长滩军团菌的荧光原位杂交检测试剂盒的制作方法_2

文档序号:8392506阅读:来源:国知局
体实施例,进一步阐述本发明。
[0032] 1.本发明所需主要试剂的制备
[0033] (1)探针合成
[0034] 委托商业探针合成公司合成探针:
[0035]探针:[FITC]-5'-CGTCCTCAGACATCATCC(核酸序列SEQIDNO :1)
[0036] FITC:异硫氰酸焚光素(fluoresceinisothiocyanate),通过一个氨基连接分子 与探针5'端相连,
[0037] 以无菌蒸馏水溶解,配制成浓度10ng/y1。
[0038] (2)配制杂交缓冲液:
[0039] 杂交缓冲液包含:20mMTris-HCl,20% 甲酰胺,900mMNaCl。
[0040] (3)配制洗脱缓冲液:
[0041] 洗脱缓冲液包含:20mMTris-HCl,0. 01%SDS,225mMNaCl和 5mMEDTA。
[0042] (4)制备阳性试剂盒性、阴性对照品:分别使用长滩军团菌(ATCC33462)和嗜肺军 团菌(ATCC35072)标准菌株,然后稀释至0. 5麦氏浊度,按0. 5mL分装。
[0043] 将上述制备好的探针、杂交缓冲液、洗脱缓冲液、阴性对照、阳性对照置于同一包 装盒中,组成试剂盒,封装。
[0044] 2.试剂盒的应用(以环境水样本检测为例)
[0045] (1)样品处理
[0046] 将200mL水样注入滤器,开启真空泵,水样通过负压抽滤至干,直接刮取滤膜上沉 淀于5mL无菌蒸馏水中,取lmL转移至1. 5mlEP管内,12000rpm离心1分钟,弃上清,向沉 淀中加入lmL4%多聚甲醛制成菌悬液,置于4°C过夜固定。12000rpm离心3分钟,弃上清, 以PBS缓冲液(PH= 7. 6)重悬菌液。取20y1菌液均匀涂于载玻片上,室温风干。
[0047] (2)荧光原位杂交
[0048] 将涂有菌液的玻片依次置于50%,80%和96 %的乙醇溶液中脱水3分钟,自然风 干。在避光条件下,取含5ng探针的0. 5y1探针溶液以及19. 5y1杂交缓冲液共计20y1 混合,滴加至玻片中央,置于46°C湿盒中杂交2h,之后于46°C预热的洗脱缓冲液洗去未杂 交的探针,去离子水冲洗玻片,避光风干。
[0049](3)荧光显微镜下观察
[0050] 调整激发光波长至490~495nm,在荧光显微镜下观察玻片。(阳性检测结果见图 1,阴性检测结果见图2)
[0051]3.试剂盒的应用(以菌株为例)
[0052](1)样品处理:
[0053] 用接种环挑取待检菌落于1. 5mlEP管内制成4%多聚甲醛菌悬液,置于4°C过夜 固定。12000rpm离心3分钟,弃上清,以PBS缓冲液(PH= 7. 6)重悬菌液。取20y1菌液 均匀涂于载玻片上,室温风干。
[0054] (2)荧光原位杂交:
[0055] 将涂有菌液的玻片依次置于50%,80%和96 %的乙醇溶液中脱水3分钟,自然风 干。在避光条件下,取含5ng探针的0. 5y1探针溶液以及19. 5y1杂交缓冲液共计20y1 混合,滴加至玻片中央,置于46°C湿盒中杂交2h,之后于46°C预热的洗脱缓冲液洗去未杂 交的探针,去离子水冲洗玻片,避光风干。
[0056] (3)焚光显微镜下观察:
[0057] 调整激发光波长至490~495nm,在焚光显微镜下观察玻片。
[0058] 4试剂盒特异性和灵敏度试验
[0059] 特异性
[0060] 按照3.试剂盒的应用(以菌株为例)中的方法,使用本发明的方法检测了 19株 长滩军团菌、4株非军团菌属菌株以及与探针匹配程度较高的21株非长滩军团菌(包括10 株嗜肺军团菌,1株圣克鲁伊军团菌,1株圣海伦军团菌,1株辛辛那提军团菌,4株博兹曼军 团菌,2株麦氏军团菌,2株杜氏军团菌),进行探针的特异性检测试验。结果显示,本发明的 试剂盒能在多种类似菌中特异性的检测出长滩军团菌(附图1和2分别显示了本发明的试 剂盒检测一株长滩军团菌和一株嗜肺军团菌时的显微镜图像,其他阳性/阴性菌株的检测 结果类似)。
[0061] 灵敏度
[0062] 将长滩军团菌标准菌株(ATCC33462)配制0.5麦氏浊度的菌悬液,按10倍体积 作梯度稀释至1〇_7倍,制成人工模拟水样。使用本发明的试剂盒检测,取最低检测浓度菌 悬液20yl涂布至BCYEa平板,36°C,5%C02,培养72h后计数平板上菌落。结果显示在 1.49X103cfU/ml的军团菌浓度下,本发明的试剂盒仍然能检测出样本中的长滩军团菌。
【主权项】
1. 一种检测长滩军团菌的荧光原位杂交试剂盒,其包括根据长滩军团菌特异性序列区 域的荧光标记探针。
2.权利要求1的试剂盒,其中所述荧光标记探针是根据长滩军团菌16S rRNA中的特异 性区域设计,为[FITC]-5' -CGTCCTCAGACATCATCC(核酸序列为SEQ ID NO :1)。
3. 权利要求1或2所述的试剂盒,还包括荧光原位杂交缓冲液、荧光原位杂交洗脱液、 阳性对照和阴性对照。
4. 权利要求3所述的试剂盒,其成分为: (1) 探针:[FITC]-5,-CGTCCTCAGACATCATCC(核酸序列为SEQIDNO:1)的探针,以无 菌蒸馏水溶解,配制成浓度l〇ng/y1 ; (2) 荧光原位杂交缓冲液:20mMTris-HCl,20%甲酰胺,900mMNaCl; (3) 荧光原位杂交洗脱液:20mM Tris-HCl,0. 01% SDS,225mM NaCl和5mM EDTA ; (4) 阳性对照:长滩军团菌标准菌株(ATCC33462),0. 5mllX104个菌/ml培养物; (5) 阴性对照:嗜肺军团菌标准菌株(ATCC35072),0. 5mllX104个菌/ml的嗜肺军团菌 培养物。
【专利摘要】本发明提供了一种检测长滩军团菌的荧光原位杂交试剂盒,其包括探针[FITC]-5’-CGTCCTCAGACATCATCC(SEQ ID NO:1)。
【IPC分类】C12Q1-04, C12R1-01, C12Q1-68
【公开号】CN104711342
【申请号】CN201410202061
【发明人】朱庆义, 顾全, 胡朝晖, 严慧
【申请人】广州金域医学检验中心有限公司
【公开日】2015年6月17日
【申请日】2014年5月13日
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