在本发明背景中,使反义化合物"靶向"特定核酸是多步过程。该过程通常始于其功能待调节的核酸序列的鉴定。这可以是例如其表达与特定病症或疾病状态相关的细胞基因(或由基因转录的mRNA),或来自传染剂的核酸分子。在本发明中,乾是编码c-Rel蛋白质的核酸分子。靶向过程还包括这种基因内用于反义相互作用发生的一个或多个位点的确定,从而使得将导致所需效应例如蛋白质的表达的检测或调节。在本发明的背景中,优选的基因内位点是包含基因的开放读码框(0RF)的转录起始或终止密码子的区域。因为翻译起始密码子一般是5'-AUG(在转录的mRNA分子中;在相应的DNA分子中是5'-ATG),所以转录起始密码子也称为"AUG密码子"、"起始密码子"或"AUG起始密码子"。少数基因具有含RNA序列5'-GUG、5'-UUG或5'-CUG的翻译起始密码子,并且5'-AUA、5'-ACG和5'-CUG已显示在体内起作用。因此,术语"翻译起始密码子,,和"起始密码子"可以包含许多密码子序列,尽管每种情况下的起始氨基酸一般是甲硫氨酸(在真核生物中)或甲酰甲硫氨酸(在原核生物中)。真核和原核基因可以具有2个或更多备选起始密码子,其中任何一个都可以优先用于在特定细胞类型或组织中,或在特定条件组下的翻译起始。在本发明的背景中,"起始密码子"和"翻译起始密码子"指在体内用于起始由编码本发明肿瘤抗原的基因转录的mRM分子翻译的一个或多个密码子,与此类密码子的序列无关。基因的翻译终止密码子(或"终止密码子")可以具有3种序列(即,5'-UAA,5'-UAG和5'-UGA;相应的DNA序列分别是5'-TAA,5'-TAG和5'-TGA)之一。术语"起始密码子区"和"翻译起始密码子区"指包含从翻译起始密码子开始的任一方向(即,5'或)中的约25-约50个邻接核苷酸的此类mRNA或基因部分。类似地,术语"终止密码子区"和"翻译终止密码子区"指包含从翻译终止密码子开始的任一方向(即,5'或3')中的约25-约50个邻接核苷酸的此类mRNA或基因部分。开放读码框(0RF)或"编码区"指翻译起始密码子和翻译终止密码子之间的区域,也是可以有效靶向的区域。其他靶区包括5'非翻译区(5'UTR),指从翻译起始密码子开始在5'方向中的mRNA部分,且因此包括mRNA或基因上的相应核苷酸的5'加帽位点和翻译起始密码子之间的核苷酸,以及3'非翻译区(3'UTR),指从翻译起始密码子开始在3'方向中的mRNA部分,且因此包括mRNA或基因上的相应核苷酸的翻译终止密码子和3'末端之间的核苷酸。mRNA的5'帽包含经由5'-5'三磷酸盐键与mRNA的最5'末端残基连接的N-曱基化鸟苷残基。认为mRNA的5'帽区域包括5'帽结构其自身以及与帽邻近的前50个核苷酸。帽区域也可以是优选靶区。尽管某些真核mRNA转录物是直接翻译的,但许多包含称为"内含子,,的一个或多个区域,所述内含子在其翻译前从转录物中切除。其余(且因此被翻译的)区域称为"外显子,,并且剪接在一起以形成连续mRNA序列。mRNA剪接位点(即,内含子-外显子连接)也可以是优选靼区,并且在其中异常剪接涉及疾病、或其中特定mRNA剪接产物的过度产生涉及疾病的情况下特别有用。由于重排或缺失的异常融合连64接也是优选靶。已发现内含子也可以是有效的,且因此是用于反义化合物耙向例如DNA或前mRNA的优选乾区。在某些实施方案中,用于反义抑制的靶位点使用商购可得的软件程序(例如,Biognostik,Gottingen,Germany;SysArrisSoftware,Bangalore,India;AntisenseResearchGroup,UniversityofLiverpool,Liverpool,England;GeneTrove,Carlsbad,CA)进行鉴定。在其他实施方案中,用于反义抑制的靶位点使用在美国专利W00198537A2中描述的可接近位点方法进行鉴定,所述专利通过引用合并入本文。一旦一个或多个靼位点已鉴定,就选择与靼足够互补的寡核苷酸(即,足够充分且以足够的特异性杂交)以产生所需效应。例如,在本发明的优选实施方案中,反义寡核苷酸靶向起始密码子或附近。在本发明的背景中,"杂交"就反义组合物和方法而言意指氢键合,这可以是在互补核苷或核苷酸碱基之间的沃森-克里克、Hoogsteen或反向Hoogsteen氩键合。例如,腺嘌呤和胸腺嘧啶是通过形成氢键配对的互补核碱基。应当理解反义化合物的序列无需与其可特异性杂交的靶核酸的那种100%互补。反义化合物是可特异性杂交的,当化合物与靼DNA或RNA分子的结合干扰靶DNA或RNA的正常功能以引起效用丧失,并且存在足够程度的互补性,以避免反义化合物与非靶序列在其中需要特异性结合的条件下的非特异性结合(即,在体内测定法或治疗处理的情况下,在生理条件下,或在体外测定法的情况下,在其中测定法进行的条件下)时。反义化合物通常用作研究试剂和诊断剂。例如,能够以特异性抑制基因表达的反义寡核苷酸可以用于阐明特定基因的功能。反义化合物可以例如用于区分生物途径的各个成员的功能。反义的特异性和敏感性也应用于治疗用途。例如,反义寡核苷酸已在动物和人中的疾病状态治疗中用作治疗部分。反义寡核苷酸已安全且有效地应用于人,并且众多临床试验目前在进行中。因此确定寡核苷酸是可以设定用于治疗细胞、组织和动物、特别是人的治疗方案中的有用治疗部分。尽管反义寡核苷酸是优选形式的反义化合物,但本发明包含其他寡聚反义化合物,包括但不限于例如下文描述的寡核苷酸模拟物。依照本发明的反义化合物优选包含约8-约30个核碱基(即,约8-约30个连接碱基),尽管更长和更短的序列也可以在本发明中找到用途。特别优选的反义化合物是反义寡核苷酸,再更优选包含约12-约25个核碱基的那些。对于本发明有用的优选反义化合物的具体例子包括包含经修饰的主链或非天然核普间键的寡核苷酸。如本说明书中定义的,具有经修饰的主链的寡核苷酸包括在主链中保留磷原子的那些和在主链中不含磷原子的那些。为了本说明书的目的,在其核苷间主链中不含磷原子的经修饰的寡核普酸也可以一见为寡核苷(oligonucleoside)。优选的经修饰的寡核苷酸主链包括例如磷硫酰、手性磷硫酰、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、氨基烷基磷酸三酯、甲基和其他烷基膦酸酯,包括3'烯基膦酸酯和手性膦酸酯、亚膦酸酯、氨基磷酸酯包括3'-氨基磷酸酯和氨基烷基氨基磷酸酯、硫代氨基磷酸酯、硫代烷基膦酸酯、硫代烷基磷酸三酯、和具有正常的3'-5'键的磷酸硼,这些的2'-5'连接的类似物,以及其中核苷单位的邻近对3'-5'与5'-3'或2'-5'与5'-2'连接具有反向极性的那些。还包括各种盐、混合盐和游离酸形式。在其中不包括磷原子的优选的经修饰的寡核苷酸主链具有由短链烷基或环烷基核苷间键、混合杂原子和烷基或环烷基核苷间键、或者一个或多个短链杂原子或杂环核苷间键形成的主链。这些包括具有吗啉代键(部分由核苷的糖部分形成);硅氧烷主链;硫化物,亚砜和砜主链;甲酰基(formacetyl)和硫甲酰基(thioformacetyl)主链;亚曱基甲酰基和硫曱酰基主链;包含链烃的主链;氨基磺酸盐主链;亚甲亚氨基和亚甲肼基主链;磺酸盐和磺酰胺主链;酰胺主链;和具有混合的N、0、S和CH2组分部分的其他。在其他优选的寡核苷酸模拟物中,核苷酸单位的糖和核苷间键(即,主链)由新基团替换。碱基单位维持用于与合适的核酸靶化合物杂交。一种此类寡聚化合物一一已显示具有极佳的杂交性质的寡核普酸模拟物称为肽核酸(PNA)。在PNA化合物中,寡核苷酸的糖主链由包含酰胺的主链,特别是氨基乙基甘氨酸主链替换。核碱基被保留且与主链的酰胺部分的氮杂氮原子直接或间接结合。教导PNA化合物制备的代表性美国专利包括但不限于美国专利号5,539,082;5,714,331;和5,719,262,所述专利中的每一个通过引用合并入本文。PNA化合物的进一步教导可以在Nielsen等人,Science254:1497(1991)中找到。本发明最优选的实施方案是具有磷硫酰主链的寡核苷酸或具有杂原子主链的寡核苷,且特别是上文提及的美国专利号5,489,677的—CH2、--NH--0—CH2—、—CH2—N(CH3)—0—CH2—[称为亚曱基(甲基亚氨基)或MMI主链]、一CH2—0—N(CH3)—CH「、—CH「N(CH3)—N(CH3)—CH2—、和--0—N(CH3)—CH「-CH「[其中天然磷酸二酯主链表示为一0--P—0--CH2—],以及上文提及的美国专利号5,602,240的酰胺主链。还优选的是具有上文提及的美国专利号5,034,506的吗啉代主链结构的寡核苷酸。经修饰的寡核苷酸还可以包含一个或多个取代糖基团。优选的寡核苷酸包含在2'位置上的下述之一OH;F;0-,S-或N-烷基;O-,S-或N-烯基;0-,S-或N-炔基;或0-烷基-O-烷基,其中烷基、烯基和炔基可以是取代的或未取代的d-d。烷基或烯基和C广d。炔基。特别优选的是O[(CH2)n0]mCH3、0(CH2)nOCH3、0(CH2)nNH2,0(CH2)nCH3、0(CH2)n0NH2、和0(CH2)n0N[(CH2)nCH3)]2,其中n和m为l一约10。其他优选的寡核苷酸包含在2'位置上的下述之一d-d。低级烷基、取代低级烷基、烷芳基、芳烷基、0-烷芳基或0-芳烷基、SH、SCH3、0CN、Cl、Br、CN、CF3、0CF3、S0CH3、S02CH3、0N02、N02、N3、NH2、杂环烷基、杂环烷芳基、氨基烷基氨基、聚烷基氨基、取代甲硅烷基、RNA切割基团、报道基团、插入剂、用于改善寡核苷酸的药代动力学性质的基团、或用于改善寡核苷酸的药效学性质的基团、和具有类似67性质的其他取代基。优选的修饰包括2'-甲氧基乙氧基(2'-0—CH2CH2OCH3,也称为2'-O-(2-甲氧基乙基)或-MOE)(Martin等人,Helv.Chim.Acta78:486[1995])即,烷氧基烷氧基。进一步优选的修饰包括2'-二甲基氨基氧基乙氧基(即,0(CH2)20N(CH3)2基团),也称为2'-DMA0E,和2'-二甲基氨基乙氧基乙氧基(在本领域中也称为2'-0-二甲基氨基乙氧基乙基或2'-DMAE0E),即2'-0—CH2—0—CH2—N(CH2)2。其他优选的修饰包括2'-甲氧基(2'-0—CH3)、2'-氨基丙氧基(2'-OCH2CH2CH2NH2)和2'-氟(?-F)。类似修饰还可以在寡核苷酸上的其他位置上进行,特别是3'末端核苷酸上或2'-5'连接的寡核苷酸中的糖的3'位置和5'末端核苷酸的5'位置。寡核苷酸还可以具有糖模拟物例如环丁基部分代替戊呋喃基糖。寡核苷酸还可以包括核碱基(在本领域中通常简称为"碱基")修饰或置换。如本文所使用的,"未修饰的,,或"天然的"核碱基包括噤呤碱基腺噤呤(A)和鸟噤呤(G),以及嘧啶碱基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)和尿嘧啶(U)。经修饰的核碱基包括其他合成和天然核碱基例如5-曱基胞嘧啶(5-me-C),5-羟基甲基胞嘧啶,黄嘌呤,次黄噪呤,2-氨基腺嘌呤,以及腺嘌呤和鸟噪呤的6-甲基和其他烷基衍生物,腺噤呤和鸟嘌呤的2-丙基和其他烷基衍生物,2-硫脲嘧啶,2-硫代胸腺嘧啶和2-硫胞嘧啶,5-卣素尿嘧啶和胞嘧啶,5-丙炔基尿嗜啶和胞嘧啶,6-氮杂尿嘧啶、胞嘧啶和胸腺嘧啶,5-尿嘧啶(假尿嘧啶),4-硫脲嘧啶,8-闺素、8-氨基、8-硫醇、8-硫烷基、8-羟基和其他8-取代腺嘌呤和乌嘌呤,5-卣素特别是5-溴、5-三氟甲基和其他5-取代尿嘧啶和胞嘧啶,7-甲基鸟嘌呤和7-曱基腺嘌呤,8-氮杂鸟嘌呤和8-氮杂腺嘌呤,7-去氮杂鸟嘌呤和7-去氮杂腺嗓呤以及3-去氮杂鸟噪呤和3-去氮杂腺嘌呤。进一步的核碱基包括美国专利号3,687,808中公开的那些。这些核碱基中的某些对于增加本发明的寡聚化合物的结合亲和力特别有用。这些包括5-取代嘧啶、6-氮杂嘧啶以及N-2、N-6和0-6取代嘌呤,包括2-氨基丙基腺嘌呤,5-丙炔基尿嘧啶和5-丙炔基胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶置换已显示使核酸双链体稳定性增加0.6-1.2'C,并且是目前优选的碱基置换,当与2'-0甲氧基乙基糖修饰组合时甚至更特别优选。本发明的寡核苷酸的另一种修饰涉及使寡核苷酸与一个或多个部分或缀合物化学连接,所述部分或缀合物增强寡核苷醉的活性、细胞分布或细胞摄取。此类部分包括但不限于脂质部分例如胆固醇部分、胆酸、硫醚(例如,己基-S-三苯甲基硫醇)、硫胆固醇、脂肪族链(例如,十二烷二醇或十一基残基)、磷脂(例如,双-十六烷基-射碳-甘油或三乙胺1,2-二-O-十六烷基-射碳-甘油-S-H-膦酸酯)、聚胺或聚乙二醇链或金刚烷乙酸、棕榈基部分、或十八胺或己胺基-羰基-羟胆甾醇部分。相关领域中的技术人员充分了解如何产生包含上述修饰的寡核苷酸。本发明不限于上文描述的反义寡核苷酸。可以利用任何合适的修饰或置换。关于给定化合物中的所有位置无需一致地修饰,并且事实上超过一种上述修饰可以掺入单个化合物或甚至寡核苷酸内的单个核苷上。本发明还包括其为嵌合化合物的反义化合物。在本发明背景中的"嵌合"反义化合物或"嵌合体"是反义化合物,特别是寡核苷酸,其包含2种或更多化学上不同的区域,各自由至少一个单体单位组成,即在寡核苷酸化合物情况下的核苷酸。这些寡核苷酸一般包含至少一个区域,其中寡核苷酸进行修饰以便对寡核苷酸赋予对于核酸酶降解增加的抗性、增加的细胞摄取和/或对于靶核酸增加的结合亲和力。寡核苷酸的另外区域可以充当能够切割RNA:DNA或RNA:RM杂交物的酶的底物。例如,RNA酶H是切割RNA:DNA双链体的RNA链的细胞核酸内切酶。因此,RNA酶H的激活导致RNA靶的切割,从而极大地增强了基因表达的寡核苷酸抑制的效率。因此,与和相同靶区杂交的磷硫酰脱氧寡核苷酸比较,当使用嵌合寡核苷酸时,使用较短的寡核苷酸通常可以获得可比较的结果。RNA靶的切割可以通过凝胶电泳进行常规检测,并且必要时联合本领域已知的核酸杂交技术。69本发明的嵌合反义化合物可以作为2个或更多寡核苷酸、经修饰的寡核苷酸、寡核苷和/或如上所述的寡核苷酸模拟物的组合结构形成0本发明还包括药物组合物和制剂,其包含如下所述的本发明的反义化合物。B.抗体疗法在其他实施方案中,本发明提供了靶向癌症、炎症或自身免疫病中的c-Rel或c-Rel途径组分的抗体。在优选实施方案中,用于治疗的抗体是人源化抗体。用于产生抗体的方法和组合物在下文描述。C.小分子药物在再进一步的实施方案中,本发明提供了通过抑制c-Rel的生物活性或改变c-Rel途径组分的生物活性来治疗癌症、炎症或自身免疫病的药物(例如,小分子药物)。示例性小分子药物在下文实施例1、2、6和7中描述。在本发明的开发过程中进行的实验鉴定了3个小分子c-Rel抑制剂家族。I类化合物包含下述通式之一其中RhR2、Rs和R6独立地选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、离代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。R3选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卤代炕基、囟代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基、卤素、CN、N02、S02R、NRR12、NR12(CO)0RU、NH(CO)NR丄、NR12(CO)Ru、0(CO)Ru、0(CO)0R、0(CS)Ru、NR12(CS)Ru、NH(CS)NRUR12、NR12(CS)0RU,其中R和Ru独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。优选的R3基团选自芳基、取代芳基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族。例如,其中X选自0、S、NH、NR7。R4独立地选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卤代烯基、卤代烯基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基、卤素、CN、N02、S(Uu、NRnR12、NR12(CO)0Rn、NH(CO)NRUR12、NR12(CO)R、0(CO)R、0(CO)OR"、0(CS)R、NR12(CS)R"、NH(CS)NRR12、NR12(CS)0Rn,并且其中R7、Ru和Ru独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卣代烯基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环芳基、取代环烷基。包含如下列出的核心结构的I类化合物由IT101-113(图15)例Y—一任何取代基II类化合物包含下述通用吡唑酮萘支架71其中R,和R2独立地选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基、卣素、0H、0R、SH、SRu、N02、CN、S02Ru、NRR12、NR12(CO)0Rn、NH(CO)NRuR12、NR12(CO)Ru、0(CO)Ru、0(CO)0R、0(CS)Ru、NR12(CS)R、NH(CS)NRR12、NR12(CS)0RU。Ru和l独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卤代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。Ru和Ru可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族、环芳基、取代环烷基。R3和^独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。113和R4可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族、环芳基、取代环烷基。II类化合物由IT202-203(图15)例示。III类化合物包含式3的下述通用结构其中X和Y独立地选自NH、NR4、0和S。Id、R2和R4独立地选自氢、芳基、烷基、取代烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、囟代烯基、囟代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。R!和R2可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环、取代杂环、环芳基、取代环烷基。R3选自氢、芳基、取代芳基、烷基、取代烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基、囟素、C0Ru、0H、0Ru、SH、SR、N02、CN、S02Ru、NRUR12、NR12(CO)0R、NH(CO)NRUR12、NR12(CO)Ru、0(CO)R、0(CO)0RU、0(CS)R、NR12(CS)Ru、NH(CS)NRUR12、NR12(CS)0RU。Ru和Ru独立地选自氢、芳基、芳烷基、取代芳烷基、烷基、取代烷基、烯基、取代烯基、炔基、取代炔基、卣代烷基、卣代烯基、卣代炔基、芳基烷基、芳基烯基、芳基炔基、杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族或非芳香族、环烷基、取代环烷基。Rn和Ru可以进行连接以形成环,所述环可以是杂环芳香族或非芳香族、取代杂环芳香族、环芳基、取代环烷基。III类化合物由IT201和IT301-302(图15)例示。本发明不限于本文描述的化合物。本发明特别考虑了所公开的前导化合物的化学修饰和衍生物。在其他实施方案中,另外的小分子药物使用下文描述的药物筛选方法进行鉴定。在特别优选的实施方案中,本发明的小分子药物导致癌症、炎症或自身免疫病的抑制或预防。D.适体在其他实施方案中,适体用作c-Rel抑制剂。适体是提供三级结构中的广大多样性的独特RNA/DNA聚合物。这允许选择与目的蛋白质特异性相互作用的独特适体。在某些实施方案中,适体由DNA或RNA分子的l条直链产生。在其他实施方案中,使用以Y型、X型和T型形式的分支DNA分子。这些分支DM分子增加无法由常规适体达到的三级结构的多样性,导致显著扩增的适体文库和更快速的适体筛选。适体是具有特异亲和力以靶向分子(通常为蛋白质)的功能寡核苷酸序列,非常类似抗体-抗原相互作用(Jayasena,1999.ClinChem45:1628)。各种适体已通过指数式富集法(ExponentialEnrichment)(SELEX)过程(Uphoff等人,1996.CurrOpinStructBiol6:281)经由配体的系统演化来产生。在这个过程中,产生可以扩增的线性核酸序列文库,且就具有与靶分子(例如,在这种情况下c-Rel)的特异性结合亲和力的序列进行快速筛选。候选物随后进行合并且经由PCR进行扩增。这个选择和富集步骤显著减少了起始文库的复杂性,并且重复数次直至鉴定阳性序列。适体已成功地用作试剂用于诊断(Gold,1995.JBiolChem270:13581)和用作抑制剂用于治疗(Gold等人,1995.A画RevBiochem64:763)。在某些实施方案中,具有组氨酸标记的c-Rel蛋白质通过使用镍柱从大肠杆菌进行纯化。蛋白质纯度通过电泳在变性SDS-PAGE上进行评估。蛋白质活性通过电泳迁移位移测定法(EMSA)进行评估。在某些实施方案中,设计Y-DNA结构。Y-DNA的每条臂设计为具有含随机序列的长突出端(单链DM或SSDNA),产生物理上分支形成的3种潜在适体。这些分支适体具有多得多的多样性和复杂性。类似地X-DNA和T-DNA可以用于产生大的、多样化的适体文库。形成后,Y-、X-或T-DNA是相当稳定的。在某些实施方案中,经由充分确定的6xHis-Ni结合的固相测定法用于筛选DNA-适体复合物(经修饰的SELEX过程)。简言之,在每个臂上具有随机序列的Y-DM、X-DNA和T-DM由DNA合成仪进行合成。6xHis-c-Rel用于结合Ni-包被的96孔。适体文库首先与附着的c-Rel进行温育,然后充分洗涤。试验性结合配偶体被保留,而未结合的DNA被洗掉。Y-DNA-适体的扩增经由PCR使用2种常见引物来进行,并且整个过程重复数次以富集对c-Rel具有高亲和力的适体。候选物经由更严格的测定法进行进一步筛选(例如,下文实验部分中描迷的EMSA测定法)。还测定结合亲和力。最终适体的序列经由测序进行确定。在另外的实施方案中,X、Y和T的组合用于产生不同效价的适体(除了如Y-DNA-适体中可见的3种外)。这更增加了多样性。例如,Y-DNA可以与Y-DNA自身进行连接。分支在几何学上得到增加且增加74效价。通过使用不同的几何学和效价,可以产生分支DNA-适体文库的许多集合,从而使得游离端(其携带适体序列)的数目从3(Y-DNA),4(X-DNA)调整至几乎所需的任何数目。例如,五效价(5臂)可以通过使Y-DNA与X-DNA简单地连接来达到。类似地,6效价(6臂)可以通过使2个四价X-DNAs简单地连接来制备。一般而言,当n是偶数时,为了制备n个游离端,所需要的是连接(n-2)个Y-DNA。当n是奇数时,为了制备n个臂,这更复杂但仍非常可行可以总是将n-效价切割成2部分偶数(m)和小的奇数(p),其中n=m+p。此处显示了11效价的例子11=6+5。6效价(6)和5效价(5)可以容易地制成。通过使6-5DNA加上额外的Y,获得具有ll个分支的多价DNA。使用这种策略,可以装配任何分支的适体DNA。适体就其阻止c-Rel蛋白质与NF-KB位点结合的能力进行筛选。此类候选物改变c-Rel三级证实(原文为confirmation,疑为conformation,构象)或与c-Rel蛋白质的临界DNA识别相结合,因此干扰c-Rel与NF-kB位点的相互作用。在EMSA测定法中显示抑制剂活性的适体用体外细胞测定法(例如,使用NF-KB-萤光素酶报道测定法)进行进一步测试。将NF-KB-萤光素酶报道质粒和c-Rel适体以各种比率共转染到3T3成纤维细胞系内。48小时后,细胞裂解物由这些转染子进行制备且使用光度计测定萤光素酶活性。所需的c-Rel适体抑制由NF-KB启动子驱动的萤光素酶活性,作为它们阻止c-Rel与启动子区中的同源NF-kB基序結合的指示。E.肽和拟肽疗法在某些实施方案中,肽和拟肽疗法用于减少c-Rel活性和/或表达。在某些实施方案中,疗法是与c-Rel或c-Rel途径组分相互作用的肽以减少或抑制c-Rel的生物活性。本发明进一步包括经修饰的肽以改善在药物化合物中有用的一种或多种性质。例如,在某些实施方案中,肽进行修饰以增强其进入细胞内间隔的能力。此类修饰包括但不限于添加带电基团、脂质、肉豆蔻酸盐(参见例如,美国专利5,607,691;通过引用合并入本文)、或衍生自HIVTAT肽或触角足基因同源结构域的细胞可渗透肽。在其他实施方案中,本发明的肽可以以脂质体的形式,其中除了其他药学上可接受的载体外,分离的肽与两亲试剂例如以聚集形式存在的脂质组合,所述聚集形式如胶束、不溶性单层、液晶、或水溶液中的片状层。用于脂质体制剂的合适脂质包括但不限于甘油单酯、甘油二酯、硫苷脂、溶血卵磷脂、磷脂、皂苷、胆汁酸等。此类脂质体制剂的制备在本领域技术水平内,如例如在美国专利号4,235,871;美国专利号4,501,728;美国专利号4,837,028;和美国专利号4,737,323中公开的,所述所有专利通过引用合并入本文。在其他实施方案中,利用拟肽。用于此类模拟物的各种设计都是可以的。例如,特别考虑了包含环的肽,其中用于结合的所需构象通过非肽进行稳定。全部通过引用在此合并的美国专利号5,192,746、美国专利号5、169,862、美国专利号5,539,085、美国专利号5,576,423、美国专利号5,051,448和美国专利号5,559,103描述了用于制备此类化合物的方法。模拟肽序列的非肽化合物的合成也是本领域已知的。E1dred等人(J.Med.Chem.,37:3882[1994])描述了模拟肽序列的非肽拮抗剂。同样地,Ku等人(J.Med.Chem.,38:9[1995])给出了一系列此类化合物的合成的进一步阐述。模拟本发明的肽抑制剂的此类非肽化合物由本发明特别考虑。本发明还考虑了合成的模拟化合物,其是重复相关肽序列的多聚化合物。如本领域已知的,肽可以通过使氨基与羧基连接进行合成,所述羧基已通过与偶联剂例如二环己基碳二亚胺(DCC)反应得到激活。激活的羧基上的游离氨基的攻击导致肽键的形成和二环己脲的释放。可能必须保护除预期反应的氨基和羧基外的潜在反应基团。例如,包含激活的羧基的组分的oc-氨基可以用叔丁氧基羰基进行阻断。这种保护基团可以随后通过使肽暴露于稀释的酸来去除,这使肽键保持完整。使用这种方法,肽可以通过固相方法通过将氨基酸逐步添加在生长的肽链上容易地合成,所述肽链与不溶性基质例如聚苯乙烯珠连接。所需肽序列的羧基末端氨基酸(具有氨基保护基团)首先与聚苯乙烯珠锚定。随后去除氨基酸的保护基团。用偶联剂添加下一个氨基酸(具有保护基团)。这随后为洗涤循环。必要时重复该循环。在一个实施方案中,本发明的拟肽是与具有所需活性的肽具有序列同源性的肽。用于评估序列同源性和更重要地统计上显著的相似性的一种常见方法是使用分析MonteCarlo,使用由Lipman和Pearson写的算法以获得Z值。根据这种分析,大于6的Z值指示可能的显著性,和大于IO的Z值视为统计上显著的(Pearson和Upman,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA),85:2444-2448(1988);Upman和Pearson,Science,227:1435(1985))。在某些实施方案中,具有所需活性的肽和拟肽使用本文描述的药物篩选方法进行鉴定。F.基因和移植疗法在另外其他的实施方案中,本发明考虑了用于在调节c-Rel表达中使用的任何基因操作的用途。基因操作的例子包括但不限于c-Rel抑制剂的递送(例如,给细胞、组织或受试者)。核酸构建体在体外或体内递送给细胞可以使用任何合适的方法来进行。合适的方法是将核酸构建体引入细胞内,从而使得所需事件发生的那种(例如,单独或与治疗剂或靶向试剂组合的siRNA构建体的表达)。例如,细胞可以进行离体感染以减少c-Rel表达,并且转染的细胞可以移植至肿瘤或其他疾病位点。携带遗传信息和/或治疗剂的分子引入细胞内通过各种方法中的任何一种来达到,所述方法包括但不限于棵露DNA构建体的直接注射,用装载所述构建体的金颗粒轰击,和使用例如脂质体、生物聚合物等的大分子介导的基因转移。优选方法使用衍生自病毒的基因递送媒介物,所述病毒包括但不限于腺病毒、逆转录病毒、痘苗病毒和腺伴随病毒。因为与逆转录病毒比较更高的效率,衍生自腺病毒的栽体是用于在体内将核酸分子转移到宿主细胞内的优选基因递送媒介物。腺病毒载体已显示提供非常有效的体内基因转移到动物模型中的各种实体77瘤内,以及转移到免疫缺陷小鼠中的人实体瘤异种移植物内。用于基因转移的腺病毒栽体的例子和方法在PCT公开W000/12738和WO00/09675以及美国专利申请号6,033,908、6,019,978、6,001,557、5,994,132、5,994,128、5,994,106、5,981,225、5,885,808、5,872,154、5,830,730和5,824,544,所述专利各自通过引用整体合并入本文。栽体可以以各种方式施用于受试者。例如,在本发明的某些实施方案中,载体使用直接注射施用到肿瘤、与肿瘤相关的组织、或发炎组织例如关节炎关节内。在其他实施方案中,施用经由血管或淋巴循环(参见例如,通过引用整体合并入本文的PCT公开99/02685)。腺病毒载体的示例性剂量水平优选为加入灌注液中的10S-10"载体颗粒。G.药物组合物本发明进一步提供了药物组合物(例如,包含上文描述的治疗化合物)。本发明的药物组合物可以以许多方式进行施用,依赖需要局部还是全身治疗以及待治疗的区域。施用可以是局部的(包括眼和粘膜包括阴道和直肠递送),肺(例如,通过粉剂或气溶胶的吸入或吹入,包括通过喷雾器;气管内、鼻内、表皮和经皮),口部或肠胃外。肠胃外施用包括静脉内、动脉内、皮下、腹膜内或肌内注射或输注;或颅内,例如鞘内或心室内施用。用于局部施用的药物组合物和制剂可以包括经皮贴剂、软骨、洗剂、乳骨、凝胶、滴剂、栓剂、喷雾剂、液体和粉剂。常规药学载体,水、粉末或油基,增稠剂等可能是必需或希望的。用于口部施用的组合物和制剂包括粉剂和粒剂、在水或非水媒介物中的悬浮液或溶液、胶嚢、囊剂或片剂。增稠剂、调味剂、稀释剂、乳化剂、分散助剂或粘合剂可能是希望的。用于肠胃外、鞘内或心室内施用的组合物和制剂可以包括无菌水溶液,其还可以包含緩沖剂、稀释剂和其他合适的添加剂,例如但不限于,穿透促进剂、载体化合物和其他药学上可接受的载体或赋形剂。本发明的药物组合物包括但不限于溶液、乳状液、和包含脂质体的制剂。这些组合物可以由各种组分产生,所述组分包括但不限于预形成的液体、自乳化固体和自乳化半固体。可以常规地以单位剂型呈现的本发明的药物制剂可以根据制药工业中众所周知的常规技术进行制备。此类技术包括使活性成分与药学栽体或赋形剂结合的步骤。一般而言制剂通过下述进行制备使活性成分与液体载体或精细分开的固体载体或两者均勻地且亲密地结合,然后必要时使产物成型。本发明的组合物可以配制成许多可能的剂型,例如但不限于片剂、胶嚢、液体糖浆剂、软凝胶、栓剂和灌肠剂。本发明的组合物还可以在水、非水或混合介质中配制为悬浮液。水悬浮液可以进一步包含增加悬浮液的粘度的物质,包括例如,羧甲基纤维素钠、山梨糖醇和/或葡聚糖。悬浮液还可以包含稳定剂。在本发明的一个实施方案中,药物组合物可以配制且作为泡沫使用。药学泡沫包括制剂,例如但不限于乳状液、微乳液、乳骨、凝胶剂和脂质体。尽管在性质中基本上类似,但这些制剂在最终产物的组分和一致4生方面不同。增强寡核苷酸在细胞水平上的摄取的试剂也可以加入本发明的药物和其他组合物中。例如,阳离子脂质例如Lipofectin(美国专利号5,705,188)、阳离子甘油衍生物、和聚阳离子分子例如聚赖氨酸(WO97/30731),也增强寡核苷酸的细胞摄取。本发明的组合物可以另外包含在药物组合物中常规发现的其他附加组分。因此,例如組合物可以包含另外的、相容的、药学活性材料,例如止痒药、收敛剂、局部麻醉药或抗炎剂,或可以包含在物理配制本发明的组合物的各种剂型中有用的另外材料,例如染料、调味剂、防腐剂、抗氧化剂、遮光剂、增稠试剂和稳定剂。然而,此类材料当调节时,不应不当地干扰本发明的組合物的组分的生物活性。制剂可以进行灭菌,和需要时与不会有害地和制剂的核酸相互作用的辅助试剂混合,例如润滑剂、防腐剂、稳定剂、湿润剂、乳化剂、用于影响渗透压的盐、緩冲剂、着色剂、调味料和/或芳香族物质等。79给药依赖待治疗的疾病状态的严重度和应答性,其中疗程从数天持续至数月,或直至实现治愈或达到疾病状态的减少。最佳给药方案可以由患者体内的药物积聚的测量进行计算。施用医师可以容易地确定最佳剂量、给药方法和重复率。最佳剂量可以依单个寡核苷酸的相对功效而变,并且一般可以基于在体外或体内动物模型中发现有效的ECs。s,或基于本文描述的实施例进行估计。一般而言,剂量为0.01)ig-100g/kg体重,并且可以每天、每周、每月或每年给予一次或多次。治疗医师可以基于测量的停留时间和药物在体液或组织中的浓度来估计用于给药的重复率。成功治疗后,可能希望使受试者经历维持疗法以阻止疾病状态的复发,其中疗法以O.Olnig-100g/kg体重的维持剂量施用,每天一次或多次至每20年一次。H.与抗c-Rel化合物组合或共施用的治疗剂在某些实施方案中,本发明的c-Rel靶向化合物与另外的治疗剂一起共施用。广泛范围的治疗剂在本发明中找到用途。可以与靶向c-Rel或相关蛋白质的化合物共施用的任何治疗剂。各类抗肿瘤药(例如,抗癌)试剂预期用于在本发明的某些实施方案中使用。适合于与本发明一起使用的抗癌剂包括但不限于,诱导凋亡的试剂,以及下述试剂抑制腺苷脱氨酶功能,抑制嘧啶生物合成,抑制嘌呤环生物合成,抑制核苷酸互变,抑制核糖核苷酸还原酶,抑制胸苷一磷酸(TMP)合成,抑制二氢叶酸还原,抑制DNA合成,与DNA形成加合物,损害DNA,抑制DNA修复,嵌入DNA,使天冬酰胺脱氨,抑制RNA合成,抑制蛋白质合成或稳定性,抑制微管合成或功能,抑制蛋白质激酶活性,阻断关于生长因子、细胞因子、激活配体等的受体。在某些实施方案中,适合于用于在本发明的组合物和方法中使用的示例性抗癌剂包括但不限于l)生物碱,包括微管抑制剂(例如,长春新碱、长春碱和长春地辛等),微管稳定剂(例如,紫杉醇(TAXOL)和多西他赛等),和染色质功能抑制剂,包括拓朴异构酶抑制剂,例如表鬼臼毒素(例如依托泊苷(VP-16)和替尼泊苷(VM-26)等),和耙向拓朴异构酶I的试剂(例如,喜树碱和依立替康(irinotecan)(CPT-ll)等);2)共价DM结合剂(烷化剂),包括氮芥(例如,氮芥、苯丁酸氮芥、环磷酰胺、异环磷酰胺和白消安(MYLERAN)等),亚硝基脲(例如,卡莫司汀、罗莫司汀和司莫司汀等),和其他烷化剂(例如,达卡巴溱、羟甲基三聚氰胺、噻替派和丝裂霉素等);3)非共价DNA结合剂(抗肿瘤抗生素),包括核酸抑制剂(例如,更生霉素(放线菌素D)等),蒽环(例如,道诺红霉素(道诺霉素和红比霉素)、多柔比星(阿霉素)、和依达比星(伊达比星)等),蒽二酮(例如,蒽环类似物例如米托蒽醌等),博来霉素(BLENOXANE)等,和普卡霉素(光辉霉素)等;4)抗代谢药,包括抗叶酸剂(例如,氨曱蝶呤、F0LEX和MEXATE等),噪呤抗代谢药(例如,6-巯嘌呤(6-MP,PURINETHOL)、6-硫代鸟噪呤(6-TG)、硫唑噤呤、阿昔洛韦、更昔洛韦、氯脱氧腺苷、2-氯脱氧腺苷(CdA)、和2'-去氧助间型霉素(喷司他丁)等),嘧啶拮抗剂(例如,氟嘧啶(例如,5-氟尿嘧啶(ADRUCIL)、5-氟脱氧尿苷(FdUrd)(氟尿苷)等),和胞嘧啶阿糖胞苷(例如,CYTOSAR(ara-C)和氟达拉滨等);5)酶,包括L-天冬酰胺酶和羟基脲等;6)激素,包括糖皮质激素,抗雌激素(例如,它莫西芬等),非类固醇抗雄激素(例如,氟他胺等),非类固醇抗雌激素(estrogens)(例如,它莫西芬),和芳香酶抑制剂(例如,阿那曲唑(ARIMIDEX)等);7)钿化合物(例如,顺铂和卡铂等);8)与抗癌药、毒素和/或放射性核素缀合的单克隆抗体(例如,爱比妥、RUuxin、阿瓦斯丁等);9)生物应答调节剂(例如,干扰素(例如,IFN-ot等)和白介素(例如,IL-2等)等);IO)过继免疫疗法;ll)造血生长因子;12)诱导肿瘤细胞分化的试剂(例如,全反式维甲酸等);13)基因治疗技术;14)反义治疗技术;15)肿瘤疫苗;16)针对肿瘤转移的治疗(例如,巴马司他等);17)血管生成抑制剂;18)蛋白体抑制剂(例如,VELCADE);19)乙酰化和/或甲基化抑制剂(例如,HDAC抑制剂);20)NFKB调节剂;21)细胞周期调节抑制剂(例如,CDK抑制剂);22)p53蛋白质功能调节剂;23)蛋白激酶抑制剂(例如81Gleevec),和23)辐射。在癌症治疗背景中常规使用的任何溶瘤试剂在本发明的组合物和方法中找到用途。例如,美国食品与药物管理局支持批准用于在美国使用溶瘤试剂的配方。关于U.S.F.D.A.的国际类似机构支持相似配方。表2提供了批准用于在美国使用的示例性抗肿瘤药的列表。本领域技术人员应当理解关于所有美国批准的化学疗法所需的"产物标记"描述关于示例性试剂的批准的适应症、给药信息、毒性数据等。表2阿地白介素ProleukinChironCorp,,(脱-丙氨酰-1,丝氨酸-125人白介素-2)Emeryville,CA阿仑珠单抗CampathMillenniumandILEX(IgGlk抗CD52抗体)Partners,LP,Cambridge,MA阿利维曱酸PanretinLigaud(9-顺式维甲酸)Pharmaceuticals,Inc.,SanDiegoCA别嘌呤醇ZyloprimGlaxoSmithKline,(1,5-二氢-4H-吡唑[3,4-d]嘧咬-4-酮一钠ResearchTriangle盐)Park,NC六甲蜜胺HexalenUSBioscience,West(N,N,N',N',N",N",-六曱基-1,3,5-三溱Conshohocken,PA-2,4,6-三胺)氨磷汀EthyolUSBioscience(乙硫醇,2-[(3-氨丙基)氨基]-,二氢磷酸盐(酯))阿那曲唑ArimidexAstraZeneca(1,3-苯二乙腈,a,a,a、a'-四甲基-5-Pharmaceuticals,LP,(1H-l,2,4-三唑-1-基曱基))Wilmington,DE三氧化二砷TrisenoxCellTherapeutic,Inc.,Seattle,WA天冬酰胺酶ElsparMerck&Co,,Inc,,(L-天冬酰胺酰胺基水解酶,EC-2型)WhitehouseStation,ntBCGLiveTICEBCGnj0rganonTeknika,(牛分枝杆菌减毒林的冻干制剂(卡介苗[BCG],Corp.,Durham,NC蒙特利尔亚株))贝沙罗汀胶囊TargretinLigaud(4-[1-(5,6,7,8-四氯-3,5,5,8,8-五甲基-2-Pharmaceuticals萘基)乙烯基]苯甲酸)贝沙罗汀凝胶TargretinLigandPharmaceuticals博来霉素BlenoxaneBristol-MyersSquibb(由轮丝链霉素(S"一輝cesrer〃c///"1y)Co.,NY,NY生产的细胞毒性糖肽抗生素;博来霉素A2和博来霉素B2)卡培他滨XelodaRoche(5'-去氧-5-氟-N-[(戊氧基)羰基]-胞苷)卡铂ParaplatinBristol-MyersSquibb(铂,二胺[1,1-环丁烷双羧酸(2-)-0,0']-,(SP-4-2))卡莫司汀BCNU,BiCNUBristol-MyersSquibb(1,3-二(2-氯乙基)-1-亚硝基脲)含聚苯丙生20植入物的卡莫司汀GliadelWaferGuilfordPharmaceuticals,Inc.,Baltimore,MD塞来昔布CelebrexSearle(作为4-[5-(4-甲苯基)-3-(三氟曱基)-1H-Pharmaceuticals,吡唑-l-基]苯磺酰胺)England苯丁酸氮芥LeukeranGlaxoSmithKline(4-[二(乙氟乙烷)氨基]犬尿氨酸)顺辆PlatinolBristol-MyersSquibb(PtCl2H6N2)克拉屈滨Leustatin,R-W.Johnson(2-氯-2'-去氧-b-D-腺苷)2-CdAPharmaceuticalResearchInstitute,Rar"an,NJ环磷酰胺Cytoxan,Bristol—MyersSquibb(2-[二(2-氯乙基)氨基]四氢-2H-13,2-氧氮Neosar磷环2-氧化物一水合物)阿糖胞苷Cytosar-UPharmacia&Upjohn(l-b-D-阿糖呋喃胞嘧啶,C9H13N305)Company阿糖胞苷脂质体DepoCytSkyePharmaceuticals,Inc.,SanDiego,CA达卡巴噪DTIC-DomeBayerAG,Leverkusen,(5-(3,3-二甲基-l-三氮烯基)-咪唑-4-甲酰Germ&ny胺(DTIC))更生霉素,放线菌素DCosmeganMsrck(由小小链霉素(S"e;^。/z7/ces;7arra〃us)生产的放线菌素,c"no")达依泊汀aAranespAmgen,Inc.,Thousand(重组肽)0aks,CA道诺红審素脂质体DanuoXomeNexsUr((8S-顺式)+乙酰基-l0-[(3-氨基-2,3,6-Pharmaceuticals,三去氧-6-L-来苏-己吡喃基)氧代]-7,8,9,10-Inc.,Boulder,CO四氢-6,8,11-三羟基-1-曱氧基-5,12-并四苯二酮盐酸盐)83道诺红霉素HCl,道诺霉素CerubidineWyethAyerst,((IS,3S)-3-乙酰基-1,2,3,4,6,11-六氬Madison,NJ-3,5,12-三羟基-lO-甲氧基_6,11_二氧代-l-naphthacenyl3-氨基-2,3,6-三去氧-(a)-L-来苏-己吡喃糖苷盐酸盐地尼白介素0ntakSeragen,Inc.,(重组肽)Hopkinton,MA右雷佐生ZinecardPharmacia&Upjohn((S)-4,4'-(1-曱基-l,2-乙烷二基)二-2,6-Company哌嗪二酮)多西他赛TaxotereAventis((2R,3S)羧基-3-苯基异丝氨酸,N-叔丁Pharmaceuticals,酉旨,13-酯含5b-20-表氧-12a,4,7b,10b,13a-Inc.,Bridgewater,六幾基tax-ll-烯-9-酮4-乙酸盐2-苯甲酸盐,NJ三水合物)阿霉素HC1Adriamycin,Pharmacia&Upjohn(8S,10S)-10-[(3-氨基-2,3,6-三去氧-a-L-Rubexcompany来苏-己吡喃基)氧代]-8-羟乙酰基-7,8,9,10-四氢-6,8,ll-三羟基-1-曱氧基-5,12_并四苯二酮盐酸盐)多柔比星AdriamycinPharmacia&UpjohnPFS静脉内注射Company多柔比星脂质体DoxilSequusPharmaceuticals,Inc.,Menlopark,CA丙酸甲雄烷酮DromostanoloneEliUlly&Company,(17b-幾基-2a-甲基-5a-雄烷-3-酮丙酸盐)Indianapolis,IN丙酸甲雄烷酮MasteroneSyntex,Corp.,PaloinjectionAlto,CAElliott'sB溶液Elliott'sBSolutionOrphanMedical,Inc表柔比星EllencePharmacia&Upjohn((8S-顺式)-10-[(3-氨基-2,3,6-三去氧-a-L-Company阿拉伯-己吡喃基)氧代]-7,8,9,10-四氢-6,8,11-三幾基-8-(幾乙酰基)-1-曱氧基-5,12-并四苯二酮盐酸盐)阿法依伯汀aEpogenAmgen,Inc(重组肽)雌莫司汀EmcytPharmacia&Upjohn(雌甾-l,3,5(10)-三烯-3,17-二醇(17(P))Company-,3-[二(2-氯乙基)氨基甲酸盐]n-(二氢磷酸盐),二钠盐,一水合物,或雌二醇3-[二(2-氯乙基)氨基甲酸盐]17-(二氢磷酸盐),二钠盐,一水合物)磷酸依托泊普EtopophosBristol-MyersSquibb(4'-去曱基表鬼臼毒素9-[4,6-0-(R)-亚乙基-(e)-D-吡喃葡萄糖苷],4'-(二氢磷酸盐))依托泊苦,VP-16VepesidBristol-MyersSquibb4-去曱基表鬼臼毒素9-[4,6-0-(R)-亚乙基-(卩)-D-吡喃葡萄糖苷]依西美坦AromasinPharmacia&Upjohn(6-亚曱基雄甾-1,4-二烯-3,17-二酮)company非格司亭NeupogenAmgen,Inc(r-metHuG-CSF)氟尿苷(动脉内的)F腿Roche(2'-去氧-5-氟尿苷)氟达拉滨FludaraBerlexLaboratories,(抗病毒剂阿糖腺普的氟化核苦酸类似物,Inc.,CedarKnolls,9-b-D-阿糖呋喃腺噪呤(ara-A))NJ氟尿嘧啶,5-FU(5-氟-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮)Adruci1ICNPharmaceuticals,Inc.,Humacao,PuertoRico氟维司群FaslodexIPRPharmaceuticals,(7-a-[9-(4,4,5,5,5-五氟戊基亚磺酰)壬基]Guayama,PuertoRico雌甾-1,3,5-(10)-三烯-3,17-0-二醇)吉西他滨GsmzarEliLilly(2'-去氧-2',2'-二氟胞嘧啶单盐酸盐(b-同分异构体))吉妥珠单抗奥佐米星MylotargWyethAyerst(抗-CD33hP67.6)乙酸戈舍瑞林ZoladexAstraZeneca([D-Ser(But)6,Azgly"]LHRH的乙酸盐;焦植入物Pharmaceuticals-Glu-His-Trp-Ser-Tyr-D-Ser(But)-Leu-Arg-Pro-Azgly-NH2乙酸盐-2-双(曱基)-乙基]甘氨酸之间硫脲共价键的免疫缀合物依达比星IdamycinPharmacia4Upjohn(5,12-并四苯二酮,9-乙酰基-7-[(3-氨基Company-2,3,6-三去氧-(a)-L-来苏-己吡喃基)氧代]-7,8,9,10-四氢-6,9,11-三羟基盐酸盐,(7S-顺式)异环磷酰胺IFEXBristol-MyersSquibb(3-(2-氯乙基)-2-[(2-氯乙基)氨基]四氢-2H-1,3,2-氧氮确环2-氧化物)曱磺酸伊马替尼GleevecNovartisAG,Basel,(4-[(4-曱基-卜哌嗪)甲基]-N-[4-曱基Switzerland85-3-[[4-(3-哌啶基)-2-嘧啶基]氨基]-苯基]笨曱酰胺甲磺酸盐)干扰素a-2aRoferon-AHoffmann-LaRoche,(重组肽)Inc*,Nutley,NJ干扰素a-2bIntronAScheringAG,Berlin,(重组肽)(冻干的GermanyBetaseron)依立替康HC1CamptosarPharmacia&Upjohn((4S)-4,ll-二乙基-4-羟基-9-[(4-哌啶-重Company氮哌啶)羰酰氧基]-lH-吡喃[3'.4':6,7]氮茚并[l,2-b]喹啉-3,14(4H,12H)二酮盐酸盐三水合物)来曲哇FenmraNovartis(4,4'-(1H-1,2,4-三唑-1-基亚曱基)二千腈)甲酰四氢叶酸Wellcovorin,Immunex,Corp.,(L-谷氨酸,N[4[[(2氨基-5-甲酰基LeucovorinSeattle,WA-1,4,5,6,7,8四氢4氧代6-蝶啶基)曱基]氨基]苯曱酰基],钩盐(1:1))左旋咪唑HC1ErgamisolJanssenResearch((-)-(S)-2,3,5,6-四氢-6-苯基咪唑[2,1-b]Foundation,逸唑单盐酸盐CuH具S.HC1)Titusville,NJ罗莫司汀MustargenMerck(2-氯-N-(2-氯乙基)-N-甲基氨乙基盐酸)乙酸甲地孕酮MegaceBristol-MyersSquibb17a(乙酰氧基)-6-曱基孕甾-4,6-二烯-3,20-一ffi曰美法仑,L-PAMAlkeranGlaxoSmithKline(4-[二(2-氯乙基)氨基]-L-苯丙氨酸)巯嘌呤,6-MPPurinetholGlaxoSmithKline(1,7-二氬-6H-嗓呤-6-石危酮一水合物)美司钠M6sri6xAstaMedica(钠2-巯乙磺酸盐)氨甲蝶呤MethotrexateLederleLaboratories(N-[4-[[(2,4-二氨基-6蝶啶基)甲基]甲氨基]苯甲酰基]-L-谷氨酸)甲氧沙林UvadexTherakos,Inc.,Way(9-甲氧基-7H-氟[3,2-g][1]-苯并呋喃-7-酮)Exton,Pa丝裂霉素cMutamycinBristol-MyersSquibb丝裂霉素CMitozytrexsuperGen,Inc.,Dublin,CA米托坦LysodrenBristol—MyersSquibb(1,1-二氯-2-(0-氯苯基)-2-(对氯苯基)乙烷)米托蒽醌NovantrcmeImmimexCorporation(1,4-二羟基-5,8-二[[2-[(2-羟乙基)氨基]乙基]氨基]-9,10-蒽二酮二盐酸盐)86苯丙酸诺龙诺非单抗奥普瑞白介素(IL-ll)奥沙利铂(顺式-[(1R,2R)-1,2-环己二胺-N,N'][草酸合(2-)-O,O']4白)紫杉醇(50,20-表氧-1,2a,4,7P,10P,13a-六羟基tax-ll-烯-9-酮4,10-二乙酸盐2-苯曱酸盐13-酯与(2R,3S)苯曱酰基-3-苯基异丝氨酸)帕米膦酸盐(膦酸(3-氨基-l-羟基亚丙基)二-,二钠盐,五水合物,(APD))培加酶((单甲氧基聚乙二醇琥珀酰亚胺基)11-17-腺苷脱氨酶)培门冬酶(单曱氧基聚乙二醇琥珀酰亚胺基L-天冬酰胺酶)培非司亭(重组曱硫氨酰人G-CSF(非格司亭)和单甲氧基聚乙二醇的共价缀合物)喷司他丁哌泊溴烷普卡霉素,光辉霉素(由褶坡链霉菌(i7re;7t。迈ycesp7/c""s)生产的抗生素)卟汾姆钠丙卡巴肼(N-异丙基-y-(2-酸盐)曱基肼)-对曱苯酰胺单盐奎纳克林(6-氯-9-(1-甲基-4-二乙基-胺)丁基氨基-2-曱氧基吖啶)拉布立酵Durabolin-50Verl訓aNeumegaEloxatinTAXOLArediaAdagen(牛培加酶)OncasparNeulastaNipentVercyteMithracinPhotofrinMatulaneAtabrineElitekOrganon,Inc.,WestOrange,NJBoehringerIngelheimPharmaKG,GermanyGeneticsInstituteInc,,Alexandria,VASanofiSynthelabo,Inc.,NY,NYBristo卜MyersSquibbNovartisEnzonPharmaceuticalsInc.,BridgewateiNJEnzonAmgen,Inc.Parke—DavisPharmaceuticalCo.,Rockville,MDAbbottLaboratories,AbbottPark,ILPfizer,Inc,,NY,NYQLTPhototherapeutics,Inc.,Vancouver,CanadaSig迈aTauPharmaceuticals,Inc.,Gaithersburg,MDAbbottLabsSanofi-Synthelabo,87(重组肽)利妥昔单抗(重组抗-CD2Q抗体)沙格司亭(重组肽)链佐星(链佐星2-去氧-2-[[(甲基亚硝胺)羰基]氨基]-a(和b)-D-吡喃葡萄糖和220mg无水柠檬酸)滑石(Mg3Si4O10(OH)2)它莫西芬((Z)2-[4-(1,2-二苯基-l-丁烯基)苯氧基]-N,N-二曱基乙胺2-轻基-l,2,3-丙烷三羧酸盐(1:1)替莫唑胺(3,4-二氢-3-曱基-4-氧代咪唑[5,l-d]-并-四。秦-8-甲酰胺)替尼泊苷,VM-26(4'-去甲基表鬼臼毒素9-[4,6-0-(R)-2-噻吩亚曱基-(P)-D-吡喃葡萄糖苷])睾内酯(13-羟基-3-氧代-13,17-扩环雄甾-1,4-二烯-17-酸[dgr]-内酯)石充鸟噪呤,6-TG(2-氨基-1,7-二氢-6H-嘌呤-6-疏酮)逸替派(氮丙啶,1,1'1''-磷酸亚硫酰次氨基三丁醇-,或Tris(l-氮丙啶基)硫化膦)拓朴替康HC1((S)-10-[(二甲氨基)曱基]-4-乙基-4,9-二羟基-lH-吡喃[3',4':6,7]舊[l,2-b]唾啉-3,14-(4H,12H)-二酮单盐酸盐)托瑞米芬(2-(p-[(Z)-4-氯-1,2-二苯基-1-丁烯基]-苯氧基)-N,N-二甲基乙胺柠檬酸盐(1:1))托西莫单抗,I131托西莫单抗(重组鼠类免疫治疗单克隆IgG2,入抗-CD20抗体(I131是放射免疫治疗抗体))曲妥珠单抗(重组单克隆IgG,tc抗-HER2抗体)维曱酸,ATRA(全反式维曱酸)尿嘧啶氮芥MtuxanProkineSclerosolNolvadexTemodarVumonTeslacThioguanineThioplexHycamtinFarestonBexxarHerceptinVasanoidUraci1MustardInc,,Genentech,Inc,,SouthSanFrancisco,CAImmunexCorpPharmacia&UpjohnCompanyBryan,Corp.,Woburn,MAAstraZenecaPharmaceuticalsScheringBristol—MyersSquibbBristol—MyersSquibbGlaxoSmithKlineI腿unexCorporationGlaxoSmithKlineRobertsPharmaceuticalCorp.,Eatontown,NJCorixaCorp.,Seattle,WAGenentech,IncRocheRobertsLabs88Capsules戊柔比星,N-三氟乙酰阿霉素-14-戊酸酯ValstarAnthra—>Medeva((2S-顺式)-2-[1,2,3,4,6,11-六氢-2,5,12-三羟基-7甲氧基-6,11-二氧代-[[42,3,6-三去氧-3-[(三氟乙酰基)-氨基-cc-L-来苏-己吡喃基]烃氧基]-2-并四苯基]-2-氧代乙基戊酸盐长春碱,醛基长春碱VelbanEliLilly(C"H56N4O10H2S04)长春械OncovinEliLilly(C46H56NA。H2S04)长春瑞滨NavelbineGlaxoSmithKline(3',4'-二去氢-4'-去氧-C'-去曱长春碱[R-(R',R')-2,3-二羟基丁二酸盐(1:2)(盐)])唑来膦酸,唑来膦酸ZometaNovartis((1-羟基-2-咪唑-l-基-膦酰基乙基)膦酸一水合物在其他实施方案中,其他试剂(例如,免疫调节剂、抗炎剂、NSAID和免疫治疗剂)连同本发明的组合物一起施用。有用的非甾类抗炎剂包括但不限于阿司匹林、布洛芬、双氯芬酸、萘普生、苯噁洛芬、氯比洛芬、非诺洛芬、氟布芬、酮洛芬、吲哚洛芬、吡咯芬、卡洛芬、奥沙普秦、普莫洛芬、莫罗洛芬、三氧洛芬、舒洛芬、氨洛芬、噻洛芬酸、氟洛芬、布氯酸、吲哚美辛、舒林酸、多美芬、佐美酸、氟洛芬、齐多美辛、阿西美辛、芬替酸、环氯茚酸、氧洛芬、曱芬那酸、甲氯芬那酸、氟芬那酸、尼氟酸、托芬那酸、二疏瑞索、氟苯柳、吡罗昔康、舒多昔康、伊索昔康;水杨酸衍生物,包括阿司匹林、水杨酸钠、三水杨酸胆碱镁、双水杨酯、二氟尼柳、水杨酰水杨酸、柳氮磺吡啶和olsalazin;对氨基苯酚衍生物包括乙氨酚和非那西丁;丐l咪和茚乙酸,包括吲哚美辛、舒林酸和依托度酸;杂芳基乙酸,包括托美丁、双氯芬酸和酮咯酸;邻氨基苯甲酸(灭酸酯),包括甲芬那酸和甲氯芬那酸;烯醇酸,包括昔康(吡罗昔康、替诺昔康),和p比咯烷二酮(保泰松、oxyphenthartazone);和烷酮,包括萘丁美酮及其药学上可接受的盐及其混合物。关于NSAIDs的更详细描述,参见PaulA.Insel,Analgesic-AntipyreticandAnti-inflammatoryAgentsandDrugsEmployedintheTreatmentofGout,inGoodman&Gilman'sThePharmacologicalBasisofTherapeutics617-57(PerryB.Molinhoff和RaymondW.Ruddon编辑,第9版,1996)和GlenR.Ha謂n,Analgesic,AntipyreticandAnti-InflammatoryDrugsinRemington:TheScienceandPracticeofPharmacyVolII1196-1221(A.R.Gennaro编辑,第19版,1995),所述参考文献通过引用整体在此合并。预防和治疗剂的其他例子包括但不限于免疫调节剂,抗炎剂(例如肾上腺皮质激素、皮质类固醇(例如,倍氯米松、布地奈德、氟尼缩松、氟替卡松、曲安西龙、甲基泼尼松龙、泼尼松龙、泼尼松、氢化可的松),糖皮质激素,类固醇,非甾类抗炎剂(例如,阿司匹林、布洛芬、双氯芬酸和C0X-2抑制剂),和白三烯拮抗剂(例如,孟鲁司特、曱基黄嘌呤、扎鲁司特和齐留通),P2-激动剂(例如,沙丁胺醇、比特罗、非诺特罗、异乙那林、奥西那林、吡布特罗、舒喘灵、特布他林福莫特罗、沙美特罗和舒喘灵特步他林),抗胆碱能药物(例如,异丙托溴铵和氧托溴铵),柳氮磺吡啶,青霉胺,氯苯砜,抗组胺药,抗疟剂(例如羟氯喹),抗病毒剂,和抗生素(例如,更生霉素(以前的放线菌素)、博来霉素、红霉素、青霉素、光辉霉素和氨茴霉素(AMC))。本领域技术人员众所周知的任何免疫调节剂都可以在本发明的共施用方法和组合物中使用。免疫调节剂可以影响受试者中的免疫应答的一个或多个或所有方面。免疫应答的方面包括但不限于,炎症应答、补体级联、白细胞和淋巴细胞分化、增殖、和/或效应子功能、单核细胞和/或嗜碱细胞计数、和免疫系统细胞中的细胞交流。在本发明的某些实施方案中,免疫调节剂调节免疫应答的一个方面。在其他实施方案中,免疫调节剂调节免疫应答的超过一个方面。在本发明的一个优选实施方案中,免疫调节剂施用于受试者抑制或减少受试者的免疫应答能力的一个或多个方面。在本发明的一个具体实施方案中,免疫调节剂抑制或阻遏受试者中的免疫应答。免疫调节剂的例子包括但不限于,蛋白质性质的试剂例如细胞因90子,肽模拟物和抗体(例如,人、人源化、嵌合、单克隆、多克隆、Fvs、ScFvs、Fab或F(ab)2片段或表位结合片段),核酸分子(例如,反义核酸分子和三螺旋),小分子,有机化合物,无机化合物,自体抗原,变应原,同种异体抗原,和病原体抗原。特别地,免疫调节剂包括但不限于氨甲蝶呤、来氟米特、环磷酰胺、Cytoxan、依木兰、环孢菌素A、米诺环素、硫唑嘌呤、抗生素(例如,FK506(他克莫司))、甲基泼尼松龙(MP)、糖皮质激素、类固醇、霉酚酸吗啉乙酯、雷帕霉素(西罗莫司)、咪唑立宾、脱氧腈胍菌素、布喹那、malononitriloamindes(例:i口leflunamide)、T细胞受体调节剂、B细胞受体调节剂、抗原呈递细胞调节剂、细胞因子受体调节剂、抗原和肥大细胞调节剂。T细胞受体调节剂的例子包括但不限于,抗T细胞受体抗体(例如,抗CD4抗体(例如,cM-T412(Boeringer)、IDEC-CE9.1(IDEC和SKB)、mAB4162W94、0rthoclone和0KTcdr4a(Janssen-CUag)),抗CD3抗体(例如,Nuvion(ProductDesignUbs)、0KT3(Johnson&Johnson)、或Rituxan(IDEC)),抗CD5抗体(例如,抗CD5蓖麻蛋白连接的免疫缀合物),抗CD7抗体(例如,CHH-380(Novartis)),抗CD8抗体,抗CD40配体单克隆体(例如,IDEC-131(IDEC)),抗CD52抗体(例如,CAMPATH1H(Ilex)),抗CD2抗体(例如,MEDI-507(Medlmm画,Inc.,国际乂^开号W002/098370和W002/069904),抗CD1a抗体(例如,Xanelim(Genentech))和抗B7抗体(例如,IDEC-114)(IDEC)),CTLA4-免疫球蛋白,LFA-3TIP(Biogen,国际发明者A·奥杨,C·Y·赫希亚,H-C·刘,J·J·赫苏,田文志,程树华申请人:康乃尔研究基金会有限公司
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