用于治疗dna修复缺陷障碍的治疗剂和方法_2

文档序号:9492738阅读:来源:国知局
中均是重要的并独立于另一个端点。也应当理解,存在本文所 公开的许多值,并且每个值也在本文公开为除了该值本身外还包括"约"该特定值。例如, 如果公开了值〃1〇〃,则也公开了 〃约10"。也应当理解,当公开一个值时,也公开了"小于或 等于该值"或"大于或等于该值"以及这些值之间的可能范围,如技术人员适当地理解。例 如,如果公开了值〃 10",则也公开了 〃小于或等于10〃以及〃大于或等于10"。
[0057] 除非本文中另外指明或明显与上下文相矛盾,否则本文所述的全部方法都能以任 何合适的顺序执行。另外,本文所述的并具有多于一个步骤的所有方法均可由多于一个人 或实体来执行。因此,一个人或实体可执行方法的步骤(a),另一个人或另一个实体可执行 方法的步骤(b),以及再一个人或再一个实体可执行方法的步骤(c),等等。任何和所有实 例或示例性语言(例如,"诸如")的使用仅仅是为了更好地阐明本发明,而不是对要求保护 的本发明的范围进行限制。
[0058] 单位、前缀和符号以其Systeme International de Unites (SI)接受的形式表示。 除非另外指明,否则核酸均以5'至3'取向从左向右书写;氨基酸序列均以氨基至羧基取向 从左向右书写。
[0059] 本文所公开的本发明的替代性要素或实施方案的分组不应被理解为限制。各个组 成员可以单独地或以与所述组的其它成员或本文内的其它要素任意组合地被提及且要求 保护。据预计,出于便利性和/或专利性的原因,组的一个或多个成员可包括在一个组内或 从该组删除。当出现任何此类包括或删除时,在本文将说明书视为包括如此修改的组,从而 满足所附权利要求书中所用的所有Markush组的书面说明。
[0060] 本文使用的标题仅用于组织目的,而无意用于限制描述或权利要求书的范围,它 们可以将说明书作为一个整体来参考。相应地,下面就要定义的术语通过将说明书作为一 个整体来参考会得到更全面的定义。
[0061] 图示是为了描述本发明的优选的实施方案的目的而不是要限制本发明。
[0062] 除非另有定义,否则本文所用的所有技术和科学术语具有本发明所属领域的技术 人员通常理解的含义。以下参考文献为技术人员提供本发明中所用的许多术语的一般定 义:Singleton 等,Dictionary of Microbiology and Molecular Biology (第 2 版 1994); The Cambridge Dictionary of Science and Technology(Walker编,1988) ;The Glossary of Genetics,第 5 版,R. Rieger 等(编),Springer Verlag (1991);和 Hale&Marham, The Harper Collins Dictionary of Biology (1991)。如本文所用,除非另外指明,否则以下术 语具有归属于它们的含义。
[0063] 如本文所用,术语〃约〃是指指定的值加上或减去10%的数值范围。例如,短语〃 约200〃包括加上或减去200的10%,或从180到220,除非明显与上下文相矛盾。
[0064] 如本文所用,术语〃施用〃意指将组合物实际物理引入到宿主或细胞中或宿主或 细胞上(如果适用的话)。将组合物引入到宿主或细胞中的任何和所有方法都是根据本发 明所设想的;该方法不依赖于任何特定的引入手段并且也不应如此解释。引入手段是本领 域技术人员已知的,并且本文也进行了举例说明。
[0065] 如本文所用,"组合"施用既指同时也指按顺序施用两种或更多种组合物。如本文 所用的同时或联合施用意指将两种或更多种组合物(a)同时地,或(b)在正常治疗计划过 程中的不同时间施用给受试者。在后一种情况下,在时间上足够近地施用两种或更多种组 合物以实现预期的效应。
[0066] 术语"药剂"和"化合物"在本文可互换使用。
[0067] 如本文所用,术语"生物活性"当涉及药剂时是本领域公认的并指这样一种形式的 药剂,其使得所施用的药剂的量或其一部分被施用给的受试者或患者吸收、结合或以其它 方式在生理上利用。
[0068] 如本文所用,"生物样品"意指包含核酸或多肽的生物组织或体液的样品。此类样 品通常来自人类,但包括从非人灵长类或啮齿类(例如小鼠和大鼠)分离的组织。生物样 品还可以包括组织分泌物,诸如活检和尸检样品、为组织学目的而获取的冷冻切片、脑脊髓 液、血液、血浆、血清、痰、粪便、泪液、粘液、毛发、皮肤等。生物样品还包括外植体和/或来 源于患者组织的原代和/或转化的细胞培养物。"生物样品"也指来自动物的一个细胞或细 胞群或一定量的组织或体液。最常见的是,生物样品已从动物移除,但术语"生物样品"还 可以指在体内分析的细胞或组织,即,不从动物移除。通常,"生物样品"将含有来自动物的 细胞,但该术语还可以指可用于测量多核苷酸或多肽的表达水平的非细胞生物材料,诸如 血液的非细胞成分、血清、唾液、脑脊髓液或尿液。许多类型的生物样品可用于本发明,包括 但不限于组织活检或血液样品。如本文所用,"组织活检"是指一定量的组织,诸如肺组织, 其从动物优选地从人移除以用于诊断分析。"组织活检"可以指任何类型的活检,诸如穿刺 活检、细针穿刺活检、手术活检等。
[0069] 如本文所用,术语"降低的表达"是指较低的基因表达产物水平和/或基因表达产 物的活性降低。优选地,相对于对照,该降低为至少20%,更优选地,该降低为至少30%、至 少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80 %或至少90%,并且最优选地,该降低为 至少100%。
[0070] 术语〃确定〃的同义词设想在本发明的范围内并且包括但不限于检测、测量、测定 或测试本发明的分子、标记或小分子的存在、不存在、量或浓度等。该术语不仅指定性确定, 也指定量确定。
[0071] 如本文所用,"确定效应"或"确定功能效应"意指测定某药剂增加或降低间接或直 接受该药剂的影响的参数,例如功能、酶、物理和化学效应。可通过本领域技术人员已知的 任何手段来测量此类效应,例如蛋白的光谱特性(如,荧光、吸光度、折射率)、流体动力学 (如,形状)、色谱分离或溶解特性的变化;测量诱导型标记物或基因的转录活化,诸如编码 DNA修复酶的基因;测量结合活性;测量细胞增殖;测量细胞凋亡;测量多肽(诸如DNA修复 酶)的亚细胞定位;等等。确定药剂对疾病、障碍或其它病变的功能效应也可使用本领域技 术人员已知的测定法进行,诸如体外测定法,例如细胞增殖、生长因子或血清依赖性;细胞 中的mRNA和蛋白表达以及细胞的其它特性。可通过本领域技术人员已知的任何手段来评 估这些效应,例如定量或定性测量形态学特征改变的显微术、测量RNA或蛋白水平的变化、 测量RNA稳定性、鉴定下游或报告基因表达(CAT、荧光素酶、B-gal、GFP等),例如经由化学 发光、荧光、比色反应、抗体结合、诱导型标记物、配体结合测定法、细胞凋亡测定法、测量乙 酰辅酶A和AMP的产生情况,等等。
[0072] 如本文所用,〃障碍〃、〃疾病〃或〃病理状态〃以包括性含义使用,并指身体的任 何部分、器官或系统(或其任意组合)的正常结构或功能的任何偏离。具体的疾病表现为 特征性症状和体征(包括生物学、化学和物理学变化),并且往往与多种其它因素,包括但 不限于人口学、环境、就业、遗传和医疗史因素相关。某些特征性体征、症状及相关因素可以 通过多种方法定量以获得重要的诊断信息。适于使用本文所述的组合物和方法进行预防和 /或治疗的优选〃障碍〃、〃疾病〃或〃病理状态〃是DNA修复缺陷障碍。
[0073] 如本文所用,术语"DNA修复缺陷"是指这样一种受试者障碍,其中DNA修复通路的 一种或多种组分低表达、突变或功能不及野生型生物体中的相同组分。DNA修复缺陷障碍可 以指至少一个细胞具有突变的受试者。DNA修复缺陷障碍的实例包括但不限于共济失调毛 细血管扩张(A-T)、着色性干皮病(XP)、范可尼贫血(FA)、李-佛美尼综合征、奈梅亨断裂 综合征(NBS)、A-T样障碍(ATLD)、沃纳综合征、布卢姆综合征、罗-汤二氏综合征、科凯恩 综合征(CS)、毛发硫营养不良症、ATR-塞克尔综合征、LIG4综合征、人类免疫缺陷伴小头畸 形、脊髓小脑性共济失调伴轴索性神经病、共济失调伴眼动失用症1型、共济失调伴眼动失 用症2型、戴-布二氏贫血、Rapadilino综合征、特科特综合征、塞克尔综合征、Lynch综合 征、NBS样综合征和RIDDLE综合征。
[0074] 如本文所用,术语"DNA修复酶"是指在修复核酸内的突变中涉及到的多肽。DNA 修复酶可得自原核生物或真核生物。优选的DNA修复酶来自真核生物。甚至更优选的是哺 乳动物DNA修复酶。最优选的是人类DNA修复酶。DNA修复酶在本领域中是已知的。
[0075] 如本文所用,术语〃有效量"、〃有效剂量"、〃足量"、〃对...有效的量"、〃治疗 有效量"或其语法等同语是指足以产生所需结果、足以改善或以一定方式减缓病症的症状 或停止或逆转病症的进展并提供由临床医生或其他有资质的观察者注意到的症状的主观 减轻或客观上可确认的改善的剂量。通过施用本文所述的药物组合物改善特定病症的症状 是指可与施用该药物组合物相关的任何减轻(不管是永久性的还是暂时性的)、持续或转 变。关于益生菌微生物的〃有效量〃、〃有效剂量〃、〃足量〃、〃对...有效的量〃、〃治疗 有效量〃,给药范围随所用的药物组合物、施用途径和特定药物组合物的效能而变化。
[0076] "功能效应"包括体外、体内和离体活性。
[0077] 本文可互换使用的术语〃个体〃、〃受试者〃、〃宿主〃和〃患者〃是指哺乳动物, 包括但不限于鼠科动物、猿猴、猫科动物、犬科动物、马科动物、牛科动物、哺乳动物类的农 场动物、哺乳动物类的运动动物和哺乳动物类宠物以及人类。优选的是人类。
[0078] 如本文所用,"体外"意指从其获取一个或多个细胞或从其分离细胞系的生物体的 体外。
[0079] 如本文所用,"体内"意指从其获取一个或多个细胞或从其分离细胞系的生物体的 体内。
[0080] 如本文所用,生物样品中的"mRNA水平〃是指存在于细胞或生物样品中的从基因 转录的mRNA的量。mRNA通常编码功能蛋白,但可以存在改变或消除编码蛋白的功能的突 变。"mRNA的水平"不需要进行定量,而是可以简单地进行检测,例如,由人进行的主观、目 视检测,与或不与对照样品的水平或对照样品的预期水平进行比较。优选的mRNA是从编码 DNA修复酶的基因转录的mRNA。
[0081] 如本文所用,生物样品中的"多肽水平"是指存在于细胞或生物样品中的从mRNA 转录的多肽的量。该多肽可以或可以不具有蛋白活性。"多肽的水平"不需要进行定量,而 是可以简单地进行检测,例如,由人进行的主观、目视检测,与或不与对照样品的水平或对 照样品的预期水平进行比较。优选的多肽是DNA修复酶。
[0082] 如本文所用,"哺乳动物"或"哺乳动物的"意指或涉及哺乳类,包括食肉目(例如 狗和猫)、啮齿目(例如小鼠、豚鼠和大鼠)和灵长目(例如人、黑猩猩和猴子)。
[0083] 如本文所用,术语"调节"及其语法等同语是本领域公认的并指上调(即,活化、刺 激、增加)或下调(即,抑制、阻遏、降低或减小)反应,或两者的组合或分离。
[0084] 如本文所用,DNA修复酶或编码DNA修复酶的基因的水平或活性的"调节剂"包括 该基因或多肽的活化剂和/或抑制剂,并用于指活化或抑制该基因或多肽的表达水平或该 基因或多肽的活性的化合物。<
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