一种假病毒颗粒及其制备方法和应用_3

文档序号:9447716阅读:来源:国知局
2、加样(在样本处理区进行):分别加入5 步骤二中处理好的样本,盖好管盖 (透明平盖),转移至核酸扩增区;
[0134] 3、RT-PCR扩增(在核酸扩增区进行):
[0135] 3. 1将反应管/板置于ABIPrism7500全自动巧光定量PCR仪样品槽中。
[0136] 3. 2打开仪器配置软件(Wvl. 4版本软件为例),新建文件。
[0137] 3. 3Setup窗口设置:选中所放置的样品孔,点击右键打开WellInspector窗口, 通过AddDetector按钮添加探针巧光标记信号OteporterDye:TEXASRED灯EX)/FAM/JOE S种同时勾选;如encherDye:None。其中TEX巧光指示甲型流感病毒,FAM巧光指示乙型流 感病毒,JOE巧光指示内标P-actin。);在SampleName栏中按照对应位置输入样本信息, 在化sk栏中设置阴性对照(NTC)、未知样本OJnknow)、阳性对照OJnknow)。
[0138] 3.Alnstrument窗口 设置:
[0139] 循环条件:48°C5分钟,
[0140] 94°C2 分钟,
[0141] 94°C10 秒,55°C35 秒,40 个循环。
[014引SampleVolume设置为 25^1。
[0143] DataCollection:Stage3,St巧2 (55. 0@0 :3f5)
[0144] 3. 5保存文件,运行程序。
[0145] 四、结果分析:
[0146] 1、反应结束后立即保存数据文件。
[0147] 2、分析条件设置:根据分析后图像调节Baseline的start值,end值(可根据试 验情况自行调整,一般情况下start值可变范围在1~10,end值可变范围在5~20)。在 Linear图谱窗口设置化reshold的Value值,或者直接拉动threshold线,使得值的设置高 于背景巧光信号,且位于扩增曲线指数扩增期。选择Analyze自动分析结果。
[0148] 3、到Results/Repo;rt窗口记录样本Ct值。
[0149] 五、质量控制:
[0150] 1、阴性对照需在TEX、FAM和JOES种巧光素下巧光信号均无明显增长,并无明显 S型扩增曲线;
[0151] 2、强阳性对照需在TEX、FAM和JOES种巧光素下巧光信号均有明显增长,有典型 的S型曲线,且Ct值应在18. 00~21. 00之间;
[0152] 3、临界阳性对照需在TEX、FAM和JOES种巧光素下巧光信号均有明显增长,有典 型的S型曲线,且Ct值应在27. 00~30. 00之间。
[0153] 4、要求在同一实验中的同一巧光素下设置相同的化reshold,并满足W上S条质 控要求。否则,实验结果不成立。
[0154] 5、所有临床口咽拭子样本的内标反应都应是阳性,即Ct值小于等于35. 00,否则 该样本结果不成立。
[01巧]【参考值(参考范围)】
[0156] 通过对大量临床阴性和阳性样本的试验,利用R0C曲线法确定本试剂盒的参考Ct 值为35. 00。即待检样本的0<Ct值《35. 00为阳性,否则为阴性。35. 00《Ct值《38. 00 为试剂盒灰区,处于灰区的样本复检结果为阳性或仍处于灰区均判为阳性,符合阴性结果 判别标准则样本为阴性。
[0157]【检验结果的解释】
[0158] 综合分析仪器给出的各项数据,设定合理的阔值(Threshold)和基线 度aseline),使仪器给出正确的结果。结果分析时请分别针对TEX、FAM或JOE巧光单独进 行判断。
[0159] -、质量控制分析:
[0160] 每次试验均需检测阴性质控品、强阳性对照和临界阳性对照,质控品结果满足检 验方法中质量控制要求时方可进行检测结果的判定。
[0161] 二、结果解释:
[0162] 1、阴性结果判定:待检样本无明显巧光增幅且无典型S型曲线,或待检样品TEX巧 光(甲型流感病毒)Ct〉38. 00或化det、FAM巧光(乙型流感病毒)Ct〉38. 00或化det、J0E 巧光(内标P-actin)Ct《35. 00,判定为阴性样本。
[0163] 2、阳性结果判定:巧光增幅明显,有典型S型曲线,且Ct值符合下表条件,判定为 阳性样本。
[0164]
[0165]
[0166] 3、灰区结果判定:
[0167] 巧光信号有明显增幅,但TEX巧光(Inf.A)35. 00《Ct值《 38. 00、FAM巧光(Inf. B) 35. 00《Ct值《38. 00,此处为试剂盒灰区,处于灰区的样本需复检。根据实际情况,可 重复取样或用同份样本重复检测。复检结果为阳性或仍处于灰区均判为阳性,符合阴性结 果判别标准则样本为阴性,如是内标符合阴性结果判别标准,则判定采样不合格。用同份样 本重复检测时,对样本进行适当的浓缩纯化,理论上会提高检测的灵敏度,但对灵敏度的增 加效果未验证。
[016引 4、结果示例:
[0169] 待检样本为5份临床样本,使用本试剂盒检测。检测结果包括强阳性对照、临界阳 性对照、阴性对照和临床样本5个,检测结果见附图4和附图5,数据整理为下表:
[0170]
[0171] W上所述实施例的各技术特征可W进行任意的组合,为使描述简洁,未对上述实 施例中的各个技术特征所有可能的组合都进行描述,然而,只要运些技术特征的组合不存 在矛盾,都应当认为是本说明书记载的范围。
[0172] W上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并 不能因此而理解为对发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来 说,在不脱离本发明构思的前提下,还可W做出若干变形和改进,运些都属于本发明的保护 范围。因此,本发明专利的保护范围应W所附权利要求为准。
【主权项】
1. 一种假病毒颗粒,其特征在于,其是由MS2噬菌体的衣壳蛋白包裹了依次由甲型流 感病毒、乙型流感病毒和P-actin三种碱基片段串联而成的检测序列的DNA-蛋白复合体。2. 根据权利要求1所述的假病毒颗粒,其特征在于,所述甲型流感病毒的碱基片段为 SEQIDN0:3或对SEQIDN0:3进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸序列。3. 根据权利要求1所述的假病毒颗粒,其特征在于,所述乙型流感病毒的碱基片段为 SEQIDN0:4或对SEQIDN0:4进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸序列。4. 根据权利要求1-3任一项所述的假病毒颗粒,其特征在于,所述P-actin的碱基片 段为SEQIDNO: 5或对SEQIDNO: 5进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸 序列。5. -种假病毒颗粒的制备方法,其特征是,包括以下步骤: (1) 使用针对MS2噬菌体基因组的引物,以MS2噬菌体基因为模板,进行RT-PCR扩增得 到产物,该扩增产物包含MS2噬菌体的包膜蛋白基因、成熟酶基因、包装信号序列; (2) 将扩增产物插入原核表达载体pSE380中,构建重组质粒pSE380-MS2 ; (3) 将所得到的重组质粒PSE380-MS2转化入大肠杆菌感受态细胞中,扩大培养,提取 质粒; (4) 得到含有依次由甲型流感病毒、乙型流感病毒和P-actin三种碱基片段串联而成 的检测序列的核苷酸序列,该核苷酸序列的两端带有限制性内切酶BglII和HindIII的酶 切位点; (5) 将步骤(4)所得到的核苷酸序列与重组质粒pSE380-MS2进行连接,构建重组质粒 PSE380-MS2-AB; (6) 诱导重组质粒pSE380-MS2-AB的表达与纯化,即得。6. 根据权利要求5所述的假病毒颗粒的制备方法,其特征是,步骤(1)中针对MS2噬菌 体基因组的引物为SEQIDNO: 1和SEQIDNO:2。7. 根据权利要求5所述的假病毒颗粒的制备方法,其特征是,步骤(4)为:用扩增引物 SEQIDNO:7和SEQIDNO:8,以SEQIDNO:6为模板进行扩增,得到的扩增产物即为所述 核苷酸序列。8. 根据权利要求5-7任一项所述的假病毒颗粒的制备方法,其特征是,步骤(6)中的诱 导表达与纯化包括以下步骤: (6. 1)、将pSE380-MS2-AB重组质粒的阳性菌落,涂布于含氨苄霉素的LB固体培养基平 板; (6. 2)、挑取单菌落接种到含氨苄霉素的LB液体培养基中; (6. 3)、培养至A600nm为0. 5-1. 0时,加入IPTG,诱导表达形成病毒颗粒; (6. 4)、采用超声破碎法裂解出病毒样颗粒物,并加入核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶I将裸露的RNA与DNA降解; (6. 5)、离心收集上清,鉴定,将鉴定正确的病毒样颗粒保存。9. 权利要求1-4任一项所述的假病毒颗粒作为甲型流感病毒和/或乙型流感病毒检测 中的外标质控品的应用。10. -种甲型流感病毒和/或乙型流感病毒核酸检测试剂盒,其特征在于,包括有检测 试剂和外标质控品,所述外标质控品为权利要求1-4任一项所述的假病毒颗粒。
【专利摘要】本发明公开了一种假病毒颗粒,其是由MS2噬菌体的衣壳蛋白包裹了依次由甲型流感病毒、乙型流感病毒和β-actin三种碱基片段串联而成的检测序列的DNA-蛋白复合体。本发明还公开了上述假病毒颗粒的制备方法和其作为甲型流感病毒、乙型流感病毒检测的质控品的应用。本发明的假病毒颗粒制备方法简单、操作容易、获得的假病毒纯度高,可作为甲型流感病毒及乙型流感病毒核酸检测试剂盒中的质控品,无传染性且稳定性好,具有耐核糖核酸酶等特点。
【IPC分类】C12N15/63, C12Q1/68, C12N7/04, C12Q1/70
【公开号】CN105200018
【申请号】CN201510712786
【发明人】李小锋, 李晨阳, 崔红, 商兴芳
【申请人】广东和信健康科技有限公司, 广州呼研所生物技术有限公司
【公开日】2015年12月30日
【申请日】2015年10月27日
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