一种治疗皮肤萎缩相关疾病的药物作用靶点的制作方法_4

文档序号:8912113阅读:来源:国知局
5min)。超净台风干;沉淀不能过干或过湿,过干则不易溶解,过湿则乙醇残留。视沉淀量加 入适量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。
[0122] 使用RNase-free的DNaseI(Promega),按以下体系配置反应液,37°C消化30min, 65°C灭活IOmin。
[0123]
[0124] 然后按以下步骤操作:
[0125] 1)加入等体积的苯酚/氯仿,上下颠倒混匀,室温放置5min,后14,OOOrpm,离心 15min,取上清。
[0126] 2)加入等体积的氯仿,上下颠倒混勾,静置分层后14,OOOrpm,离心15min,取上 清。
[0127]3)加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次),_20°C静置15min;
[0128] 4) 4°C下,14,OOOg离心15min,收集RNA沉淀,去上清;5)用75 %乙醇洗涤两次 (12,OOOg离心5min),超净台风干;6)加入适量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。
[0129] 纯度检测:取IyIRNA样品50倍稀释,在核酸蛋白检测仪上测定OD值,0D260/ 0D280的比值应大于1.8。
[0130]总RNA完整性检测:取RNA样品IyI,1 %琼脂糖凝胶电泳80VX20min,EB染色 lOmin,用凝胶成像系统观察并拍照,总RNA的5srRNA,18srRNA和28srRNA条带,三条条 带完整的话即可证明总RNA抽提比较完整。
[0131] 计算好实验中需用多少份体系,则按具体量配置。总的体系配好后,在振荡器中振 荡均匀或用枪吸打均匀,然后15ul每管分装至8连管中。
[0132] cDNA用灭菌纯水稀释适当的浓度,一般为1:20稀释,如遇到基因表达低的样品, 则适当降低稀释比例至1:10或1: 5。cDNA按一定顺序排好后,即可加至刚配好的反应体系 中。加样完毕。把各排八连管放在掌上离心机上离心数秒,随后上机检测。
[0133] 本发明中所涉及的引物序列由表2给出。
[0134] 表2本发明中所涉及的引物序列
[0135]


[0138] 2.IOWesternblot检测
[0139] 蛋白抽提:细胞培养至所需要的密度时,细胞经预冷的PBS漂洗3次,加入450yI 裂解液,细胞刮刀收集,用移液器转移至离心管中,反复吹打。所得的样品用超声细胞破碎 仪超声处理,超声时为5S,间歇时间为10S,功率为100-120W至溶液清澈无粘稠为止,处理 过程在水浴中进行,后4°C25000g离心,上清液样品置KKTC水浴箱里水浴加热3-5分钟, 1000 Og离心10分钟,取出清液,将其移入另一洁净试管中。
[0140] 蛋白定量:
[0141] ①Bradford法浓染液的配制:将IOOmg考马斯亮蓝G-250溶于50ml95%乙醇, 加入100mL浓磷酸;然后,用蒸馏水补充至200ml;此染液放4°C至少6个月保持稳定。
[0142] ②标准曲线蛋白质样本的制备:尽量使用与待测样本性质相近的蛋白质作为标准 品,例如测定抗体,可用纯化的抗体作为标准,如果待测样品是未知的,也可用抗体作为标 准蛋白,通常在20yg-150yg/100y1之间绘制标准曲线。
[0143] ③将待测样本溶于100y1缓冲溶液中,该缓冲溶液相同(最好用PBS)。
[0144] ④按照1:5用水稀释浓燃料结合溶液,如果出现沉淀,过滤除去。
[0145] ⑤每个样品加5ml稀释的染料结合溶液,作用5-30分钟,染料与蛋白结合,将由红 色变为兰色,在595nm波长下测定其吸光度,注意显色反应不超过30分钟。
[0146] ⑥根据标准曲线计算待测样品的浓度。
[0147] 制做分离胶、浓缩胶:
[0148] ①按比例配制分离胶,轻缓地摇动溶液(8-10下),使激活剂混合均匀,将凝胶溶 液平缓地注入两层玻璃极中,再在液面上小心注入一层水或正丁醇,以阻止氧气进入凝胶 溶液中,然后静置90min。
[0149] ②同前按比例配制浓缩胶,但摇动溶液时不要过于剧烈以免引入过多地氧气。吸 去不连续系统中下层分离胶上的水分,以连续平稳的液流注入凝胶溶液,然后小心插入梳 子并注意不得在齿尖留有气泡,静制90min以上以保证完全聚合。
[0150] 加样:预电泳后依次加入标准品和待分析样品,注意加样时间要尽量短,以免样品 扩散,为避免边缘效应,可在未加样的孔中加入等量的样品缓冲液。
[0151] 电泳:加样完毕,盖好电泳槽的盖子并选择适当的电压进行电泳,通常在连续系统 中,上层浓缩胶的电泳电压要低于分离胶的电泳电压,使样品更好的进入凝胶,电泳时,应 采用恒压的模式,这样蛋白质才可以保证恒定的电泳迀移率。一般采用恒压浓缩胶80V,分 离胶120V,电泳直至溴酚染料前沿下至凝胶末端处,即停止电泳。
[0152] 转膜:
[0153] ①Tris/甘氨酸-SDS-PAGE结束后,取出凝胶,在Tris/甘氨酸缓冲液中漂洗数 秒。取凝胶方法:用刀片将两玻璃板分开,将多余的凝胶划去,上部以浓缩胶为准全部弃去, 下部以分子量标准最小分子带下一点全部划去,取一IOml注射器注满转印缓冲液,插入玻 璃板与凝胶之间注水,使水的压力将两者自然分开,边推边进,反复多次注水,直至凝胶从 玻璃板上滑落下来。
[0154] ②将NC膜和滤纸切出与凝胶一样大小,置转移缓冲液中湿润5-10min.
[0155] ③按照以下顺序放置滤纸,凝胶和NC膜到半干槽中。
[0156] ④每层之间的气泡要全部去除。可以用IOml吸管轻轻在上一层滚动去除气泡,然 后用一绝缘的塑料片中间挖空与凝胶一样大小或略小一点,以防电流直接从没有凝胶处通 过造成短路,盖好加上阳极电极板。
[0157] 膜的封闭:
[0158] 1)洗转印膜:室温漂洗3次XlOmin,以尽量洗去转印膜上的SDS,防止影响后面的 抗体结合。
[0159] 2)取漂洗的转印膜,放入5%No-fatmilk的封闭液内,摇床震动,室温封闭2h,也 可在4度过夜。
[0160] 3)用lxTBS-T,PH7. 6 洗液,室温漂洗 3 次xlOmin.
[0161] 抗体孵育:
[0162] 1)封闭后的杂交膜放入杂交袋中,加入抗体稀释液稀释的Abl浓度为lug/ml,封 口,4°C孵育过夜或室温(22-25°C)摇动孵育2h;
[0163] 2)液洗膜 3 次xlOmin;
[0164] 3)标记的Ab2 (羊抗兔-HRP)室温lh,洗膜3xl0min。
[0165]检测:
[0166] ①DAB显色液的配制:按照lmlH20加显色剂A,B,C各1滴,混匀。
[0167] ②显色:将适量DAB显色液平铺在Ab2杂交后的印迹膜上,室温放置观察,可出现 明显的棕褐色蛋白显色带。
[0168] ③终止:用Tris-HCl缓冲液或水漂洗杂交膜即可终止反应。
[0169] 3?实验结果
[0170] 3.IsiRNA干扰靶基因结果
[0171] 体外实验中,本发明筛选出了有效的SiRNA序列,相对于对照组,能够显著敲低大 鼠和人类Cdhl和FoxOl的基因表达,和蛋白水平的表达(图2)。
[0172] 3. 2E_Cadherin敲低后可逆转分化细胞成为干细胞
[0173] 体外实验中,我们发现皮肤角质形成细胞敲低E-cadherin的表达后,通过免疫荧 光检测,比较干预前后干细胞标记物的变化。PCR实验发现,诸多干细胞标记物相对于对 照组显著上升。例如:基底层干细胞和毛囊干细胞都表达的ITGB1、ITGA6、Krtl5、Krt5, Krtl4,毛囊干细胞特有标记物:⑶34,S0X9,Krtl9 (图3左)(毛囊干细胞是相对于基底 层干细胞更原始的干细胞标记物)。Westernblot实验进一步证实,基底层干细胞标记物 Keratin5,ITGA6表达量相对于对照组显著升高,除此以外,毛囊干细胞标记物Keratin 19,Keratin15 重新开始表达,而分化标记物,如Krtl,KrtlO,Involucrine,Filaggrin, Loricrin则显著降低(图3右)。在免疫荧光检测中,研宄发现诸多干细胞标记物表达高 于对照组,与westernblot实验结果相符(图4左)。
[0174] 3. 3E_Cadherin敲低后可促进角质形成细胞增殖、抗凋亡能力。
[0175] 在进一步实验中发现,皮肤角质形成细胞敲低E-cadherin的表达后,可显著增加 细胞的增殖能力,增殖指数显著高于对照组。在失巢凋亡的流式检测中,敲低E-cadherin 的表达后,可显著增加细胞的早期抗凋亡能力,增加细胞的生存活力(图4右)。
[0176] 3. 4E_Cadherin敲低后激活Wnt/ 0-catenin信号通路
[0177] 本发明发现,当干扰E-Cadherin表达后,可促进转录因子|3-catenin的基因 CTNNBl的表达及|3 -catenin蛋白核转移能力增加(图5),并从而激活Wnt/ |3 -catenin信 号通路。在进入细胞核后,转录因子0-catenin能够结合端粒酶的启动子部位,并启动对 端粒酶基因T
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