一种与白叶枯病抗性基因Xa7紧密连锁的SNP分子标记及其应用的制作方法

文档序号:11145742阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种与白叶枯病抗性基因Xa7紧密连锁的SNP分子标记,其特征在于,其序列如SEQ ID No.2所示,第61bp位点处的碱基为G或A。

2.用于检测权利要求1所述分子标记的引物组合,其特征在于,包括:

(1)两条特异性引物:

Primer X:5’-GCTGTAATTTATTTGCTCAACG-3’;

Primer Y:5’-TGCTGTAATTTATTTGCTCAACA-3’;

(2)一条通用引物:

Primer C:5’-ATGCCCATAAGGCCATAATA-3’。

3.含有权利要求2所述引物组合的试剂或试剂盒。

4.权利要求2所述的引物组合在检测白叶枯病抗性基因Xa7中的应用。

5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,包括如下步骤:

S1、提取水稻样品基因组DNA;

S2、以水稻基因组DNA为模板,利用权利要求2所述引物组合进行KASP反应检测;其中,两条特异性引物分别连接不同的荧光序列;

S3、若只检测到引物PrimerY所连荧光序列对应的荧光信号,则判断水稻样品为携带白叶枯病抗性基因Xa7的纯和型;若只检测到引物PrimerX所连荧光序列对应的荧光信号,则判断水稻样品为不携带白叶枯病抗性基因Xa7的纯和型;若同时检测到两种荧光,则判断水稻样品为携带白叶枯病抗性基因Xa7的杂合型。

上述应用的实质为前述分子标记的检测方法。

6.权利要求1所述分子标记在水稻抗病性辅助育种中的应用,其特征在于,包括如下步骤:

S1、提取水稻样品基因组DNA;

S2、以水稻基因组DNA为模板,利用权利要求2所述引物组合进行KASP反应检测;其中,两条特异性引物分别连接不同的荧光序列;

S3、选择检测到引物PrimerY所连荧光序列对应的荧光信号的水稻样品进行育种。

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