抗精神病药物相关代谢综合征的易感基因及其应用_2

文档序号:9300651阅读:来源:国知局
r>[0047] 在另一优选例中,所述样品包括血液样本。
[0048] 在另一优选例中,所述的个体包括患有精神疾病的患者和/或拟用抗精神病药物 治疗的患者。
[0049] 应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具 体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在 此不再一一累述。
【具体实施方式】
[0050] 本发明人经过广泛而深入的研究,从多个代谢相关基因的数百个SNP中,首次意 外地筛选获得了一个与抗精神病药物相关代谢综合征易感性密切相关的、来源于SREBF-I 基因的SNP。通过检测该基因及SNP,能够辅助性判断个体对于抗精神病药物相关代谢综合 征的易感性,为该疾病的诊断和相应治疗提供了新的途径;此外,该基因及SNP的发现,还 提供了开发治疗相关代谢性疾病的药物新靶点,并可作为用于该病患者转归、预后的分子 标志。在此基础上,完成了本发明。
[0051] 单核苷酸多态性(SNP)
[0052] 单核苷酸多态性是人类基因组中最常见的DNA序列变异,在各种生物学和生物医 学的应用中获得了越来越多的重要性。SNPs可以用来探索人类种群进化历史、分析法医样 品,因此在遗传学中发挥重要作用。药物遗传学利用这些DNA变异来阐明构成不同药物功 效或不良事件的基础遗传因素。
[0053] 本发明涉及鉴定特定疾病的单核苷酸多态性(SNPs),其明确鉴定为与抗精神病药 物相关代谢综合征相关,因此,在疾病症状存在之前,可以对这些个体进行干预,例如饮食 改变,锻炼和/或药物治疗。鉴定涉及抗精神病药物相关代谢综合征的SNPs有助于更好的 理解疾病过程,改善诊断试剂和治疗试剂。
[0054] 如本文所用,术语"SNP"是指在个体群体之间不同的人类基因组中特定位置上的 单核苷酸多态性。在本发明中,SNP可以通过它的名称或通过位于特定序列的位置来确定。 如SNP " [G/A] "表示在该序列的该位置的核苷酸碱基(或等位基因)可以是鸟嘌呤或腺嘌 呤。
[0055] 如本文所用,本发明公开的核苷酸序列包括所述核苷酸序列的互补序列。另外,术 语" SNP "包括在一组等位基因中的任何等位基因。
[0056] 如本文所用,术语"等位基因"是指在定义SNP的核苷酸选择中特定的核苷酸。
[0057] 如本文所用,术语"风险等位基因"是指与抗精神病药物相关代谢综合征疾病关联 的等位基因。
[0058] 如本文所用,术语"单倍型"是指来自于两个或多个SNPs的具体等位基因的组合。
[0059] 如本文所用,术语"风险状态单倍型"是指与抗精神病药物相关代谢综合征疾病相 关联的单倍型。
[0060] SREBF-I 基因及相关 SNP
[0061] 脂代谢的信号传导途径相当复杂,SREBP是其中一条很重要的途径,是调控胆固醇 生物合成和摄取转录的关键基因,能与脂质合酶基因的启动子/增强子的固醇调节元件结 合,激活靶基因转录,特异性地调控胆固醇酸代谢。其调控的靶基因众多,同时其成熟又受 多个蛋白分子的调控,此途径中的多个环节都受到其终末产物的负反馈抑制作用。
[0062] 哺乳动物基因编码的SREBP有3种亚型:SREBP-la、SREBP-Ic和SREBP-2。 SREBP-la、-Ic基因定位于染色体17pll. 2,由SREBFl基因的不同启动子编码产生。 SREBP-Ia主要调控胆固醇和脂肪酸合酶以及低密度脂蛋白受体的基因转录,能够促进胆固 醇和脂肪酸的合成;SREBP-Ic选择性调控脂肪酸、甘油三酯以及糖代谢中酶的基因表达水 平,通过作用于启动子,选择性活化脂质合成相关酶基因。SREBF2基因定位于22ql3,主要 参与胆固醇合成酶的基因调控,促进胆固醇的合成。
[0063] Le Hel Iard 等(Le Hel lard S,et al. A ssociation between the insulin-induced gene 2 (INSIG2)and weight gain in a German sample of antipsychotic-treated schizophrenic patients:perturbation of SREBP-controlied lipogenesis in drug-related metabolic adverse effects ? [J].Mol Psychiatry, 2009, 14(3) :308-317.)等的研究表明,SREBF2 的 rs4822064SNP 对抗精神病药 引起的体重增加具有一定的相关性,而SREBFl则无显著的相关性。
[0064] 本发明人通过对服用抗精神病类药物患者进行了大样本分析,选取了多个代谢相 关基因的227个SNP,初步筛选获得SREBFl基因的12个标签SNP、SCAP基因的5个SNP, 使用Sequenom MassARRAY技术等对这些标签SNP进行基因分型、采用生物信息学软件分 析两组间等位基因及基因型分布差异,并通过回归分析进一步校正分析(年龄、性别、吸烟 情况、服用氯氮平剂量、代谢综合征家族史、服用药物前的BMI),结果发现了一个SREBFl基 因的SNP与抗精神病药物相关代谢综合征的相关性具有非常显著的差异,所述的SNP位于 17pll. 2。含有所述SNP的SREBFl基因组序列如SEQ ID NO. : 1所示。
[0065] SNP :rsll654081的等位基因检测为T时,或基因型检测为TT时,则说明所述样 本中含有的SREBP-I基因为抗精神病药物相关代谢综合征的易感基因与抗精神病药物相 关代谢综合征相关联,可能是该疾病的风险位点,或与该疾病的风险位点相关联。通过对 rsll654081位点进行基因分型可以对待测个体的抗精神病药物相关代谢综合征患病风险 进行评估或辅助诊断待测个体是否为抗精神病药物相关代谢综合征患者。
[0066] 含SNP的多核苷酸
[0067] 本发明还提供了含本发明所述SNP的多核苷酸。
[0068] 如本文所用,术语"多核苷酸"是指任何长度的核苷酸的多态式。多核苷酸可以含 有脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、和/或它们的类似物。多核苷酸可以具有任何三维结构, 包括单链、双链和三螺旋分子结构,并且可以执行任何已知或未知的功能。如以下非限制性 实施例:基因或基因片段,外显子,内含子,mRNA,tRNA,rRNA,siRNA,核酶,cDNA,重组多核苷 酸,质粒,载体,分离的任何序列的DNA,分离的任何序列的RNA,核酸探针,引物。多核苷酸 也可以包括经修饰的核酸分子,如甲基化核酸分子和核酸分子类似物。
[0069] 在另一优选例中,所述的多核苷酸本身还可以包括检测所述多核苷酸的检测试 剂,包括引物、探针、扩增产物、或质粒。
[0070] 如本文所用,术语"基本分离的"或"分离的"多核苷酸是指基本没有天然的相关 序列的多核苷酸。基本上没有是指至少50%、较优地至少70%、更优地至少80%或最优地 至少90%不含其它天然相关物质。"分离的多核苷酸"还包括重组的多核苷酸。
[0071] 如本文所用,术语"在严格条件下杂交"意在描述杂交条件,在该条件下,彼此至 少60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或98%相同的核苷酸序列典型地彼此保 持杂交。这些严格的条件是本领域技术人员已知的并且可以在Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley&Sons,Ν· Y(1989)中找到。严格杂交的一个非限制性实 例是在约45°C下在6χ氯化钠/柠檬酸钠(SSC)中杂交,接着在0. 2xSSC,0. 1% SDS中在 50-65 °C下一次或多次洗涤。
[0072] 如本文所用,术语"引物"是指在与模板配对,在DNA聚合酶的作用下能以其为起 点进行合成与模板互补的DNA链的寡居核苷酸的总称。引物可以是天然的RNA、DNA,也可以 是任何形式的天然核苷酸。引物甚至可以是非天然的核苷酸如LNA或ZNA等。引物"大致 上"(或"基本上")与模板上一条链上的一个特殊的序列互补。引物必须与模板上的一条 链充分互补才能开始延伸,但引物的序列不必与模板的序列完全互补。比如,在一个3'端与 模板互补的引物的5'端加上一段与模板不互补的序列,这样的引物仍大致上与模板互补。 只要有足够长的引物能与模板充分的结合,非完全互补的引物也可以与模板形成引物-模 板复合物,从
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