蛋白激酶抑制剂的制作方法_3

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方案涉及根据以下方案12从酰胺合成获得硫代酰胺:
[0363]
[0364] 其中R2和R3如上所定义。
[0365] 优选,该方法包含至少一个以下步骤:
[0366]w)用劳氏试剂(LR)处理起始酰胺基-胺衍生物,以形成其硫代酰胺衍生物,
[0367]X)与各种羧基试剂的偶联反应。
[0368] 本领域技术人员自然能够应用所有其它已知的合成技术来获得硫代酰胺基-酰 胺的最终衍生物,然而所述方法优选包含步骤w)和x)。
[0369] 另一个实施方案涉及合成根据以下方案获得的酸衍生物(化合物D)的方法: [03701
[0371] 其中R2、R3、X如上所定义。
[0372] 该方法包含至少以下阶段:
[0373]y)甲基酯化合物C的皂化反应获得羧酸衍生物,即化合物D。
[0374] 另一个实施方案涉及合成根据以下方案获得的化合物E的方法:
[0375]
[0376]方案 14
[0377] 其中R2、R3、R4、R5和X如上所定义。
[0378] 有利地,该方法包含至少以下步骤:
[0379]z)在碱如二异丙基乙基胺(DIEA)的存在下,使用碳化二亚胺如二环碳化二亚 胺(DCC)或N-(3-二甲氨基丙基)-N' -乙基碳化二亚胺(EDCI),包含至少一种活化剂如 2_ (7-氮杂-1H-苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸盐(HATU)或1-羟基苯 并三唑(H0BT)的偶联反应,优选HOBT、EDCI和DIEA。
[0380] 本领域技术人员自然能够应用所有其它已知的合成技术来获得化合物E,然而所 述方法优选包含步骤z)。
[0381] 另一个实施方案涉及合成根据以下方案获得的化合物F的方法:
[0382]
[0383]方案15
[0384] 其中R1为烷基或如上定义的_NR4R5,且R3如上所定义。
[0385] 优选,该方法包含至少一个以下步骤:
[0386]aa) 3-氰基-苯甲酸和胺衍生物的肽偶联反应,
[0387] bb)将得到的腈还原为对应的醛,
[0388]cc)使用5-氨基-1H-吡咯并[2, 3-b]吡啶-2-取代衍生物的关键醛化合物的还 原胺化。
[0389] 另一个实施方案涉及合成根据以下方案获得的化合物G的方法:
[0390]
[0391_ _____
[0392] 其中R3如上所定义,且Y是0或S。
[0393] 优选地,该方法包含至少一个以下步骤:
[0394]dd)使用3-氨甲基_苯甲酸甲酯和羧酸的肽偶联反应,
[0395]ee)关键中间体酰胺化合物与劳氏试剂的反应,
[0396]ff)得到的酯的皂化反应,得到对应的羧酸,
[0397] gg)使用关键羧酸化合物和5-氨基-1H-吡咯并[2, 3-b]吡啶-2-羧酸甲酯的肽 偶联反应。
[0398] 用涂
[0399] 本发明还涉及根据本发明的化合物作为蛋白激酶抑制剂的用途。取决于癌症类 型,可对准一种或数种激酶蛋白质。
[0400] 在一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶BRAF的抑制剂。
[0401] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶EGFR(ErbBl)的抑制 剂。
[0402] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶EGFR(ErbB1)T790M L858R的抑制剂。
[0403] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FGFR2的抑制剂。
[0404] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶KDR(VEGFR2)的抑制 剂。
[0405] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶H)GFRA(PDGFR a)的抑 制剂。
[0406] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶SRC的抑制剂。
[0407] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ABL的抑制剂。
[0408] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ABLT3151的抑制剂。
[0409] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FGFR1的抑制剂。
[0410] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶VEGFR1的抑制剂。
[0411] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶H)GFRB(PDGFR0)的抑 制剂。
[0412] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ABLE255K的抑制剂。
[0413] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ABLG250E的抑制剂。
[0414] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ABLY253F的抑制剂。
[0415] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ABL2的抑制剂。
[0416] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶BLK的抑制剂。
[0417] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶BMX的抑制剂。
[0418] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶BRAFV600E的抑制剂。
[0419] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶BTK的抑制剂。
[0420] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶CSK的抑制剂。
[0421] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶EPHA1的抑制剂。
[0422] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶EPHA2的抑制剂。
[0423] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶EPHA4的抑制剂。
[0424] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶EPHB2的抑制剂。
[0425] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶EPHB4的抑制剂。
[0426] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶HER2的抑制剂。
[0427] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ERBB4的抑制剂。
[0428] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FES的抑制剂。
[0429] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FGR的抑制剂。
[0430] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FLT3的抑制剂。
[0431] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FMS的抑制剂。
[0432] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FRK的抑制剂。
[0433] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶FYN的抑制剂。
[0434] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶HCK的抑制剂。
[0435] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶LCK的抑制剂。
[0436] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶LYN的抑制剂。
[0437] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶MAPK14的抑制剂。
[0438] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶ERK2的抑制剂。
[0439] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶PKC0的抑制剂。
[0440] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶RET的抑制剂。
[0441] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶VEGFR3的抑制剂。
[0442] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作蛋白激酶YES的抑制剂。
[0443] 优选地,根据本发明的化合物用作任何一种或数种选自BRAF、EGFR(ErbBl)、 EGFR(ErbBl)T790ML858R、FGFR2、KDR(VEGFR2)、PDGFRA(PDGFRa)、SRC、ABL、ABLT315I、 FGFR1、VEGFR1、PDGFRB(PDGFR0 )的蛋白激酶的抑制剂。
[0444] 更优选地,根据本发明的化合物用作任何一种或数种选自BRAF、EGFR(ErbBl)、 EGFR(ErbBl)I790ML858R、FGFR2、KDR(VEGFR2)、PDGFRA(PDGFRa)、SRC的蛋白激酶的抑制 剂。
[0445] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作A549癌细胞系增殖的抑制剂。
[0446] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作IfepG2癌细胞系增殖的抑制剂。
[0447] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作HuCCTl癌细胞系增殖的抑制剂。
[0448] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作HuH6选殖株5癌细胞系增殖的抑 制剂。
[0449] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作HuH7癌细胞系增殖的抑制剂。
[0450] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作PC-3癌细胞系增殖的抑制剂。
[0451] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作Caki-2癌细胞系增殖的抑制剂。
[0452] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作MDA-MB-231癌细胞系增殖的抑 制剂。
[0453] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作HT29癌细胞系增殖的抑制剂。
[0454] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作BxPC-3癌细胞系增殖的抑制剂。
[0455] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作H1975癌细胞系增殖的抑制剂。
[0456] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作BaF3WT增殖的抑制剂。
[0457] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作BaF3T3151增殖的抑制剂。
[0458] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作BaF3G250A增殖的抑制剂。
[0459] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作BaF3G250E增殖的抑制剂。
[0460] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作BaF3G250A+E279N增殖的抑制 剂。
[0461] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作BaF3E255K+M351T增殖的抑制 剂。
[0462] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作HeLa癌细胞系增殖和移行的抑 制剂。
[0463] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作HUVEC原代细胞增殖和移行的抑 制剂。
[0464] 在另一个实施方案中,根据本发明的化合物用作HRMEC原代细胞增殖和移行的抑 制剂。
[0465] 优选地,根据本发明的化合物能够抑制至少一种选自A549、IfepG2、HuCCTl、HuH6 选殖体5、HuH7、HT29、BxPC3、H1975、PC3、Caki-2、MDA-MB-231、Hela的癌细胞系的增殖和 /或至少一种选自HUVEC和HRMEC原代细胞的增殖。
[0466] 本发明的化合物以及理所当然地包含该化合物的药物组合物,可用于治疗与蛋白 激酶反常相关的病理学:
[0467]-免疫病症、炎性疾病、血栓疾病、神经退行性疾病、骨病、黄斑变性、纤维化、囊肿 生成、过度增殖性疾病的情况,
[0468] _所有的癌症的情况,更特别地为液体肿瘤如血液学癌症,如白血病、慢性或急性 骨髓增殖病症;或实体瘤,如鳞状细胞癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、胃肠癌、胰腺癌、胶细 胞肿瘤如胶质母细胞瘤和神经纤维瘤、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、乳腺癌、黑色素瘤、结 直肠癌、子宫内膜癌、唾腺癌、肾癌、前列腺癌、外阴癌、甲状腺癌、肉瘤和/或星状细胞瘤,
[0469]-慢性或急性骨髓增殖病症的情况,如某些白血病,
[0470]-肝、肺、前列腺、肾、乳房、胰腺和结直肠胃肠癌的情况。
[0471] 有利地,本发明的化合物以及理所当然地包含这些化合物的药物组合物,可用于 治疗与疾病情况中的蛋白激酶反常相关的病理学,其中所述疾病选自肝癌、胰腺癌、肺癌、 乳腺癌、前列腺癌、白血病、肾癌、子宫内膜癌、结直肠癌、化疗抗性癌以及黄斑变性。
[0472] 根据另一方面,本发明涉及一种包含根据本发明的化合物作为活性成分的药物产 品。因此,根据本发明的化合物可用作治疗与蛋白激酶反常相关的病理学的药物产品:
[0473]-免疫病症、炎性疾病、血栓疾病、神经退行性疾病、骨病、黄斑变性、纤维化、囊肿 生成、过度增殖性疾病的情况,
[0474] _所有的癌症的情况,更特别地为液体肿瘤如血液学癌症,如白血病、慢性或急性 骨髓增殖病症;或实体瘤,如鳞状细胞癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、胃肠癌、胰腺癌、胶质 细胞肿瘤如胶质母细胞瘤和神经纤维瘤、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、乳腺癌、黑色素瘤、 结直肠癌、子宫内膜癌、唾腺癌、肾癌、前列腺癌、外阴癌、甲状腺癌、肉瘤和/或星状细胞 瘤,
[0475] _慢性或急性骨髓增殖病症如某些白血病的情况,
[0476]-肝、肺、前列腺、肾、乳腺、胰腺和结直肠胃肠癌的情况。
[0477] 根据本发明的组合物可用于治疗与蛋白激酶反常相关的病理学:
[0478]-免疫病症、炎性疾病、血栓疾病、神经退行性疾病、骨病、黄斑变性、纤维化、囊肿 生成、过度增殖性疾病的情况。
[0479] _所有的癌症的情况,更特别地为液体肿瘤如血液学癌症,如白血病、慢性或急性 骨髓增殖病症;或实体瘤,如鳞状细胞癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、胃肠癌、胰腺癌、胶质 细胞肿瘤如胶质母细胞瘤和神经纤维瘤、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、乳腺癌、黑色素瘤、 结直肠癌、子宫内膜癌、唾腺癌、肾癌、前列腺癌、外阴癌、甲状腺癌、肉瘤和/或星状细胞瘤 的情况。
[0480] _慢性或急性骨髓增殖病症如某些白血病的情况,
[0481]-肝、肺、前列腺、肾、乳腺、胰腺和结直肠胃肠癌的情况。
[0482] 并且,有利地,根据本发明的化合物可用于抑制人类或动物疾病中涉及的细胞增 殖和/或血管生成。
[0483] 相同地,根据本发明的组合物可用于抑制人类或动物疾病中涉及的细胞增殖和/ 或血管生成。
[0484] 本发明的另一方面涉及一种基本上安全和有效的使用根据本发明的化合物,以 提供信息的体外方法(体外诊断装置或成像工具)。举例而言,所述方法使能够预测需 要其的患者如呈现癌症的患者是否能够对至少一个根据本发明的化合物产生应答,所述 方法包含确定所述患者的样本中至少一种蛋白激酶的蛋白的表达水平、基因修饰(扩增、 突变)、活化状态或突变形式的外观,其中所述蛋白激酶选自下列激酶列表:BRAF、EGFR、 FGFR2、KDR、PDGFRA、SRC、ABL、FGFR1、VEGFR1、PDGFRB(PDGFRP)、ABL2、BLK、BMX、BTK、 CSK、EPHA1、EPHA2、EPHA4、EPHB2、EPHB4、HER2、ERBB4、FES、FGR、FLT3、FMS、FRK、FYN、HCK、 LCK、LYN、MAPK14、ERK2、PKC9、RET、VEGFR3 和YES,优选BRAF、EGFR(ErbBl)、EGFR(ErbBl) T790ML858R、FGFR2、KDR(VEGFR2)、PDGFRA(PDGFRa)、SRC、ABL、ABLT315I、FGFR1、VEGFR1、 PDGFRB(PDGFRP) 〇
[0485] 蛋白激酶的表达水平、基因修饰(扩增、突变)、活化状态或突变形式的外观,典型 地是利用一般已知的方法确定(见例如经FDA批准的医学设备的体外成像工具:http:// www.fda.gov/MedicalDevices/ProductsandMedicalProcedures/InVitroDiagnostics/ ucm301431.htm),如实时PCR、免疫组织化学、ELISA、原位杂交荧光(FISH)、显色原位杂交 (CISH)〇
[0486] 本发明的另一方面涉及一种体外预测被施用于需要其的患者如呈现癌症的患者 的至少一种根据本发明的化合物的方法,其特征在于,其包含下列步骤:
[0487]a)使所述化合物与人类组织或细胞样本接触,
[0488]b)通过例如IC5。和/或通过所存在的蛋白激酶的活性比较,确定化合物对样本 的活性,所述蛋白激酶选自下列激酶列表:BRAF、EGFR、EGFRT790ML858R、FGFR2、KDR、 PDGFRA、SRC、ABL、ABLT315I、FGFR1、VEGFR1、PDGFRB、ABLE255K、ABLG250E、ABLY253F、 ABL2、BLK、BMX、BRAFV600E、BTK、CSK、EPHA1、EPHA2、EPHA4、EPHB2、EPHB4、HER2、ERBB4、 FES、FGR、FLT3、FMS、FRK、FYN、HCK、LCK、LYN、MAPK14、ERK2、PKC9、RET、VEGFR3 和YES;优 选BRAF、EGFR(ErbBl)、EGFR(ErbBl)I790ML858R、FGFR2、KDR(VEGFR2)、PDGFRA(PDGFRa)、 SRC、ABL、ABLT315I、FGFR1、VEGFR1、PDGFRB(PDGFR0 )。
[0489]c)任选用健康的细胞,如所述患者的血液细胞或干细胞或肝细胞,进行与步骤a) 相同的试验,以确定根据本发明的化合物对健康细胞的毒性(即,不会出现任何的病理学 态样/特性);
[0490]d)选择呈现最佳活性和/或实际上最低毒性的根据本发明的化合物,将其施用至 需要其的患者。
[0491] 用于确定蛋白激酶活性的方法是典型地已知的(如Rosen等 人,JBiolChem. ,15 ;261 (29) ,13754-9. 1986;Ma等人,ExpertOpinDrug Discov.,3 (6),607 - 621,2008 中所报道)。
【附图说明】
[0492] 图1是表示一些化合物对A549细胞的抗增殖活性的图。
[0493] 图2是表示一些化合物对HepG2细胞的抗增殖活性的图。
[0494] 图3是表示一些化合物对HuCCTl细胞的抗增殖活性的图。
[0495] 图4是表示一些化合物对HuH6选殖株5细胞的抗增殖活性的图。
[0496] 图5是表示一些化合物对HuH7细胞的抗增殖活性的图。
[0497] 图6是表示一些化合物对HT29细胞的抗增殖活性的图。
[0498] 图7是表示一些化合物对BxPC-3细胞的抗增殖活性的图。
[0499] 图8是表示一些化合物对H1975细胞的抗增殖活性的图。
[0500] 图9是表示一些化合物对HUVEC细胞的抗增殖活性的图。
[0501] 图10是表示化合物0R0720与B-Raf?的激酶功能区的活性位点氨基酸(根据 其结晶结构)(PDBid= 1UWH)之间的相互作用(疏水接触、氢键和芳香铆合(aromatic staking))的概略图。
[0502] 图11是表示化合物0R0720与VEGFR2的激酶功能区的活性位点氨基酸(根据其 结晶结构)(PDBid= 4ASD)之间的相互作用(疏水接触、氢键和芳香铆合)的概略图。
[0503] 图12是表示化合物0R0720与EGFR的激酶功能区的活性位点氨基酸(根据该激 酶的同源模型)之间的相互作用(疏水接触、氢键和芳香铆合)的概略图。
[0504]
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