本发明涉及一种多重pcr同时检测美彩按蚊、多斑按蚊、乌头按蚊的试剂盒。
背景技术:
按蚊(anopheles)属昆虫纲双翅目蚊科按蚊属,已知约450种及亚种,分为6个亚属,呈世界性分布,主要分布在热带地区。按蚊雌虫吸取人、畜的血,可传播疟原虫、丝虫病等疾病,根据世界卫生组织的报告,2016年全球发生2.16亿例疟疾,44.5万人死于疟疾,受到淋巴丝虫病威胁的人数高达8.93亿,约4000万人被疾病毁容和丧失劳动力。
随着自然条件的变化和国际交通、贸易、旅游业的发展,蚊虫及其携带的病原体可借助交通工具、集装箱、货物、邮件等在国际间传播,使原本局限在一定范围内的虫媒传染病突破国境或自然地理的界限,在全球范围内广泛传播与流行,对输入国的卫生安全造成极大的威胁。因此,蚊类及其传播疾病的监测,对保障口岸地区的卫生安全,预防和控制虫媒传染病传入、传出具有重要意义。
现阶段对按蚊的鉴定,主要依靠形态学鉴定,其结果准确性难以保证,且对于残缺样本和非成虫期的样本,形态学无法鉴定;分子标记的方法耗时长成本高,对人员和设备的要求也较高。多重pcr技术是在一个反应体系中同时扩增多个目标序列,具有用时短、操作简单、准确性高和特异性强的优点。因此,迫切需要建立一种能快速准确鉴定美彩按蚊、多斑按蚊和乌头按蚊的多重pcr检测试剂盒。
技术实现要素:
本发明的目的在于克服现有技术存在的缺点和不足,提供一种用于鉴定美彩按蚊、多斑按蚊和乌头按蚊多重pcr检测试剂盒及制备方法,具有较高的特异性和敏感性,可在较短时间内测出结果,无需测序,大大节约成本。
本发明提供了美彩按蚊、多斑按蚊、乌头按蚊的特异性引物序列,具体如下:
1)美彩按蚊:扩增目的片段66bp
f3:5’-atcctgttcctgctccat-3’(seqidno.5)
r3:5’-cttcctccctcattaactttac-3’(seqidno.6)
2)多斑按蚊:扩增目的片段135bp
f7:5’-agaggaggatataccgttca-3’(seqidno.13)
r7:5’-aggagcaccagatatagca-3’(seqidno.14)
3)乌头按蚊:扩增目的片段299bp
f13:5’-catgtgcaataccagaagaa-3’(seqidno.25)
r13:5’-agaattaggtcatccaggag-3’(seqidno.26)
本发明还提供了一种用于鉴定美彩按蚊、多斑按蚊和乌头按蚊多重pcr检测试剂盒,该试剂盒包括上述3对引物、10×buffer、dntps、mgcl2、taq酶、模板dna、无菌双蒸水。
该试剂盒的使用步骤如下:
1)配置pcr反应液:50μl所述反应液包含5μl10×buffer、3μldntps,3μlmgcl2,1μltaq酶,6条引物各1μl(浓度为50pmol/μl),2μl模板dna,无菌双蒸水补足体积至50μl。
2)多重pcr反应条件:94℃预变性5min;94℃30s,58℃30s,72℃45s,进行35个循环;最后72℃终延伸10min。
3)pcr扩增产物的鉴定:取pcr扩增产物10μl,置于qiaxceladvanced毛细管电泳仪中进行电泳,选定alignmentmarker为15bp/600bp,sizemarker为25bp-500bp(25bp、50bp、75bp、100bp、150bp、200bp、250bp、300bp、400bp、500bp),电泳后可见多重pcr检测美彩按蚊出现66bp的特异性条带,多斑按蚊出现135bp特异性条带,乌头按蚊出现299bp特异性条带,且无其它杂带。
特异性试验:采用该试剂盒对多种样本进行检测,结果如图1,电泳后可见多重pcr检测美彩按蚊出现64bp的特异性条带,多斑按蚊出现135bp特异性条带,乌头按蚊出现299bp特异性条带,且无其它杂带;带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊、克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊及无菌双蒸水结果均为阴性,这表明该方法具有良好的特异性。
多重pcr敏感性试验:用紫外分光光度计对蚊虫dna进行定量,调整浓度为10ng/μl,再按10倍梯度稀释至10-6ng/μl,共计8个浓度,确定其检测下限为10-4ng/μl,这表明该方法具有良好的敏感性(图2)。
本发明对样本适用范围广,适合日常蚊媒监测中各种方式捕获的蚊种,对标本的完整性没有要求,同时可对非成虫阶段样本进行鉴定。试剂盒提供的试剂,无感染性,无生物安全隐患成分,使用安全性很高。
本发明的多重pcr检测试剂盒,可在收到dna样品后的3小时内给出定性检测结果,节约成本和时间,对人员设备要求低,是一种检测美彩按蚊、多斑按蚊和乌头按蚊的有效工具。
本发明和已有技术相比,其优势是明显的,本发明可在同一反应体系内同时检测是否被测样本是否为美彩按蚊、多斑按蚊或乌头按蚊,具有较高的特异性和敏感性,可在短时间内测出结果,无需测序,高效便捷的同时能够节约成本。
附图说明
图1是多重pcr特异性检测试验结果,m为dnamarker,1-2为美彩按蚊多重pcr产物,3-4为多斑按蚊多重pcr产物,5-6为乌头按蚊多重pcr产物,7-8为带足按蚊多重pcr产物,9-10为雷氏按蚊多重pcr产物,11-12为须喙按蚊多重pcr产物,13-14为克劳按蚊多重pcr产物,15-16为迷糊按蚊多重pcr产物,17-18为棋斑按蚊多重pcr产物,19-20为无菌双蒸水。
图2是多重pcr敏感性试验结果,m为dnamarker,1-8为浓度为10ng/μl、1ng/μl、10-1ng/μl、10-2ng/μl、10-3ng/μl、10-4ng/μl、10-5ng/μl、10-6ng/μl的美彩按蚊多重pcr检测结果;9-16为浓度为10ng/μl、1ng/μl、10-1ng/μl、10-2ng/μl、10-3ng/μl、10-4ng/μl、10-5ng/μl、10-6ng/μl的多斑按蚊多重pcr检测结果;17-24为浓度为10ng/μl、1ng/μl、10-1ng/μl、10-2ng/μl、10-3ng/μl、10-4ng/μl、10-5ng/μl、10-6ng/μl的乌头按蚊多重pcr检测结果。
图3是美彩按蚊引物筛选试验结果,m为dnamarker,1、3、5、7、9、11分别为第1-6组引物的pcr检测结果,模板为1ng/μl美彩按蚊模板dna,2、4、6、8、10、12分别为第1-6组引物的阴性对照,模板为无菌双蒸水。结果显示5所在的第3组引物pcr产生的条带清晰,约64bp,无其余杂带。
图4是多斑按蚊引物筛选试验结果,m为dnamarker,1、3、5、7、9、11分别为第7-12组引物的pcr检测结果,模板为1ng/μl多斑按蚊模板dna,2、4、6、8、10、12分别为第7-12组引物的阴性对照,模板为无菌双蒸水。结果显示1所在的第7组引物pcr产生的条带清晰,约135bp,无其余杂带。
图5是乌头按蚊引物筛选试验结果,m为dnamarker,1、3、5、7、9、11分别为第13-18组引物的pcr检测结果,模板为1ng/μl乌头按蚊模板dna,2、4、6、8、10、12分别为第13-18组引物的阴性对照,模板为无菌双蒸水。结果显示1所在的第13组引物pcr产生的条带清晰,约299bp,无其余杂带。
具体实施方式
实施例
一、美彩按蚊引物筛选试验,依据美彩按蚊基因保守序列(基因登录号mk685253.1),设计了6组引物(编号为第1-6组):
第1组:
f1:5’-tcctgttcctgctccatt-3’(seqidno.1)
r1:5’-gcttcctccctcattaactt-3’(seqidno.2)
第2组:
f2:5’-cctgttcctgctccattt-3’(seqidno.3)
r2:5’-tgcttcctccctcattaac-3’(seqidno.4)
第3组:
f3:5’-atcctgttcctgctccat-3’(seqidno.5)
r3:5’-cttcctccctcattaactttac-3’(seqidno.6)
第4组:
f4:5’-ctcccgcatgagcaattc-3’(seqidno.7)
r4:5’-aatggagcaggaacaggat-3’(seqidno.8)
第5组
f5:5’-cctggatggcctaattcag-3’(seqidno.9)
r5:5’-cttgagctggaatagtaggaa-3’(seqidno.10)
第6组:
f6:5’-ctcctggatggcctaattc-3’(seqidno.11)
r6:5’-tgagctggaatagtaggaac-3’(seqidno.12)
引物筛选所用pcr反应液按照下列成分配置:50μl所述反应液包含5μl10×buffer、3μldntps,3μlmgcl2,1μltaq酶,上下游引物各1μl(浓度为50pmol/μl),2μl模板dna,无菌双蒸水补足体积至50μl。
pcr反应条件如下:94℃预变性5min;94℃30s,58℃30s,72℃45s,进行35个循环;最后72℃终延伸10min。
图3为美彩按蚊引物筛选试验,m为dnamarker,1、3、5、7、9、11分别为第1-6组引物的pcr检测结果,模板为1ng/μl美彩按蚊模板dna,2、4、6、8、10、12分别为第1-6组引物的阴性对照,模板为无菌双蒸水,结果显示5所在的第3组引物pcr产生的条带清晰,约64bp,无其余杂带。
二、多斑按蚊引物筛选试验,依据多斑按蚊基因保守序列(基因登录号mk685255.1),设计了6组引物(编号为第7-12组):
第7组:
f7:5’-agaggaggatataccgttca-3’(seqidno.13)
r7:5’-aggagcaccagatatagca-3’(seqidno.14)
第8组:
f8:5’-aagaggaggatataccgttca-3’(seqidno.15)
r8:5’-ggagcaccagatatagcatt-3’(seqidno.16)
第9组:
f9:5’-ggaggatataccgttcaac-3’(seqidno.17)
r9:5’-attaggagcaccagatatag-3’(seqidno.18)
第10组:
f10:5’-aaagaggaggatataccgttc-3’(seqidno.19)
r10:5’-gagcaccagatatagcatttc-3’(seqidno.20)
第11组:
f11:5’-aagtaattcctggtgatcgt-3’(seqidno.21)
r11:5’-cttctggaattgctcatgc-3’(seqidno.22)
第12组:
f12:5’-aagaaagaggaggatataccg-3’(seqidno.23)
r12:5’-caccagatatagcatttcctc-3’(seqidno.24)
引物筛选所用pcr反应液按照下列成分配置:50μl所述反应液包含5μl10×buffer、3μldntps,3μlmgcl2,1μltaq酶,上下游引物各1μl(浓度为50pmol/μl),2μl模板dna,无菌双蒸水补足体积至50μl。
pcr反应条件如下:94℃预变性5min;94℃30s,58℃30s,72℃45s,进行35个循环;最后72℃终延伸10min。
图4为多斑按蚊引物筛选试验,m为dnamarker,1、3、5、7、9、11分别为第7-12组引物的pcr检测结果,模板为1ng/μl多斑按蚊模板dna,2、4、6、8、10、12分别为第7-12组引物的阴性对照,模板为无菌双蒸水,结果显示1所在的第7组引物pcr产生的条带清晰,约135bp,无其余杂带。
三、乌头按蚊引物筛选试验,依据乌头按蚊基因保守序列(基因登录号mk685256.1),设计了6组引物(编号为第13-18组):
第13组:
f13:5’-catgtgcaataccagaagaa-3’(seqidno.25)
r13:5’-agaattaggtcatccaggag-3’(seqidno.26)
第14组:
f14:5’-caataccagaagaaagaggag-3’(seqidno.27)
r14:5’-tcgtgcagaattaggtcat-3’(seqidno.28)
第15组:
f15:5’-ccagcatgtgcaatacca-3’(seqidno.29)
r15:5’-ttaggtcatccaggagctt-3’(seqidno.30)
第16组:
f16:5’-ccagaagaaagaggagggta-3’(seqidno.31)
r16:5’-cttattcgtgcagaattaggtc-3’(seqidno.32)
第17组:
f17:5’-tgtgcaataccagaagaaag-3’(seqidno.33)
r17:5’-gcagaattaggtcatccag-3’(seqidno.34)
第18组:
f18:5’-gcaataccagaagaaagagga-3’(seqidno.35)
r18:5’-cgtgcagaattaggtcatcc-3’(seqidno.36)
引物筛选所用pcr反应液按照下列成分配置:50μl所述反应液包含5μl10×buffer、3μldntps,3μlmgcl2,1μltaq酶,上下游引物各1μl(浓度为50pmol/μl),2μl模板dna,无菌双蒸水补足体积至50μl。
pcr反应条件如下:94℃预变性5min;94℃30s,58℃30s,72℃45s,进行35个循环;最后72℃终延伸10min。
图5为乌头按蚊引物筛选试验,m为dnamarker,1、3、5、7、9、11分别为第13-18组引物的pcr检测结果,模板为1ng/μl乌头按蚊模板dna,2、4、6、8、10、12分别为第13-18组引物的阴性对照,模板为无菌双蒸水,结果显示1所在的第13组引物pcr产生的条带清晰,约299bp,无其余杂带。
sequencelisting
<110>江苏省检验检疫科学技术研究院
南京中医药大学
江苏国际旅行卫生保健中心(南京海关口岸门诊部)
<120>一种美彩按蚊、多斑按蚊和乌头按蚊多重pcr检测试剂盒
<130>
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