与瘦表型相关的基因表达谱及其用途的制作方法

专利名称：与瘦表型相关的基因表达谱及其用途的制作方法
技术领域：
本发明通常涉及身体组成的营养或药物调节，特别涉及与改善或维持瘦体质 (lean body mass)或与降低的体脂相关的基因表达谱，以及此类谱用于鉴别制药的、保健品的或膳食物质的用途，所述物质调节动物中的理想表型或促进动物中的理想表型。相关领域的描述体重主要是瘦体质和个体中的脂肪量的函数。瘦体质是骨骼、肌肉、器官、身体水分和身体的所有其它非脂肪组分的重量。脂肪量是身体的储存脂类的重量。比例失调或过多的脂肪量是个体超重或肥胖的标志。过多的脂肪量和肥胖被认为是世界范围的人类健康问题。世界卫生组织估计有超过10亿的超重成人，其中仅低于三分之一的人分类为肥胖。此外，肥胖也日益被认为是动物，特别是陪伴动物例如狗和猫的问题。根据疾病控制中心(CDC)，肥胖至少与其它的健康问题的风险密切相关，所述问题包括高血压、血脂异常、II型糖尿病、心脏病、中风、睡眠窒息和一些癌症，例如乳腺癌、子宫内膜癌和结肠癌。个体变成肥胖的风险因子包括遗传、情绪/压力、反应过激和静坐的生活方式。增强的瘦体质可以增强身体的基础代谢率。当膳食卡路里摄入不足以满足身体的能量需要时，增强代谢率可以促进过多的脂肪量的减少，或者当膳食卡路里摄入超过了身体的维持能量需求时，可以降低脂肪量的积累。已描述了增加瘦体质的各种方法。一种此类方法是具有共轭亚油酸(CLA)的膳食补充剂。CLA是用于描述可见于多种食物(例如奶制品)中的十八碳二烯酸的异构体的术语(Terpstra AHM(2004)Am. J. Clin. Nutr. 79 352-61)。CLA已表现出降低小鼠和人的脂肪量，并涉及瘦体质的增加 hattacharya A 等，(2005) J. Nutr. 135 :1124-30 ；Gaullier J-M 等，(2004) Am. J. Clin. Nutr. 79 :1118-25 ； Blankson H 等，(2000) J. Nutr. 130 :2943-8 ；和 Park Y 等，(1997) Lipids 32:853-8)。另一种增加瘦体质的方法是消耗高蛋白质饮食。研究提示，具有较高蛋白质含量的饮食结合降低的碳水化合物消耗和/或规律的运动，可以增强脂肪量的丢失并降低瘦体质的丢失 (Layman DK 等，0005) J. Nutr. 135 :1903-10 ；Layman DK 等，0004) J. Nutr. 134 :968S_73S ； Marsset-Baglieri A 等，(2004) J. Nutr. 134 :2646-52 ；和 Due A 等，(2004) Int. J. Obes. Relat. Metab. Disord. 28 :1283-90)。第三种增加瘦体质和减少脂肪量的方法是规律的运动(Bhattacharya A 等，(2005) J. Nutr. 135 :1124-30 ；Layman DK 等，(2005) J. Nutr. 135 1903-10 ；禾口 Tsai AC 等，(2003) J. Nutr. Biochem. 14 :541-9)。多种研究已评估了瘦体质和肥胖的遗传学的不同方面。相关性研究揭示在体重、超重、肥胖和多个基因中多态性之间的关联(Chagnon YC等，(2003)Obesity Res. 11 313-67)。相似的，相关研究已鉴别了与身体脂肪量、体脂百分比和皮肤皱襞(skin folds)、体脂分布(腰臀比、腰围等)、静息能量消耗和脂肪细胞脂解作用相关的基因(Chagnon YC等，(2003)Obesity Res. 11 :313-67)。此外，研究已评估了在候选基因和体重改变之间的相关性，包括与随时间的自发性体重获得相关的基因，与耐力训练-诱导的脂肪量改变相关的基因和与在三年生活方式改变的过程中体重丢失相关的基因(Chagnon YC等， (2003)Obesity Res. 11 :313-67)。所有此类基因的列表可见于现有技术(Chagnon YC等， (2003)Obesity Res. 11 :313-67)。研究还已分析了瘦体质的遗传学方面。瘦体质研究将 1型脱碘酶的多态性与较高的瘦体质和肌肉强度相关联(Peeters RP等，(2005) J. Clin. Endocrinol. 90 :256-63)，糖皮质激素受体的多态性与较高的肌肉量和肌肉强度相关联 (van Rossum EFC 等，Q004) J. Clin. Endocrinol. 89 :4004-9)。虽然瘦体质和脂肪量是直接相关的，但是极少研究试图探讨介导较高比例的一种类型与另一种相关的遗传机制。这类机制的详细知识可以提供对有利于高水平的瘦体质和 /或降低的体脂的条件的更好理解，并可以提供对如何在动物中促进瘦体质的更好的理解。 因为较高比例的瘦体质，特别是相当于脂肪量的瘦体质，对改善健康和减少与肥胖相关的疾病风险具有正面的影响，对个体而言，通过增加瘦体质和/或降低体脂，来增加瘦体质相当于脂肪量的比例是理想的。发明概述因此，本发明的目标是提供一种或多种的基因或基因区段，所述基因或基因区段在表现出由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致的瘦表型的动物中是差异表达的，所述治疗包括⑴施用CLA，⑵消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动。本发明的另一个目标是提供包括多种多核苷酸的组合，所述多核苷酸在表现出由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致的瘦表型的动物中是差异表达的，所述治疗包括(1) 施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动。本发明的另一个目标是提供两种或多种多核苷酸或多肽探针的组合物，所述探针适于在表现出由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致的瘦表型的动物中检测差异表达的基因的表达，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动，以及含有所述探针的装置，例如基质阵列。本发明的另一个目标是提供用于在动物中检测一个或多个差异表达的基因的表达的方法，其中所述动物与正常或未治疗的动物相比，表现出由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致的瘦表型，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动。本发明的另一个目标是提供用于测量测试物质(例如，瘦体质促进性营养物或生物活性剂)对在动物中差异表达的一种或多种基因的表达谱的影响，其中所述动物与正常或未治疗的动物相比，表现出由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致的瘦表型，所述治疗包括⑴施用CLA，⑵消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动。一个或多个这类其它的目标是使用这样的多核苷酸或多肽的新的组合来实现的， 所述多核苷酸或多肽代表在动物中差异表达的基因和基因区段，其中所述动物表现出由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致的瘦表型，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动。多核苷酸用于生产组合物、探针、基于探针的装置，和用于确定在与正常或未治疗的动物相比表现出瘦表型的动物中差异表达的多核苷酸状态的方法，所述方法可用于实现上述鉴别的目的，例如预后和诊断与表型相关的状况，并用于筛选物质，以确定所述物质是否可用于促进所述表型。此类物质一旦经鉴别，就可以用于促进所述表型。 还提供了包含探针的组合的多种试剂盒、使用探针的装置以及物质，并提供了多种用于操作信息的计算机程序，和用于传播属于差异表达基因的信息的传播介质，及其使用方法。本发明的其它目标、特征和优点对本领域技术人员是显而易见的。发明详述定义除非另外特别说明，本文表述的所有百分比都是在干物质的基础上按组合物的重量计。熟练的技术人员可以理解术语“干物质基础”意指在组合物中的任何游离水分都去除后，再测量组合物中的成分的浓度。如全文使用的，范围在本文中作为简写使用，使得避免必需冗长的叙述和描述范围内的每个值。当合适时，可以选择范围内的任何合适的值作为上限值、下限值或范围的终点。可以理解在本文提出的任何范围或间隔之间的任意和所有的全体或部分整数都包括在本文中。如本文和所附权利要求中使用的，词语的单数形式包括了复数形式，反之亦然，除非上下文中清楚的另外指出。因此，称谓“一”、“一个”和“这个”一般包括了各个术语的复数形式。例如，称谓“一只动物”、“一种方法”或“一种物质”包括了复数的此类“动物”、“方法”或“物质”。类似地，词语“包括”解释为包括性的而非排他的。术语“动物”意指人或其它动物，包括鸟类、牛科、犬科、马科、猫科、hicrine、鼠类、 羊和猪科的具有脂肪组织的动物。当该术语用于比较测试对象的上下文中时，所比较的动物是同一物种的动物，并可能是相同的血统(race)或品种(breed)。“陪伴动物”是任何家养的动物，包括但不限于猫、狗、大鼠、豚鼠、雪貂、仓鼠、小鼠、沙鼠、马、奶牛、山羊、绵羊、 驴、猪等。优选的，动物是人或陪伴动物例如犬科或猫科动物。术语“抗体”意指任何结合特异抗原的免疫球蛋白，包括IgG、IgM、IgA、IgD和IgE 抗体。该术语包括多克隆的、单克隆的、单价的、人源化的、异源缀合的、具有多表位特异性的抗体组合物、嵌合的、双特异性的抗体、双抗体、单链抗体和抗体片段例如Fab、Fab\ F(ab' )2和Fv，或其它的抗原结合片段。术语“阵列，，意指至少2种探针在基质上的有序排列。至少1种探针是对照或标准，并且至少1种探针是诊断探针。约2种至约40，000种探针在基质上的排列保证了在探针和样品多核苷酸或多肽之间形成的各种标记的复合物的大小和信号强度是可以分别区分的。术语“结合复合物”指当样品中的多肽特异性的结合(如本文定义的)结合配偶体(例如抗体或其功能性片段)时形成的复合物。术语“膳食补充剂^t指打算添加到动物的正常饮食中供摄入的产物。膳食补充剂可以是任何形式——例如，固体、液体、凝胶剂、片剂、胶囊剂、粉剂等。优选的以常规剂型提供。在一些实施方案中，以散装消费包装提供，例如散装粉剂或液体。在其它实施方案中， 以大批量提供补充剂以包括在其它食品种类中，例如零食(snack)、宠物零食(treats)、补充剂条(supplement bar)、饮料等。术语“差异表达”或“差异表达的”意指增加的或上调的基因表达，或意指减少的或下调的基因表达，通过样品中的转录信使RNA或翻译的蛋白质的量的缺失、存在或至少统计学显著性来检测。术语“食品”或“食品组合物”意指打算被动物包括人消耗并向其提供营养的组合物。“配制供人消耗的食品产品”是特别打算供人类摄入的任何组合物。“宠物食品”是打算供宠物，优选的被陪伴动物消耗的组合物。“完全的和营养均衡的宠物食品”是基于例如陪伴动物营养学领域公认权威的推荐，以合适的量和比例含有食品预期的接受者或消费者所有已知必需的营养物的食品。此类食品因而能够作为膳食摄入的单一来源，来维持生命或促进生产，不需要添加补充的营养源。营养均衡的宠物食品组合物是本领域普遍已知且普遍使用的。术语“片段”意指(1)是完整序列的一部分的寡核苷酸或多核苷酸序列，并对特定用途具有与完整多核苷酸序列相同或相似的活性，或( 是完整序列的一部分的肽或多肽序列，并对特定用途具有与完整多肽序列相同或相似的活性。此类片段可包含对特定用途视为合适的任意数量的核苷酸或氨基酸。一般而言，寡核苷酸或多核苷酸片段含有至少约 10、50、100或1000个核苷酸，多肽片段含有来自完整序列的至少约4、10、20或50个连续的氨基酸。该术语涵盖了片段的多核苷酸和多肽变体。术语“基因”意指在生产多肽中涉及的完整的DNA或DNA的部分区段，包括在编码区之前和之后的区域(前导子和非转录尾区)以及在单个编码片段(外显子)之间的间插序列(内含子)。该术语涵盖了与基因编码序列的互补序列杂交的任何DNA序列。术语“基因产物”意指基因的转录产物，例如mRNA或其衍生物(例如，cDNA)，或基因转录物的翻译物。术语“基因产物”一般指翻译产物，即蛋白质。在本文中，术语“基因产物”与术语“蛋白质”可互换的使用。术语“高蛋白质饮食”指包含食品或膳食补充剂的饮食，所述饮食导致动物的蛋白质摄入在日常基础上比可比较的对照动物高至少约10%。在一些实施方案中，动物的蛋白质摄入可以比可比较的对照动物高20、30、40、50、60、70、80、90或100 % ( S卩，在最后一种情况下是其两倍)。在其它实施方案中，动物的蛋白质摄入可以比可比较的对照动物高3或4 倍或更高倍。通常，高蛋白质饮食配制为包含与日常饮食相同的卡路里摄入。通常但并非一直的，这是通过降低饮食的碳水化合物含量实现的。备选的或额外的，可以降低饮食的脂肪含量。在特定的实施方案中，高蛋白质饮食的蛋白质含量可以包含至少约25%的总卡路里作为蛋白质。在其它实施方案中，高蛋白质饮食的蛋白质含量可以包含至少约30%、35%、 40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%或 80%的总卡路里作为蛋白质。术语“同源物”意指(1)多核苷酸，包括来自相同或不同动物物种的多核苷酸，具有与对照多核苷酸大于30^^50%,70%或90%序列相似性，并具有与参照多核苷酸相同或基本相同的性质和实施相同或基本相同的功能，或具有在严格条件下与参照多核苷酸特异性杂交的能力，或O)多肽，包括来自相同或不同动物物种的多肽，具有与对照多肽大于 30150170%或90%序列相似性，并具有与参照多肽相同或基本相同的性质和实施相同或基本相同的功能，或具有特异性结合参照多肽的能力。当指代全长编码序列的片段时，这些片段的功能可以简单的是编码一些序列的多肽的选定的部分，或者是适当的相似序列以与编码所述多肽的另一种多核苷酸片段杂交。当指代多肽的片段时，这些片段的功能可以简单的是形成适合抗体生成的表位。两条多肽序列或两条多核苷酸序列的序列相似性是使用技术人员已知的方法确定的，例如Karlin和Altschul的算法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87 :2264-2268 (1990))。此类算法整合到 Altschul 等(J. Mol. Biol. 215 :403-410 (1990)) 的NBLAST和XBLAST程序中。出于比较目的为了获得带空位的比对，可以使用如Altschul 等(Nucl.Acids Res. 25 :3389-3402 (1997))中描述的 Gapped Blast。当使用 BLAST 禾口 Gapped BLAST程序时，使用各程序(例如，XBLAST和NBLAST)的缺省参数。参见httD:// www, ncbi. nlm. nih. rov/。术语“杂交复合物”意指当一条多核苷酸的嘌呤与互补多核苷酸的嘧啶氢键结合时，在样品多核苷酸之间形成的复合物，例如，5’ -A-G-T-C-3’碱基对与3’ -T-C-A-G-5’配对。互补的程度和核苷酸类似物的使用影响杂交反应的效率和严格性。术语“增加的运动，，指身体活动的增加比可比较的对照动物在相同时期内的身体活动高至少约10%。在一些实施方案中，动物的身体活动可以比可比较的对照动物的身体活动高20、30、40、50、60、70、80、90或100% (即，在最后一种情况下是其两倍)。在其它实施方案中，动物的身体活动可以比可比较的对照动物的身体活动高3或4倍或更高倍。可以通过本领域技术人员普遍已知的各种技术测量动物的身体活动。当指代动物时，术语“个体”意指任意物种或种类的单个动物。术语“瘦表型”指在由基因的差异表达导致的在动物中观察到的任何分子的、生物化学的、生理学的、细胞的、系统的和身体的影响，所述基因的差异表达发生于当动物运动、 消耗特定的饮食方案例如高蛋白质饮食，和/或施用化合物、组合物或膳食补充剂以调节与增加或维持瘦体质和/或降低体脂相关的基因的表达时。该类型的示例性化合物是CLA。 术语“瘦表型”还包括“向瘦表型的过渡”，指在由基因的差异表达引起的在动物中观察到的任何分子的、生物化学的、生理学的、细胞的、系统的和身体的影响，所述基因的差异表达发生于当动物经历从正常(如下文定义的)向瘦表型的改变时。术语“施用”意指向动物施用物质、饮食或测试治疗(例如增加的体育运动)。施用周期包括特定物质、饮食或治疗和动物保持一致的时期。“长期施用”通常指超过1周的时期。也考虑长于2或3周，或长于1、2、3或4个月的时期。还包括了更延长的时期，包括长于5、6、7、8、9或10个月。还包括超过11个月或1年的时期。本文还考虑长期使用超过 1、2、3或更多年。在一些动物的情况下，设想在规律的基础上向动物施用通过本方法鉴别的物质或治疗方案。“规律的基础”指至少每月施用。包括更频繁的施用，例如每周1次或每周2或3次。还包括的是包括每天至少1次、2次、3次或更多次施用的方案。不论本文是否清楚的示例，任何给药频率都认为是有效的。熟练的技术人员可以理解给药频率是待施用的物质的函数，一些组合物可以需要更高或更低的频率施用，来维持理想的生物化学、 生理学或基因表达效果，即包括一种或多种的食物摄入、饱腹感、脂类代谢和脂肪利用的效果，以及与其相关的基因表达谱。术语“长期的规律的基础”指在规律的基础上物质的长期施用。所用的“正常的”涉及表现出瘦表型的动物时，指缺少由与瘦表型相关的基因的差异表达导致的分子的、生物化学的、生理学的、细胞的、系统的和身体的影响。术语“口服施用”意指动物摄入或人按指导喂养或剂量喂养动物一种或多种本文描述的物质。术语“摄入”在本文中与术语“口服施用”可互换的使用。术语“消耗”在本文中也用于指在延长的规律的基础上物质的摄入，特别是食品组合物。当人按指导口服施用或喂养物质时，此类指导可以是说明和/或通知人所述物质的用途的，和/或将提供参考的益处。此类指导可以是口头指导(例如，通过来自例如医师、兽医或其它健康专业人员或收音机或电视媒介(例如，广告)的口头说明，或书面指导(例如，通过来自例如医师、兽医或其它健康专业人员(例如处方)、销售专业人员或组织(例如，通过例如销售宣传册、手册或其它指导性的工具)、书面媒介(例如，网络、电子邮件或其它计算机相关的媒介)和/或与物质相关的包装)。术语“多核苷酸”或“寡核苷酸”意指核苷酸的聚合物。该术语涵盖了单链或双链的DNA和RNA (包括cDNA和mRNA)分子，如果是单链的，包括线性或环状形式的它的互补序列。当序列合适时，该术语还涵盖了片段、变体、同源物和等位基因，其具有与原始序列相同或基本相同的性质，实施相同或基本相同的功能。特别的，该术语涵盖了来自不同物种的同源物，例如小鼠和狗或猫。序列可以是当比对时完全互补的(无错配)，或可以具有高达约 30%序列错配。优选的，对于多核苷酸，链含有从约50至约10，000个核苷酸，更优选的从约150至约3，500个核苷酸。优选的，对于寡核苷酸，链含有从约2至约100个核苷酸，更优选的从约6至约30个核苷酸。多核苷酸或寡核苷酸的实际大小可依赖于各种因素以及多核苷酸或寡核苷酸的特定应用和用途。该术语包括合成的核苷酸聚合物以及从天然来源分离和纯化的核苷酸聚合物。术语“多核苷酸”包括了 “寡核苷酸”。术语“多肽”、“肽”或“蛋白质”意指氨基酸的聚合物。该术语涵盖了天然存在的和非天然存在的(合成的)聚合物，和其中一个或多个氨基酸被人工的化学模拟物取代的聚合物。该术语还涵盖了具有与原始序列相同或基本相同的性质，实施相同或基本相同的功能的片段、变体和同源物。该术语涵盖了任意长度的聚合物，优选含有从约2至约1000个氨基酸的聚合物，更优选从约5至约500个氨基酸。该术语包括合成的和从天然来源分离和纯化的氨基酸聚合物。术语“探针”意指(1)寡核苷酸或多核苷酸，不论RNA或DNA，不论天然的存在的， 如在纯化的限制性酶消化物中的或是合成生产的，其能够与具有和探针互补的序列的多核苷酸退火或特异性杂交，或( 化合物或物质，包括肽或多肽，其能够与基本排除其他蛋白质或蛋白质片段的特定蛋白质或蛋白质片段特异性结合。寡核苷酸或多核苷酸探针可以是单链或双链的。探针的实际长度可依赖于多种因素，包括温度、来源和用途。例如，对于诊断性应用，取决于靶序列的复杂程度，寡核苷酸探针通常含有约10-100、15-50或15-25个核苷酸。在一些诊断性应用中，多核苷酸探针含有约100-1000、300-600个核苷酸，优选约 300个核苷酸。本文中，探针选择与特定靶序列的不同链“基本”互补的。这意味着在预定的条件组合下，探针必需足够互补以和它们各自的靶序列特异性的杂交或退火。因此，探针序列不需要反映靶的实际互补序列。例如，可以在探针的5’或3’端附加非互补的核苷酸片段，而剩余的探针序列与靶序列互补。备选的，可以在探针中散布非互补的碱基或较长的序列，只要探针序列与靶多核苷酸的序列具有足够的互补性，以与靶多核苷酸特异性退火。 肽或多肽探针可以是蛋白质或肽特异性结合的任何分子，包括DNA(对于DNA结合蛋白)、抗体、细胞膜受体、肽、辅因子、植物凝聚素、糖类、多糖、细胞、细胞膜、细胞器或细胞器膜。术语“样品”意指含有例如多核苷酸、多肽、抗体、代谢物等的任何动物组织或液体，包括含有DNA和RNA的细胞和其它组织。实例包括脂肪组织、血液、软骨、结缔组织、上皮组织、淋巴、肌肉、神经、唾液等。样品可以是固体或液体，可以是DNA、RNA、cDNA、体液例如血液或尿液、细胞、细胞制品或可溶性级分或其培养基等分试样、染色体、细胞器等。术语“单个包装”意指试剂盒的组分在一个或多个容器中物理的关联或与一个或多个容器物理的关联，并对生产、分配、销售或使用而言被认为是一个单位。容器包括但不限于袋、盒子、瓶子、收缩包装、U型钉或其它方式固定的组分，或其组合。单个包装可以是物理关联的各个食品组合物的容器，使得对生产、分配、销售或使用而言被认为是一个单位。术语“特异性的结合”意指两个分子之间的特异和精确的相互作用，所述相互作用取决于它们的结构，特别是它们的分子侧基。例如，调控蛋白嵌入到DNA分子的大沟中，沿着两条单链核酸之间的骨架的氢键，或在蛋白质的表位和激动剂、拮抗剂或抗体之间的结
I=I ο术语“特异的杂交”意指两条足够互补的序列的单链多核苷酸之间的关联，所述序列允许在本领域通常使用的预定条件下的此类杂交(有时称为“基本互补的”)。例如，该术语可以指多核苷酸探针与包含在根据本发明的一方面的单链DNA或RNA分子中的基本互补的序列的杂交，指基本排除多核苷酸探针与非互补序列的单链多核苷酸的杂交。术语“标准”意指(1)含有来自施用了对照或参照物质的动物，或未施用物质的动物的组织的对照样品，与含有来自施用了测试物质的动物的组织的样品相比，例如，当其使用的环境适当时，为了确定测试物质是否导致差异的基因表达。术语“严格的条件”意指(1)42°C下，在含0. 牛血清白蛋白，0. Ficoll， 0. 1 %聚乙烯吡咯烷酮，50mM磷酸钠缓冲液pH 6. 5的50% (体积/体积)甲酰胺，和750mM NaCl，75mM 柠檬酸钠中杂交，(2) 42°C下，在 50% 甲酰胺，5x SSC(0. 75M NaCl，0. 075M 柠檬酸钠)，50mM磷酸钠缓冲液(pH 6. 8)，0. 1 %焦磷酸钠，5x Denhardt氏溶液，超声化的鲑精 DNA(50y g/ml),0. 1% SDS 和 10% 硫酸葡聚糖；在 0. 2x SSC 和 0. SDS 中 42 °C 下洗涤， 或用0. 015M NaCl, 0. 0015M柠檬酸钠，0. 1 % Na2SO4在50°C下洗涤，或使用相似的低离子强度和高温洗涤试剂和相似的变性试剂的相似程序。术语“变体”意指(1)含有来自核苷酸序列的任何一个或多个核苷酸的取代、变异、修饰、替代、缺失或添加的多核苷酸序列，且所述序列具有与原始序列相同或基本相同的性质，实施相同或基本相同的功能，和( 含有来自多肽序列的任何一个或多个氨基酸的取代、变异、修饰、替代、缺失或添加的多肽序列，且所述序列具有与原始序列相同或基本相同的性质，实施相同或基本相同的功能。因此，该术语包括单核苷酸多态性(SNP)和等位变体，并包括在多肽中的保守的和非保守的氨基酸替代。该术语还涵盖了多核苷酸或多肽的化学衍生物，以及适当时用非天然存在的核苷酸或氨基酸取代核苷酸或氨基酸。术语“虚拟包装”意指试剂盒的组分通过在一个或多个物理的或虚拟的试剂盒组分上的说明相关联，指示用户如何获得其它组分，例如在含有一种组分的袋子中的其他组分，和指示用户前往网站、联系所记录的信息、观看视觉信息或联系看护者或技术指导者以获得对如何使用试剂盒的说明。本文公开的组合、组合物、装置、方法、探针和其它进展不限于本文描述的特定的方法学、规程和试剂，因为如技术人员可理解的，它们是可以变化的。此外，本文使用的术语是仅出于描述特定实施方案的目的，并非意在且并未限制所公开或要求保护的范围。除非另外定义，本文使用的所有的技术和科学术语、领域的术语和首字母缩写具有本发明所属领域或使用术语的领域中的普遍技术人员常规理解的含义。虽然在本发明的实践中可以使用与本文所述的相似或等价的任何组合物、方法、制品或其它手段或材料，但是优选的组合物、方法、制品或其它手段或材料是本文所述的。本文引用或提及的所有专利、专利申请、出版物和其它参考文献都通过引用并入到本文中，达到所管辖法律允许的程度。对上述参考文献的讨论仅意在概括其中提出的主张。并未作出任何此类专利、专利申请、出版物或参考文献，或其任何部分是相关的材料或现有技术的承认。特别保留对此类专利、专利申请、出版物和其他参考文献，是相关的材料或现有技术的任何主张的准确性和相关性质疑的权利。本发明本发明是部分基于这样的清楚论证，即已知促进如本文定义的瘦表型的治疗与经历这些治疗的动物的三种不同组织中的基因表达谱的显著改变相关。通过比较基因在正常组织(即，肌肉、肝脏和脂肪组织)与由一种或多种LP-促进性治疗的结果而表现出瘦表型 (LP)的动物的组织中的表达来确定相关性，所述LP-促进性治疗即(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和/或(3)增加的运动。在一个实施方案中，发现几百种基因作为所有三种治疗(本文中有时称为“三种治疗”)的结果是差异表达的；即，CLA补充、高蛋白质饮食或导致该基因的子集差异表达的增加的运动，其编码的蛋白质列举在本文的表6(实施例3)中。基于不同的准则将表6中提出的蛋白质分组。首先，表6按组织列举蛋白质，代表了在脂肪组织(表6A)、肝脏(表 6B)和肌肉(四头肌)(表6C)中差异表达的基因。表6还列举了代表在所述三种组织类型中的两个或多个中差异表达的基因的蛋白质的子集，S卩(1)脂肪和肝脏(表6D)，(2)脂肪和肌肉(表6E)，(3)肝脏和肌肉(表6F)，和(4)所有三种组织(表6G)。第二，在所编码的蛋白质的功能或生理角色，以及差异表达发生的组织的基础上将蛋白质分组。这些分组提出在表7(脂肪)、表8(肝脏)和表9(肌肉)中。这些功能包括(1)在脂肪组织中，胆固醇生物合成途径、抑制素(statin)途径、脂肪生成、细胞凋亡、细胞运动性、线粒体脂肪酸β氧化、脂肪酸生物合成、脂肪酸代谢、糖酵解、细胞增殖的调控、炎症、免疫和应激应答 (包括1 T-细胞受体子类、1 B-细胞受体、白细胞跨内皮迁移、紧密连接、黏着连接、抗原加工、对未折叠蛋白质的应答、对创伤的应答、对外部刺激的应答、炎症应答、免疫应答、T细胞激活和1 IL-4)、多细胞器官发育和凋亡的调控；( 在肝脏中，PPAR信号传递途径和脂肪酸代谢；和( 在肌肉中，脂类代谢。在另一个实施方案中，简单分析发现高蛋白质饮食治疗导致数千种基因的差异表达。由这些基因编码的蛋白质列举在本文的表10 (实施例4)中。如“三种治疗”子集，基于不同的准则将表10中提出的蛋白质分组。首先，表10按组织列举蛋白质，代表了在脂肪组织(表10A)、肝脏(表10B)和肌肉(四头肌)(表10C)中差异表达的基因。表10还列举了代表在所述三种组织类型中的两个或多个中差异表达的基因的蛋白质的子集，即(1)脂肪和肝脏(表10D)，(2)脂肪和肌肉(表10E)，(3)肝脏和肌肉(表10F)，和(4)所有三种组织(表10G)。第二，在所编码的蛋白质的功能或生理角色，以及差异表达发生的组织的基础上将蛋白质分组。这些分组提出在表11 (脂肪)、表12 (肝脏)和表13 (肌肉)中。这些功能包括(1)在脂肪组织中，免疫应答、炎症应答、对应激的应答、趋化性、对未折叠的蛋白质的应答、防御应答、细胞激活、淋巴细胞激活、运动行为、脂类代谢过程、脂类生物合成过程、类固醇生物合成过程、胆固醇代谢过程、类固醇代谢过程、糖酵解、葡萄糖代谢过程、器官发育、肌肉发育、细胞增殖的正调控、血管发生、血管形态发生、抗凋亡、肌肉收缩、磷酸盐运输、蛋白质复合体装配、钙介导的信号传递、GTP酶活性的调控、蛋白质氨基酸糖基化、细胞形状的调控、褐家鼠(Rattus norvegicus, foi)B细胞受体NetPath 12(约翰霍普金斯大学和生物信息学研究所(www. netpath. org/)) ,Rn T 细胞受体 NetPath ll、RnIL_4NetPath 16, Rn IL-7NetPath 19、1 类花生酸合成、1 胰岛素信号传递、1 胆固醇生物合成、1 脂肪酸合成 BiGCaT (马萨诸塞大学(www. bigcat. unimass. nl/index. html))、Rn Krebs-TCA 循环、1 线粒体脂肪酸β氧化、1 横纹肌收缩、白细胞跨内皮迁移、T细胞受体信号传递途径、紧密连接、B细胞受体信号传递途径、补体和凝血级联、Fc ε RI信号传递途径、Toll样受体信号传递途径、PPAR信号传递途径、类固醇的生物合成、糖酵解/糖异生、花生四烯酸代谢、丙酮酸代谢和核黄素代谢；( 在肝脏中，脂类代谢过程、脂肪酸代谢过程、脂类生物合成过程、脂肪酸生物合成过程、类固醇代谢过程、蛋白水解作用、碳水化合物代谢过程、葡萄糖代谢过程、糖异生、氨基酸代谢过程、胺代谢过程、氮化合物代谢过程、一碳化合物代谢过程、异生素(xenobiotic)代谢过程、钠离子运输、多细胞生物发育、细胞生长的调控、髓鞘形成、通过细胞周期的进展的调控、抗原加工和呈递、Rn脂肪发生、Rn脂肪酸合成BiGCaT、 1 糖酵解和糖异生、脂类代谢和毒性中的1 核受体、1 脂肪酸β氧化IBiGCaTjn脂肪酸 ω氧化BiGCaT、PPAR信号传递途径、细胞色素Ρ450的异生素的代谢、脂肪酸代谢、丙氨酸和天冬氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、丙酮酸代谢、谷氨酸代谢、氮代谢、半胱氨酸代谢和酪氨酸代谢；和C3)在肌肉中，免疫应答、防御应答、炎症应答和1 昼夜节律锻炼(circadian exercise)0 因此，已鉴别多种基因在表现出瘦表型的动物中差异的表达，所述表型是由 LP-促进性治疗导致的，所述治疗包括高蛋白质饮食、施用CLA和/或增加的运动。可以使用形成这些基因的多核苷酸及其片段，以及它们编码的蛋白质和片段，例如用于诊断或预后测定中来测量向瘦表型的变化，或用于筛选测试物质促进或支持瘦表型的有效性的测定。
在一些实施方案中，测量至少一种差异表达的基因。在优选的实施方案中，测量两种或多种差异表达的基因的表达，提供基因表达模式或基因表达谱。更优选的，实施多种差异表达基因的测量，为基因表达模式或谱提供额外的信息。在本发明的多个实施方案中，可以以两种方式之一或两者测量基因表达的改变 (1)通过检测特定基因产生的mRNA来测量转录；和( 通过检测特定转录物产生的蛋白质来测量翻译。可以使用本领域普遍已知用于多核苷酸定量的任何方法，在RNA水平测量减少或增加的表达，所述方法例如，PCR(包括但不限于RT-PCR和qPCR)、RNA酶保护、Northern印迹、微阵列、巨阵列(macroarray)和其它杂交方法。根据本发明待测定或查询的基因通常是mRNA或逆转录mRNA的形式。基因可以克隆和/或扩增的。克隆本身不表现出对群体内的基因代表的偏见。然而，可以优选使用polyA+RNA作为来源，因其可以用较少的加工步骤使用。因此，在一个方面，本发明提供了包括多种多核苷酸或从其表达的蛋白质的组合， 所述多核苷酸是在由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致表现出瘦表型的动物中差异表达的，所述治疗包括⑴施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动，其中多核苷酸选自编码在表6或表10中列举的蛋白质的基因，或其片段。
在一个实施方案中，多核苷酸在每种瘦表型促进性治疗中差异的表达，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动，且多核苷酸选自编码在表6中列举的蛋白质的基因，或其片段。在更特定的实施方案中，多核苷酸选自编码在表6的组织特异性子集中列举的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、 表6F和表6G。在其它实施方案中，多核苷酸在脂肪组织中差异的表达，并编码涉及选自前文详述功能且在表7中提出的蛋白质。在其它实施方案中，多核苷酸在肝脏中差异的表达， 并编码涉及前文详述功能且在表8中提出的蛋白质。在其它实施方案中，多核苷酸在肌肉中差异的表达，并编码涉及脂类代谢且在表9中提出的蛋白质。在另一个实施方案中，多核苷酸在瘦表型促进性治疗中差异的表达，所述治疗包括消耗高蛋白质饮食，且多核苷酸选自编码在表10中列举的蛋白质的基因，或其片段。在更特定的实施方案中，多核苷酸选自编码在表10的组织特异性子集中列举的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF和表10G。在其它实施方案中，多核苷酸在脂肪组织中差异的表达，并编码涉及选自前文详述功能且列举在表11中的蛋白质。在其它实施方案中，多核苷酸在肝脏中差异的表达，并编码涉及选自前文详述功能且列举在表12中的蛋白质。在另一个实施方案中，多核苷酸在肌肉中差异的表达，并编码涉及选自前文详述功能且列举在表13中的蛋白质。在一个实施方案中，组合包括两种或多种多核苷酸或从多核苷酸表达的蛋白质。 优选的，组合包括多种多核苷酸或从多核苷酸表达的蛋白质，如果对特定的组别和用途适当，通常约5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100或更多种多核苷酸或蛋白质，或其片段。当组合包括一个或多个片段时，片段可以是任何大小，其保留了原始多核苷酸或蛋白质的性质和功能，优选是原始的30%、60%或90%的性质和功能。多核苷酸和蛋白质可以来自任何动物，优选犬科和猫科动物，最优选犬科动物。来自不同的动物物种的多核苷酸和蛋白质的同源物可通过标准信息发掘和熟练的技术人员普遍已知的分子学方法获得。例如，基因或蛋白质的名称或功能描述可能录入了若干公众可获得的数据库之一，所述数据库可产生提供关于来自不同物种的基因的信息来源列表， 包括序列信息。一种此类数据库是“蛋白质信息超链接(iHOP)数据库”，其可通过url ihop-net.org在网络上获取。备选地，可以利用已知基因或蛋白质的公众数据库登录号来获取基因或蛋白质的序列信息，并使用序列比较检索搜索其它物种中的同源物或直向同源物。例如，小鼠基因或蛋白质的GenBank登录号可以进入国立健康研究所的国立生物技术信息中心(NCBI)数据库，从而获取所述小鼠基因的DNA或多肽序列。使用同一数据库，可以对小鼠DNA或蛋白质序列或其长度足以定义基因或蛋白质的片段来实施BLAST搜索，以鉴别来自其它物种(例如犬科)的具有足够同源性的序列。然后，来自其它物种的感兴趣的序列的登录号可以进入数据库，获得属于那些全长核苷酸或蛋白质序列的信息，以及其它的描述性信息。在另一个方面，本发明提供了包括两种或多种探针的组合物，用于检测在由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致表现出瘦表型的动物中的差异基因表达，所述治疗包括 ⑴施用CLA，⑵消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动，其中探针包括(a)与编码在表6或表10中列举的蛋白质的两个或多个基因或其片段特异性杂交的多核苷酸，或(b)与两个或多个这样的多肽特异性结合的多肽结合剂，所述多肽选自在表6(在所有三种治疗中差异表达的基因)或表10(在高蛋白质饮食治疗中差异表达的基因)中列举的蛋白质或其片段。在一些实施方案中，探针特异性的杂交编码在表6的组织特异性子集中列举的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G，或者特异性的结合包含在表6的组织特异性子集中列举的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G。在其它实施方案中，探针特异性杂交或特异性结合编码蛋白质的多核苷酸或包含蛋白质的多肽，所述蛋白质具有如表7、表8或表9中列举的一些功能或生物化学作用。在其它实施方案中，探针特异性的杂交编码在表10的组织特异性子集中列举的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF和表 10G，或者特异性的结合包含在表10的组织特异性子集中列举的蛋白质的多肽或其片段， 所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF和表10G。在其它实施方案中， 探针特异性杂交或特异性结合编码蛋白质的多核苷酸或包含蛋白质的多肽，所述蛋白质具有如表11、表12或表13中列举的一些功能或生物化学作用。优选的，组合物包括多种探针，通常约5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、 80、90、100、200、500或更多种探针，用于检测多核苷酸或蛋白质或其片段，如对特定的组别和用途适当时。熟练的技术人员可以理解，为了改进利用探针的测定的灵敏度或准确性，可利用针对单个靶基因或蛋白质的多种不同的探针。例如，可以使用与靶多核苷酸的不同序列特异性杂交的若干寡核苷酸探针。同样的，可以利用对靶蛋白上的不同表位免疫性特异性的若干抗体。可以使用本文列举的任何基因的序列信息制备用于查询样品的一个或多个寡核苷酸或多核苷酸探针，所述基因来自任何物种，优选犬科或猫科动物。探针应该长度足以与合适的互补基因或转录物基本排他性的特异杂交。在一些实施方案中，寡核苷酸探针的长度可以是至少约10、12、14、16、18、20或25个核苷酸。在一些实施方案中，具有至少约30、 40、50、60、70、80、90或100个核苷酸的较长的探针是理想的，长于约100个核苷酸的探针在一些实施方案中可以是合适的。探针可包括编码功能蛋白质的全长序列。核酸探针是使用熟练的技术人员已知的方法制备或获得的，例如从核苷酸体外合成、从天然来源分离和纯化，或酶促切割本发明的多核苷酸。可通过本领域已知的多种方法检测包括与本发明的多核苷酸杂交的核酸探针的杂交复合物。在本发明的一些实施方案中，固定的核酸探针可用于快速且特异性的检测多核苷酸及其表达模式。典型的，核酸探针连接到固相支持体上，靶多核苷酸(例如，基因、转录产物、扩增子或最常见的，扩增混合物)与探针杂交。对探针或靶标或两者都可以进行标记，典型的使用荧光团或其它标签，例如链霉亲和素。在标记了靶标的条件下，可以通过检测结合的荧光来检测杂交。在标记了探针的条件下，典型的通过标记的淬灭来检测杂交。在同时标记探针和靶标的条件下，典型的通过监控由两种结合的标记的接近而导致的色移来实施杂交的检测。本领域已知多种标记策略、标记等，特别是基于荧光的应用。在另一个实施方案中，探针包括多肽结合剂，其通过本文列举的一种或多种多肽的表达产生的多肽或其片段特异性结合。此类蛋白质结合探针可以使用对表6和表10中鉴别的任何蛋白质或其片段的可获得的序列信息来制备。
可用于确定样品中的蛋白质水平的测定技术也是本领域技术人员普遍已知的。此类测定方法包括放射免疫测定、竞争性结合测定、Western印迹分析和ELISA测定。在利用抗体的测定方法中，多克隆和单克隆抗体适合用于本发明中。如本领域技术人员可以理解的，此类抗体可以免疫特异性的针对特定的蛋白质，或蛋白质的表位，或蛋白质片段。生产免疫学特异性的针对蛋白质或肽的多克隆和单克隆抗体的方法也是本领域公知的。本发明的优选的实施方案可利用抗体进行通过本文描述的基因的表达而产生的蛋白质的检测和定量。虽然可以通过免疫沉淀、亲和分离、Western印迹分析等来检测蛋白质，但是优选的方法利用ELISA-型方法，其中抗体固定在固相支持体上，而将靶蛋白或肽暴露给固定化的抗体。对探针或靶标或两者都可以进行标记。本领域已知多种标记策略、 标记等。在另一个方面，本发明提供了包括固相支持体的装置，所述支持体上固定了包含多种探针的阵列，所述探针用于在表现出瘦表型的动物中检测差异基因表达，所述表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动。在本发明的特别优选的实施方案中，利用检测靶多核苷酸或蛋白质的探针的阵列观察多种基因的表达模式或谱，所述基因在相对于如本文定义的正常表型的瘦表型中是差异表达的。装置可用于检测编码这样的基因产物的基因的差异表达，所述基因产物在表6或表10中，或其子集中给出，S卩如表6A-G和表10A-G中列举的组织特异性子集， 或如表7、8和9(三种治疗分析)和表11、12和13 (高蛋白质饮食分析)中给出的功能性子集。在优选的实施方案中，装置用于检测来自犬科或猫科动物的基因的差异表达。在一个实施方案中，可以利用寡核苷酸或多核苷酸探针的阵列，而另一个实施方案可利用抗体或其它蛋白质的阵列，所述抗体或其它蛋白质与差异表达的基因产物特异性结合。此类阵列可根据已知的方法定制，例如在固相支持体上原位合成，或通过显微打印技术将预合成的特征附着到固相支持体上。在优选的实施方案中，定制核酸或蛋白质-结合探针的阵列用于特异性的检测由两个或多个本文描述的差异表达的基因或基因片段产生的转录物或蛋白质。在其它方面，本发明提供了用于在与正常或未治疗的动物相比较，表现出瘦表型的动物中检测一种或多种差异表达的基因的方法，所述表型是由一种或多种瘦表型-促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动。方法通常包括(a)提供探针，包括(i)与两个或多个编码在表6或表10中列举的蛋白质的基因或其片段特异性杂交的多核苷酸；或(ii)与两个或多个选自表6或表10中列举的蛋白质的多肽或其片段特异性结合的多肽结合剂；(b)以使探针能够与样品中的mRNA或蛋白质杂交或结合的方式，将探针添加到包含来自表现出瘦表型的动物的mRNA或蛋白质的样品中， 从而在样品中形成杂交或结合复合物；(c)任选的，以使探针能够与第二种样品中的mRNA 或蛋白质杂交或结合的方式，将探针添加到另一种包含来自正常动物的mRNA或蛋白质的样品中，从而在其它样品中形成杂交或结合复合物；(d)在一种或多种样品中检测杂交复合物；和(e)比较来自第一种样品的杂交或结合复合物和来自标准的或任选来自另一样品的杂交或结合复合物，其中与标准的或任选的另一样品相比，样品中的杂交或结合的量之间的至少一种差异表示与未表现出所述表型的动物相比，在表现出瘦表型的动物中差异表达的一种或多种基因的差异表达。
该方法可用于检测编码基因产物的基因的差异表达，所述基因产物给出在表6或表10中，或其子集中，即如表6A-G和表10A-G中列举的组织特异性子集，或如表7、8和 9(三种治疗分析)和表11、12和13(高蛋白质饮食分析)中给出的功能性子集。在优选的实施方案中，装置用于检测来自犬科或猫科动物的基因的差异表达。在特定的实施方案中， 探针与基质(优选在阵列中)结合。步骤(c)和部分的步骤(d)和(e)是任选的，在如果进行两个或多个测试系统的相对同时的比较时使用。然而，在优选的实施方案中，用于比较的标准是基于使用所述方法之前所获得的数据。将上述探针暴露给样品，形成待检测和与标准进行比较的杂交或结合复合物。在来自样品和标准的杂交或结合复合物之间的差异指出多核苷酸的差异表达，因而指出在相对于样品中的正常表型，在瘦表型中差异表达的基因。在优选的实施方案中，制备探针，以特异性的检测通过本发明鉴别的一个或多个基因或基因片段产生的多核苷酸或其片段。用于检测杂交复合物的方法是熟练的技术人员已知的。在一个实施方案中，方法还包括在实施测定前，将动物或样品暴露给测试物质。然后，比较表示相对于未治疗的动物，测试物质是否在治疗的动物中改变差异表达的基因的表达。本文所述的用于瘦表型-相关性转录和翻译产物检测的测定可用于在动物中鉴别瘦表型或在动物中瘦表型的缺少的方法。此类方法可用于实施、促进或指导体重减轻方案(特别是对于脂肪量的减轻，以及特别对于当保留或改善瘦体质的同时脂肪的减轻)或体能方案，或用于诊断性目的，以鉴别处于肥胖风险或肥胖-相关性健康风险或疾病的动物。此类方法包括从表现出如本文定义的瘦表型的动物或超重或肥胖的动物获得细胞或组织的样品。此类细胞或组织可包括但不限于脂肪、肌肉或肝脏组织。然后，分析细胞或组织样品的一个或多个与瘦表型相关的基因的受调节表达，通过mRNA或蛋白质的检测，或使用如本文所述的基因或蛋白质阵列分析特定的瘦表型-相关基因表达谱。分析的结果可揭示动物是否表现出瘦表型或向瘦表型过渡。方法还可以提供关于动物的体重减轻或体能方案的功效的信息，或监控随时间动物的肥胖或肥胖-相关性健康风险或疾病的相关风险。 在这些情况下，在动物的体重减轻或体能方案期间或一般是生存期间，以一定间隔进行所述方法，其中与瘦表型相关的靶基因的表达或表达模式的改变表示动物的进展、改善或持续的风险。在另一个方面，本发明提供了确定当施用给动物时，测试物质是否可能用于促进瘦表型的方法。该方法典型的包括(a)在缺少测试物质的测试系统中，通过测量两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物来确定第一种基因表达谱，所述多核苷酸选自编码表6或表 10中列举的蛋白质的基因或其片段；(b)在存在测试物质的测试系统中，通过测量两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物来确定第二种基因表达谱，所述多核苷酸选自编码表6或表10中列举的蛋白质的基因或其片段；和(c)比较第一种基因表达谱与第二种基因表达谱，其中与第一种基因表达谱相比，第二种基因表达谱中的改变表示当施用给动物时，测试物质可能用于促进瘦表型。在一些实施方案中，方法还包括在存在参照物质的测试系统中，至少比较第二种基因表达谱与参照或标准基因表达谱，其中所述参照物质当施用给动物时是已知促进瘦表型，所述表达谱是通过测量两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物获得的，所述多核苷酸选自编码表6或表10列出的蛋白质的基因或其片段。此类物质可以是例如CLA。在一个实施方案中，测试系统包括培养细胞的群体。将包含根据本发明的瘦表型-相关性基因的核酸构建体导入培养的宿主细胞内。宿主细胞可以是哺乳动物细胞系， 例如但不限于NIH3T3、CH0、HELA和COS，但是也可以使用非哺乳动物细胞如酵母、细菌和昆虫细胞。基因的编码序列与适合所利用的特定宿主细胞的合适的调控表达元件有效连接。 核酸构建体可以根据本领域的任何可接受的手段导入宿主细胞中，包括但不限于转染、转化、磷酸钙沉淀、电穿孔和脂转染。此类技术是本领域公知且常规的。转化的细胞还可用于鉴别调节瘦表型-相关基因的表达的化合物。可以使用这样的基因构建体进行基因表达测定，所述基因构建体包含与报告基因有效连接的选定的瘦表型-相关基因的启动子。报告子构建体可以导入到合适的培养细胞内，包括但不限于上述标准的宿主细胞系，或从动物新鲜分离的细胞，例如脂肪、肌肉或肝细胞。通过监控报告基因在存在或缺少测试物质(例如，测试化合物)的条件下的表达来实施测定。在优选的实施方案中，测试系统包括动物。典型地，将测试物质施用给动物，分析动物的基因表达谱来确定测试物质对本发明的基因或基因产物的转录或翻译的影响。可以在原位或离体分析基因表达，来确定测试物质的影响。在另一个实施方案中，将测试物质施用给动物，根据本领域的任何合适的手段，原位或离体分析从基因表达的蛋白质的活性，来确定测试物质对目标蛋白质的活性的影响。此外，当测试物质施用给动物时，还可以评估化合物的生理性、系统性和身体性的影响，以及化合物的潜在毒性。可以向动物施用测试物质一段适合测试物质、动物以及目标的时间，包括长期施用、在规律的基础上施用，和在长期的规律的基础上施用。施用可以通过任何合适的途径，包括但不限于口服、直肠、鼻、局部、 皮内、皮下、静脉内、肌内和肠胃外的施用模式。口服施用是优选的，最优选的是作为食品组分口服使用。测试物质可以是对在表现出瘦表型的动物中差异表达的多核苷酸或基因具有影响的任何物质。合适的测试物质包括但不限于氨基酸、蛋白质、肽、多肽、核酸、寡核苷酸、 多核苷酸、小分子、大分子、维生素、矿物质、简单糖类；复杂糖类；多糖；碳水化合物；中链甘油三酯(MCT)；三酰基甘油酯(TAG) ；η-3(ω-3)脂肪酸，包括DHA、EPA、ALA ；η-6(ω-6)脂肪酸，包括LA、γ-亚麻酸(GLA)和ARA ；SA，共轭亚油酸(CLA)；胆碱源例如卵磷脂；脂溶性维生素包括维生素A及其前体，例如类胡萝卜素(例如β-胡萝卜素)、维生素D源例如维生素D2 (麦角钙化留醇)和维生素D3 (胆钙化固醇)、维生素E源例如生育酚(α -生育酚) 和生育三烯酸，以及维生素K源例如维生素Kl (叶绿醌)和维生素Κ2 (甲萘醌)；水溶性维生素，包括B族维生素例如核黄素、烟酸(包括烟酰胺和烟酸)、吡哆醇、泛酸、叶酸、生物素和钴胺素；和维生素C(抗坏血酸)；抗氧化剂，包括上文列举的一些维生素，特别是维生素 E和C ；以及生物黄酮类(bioflavonoid)例如儿茶素、槲皮素和茶黄素；醌类例如泛醌；类胡萝卜素类例如番茄红素和番茄黄质；白藜芦醇；和α -硫辛酸；L-肉碱；D-柠檬油精；葡糖胺；S-腺苷甲硫氨酸和壳聚糖。在优选的实施方案中，测试物质是可以添加到食品中或作为补充剂消耗的营养物。通过前述方法鉴别的物质也可视为本发明的一部分。在其它方面，本发明提供了计算机系统，包含数据库以及使用户能够获取或操作
20数据库中的信息的用户界面，所述数据库含有鉴别一种或多种多核苷酸的表达水平的信息，所述多核苷酸在施用了影响一种或多种的食物摄入、饱食感、脂类代谢和脂肪利用的物质的动物中是差异表达的，其中多核苷酸选自编码在表6或表10中列举的蛋白质的基因或其片段。系统包括含有信息的数据库和与数据库交互的用户界面，特别是输入、操作和审阅关于不同动物或动物类别的信息，所述信息鉴别一种或多种选自编码表6或表10中列举的蛋白质的多核苷酸和/或特异性结合表6或表10中列举的蛋白质的多肽的表达水平。在一个实施方案中，数据库还含有鉴别表6或表10中列举的一种或多种多肽的活性水平的信息。在另一个实施方案中，数据库还包括关于表6或表10中列举的一种或多种多核苷酸或多肽的序列信息，优选来自多种物种。在其它实施方案中，数据库含有属于一种或多种动物物种中的基因描述的额外信息。计算机系统是任何能够包含和操作数据并与用户互动的电子装置，例如典型的计算机或分析性仪器设计为有利于使用本发明和输出与动物状态相关的结果。在另一个方面，本发明提供了试剂盒，包括含有两种或多种探针的集合的容器，所述探针用于检测由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的瘦表型的差异基因表达，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动。当对用途和试剂盒组分适合时，在单个包装中的分离的容器中，或在虚拟包装(virtual package)中的分离的容器中， 试剂盒包含两种或多种用于在表现出瘦表型的动物中检测差异基因表达的探针，所述表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动，其中探针包括(a)与两个或多个编码在表6或表10中列举的蛋白质的基因或其片段特异性杂交的多核苷酸；或(b)与两个或多个选自表6或表10中列举的蛋白质的多肽或其片段特异性结合的多肽结合剂；且还包括至少一种的(1)对如何在基因表达阵列中使用探针，用于在表现出瘦表型的动物中检测差异基因表达的说明，所述表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括施用CLA、消耗高蛋白质饮食和/ 或增加运动，( 试剂和用于使用探针的仪器，和(3)已知诱导瘦表型的组合物。优选的， 探针固定在固相支持体的已知位置上。已知诱导瘦表型的合适的参照物质包括例如CLA。当试剂盒包括虚拟包装时，试剂盒限于在虚拟环境中的说明书与一种或多种物理性试剂盒组分的组合。在一个实施方案中，试剂盒含有探针和/或其它物理组分，关于使用探针和其它组分的说明书可通过英特网获得。试剂盒可以含有其它物品，例如用于混合样品、探针和试剂的装置，以及用于使用试剂盒的装置，例如试管或混合用器皿。在另一个方面，本发明提供了这样的手段，所述手段用于传播关于本文所述的一种或多种组合物和方法的信息，或用于对一种或多种组合物和方法进行说明。此类手段典型的包括含有信息或说明书的文件、数字储存介质、光学储存介质、声音呈示、视觉展示等。 例如，传播手段可以是展示的网站、展示亭、宣传册、产品标签、包装插页、广告、传单、公告录音带、录像带、DVD、CD、计算机可读芯片、计算机可读的卡、计算机可读的盘、计算机内存或其任意的组合。有用的信息包括一种或多种的(1)促进动物的健康和身心健康的方法， 和(2)关于动物看护者的联系信息供使用，如果对本发明及其用途存在问题。有用的说明书包括使用探针的技术，实施基因表达测定的说明，和物质的施用量与频率。传播手段可用于说明使用本发明的益处。实施例
通过下列实施例可以进一步示例本发明的各个方面。可以理解这些实施例仅出于示例的目的而提供，并不限制本文公开的本发明的范围，除非另外特别的指出。实施例1本实施例提出的实验结果证实动物可以三种方式经诱导转变为瘦表型(1)用 CLA进行膳食补充，⑵高蛋白质饮食，和(3)增加的运动。材料和方法允许四周龄雄性Sprague Dawley大鼠用对照饮食适应两周，所述饮食包括 AIN-93M(美国营养研究所的用于成熟啮齿类维持的纯化饮食配方)。将大鼠分为12只一组共四组。组1用补充了 CLA的对照饮食喂养(表1)。组2用增加了蛋白质并降低了碳水化合物的修饰的饮食喂养(表1)。组3用对照饮食喂养，并给予参与补充运动的机会。特别的，在组3的每只大鼠的笼子中放置跑步轮，并通过使用与计算机连接的传感器记录轮子的每次旋转，来监控轮子的每日使用。组4用对照饮食喂养(表1)。对照和测试饮食的能量含量显示在表2中。表1 对照和测试饮食的组成
修饰的 AIN-93M( 对照)(g/kg饮食)高蛋白质饮食 (g/kg饮食)3%CLA 饮食 (g/kg饮食)酪蛋白(大于200500200
权利要求
1.包含多种多核苷酸的组合，所述多核苷酸在由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的表现出瘦表型的动物中差异表达，所述治疗包括(1)施用共轭亚油酸(CLA)，(2)消耗高蛋白质饮食，和⑶增加运动，其中所述多核苷酸选自编码在表6或表10中列出的蛋白质的基因，或其片段。
2.权利要求1的组合，其中所述多核苷酸在每种瘦表型促进性治疗中差异表达，所述治疗包括⑴施用CLA，⑵消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动，并且所述多核苷酸选自编码在表6中列出的蛋白质的基因，或其片段。
3.权利要求2的组合，其中所述多核苷酸选自编码在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G。
4.权利要求2的组合，其中所述多核苷酸在脂肪组织中差异表达，并编码涉及这样的功能的蛋白质，所述功能选自胆固醇生物合成途径、抑制素途径、脂肪生成、凋亡、细胞运动性、线粒体脂肪酸β氧化、脂肪酸生物合成、脂肪酸代谢、糖酵解、细胞增殖的调控、炎症、 免疫和应激应答、多细胞生物的发育和凋亡的调控。
5.权利要求2的组合，其中所述多核苷酸在肝脏中差异表达，并编码涉及这样的功能的蛋白质，所述功能选自PPAR信号途径和脂肪酸代谢。
6.权利要求2的组合，其中所述多核苷酸在肌肉中差异的表达，并编码涉及脂类代谢的蛋白质。
7.权利要求1的组合，其中所述多核苷酸在瘦表型促进性治疗中差异的表达，所述治疗包括消耗高蛋白质饮食，且所述多核苷酸选自编码在表10中列出的蛋白质的基因或其片段。
8.权利要求7的组合，其中所述多核苷酸选自编码在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表10Α、表10Β、表10C、表10D、表10Ε、表IOF和表 10G。
9.权利要求7的组合，其中所述多核苷酸在脂肪组织中差异的表达，并编码涉及这样的功能的蛋白质，所述功能选自免疫应答、炎症应答、对应激的应答、趋化性、对解折叠蛋白质的应答、防御应答、细胞激活、淋巴细胞激活、运动行为、脂类代谢过程、脂类生物合成过程、类固醇生物合成过程、胆固醇代谢过程、类固醇代谢过程、糖酵解、葡萄糖代谢过程、器官发育、肌肉发育、细胞增殖的正调控、血管发生、血管形态发生、抗凋亡、肌肉收缩、磷酸盐运输、蛋白质复合体装配、钙介导的信号传递、GTP酶活性的调控、蛋白质氨基酸糖基化、细胞形状的调控、褐家鼠(Rattus norvegicus，Ι η)Β细胞受体NetPath 12, Rn T细胞受体 NetPath IURn IL_4NetPath 16,Rn IL_7NetPath 19、Rn 类花生酸合成、Rn 胰岛素信号传递、1 胆固醇生物合成、1 脂肪酸合成BiGCaT、foi Krebs-TCA循环、1 线粒体脂肪酸β氧化、Rn横纹肌收缩、白细胞跨内皮迁移、T细胞受体信号途径、紧密连接、B细胞受体信号途径、补体和凝血级联、Fc ε RI信号途径、Toll样受体信号途径、PPAR信号途径、类固醇的生物合成、糖酵解/糖异生、花生四烯酸代谢、丙酮酸代谢和核黄素代谢。
10.权利要求7的组合，其中所述多核苷酸在肝脏中差异的表达，并编码涉及这样的功能的蛋白质，所述功能选自脂类代谢过程、脂肪酸代谢过程、脂类生物合成过程、脂肪酸生物合成过程、类固醇代谢过程、蛋白水解作用、碳水化合物代谢过程、葡萄糖代谢过程、糖异生、氨基酸代谢过程、胺代谢过程、氮化合物代谢过程、一碳化合物代谢过程、异生素代谢过程、钠离子运输、多细胞生物发育、细胞生长的调控、髓鞘形成、通过细胞周期的进展的调控、抗原加工和呈递、1 脂肪生成、to脂肪酸合成BiGCaT、foi糖酵解和糖异生、脂类代谢和毒性中的1 核受体、Rn脂肪酸β氧化IBiGCaT、Rn脂肪酸ω氧化BiGCaT、PPAR信号途径、细胞色素P450的异生素的代谢、脂肪酸代谢、丙氨酸和天冬氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、丙酮酸代谢、谷氨酸代谢、氮代谢、半胱氨酸代谢和酪氨酸代谢。
11.权利要求7的组合，其中所述多核苷酸在肌肉中差异的表达，并编码涉及这样的功能的蛋白质，所述功能选自免疫应答、防御应答、炎症应答和1 昼夜节律运动。
12.权利要求1的组合，其中所述瘦表型-促进治疗施用至少1周。
13.权利要求1的组合，其中所述瘦表型-促进治疗施用至少4周。
14.权利要求1的组合，其中所述瘦表型-促进治疗施用至少8周。
15.权利要求1的组合，其中所述多核苷酸是犬科的或猫科的多核苷酸。
16.组合物，其包含两种或多种用于在表现出瘦表型的动物中检测差异基因表达的探针，所述瘦表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2) 消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动，其中所述探针包含a)与编码在表6或表10中列出的蛋白质的两种或多种基因或其片段特异性杂交的多核苷酸；或b)与表6或表10中列出的两种或多种蛋白质或其片段特异性结合的多肽结合剂。
17.权利要求16的组合物，其中所述多肽结合剂是抗体。
18.权利要求16的组合物，其中所述探针与编码在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段特异性杂交，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表 6G，或者特异性结合包含在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G。
19.权利要求16的组合物，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表7、表8或表9中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
20.权利要求16的组合物，其中所述探针特异性杂交编码在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF 和表10G，或者特异性结合包含在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF和表10G。
21.权利要求16的组合物，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表11、表12 或表13中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
22.权利要求16的组合物，其中所述探针特异性的杂交或结合犬科或猫科的多核苷酸或多肽。
23.包括固相支持体的装置，所述固相支持体上固定了包含多种探针的阵列，所述探针用于检测在表现出瘦表型的动物中差异基因表达，所述瘦表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和(3)增加运动，其中所述探针包括a)与编码在表6或表10中列出的蛋白质的两种或多种基因或其片段特异性杂交的多核苷酸；或b)与表6或表10中列出的两种或多种蛋白质或其片段特异性结合的多肽结合剂。
24.权利要求23的装置，其中所述多肽结合剂是抗体。
25.权利要求23的装置，其中所述探针特异性的杂交编码在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G， 或者特异性的结合包含在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G。
26.权利要求23的装置，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表7、表8或表 9中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
27.权利要求23的装置，其中所述探针特异性的杂交编码在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF 和表10G，或者特异性的结合包含在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF和表10G。
28.权利要求23的装置，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表11、表12或表13中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
29.用于在与正常动物相比较，表现出瘦表型的动物中检测差异表达的一种或多种基因的差异表达的方法，所述瘦表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动，所述方法包括a)提供探针，其包含(i)与两种或多种编码在表6或表10中列出的蛋白质的基因或其片段特异性杂交的多核苷酸；或(ii)与两种或多种选自表6或表10中列出的蛋白质的多肽或其片段特异性结合的多肽结合剂；b)以使得探针能够与样品中的mRNA或蛋白质杂交或结合的方式，将探针添加到包含来自表现出瘦表型的动物的mRNA或蛋白质的样品中，从而在样品中形成杂交或结合复合物；c)任选地，以使探针能够与另一种样品中的mRNA或蛋白质杂交或结合的方式，将探针添加到该第二种包含来自正常动物的mRNA或蛋白质的样品中，从而在该第二种样品中形成杂交或结合复合物；d)检测所述一种或多种样品中的杂交复合物；和e)比较来自第一种样品的杂交或结合复合物和来自标准品的或任选来自所述第二种样品的杂交或结合复合物，其中与标准品的或任选的第二种样品相比，样品中的杂交或结合的量之间的至少一种差异表示在表现出瘦表型的动物中差异表达的一种或多种基因的差异表达。
30.权利要求四的方法，其中所述探针特异性的杂交编码在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G， 或者特异性的结合包含在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G。
31.权利要求四的方法，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表7、表8或表 9中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
32.权利要求四的方法，其中所述探针特异性的杂交编码在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF 和表10G，或者特异性的结合包含在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF和表10G。
33.权利要求四的方法，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表11、表12或表13中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
34.权利要求四的方法，其中所述探针特异性杂交或结合犬科或猫科动物的多核苷酸或多肽。
35.权利要求四的方法，其中所述探针与基质结合。
36.权利要求35的方法，其中探针处于阵列中。
37.权利要求四的方法，其中所述检测是不时实施的，并且当试图促进动物中的瘦表型时，用于监控动物的进展。
38.确定当施用于动物时测试物质是否可能用于促进瘦表型的方法，该方法包括a)在缺少测试物质的测试系统中，通过测量两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物来确定第一种基因表达谱，所述多核苷酸选自编码表6或表10中列出的蛋白质的基因或其片段；b)在存在测试物质的测试系统中，通过测量两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物来确定第二种基因表达谱，所述多核苷酸选自编码表6或表10中列出的蛋白质的基因或其片段；和c)比较第一种基因表达谱与第二种基因表达谱，其中与第一种基因表达谱相比，第二种基因表达谱中的改变表示当施用给动物时，测试物质可能用于促进瘦表型。
39.权利要求38的方法，还包括比较至少第二种基因表达谱与参考基因表达谱，所述参考基因表达谱是在存在已知当施用给动物时促进瘦表型的参考物质的测试系统中，通过测量选自编码表6或表10列出的蛋白质的基因或其片段的两种或多种多核苷酸的转录或翻译产物获得的。
40.权利要求38的方法，其中所述测试系统包含培养细胞的群体。
41.权利要求38的方法，其中所述测试系统包括动物。
42.权利要求38的方法，其中所述探针特异性的杂交编码在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G， 或者特异性的结合包含在表6的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表6A、表6B、表6C、表6D、表6E、表6F和表6G。
43.权利要求38的方法，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表7、表8或表 9中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
44.权利要求38的方法，其中所述探针特异性的杂交编码在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的基因或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF 和表10G，或者特异性的结合包含在表10的组织特异性子集中列出的蛋白质的多肽或其片段，所述子集选自表10A、表10B、表10C、表10D、表10E、表IOF和表10G。
45.权利要求38的方法，其中所述探针特异性杂交或特异性结合编码在表11、表12或表13中列出的蛋白质的多核苷酸或包含所述蛋白质的多肽。
46.权利要求38的方法，其中所述探针与基质结合。
47.权利要求46的方法，其中所述探针处于阵列中。
48.权利要求38的方法，其中所述样品含有来自犬科或猫科动物的mRNA或蛋白质。
49.通过权利要求38的方法鉴别的物质，其当施用给动物时，可能促进瘦表型。
50.计算机系统，其包含数据库以及使用户能够获取或操作数据库中的信息的用户界面，所述数据库含有鉴别在表现出瘦表型的动物中是差异表达的一种或多种多核苷酸的表达水平的信息，所述表型由一种或多种瘦表型促进性治疗导致，所述治疗包括(1)施用 CLA, (2)消耗高蛋白质饮食，和C3)增加运动，其中所述多核苷酸选自编码在表6-13的任一个中列出的蛋白质的基因或其片段。
51.试剂盒，其在单个包装中的分离的容器中，或在虚拟包装中分离的容器中，包含两种或多种用于检测在表现出瘦表型的动物中差异基因表达的探针，所述瘦表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和(3) 增加运动，其中所述探针包括(a)与编码在表6-13的任一个中列出的蛋白质的两种或多种基因特异性杂交的多核苷酸或其片段；或(b)与两种或多种选自表6-13的任一个中列出的蛋白质的多肽或其片段特异性结合的多肽结合剂；其中试剂盒还包含至少一种的(1) 对如何在基因表达阵列中使用探针，用于在表现出瘦表型的动物中检测差异基因表达的说明，所述表型是由一种或多种瘦表型促进性治疗导致的，所述治疗包括(1)施用CLA，(2)消耗高蛋白质饮食，和( 增加运动，( 用于使用探针的试剂和仪器，和(3)已知当规律的摄食时诱导瘦表型的组合物。
52.权利要求51的试剂盒，其中所述探针固定在固相支持体的已知位置上。
53.权利要求51的试剂盒，其中所述多肽结合剂是抗体。
54.权利要求51的试剂盒，其中已知诱导瘦表型的物质是CLA。
55.用于传播以下信息或对一种或多种以下内容进行说明的手段，所述信息或内容是 (1)使用编码在表6-13的任一个中列出的蛋白质的多核苷酸，或由其编码的蛋白质，或其片段，用于检测在表现出瘦表型的动物中差异表达的基因的表达；( 使用编码在表6-13 的任一个中列出的蛋白质的多核苷酸，或由其编码的蛋白质，或其片段，用于测量测试物质对在表现出瘦表型的动物中差异表达的基因的表达的影响；C3)使用编码在表6-13的任一个中列出的蛋白质的多核苷酸，或由其编码的蛋白质，或其片段，用于筛选测试物质，来确定它是否可能调节在表现出瘦表型的动物中差异表达的基因的表达；(4)使用编码在表 6-13的任一个中列出的蛋白质的多核苷酸，或由其编码的蛋白质，或其片段，用于调节在表现出瘦表型的动物中差异表达的一种或多种基因的表达；( 使用包含数据库的计算机系统，所述数据库含有鉴别一种或多种多核苷酸的表达水平的信息，所述多核苷酸在表现出瘦表型的动物中是差异表达的，其中所述多核苷酸选自编码在表6-13的任一个中列出的蛋白质的基因或其片段；和(6)施用通过其导致一种或多种基因差异表达的能力而鉴别的物质，所述基因编码在表6-13的任一个中列出的蛋白质，当所述物质施用给动物时可能用于促进瘦表型；其中所述手段包括一种或多种含有所述信息或说明的文件、数据储存介质、 光学储存介质、声音呈示或视觉展示。
56.权利要求55的手段，选自展示的网站、报摊、宣传册、产品标签、包装插页、广告、传单、公告录音带、录像带、DVD、CD、计算机可读芯片、计算机可读的卡、计算机可读的盘、计算机内存或其组合。
全文摘要
本发明公开了与改善或维持瘦体质或与降低的体脂相关的基因表达谱。基因表达谱是在经历了瘦身促进方案的动物的脂肪、肝脏和肌肉组织中确定的，所述方案为例如消耗高蛋白质饮食、摄入共轭亚油酸，和/或增加运动。还公开了使用此类表达谱鉴别药物物质、营养食品物质、膳食物质或治疗方案的方法，所述物质或方案调节或促进动物中的理想表型。
文档编号C07H21/02GK102197145SQ200980142152
公开日2011年9月21日 申请日期2009年8月10日 优先权日2008年8月28日
发明者R·米德尔顿, S·汉娜, Y·潘 申请人:雀巢产品技术援助有限公司