一种提取农杆菌质粒dna的试剂盒的制作方法

文档序号:9320534阅读:2040来源:国知局
一种提取农杆菌质粒dna的试剂盒的制作方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种提取农杆菌质粒DNA的试剂盒,属于生物技术领域。 技术背景
[0002] 农杆菌质粒DNA的提取和检测在植物基因工程研究中是必需的试验,也是在分子 生物学试验中一项常规技术。农杆菌转化系统是一种天然的基因转化系统。农杆菌分为 根瘤农杆菌和发根农杆菌。根瘤农杆菌中含有肿瘤诱导(T)质粒,Ti质粒上含有可转移 DNA(T-DNA)区、毒性区(Vir区)以及冠癭碱代谢基因编码区。T-DNA两端是两个25bp的 重复序列,分别称为左边界和右边界,两个边界序列之间是生长素和细胞分裂素合成基因 以及冠癭碱合成基因。Vir区中也含有多个基因段,如FiM、FirB、FirC、VirD.、VirE、VirG、 VirH等,每个基因段都含有多个基因。当植物受到伤害时,分泌含有酚类化合物的汁液,这 些酚类化合物一方面通过染色体毒性基因(chvA、chvB等介导的趋化性促使农杆菌向植物 受伤部位移动并附着于植物细胞表面;另一方面则被Ti质粒上由VirA和VirG组成的双组 分调节系统识别,从而诱导其他Vir的表达。VirDl和VirD2共同作用,由T-DNA右边界开 始向左边界切割产生一条T-DNA单链,并与Vir其它表达蛋白结合成复合体转移到农杆菌 外,然后进入细胞到达细胞核内并整合到细胞染色体上。
[0003] 转基因植物在近代工业、医药业、特别是农业等各个领域的研究和应用越来越为 人类所重视。通过农杆菌对植物植株、器官、组织及细胞的侵染进行质粒转化,是将外源基 因导入目的植物的重要方法之一。将外源基因人为导入天然植物中,从遗传物质水平上对 植物进行有目的改造,由此获得转基因植物,其性状将按着有利于人们需要的方向发生改 变。如转基因的抗虫棉花,通过人们的改造,使棉花在生长过程中体内能够自主地产生抵抗 害虫的毒素,以达到自我保护、减少农药使用增产增收的目的。
[0004] 为了更好地将外源基因导入目的植物,需要研制一种提取农杆菌质粒DNA的方 法。因此研制一种农杆菌质粒DNA提取的试剂盒对于外源基因整合到植物基因组中,参与 植物基因调控表达具有重要意义。

【发明内容】
: 本发明提供一种提取农杆菌质粒DNA的试剂盒,利用该试剂盒可以方便、快速地提取 到农杆菌的质粒DNA。
[0006] -种提取农杆菌质粒DNA的试剂盒,包括农杆菌菌液培养,农杆菌细胞破碎,DNA 吸附柱吸附DNA以及杂质的去除,DNA洗脱,具体步骤如下: 农杆菌菌液培养:挑取含有质粒的农杆菌菌株接种到50-100ml YEB液体培养基中, 在恒温摇床上28-30°C,160-200rpm/h,培养40-48h。吸取2-4ml菌液于5ml离心管中, 10000-13000rpm/min 离心 5-10min,弃上清,保留沉淀。
[0007] 农杆菌细胞破碎:往含有农杆菌沉淀的5ml离心管中加入3-4ml Buffer A,漩 祸悬浮菌体后10000-13000rpm/h离心3-5min,弃上清,保留沉淀。往沉淀中加入3-4ml Buffer A,漩祸悬浮菌体后10000-13000rpm/h离心3-5min,弃上清,保留沉淀。往沉淀中 加入0. 4-0. 5ml Buffer B,漩涡悬浮菌体,室温下静止10-20min,加入0. 8-lml新配置的 Buffer C,上下颠倒离心管5-10次,室温下静止10_20min,加入0.4-lml Buffer D,轻柔颠 倒离心管数次,使其充分混匀。加入0.2-lml Buffer E,轻柔颠倒离心管数次,使其充分混 勾,将离心管冰浴5-10min后10000-13000rpm/h离心10_15min,将上清转入新的离心管中。 加入与上清等体积的Buffer F溶液抽提,10000-13000rpm/min离心5-10分钟,将上清转 移至新的离心管中。加入与上清等体积的Buffer G抽提,10000-13000rpm/min离心10-20 分钟,将上清转移至新的离心管中。
[0008] DNA吸附柱吸附DNA以及杂质的去除:往离心管中加入两倍体积的沉淀剂,混匀后 加入DNA吸附柱,10000-13000rpm/min离心l-2min,弃废液,加入500-600 y 1去蛋白液, 10000-13000rpm/min 离心 l-2min,弃废液,加入 300-500 y 1 漂洗液,12000-13000rpm/min 离心l-2min,弃废液,加入500-600 y 1漂洗液,12000-13000rpm/min离心l-2min,弃废液, 12000-13000rpm/min 离心 l_2min,静置吹干。
[0009] DNA 洗脱:往吸附柱中加入 30-60 y 1 洗脱液,12000-13000rpm/min 离心 l-2min, 所得液体为农杆菌质粒DNA。取3-6 yl DNA水溶液,于1-2%琼脂糖凝胶中电泳检测。
[0010] 试剂的配方如下: DNA吸附柱为硅胶模吸附柱,购自北京天恩泽公司。
[0011] YEB液体培养基:5-10g/L牛肉浸膏,5-10g/L胰蛋白胨,l-10g/L酵母提取物, 5-10g/L蔗糖,0. 5-lg/L七水硫酸镁,用氢氧化钠调PH至7. 0-8. 0。
[0012] Buffer A:0. 1-0. 5mol/L 氯化钠,10-20mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(PH = 8-9), 0? 1-0. 3mol/L 乙二胺四乙酸(PH = 8-9)。
[0013] Buffer B: 50_80mmol/L 葡萄糖,25_50mmol/L 三轻甲基氨基甲烧(PH = 8-9), 10_20mmol/L 乙二胺四乙酸(PH = 8-9),2. 5_4mg/ml 溶菌酶。
[0014] Buffer C:0. 2-0. 5mol/L氢氧化钠,1-3%质量体积比的十二烷基硫酸钠(SDS),氢 氧化钠溶液与SDS溶液单独配置,使用前现配现用,等体积混合即是Buffer C溶液。
[0015] 811打6『0:3-5111〇1/1醋酸钾,11.5-20%冰醋酸。
[0016] Buffer E:3-5mol/L 乙酸钠(PH = 4. 8-6),用冰乙酸调 PH 至 4. 8-6〇
[0017] Buffer F:酸:氯仿:异戊醇的体积比为25:24:1。
[0018] Buffer G:氯仿:异戊醇的体积比为24:1。
[0019] 沉淀剂:70-80 %无水乙醇。
[0020] 去蛋白液:3-61盐酸胍,10-30禮三羟甲基氨基甲烷〇^8),口11 = 6.0-7.0,用前 加乙醇,使得乙醇在去蛋白液中的终浓度为30-40 %。
[0021] 漂洗液:20-50mM 氯化钠(NaCL),2-5mM 三羟甲基氨基甲烷(Tris),pH = 7. 0-8. 0, 80-90%比重无水乙醇。
[0022] 洗脱液:10-20mM三羟甲基氨基甲烷(Tris),pH = 8. 0-9. 0。
[0023] 本发明的显著优点: 农杆菌质粒DNA的提取和检测在植物基因工程研究中是必需的试验,常规的农杆菌质 粒提取步骤繁琐,操作麻烦,一般需要4h左右才能完成农杆菌质粒DNA的提取。本发明提 供一种提取农杆菌质粒DNA的试剂盒,利用该试剂盒仅需1. 5h即可完成农杆菌质粒DNA的 提取,该试剂盒与常规提取方法相比不仅节省了大量时间,同时也更加方便、快捷,具有一 定的经济效应。
【附图说明】
[0024] 图1为利用本试剂盒提取的农杆菌质粒DNA的电泳检测图。 具体实施例
[0025] 图1中,泳道1、2均为利用本试剂盒提取的农杆菌质粒DNA电泳检测图,泳道3为 TAKARA 公司的 DL4500Marker。
[0026] -种提取农杆菌质粒DNA的试剂盒,具体步骤如下: (1)农杆菌菌液培养:挑取含有质粒的农杆菌菌株EH105接种到50ml YEB液体培养基 中,在恒温摇床上28°C,160rpm/h,培养48h。吸取4ml菌液于5ml离心管中,10000rpm/min 离心5min,弃上清,保留沉淀。
[0027] (2)农杆菌细胞破碎:往含有农杆菌沉淀的5ml离心管中加入3ml Buffer A,漩 祸悬浮菌体后l〇〇〇〇rpm/h离心3min,弃上清,保留沉淀。往沉淀中加入3ml Buffer A,漩 祸悬浮菌体后l〇〇〇〇rpm/h离心3min,弃上清,保留沉淀。往沉淀中加入0.4ml Buffer B, 漩涡悬浮菌体,室温下静止l〇min,加入0. 8ml新配置的Buffer C,上下颠倒离心管5次,室 温下静止l〇min,加入0. 4ml Buffer D,轻柔颠倒离心管数次,使其充分混匀。加入0. 2ml Buffer E,轻柔颠倒离心管数次,使其充分混匀,将离心管冰浴5min后10000rpm/h离心 10min,将上清转入新的离心管中。加入与上清等体积的Buffer F溶液抽提,13000rpm/min 离心10分钟,将上清转移至新的离心管中。加入与上清等体积的Buffer G抽提,1300
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