用于食管癌易感基因检测的试剂盒的制作方法

文档序号:11936961阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种用于食管癌易感基因检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:

针对单核苷酸多态性位点rs10052657的引物,以及

针对单核苷酸多态性位点rs2274223的引物。

2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒进一步包括针对单核苷酸多态性位点rs4785204的引物。

3.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述针对单核苷酸多态性位点rs10052657的引物包括:

rs10052657上游引物:AAGGCTCTTAATGGGAAACC;

rs10052657下游引物:ATGCATCGCACATTAATACC。

4.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述针对单核苷酸多态性位点rs2274223的引物包括:

rs2274223上游引物:GGTGACTTTGATCCCTTTTG;

rs2274223下游引物:CATCCATCACCTAGCTACAAC。

5.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述针对单核苷酸多态性位点rs4785204的引物包括:

rs4785204上游引物:TTCAGTAGTACCTGGATTGA;

rs4785204下游引物:GATGAAATAAGAGCTTCTACC。

6.权利要求1-5之一所述试剂盒的检测结果的评估方法,其包括如下步骤:

A、将单核苷酸多态性位点rs10052657、rs2274223、rs4785204的不同基因型进行风险度赋值;

B、提取受检者的DNA;

C、使用以下引物对进行PCR扩增反应:

(1)rs10052657上游引物:AAGGCTCTTAATGGGAAACC;

rs10052657下游引物:ATGCATCGCACATTAATACC;

(2)rs2274223上游引物:GGTGACTTTGATCCCTTTTG;

rs2274223下游引物:CATCCATCACCTAGCTACAAC;

(3)rs4785204上游引物:TTCAGTAGTACCTGGATTGA;

rs4785204下游引物:GATGAAATAAGAGCTTCTACC;

D、PCR扩增产物纯化;

E、DNA测序,确定单核苷酸多态性位点rs10052657、rs2274223、rs4785204的基因型;

F、根据步骤A,确定步骤E所测得的单核苷酸多态性位点rs10052657、rs2274223、rs4785204的基因型的风险值Risk(rs10052657)、Risk(rs2274223)、Risk(rs4785204);

G、根据步骤F得到的三个风险值Risk(rs10052657)、Risk(rs2274223)、Risk(rs4785204)判断受检者的风险级别。

7.如权利要求6所述的评估方法,其特征在于,所述步骤G具体包括如下步骤:

G1、计算三个单核苷酸多态性位点的总风险值R,计算公式为

总风险值R=Risk(rs10052657)×Risk(rs2274223)×Risk(rs4785204);

G2、根据如下标准判断风险级别:

总风险值R<0.78 风险较低

0.78≤总风险值R≤1.34 风险一般

总风险值R>1.34 风险较高。

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