一种通过自由基攻击微小rna造成rna氧化损伤的方法_2

文档序号:9224118阅读:来源:国知局
实施例的结果显示,以OmMH202处理组为对照,25yM,50yM,100yM和 200yMH202处理组的细胞内R0S水平升高倍数分别为2. 25±0. 19,3. 43±0. 31, 5. 54±0. 46,6. 72±0. 57(p〈0. 05);相应地,25yM,50yM,100yM和 200yMH202处理 组的细胞内8-氧鸟嘌呤含量升高倍数分别为1.41±0. 11,2. 01±0. 19,3. 35±0. 32, 3. 69 ±0. 29 (p〈0. 05),证实,在0-lmMH202处理浓度范围内,H9C2细胞的miRNA氧化损伤程 度与H202浓度呈正相关;此外,以0. 4mM浓度的H202处理H9c2细胞,分别在0h,0. 5h,lh, 2h,4h和6h后的时间点收集细胞进行R0S检测和NorthwesternBlot分析(图2c和图 2d),结果显示,以Oh处理组为对照,lh,2h,4h和6h处理组的细胞内R0S水平升高倍数分别 为 3. 29±0. 21,4. 71±0. 35,5. 35±0. 49,6. 79±0. 62,5. 99±0. 51(p〈0. 05);相应地,lh, 2h,4h和6h处理组的细胞内8-氧鸟嘌呤含量升高倍数分别为1.69±0. 55,2. 14±0. 18, 3. 01±0. 26,3. 72±0. 31,4. 06±0. 39(p〈0. 05);由此证实,以0. 4mMH202处理H9c2细胞,细 胞内miRNA氧化损伤程度与H202处理时间呈正相关。
[0036] 实施例3 :铁超载诱导心肌损伤模型中miRNA氧化损伤,产生8-氧鸟嘌呤
[0037] 本实施例的心肌细胞内铁超载(ironoverload)可引起胞内R0S水平显著升高, 并造成心肌功能受损和心肌细胞凋亡程度增高,采用定期定量给雄性C57BL/6小鼠(其可 得自中国科学院动物研宄所实验动物中心)腹腔注射右旋糖酐铁快速建立铁超载模型,剂 量为12mg/天,一周五天,注射四周后处死;心脏组织石蜡切片经普鲁士蓝铁染色后发现, 铁超载(Fe)组可见蓝色铁颗粒沉积于细胞质中,而安慰剂对照(Plecebo)组细胞未见铁 颗粒沉积,证实小鼠铁超载模型的成功建立(图3a);同时,Fe组细胞R0S和凋亡水平与 Plecebo组比较明显升高(图3b和图3c);为了进一步评定铁超载模型中miRNA氧化损伤 程度,分别提取小鼠心、肝、脾、肺、肾和脑各器官miRNA进行NorthwesternBlot分析,Fe组 小鼠各器官miRNA样品中8-氧鸟嘌呤含量与Plecebo组比较均明显升高(图3d)。
[0038] 实施例4 :心肌缺血-再灌注损伤模型中miRNA氧化损伤,产生8-氧鸟嘌呤
[0039] 本实施例将各组小鼠开胸后结扎冠状动脉左前降支,分别记录结扎前ECG心电图 和结扎30min后再灌注后的心电图,动物冠状动脉结扎后逐渐出现ST段抬高,说明小鼠左 室前壁有明显缺血,灌注2h结束后,如所述采用伊文蓝-TTC双染法测定心肌梗死范围;危 险区(areaatrisk,AAR)为红色和白色指示区域;梗死区(infarctarea,INF)为白色指 示区域,证实心肌缺血-再灌注损伤模型的成功建立(图4a);同时,缺血-再灌注(I/R) 组细胞R0S和凋亡水平与假手术(Sham)组比较明显升高(图4b和图4c);为了进一步评 定心肌缺血再灌注模型中miRNA氧化损伤程度,分别提取小鼠心脏危险区(AAR)和非危险 区(areanotatrisk,ANAR)的miRNA进行NorthwesternBlot分析,I/R组小鼠心脏危 险区miRNA中8-氧鸟嘌呤含量与Sham组比较明显升高(图4d)。
[0040] 实施例5 :免疫沉淀法纯化氧化miRNA及芯片检测氧化miRNA
[0041] 本实施例为鉴定H202诱导细胞凋亡所导致氧化损伤的miRNA亚型种类,以0.4mM H202处理H9c2细胞,3h后收集细胞,分别提取对照组(OmMH202处理组)和H202 (0?4nMH202 处理组)细胞miRNA,采用免疫沉淀法纯化得到氧化miRNA,然后进行miRNA芯片检测,具体 方法详述如下:将2. 5 ygmiRNA与2. 5 yganti-8-oxoG抗体(可得自 QEDBioscience) 在室温下孵育lh,而阴性对照组省略抗体孵育或抗体预先与24ng/ y1 8-〇X〇G孵育lh;加 入ProteinLgelbeads(可得自Pierce,20 yl)并在4°C条件下孵育15h;孵育结束后,用 含0.04% (v/v)NP-40的PBS溶液洗涤3次;随后,按如顺序下向ProteinLgelbeads中 依次加入:300 y1含 0?04% (v/v)NP-40的 PBS溶液,30 y1的10% (w/v)SDS和300 y1的 PCI(苯酚:氯仿:异戊醇为25:24:1);将该混合液在37°C条件下孵育15min(每隔5min振 荡一次),14,OOOrpm离心5min,用以分离水相和有机相。收集的水相,并与40 y1 3M醋酸 钠(pH5. 2),2 y1 5mg/ml糖原和lml95% (v/v)乙醇混合;将该样品冻存于-80°C,lh以 上,随后再以14,OOOrpm离心20min得到沉淀的miRNA;用75%乙醇洗涤并进行空气干燥, 将miRNA样品溶解于10ylDEPC处理水中,得到氧化miRNA;采用NorthwesternBlot鉴 定免疫沉淀法纯化得到的氧化miRNA(图5a)。
[0042] 本实施例的miRNA表达谱芯片(miRCURY?LNAArray(v. 10. 0),购自康成生物有 限公司)的筛选;利用miRCURY?芯片标记试剂盒和RNEasyMini试剂盒(可得自Exiqon) 进行miRNA标记及浓缩标记样品,采用miRCURY?芯片微点阵试剂盒进行miRNA芯片杂 交,并在635nm处激发焚光,利用Genepix4000B进行图像扫描并使用GenepixPro6. 0 进行数据分析(图5b);通过对氧化miRNA组(oxi-miR)标准值分析,oxi-miR组共发现 有 11 个miRNA,分别为rn〇-miR-184、rn〇-miR-21*、rn〇-miR_135a*、rn〇-miR-139_3p、 rn〇-miR-30c_2*、rn〇-miR-290、rn〇-miR_29a、rn〇-miR_23a、rn〇-miR-21、rn〇-miR-204* 和 rn〇-miR-106b(表1);采用qRT-PCR方法对oxi-miR组11个miRNA进行验证,其结果与芯 片检测结果一致(图5c)。
[0043] 表1基因芯片筛选与qRT-PCR验证氧化损伤的microRNA
[0045]
[0046] 实施例6 :过表达miR-184和氧化miR-184 (oxi-miR-184)差异调苄基因表达的筛 查
[0047] 本实施例为评定miR-184和oxi-miR-184对H9c2细胞基因表达水平的影响,采用 脂质体瞬时转染H9c2细胞的方法过表达miR-184和oxi-miR-184,提取细胞总RNA,进行大 鼠全基因组表达谱分析,具体方法详述如下:
[0048] 采用实施加1所述Fe2+与H202构成Fenton试剂氧化体系,将化学合成 的miR-184mimics进行体外氧化,进而采用实施例5所述免疫沉淀方法纯化得到 oxi-miR-184。如所述[6]采用脂质体法分别瞬时转染H9c2细胞5nMmiR-184和 oxi-miR-184, 24h后收集细胞,用Trizol试剂(可得自Invitrogen)分别提取过表达对照 1组(miR-NC-1组)和过表达miR-184 (miR-184组),过表达对照2组(miR-NC-2组)和过 表达oxi-miR-184细胞总RNA,并进一步使用NucleoSpin?RNAclean-up试剂盒对总RNA 进行过柱纯化,用分光光度计定量,甲醛变性胶电泳质检。
[0049] 本实施例的大鼠全基因组表达谱芯片(27KRatGenomeArray,购自CapitalBio 公司)的筛选;米用晶芯?cRNA扩增标记试剂盒对样品RNA进彳丁焚光标记;芯片用LuxScan 10KA双通道激光扫描仪(CapitalBio公司)进行扫描,采用LuxScan3. 0图像分析软件 (CapitalBio公司)对芯片图像进行分析,把图像信号转化为数字信号,观察差异表达的基 因(图6);通过对各组标准值进行分析,发现过表达miR-184会使33个基因在mRNA水平 发生显著变化(miR-184/miR-NC彡0. 5为显著下调,miR-184/miR-NC彡2为显著上调),过 表达oxi-miR-184会使66个基因在mRNA水平发生显著变化(oxi-miR-184/miR-NC彡0. 5 为显著下调,oxi-miR-184/miR-NC彡2为显著上调),差异调苄基因包括PRKCB1,BCL2L1和 BCL2L2等,结果见表2 :
[0050] 表2基因芯片筛选过表达miR-184和oxi-miR-184的差异调苄基因
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【主权项】
1. 一种通过自由基攻击微小RNA造成RNA氧化损伤的方法,其特征在于该方法在氧化 应激状态下通过氧化鸟嘌呤8位碳产生8-氧鸟嘌呤而使微小RNA发生氧化损伤,损伤方式 选自以下4种的一种或几种:1)用Fenton试剂氧化体系氧化损伤微小RNA ;2)用H2O2处 理诱导细胞凋亡的过程中氧化损伤微小RNA ;3)在铁超载诱导的心肌损伤动物模型中氧化 损伤微小RNA ;4)在心肌缺血-再灌注损伤动物模型中氧化损伤微小RNA ;氧化损伤的微小 RNA 选自 rn〇-miR-184、rn〇-miR-21*、rn〇-miR_135a*、rn〇-miR-139_3p、rn〇-miR-30c-2*、 rn〇-miR-290、rn〇-miR_29a、rn〇-miR_23a、rn〇-miR-21、rn〇-miR-204* 和 rn〇-miR-106b 中 的一种或多种,其序列如序列表中SEQ IDNO :1-11所示。2. 根据权利要求1所述的一种通过自由基攻击微小RNA造成RNA氧化损伤的方法,其 特征在于所述Fenton试剂氧化体系是由Cu +或Fe 2+与H2O2组成的;Cu +/Fe2+的浓度分别为 0. 5mM,H202的浓度为0. l-2mM ;或者Fenton试剂氧化体系是将Fe 3+或Cu 2+分别与抗坏血酸 和H2O2在磷酸盐缓冲液中混合制备的;所述用H 2O2处理诱导心肌细胞凋亡的过程中,H2O2的 浓度为〇. 4-lmM ;用H2O2处理诱导心肌细胞凋亡的时间为1-6小时;其中所述铁超载诱导的 心肌损伤动物模型是通过向动物腹腔注射右旋糖酐铁而建立的;所述右旋糖酐铁的注射剂 量为12mg/日,连续注射5日;所述方法还包括纯化被氧化损伤的微小RNA的步骤;所述纯 化被氧化损伤的微小RNA是通过免疫沉淀反应进行的,免疫沉淀反应中的抗体为抗8-氧鸟 嘌呤抗体。
【专利摘要】本发明涉及一种通过自由基攻击微小RNA造成RNA氧化损伤的方法,该方法在氧化应激状态下通过氧化鸟嘌呤8位碳产生8-氧鸟嘌呤而使微小RNA发生氧化损伤,损伤方式选自以下一种或几种:1)用Fenton试剂氧化体系氧化损伤微小RNA;2)用H2O2处理诱导细胞凋亡的过程中氧化损伤微小RNA;3)在铁超载诱导的心肌损伤动物模型中氧化损伤微小RNA;4)在心肌缺血-再灌注损伤动物模型中氧化损伤微小RNA;本发明确定了H2O2诱导心肌细胞凋亡过程中发生氧化损伤的miRNA亚型种类,通过对氧化损伤miRNA在心肌细胞中生成与降解,定位特性,与其他生物大分子协同作用以及氧化损伤miRNA调控基因表达功能差异;其工艺过程简单,损伤效果明显,应用范围广泛,应用环境友好。
【IPC分类】A61K31/721, A61K33/34, A61K31/327, A61K33/26
【公开号】CN104940230
【申请号】CN201510350931
【发明人】李培峰, 高洁, 丁素玲, 周露玙
【申请人】青岛大学
【公开日】2015年9月30日
【申请日】2015年6月24日
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